LIMA, José Vinícius Leite. Populações microbianas e antagonismo de actinobactérias sobre rizóbios em solos do semiárido. 2017. 81 f. Tese (Doutorado em Ecologia e Recursos Naturais)-Centro de Ciências, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2017. / Submitted by ELAINE PEREIRA (ellainec.pereira@gmail.com) on 2017-09-19T17:31:18Z No. of bitstreams: 1 2017_tese_jvllima.pdf: 1448998 bytes, checksum: 2c2b1578a9568ad79222074a03a8f266 (MD5) / Approved for entry into archive by Jairo Viana (jairo@ufc.br) on 2017-09-22T17:59:28Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2017_tese_jvllima.pdf: 1448998 bytes, checksum: 2c2b1578a9568ad79222074a03a8f266 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-09-22T17:59:28Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2017_tese_jvllima.pdf: 1448998 bytes, checksum: 2c2b1578a9568ad79222074a03a8f266 (MD5) Previous issue date: 2017 / The structure of the communities living in the soil is driven by various mechanisms and the ecological interactions established between the living organisms. In the same way, the components of the microbiota present harmonic or non-harmonic relationships, for example, between actinobacteria and rhizobia. Interspecific competition among microorganisms occurs when many species require the same resources, and the negative effect on the availability of common resources adversely affects the others. In this context, the objective of this study was to quantify the microbial population in the soil and leaf litter in the vegetation of the caatinga and carrasco in the Brazilian semiarid region (Chapter I) and to characterize and evaluate the antagonistic effect of actinobacteria on rhizobia (Chapter II). The soil samples were collected at the Ecological Station of Aiuaba (Aiuaba, Ceará), characterized by the vegetation of caatinga and carrasco. In chapter I, the population density of the microbial community was evaluated by sampling of soil and litter in the vegetation of caatinga and carrasco at the Aiuaba Ecological Station. The microorganisms were isolated from the soil samples in flasks containing 0.8% saline solution and cultured, after consecutive dilutions, in culturing media specific to cultivable populations of total bacteria, actinobacteria, cellulolytic bacteria, phosphate solubilizing bacteria and fungi. Population estimation was then performed by standard counting on plates and the values were expressed in CFU.g-1. The microbial populations from the soil and leaf litter differed each other quantitatively and in the two vegetations, but in general were greater in the leaf litter. Thus, the knowledge of the population structure of the microbial community can be extended to the semiarid soils. In Chapter II, the strains of actinobacteria isolated in the first study were characterized and tested for “in vitro” inhibitory effect on strains of rhizobia also isolated from semiarid soils. The actinobacteria were purified in their respective culture medium (CDA medium). The strains were characterized for their color and morphology of the colonies, tolerance to pH levels, production of melanin and use of carbon sources. The “in vitro” antagonism of actinobacteria on rhizobia was evaluated in Petri dish containing yeast mannitol agar (YMA) medium by the formation of inhibition zone. The actinobacteria and rhizobia that had greater antagonistic effect or did not presented inhibition zones were molecularly identified. Sixty strains were identified in seven genera of actinobacteria in which had tolerance to variations in pH, low melanin production and generalist use of carbon sources. It was also observed “in vitro” antagonism of actinobacteria species, standing out the genus Streptomyces, on strains of Rhizobium tropici, Bradyrhizobium yuanmingense and two other rhizobia strains not identified. This is the first work that addresses this ecological interaction between microorganisms of the Brazilian semiarid region and reveals the occurrence of new species related to this negative interaction. Thus, the presence of antagonism among these organisms may lead to “in vivo” studies, contributing to future agricultural and/or ecological uses. / A estrutura das comunidades que vivem no solo é direcionada por vários mecanismos e as interações ecológicas estabelecidas entre os organismos. Da mesma forma, os componentes da microbiota apresentam relações harmônicas ou não entre si, como por exemplo, entre actinobactérias e rizóbios. A competição interespecífica entre os micro-organismos acontece quando muitas espécies procuram pelos mesmos recursos, e o efeito depressor que cada uma tem na disponibilidade dos recursos comuns afeta adversamente os outros. Neste contexto, teve-se como objetivo neste estudo quantificar em região semiárida a população microbiana no solo e serrapilheira nas fisionomias vegetais de caatinga e carrasco (Capítulo I) e caracterizar e avaliar o efeito antagônico de actinobactérias sobre rizóbios do semiárido (Capítulo II). O estudo foi realizado na Estação Ecológica de Aiuaba (Aiuaba, Ceará) caracterizada pelas fisionomias de caatinga e carrasco. No capítulo I, avaliou-se a densidade populacional da comunidade microbiana por meio de coleta de amostras do solo e serrapilheira nas fisionomias vegetais de caatinga e carrasco na Estação Ecológica de Aiuaba. Os micro-organismos foram isolados das amostras em solução salina 0,8% e cultivados, após diluições seriadas, em meios de cultura específicos para populações cultiváveis de bactérias totais, actinobactérias, bactérias celulolíticas, bactérias solubilizadoras de fosfato e fungos. Em seguida foi realizada a contagem das populações pela contagem padrão em placas usando a técnica de espalhamento em superfície, e os valores foram expressos em UFC.g-1. As populações microbianas oriundas do solo e serrapilheira diferiram quantitativamente entre elas e nas duas fisionomias vegetais, mas no geral foram maiores na serrapilheira. Dessa forma, pode-se ampliar o conhecimento da estrutura populacional da comunidade microbiana em solos de clima semiárido. No capítulo II, caracterizaram-se as cepas de actinobactérias isoladas das populações obtidas do primeiro estudo e testou-as para efeito inibidor in vitro sobre estirpes de rizóbios também oriundas de solos semiáridos. As actinobactérias foram purificadas no seu respectivo meio de cultura (meio CDA). As cepas foram caracterizadas quanto a atributos cromogênicos e morfológicos, para tolerância a níveis de pH, na produção de melanina e uso de fontes de carbono. O antagonismo das actinobactérias in vitro sobre rizóbios foi avaliado em meio de cultura ágar manitol levedura (YMA) pela formação de halo de inibição em placa de Petri. Em seguida, as actinobactérias e rizóbios que tiveram maior efeito antagônico ou que não formaram halo inibidor foram caracterizadas molecularmente. Foram obtidas 60 cepas identificados em sete gêneros de actinobactérias que tiveram tolerância a variações de pH, baixa produção de melanina e uso generalista de fontes de carbono. Foi observado antagonismo in vitro com formação de halo inibidor de espécies de actinobactérias, com destaque para o gênero Streptomyces, sobre os rizóbios Rhizobium tropici, Bradyrhizobium yuanmingense e outras duas estirpes não identificadas. Este é o primeiro trabalho que aborda essa relação ecológica em micro-organismos do semiárido e revela a ocorrência de novas espécies relacionados com essa interação negativa. Com isso, confirma-se a presença de antagonismo entre esses organismos que pode direcionar estudos de certificação in vivo, contribuindo para futuros usos agrícolas e/ou ecológicos.

