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Diversidade e estrutura funcional de comunidades microbianas presentes na água de uma cava e lagoa de rejeitos de uma região mineradora desativada /

Constancio, Milena Tavares Lima January 2018 (has links)
Orientador: Eliana Gertrudes de Macedo Lemos / Banca: Rodrigo Mateus Pereira / Banca: Maria Benincasa Vidotti / Banca: Danillo Oliveira de Alvarenga / Banca: Everlon Cid Rigobelo / Resumo: O interesse no estudo de comunidades microbianas de ambientes pouco avaliados, impactados e/ou extremos tem aumentado significativamente. Dentre os ambientes estudados, encontram-se as águas residuais de áreas de mineração. Com o grande número de cavas e lagoas de rejeitos gerados através da atividade mineradora e o pouco estudo deste tema no Brasil, foi desenvolvido este trabalho, onde avaliamos a taxonomia e capacidade funcional da comunidade microbiana. As amostras de água foram coletadas de uma cava de mineração e uma lagoa de rejeitos de uma região anteriormente utilizada para extração de minério de ferro no Centro de Biodiversidade (CeBio) da empresa VALE/SA, em Sabará/MG. Análises do perfil de atividade metabólica indicaram um excelente desempenho quanto à degradação de diferentes compostos. Além disso, o isolamento com métodos tradicionais de cultivo mostrou que algumas bactérias apresentam capacidade em produzir diferentes enzimas de interesse biotecnológico. O DNA foi extraído e sequenciado através de técnicas metagenômicas, o sequenciamento do gene de 16S rRNA foi realizado na plataforma Ion PGM™. Esta análise, além de revelar a taxonomia da comunidade presente na água da cava e lagoa, identificou o perfil funcional indicando enriquecimento de subsistemas importantes para ambas as amostras. Adicionalmente para a água da cava de mineração, foi realizado o sequenciamento do DNA total na plataforma Ion Proton™, que através de análises com o banco de dados SEED revelou... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The interest in the study of microbial communities of low evaluated, impacted or extreme environments has increased significantly. Among the studied environments, there is the wastewater from mining areas. Due to the large number of reject pits and lagoons generated by the mining activity and the lack of study of this theme in Brazil, this study was developed to evaluate the taxonomy and functional capacity of the microbial community. The water samples were collected from a mining pit and a reject lagoon from a region formerly used for iron extraction at the Biodiversity Center (CeBio) from VALE/SA, in Sabará/MG. Analyzes of the metabolic activity profile indicated an excellent performance regarding the degradation of different compounds. Moreover, the isolation with traditional methods of culture showed that some bacteria have the capacity to produce different enzymes of biotechnological interest. The DNA was extracted and sequenced using metagenomic techniques, the 16S rRNA gene sequencing was performed on the Ion PGM™ platform. This analysis, in addition to revealing the taxonomy of the community present in the water of the pit and the lagoon, identified the functional profile indicating enrichment of important subsystems for the studied samples. In addition to the water from the mining pit, the total DNA sequencing was carried out on the ION Proton™ platform, which, through analysis with the SEED database, revealed genes associated with cell maintenance and the nitrogen c... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor
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Estudos de rotas de beneficiamento da nefelina-sienito para aplicação como fundente na massa cerâmica do porcelanato

Volkmann, Alexandre Ritter January 2004 (has links)
