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Identificação e validação do perfil neurolinguístico de programadores através da mineração de repositórios de software

Rodrigues Júnior, Methanias Colaço 25 January 2013 (has links)
Submitted by Santos Davilene (davilenes@ufba.br) on 2013-01-25T11:15:23Z No. of bitstreams: 1 TESE_Methanias Rodrigues Júnior.pdf: 1771083 bytes, checksum: a086d4543ad576bc8ac845022acd6eb5 (MD5) / Made available in DSpace on 2013-01-25T11:15:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1 TESE_Methanias Rodrigues Júnior.pdf: 1771083 bytes, checksum: a086d4543ad576bc8ac845022acd6eb5 (MD5) / Hodiernamente, o processo de desenvolvimento de software pode contar com a utilização de diversas ferramentas de apoio. Os sistemas de controle de versão, as listas de discussão entre as pessoas envolvidas no projeto e os sistemas de rastreamento de erros são usados freqüentemente para ajudar a controlar o andamento de projetos de software, produzindo repositórios de dados históricos. Nos últimos anos, pesquisadores vêm realizando análises lingüísticas nas listas de discussão de projetos de software para compreender as complexidades e especificidades do seu desenvolvimento. Uma abordagem inovadora para isso é usar a Teoria da Neuro-Lingüística. A Neuro-Lingüística postula que indivíduos, em contextos específicos, utilizam um sistema representacional preferencial (SRP) para cognição. Isto significa que apesar de diferentes recursos e canais cognitivos serem usados pelos desenvolvedores para entender o software, existem sistemas representacionais preferidos pelos mesmos. Nesta tese, apresentamos uma ferramenta de análise psicométrica baseada na Neuro-Lingüística (NEUROMINER) para classificar os Sistemas Representacionais Preferidos (SRP) de desenvolvedores de software. A avaliação experimental da abordagem foi realizada em três experimentos que visaram testar a classificação do SRP: (1) Um estudo realizado nas listas de discussão dos projetos do servidor Apache e do PostgreSQL; (2) Uma pesquisa de campo com engenheiros de software para estabelecer quais os tipos de sistemas representacionais são os preferidos pelos mesmos; e (3) Um experimento controlado feito na indústria para avaliação da efetividade da ferramenta neste tipo de ambiente. Os resultados indicaram que a nossa abordagem pode ser usada para classificar engenheiros de software com relação às suas preferências de representação para cognição. Esta classificação pode nortear a alocação de desenvolvedores em tarefas específicas e, possivelmente, melhorar a comunicação em organizações de desenvolvimento de software. / Salvador
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Framework de integração para o modelo estratégico de colaboração e mineração de dados espaciais na WEB

Moraes, André Fabiano de January 2011 (has links)
Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro Tecnológico, Programa de Pós-Graduação em Engenharia Civil, Florianópolis, 2011 / Made available in DSpace on 2012-10-26T06:42:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1 299724.pdf: 25008046 bytes, checksum: e7c6c14292df4b9be0a6385812006dd5 (MD5) / Após o levantamento da situação de alguns municípios brasileiros com relação a produção e ao tratamento de dados espaciais, ficou detectada a carência de infraestruturas, de informações e por consequência, a falta de mecanismos colaborativos com suporte a mineração de dados para análise espacial. As dificuldades aumentam com a disseminação de diferentes estruturas de dados espaciais a exemplo de padrões CAD/GIS produzidas através do rápido avanço das tecnologias de informação, sendo reais os desafios para implementação de uma infraestrutura interoperável e foco de várias discussões. Entretanto o acesso a esses dados via internet e os problemas ocasionados na troca dos mesmos estão relacionados diretamente a natureza particular de cada padrão adotado, por isso devem ser analisados e adequados para colaboração. Inicialmente a hipótese do trabalho visa intensificar a interoperabilidade entre dados espaciais e a integração de sistemas, tornando possível estabelecer canais de comunicação para um ambiente colaborativo visando ações potenciais e cooperativas. A partir disso, a pesquisa apresenta uma investigação sobre os aspectos relevantes que influenciam na engenharia de projetos, originando o desenvolvimento do protótipo denominado OpenCGFW (Collaborative Geospatial Framework Web), visando o reconhecimento de estruturas, integração, manipulação e colaboração, em sintonia com esforços da INDE, OGC e W3C. Inicialmente são realizados estudos e revisões sobre os assuntos diretamente relacionados à interoperabilidade. Também são abordados temas relacionados ao armazenamento, tratamento e colaboração computacional especificamente entre os dados geográficos produzidos por diferentes instituições públicas. Para construção do framework foi aplicado o método MCDA-C (Multicritério de Apoio à Decisão - Construtivista) para identificação dos aspectos fundamentais e elementares. A partir disso o trabalho também descreve os resultados obtidos na implementação das etapas de um padrão de projeto para apoiar nas atividades e na avaliação de geosoluções livres. Durante a discussão, são apresentados os resultados através experimentos e aplicações para mapas digitais na web visando a integração de várias bases de dados distribuídas ao cadastro técnico multifinalitário para uso das principais técnicas de mineração de dados espaciais. Ao final, o trabalho discute a hipótese e a contribuição da pesquisa, visando atender principalmente às características regionais, buscando contribuir para o avanço tecnológico do país ao intensificar o uso de padrões abertos e geotecnologias livres na colaboração e gestão do conhecimento / After surveying the situation in some municipals Brazilian with respect to production and processing of spatial data, it was detected the lack of infrastructure, of information, and therefore the lack of mechanisms to support collaborative for data mining and spatial analysis. The