Staphylococcus coagulase negativa formam o grupo de agentes mais isolados de vacas com mastite em diversos países. No entanto, a grande variedade de espécies e a ausência de métodos de identificação simples e rápidos são fatores que limitam a avaliação do efeito da mastite causada por SCN sobre a produção e composição do leite. Portanto, os objetivos gerais deste estudo foram: 1) avaliar o efeito da infecção intramamária (IIM) subclínica causada por SCN sobre a composição e a produção de leite de quartos mamários; 2) determinar o efeito da IIM causada por SCN sobre a composição do leite e contagem de células somáticas (CCS); 3) avaliar a técnica de espectrometria de massas por ionização e dessorção a laser assistida por matriz tempo de voo (MALDI-TOF MS) para a identificação das espécies de SCN isoladas de vacas com mastite; 4) avaliar a frequência de espécies de SCN isoladas de vacas com mastite subclínica. Amostras compostas de leite foram coletadas de 1.242 vacas pertencentes a 21 rebanhos leiteiros. As coletas foram realizadas em duas etapas: na primeira, realizou-se coleta asséptica de amostras compostas para identificação dos agentes causadores de mastite; e na segunda, para as vacas com isolamento de SCN, a produção de leite foi mensurada e amostras de leite foram coletadas por quarto mamário para confirmação do diagnóstico microbiológico (SCN) e avaliação da composição e CCS. Os isolados de SCN foram diferenciados genotipicamente pela técnica de reação em cadeia da polimerase (PCR), associado com o polimorfismo de fragmentos de DNA obtidos por enzimas de restrição (RFLP) e por MALDI-TOF MS. Treze cepas de referência de espécies de SCN normalmente isoladas da mastite foram utilizadas como controle positivo para as duas metodologias de identificação. Um total de 108 quartos mamários foram identificados em nível de espécie pela técnica de PCR-RFLP. Destes, foram selecionados 41 pares de quartos mamários contralaterais com e sem IIM causada por SCN para avaliação do efeito de SCN sobre a produção e composição do leite. Quartos mamários com IIM causada por SCN apresentaram maior CCS (496,99 x 103 células/mL) que os quartos mamários contralaterais sadios (160,79 x 103 células/mL). A IIM causada por SCN não afetou a produção de leite e as concentrações de gordura, proteína, caseína, lactose, sólidos totais e extrato seco desengordurado. Do total de amostras identificadas em nível de espécie pela técnica de PCRRFLP (n=108), 103 (95,37%) foram identificadas pela MALDI-TOF MS em nível de espécie. Cinco isolados de SCN apresentaram identificação em nível de gênero (Staphylococcus spp.) pela MALDI-TOF MS. Todas as cepas de referência foram corretamente identificadas por ambas as metodologias de identificação. Staphylococcus chromogenes foi a espécie mais prevalente (n=80; 74,07%) em vacas com mastite, seguida de S. saprophyticus (n=6; 5,55%) e S. haemolyticus (n=5; 4,63%). Em conclusão, a IIM subclínica causada por SCN aumenta a CCS, porém não altera a produção e composição do leite. A técnica de MALDI-TOF MS é um método sensível (95,37%) e que pode ser utilizado na identificação de espécies de SCN causadoras de mastite. Staphylococcus chromogenes é a espécie mais prevalente em vacas com mastite subclínica causada por SCN. / Coagulase negative staphylococci (CNS) are the most isolated group of mastitis pathogens in many countries. However, the diversity of species and the absence of a simple and fast identification method are limiting factors for the evaluation of the effect of CNS mastitis effect on milk yield and composition of dairy cows. Therefore, the main objectives of this study were: 1) to evaluate the effect of subclinical intramammary infection (IMI) caused by CNS on milk yield and composition at mammary quarter level; 2) to determine the effect of IMI caused by CNS on the milk composition and somatic cell count (SCC); 3) to evaluate the technique of matrix-assisted laser desorption ionization - time-of-flight - mass spectrometry (MALDI/TOF-MS) for species identification of CNS isolated from mammary glands; 4) to evaluate the frequency of CNS species isolated from cows with subclinical mastitis. Milk samples were collected from 1,242 cows distributed in 21 dairy herds. Milk samples were collected in two visits to the farm: first, composite milk samples were aseptically collected for identification of mastitis causative pathogens; and the second, the milk yield was measured and milk samples were collected at mammary quarter level for cows with isolation of CNS to confirm the diagnosis and for analysis of milk composition and SCC. Isolates of CNS were genotypically differentiated by polymerase chain reaction (PCR) associated with restriction fragment length polymorphism assays and by MALDI-TOF MS. Thirteen CNS reference strains commonly isolated from mastitis were used as positive controls for the two identification methods. A total of 108 mammary quarters were genotipically identified by PCR-RFLP. Of these, 41 pairs of contralateral mammary quarters both with and without IIM caused by SCN were evaluated. Mammary quarters infected with CNS presented higher SCC (496.99 x 103 cells / mL) than contralateral healthy mammary quarters (160.79 x 103 cells / mL). Intramammary infection caused by CNS did not affect the milk yield and the concentrations of fat, protein, casein, lactose, total solids and solids not fat. Of the 108 samples identified by PCR-RFLP, 103 (95.37%) were also identified by MALDI-TOF MS with to the species level. Five CNS had reliable identification at genus level (Staphylococcus spp.). All the reference strains were correctly identified by both identification methods. The most prevalent species isolated from samples collected from cows with mastitis were Staphylococcus chromogenes (n = 80, 74.07%), followed by S. saprophyticus (n = 6, 5.55%) and S. haemolyticus (n = 5, 4.63%). In conclusion, subclinical mastitis caused by CNS increases the SCC, but do not affect the milk yield and composition. The MALDI-TOF MS is a sensitive method (95.37%) that can be used for the identification of CNS species causing mastitis. Staphylococcus chromogenes is the most prevalent CNS species isolated in the samples collected from cows with subclinical mastitis.