Este trabalho consiste em um estudo de caracterização e viabilidade econômica, para implantação de uma linha de processo, para beneficiar uma jazida de nefelina-sienito. Esta jazida pertence à Mineração e Pesquisa Brasileira Ltda e está localizada no Domo Alcalino do Planalto Lageano, no Estado de Santa Catarina. Nefelina-sienito é uma rocha ígnea de origem plutônica, com ausência de quartzo livre, constituída por minerais félsicos que são os feldspatos e feldspatóides e máficos, que são o piroxênio e anfibólio, associados a minerais acessórios como zircão, apatita, titanita e minerais opacos. Sua principal utilização é como fundente para a indústria cerâmica e vidreira. Este insumo concorre com o Feldspato neste segmento, com vantagens intrínsecas, como teor mais elevado de álcalis (Na2O+K2O), homogeneidade da jazida, além da proximidade do centro consumidor. Por outro lado, apresenta uma grande desvantagem que limita sua utilização na indústria cerâmica, e praticamente exclui seu emprego para o porcelanato e esmalte, que é a interferência na cor do produto final, reflexo do elevado teor de ferro. O objetivo deste trabalho é obter um produto que sirva de insumo (matériaprima) fundente à indústria cerâmica, especificamente na linha de revestimentos nobres, para a fabricação de um piso cerâmico de alto valor agregado, denominado grêsporcelanato Para atingir este objetivo, definiu-se as etapas e ensaios a serem realizados para extrair os minerais máficos (cromóforos), ou seja, aqueles com ferro presente em sua estrutura, e com isto enquadrar o produto dentro dos padrões exigidos pela indústria cerâmica. Inicialmente realizou-se uma caracterização mineralógica da nefelina-sienito, identificando suas características estruturais e texturais e seus minerais constituintes, diferenciando os máficos dos félsicos, estudando suas características físicas, químicas e morfológicas. Posteriormente, efetuou-se a caracterização tecnológica avaliando o grau de liberação destes minerais e, por fim, ensaios de beneficiamento, utilizando-se as técnicas de flotação e separação magnética a seco e a úmido, avaliando suas performances e definindo a rota de processo mais indicada.Elaborou-se um fluxograma de processo específico para esta linha de produção considerando os equipamentos que a empresa já possui, buscando reduzir o custo de implantação. Definida a linha de processo e os equipamentos necessários para sua implantação, avaliou-se os investimentos e custos envolvidos para duas escalas de produção. Por fim elaborou-se um fluxo de caixa para avaliar a viabilidade econômica do projeto. Os resultados encontrados confirmaram a viabilidade técnica e econômica para implantação desta nova linha de processo.
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Zoneamento da vegetação e sua relação com metais pesados na mina Volta Grande, Lavras do Sul, RS

Frizzo, Taís Cristine Ernst January 2002 (has links)
O conhecimento da vegetação em regiões de ocorrências minerais de cobre e ouro torna-se de grande importância para o desenvolvimento de tecnologias limpas na reabilitação de áreas degradadas pela mineração (fitorremediação) e na bioprospecção mineral no Estado. Buscou-se verificar a relação entre a organização espacial e fitossociológica das unidades e subunidades de vegetação na mina Volta Grande, Lavras do Sul, RS e a presença de cobre nas mineralizações. Com base em Ecologia de Paisagem, realizou-se investigações fitossociológicas, avaliação do conteúdo de cobre em raízes e folhas de Axonopus affinis, Eugenia uniflora, Heterothalamus alienus, Saccharum angustifolium, Schizachyrium microstachyum e Schinus lentiscifolius e o zoneamento da vegetação com sobreposição ao mapa de estruturas mineralizadas conhecidas. De acordo com os resultados obtidos, sugere-se que a distribuição das unidades e subunidades de vegetação (unidade de vegetação Eugenia uniflora – Scutia buxifolia, com subunidades Eugenia uniflora – Cupania vernalis e Eugenia uniflora – Allophylus edulis; unidade de vegetação Schinus lentiscifolius – Heterothalamus alienus; unidade de vegetação Eryngium horridum – Saccharum angustifolium, com subunidade Eryngium horridum – Piptochaetium montevidense e unidade de vegetação Axonopus affinis – Paspalum pumilum) pode estar relacionada à posição geomorfológica, à declividade, à umidade do solo e ao manejo para o uso do gado A unidade de vegetação Schinus lentiscifolius – Heterothalamus alienus parece estar relacionada às ocorrências de mineralizações (filões) de cobre e ouro, sendo necessária uma comparação com outras áreas mineralizadas e não-mineralizadas no Estado para utilizar esse dado em prospecção mineral. A espécie Axonopus affinis possui em suas raízes um conteúdo de cobre muito maior do que o considerado normal em plantas, sendo indicada para estudos mais detalhados quanto a sua aplicabilidade na reabilitação de áreas degradadas pela mineração no Rio Grande do Sul.