difficulties increase with the spread of different structures of spatial data standards like ie: CAD / GIS produced by the rapid advancement of information technology, and real challenges to implementation of an interoperable infrastructure and it focus of several discussions. However access to this data via the Internet and the problems caused in the same exchange are directly related to the particular nature of each standard adopted, so it they should must be analyzed and appropriate for collaboration. Initially, the hypothesis of the study aims to enhance interoperability between spatial data and systems integration, making it possible to establish communication channels for a collaborative environment aimed at potential and cooperative actions. From this, the study presents an investigation into the relevant aspects that influence the projects engineering, resulting in the development of the prototype called OpenCGFW (Collaborative Geospatial Framework Web), to the recognition of structures, integration, manipulation and collaboration, in tuning with efforts GSDI-INDE, OGC and W3C. Initially, studies and reviews on subjects directly related to interoperability. Are also discussed issues related to storage, processing between collaboration computational and specifically geographic data produced by different public institutions. For construction of the framework was applied MCDA-C method (Multicriteria Decision Aid - Constructivist) to identify the fundamental and elementary. From this work also describes the results obtained in implementing the steps of a design pattern to support the activities and evaluating free geo-solutions. During the discussion, are present the results through experiments and applications of the web mapping for digital maps to integrate multiple databases distributed of the multipurpose cadaster and use of the main techniques of spatial data mining. At the end, the work discusses the hypothesis and the contribution of research, mainly to meet the regional characteristics, seeking to contribute to the technological advancement of the country intensifying the use of open standards, the free geo-solutions collaboration and knowledge management
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Gerenciamento ambiental de projetos de mineração: um estudo de caso

Borges, Leandro Augusto de Freitas January 2009 (has links)
Submitted by Stéfany Moreira (stemellra@yahoo.com.br) on 2013-02-28T14:36:37Z No. of bitstreams: 1 DISSERTAÇÃO_GerenciamentoAmbientalProjetos.pdf: 6005417 bytes, checksum: b96913ad04dc55c54c00129c82562cc7 (MD5) / Approved for entry into archive by Neide Nativa (neide@sisbin.ufop.br) on 2013-03-13T22:20:54Z (GMT) No. of bitstreams: 1 DISSERTAÇÃO_GerenciamentoAmbientalProjetos.pdf: 6005417 bytes, checksum: b96913ad04dc55c54c00129c82562cc7 (MD5) / Made available in DSpace on 2013-03-13T22:20:54Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DISSERTAÇÃO_GerenciamentoAmbientalProjetos.pdf: 6005417 bytes, checksum: b96913ad04dc55c54c00129c82562cc7 (MD5) Previous issue date: 2009 / A exploração dos recursos naturais com a inserção da variável ambiental é uma realidade inerente a todos os projetos de mineração atualmente existentes. Esta forma de agir vem em busca do equilíbrio entre atender as demandas da população por minérios e manter a capacidade de suporte do meio ambiente. Desse modo, com a evolução das questões legais, foram sendo criadas normas para a cobrança da gestão ambiental, a ser executada por parte das empresas de mineração. Nesta dissertação é discutido um modelo de gestão ambiental aplicável a minerações de pequeno porte, definidas em função das políticas governamentais, especificamente àquelas dentro do Estado de Minas Gerais. Discute-se como o processo de regularização ambiental exigido pelas entidades governamentais estaduais pode se tornar a principal ferramenta de gestão e administração ambiental empresarial. O modelo de gestão proposto tem por base a aplicação das exigências legais impostas aos projetos de mineração, para a obtenção das várias licenças ambientais necessárias para a extração dos recursos minerais, como principal ferramenta de prevenção dos danos ambientais potenciais que poderão advir dessas atividades. Ao final, apresenta-se um estudo de caso, que cuida da aplicação do modelo de gestão proposto à Pedreira Santa Efigênia, localizada no Distrito de Antônio Pereira, no município de Ouro Preto, no Estado de Minas Gerais, cuja lavra está sendo pleiteada pela Cooperativa dos Trabalhadores da Pedreira Santa Efigênia – COOPERSERF. ____________________________________________________________________________________________________ / ABSTRACT: The exploration of natural sources with the insertion of the changeable environmental projects which is a reality attached to all current mining projects. The goal is to get balance between mining population needs and protection to environment. By the legal subjects, new laws were created, so that it became mandatory for the mining corporations to follow them by the environmental management groups. This article is about the environmental management groups standards that were developed to watch small corporations, defined by the governmental politics, specially the ones into Minas Gerais state. It’s a topic of discussion, how the process of environmental regulation demanded by the government might become the main tool of environmental management and business administration. The example of the proposed management requirements is based on application of the legal demands related to the mining projects. The main tool utilized for environmental acquisition of protection is the various environmental licenses necessary for the mining operation in order to protect the environment. A specific case is presented at the end which deals with an example of the management project proposed to Pedreira Santa Efigênia, located in Ouro Preto, Minas Gerais state, at Antonio Pereira district, which exploitation has been requested by the Cooperative of Workers of Pedreira Santa Efigênia - COOPERSERF.