The equine cecal microbiome is an incredibly diverse ecosystem that is critical to the overall health of the horse. It is of particular interest to equine researchers because of the link between colic and the bacterial profile residing within the cecum. We investigated ten probiotics for their ability to reduce numbers of previously identified pathogenic microorganisms: Streptococcus bovis/equinus complex (SBEC), Escherichia coli K-12, Escherichia coli general, Clostridium difficile, and Clostridium perfringens. A preliminary in vitro study was used to measure the reduction in opportunistic bacteria that are commonly found in the equine gastrointestinal tract. The second in vitro was designed as a titration study using the three most effective probiotics from the first project. In this second stage of testing, different dosage levels were utilized to determine if dosage had an effect on bacterial reduction potential. Dosage levels included manufacturer’s recommended dosage (1x), twice the recommended dosage (2x), and three times the recommended dosage (3x). Lastly, an in vivo study was conducted using three cecally-cannulated horses in a Latin square design in order to measure opportunistic bacteria reduction potential in the live horse model. Cecal fluid characteristics, pH, volatile fatty acids, and ammonia concentrations were measured, along with bacterial concentrations. In the initial in vitro experiment, we observed that all probiotic treatments numerically decreased the bacterial concentrations in comparison to the control. There were three products that decreased bacterial concentrations most consistently: Command FT, CRS, and SmartDigest Ultra. These probiotics were chosen for a titration in vitro study. Selected probiotics were dosed at the recommended dose (1x), as well as at two times the recommended dose (2x) and three times the recommended dose. In the titration in vitro experiment, SmartDigest Ultra increased (P < 0.01) bacterial concentrations of E. coli K12 and C. perfringens at 2x and 3x. Due to a lack of statistical significance for Command FT and CRS (P ≥ 0.10), cost efficiency was used as a selection criteria. Command FT was approximately $0.27 per dose and CRS was approximately $0.18 per dose. Therefore, CRS was chosen for further testing in the following in vivo experiment. In the in vivo experiment, CRS was dosed at one times (1x) and two times (2x) the recommended dose. We observed that blood parameters, cecal fluid characteristics, and bacterial concentrations were not statistically (P ≥ 0.10) altered by treatment. Numerical increases for bacterial concentrations were observed for SBEC at 1x and 2x, C. difficile at 2x, and C. perfringens at 2x. Numerical decreases were observed for E. coli K12 at 1x and 2x and E. coli general at 1x and 2x. Overall, this study suggests that the selected probiotics can be safely used at the recommended dose.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:31:29Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2008-06-23Bitstream added on 2014-06-13T21:02:33Z : No. of bitstreams: 1 silva_amp_me_botfm.pdf: 250136 bytes, checksum: f99e12385d4a9d89890a24ca11329cf8 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Universidade Estadual Paulista (UNESP) / O trato gastrointestinal é um complexo ecossistema que associa uma microbiota residente e células de vários fenótipos alinhadas na parede epitelial que expressam complexa atividade metabólica. A microbiota pode ser alterada durante o processo infeccioso e/ou a utilização de medicamentos, o que pode interferir com a digestão e absorção de nutrientes, a rápida resposta imune contra patógenos, a estimulação e a maturação do sistema imune. O desequilíbrio deste ecossistema altera a população de microrganismos, principalmente os dos gêneros Bacteroides, Bifidobacterium e Lactobacillus da microbiota intestinal, ocasionando diversos prejuízos para o hospedeiro. Assim, este estudo teve como objetivo verificar a influência da pneumonia adquirida na comunidade e a monoterapia com levofloxacina, por via oral, sobre a microbiota intestinal normal do paciente. Por meio de análises microbiológicas das fezes de 15 pacientes estudados, verificou-se que a pneumonia adquirida na comunidade afetou a microbiota intestinal reduzindo a população de Lactobacillus e Bacteroides. O tratamento com levofloxacina alterou a população de Bifidobacterium e Lactobacillus que, no entanto, 30 dias após o término do antimicrobiano a microbiota intestinal dos pacientes retornou ao normal. Uma vez que a incidência de pneumonia adquirida na comunidade é alta e que o antimicrobiano mais utilizado para o seu tratamento é a levofloxacina, é importante que se conheçam as alterações impostas pelo antimicrobiano na microbiota intestinal dos indivíduos doentes, para que se tomem medidas que minimizem os efeitos prejudiciais decorrentes dessas alterações. / The gastrointestinal tract is a complex ecosystem that associates resident microbiota and differents phenotypes cells aligned in epithelial wall that means complex metabolic activity. The microbiota can be changed during the infectious process and/or medicines use, it can be interfered with foods digestion and nutrients absorption, the quick answer immune against pathogens, the stimulation and the immune maturation system. The imbalance of this ecosystem alters the microorganisms population, mostly the Bacteroides, Bifidobacterium and Lactobacillus genus of intestinal microbiota can represent many damages for host. So, this study has a target to verify the influence of community acquired pneumonia in the and monotherapy with levofloxacin, by oral administration, on normal intestinal microbiota of the patient. Through microbiological analysis of 15 patients stool, it could be verified that community acquired pneumonia affected a intestinal microbiota leading to decreasing Lactobacillus and Bacteroides population. The treatment with levofloxacin changed the Bifidobacterium and Lactobacillus population that, however, 30 days after the end of the antimicrobial the intestinal microbiota returned to normal. Once that the incidence of community acquired pneumonia is high and the most used antimicrobial for its treatments is levofloxacin it is important that you have knowledge of imposed changes by antimicrobial in intestinal microbiota of ill patients, and the right decisions should be made to minimize harmful effects of this changes.

Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Ciências da Saúde, Programa de Pós-Graduação em Ciências da Saúde, 2018. / Submitted by Raquel Viana (raquelviana@bce.unb.br) on 2018-07-04T19:26:47Z No. of bitstreams: 1 2018_BrunaTelesSoaresBeserra.pdf: 3183640 bytes, checksum: 08b77beb878a43136e8485ff6b3ba3ae (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana (raquelviana@bce.unb.br) on 2018-07-09T17:44:19Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2018_BrunaTelesSoaresBeserra.pdf: 3183640 bytes, checksum: 08b77beb878a43136e8485ff6b3ba3ae (MD5) / Made available in DSpace on 2018-07-09T17:44:19Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2018_BrunaTelesSoaresBeserra.pdf: 3183640 bytes, checksum: 08b77beb878a43136e8485ff6b3ba3ae (MD5) Previous issue date: 2018-07-04 / Introdução: A microbiota intestinal pode estar relacionada com a patogênese e progressão da obesidade, por meio da sua influência sobre processos metabólicos do hospedeiro, dentre eles o gasto energético. Este tem como um de seus componentes a termogênese adaptativa no tecido adiposo (TA) termogênico. Os principais estímulos à termogênese adaptativa são a sinalização 3-adrenérgica e o hormônio tireoidiano (HT). Objetivo: Avaliar o efeito da modulação da microbiota intestinal sobre o efeito da sinalização β3-adrenérgica ou pelo HT no TA. Métodos: Camundongos machos C57BL/6 foram alimentados com dieta normolipídica ou hiperlipídica e divididos aleatoriamente em seis grupos contento cinco animais cada: controle, antibióticos (ATB), agonista 3-adrenérgico (CL316,243), triiodotironina (T3), antibióticos + CL316,243 e antibióticos + T3. Os animais foram tratados com ATB na água de beber (vancomicina 0,5 g/L e ciprofloxacina 0,2 g/L por 5 semanas), CL316,243 por via intraperitoneal (1 mg/kg/dia, 5 dias) e T3 por via intraperitoneal (10 g/dia, 3 dias). Foram avaliados ganho de peso corporal, ingestão hídrica, ingestão de energia, eficiência calórica, massa dos depósitos de TA e do fígado, expressão de genes relacionados à termogênese e à ação do HT no TA, concentração sérica de TSH e atividade da desiodinase tipo 2 (DIO2) no tecido adiposo branco (TAB) subcutâneo axilar. Resultados: No cenário de dieta normolipídica, o CL316,243 reduziu a massa do TAB visceral e, na presença de ATB, reduziu a massa do TAB subcutâneo. O T3 reduziu a massa do TAB epididimal e, na presença de ATB, aumentou a massa do TA marrom (TAM). O CL316,243 ou T3 aumentaram a expressão de Ucp1 no TAB e, na presença de ATB, houve acentuação da indução de Ucp1 em resposta ao CL316,243. A modulação da microbiota reduziu a atividade da DIO2 e não modificou a concentração sérica de TSH. No cenário de dieta hiperlipídica, o uso CL316,243 e o T3, isoladamente e com ATB, não modificaram a massa de TAB. O T3 aumentou a massa do TAM. O CL316,243 e T3, isoladamente, aumentaram a expressão de Ucp1 no TAB; o co-tratamento com ATB acentuou a indução de Ucp1 pelo CL316,243 e diminuiu a indução deste transcrito pelo T3. No TAB inguinal, o uso de ATB acentuou a indução de Ppargc1a e Dio2 pelo CL316,243 e pelo T3. No TAB epididimal, o tratamento com ATB diminuiu a indução de Prmd16 pelo T3. A modulação da microbiota resultou em tendência de redução da atividade da DIO2 e não modificou a concentração sérica de TSH. Conclusão: Em condições basais, a microbiota intestinal não apresenta efeito significativo sobre a transcrição do gene que codifica a UCP-1 no TAB e no TAM, porém pode reduzir a ação do HT por diminuir sua ativação intracelular no TAB. Além disso, a resposta do TAB aos estímulos termogênicos clássicos parece ser influenciada de forma distinta pela microbiota intestinal. / Background: Gut microbiota composition is associated with the pathogenesis and progression of obesity, possibly due to its major role in regulating components of the host’s metabolic homeostasis, such energy expenditure. The latter comprises adaptive thermogenesis in adipose tissue (AT), which is classically stimulated by β3-adrenergic signaling and thyroid hormone (TH). Objective: To evaluate the effect of gut microbiota modulation on the action of β3-adrenergic signaling and TH on AT. Methods: Male C57BL/6 mice were fed a control or high fat diet and randomly assigned into six groups containing five animals each: control, antibiotics (ATB), β3-adrenergic agonist (CL316,243), triiodothyronine (T3), antibiotics + CL316,243 and antibiotics + T3. The animals were treated with ATB in drinking water (vancomycin 0.5 g/L and ciprofloxacin 0.2 g/L for 5 weeks), CL316,243 intraperitoneally (1 mg/kg/day, 5 days) and T3 intraperitoneally (10 μg/day, 3 days). Body weight gain, water intake, energy intake, caloric efficiency, AT and liver mass, expression of genes related to thermogenesis and to the action of TH in TA, serum TSH concentration and type 2 deiodinase (DIO2) activity in axillary subcutaneous white adipose tissue (WAT) were evaluated. Results: In the