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Uma avaliação das interações de alunos em atividades colaborativas apoiadas em técnicas de mineração para identificação de parâmetros para análise de desempenho

Padilha, Thereza Patrícia Pereira January 2005 (has links)
Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro Tecnológico, Programa de Pós-Graduação em Ciência da Computação. / Made available in DSpace on 2013-07-16T02:12:03Z (GMT). No. of bitstreams: 0Bitstream added on 2013-07-16T19:52:06Z : No. of bitstreams: 1 221659.pdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / A facilidade de comunicação introduzida pelo avanço das redes de comunicação tem viabilizado o desenvolvimento de vários ambientes de aprendizado colaborativo para a Educação a Distância via Internet. Esse avanço tem possibilitado a interação síncrona e assíncrona entre os participantes (aluno-aluno ou aluno-professor), independentemente de tempo e local. Um importante tópico de pesquisa relacionado com os ambientes de aprendizado colaborativo diz respeito à análise das interações dos alunos na execução das atividades. Muitas interações de alunos no aprendizado colaborativo podem ser capturadas e armazenadas num banco de dados para análises futuras. Entretanto, a extração de informações úteis nesse banco é quase impossível sem o uso de técnicas de mineração. Este trabalho propõe um modelo de análise das interações dos alunos que integra técnicas de mineração de textos e de dados para identificar o desempenho de colaboração. Dentre as interações analisadas, existem índices quantitativos, que fornecem um aspecto numérico das interações realizadas e índices qualitativos, que representam aspectos cognitivos e sociais das interações. A técnica de mineração de textos atua como uma forma alternativa para categorizar as intenções dos alunos em interações textuais de acordo com a taxonomia de Soller. A técnica de mineração de dados, por sua vez, encontra padrões de classificação para a construção de relatórios de desempenho em três níveis de detalhamento: inter-grupos, grupos e alunos. O modelo proposto foi incorporado ao ambiente de aprendizado colaborativo RESOLVE que dispõe das ferramentas de comunicação chat, editor de texto, votação e agenda para a resolução de problemas. A arquitetura, os aspectos da implementação e as interfaces desse ambiente são apresentados. Experimentos, com dez grupos de três pessoas cada, foram realizados para verificar a viabilidade do modelo, que se mostrou eficiente para auxiliar o professor no acompanhamento das atividades desempenhadas pelos alunos.
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Proposição de uma metodologia para o desenvolvimento de uma arquitetura de informações como uma etapa de implantação de um datamining de suporte à tomada de decisão gerencial

Mafra, Denis Teixeira January 2005 (has links)
Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro Sócio-Econômico. Programa de Pós-Graduação em Administração / Made available in DSpace on 2013-07-16T02:17:29Z (GMT). No. of bitstreams: 0 / A Tecnologia da Informação - TI emerge como uma mudança inevitável para as organizações que almejam a permanência no mercado. Nesse sentido, pode-se afirmar que o uso dessa ferramenta permite às organizações uma rapidez no acesso as informações que são necessárias para um monitoramento eficiente dos seus desempenhos. Nesse sentido, o problema central do estudo é: Como nortear o desenvolvimento de um arquitetura de informações sendo uma etapa de implantação de um Datamining de suporte à tomada de decisão gerencial ? Dessa forma, fixou-se o seguinte objetivo geral: Propor uma metodologia para o desenvolvimento de uma arquitetura de informações como uma etapa de implantação de um Datamining de suporte à tomada de decisão gerencial para o Planejamento e Sistema de Medição de Desempenho - Balanced Scorecard - do SENAI/SC. Para alcançá-lo, foram fixados objetivos específicos. Na caracterização da pesquisa, o método utilizado quanto à abordagem do problema foi qualitativo e a perspectiva de estudo quanto à dimensão temporal consistiu no estudo cross-sectional. A pesquisa foi bibliográfica e estudo de caso.Quanto à classificação com base em seus objetivos gerais, a pesquisa foi exploratória e descritiva. O objeto de estudo foi o SENAI/SC. Foram propostas e apresentadas as seguintes Ferramentas de Gestão e dentre elas, o objeto do estudo em questão - Planejamento e Sistema de Medição de Desempenho - o Balanced Scorecard (BSC). Para o BSC, apresentaram-se: o Mapa Estratégico, as Perspectivas, os Objetivos Estratégicos, e o Painel de Desempenho Balanceado (Indicadores e Iniciativas Estratégicas). Concernente ao objetivo central do trabalho, foram apresentadas as etapas necessárias para o desenvolvimento de uma arquitetura de informações: 1) Mapeamento dos processos; 2) Implantação de um sistema de informações gerenciais (ERP); 3) Mapeamento e descrição dos softwares da organização; 4)Identificação do objetivo e da fórmula de cálculo dos indicadores; 5) Mapeamento e descrição de todas os dados necessários para a medição dos indicadores; 6) Identificação das fontes, responsáveis e prazos de cada um dos dados; e 7) Verificação de possíveis inter-relações do mesmo dado com mais de um indicador. Cada uma dessas etapas foi aplicada no BSC do SENAI/SC, sendo que foram coletadas as principais informações para o desenvolvimento da arquitetura de informações. Com base na arquitetura, demonstrou-se também a construção de Datamart´s de Indicadores do BSC, que irão compor o Datawarehouse necessário para que o Datamining possa filtrar as informações e permitir a geração de informações gerenciais para a tomada de decisão.