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A mineração de agregados na região metropolitana de Fortaleza: impactos ambientais e conflitos de uso e ocupação do solo / The mining of aggregates in the metropolitan region of Fortaleza: environmental impacts and use conflicts and land use

Batista, Clístenes Teixeira 22 July 2010 (has links)
BATISTA, Clístenes Teixeira. A mineração de agregados na região metropolitana de Fortaleza: impactos ambientais e conflitos de uso e ocupação do solo. 2010. 147f. Dissertação(Mestrado em Geologia)- Centro de Ciências, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2010. / Submitted by Maria Naires Souza (marianaires@ufc.br) on 2011-12-13T16:27:47Z No. of bitstreams: 1 2010-dis-ctbatista.pdf: 10120028 bytes, checksum: be1da021b0f5a1b329e6af48de76fd0b (MD5) / Approved for entry into archive by Aline Nascimento(vieiraaline@yahoo.com.br) on 2011-12-19T12:33:03Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2010-dis-ctbatista.pdf: 10120028 bytes, checksum: be1da021b0f5a1b329e6af48de76fd0b (MD5) / Made available in DSpace on 2011-12-19T12:33:03Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2010-dis-ctbatista.pdf: 10120028 bytes, checksum: be1da021b0f5a1b329e6af48de76fd0b (MD5) Previous issue date: 2010-07-22 / The Metropolitan Area of Fortaleza has great potential natural and economic for the development of mining of aggregates. Diversity of lithology ensures good supply of material for immediate use in civil construction and economic growth associated pent-up demand by building housing and also the deficiencies, of urban structure form the scenery favorable to expansion of this activity in the region. It is a activity of environmental impacts in the physical and social, both positive and adverse. Is responsible for the generation of jobs and revenue publics, an activity very important the growth of other branches of economy and urban development and at the same time causes serious changes on landscapes and environment. In The Metropolitan Area of Fortaleza, many companies do not observe care in their activities to mitigate the consequences it can have on their surroundings. Another important is the conflicts of soil use. The mining dispute with other forms of occupation and activities such as industry, agriculture and the urban growth, territorial space in the region. Added to this, limitations natural and physical environment of regions and metropolitan areas of environmental interest in the form of Units Conservation e Areas of Permanent Preservation, where mining should be prohibited or limitations performed with more stringent. The Metropolitan Area of Fortaleza has a good set of areas of environmental interest established legally, but lacks territorial planning that takes into account the importance of mining in the growth of regions reduce or avoid conflicts of use and occupancy of the soil, ensuring the supply of aggregates the local economy, input to its growth. / A Região Metropolitana de Fortaleza possui grande potencial natural e socioeconômico para o desenvolvimento da mineração de agregados. A diversidade litológica garante boa oferta desse material de uso imediato na construção civil e o crescimento econômico associado à demanda reprimida por construções habitacionais e ainda, as deficiências da estrutura urbana formam o cenário favorável á expansão dessa atividade na região. A mineração é uma atividade de impactos ambientais no meio físico e no meio socioeconômico notórios, tanto positivos como adversos. É responsável pela geração de empregos e receita pública, é uma atividade imprescindível ao crescimento de outros ramos da economia e no desenvolvimento urbano e, ao mesmo tempo, provoca sérias alterações na paisagem e no meio ambiente. Na Região Metropolitana de Fortaleza, muitas empresas de mineração não seguem os cuidados necessários nas suas atividades para mitigar os impactos que ela causam no seu entorno. Outro ponto crítico é a questão dos conflitos de uso e ocupação do solo. A mineração disputa com outras formas de ocupação e atividades como a indústria, a agricultura e o próprio crescimento da malha urbana, espaço territorial na região. Somam-se a isso, as limitações naturais do meio físico da região metropolitana e as áreas de interesse ambiental na forma de Unidades de Conservação e Áreas de Preservação Permanente, onde a mineração deve ser proibida ou executada com limitações mais rigorosas. A Região Metropolitana de Fortaleza possui um bom conjunto de áreas de interesse ambiental legalmente instituídas, mas carece de planejamento territorial que leve em conta a importância da mineração no crescimento da região e amenize ou evite os conflitos de uso e ocupação do solo, assegurando a oferta dos agregados à economia local, insumo básico ao seu crescimento.