control diet scenario, CL316,243 reduced visceral WAT mass and, in the presence of ATB, reduced the mass of subcutaneous WAT. T3 reduced visceral (epididymal) WAT mass and, in the presence of ATB, increased brown AT (BAT) mass. Treatment with CL316,243 or T3 increased Ucp1 expression in WAT and, in the presence of ATB, there was an enhancement of Ucp1 induction in response to CL316,243. Modulation of gut microbiota reduced the activity of DIO2 in WAT and did not modify the serum TSH concentration. In the high fat diet scenario, CL316,243 and T3, alone or with ATB, did not modify the WAT mass, and T3 increased BAT mass. Both treatment with CL316,243 or T3 alone increased Ucp1 expression in WAT; co-treatment with ATB enhanced the induction of Ucp1 by CL316,243 and decreased the induction of this transcript by T3. In inguinal WAT, ATB treatment enhanced the induction of Ppargc1a and Dio2 by CL316,243 and T3. In epididymal WAT, treatment with ATB decreased the induction of Prmd16 by T3. Modulation of gut microbiota resulted in a trend towards reduction of DIO2 activity in WAT and did not modify the serum TSH concentration. Conclusion: Under basal conditions, the gut microbiota has no significant effect on the transcription of the gene encoding UCP-1 in TAB and TAM, but may reduce TH action in WAT by decreasing its intracellular activation. Moreover, WAT response to classical thermogenic stimuli seems to be influenced differently by the gut microbiota.

Dissertação apresentada ao Programa de Pós-Graduação em Ciências da Saúde da Universidade do Extremo Sul Catarinense - UNESC, como requisito parcial para a obtenção do título de Mestre em Ciências da Saúde. / A enterocolite necrosante é uma doença grave que acomete neonatos prematuros, provocando necrose parcial ou completa da parede gastrointestinal. Seu tratamento é realizado com antibióticos, nutrição parenteral, suporte avançado de vida, e em parte significante dos casos também cirurgia. A despeito do desenvolvimento tecnológico em terapia intensiva neonatal, persiste causando mortalidade elevada, com até 50% de óbitos nos pacientes que necessitaram de tratamento cirúrgico. A microbiota intestinal tem um papel importante no desenvolvimento da doença, principalmente quando alterada, apresentando predomínio de bactérias patogênicas, ao que é chamado desbiose. Na busca de novas opções de tratamento, foi pesquisado se o transplante de microbiota de um doador saudável adulto previne, ou diminui, a resposta inflamatória em um modelo murino experimental de enterocolite necrosante. O experimento utilizou 71 ratos Wistar, divididos da seguinte forma: um rato adulto doador das fezes para o experimento, 10 ratos controle de 3 dias de vida amamentados por sua progenitora (grupo controle = GC), 20 ratos Sham submetidos a indução de enterocolite necrosante, (grupo sham = GS), 20 ratos que receberam transplante de microbiota antes da indução (transplante de microbiota pré = TMPE) e 20 ratos que receberam o transplante de microbiota após a indução (transplante de microbiota pós = TMPO). A indução da enterocolite seguiu metodologia já descrita, que envolve alimentação por fórmula artificial, hipotermia, hipóxia e administração de endotoxina por via oral. O transplante de microbiota foi realizado através da admistração de 100μL da solução contendo 3x108 células, provenientes das fezes do rato doador adulto. Foram analisados a resposta inflamatória aguda através das dosagens dos níveis de TNF-α, IL-1β e IL-6, a presença de dano oxidativo pelas técnicas de TBARS e carbonil. A presença de dano nitrosativo por Western blotting de 3-nitrotirosina. A avaliação do grau de lesão histológica na mucosa intestinal foi realizada através de escore desenvolvido por Caplan et al. Este escore varia de 0, que equivale a mucosa normal, até 4, o qual representa lesão transmural. O GS teve aumento significativo em relação ao GC dos níveis de TNF-α, IL-1β e IL-6, na atividade da mieloperoxidase e equivalente MDA, e na de dosagem 3-nitrotirosina (p<0,05). O TMPE teve redução significativa em relação ao GS em relação aos níveis de de TNF-α, IL-1β e IL-6 na atividade da mieloperoxidase e equivalente MDA, e na de dosagem 3-nitrotirosina (p<0,05). O TMPO teve redução significativa em relação ao GS em relação aos níveis de IL-6 , equivalente MDA, e na de dosagem 3-nitrotirosina (p<0,05). Não houve variação significativa entre os grupos em relação a carbonilação de proteínas. No escore histológico de lesão intestinal, o GS apresentou valores maiores que os outros grupos, variando entre 1 e 3 (p<0,05). Os espécimes do GC, TMPE e TMPO apresentaram predominantemente escore 0, equivalente a mucosa normal, desta forma, sem diferença significativa entre si. O transplante de microbiota apresentou potencial terapêutico para o tratamento de enterocolite necrosante, principalmente na prevenção, quando realizada precocemente, no modelo experimental de indução da doença.