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Estudo de estabilidade de taludes da Mina de Tapira - MG

Reis, Renato Capucho January 2010 (has links)
Submitted by Maurílio Figueiredo (maurilioafigueiredo@yahoo.com.br) on 2013-02-22T21:45:06Z No. of bitstreams: 1 DISSERTAÇÃO_EstudoEstabilidadeTaludes.pdf: 7704572 bytes, checksum: 53a2816fc8193db399d39efe0f9f10cd (MD5) / Approved for entry into archive by Neide Nativa (neide@sisbin.ufop.br) on 2013-02-25T14:27:47Z (GMT) No. of bitstreams: 1 DISSERTAÇÃO_EstudoEstabilidadeTaludes.pdf: 7704572 bytes, checksum: 53a2816fc8193db399d39efe0f9f10cd (MD5) / Made available in DSpace on 2013-02-25T14:27:47Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DISSERTAÇÃO_EstudoEstabilidadeTaludes.pdf: 7704572 bytes, checksum: 53a2816fc8193db399d39efe0f9f10cd (MD5) Previous issue date: 2010 / ABSTRACT: Geotechnical engineering has, in increasing scale, played a very important role in civil and mineral enterprises, especially in terms of slope projects. Therefore, the increasing importance that the stability of slopes in soils, fresh and weathered rock currently has, are due to more and more significant dimensions imposed on both open-pit mining excavations and cuts, which are required in either railways or roads with heavy traffic. Roads usually have sections with more than one hundred and fifty meters; when it comes to open-pit mining, the slopes reach over than 300 meters high. Taking into account the mining context, the angle of the final slope represents the optimization of both economy and safety of mining excavations. Consequently, the study of the slope stability in an open-pit mining involves the determination of the excavation geometry with direct access to the mineral of interest and with the highest security possible. This geometry is composed of the determination of the individual slope angles, general mine angles and benches heights and sizes. The aim of this work consists in deterministic evaluation of the slopes stability in Tapira mine where there are friable materials (layers of clay, titanium and friable phosphate). This work is based on an extensive geotechnical investigation of the slope materials which included the collection of representative samples of those materials as well as the execution of laboratory trials for the characterization of local soils and the determination of corresponding strength parameters. The results were consistent with both data from previous investigations and the field observations. They confirmed the adequacy of working methodology adopted in this research. / A engenharia geotécnica tem desempenhado, em escala crescente, um papel de enorme relevância em empreendimentos civis e minerais, particularmente em termos de projetos de taludes. Com efeito, a importância crescente que a estabilidade de taludes em solos, rochas frescas e rochas muito alteradas tem atualmente deve-se às dimensões cada vez mais significativas que são impostas às escavações mineiras em lavra a céu aberto e aos grandes cortes exigidos em ferrovias e rodovias de grande tráfego. É comum ter-se em rodovias cortes com mais de uma centena e meia de metros; em lavras a céu aberto, os taludes chegam a atingir mais de 300 metros de altura. No contexto da mineração, o ângulo do talude final representa a otimização do binômio envolvendo a economia e a segurança das escavações de lavra. Assim, o estudo da estabilidade dos taludes de uma cava de mineração a céu aberto implica a determinação da geometria de escavação com acesso direto ao bem mineral de interesse e com a maior segurança possível. Esta geometria contempla a determinação dos ângulos dos taludes individuais, ângulos gerais da cava, alturas de bancadas e dimensões das bermas. A proposta desse trabalho consiste na avaliação determinística da estabilidade dos taludes da Mina de Tapira, constituídos por materiais friáveis (camadas de argilas, titânio e fosfato friável), com base em uma ampla campanha de investigação geotécnica dos materiais dos taludes, que compreendeu a coleta de amostras representativas dos mesmos e a execução de ensaios de laboratório para a caracterização dos solos locais e a determinação dos correspondentes parâmetros de resistência. Os resultados obtidos foram consistentes tanto com os dados das investigações prévias como com as observações de campo e confirmaram a adequação da metodologia de trabalho adotada nesta pesquisa. ______________________________________________________________________________________________________________________________________________________