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Evolução costeira controlada por promontório no litoral de Paracuru – Ceará / Geo-environmental dynamics associated with headland in Paracuru - Ceará - Brazil

Magalhães, Danilo Carneiro January 2015 (has links)
MAGALHÃES, Danilo Carneiro. Evolução costeira controlada por promontório no litoral de Paracuru – Ceará. 2015. 97 f. Dissertação (Mestrado em geografia)- Universidade Federal do Ceará, Fortaleza-CE, 2015. / Submitted by Elineudson Ribeiro (elineudsonr@gmail.com) on 2016-06-10T18:32:08Z No. of bitstreams: 1 2015_dis_dcmagalhaes.pdf: 7795450 bytes, checksum: 484b0b43e79467cdf572ad1fd5dfc279 (MD5) / Approved for entry into archive by José Jairo Viana de Sousa (jairo@ufc.br) on 2016-06-14T23:22:00Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2015_dis_dcmagalhaes.pdf: 7795450 bytes, checksum: 484b0b43e79467cdf572ad1fd5dfc279 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-06-14T23:22:00Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2015_dis_dcmagalhaes.pdf: 7795450 bytes, checksum: 484b0b43e79467cdf572ad1fd5dfc279 (MD5) Previous issue date: 2015 / The city of Paracuru is part of the coastal area of the state of Ceará and is located 85 km from the capital, Fortaleza. Paracuru presents intense environmental dynamics that can be seen through various types of reliefs that show the exchanges between matter and energy in the coastal system. This paper took under consideration the influence of the Paracuru’s promontory in the coastal and littoral dynamics. Thus, the research was based on the analysis of littoral relief to understand the environmental dynamics of that part of city’s coast. To analyze these coastal areas, it was made bibliographic search, cartographic survey and fieldworks, plus some cabinet steps for the treatment of data. The environmental characterization and analysis of the coastal dynamics demonstrates that the Paracuru’s promontory develops determining functions in the current configuration of the coast because it controls the distribution of sediments transported by longshore drift. The analysis also shows that the variety of land uses determines historically the accumulation of environmental impacts on the coastal plain of Paracuru. / Inserido na zona costeira cearense, 85 km a oeste de Fortaleza, o município de Paracuru apresenta intensa dinâmica geoambiental expressa na forma de variados tipos de relevo que evidenciam as trocas de matéria e energia no sistema costeiro. Tomamos em análise as influências oferecidas pelo promontório de Paracuru à sua dinâmica costeira e litorânea. Assim, a pesquisa se baseou na análise do relevo litorâneo como instrumento à compreensão da dinâmica geoambiental do referido município. Realizou-se pesquisa bibliográfica em diferentes meios (livros, periódicos, internet), levantamento cartográfico para a produção de mapas temáticos, trabalhos de campo para reconhecimento e construção de análises sobre o espaço costeiro, e etapas de gabinete para o tratamento de dados e escrita do trabalho final. Desenvolveu-se a caracterização ambiental, análises sobre a dinâmica litorânea e a formação socioespacial do município considerando os principais usos do solo. Demonstra-se que o promontório de Paracuru desenvolve funções determinantes na atual configuração do litoral ao controlar a distribuição de sedimentos transportados pela deriva litorânea e ainda que a variedade de usos do solo determina historicamente o acúmulo de impactos ambientais na planície costeira paracuruense.
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A evolução do marco regulatório da mineração no Brasil

Galvão, Carolina 31 August 2015 (has links)
Submitted by Carolina Galvão (carolina.galvao@uol.com.br) on 2016-06-16T19:18:16Z No. of bitstreams: 1 Dissertação_Marco Regulatorio Mineração.pdf: 10942580 bytes, checksum: 985c2c7a6e75ffb0f13ac0ff3614fd90 (MD5) / Approved for entry into archive by GILSON ROCHA MIRANDA (gilson.miranda@fgv.br) on 2016-11-01T14:52:22Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação_Marco Regulatorio Mineração.pdf: 10942580 bytes, checksum: 985c2c7a6e75ffb0f13ac0ff3614fd90 (MD5) / Approved for entry into archive by Maria Almeida (maria.socorro@fgv.br) on 2016-11-07T18:21:43Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação_Marco Regulatorio Mineração.pdf: 10942580 bytes, checksum: 985c2c7a6e75ffb0f13ac0ff3614fd90 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-11-07T18:22:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertação_Marco Regulatorio Mineração.pdf: 10942580 bytes, checksum: 985c2c7a6e75ffb0f13ac0ff3614fd90 (MD5) Previous issue date: 2015-08-31 / Este trabalho tem como objetivo apresentar a evolução do marco regulatório da mineração no Brasil, considerando o modelo atual de regulação e as principais alterações propostas pelo Novo Marco Regulatório. Para tal estudo, serão apresentadas as características do mercado da mineração, a evolução do processo regulatório no Brasil, o modelo institucional atual, as alterações propostas e seus impactos, bem como um modelo internacional de regulação da atividade mineral.