Orientador: Daniela Cardoso Umbelino Cavallini / Banca: Patricia de Oliveira Prada / Banca: Marla Simone Jovenasso Manzoni / Resumo: Objetivos: A utilização de microrganismos probióticos na redução do risco de doenças inflamatórias intestinais (DIIs), incluindo a colite ulcerativa (CU), tem se mostrado promissora, sendo que o efeito benéfico depende da cepa utilizada e da fase da patologia. O objetivo do presente estudo foi averiguar o efeito de um produto probiótico à base de soja, fermentado com Enterococcus faecium CRL 183 e Lactobacillus helveticus 416 e com adição de Bifidobacterium longum ATCC 15707, na fase aguda da colite quimicamente induzida em camundongos. Métodos: O protocolo experimental teve duração total de 14 dias e os animais foram distribuídos aleatoriamente em quatro grupos (n=10): Grupo C - Animais sadios que não receberam os produtos em estudo; Grupo CL - Animais com colite quimicamente induzida e que não receberam os produtos em estudo; Grupo CLF - Animais com colite quimicamente induzida e que receberam o produto fermentado probiótico; Grupo CLP - Animais com colite quimicamente induzida e que receberam o produto não fermentado (placebo). A indução da colite foi feita pela administração de dextran sulfato de sódio (DSS) a 3% dissolvido na água fornecida diariamente aos animais, por um período de sete dias, e os produtos foram administrados ao longo dos 14 dias de estudo. Durante o período experimental foram monitorados os seguintes parâmetros: peso corpóreo dos animais, ingestão hídrica e de ração, consistência e presença de sangue oculto ou aparente nas fezes e composição da microbiota fecal. Ao final do protocolo, os animais foram eutanasiados e o intestino grosso foi removido para realização das análises macroscópica e histológica. Resultados: De acordo com os resultados do índice de atividade da doença (IAD), os animais que consumiram o produto probiótico (CLF) apresentaram redução dos sintomas associados à colite durante... / Abstract: Objectives: The use of probiotic microorganisms in the reduction of inflammatory bowel diseases (IBD) risks, including ulcerative colitis (UC), has been shown promising, and the beneficial effect depends on the strain used and the stage of disease. The objective of this study was to investigate the effect of a probiotic soy product fermented with Enterococcus faecium CRL 183 and Lactobacillus helveticus 416 with addition of Bifidobacterium longum ATCC 15707 in the acute phase of colitis chemically induced in mice. Methods: The experimental protocol had total duration of 14 days and the animals were randomized into four groups (n = 10): Group C - healthy animals that have not received the products under study; CL Group - Animals with chemically induced colitis and who have not received the products under study; CLF Group - Animals with chemically induced colitis and receiving the probiotic fermented product; Group CLP - animals with chemically induced colitis and receiving the unfermented product (placebo). The induction of colitis was made by the administration of dextran sodium sulfate (DSS) 3% dissolved in the drinking water for a period of seven days, and the products were administered over the 14 days of the study. During the trial period the following parameters were monitored: body weight, water and food intake, consistency and presence of hidden or apparent blood in stool and composition of the fecal microbiota. At the end of the protocol, the animals were euthanized and the large intestine was removed to perform the macroscopic and histological analysis. Results: According to the results of disease activity index (DAI), the animals that consumed the probiotic product (CLF) showed a reduction of symptoms associated with colitis during the induction period, compared to the ... / Mestre

Submitted by Luiza Maria Pereira de Oliveira (luiza.oliveira@ufpe.br) on 2015-05-18T15:20:59Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) DISSERTAÇÃO Isis Regina Cypriano de Melo.pdf: 761788 bytes, checksum: 023dc18ee65f911eb3f3a7a947f05243 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-05-18T15:20:59Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) DISSERTAÇÃO Isis Regina Cypriano de Melo.pdf: 761788 bytes, checksum: 023dc18ee65f911eb3f3a7a947f05243 (MD5) Previous issue date: 2014-02-25 / Pacientes portadores de distúrbios neurológicos apresentam dificuldade de contenção de saliva, hipersalivação ou sialorréia. Uma nova opção terapêutica para o tratamento destes pacientes surge com a aplicação de toxina botulínica em glândulas salivares com objetivo de reduzir a quantidade de saliva dos mesmos. Por outro lado, sabe-se que, ao diminuir a salivação pode-se favorecer a modificação de algumas espécies bacterianas. Assim sendo este trabalho objetivou estudar a composição bacteriana da saliva de ratas quando submetidas à injeção intraglandular de toxina botulínica tipo A em glândulas submandibulares. Para tal, foram utilizadas 30 ratas albinas (Wistar), divididas em três grupos: grupo I (controle), grupo II (tratado com gelatina bovina a 0,1 ml) e grupo III (tratado com toxina botulínica 2,5U, diluído em 0,1ml de soro fisiológico). Os grupos II e III foram subdivididos de acordo com o tempo de tratamento em grupos com 15 e com 28 dias. Coletas da microbiota oral foram realizadas na saída do ducto da glândula submandibular direita através de “swab” antes, e com 15 e 28 dias após o tratamento. Os resultados mostraram que o percentual de UFCs no grupo I foi de 18%, no grupo II foi de 16% no 15º dia e 17% no 28º. No grupo III foi de 24% no 15º dia e 25% no 28º dia, ocorrendo um aumento significativo das mesmas no grupo III (p< 