O uso do Cateter Venoso Central (CVC) viabiliza a assistência de alta complexidade aos pacientes críticos. Contudo, as infecções desses cateteres demonstram uma associação com a migração dos microrganismos da pele do local de inserção até a ponta do cateter. A utilização de novas tecnologias para reduzir a colonização cutânea no sítio de inserção do cateter reforça a questão da antissepsia cutânea e a sugestão do curativo adequado a esta região. As recomendações do Centers for Disease Control and Prevention (CDC) apontam como uma opção de curativo o uso da cobertura de filme transparente de poliuretano (FTP) que protege e facilita a visualização do sítio de inserção. Contudo, o uso do curativo gel de clorexidina (CGCHX), vem apresentado uma resposta superior na prevenção dessas colonizações e infecções. Diante do exposto, propôs-se identificar por meio de um estudo de corte transversal prospectivo, os microrganismos presentes no swab de pele após o uso do CGCHX e do FTP, no momento da retirada do CVC. Fizeram parte do estudo um total de 92 pacientes, destes 45 pacientes em uso do CGCHX e 47 utilizaram FTP, em ambos os grupos, a faixa etária foi em média 60 anos, declararam-se brancos e não houve diferença significativa entre o número de homens e mulheres. A escolha do sítio de inserção preferencial foi a veia jugular interna direita. Houve o crescimento em 13 amostras de Swabs no grupo do CGCHX os microrganismos encontrados foram Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa, Morganella morganii, Enterobater cloacae, Staphylococcus aereus e Staphylococcus epidermidis. O Staphylococcus aereus apresentou resistência a oxacilina, o que podemos sugerir a possibilidade de uma cepa MRSA. Quanto ao FTP foram seis amostras positivas com o crescimento de Serratia marcescens, Acinetobacter baumannii, Klebsiella pneumoniae, Staphylococcus epidermidis e Staphylococcus haemolyticus. A presença da Klebsiella pneumoniae sensível somente a amicacina sugere a possibilidade da cepa Klebsiella pneumoniae carbapenemas (KPC). Apesar dos achados evidenciarem um número maior de crescimento bacteriano no curativo gel de CHX, este estudo pode contribuir para o olhar e desenvolvimento de novos trabalhos para a nossa população, levando em consideração nosso clima e tipo de pele, como também a importância de medidas educativas permanentes no treinamento da equipe de saúde nos centros onde as novas tecnologias são implementadas / The use of Central Venous Catheter (CVC) enables the high complexity assistance to critically ill patients. However, these catheters infections show an association with the migration of skin microorganisms from the insertion site to the tip of the catheter. The use of new technologies to reduce skin colonization on the catheter insertion site reinforces the issue of skin disinfection and use of suitable dressing to this region. The recommendations from the Centers for Disease Control and Prevention (CDC) show the use of coverages with transparent polyurethane film (TPF) as an option of dressing, which protects and facilitates the visualization of the insertion site. However, the use of chlorhexidine gel dressing (CGD) has presented a higher response in preventing these colonizations and infections. Given the above, this study aimed to identify the microorganisms present on the skin swab after using the CGD and TPF at the time of removal of the CVC from a prospective cross-sectional study. The total of participants were 92 patients, 45 of them were using CGD and 47 were using FTP. In both groups, the average age was 60 years, white, and there was no significant difference between the number of men and women. The choice of preferred insertion site was the right internal jugular vein. There was growth in 13 samples Swabs in the CGD group. Microorganisms found were Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa, Morganella morganii, Enterobater cloacae, Staphylococcus aereus and Staphylococcus epidermidis. Staphylococcus aereus showed resistance to oxacillin, which can suggest the possibility of a MRSA strain. Related to the FTP group, there were six positive samples with the growth of Serratia marcescens, Acinetobacter baumannii, Klebsiella pneumoniae, Staphylococcus epidermidis and Staphylococcus haemolyticus. The presence of Klebsiella pneumoniae sensitive only to amikacin suggests the possibility of Klebsiellapneumoniaecarbapenemase strain (KPC). Despite findings showing a greater number of bacterial growth in the chlorhexidine gel dressing, this study may contribute to the development of new studies for population, taking into account the climate and skin type, as well as the importance of educational measures for the training of health team in centers where new technologies are implemented

Orientadores: Paulo Ademar Martins Leal, Antonio Carlos de Oliveira Ferraz / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia Agrícola / Made available in DSpace on 2018-08-21T10:17:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Souza_FrancianeColares_D.pdf: 2902759 bytes, checksum: 9132390d28bc3d61c99fb9c0a0385692 (MD5) Previous issue date: 2012 / Resumo: O manejo inadequado é um fatores que afetam a qualidade de produtos agrícolas, conduzindo a perdas devido aos danos mecânicos e o desenvolvimento microbiano, agravado pelo armazenamento inadequado. No caso do figo, devido à limitada proteção oferecida pela epiderme e presença do ostíolo, o beneficiamento utilizando água não é recomendado, trazendo em pauta ações capazes de promover a desinfecção superficial sem afetar a qualidade do produto. Dentre os métodos físicos mais promissores para conservação de frutas estão a refrigeração, radiação ultravioleta (UV-C) e atmosfera modificada. Por outro lado, a utilização de métodos combinados apresenta vantagens devido sua ação sinérgica e complementar. Neste sentido, acredita-se que o uso combinado de métodos físicos pode trazer benefícios para a conservação de figos, principalmente voltada para o mercado externo, auxiliando na manutenção da qualidade do produto e redução da carga microbiana. Este trabalho teve como objetivo avaliar o desempenho da combinação dos tratamentos de atmosfera modificada passiva, atmosfera enriquecida com 100% de CO2 e radiação UV-C na conservação do figo 'Roxo de Valinhos'. As principais etapas foram as seguintes: (1) isolamento dos fungos causadores de podridao