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Métodos de mineração de dados para extração de conhecimento em bioinformática: aplicação em dados de Geminivirus e predição de novas proteínas ribossomais / Data mining methods for knowledge extraction in bioinformatics: Application on Geminivirus data and prediction of new ribosomal pro-teins

Carvalho, Thales Francisco Mota 25 July 2016 (has links)
Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2017-02-10T10:24:21Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 4520555 bytes, checksum: fe8d3a2da8cd19ec1afdfb3b0e97134e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-10T10:24:21Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 4520555 bytes, checksum: fe8d3a2da8cd19ec1afdfb3b0e97134e (MD5) Previous issue date: 2016-07-25 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / A mineração de dados (DM, do inglês data mining) é um processo de des- coberta de padrões que permite extrair informação e conhecimento em grandes volumes de dados. Suas principais técnicas se baseiam em predição, classificação e agrupamento (clustering). Estas técnicas têm sido utilizadas na bioinformá- tica para classificar o perfil de expressão gênica, encontrar padrões em sequências de DNA, avaliar a estrutura do dobramento de proteínas, entre outras aplicações. Neste trabalho, avançadas técnicas de DM foram aplicadas para o desenvolvimento de um Data Warehouse específica para geminivírus (geminivirus.org), a fim de au- xiliar na organização, correção e normalização de dados referentes a geminivírus. Neste Data Warehouse também foram propostas metodologias baseadas em regras e aprendizado de máquina (ML) que classificam as sequências de DNA e seus ge- nes. A família Geminiviridae é composta por pequenos vírus de DNA circular de fita simples que infectam uma grande variedade de plantas e causam sérios danos econômicos ao redor do mundo. O aprimoramento da amplificação do DNA viral e de técnicas de sequenciamento permitiram um enorme crescimento de dados em banco de dados públicos. Simultaneamente, ocorreu o crescimento no volume de publicações relacionadas a esta família. Desta forma, numa segunda linha de tra- balho surgiu a necessidade de aplicar as técnicas de DM, seguindo o processo de KDD (knowledge-discovery in databases) para extrair informações desses dados. Além disso, técnicas de Processamento de Linguagem Natural (NLP) foram utili- zadas para extrair informação em resumos de artigos relacionados a geminivírus. Assim, o acervo científico pode ser explorado de maneira contextualizada. Final- mente, uma terceira frente de trabalho em mineração de dados foi empreendida, desta vez direcionada à descoberta de proteínas ribossomais. Pesquisas recentes têm demonstrado que plantas suprimem o mecanismo global de tradução como uma estratégia de imunidade antiviral. Entretanto, poucas proteínas ribossomais são mencionadas a integrarem vias do mecanismo de defesa das plantas. As pro- teínas ribossomais (RPs) desempenham um papel fundamental em células vivas, pois são o principal componente dos ribossomos. Além disso, estas proteínas estão envolvidas em vários processos fisiológicos e patológicos. Assim, foi desenvolvido um método de aprendizado de máquina capaz de identificar novas proteínas ri- bossomais, designado Rama. O Rama utiliza abordagens inovadoras em relação aos métodos computacionais atualmente existentes. Em experimentos in silico, o Rama obteve resultados médios de precisão, acurácia, sensitividade e especifici- dade de 0.9203, 0.9214, 0.9214 e 0.8236, respectivamente. Ademais, duas proteínas não caracterizadas foram preditas como RPs pelo Rama e experimentos in vitro confirmaram a veracidade do resultado, ao passo que as metodologias atuais não conseguem lograr o mesmo sucesso. / Data mining (DM) is a pattern discovery process that can extract information and knowledge in large volumes of data. Its main techniques are based on prediction, classification, and clustering. These techniques have been used in bioinformatics to identify gene expression profiles, find patterns in DNA sequences, evaluate protein folding structure, among other applications. In this work, advanced techniques of DM were applied to the development of a specific Data Warehouse for geminivi- ruses (geminivirus.org) to assist in organization, correction, and normalization of data related to geminivirus. In this Data Warehouse, we also propose methodo- logies based on rules and machine learning (ML) to classify DNA sequences and their genes. The Geminiviridae family consists of small circular single-stranded DNA viruses which infect a wide variety of plants and cause serious economic losses wordwide. Improvements in amplification of viral DNA and sequencing techniques have led to an enormous growth of public databases. Thus, in a second endeavor in this work, we realized the need to apply DM techniques, following the process of KDD (knowledge-discovery in databases), to extract yet-unknown information. Furthermore, natural language processing techniques (NLP) were used to extract information in abstracts of paper related to geminivirus. In this way, the scientific literature can be explored in a contextualized manner. Finally, a third effort using data mining approaches was carried out, this time directed to the identification of new ribosomal proteins. Recent research has shown that plants suppress the ove- rall mechanism of translation as a strategy for antiviral immunity. However, few ribosomal proteins are referred to integrate pathways of plant defense mechanisms. Ribosomal proteins (RPs) have a fundamental role in living cells, as they are the main component of ribosomes. Furthermore, these proteins are involved in various physiological and pathological processes. Therefore, we developed a ML method to identify new ribosomal proteins, called Rama. Rama uses innovative approaches in comparison to currently existing computational methods. In in silico experiments, Rama presented average results of precision, accuracy, sensitivity, and specificity of 0.9203, 0.9214, 0.9214, and 0.8236, respectively. In addition, two proteins not yet characterized were predicted as RPs by Rama, whereas other methods could not achieve the same success. In vitro experiments confirmed the veracity of our result.