0,05). Na comparação das espécies bacterianas, houve uma maior variedade no grupo III em relação ao grupo controle e ao grupo II (p< 0,05). As espécies bacterianas mais frequentes no grupo I foram E. viridans (42,86%), seguidas da S. aureus (28,57%). No grupo III, ao 15º dia houve a presença da S. saprophyticus (33,33%), seguido de E. bovis (22,22%) e, no grupo II, ao 28º dia houve uma maior porcentagem das bactérias do grupo viridans, com frequência de 75% do total de bactérias (p< 0,05). Ocorreu ainda o surgimento de bactérias gram-negativas no grupo III, que não foi observada nos grupos I e II. Concluiu-se que, a toxina botulínica interferiu na microbiota oral das ratas, alterando-a quantitativa e qualitativamente. Ao passo que, quando tratadas com gelatina bovina constatou-se uma alteração qualitativa das espécies bacterianas encontradas.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2018-09-03T15:10:10Z No. of bitstreams: 1 Maria Camila de Barros Silva Leite.pdf: 2233110 bytes, checksum: b48d74525b04981dfa28c12c5e58bdd2 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-09-03T15:10:10Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Maria Camila de Barros Silva Leite.pdf: 2233110 bytes, checksum: b48d74525b04981dfa28c12c5e58bdd2 (MD5) Previous issue date: 2018-07-12 / The search for alternatives for the recovery of degraded soils is constant. The restoration of its attributes is essential for the maintenance of ecosystem services. The objective of this work was to evaluate the influence of revegetation on physical, chemical and biological attributes of a degraded soil in the Brazilian Northeast semiarid, in the dry and rainy seasons; as well as to analyze the associated microbiota and the extraction of chemical elements by different plant species. For that, an experiment was installed in the field, in November of 2013. The experimental area was fenced and divided into four blocks, with eight treatments: 1) control (without plant cultivation); 2) Atriplex plants; 3) Sabiá plants; 4) Leucaena plants; 5) Neem plants; 6) Atriplex and Sabiá consortium; 7) Atriplex and Neem consortium; 8) Atriplex and Leucaena consortium. Two evaluations were performed in the experiment, the first at the end of dry period (November/2015), 24 months after transplanting, and the second at the end of rainy season (May/2016) at 30 months. The samples were collected in three layers, 0-10, 10-30 and 30-60 cm, being carried out the physical characterization, by granulometric composition and particle density, and analyzed physical attributes (water dispersed clay - WDC, flocculation degree, soil density and saturated hydraulic conductivity - Ksat) and chemical attributes (pH in water, exchangeable cations, cation exchange capacity - CEC, total organic carbon - TOC, total nitrogen - N, C/N ratio, pH and electrical conductivity of the saturation paste, and soluble cations). The biological attributes were evaluated in the superficial layer, being rhizospheric pH, basal respiration of the soil - BRS, carbon of the microbial biomass - CMB, metabolic quotient - qCO2 and microbial quotient - qMIC. The presence of arbuscular mycorrhizal fungi (AMF) was also evaluated through glomerospores density, mycorrhizal colonization and glomalin quantification. The structure of the soil microbial community was analyzed by the fatty acid methyl ester (FAMEs) technique. In the rainy season, the plants were collected for analysis of Na, K, Ca, Mg, Cl, P and N in the plant tissue. The results of this work indicate that the plant species were efficient in improving attributes of degraded soil due to the reduction in WDC content and increase in flocculation degree, as well as decrease in soil density and increase in saturated water hydraulic conductivity (Ksat). Plant species also increased soil TOC and CMB. In the rainy season, BRS and qCO2 were lower in the cultivated area, compared to the control area. In general, the FMA spore density and mycorrhizal colonization were higher in the cultivated area. It confirmed the formation of mycorrhizal association in Atriplex nummularia (Chenopodiaceae), with rates higher than 50%. The rainy season and both crops, isolated or consortium, positively influenced diverse attributes of the soil. Regarding the extraction of sodium and chloride, the isolated or intercropping culture did not influence the phytoextractor potential of Atriplex. Atriplex consortium with Neem was more efficient at extracting K, Ca, Mg, P and N. / A busca por alternativas para a recuperação de solos degradados é constante. A restauração de seus atributos é essencial para a manutenção dos serviços ecossistêmicos. O objetivo deste trabalho foi avaliar a influência da revegetação sobre atributos físicos, químicos e biológicos de um solo degradado no Semiárido do Nordeste brasileiro, nas estações seca e chuvosa; bem como analisar a microbiota a ele associada e a extração de elementos pelas diferentes espécies vegetais. Para tanto, um experimento foi instalado em campo em novembro de 2013. A área experimental foi cercada e dividida em quatro blocos, com oito tratamentos: 1) testemunha (sem cultivo de plantas); 2) plantas de Atriplex; 3) plantas de Sabiá; 4) plantas de Leucena; 5) plantas de Nim; 6) consórcio Atriplex e Sabiá; 7) consórcio Atriplex e Nim; 8) consórcio Atriplex e Leucena. Foram realizadas duas avaliações no experimento, a primeira ao final do período seco (Novembro/2015), 24 meses após o transplantio, e a segunda ao final do período chuvoso (Maio/2016), aos 30 meses. As coletas foram realizadas em três camadas, 0-10, 10-30 e 30-60 cm, sendo realizada a caracterização física, por meio da composição