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Teorias de redes sociais aplicada ao problema de classificação online com mudança de conceito / Heitor Murilo Gomes ; orientador, Fabrício Enembreck

Gomes, Heitor Murilo January 2012 (has links)
Dissertação (mestrado) - Pontifícia Universidade Católica do Paraná, Curitiba, 2012 / Bibliografia: p. 107-111 / Este trabalho compreende o desenvolvimento do método de conjunto de classificadores baseado em Redes Sociais SAE (Social Adaptive Ensemble ? Conjunto de Classificadores Adaptativos Sociais) para classificação de streams de dados (Classificação Online). / This work encompasses the development of a new ensemble classifier based on Social Networks named SAE (Social Adaptive Ensemble) for Stream Classification. Within Stream Classification, concept drift is considered one of the most important issues. Ensem
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Análise dos impactos sócio-ambientais decorrentes da mineração na Chapada do Araripe – Nova Olinda/Ceará / Analysis of the socio environmental impacts due to mining in Araripe - Nova Olinda/Ceará

Bezerra, Lireida Maria Albuquerque January 2013 (has links)
BEZERRA, Lireida Maria Albuquerque. Análise dos impactos sócio-ambientais decorrentes da mineração na Chapada do Araripe – Nova Olinda/Ceará. 2013. 139 f. Dissertação (Mestrado em geografia)- Universidade Federal do Ceará, Fortaleza-CE, 2013. / Submitted by Elineudson Ribeiro (elineudsonr@gmail.com) on 2016-10-14T12:36:01Z No. of bitstreams: 1 2013_dis_lmabezerra.pdf: 4927300 bytes, checksum: 0c8ac8d94ef161f1cce44d8b6b159a67 (MD5) / Approved for entry into archive by Jairo Viana (jairo@ufc.br) on 2016-10-18T18:55:53Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2013_dis_lmabezerra.pdf: 4927300 bytes, checksum: 0c8ac8d94ef161f1cce44d8b6b159a67 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-10-18T18:55:53Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2013_dis_lmabezerra.pdf: 4927300 bytes, checksum: 0c8ac8d94ef161f1cce44d8b6b159a67 (MD5) Previous issue date: 2013 / The research aims to analyze the process of socio environmental degradation in Chapada do Araripe , in the city Nova Olinda/Ceará, resulting from the extraction and exploitation of limestone, offering theoretical elements that contribute to the emergence of alternatives that contribute to mitigate the damage caused by the mining activity in the capitalist mold. The methodology was based on a qualitative analysis, based on the understanding of the subjective characteristics and on the information related to the communities living around the mining activity, and also on the specific literature on the study subject. The analysis of the environmental impacts arisingfrom the mining in Nova Olinda is of paramount importance for thecomprehension of the intensity of the environmental impacts and how theycompromise the Chapada do Araripe and its surroundings, as well as the historical and paleontological records of the sedimentary basin of Araripe. It is noticed that the intensity of theenvironmental impacts result from thenon-sustainable exploitation, compromising the environment and its surroundings, with the waste tailings, changes in vegetation and extraction that degrades and impacts the local landscape. / A pesquisa objetiva analisar o processo de degradação sócio ambiental na Chapada do Araripe, no município de Nova Olinda/Ceará, decorrente da extração e exploração do calcário, oferecendo elementos teóricos, que contribuam para o surgimento de alternativas que contribuam para mitigar os estragos provocados pela atividade da mineração nos moldes capitalistas. A metodologia partiu de uma análise qualitativa, com base no entendimento das características subjetivas e das informações relacionadas às comunidades que vivem no entorno da atividade mineradora e, também o embasamento de literatura específica na área do objeto de estudo. A análise dos impactos ambientais decorrentes da mineração em Nova Olinda é de suma importância para a compreensão da intensidade dos impactos ambientais e como estes comprometem a Chapada do Araripe e seu entorno, bem como, os registros históricos e paleontológicos da bacia sedimentar do Araripe. Percebe-se, que o grau de intensidade dos impactos ambientais resulta de uma exploração não sustentável comprometendo o meio ambiente e seu entorno, com o desperdício do rejeito, alteração na vegetação e uma extração que degrada e impacta a paisagem local.