em figos 'Roxo de Valinhos' e teste de patogenicidade, utilizando métodos de inoculação de deposição de suspensão de esporos na epiderme do figo, com e sem perfuração, e com deposição sobre papel filtro, avaliando-se a incidência e a severidade dos patógenos com cálculo do Índice de Doença (ID); (2) identificação do nível de tolerância do figo à exposição da radiação UV-C de 0,00 kJ.m-2; 0,70 kJ.m-2; 1,32 kJ.m-2; 2,64 kJ.m-2 e 4,00 kJ.m-2, armazenados à 10°C e 20°C, utilizando como parâmetro de qualidade a aparência visual; (3) avaliação do efeito da radiação UV-C no crescimento in vitro e in vivo dos fungos Rhizopus stolonifer, Lasiodiplodia theobromae e Alternaria alternata, utilizando-se valores de energia de radiação iguais a 0,00 kJ.m-2; 2,64 kJ.m-2; 4,00 kJ.m-2; 8,00 kJ.m-2 e 16,00 kJ.m-2 para os ensaios in vitro e iguais a 0,00 kJ.m-2; 0,70 kJ.m-2; 1,32 kJ.m-2 e 2,64 kJ.m-2 para os ensaios in vivo, a 10ºC e 20ºC; (4) avaliação de desempenho do filme de polipropileno (PP) com espessuras de 25'mi'm, 30'mi'm e 50'mi'm na manutenção da qualidade de figos, avaliada pelos parâmetros perda de massa (PM), sólidos solúveis (SS), acidez titulável (AT), aparência visual e redução da incidência de podridão; (5) avaliação do efeito de atmosfera com 100% de CO2 por 4h, 8h e 12h, à 10ºC e 20ºC, na manutenção da qualidade e diminuição da carga microbiana no figo, avaliada pelos índices PM, SS, AT e aparência visual e (6) combinação do filme de PP de 30'mi'm com radiação UV-C de 1,32 kJ.m-2 e com a exposição à atmosfera com 100% de CO2 durante 4h. Os resultados evidenciaram que a utilização isolada do filme de PP de 30'mi'm, radiação UV-C e exposição à 100% de CO2 mostrou-se eficiente na manutenção da qualidade das frutas, sobretudo quando se utiliza o armazenamento refrigerado. O uso combinado do filme de PP de 30'mi'm com atmosfera modificada com 100% de CO2, representa uma alternativa para o armazenamento do figo, mesmo quando não se utiliza refrigeração, em função da redução da carga microbiana e manutenção da qualidade / Abstract: The main factor affecting quality of agricultural products is the inadequate management, leading to considerable losses due to mechanical damage and fungal contamination, aggravated by improper storage. The fig vulnerability is amplified due to the presence of the ostiole, a peculiar fig orifice, acting as an open door to contamination. Since aqueous sanitization is not recomended, other methods should be searched to promote surface sanitization without affecting the quality of the product. Some promising methods are cooling, ultraviolet radiation (UV-C) and modified atmosphere. A combined method also has advantages because of their synergistic effect on inhibiting microbial growth, and thus maintaining the nutritional and visual qualities of the product. Moreover, the combined use of physical methods, to improve the fig shelf life, potentially can increase business opportunities, specially in the international market. The main objective of this work was to evaluate the performance of the combination of modified atmosphere and UV-C radiation on 'Roxo de Valinhos' fig conservation. To attain this general goal several intermediate steps were performed: (1) fungi rot identification and associated pathogenicity using inoculation by deposition on filter paper to evaluate disease incidence and contamination severity; (2) UV-C radiation fig tolerance identification using energy levels of 0,00 kJ.m-2; 0,70 kJ.m-2; 1,32 kJ.m-2; 2,64 kJ.m-2 and 4,00 kJ.m-2, followed by storage at 10ºC and 20ºC; (3) evaluation of the effect of UV-C radiation on Rhizopus stolonifer, Lasiodiplodia theobromae and Alternaria alternata fungi growth, for in vitro and in vivo tests, using energy irradiation of 0,00 kJ.m-2; 2,64 kJ.m-2; 4,00 kJ.m-2; 8,00 kJ.m-2 and 16,00 kJ.m-2 for the in vitro test, and 0,00 kJ.m-2; 0,70 kJ.m-2; 1,32 kJ.m-2 e 2,64 kJ.m-2 for the in vivo test, at 10ºC and 20ºC; (4) evaluation of the polypropylene (PP) in maintaining the quality, using film thicknesses of 25'mi'm, 30'mi'm and 50'mi'm; (5) evaluation of the fig exposition to 100% CO2 modified atmosphere for 4h, 8h and 12h, followed by storage at 10ºC and 20ºC, in maintaining quality and keeping the microbiological load low and (6) evaluation of the combined use of 30'mi'm PP film with UV-C irradiation of 1,32 kJ.m-2 and 100% CO2 modified atmosphere during 4h. Results have shown that the use of the 30'mi'm PP film, radiation UV-C of 1,32 kJ.m-2 and exposition to 100% of CO2 for 4h was effective in maintaining the quality of the fruits, specially when refrigerated storage is employed. It was concluded that combined use of the 30'mi'm PP film with high CO2 concentration represents an alternative to non refrigerated fig storage, due to the reduction of the microbial load / Doutorado / Tecnologia Pós-Colheita / Doutora em Engenharia Agrícola

Submitted by Biblioteca da Faculdade de Farmácia (bff@ndc.uff.br) on 2017-03-14T17:16:12Z No. of bitstreams: 1 Lopes, Patricia Regina Kraschinski [Dissertação, 2016].pdf: 1353027 bytes, checksum: d3bd0a8823abd0576a16231891f91a13 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-14T17:16:12Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Lopes, Patricia Regina Kraschinski [Dissertação, 2016].pdf: 1353027 bytes, checksum: d3bd0a8823abd0576a16231891f91a13 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / O objetivo deste estudo foi avaliar a qualidade microbiológica do leite bovino em diferentes etapas da cadeia produtiva de uma cooperativa de leite do Estado do Rio de Janeiro, e investigar a presença de STEC e STEC O157 no leite e nas fezes dos animais ordenhados. Foram coletadas 100 amostras de leite nas diferentes etapas da cadeia produtiva, sendo 54 amostras do galão de cada propriedade rural, 25 amostras de leite do tanque de refrigeração comunitário, 14 amostras dos carros-tanque isotérmicos e 7 amostras do tanque de resfriamento da indústria bem como 10 amostras de leite pasteurizado. Foram também avaliadas 63 amostras de swab retal do animal ordenhado e 35 amostras de leite recém ordenhado. Para conferir a eficiência da pasteurização foram realizados os testes de peroxidase e fosfatase alcalina. A maioria das amostras (75,9%) de leite cru coletadas nos galões dos produtores apresentou condições microbiológicas satisfatórias, contagem bacteriana total (CBT) < 5,5 log UFC/mL. No