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Uso de ferramentas de análise de 'big data' na identificação de ameaças e fatores de risco fitossanitário / Use of analysis tools 'big data' in identifying threats and phytosanitary risk factors

Alves, Giliardi Anício 31 March 2016 (has links)
Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2017-02-14T16:40:14Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 497659 bytes, checksum: 2c99a8ab10eb6c5a75f20d8df5487dd7 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-14T16:40:14Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 497659 bytes, checksum: 2c99a8ab10eb6c5a75f20d8df5487dd7 (MD5) Previous issue date: 2016-03-31 / Entender o movimento das pragas entre fronteiras, identificar os padrões de dispersão e tendências neste movimento são desafios em serviços de inteligência quarentenária. As espécies que foram introduzidas na América do Sul e Trindade e Tobago, em muitos casos, causam grande dano à agricultura e à economia local. O Brasil, por sua vez, sendo o país com maior produção agrícola nesta região, enfrenta grandes desafios para impedir a entrada de novas pragas e controlar aquelas já introduzidas em seu território. Com o intuito de identificar o padrão atual de distribuição geográfica e incentivar o uso de novas tecnologias na área de pesquisa em defesa vegetal, o presente trabalho trata da identificação de ameaças fitossanitárias utilizando ferramentas computacionais de mineração de dados. Essas ferramentas permitiram identificar dezessete espécies de pragas quarentenárias ausentes para o Brasil com presença confirmada para os países da América do Sul e Trindade e Tobago, as quais foram submetidas a uma avaliação de risco de pragas. Os hemípteros Perkinsiella saccharicida e Pseudococcus calceolariae, os fungos Boeremia foveata, Botrytis fabae, Phoma andigena, Tilletia laevis, Urocystis agropyri, Phytophthora erythroseptica e o coleóptero Prostephanus truncatus são espécies de pragas quarentenárias ausentes para o Brasil com alta probabilidade de entrada a partir da América do Sul e com alto potencial de risco para o país. / Understanding pest movement across international borders, identifying standards of their dispersal and trends are challenges to quarantine intelligence services. Often, exotic species that have become introduced in South America and Trinidad and Tobago cause severe damages to local agriculture and economy. In turn, Brazil, given its regional prominence in agriculture faces challenges to prevent the entry of new pests as well as to control the ones that have already become introduced. Aiming to identify patterns of geographic distribution and to encourage the use of new technological tools in quarantine intelligence, this work deals with the use of data mining and big data analysis tools. 17 pest species of quarantine species have been identified as highly likely to be introduced through the terrestrial borders of Brazil and were submitted to a pest assessment analysis. The hemipterans Perkinsiella saccharicida and Pseudococcus calceolariae, fungi Boeremia foveata, Botrytis fabae, Phoma andigena, Tilletia laevis, Urocystis agropyri, Phytophthora erythrosepticaand the beetle Prostephanus truncatus were qualified as the most risky species to Brazil.