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Zoneamento da vegetação e sua relação com metais pesados na mina Volta Grande, Lavras do Sul, RS

Frizzo, Taís Cristine Ernst January 2002 (has links)
O conhecimento da vegetação em regiões de ocorrências minerais de cobre e ouro torna-se de grande importância para o desenvolvimento de tecnologias limpas na reabilitação de áreas degradadas pela mineração (fitorremediação) e na bioprospecção mineral no Estado. Buscou-se verificar a relação entre a organização espacial e fitossociológica das unidades e subunidades de vegetação na mina Volta Grande, Lavras do Sul, RS e a presença de cobre nas mineralizações. Com base em Ecologia de Paisagem, realizou-se investigações fitossociológicas, avaliação do conteúdo de cobre em raízes e folhas de Axonopus affinis, Eugenia uniflora, Heterothalamus alienus, Saccharum angustifolium, Schizachyrium microstachyum e Schinus lentiscifolius e o zoneamento da vegetação com sobreposição ao mapa de estruturas mineralizadas conhecidas. De acordo com os resultados obtidos, sugere-se que a distribuição das unidades e subunidades de vegetação (unidade de vegetação Eugenia uniflora – Scutia buxifolia, com subunidades Eugenia uniflora – Cupania vernalis e Eugenia uniflora – Allophylus edulis; unidade de vegetação Schinus lentiscifolius – Heterothalamus alienus; unidade de vegetação Eryngium horridum – Saccharum angustifolium, com subunidade Eryngium horridum – Piptochaetium montevidense e unidade de vegetação Axonopus affinis – Paspalum pumilum) pode estar relacionada à posição geomorfológica, à declividade, à umidade do solo e ao manejo para o uso do gado A unidade de vegetação Schinus lentiscifolius – Heterothalamus alienus parece estar relacionada às ocorrências de mineralizações (filões) de cobre e ouro, sendo necessária uma comparação com outras áreas mineralizadas e não-mineralizadas no Estado para utilizar esse dado em prospecção mineral. A espécie Axonopus affinis possui em suas raízes um conteúdo de cobre muito maior do que o considerado normal em plantas, sendo indicada para estudos mais detalhados quanto a sua aplicabilidade na reabilitação de áreas degradadas pela mineração no Rio Grande do Sul.