entanto, 72% das amostras de leite coletadas no tanque de refrigeração comunitário, 100% das amostras coletadas nos carros-tanque isotérmicos e 100% das amostras coletadas nos tanques de refrigeração da indústria apresentaram condições microbiológicas insatisfatórias. Todas as amostras de leite pasteurizado foram aprovadas quanto a CBT, além de apresentarem a enzina peroxidase ativa e a enzima fosfatase alcalina inativa. No entanto, 80% destas amostras foram classificadas em condições microbiológicas insatisfatórias por apresentarem coliformes totais e E. coli acima dos padrões estabelecidos pela legislação brasileira. Das 100 amostras de leite cru analisadas, 65 apresentaram o gene stx, sendo 33 (61,1%) amostras do galão do produtor, 13 (52%) amostras do tanque de refrigeração comunitário, 14 (100%) amostras dos carros-tanque isotérmicos e cinco (71,4%) amostras dos tanques de resfriamento da indústria. Cinquenta e seis (88,9%) amostras fecais e 17 (48,6%) amostras de leite recém-ordenhado apresentaram o gene stx. Com exceção de uma amostra, todas as amostras de leite recém ordenhado provinham de um animal carreador do gene stx. Foram isolados STEC O157:H7 em 11,9% das amostras de fezes bovinas stxpositivas. Todas as cepas STEC O157:H7 isoladas apresentaram os genes stx2c, eae , tir , espA , espB , ler, iha, astA, EHEC-hlyA e espP. A qualidade microbiológica dos produtos lácteos está diretamente relacionada à qualidade da matéria-prima, com isso, é necessário a adequação dos produtores rurais quanto à implementação de Boas Práticas Agropecuárias, além da implementação das Boas Práticas de Fabricação pela indústria de laticínios / The aim of this study was to evaluate the microbiological quality of cow's milk in different stages of the production chain of a cooperative state milk Rio de Janeiro, and to investigate the presence of STEC and STEC O157 on themilk and the faeces of milked animals. 100 milk samples at different stages of the production chain were collected, 54 samples of a gallon of each rural property, 25 milk samples of Community coolant tank, 14 samples of insulated tank cars and 7 samples of the industrial cooling tank; and 10 samples of pasteurized milk. It was also evaluated 63 samples of rectal swab of milking animals and 35 sample of freshly milked milk. To check the effectiveness of the pasteurization tests peroxidase and alkaline phosphatase were performed. The majority of samples (75.9%) of raw milk collected in gallons producers had satisfactory microbiological conditions, total bacterial count (TBC) < 5.5 log CFU/mL. However, 72% of milk samples collected in the Community coolant tank, 100% of the samples collected in the isothermal tank cars and 100% of the samples collected in the industrial cooling tanks had unsatisfactory microbiological conditions. All (100%) samples of pasteurized milk were approved as the TBC, besides having the peroxidase enzyme is of not presenting the enzyme alkaline phosphatase. However, 80% of these samples were classified as unsatisfactory microbiological conditions for presenting total coliforms and E. coli above the standards set by law. Of 100 raw milk samples analyzed, 65 showed the stx gene, 33 (61.1%) of the producer gallon, 13 (52%) of the community coolant tank, 14 (100%) of the isothermal tank cars and five (71.4%) of cooling tanks industry. Fifty-six (88.9%) and 17 faecal samples (48.6%) of freshly milked milk samples showed the stx gene. With the exception of one sample, all milk samples freshly milked, came from a carrier animal stx gene. They were isolated STEC O157: H7 in 11.9% of samples stx-positive cattle dung. All strains STEC O157: H7 isolated genes showed stx2c, eae , tir , espA , espB , read, iha, astA, EHEC-hlyA and espP. The microbiological quality of dairy products is directly related to the quality of the raw material, thus, the adequacy of farmers as the implementation of Best Practices of Agricultural is required in addition to the implementation of Good Manufacturing Practices by the dairy industry

Abstract The aim of this work was to assess and improve the enrichment cultivation of food-contaminating bacteria prior to detection by means of RNA-based sandwich hybridization assay (SHA). The examples of beer-spoiling lactic acid bacteria (LAB) and food-borne Salmonella Typhimurium were selected based on their relevance in Finnish food industry. Also universal challenges affecting on the selection of the enrichment cultivation procedure are discussed, including some potential possibilities for improved enrichment cultivation. The results of this study may therefore be used for the assessment of the efficiency of bacterial cultivation in other applications. The evaluation of the enrichment cultivation procedures prior to SHA lead to following conclusions: i) the enrichment cultivation procedure is necessary prior to rRNA-based SHA, and it directly influences the accuracy of SHA; ii) the improvement of the enrichment cultivation may allow faster recovery and growth of bacteria; iii) the improved recovery of bacteria can be achieved by reducing environmental stress factors in the enrichment culture; and iv) the growth of bacteria may be accelerated by assuring the selectivity of medium and allowing accessibility to growth factors. Several growth factors were studied by means of full factorial design and response surface modeling. Measured cell densities, as well as predicted lag-times and maximum growth rates in the bacterial cultures were used as responses. The results show that small shifts in the cultivation conditions extend the lag-time and decrease the growth rate of both LAB and Salmonella. Besides adjusting the temperature and pH, the growth of LAB was facilitated by reducing osmotic and oxidative stresses in the enrichment medium. In this study, a novel enzyme controlled glucose delivery system was used for the first time in the enrichment cultivation of food-contaminating bacteria. The glucose delivery system improved the growth of LAB in single strain cultures and in actual brewing process samples. The recovery of injured Salmonella was also enhanced by using the glucose delivery system together with selective siderophore ferrioxamine E, both in terms of reduced lag-times and increased growth rates. Based on the SHA, the adjusted BPW broth enhanced the molecular detection of heat-injured Salmonella in meat.