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Distribuição e contaminação de Zn, Cd e Pb em perfis de solo e obtenção de valores de referência local no município de Vazante-MG / Distribution and contamination of Zn, Cd and Pb, and establishment of local reference values for the Vazante-MG County

Borges Júnior, Meubles 21 August 2002 (has links)
Submitted by Nathália Faria da Silva (nathaliafsilva.ufv@gmail.com) on 2017-06-21T12:00:53Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1640010 bytes, checksum: 164e79ea0d9bf2327b08bba217ccda91 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-21T12:00:53Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1640010 bytes, checksum: 164e79ea0d9bf2327b08bba217ccda91 (MD5) Previous issue date: 2002-08-21 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Este trabalho foi desenvolvido com o objetivo de avaliar a distribuição e formas de ocorrência de Zn, Cd e Pb, tendo em vista identificar a origem de valores anômalos em amostras de solos, adjacentes às áreas mineradas da Companhia Mineira de Metais (CMM), no município de Vazante-MG. Objetivou-se, também, estabelecer valores de referência local (VRL) para estes metais nestas zonas mineralizadas, a fim de permitir uma avaliação da contaminação ambiental. Foram coletadas amostras de perfis de solo em remanescentes sobre a área mineralizada e a jusante e montante desta, nas profundidades de 0 a 2 cm, 2 a 5 cm, 5 a 10 cm, 10 a 20 cm, 20 a 50 cm, 50 a 100 cm e 100 a 150 cm. As concentrações de Zn, Cd e Pb foram obtidas para as formas: a) solúvel; b) trocável; c) associada a carbonatos; d) associada a óxidos amorfos; e) associada a óxidos cristalinos; f) associada a matéria orgânica; g) residual; e h) total. Foram determinadas, também, as concentrações desses elementos nas formas disponíveis (Mehlich-3 e DTPA). Os valores de referência local (VRL’s) foram obtidos considerando-se a média ponderada dos teores de Zn, Cd e Pb nas camadas de 0 a 20 cm dos perfis a montante. De posse desses valores calculou-se o fator de contaminação (F.C.) e o índice de geoacumulação (IGeo) para cada perfil. Verificou-se que os teores de Zn, Cd e Pb, de modo geral, são mais elevados nas áreas localizadas sobre a zona de mineralização, com solos mais jovens (Cambissolos e Neossolos), em relação àqueles perfis mais intemperizados (Latossolos e Argissolos), localizados à montante e a jusante do empreendimento. Os teores totais podem ser considerados extremamente elevados, principalmente para Zn e Cd. Mesmo considerando apenas os teores de Zn e Cd trocáveis e associados a matéria orgânica, obtêm-se valores superiores aos reportados, como teores totais encontrados naturalmente em solos. Há um padrão decrescente dos teores com a profundidade, principalmente para Zn e Cd, nos perfis localizados fora da área mineralizada (áreas a montante e jusante). Há um aumento dos teores de Zn em profundidade para o Cambissolo (perfil 2), e de Cd para os Cambissolos (perfis 2, 3, 4 e 5) localizados na zona de mineralização. Não há diferença significativa entre os teores médios de Zn, Cd e Pb das áreas à montante e à jusante, ao nível de 5% de significância, para todas as formas nas quais esses elementos encontram-se associados. Os valores de referência (VRL ́s) obtidos foram de 1.262 mg/kg para Zn; 4,75 mg/kg para Cd e 384 mg/kg para Pb. O VRL para Zn é inferior aos valores de intervenção (VI ́s) para as áreas industriais adotados no Estado de São Paulo, EUA e Canadá. Para o Cd o VRL é inferior aos VI’s adotados em São Paulo, para a área agrícola de proteção máxima e nos EUA e Canadá, para áreas residenciais. O VRL para Pb é inferior aos VI’s adotados em São Paulo, Alemanha, Canadá e EUA, para áreas residenciais. Os perfis das áreas mineralizadas apresentaram os maiores fatores de contaminação com destaque para o perfil 5 (área mineralizada em exploração). De acordo com o índice de geoacumulação (IGeo) os perfis de solo a jusante foram classificados como não poluídos a moderadamente poluídos. / This work was carried out to evaluate the distribution and forms of Zn, Cd and Pb, aiming to identify the origin of abnormal values in soils associated with mining areas of the CMM company, in Vazante (MG-Brazil). Also, it aimed to establish local reference values (LRV) for these elements based on total and available levels (Melich 3 and DTPA) and offer subsidies to environmental risk assessment. Soil profiles were samples in mined areas, at both upper and downslope at depths of 0-2, 2-5, 5-10, 10-20, 20-50, 50-100 and 100-150 cm. The Zn, Cd and Pb concentrations were obtained for the following forms: (a) soluble; (b) exchangeable; (c) carbonate-associated; (d) associated with amorphous oxides; (e) associated with crystalline oxides; (f) organically bound; (g) residual and (h) total. It was also determined the concentration of available forms of these elements (Melich-3 and DTPA). The LRV’s were obtained by the mean of Zn, Cd and Pb levels at 0-20 cm soils at upslope position. Based on the LRV, the contamination factor (C.F.) and the geo-accumulation index were calculated for xiiieach profile. Overall, the levels of Zn, Cd and Pb were higher in younger soils of the mineralized zone in relation to deeply weathered soils, at both upslope and downslope from the mine plant. The total levels are extremely high, specialy for Zn and Cd. Even when only the exchangeable and organically bound forms of Zn and Cd are considered, the values are much higher than those reported by Alloway, considering the naturally occurring levels in soils. There is a decreasing trend with depth, mostly for Zn and Cd, in soils outside the mineralized area (at both up and downslope positions). There is an increase in the Zn levels with depth in the Cambisol (P2), and also for Cd (P2, P3, P8, P9), in the mined area. There is no significant difference between mean values of Zn, Cd and Pb at upslope and downslope, at 5% significance. The LRV’s obtained were 1.662 mg/kg for Zn; 4,75 mg/kg for Cd and 384 mg/kg for Pb. The LRV for Zn is lower than the IV’s adopted in São Paulo for agricultural areas at maximum protection and lower than those adopted in the USA and in Canada for residential areas. The LRV for Pb is lower than the IV’s adopted in São Paulo, USA, Canada and Germany for residential areas. The profiles of the mineralized area, specially P9 (mining area), presented higher CF’s. Based on the geo-accumulation index (IGeo), the profiles positioned dowslope were classified as moderately contaminated to not contaminated.