granulométrica e densidade de partículas, e analisados atributos físicos (argila dispersa em água – ADA, grau de floculação, densidade do solo e condutividade hidráulica saturada – Ksat) e atributos químicos (pH em água, cátions trocáveis, capacidade de troca catiônica – CTC, carbono orgânico total – COT, nitrogênio total – N, relação C/N, pH e condutividade elétrica da pasta de saturação, e cátions solúveis). Os atributos biológicos foram avaliados na camada superficial, sendo eles o pH rizosférico, respiração basal do solo – RBS, carbono da biomassa microbiana – CBM, quociente metabólico – qCO2 e quociente microbiano – qMIC. Também foi avaliada a presença de fungos micorrízicos arbusculares (FMA), por meio da densidade de glomerosporos, colonização micorrízica e quantificação da glomalina. A estrutura da comunidade microbiana do solo foi analisada pela técnica fatty acid methyl ester (FAMEs). Na estação chuvosa, as plantas foram coletadas para a análises de Na, K, Ca, Mg, Cl, P e N no tecido vegetal. Os resultados deste trabalho indicam que as espécies vegetais foram eficientes na melhoria de atributos do solo degradado, devido à redução no teor de ADA e aumento no grau de floculação, bem como diminuição na densidade do solo e aumento na condutividade hidráulica em meio saturado (Ksat). As espécies vegetais também aumentaram o teor de COT no solo e o CBM. Na estação chuvosa, a RBS e o qCO2 foram menores na área cultivada, comparada à área testemunha. Em geral, a densidade de esporos de FMA e a colonização micorrízica foram maiores na área cultivada. Confirmou-se a formação de associação micorrízica em Atriplex nummularia (Chenopodiaceae), com taxas superiores a 50%. A estação chuvosa e ambos os cultivos, isolado ou consórcio, influenciaram positivamente diversos atributos do solo. Com relação à extração de sódio e cloro, o cultivo isolado ou consorciado não influenciou o potencial fitoextrator da Atriplex. E o consórcio de Atriplex com Nim foi mais eficiente na extração de K, Ca, Mg, P e N.

Submitted by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2018-04-12T14:41:49Z No. of bitstreams: 3 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese_LorenaNacifMarçal_PARCIAL..pdf: 1427616 bytes, checksum: c2179520b18319664c19031d35bc7acb (MD5) Reprodução Não Autorizada.pdf: 47716 bytes, checksum: 0353d988c60b584cfc9978721c498a11 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2018-04-12T14:42:04Z (GMT) No. of bitstreams: 3 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese_LorenaNacifMarçal_PARCIAL..pdf: 1427616 bytes, checksum: c2179520b18319664c19031d35bc7acb (MD5) Reprodução Não Autorizada.pdf: 47716 bytes, checksum: 0353d988c60b584cfc9978721c498a11 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-04-12T14:42:04Z (GMT). No. of bitstreams: 3 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese_LorenaNacifMarçal_PARCIAL..pdf: 1427616 bytes, checksum: c2179520b18319664c19031d35bc7acb (MD5) Reprodução Não Autorizada.pdf: 47716 bytes, checksum: 0353d988c60b584cfc9978721c498a11 (MD5) Previous issue date: 2017-08-29 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Bees, as other social insects, present complex symbiotic interactions with microorganisms, ranging from the individual level (bee) to the different microenvironments of the nest/ colony. These relationships can directly affect the nutritional potential and immunity of bees as well as influence productive processes within the colony, such as food storage and production. Considering that: i) there are few studies on the microbiota of wild bees, in constrast with the available literature of exotic bees Apis mellifera; ii) the knowledge about the symbiotic microorganisms contribute to the understanding of the ecological relationship that guarantee the colony homeostasis and it also provides tools for the prospection of products of biotechnological interest; iii) the fermentative production of bee pollen, the main food of the colony, is a little known process regardless its fundamental importance to the social colonies development; the objective of this work was to elucidate the bacterial communities associated with the bee gut and food supplies based on pollen of the Amazonian bee Melipona seminigra, with the purpose of knowing better the microorganisms associated to this bee and the process of storage and preservation of the bee pollen in the colony, glimpsing biotechnological applications. The experiments were carried out in three phases, starting with the description of the bacterial microbiota present in the pollen supply of Melipona seminigra bee, using independent culture methods (direct sequencing of microbial DNA samples) and culture-dependent methods ( Bacterial culture). Bacterial isolates obtained by pollen and larval food cultivation were evaluated for their hydrolytic enzyme production. Finally, the study of the Melipona seminigra gut microbiota was carried out based on cloning and sequencing of the 16SrRNA gene. It was identified 26 bacterial genera associated to pollen provisions of Melipona seminigra, many of which are of environmental in origin and related to natural and / or industrial fermentation processes. Changes in the bacterial composition of pollen from its collection until maturation suggest that the production of this food is mediated by a microbial succession process. Most of the bacteria isolated from pollen produce lipases, amylases, proteases and cellulases with high enzymatic indexes, indicating the potential of them for the bioprospection of enzymes of industrial interest. Regarding to the gut microbiota it was demonstrated that the bacterial populations colonize differentially