Poor sanitation, unhygienic practices and close living associations between people and animals in rural communities increase the risk of zoonoses and add to faecal contamination of stored drinking water. Point-of-use interventions can improve the microbiological quality of household drinking water and a combination of microbial and chemical indicator tests could identify the origin of faecal pollution. The improvement of the microbiological quality of drinking water in rural households by the implementation of intervention strategies which included the use of traditional storage containers as well as an improved safe storage container (CDC, USA), with or without the addition of a sodium hypochlorite solution were determined. The origin of faecal contamination in the water sources and household stored water were determined using male specific F-RNA subgroup genotyping. This study attempted to assess the survival of indicator microorganisms and selected bacterial pathogens and viruses in the improved safe storage container in borehole and river water samples. An intervention study was conducted in two rural villages utilising different source water. Results indicated that the improved safe storage container without the addition of a stabilized sodium hypochlorite solution did not improve the microbiological quality of the stored drinking water and had counts of indicator microorganisms similar to that found in the traditional storage containers. However, the households using the 1% and the 3.5% sodium hypochlorite solutions have shown an effective reduction in the counts of indicator microorganisms in both the traditional and the improved safe storage containers. The compliance with the use of the sodium hypochlorite interventions ranged between 60% and 100%, which was in agreement with similar studies carried out in other developing countries. One village complied with the intervention while the other village did not. Reasons for this included financial factors, an unsupportive infrastructures and lack of education and knowledge on health risks by the households. Male specific F-RNA bacteriophage genotyping showed that faecal contamination in the water source samples and both the traditional and improved safe storage containers at the point-of-use were primarily of animal origin (Subgroup I). Households using river water had subgroup II F-RNA bacteriophages present in the stored household water, which was associated with human faecal pollution. However, subgroup II F-RNA bacteriophages has been isolated from faeces of cattle and poultry, which indicated that F-RNA subgroup typing might not be a specific tool to determine the origin of faecal pollution in water sources. Laboratory seeding experiments indicated that 1% sodium hypochlorite solution were less effective in reducing heterotrophic bacteria, Escherichia coli, Salmonella typhimurium, Clostridium perfringens, F-RNA bacteriophages and coxsackie B1 virus counts in the improved safe storage containers filled with river water with a high turbidity. However, the 1% sodium hypochlorite solution did reduce the indicator and seeded microorganisms within 60 min in containers filled with borehole water with a low turbidity. The 3.5% sodium hypochlorite solution effectively decreased the numbers of microorganisms to undetectable limits within 60 min in both the borehole and river filled storage containers irrespective of the turbidity values. This study has showed that a combination of intervention strategies can provide rural communities with microbiologically safe drinking water. / Thesis (PhD (Medical Virology))--University of Pretoria, 2008. / Medical Virology / PhD / unrestricted

Orientador: Jose Luiz Pereira / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia de Alimentos / Made available in DSpace on 2018-08-07T14:47:03Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Pereira_KarenSignori_D.pdf: 795788 bytes, checksum: 3c56762962a9dfbb567a0cc78805f20c (MD5) Previous issue date: 2006 / Resumo: As bactérias pertencentes ao gênero Staphylococcus são bastante peculiares porque apesar de terem distribuição ubiqüitária e formarem a microbiota residente na pele e mucosa de humanos também podem ser causadoras de diversas enfermidades aos mesmos, tais como a intoxicação alimentar estafilocócica.Todavia, para a indústria de produtos cárneos a importância dos estafilococos está além do fato de serem microrganismos patogênicos. Algumas espécies do gênero são coadjuvantes de tecnologia para a fabricação de salames, estando presentes como componentes de culturas starter ou iniciadoras. Entre as características importantes das espécies utilizadas em culturas iniciadoras está a incapacidade enterotoxigênica, o que tem sido diretamente relacionado às espécies coagulase positiva. Diversos trabalhos, porém, têm demonstrado a capacidade de estafilococos coagulase negativa produzirem enterotoxina em meio de cultivo laboratorial e há, inclusive, registros de surtos de intoxicação estafilocócica associados a espécies não produtoras de coagulase. Assim, 90 amostras de salames industrializados, pertencentes a seis diferentes marcas, foram analisadas visando a enumeração, identificação e verificação do potencial enterotoxigênico das espécies de estafilococos coagulase negativa (ECN). Determinações de pH, Aw, análises de coliformes termotolerantes, Salmonella, Staphylococcus coagulase positiva e bactérias láticas também foram realizadas. Salmonella foi detectada em uma amostra. Entre os 266 isolados de ECN nenhum produziu enterotoxina, e dos 252 identificados cerca de 90% eram S. xylosus e S. carnosus / Abstract: Staphylococcus is ubiquitous distribution bacteria and present in skin of humans and other animals. However, staphylococci species can cause various diseases. Staphylococcal food poisoning is one of these diseases. But for meat industry staphylococci importance is not only because diseases. Some species are very important for the fermented sausage¿s manufacture like starter cultures. To be used, staphylococci have do not produce coagulase. However, many researches have demonstrated capacity of coagulase negative staphylococci (CNS) to produce enterotoxin and there are registers of staphylococcal food poisoning outbreaks linked to CNS. Ninety samples of industrialized salamis, for six different brands, had been studied. Enumeration, identification and potencial enterotoxigenic of CNS were analyzed. Additionally, termotolerants coliforms, staphylococci coagulase positive and lactic acid were counted; Salmonella isolated; pH and Aw measured. Salmonella was isolated of one sample. None of 266 CNS produced enterotoxins, 252 were identified and about 90% were S. xylosus and S. carnosus / Doutorado / Doutor em Ciência de Alimentos