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Determinantes e forças seletivas na evolução das proteínas

Encinas Ponce, Luis Fernando January 2014 (has links)
Made available in DSpace on 2015-11-11T12:12:01Z (GMT). No. of bitstreams: 2 luis_ponce_ioc_dout_2014.pdf: 1486134 bytes, checksum: 9dd0c29de095c29028394b797fd2d769 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2015-06-10 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / A análise de grandes quantidades de dados aproveitando o poder computacional de ferramentas \2015open source\2016 que estão disponíveis na internet é o que veio a conhecer-se como quarto paradigma da investigação científica. Em muitas áreas do conhecimento como a Astronomia, a Física e Geologia, a experimentação, o desenvolvimento teórico e o poder computacional (os três primeiros paradigmas) têm dado lugar à análise rotineira de grandes quantidades de dados e o desenvolvimento de novos métodos, conceitos e teorias que permitam interpretar a informação gerada por novas tecnologias. No campo da biologia, esta mudança nos paradigmas da investigação científica supõe um desafio na hora de encarar uma questão biológica; mas, em contrapartida, ela oferece a oportunidade de validar teorias clássicas e/ou testar hipóteses novas. Precisamente neste contexto, a presente tese aborda duas questões pertinentes ao campo da biologia evolutiva: Quais são os fatores que determinam a evolução de uma proteína? e Qual é a natureza da seleção cinética traducional?. Estas perguntas são, em principio, relevantes no âmbito teórico; por outro lado, sua compreensão, implicações e perspectivas têm também espaço importante na área experimental A tese está estruturada da seguinte forma: No Capitulo um se descreve uma combinação de análise de texto com outras técnicas de mineração de dados para identificar, classificar, integrar e modelar associações existentes entre caracteres genômicos que favorecem ou impedem a acumulação de substituções nucleotídicas ao nível das regiões codificadoras. Nossa metodologia permitiu identificar características genômicas como a eficiência traduçional, a instabilidade estrutural e as regiões de baixa complexidade que em principio poderiam constituir determinantes da evolução das proteínas. Construtos latentes como esquema de integração de dados biológicos mostraram que, em vez de considerar o nível de mRNA como o maior determinante da evolução das proteínas, outras variáveis relacionadas com a expressão de um gene podem ser igualmente importantes Finalmente, graças a um modelo de fatores Bayesiano, foi possível estimar os componentes de um sistema de tradução de proteínas identificado com a eficiência e adaptação da maquinaria celular. No Capitulo dois, o controle cinético exercido pelos códons raros durante a tradução das proteínas é abordado com a ajuda de uma análise de custo-benefício que tenta identificar a natureza do que veio a denominar-se como seleção cinética traducional. Diferenças entre proteínas estáveis e instáveis apóiam permitiram identificar a ação da regulação cinética traducional sobre determinado grupos de genes. Os padrões de substituções sinônimas encontrados nas proteínas instáveis permitiram estender nossa discussão apontando à existência de combinações de códons num espaço genotípico determinado que assegure a conservação da estrutura terciária de uma proteína, mas, ao mesmo tempo procure a otimização da cinética da sua tradução / In scientific discovery, three acknowledged paradigms are experimental, theoretical and computational. In the last ten years however, scientists have been over whelmed with large amounts of data coming from high - throughput technologies that are analyzed tak ing advantage of computational power, the internet and open source data - analysis tools. Late researcher of Microsoft, Dr. James Gray (1944 - 2012 in absentia ) ca lled this ―the fourth paradigm of scientific research‖ and urged the need to acknowledge that making sense of data will turn routine in most areas of science. For biologists and others involved in life sciences, this paradigm shift may address daunting cha llenges, however; in return, it offers the oppo rtunity to examine old theories and test new hypothesis. It is within this context that the thesis presented here tackles two fundamental problems of evolutionary biology: What are the constraints of protein e volution? and what is the underlying nature of the kinetic - translational selection?. Although at first glance these questions might appear exclusively relevant for the theoretical field of evolutionary biology, we consider their implications for other area s such as biotechnology and clinical applications. The thesis is organized as following: In Chapter one , we present a combination of text analysis with other data mining techniques to identify, classify, integrate and model existing associations between g enomic c haracters that favor o r hinder the rate at which proteins evolve Our methodology allowed us to identify genomic features such as translational efficiency, structural instability and low - complexity regions that appear to constitute constraints of p rotein evolution. Latent constructs were used as an alternative to integrate biological data and they showed that instead of using mRNA levels as primary determinants of protein evolution, other expression - related factors should be considered. We devised a Bayesian factor model to estimate the components of a protein translation system identified with the efficiency and adaptation of the cellular machinery. In Chapter two , we aboard the fine - tuning kinetic control of rare codons during protein translation i n the context of a cost - benefit analysis devised to identify the action o f recently proposed ki netic translational selective force. The pattern of synonymous substitutions found in proteins classified as structurally unstable led us to extend our discussio n to the existence of a determined genotypic space in which combinations of codons are ―tested‖ in order to optimize the protein synthesis kinetics maintaining the tridimensional structure.

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