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Estudo da viabilidade de utilização de indicadores de recuperação de áreas degradadas por mineração de bauxita / Study of the viability of utilization of of bauxite mining areas

Oliveira, Deise Machado Ferreira de 27 February 2003 (has links)
Submitted by Nathália Faria da Silva (nathaliafsilva.ufv@gmail.com) on 2017-06-21T19:13:59Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 261371 bytes, checksum: c5ff9d791c2952d64da4e6abae672c09 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-21T19:13:59Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 261371 bytes, checksum: c5ff9d791c2952d64da4e6abae672c09 (MD5) Previous issue date: 2003-02-27 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Este trabalho foi desenvolvido com o objetivo de se avaliar algumas características químicas e microbiológicas como indicadoras de qualidade ambiental em substratos de áreas mineradas para extração de bauxita, com diferentes idades de revegetação. Foram amostradas nove áreas da Mineração Rio do Norte, em Porto Trombetas, no estado do Pará, revegetadas em 1982, 1984, 1986, 1987, 1992, 1994, 1996, 1998. Uma área de solo (Latossolo Amarelo) sob cobertura de mata primária foi amostrada para servir como área de referência. Foram feitas amostragens de duas áreas revegetadas em 1994, uma área denominada de 1994c, que recebeu o horizonte A do solo original como cobertura e 1994s, que não recebeu o horizonte A superficialmente. Nas áreas revegetadas na década de 80 o horizonte A original foi incorporado ao material e nas áreas da década de 90 esse horizonte A do Latossolo Amarelo original foi colocado como cobertura em uma camada de aproximadamente 20 a 30 cm. As áreas foram revegetadas com uma mistura de espécies arbóreas, com exceção da área revegetada em 1987, onde se cultivou apenas tachi- branco (Sclerolobium paniculatum Voguel). As amostras de substrato e solo foram coletadas em duas épocas do ano, nos períodos de menor e maior precipitação na região, à profundidade de 0 a 2,5 cm para a avaliação do carbono e do nitrogênio da biomassa microbiana e de 0 a 2,5, 2,5 a 7,5 e 7,5 a 20 cm para as características químicas do solo. Os resultados obtidos foram submetidos a análise de agrupamento e por componentes principais. O carbono e o nitrogênio da biomassa microbiana se apresentaram como bons indicadores do estágio de recuperação/degradação dos substratos. Não obstante, os resultados terem sido diferentes entre as áreas, o uso de C e N da biomassa como indicadores de qualidade do solo, necessariamente requer um plano de amostragem que considere as variações climáticas locais. A utilização das frações da matéria orgânica como indicadores da qualidade do solo requer amostragens periódicas a fim de se obter um banco de dados que reflita o perfil da área. A matéria orgânica total e matéria orgânica leve são características que podem ser usadas como indicadoras da qualidade do solo. / Chemical and microbiologic characteristics were evaluated as environment quality indicators in substrates from bauxite extraction areas with different ages of revegetation. Nine areas (revegetated in 1982, 1984, 1986, 1987, 1992, 1994, 1996, and 1998) of the Company Mineração Rio do Norte were sampled in Porto Trombetas, State of Para, Brazil. Control samples were taken from the soil (Oxisol) of a neighboring area under natural rain forest. Two areas revegetated in 1994 were sampled, one called 1994c which had received original topsoil as cover layer and another, called 1994s, which had not received topsoil. In all areas revegetated in the 80’s, the horizon A of the original Oxisol was incorporated into the substrate while in the areas revegetated during the 90’s the topsoil was applied as a cover layer of 20- 30 cm. The areas were revegetated with a composition of tree species, except for the area revegetated in 1987, where only taxi-branco (Sclerolobium paniculatum Voguel) was planted. Substrate and soil samples were collected twice a year, once in the dry and once in the wet season, at a depth of 0-2.5 cm for the evaluation of C and N contents in the microbial biomass and at depths of 0-2.5, 2.5-7.5, and 7.5-20 cm for the chemical characteristics. The obtained results were submitted to cluster and mean component analysis. C and N contents in the microbial biomass proved to be appropriate indicators for the reclamation/degradation stage of the substrates. However, since results differed among the sampled areas, the use of C and N of the microbial biomass as soil quality indicators necessarily requires a sampling plan which considers local climatic variations. The utilization of organic matter fractions as soil quality indicators requires periodical evaluations for the formation of a data bank that represents the area’s profile. Total organic matter and light organic matter are characteristics that can be used as soil quality indicators.

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