Orientador: Lucia Regina Durrant / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia de Alimentos / Made available in DSpace on 2018-08-14T12:37:36Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Hervatin_HeloisaLitholdo_M.pdf: 1981858 bytes, checksum: ffb8ed64cae5f9232a96630b93cc06fa (MD5) Previous issue date: 2009 / Resumo: O pólen apícola é a aglutinação do pólen presente nas flores coletados pelas abelhas operarias, e depositados na entrada da colméia. O estudo visou avaliar a qualidade microbiológica e físico-química do pólen IN NATURA e do submetido a diferentes processos de secagem, simulando as condições de processamento do produto comercializado. Também avaliou as amostras adquiridas no comercio do estado de São Paulo. Registrou-se a escassez das pesquisas sobre a qualidade microbiológica do pólen apícola. Primeiramente a pesquisa, analisou amostras de pólen apícola obtidas através de coletores instalados nas colméias pertencentes ao apiário experimental do Pólo Regional de Desenvolvimento Tecnológico dos Agronegócios do Vale do Paraíba, localizado em Pindamonhangaba-SP, pertencente à Agência Paulista de Tecnologia dos Agronegócios. A coleta ocorreu nos intervalos de 24horas, 48horas e 72horas, objetivando a presença e/ou quantidade de microrganismos patogênicos no pólen com relação ao tempo de permanência do produto no campo. As amostras foram congeladas por 48horas, e submetidas a dois processos de secagem (circulação de ar em sistema aberto a 40-42°C e sistema de circulação de ar fechado a 30°C). Foram realizadas as análises físico-químicas para os parâmetros de pH, umidade e atividade de água e as microbiológicas com avaliação de Bacillus cereus, Estafilococos coagulase positiva, coliformes a 45°C, Escherichia coli, Salmonella sp, bolores e leveduras, além de microrganismos sulfitos redutores. Amostras de pólen apícola desidratado foram adquiridas no mercado vajerista do Estado de São Paulo, com registro no Serviço de Inspeção Federal (SIF), submetidas aos mesmos parâmetros. Através dos cálculos estatísticos observaram-se possíveis diferenças e/ou correlações existentes entre os parâmetros analisados (microbiológicos, físico-químicos) para os tratamentos propostos (frequência de coleta e processos de desidratação). Verificou-se que as amostras analisadas, as IN NATURA e as desidratadas, mostraram-se isentas dos principais patógenos como Salmonella sp e Estafilococos coagulase positiva, porém, a população de bolores e leveduras foi relativamente elevada. Podendo concluir que os bolores e leveduras são os parâmetros microbiológicos mais significativos para o pólen apícola, seguido por Bacillus cereus e por bactérias coliformes totais, sendo parâmetros que devem ser introduzidos na legislação; além do processo de desidratação normalmente utilizado para pólen, não reduzir a população fúngica. Com base na Legislação atual para padrões microbiológicos em alimentos, considerando o grupo da granola, todas as amostras analisadas, encontram-se dentro dos padrões estabelecidos. Bolores e leveduras não estão incluídos na Legislação do MAPA. A época do ano teve influência na contaminação de Bolores e Leveduras, paralelamente com o tempo de permanência do pólen no campo, sendo indicada a coleta do material a cada 24horas. Assim os processos de secagem devem ser otimizados para permitirem a obtenção de produto livre de contaminantes microbiológicos; juntamente com a higienização do material nas diferentes etapas de produção e processamento do pólen, com foco na busca de materiais que substituam a madeira que é extremamente porosa, de forma a permitir higienização adequada e satisfatória. Outro parâmetro a ser considerado é a embalagem para o produto que merece atenção de especialistas nesta área / Abstract: The bee pollen is the agglutination of pollen present in flowers collected worker bees, and deposited at the entrance of the hive. The study aimed to evaluate the microbiological quality and physico-chemistry of the pollen in nature and subject to different processes of drying, simulating the processing conditions of the product sold. Also evaluated the samples acquired in the trade of the state. We have registered the scarcity of research on the microbiological quality of bee pollen. First the research, analyzed samples of bee pollen obtained from collectors installed in the experimental apiary hives belonging to the Regional Technology Development Center of Agribusiness of the Paraíba Valley, located in Pindamonhangaba-SP, belonging to the Agency of Technology Agribusiness Paulista. Frequency of collection in intervals of 24 hours, 48 hours and 72 hours, to the presence and/or amount of pathogenic microorganisms in pollen with the time of product in the field. The samples were frozen by 48 hours, and subjected to two drying processes (movement of air in the open system 40-42°C and a system of closed circulation of air at 30°C). Performed the analysis for the physical-chemical parameters of pH, humidity and water activity and with the microbiological assessment of Bacillus cereus, Coagulase positive Staphylococci, coliforms at 45°C, Escherichia coli, Salmonella, molds and yeasts, and micro sulphites reducing. Acquired