the morphofunctional parts of gut, being the greater diversity of bacteria found in the middle and posterior intestines. This work resulted in unprecedented data on M. seminigra microbiota, which largely contribute to a better understanding of the complex and fascinating symbiotic relationships between social bees and microorganisms. / As abelhas, assim como outros insetos sociais, apresentam complexas interações simbióticas com microrganismos, que vão desde o nível do indivíduo (abelha) até os diferentes microambientes do ninho/colônia. Estas relações afetam diretamente a imunidade e o potencial nutricional das abelhas bem como influenciam processos produtivos dentro da colônia, como a produção e armazenamento de alimentos. Considerando que: i) são escassos os estudos sobre a microbiota de abelhas silvestres, sendo grande parte da literatura voltada para as abelhas exóticas Apis mellifera; ii) o conhecimento dos microrganismos simbióticos contribue para o entendimento das relações ecológicas que garantem a homeostase da colônia bem como fornece ferramentas para a prospecção de produtos de interesse biotecnológico; iii) a produção fermentativa do pólen, principal alimento da colônia, é um processo pouco conhecido embora fundamental para o desenvolvimento das colônias de abelhas sociais; o objetivo deste trabalho foi elucidar as comunidades bacterianas associadas às provisões alimentares à base de pólen da abelha amazônica Melipona seminigra e ao seu intestino, com a finalidade de se conhecer melhor os microrganismos associados à esta abelha e ao armazenamento e preservação do pólen na colônia, vislumbrando aplicações biotecnológicas. Os experimentos deste trabalho foram realizados em três fases, iniciando-se com a descrição da microbiota bacteriana presente em potes e células de alimento da abelha Melipona seminigra, por meio de métodos independentes de cultivo (sequenciamento direto de DNA microbiano das amostras) e métodos dependentes de cultivo (cultivo bacteriano). Os isolados bacterianos obtidos pelo cultivo do pólen e alimento larval foram avaliados quanto ao seu potencial de produção de enzimas hidrolíticas e, por fim, realizou-se o estudo da microbiota bacteriana intestinal, a partir da clonagem gênica e sequenciamento do gene 16S rRNA. Foram identificados 26 gêneros bacterianos associados às provisões polínicas de Melipona seminigra, muitos dos quais são de origem ambiental e relacionados com processos fermentativos naturais e/ou industriais. Mudanças na composição bacteriana do pólen, desde a sua coleta até sua maturação sugerem que a produção deste alimento é mediada por um processo de sucessão microbiana. Grande parte das bactérias isoladas do pólen produz lipases, amilases, proteases e celulases com altos índices enzimáticos, indicando o potencial dessas bactérias para a bioprospecção de enzimas de interesse industrial. Em relação à microbiota intestinal, demonstrou-se que as populações bacterianas colonizam diferencialmente as partes morfofuncionais do intestino, sendo a maior diversidade de bactérias encontradas nos intestinos médios e posteriores. Este trabalho resultou em dados inéditos acerca da microbiota associada a abelhas M. seminigra, que contribuem para o melhor entendimento das complexas e fascinantes relações simbióticas entre abelhas sociais e microrganismos.

Made available in DSpace on 2014-06-12T18:27:29Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo1004_1.pdf: 1251472 bytes, checksum: 1f6e464692ea89b8cd077af78f9fa70b (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2010 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / A injeção intravítrea representa um dos maiores desafios na terapêutica oftalmológica atual para o tratamento da degeneração macular relacionada à idade, na forma exsudativa, embora as injeções intravítreas possam levar a endoftalmite póscirurgica, onde a fonte pricipal é a microbiota conjuntival. Objetivos: descrever a microbiota conjuntival bacteriana e fúngica de portadores de degeneração macular relacionada à idade no peri-operatório com uso de injeção intravítrea de antiangiogênico em um esquema terapêutico trimestral. Métodos: foi realizado um estudo de série de casos com 35 pacientes submetidos a injeção intravítrea de antiangiogênico para o tratamento de DMRI e 30 pacientes controles sadios, na Fundação Altino Ventura-PE. O material da conjuntiva foi coletado em 4 momentos: (t0) antes da primeira aplicação de antiangiogênico; (t1) após uso tópico de 3 dias de antibiótico; (t2) antes da terceira aplicação de antiangiogênico e (t3) no retorno de 30 dias após término, para o grupo DMRI. Com relação ao grupo controle, foi feita apenas uma coleta para o islomento bacteriano e fúngico, correspondente a t0. A coleta foi através de swab no fundo de saco conjuntival inferior, e colocado em meio BHI.O processo de investigação microbiológica seguia as seguintes etapas:bacterioscopia, cultura e antibiograma. Resultados: para o grupo DMRI, o houve crescimento positivo das culturas para os momentos t0, t1, t2 e t3, cujos percentuais foram respectivamente de 91,4%; 28,6%; 74,3% e 94,3%. Para o grupo controle, foi realizada a cultura da microbiota apenas no momento t0, evidenciando-se um percentual de 93,3% de culturas positivas. Para ambos os grupos houve maior freqüência de bactérias Gram-positivas em todos momentos, prevalecendo às espécies Staphyloccocus aureus e Staphyloccocus coagulase negativo. Os fungos mais frequentemente isolados Aspergillus sp e Penicillium sp para ambos grupos.Conclusão: não houve diferença na distribuição dos micro-organismos isolados na conjuntiva dos portadores de DMRI, comparada aos pacientes controles