samples of dried bee pollen market of the State of São Paulo, with registration at the Federal Inspection Service (SIF), subject to the same parameters. Through statistical calculations were observed possible differences and/or correlations between the analyzed parameters (microbiological, physico-chemical) for the proposed treatments (frequency of collection and processes of dehydration). It was found that the samples analyzed, the IN NATURE and dehydrated, were free of major pathogens such as Salmonella and Coagulase positive Staphylococci, however, the population of yeasts and molds is relatively high. May conclude that the yeasts and molds are the most significant microbiological parameters for the bee pollen, followed by Bacillus cereus bacteria and total coliforms, and parameters to be introduced into legislation, in addition to the dehydration process typically used for pollen, is not able to eliminate fungal its population, based on current legislation for microbiological standards in food, considering the group of granola, all the samples, are within the standards set. Yeast and molds are not included in the legislation of the MAP. The time of year influences the contamination of molds and yeasts, along with the time of pollen in the field, being given the collection of material every 24 hours. Thus the process of drying must be optimized to allow the achievement of product free of microbiological contaminants, together with the cleaning of equipment in various stages of production and processing of pollen constantly, with a focus in the search for materials to replace the wood that is extremely porous to enable proper cleaning and satisfactory. Another parameter to be considered is the packaging for the product deserves the attention of specialists in this area / Mestrado / Mestre em Ciência de Alimentos

The use of medicinal plants has always been a constant in the folk medicine of different civilizations around the world. However, their pharmacological activities are still poorly studied. This work aims to study the toxicological and microbiological activity of industrialized teas of Black Tea (Camellia sinensis), chamomile (Matricaria recutita), Fennel (Foeniculum vulgare L.) and spearmint (Mentha piperita) in Swiss albino mice. There were made aqueous and alcoholic extracts of the teas in study. Those who had strong antimicrobial and toxicological activity had their ethanolic extracts fractionated by a method of liquid- liquid partition in a gradient of increasing polarity. Female mice of Swiss albino species were used in toxicity testing. To evaluate the antimicrobial activity of these extracts it was used an Agar diffusion method based on Kirby and Bauer modified method. According to the preliminary analysis of the microbiological profile of these teas could observe the presence of a large number of units According to the preliminary analysis of the microbiological profile of these teas it could be observed the presence of a large number of colony forming units per gram of tea, despite all the teas were maintained within the standards established by law. The toxicological tests carried out with extracts of the teas showed significant results for the extracts of C. sinensis (Black Tea) and M. recutita (Chamomile). With testing of the fractions from ethanolic extracts of C. sinensis and M. recutita it could be observed a hepatotoxic activity in fractions of chloroform and ethyl acetate of C. sinensis of which were determined the LD50 of 1.67 g.kg-1 and 0.84 g.kg-1 respectively. The extract of M. recutita, at a dose of 3.34 g.kg-1 mass inoculation, also demonstrated a high power-toxic on the liver and spleen. The ethanol extract of C. sinensis, especially in its chloroform fraction, showed good antimicrobial activity against bacterial strains of S. aureus, P. aeruginosa, E. coli and C. albicans strains, showing a pronounced antifungal activity. / Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado de Alagoas / O uso de fitoterápicos na medicina popular sempre foi uma constante em todas as civilizações do mundo. Entretanto, suas atividades farmacológicas ainda são pouco estudadas. Este trabalho tem como objetivo estudar a atividade toxicológica e microbiológica de chás industrializados de Chá Preto (Camelia sinensis), Camomila (Matricaria recutita), Erva Doce (Foeniculum vulgare, L.) e Hortelã (Mentha piperita), em camundongos Swiss albinos. Foram feitas extrações aquosas e etanólicas dos chás em questão. Aqueles que apresentaram acentuada atividade toxicológica e antimicrobiana tiveram seus extratos etanólicos fracionados por um método de partição líquido-líquido segundo um gradiente crescente de polaridade. Foram utilizados nos testes toxicológicos camundongos Swiss Albinos fêmeas. Para avaliação da atividade antimicrobiana destes extratos foi utilizado um método de difusão em Agar baseado no Método de Kirby e Bauer modificado. De acordo com as analises preliminares do perfil microbiológico destes chás pôde-se observar a presença de um número elevado de Unidades Formadoras de Colônias por grama de chá, porém todos os chás se mantiveram dentro dos padrões estabelecidos por lei. Os testes toxicológicos realizados com os extratos dos chás apresentaram resultados expressivos para os extratos de C. sinensis (Chá Preto) e de M. recutita (Camomila). Com os testes das frações dos extratos etanólicos de C. sinensis e M. recutita pode-se observar uma atividade hepatotóxica nas frações clorofórmica e de acetato de etila de C. sinensis determinadose a DL50 de 1,67 g.kg-1 e 0,84 g.kg-1 respectivamente. Observou-se ainda o alto poder hepato-esplenotóxico do extrato de M. recutita na dose de 3,34 g.kg-1 de massa inoculada. O extrato etanólico de C. sinensis, principalmente em sua fração clorofórmica, apresentou uma boa atividade antimicrobiana frente a linhagens bacterianas de S. aureus, P. aeruginosa, E. coli e cepas de C. albicans, demonstrando uma atividade antifúngica pronunciada.

Submitted by Renata Lopes (renatasil82@gmail.com) on 2016-01-22T13:28:22Z No. of bitstreams: 1 marciotavaresrodrigues.pdf: 2527893 bytes, checksum: cffa1b6b9f47e12a219e28ecedcb98f3 (MD5) / Approved for entry into archive by Adriana Oliveira (adriana.oliveira@ufjf.edu.br) on 2016-01-25T18:52:12Z (GMT) No. of bitstreams: 1 marciotavaresrodrigues.pdf: 2527893 bytes, checksum: cffa1b6b9f47e12a219e28ecedcb98f3 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-01-25T18:52:12Z (GMT). No. of bitstreams: 1 marciotavaresrodrigues.pdf: 2527893 bytes, checksum: cffa1b6b9f47e12a219e28ecedcb98f3 (MD5) Previous issue date: 2014-02-11 / CNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / FAPEMIG - Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais / Candidíase vulvovaginal (CVV) é um dos diagnósticos mais frequentes na prática ginecológica e sua incidência tem aumentado drasticamente. Portanto, estudos regionais prospectivos tornam-se necessários para conhecimento da epidemiologia da doença. Tem sido reconhecida a emergência de outras espécies de leveduras, além de Candida albicans, como agentes etiológicos em infecções mono ou polimicrobianas, com reflexo direto na terapia antifúngica, frequentemente empírica. O objetivo deste estudo foi investigar a etiologia, o perfil epidemiológico de pacientes com candidíase vulvovaginal e possíveis fatores predisponentes, além da diversidade genética das leveduras. Secreção vaginal das pacientes foi semeada em Agar Sabouraud e amostras de leveduras foram isoladas e identificadas por PCR. Dados demográficos, clínicos e fatores predisponentes foram obtidos por meio de questionário. Genotipagem das leveduras foi realizada pela técnica de RAPD e matriz de similaridade foi construída para avaliação da diversidade de C. albicans e sua relação com os dados clínicos e epidemiológicos. Para análise estatística foram utilizados os testes t-Student, Fischer e qui-quadrado, com auxílio do software Statistical Package for the Social Sciences (SPSS), com nível de significância de 5%. Foram avaliadas 69 pacientes, entre 15 e 52 anos, predominando mulheres brancas (79,7%), com escolaridade de nível superior completo (58%), casadas (56,5%) e com vida sexual ativa (97,1%). Dentre elas, 34,8% eram gestantes, 7,2% diabéticas, 1,4% soropositivas para HIV e 36,2% usavam anticoncepcional oral. Antibioticoterapia recente foi citada por 13% das pacientes, uso de antifúngico por 5,8% e de antitricomonas por 1,4%. Uso de corticosteróides foi relatado por 2,9% das participantes e de anti-neoplásicos por 1,4%. Fluxo vaginal e prurido foram as principais queixas apresentadas, respectivamente, por 97,1% e 73,9% das pacientes, seguido de ardência (63,8%) e hiperemia (63,8%). Quando presente, o fluxo foi majoritariamente branco (88,1%) ou grumoso (86,6%). O diagnóstico foi confirmado pela cultura em 55 (79,7%) pacientes, sendo quatro casos de infecção mista. A espécie prevalente foi C. albicans, seguida por um caso de C. glabrata, que foi encontrada em mais duas pacientes em associação com C. albicans. Nas outras duas infecções polimicrobianas, C. lusitaniae foi isolada com C. albicans. A análise dos dados gerados pela genotipagem das leveduras permitiu discriminar linhagens de C. albicans na população amostrada. Foi possível evidenciar sete tipos eletroforéticos (TE) classificados como grupos I a VII, sendo os grupos I, II, III, IV, V e VI compostos por linhagens de levedura que apresentaram 100% de similaridade genética. No grupo VII foram incluídas linhagens de levedura altamente polimórficas que apresentaram no máximo 80% de semelhança. Embora nenhuma relação tenha sido estabelecida entre TE e dados clínicos e epidemiológicos, percebeu-se que os tipos I e IV são os mais prevalentes na população amostrada. Embora a positividade da cultura tenha sido alta e os dados clínicos de CVV sejam característicos, a sintomatologia não é patognomônica. C. albicans é a espécie prevalente, mas devese atentar para a ocorrência de outras espécies na etiologia de CVV, como a emergência de C. lusitaniae. Sugere-se realização do diagnóstico microbiológico com identificação da espécie envolvida e detecção de infecção mista antes da terapia antimicrobiana. / The vulvovaginal candidiases (VVC) is one of the most frequent diagnosed disease in gynecological practice and its incidence has increased drastically. Therefore, regional prospective studies become necessary to better address epidemiological issues. It has been recognized the emergence of other yeast species, besides Candida albicans, as VVC in mono or polymicrobial infections, with direct reflex in antifungal therapy, often empirical. This study was focused on the etiology investigation, the epidemiological profile of patients with vulvovaginal candidiasis (VVC) and predisposing factors, addition to the genetic diversity of yeasts. Vaginal secretions were streaked in Sabouraud agar and yeast samples were isolated and identified by PCR. Demographic and clinical data were obtained by questionnaire. For statistical analysis the Student t test, chi-square and Fischer, were applied as needed using the software Statistical Package for Social Sciences (SPSS) with a significance level of 5 %. Yeast genotyping was performed by the RAPD approach, and a similarity matrix was obtained to evaluate C. albicans diversity and their relationships with clinical and epidemiological data. Sixty nine patients were evaluated between 15 and 52 years, predominantly white (79.7 %), with higher education (58 %), married (56.5 %) and sexually active (97.1 %). Among them, 34.8 % were pregnant, 7.2% diabetic, 1.4 % seropositive for HIV and 36.2 % using oral contraceptives. Recent antibiotic therapy was mentioned by 13 % of patients, and antifungal or anti-trichomonas therapy were mentioned by 5.8% and 1.4 % of the patients. Corticosteroid use was reported by 2.9 % and antineoplastic by 1.4 %. Vaginal discharge and itching were the main complaints (97.1 % and 73.9 %), followed by burning (63.8 %) and erythema (63.8 %). When present, the vaginal flow was predominantly white (88.1 %) or lumpy (86.6 %). The diagnosis was confirmed by culture in 55 (79.7 %) patients, with mixed infections in four patients. The most prevalent species was C. albicans, followed by C. glabrata (one monoinfection and two mixed infections with C. albicans). C. lusitaniae and C. albicans were also identified in mixed infections (two patients). The analysis of data generated by yeasts genotyping allowed discriminating different C. albicans strains in the sampled population. It was identified seven electrophoretic types (ET) classified within groups I to VII. The groups I, II, III, IV, V and VI included yeast strains with of 100% genetic similarity. In group VII were included the yeast strains highly polymorphic that present less than 80% of similarity. Despite the high culture positivity and clinical data being characteristic of VVC, the symptoms are not pathognomonic. C. albicans is the most prevalent species, but other species are also involved in the VVC etiology, as the emergence of C. lusitaniae. It is suggested the diagnosis and identification of microbial species involved including detection of mixed infections before antimicrobial chemotherapy.