Made available in DSpace on 2014-04-05T02:01:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1 000456493-Texto+Completo-0.pdf: 8676620 bytes, checksum: ab14797b76f59292226e96a871d584a6 (MD5) Previous issue date: 2013 / The world impact of cancer is increasing through the years and only a few decades ago it was classified as a worldwide public health problem. Cancer cells display many biochemical and biological peculiarities and the research for new drugs to treat or improve the quality of patient life justify the design of compounds with defined molecular targets to affect biochemical pathways of the tumor. The pyrimidine salvage pathway is one of the cellular pathways that have interesting molecular targets for drug design. The human uridine phosphorylase 1 (hUP1) is a key enzyme of pyrimidine salvage and is responsible for the reversible phosphorolysis of uridine to uracil and ribose-1-phosphate in presence of inorganic phosphate. Uridine is proposed to be a biochemical modulator to counteract the host toxicity caused by chemotherapy with 5-fluorouracil (5-FU).Kinetic characterization data were the starting point for hUP1 inhibitors planning. This work describes synthesis, kinetic and thermodynamic characterization of new compounds; also, results from eukaryotic cell cultured analysis and animal models supported the selection of the most promising compound. From the lead molecule, presenting inhibition values in nanomolar range, chemical replacement experiments were performed in specific spots of the molecule, leading to derived compounds with improved affinity profile. By kinetic characterization and thermodynamic discrimination profile the most potent inhibitors were characterized as competitive and uncompetitve inhibitors towards hUP1 natural substrates uridine and inorganic phosphate, respectively, showing its abilities to form a noncatalytic ternary complex. The cell cultured assessment with our lead compound showed the improved capacity of the compound to boost the sensibility of tumor cells to 5-FU treatment, with no significant influence on normal cells. Likewise, in murine model of mucositis, our data suggest that the lead compound maybe efficient to intestinal mucosa protection and to inhibit the hUP1 enzyme-mediated increase in the uridine plasma levels. Thus, the results presented here strengthen the interest for hUP1 inhibitors and for the uridine use as a biochemical modulator of side effects observed during fluoropyrimidines chemotherapy. / O impacto do câncer no mundo vem crescendo ao longo dos anos e há algumas décadas foi classificado como um problema de saúde pública mundial. A busca por novos fármacos para o tratamento e para a melhora da qualidade de vida dos pacientes visa o desenho de fármacos com alvos moleculares definidos, a fim de atingir rotas metabólicas do tumor. Dentre as rotas celulares, a via de salvamento de pirimidinas apresenta alvos moleculares interessantes para o desenho de possíveis novos fármacos quimioterápicos. A enzima humana uridina fosforilase 1 (hUP1) é uma das enzimas-chave dessa via, sendo responsável pelo controle da concentração homeostática da uridina, através da fosforólise reversível de uridina à uracil e ribose-1-fosfato na presença de fosfato inorgânico.A uridina tem sido proposta como um modulador para auxiliar na diminuição dos efeitos adversos gerados durante o tratamento com 5-fluorouracil (5-FU). Os dados da caracterização cinética foram utilizados como ponto de partida para o planejamento de novos inibidores da hUP1. Este trabalho descreve a síntese desses novos compostos, assim como a caracterização cinética e termodinâmica; análise em cultura de células eucarióticas e experimentos em roedores também auxiliaram na seleção de um composto promissor. A partir do composto líder, com valores de inibição na faixa de nanomolar, derivatizações químicas foram realizadas em locais específicos da molécula e a obtenção de compostos com afinidades aprimoradas foi confirmada.A partir da caracterização cinética e termodinâmica, determinamos que os melhores inibidores atuam como inibidores competitivos e incompetitivos em relação aos substratos naturais da hUP1, uridina e fosfato inorgânico, respectivamente, revelando a capacidade desses em formar um complexo ternário não catalítico. O ensaio em cultura de células com a molécula líder revelou que o composto é capaz de elevar a sensibilidade de células tumorais ao 5-FU, não exercendo, entretanto, nenhuma influência sobre células normais. Do mesmo modo, no modelo de mucosite intestinal em ratos, o composto apresentou resultados promissores, revelando uma possível proteção da mucosa intestinal, que pode se dar através da elevação da concentração de uridina no plasma. Assim, os resultados aqui apresentados reforçam o interesse na busca de inibidores da enzima hUP1 e na estratégia do uso da uridina como um modulador bioquímico dos efeitos adversos gerados durante a quimioterapia com fluoropirimidinas.

Orientador: Ricardo de Oliveira Orsi / Resumo: Os objetivos deste trabalho foram selecionar Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) associados à produção de mel e genes candidatos para esta característica. Foram selecionadas oito colmeias mais (APM) e dez menos (BPM) produtivas de um total de 50 colmeias, e avaliados seu comportamento higiênico e defensivo. Após sequenciado o DNA extraído das rainhas das colônias, SNPs foram associados à produção de mel e genes candidatos selecionados. Sondas Taqman foram testadas nas amostras, sendo selecionados dois SNPs e quatro genes candidatos para produção de mel. Foi calculada a probabilidade conjunta para a associação do genótipo e produção de mel, apresentando 0,9844 para genótipos em colônias com alta produção de mel quando presentes os dois SNPs descritos. Deste modo, a utilização dos dois SNPs para alta produção de mel poderá ser utilizada como ferramenta rápida e precisa em programas de melhoramento. / Doutor

Made available in DSpace on 2013-08-07T18:41:28Z (GMT). No. of bitstreams: 1 000411831-Texto+Completo-0.pdf: 610126 bytes, checksum: aecb440e9c0d0afffb07d75e00577faf (MD5) Previous issue date: 2009 / Trichomonas vaginalis is a flagellate protozoan that causes trichomonosis, the most common, non-viral sexually transmitted disease (STD). Steroids may influence the pathogenesis of Trichomonas vaginalis. These hormones can influence the immune system and thus the susceptibility for diseases caused by protozoan parasites. Studies have described that the modulation of nucleotide levels seems to be essential for the survival of the parasite. Trichomonas vaginalis colonization may be influenced by the vaginal concentrations of estrogens. The role of estrogens in the pathogenesis of T. vaginalis has been controversial, and seemingly contradictory reports are found in the literature. Considering that T. vaginalis have not the ability to perform purine and pirimidine synthesis de novo, it becomes important to evaluate the enzyme activities involved in adenosine production in the presence of steroid hormones. We investigated the effect of dehydroepiandrosterone sulfate (DHEAS) and 17b-estradiol on NTPDase and ecto-5´- nucleotidase activities in fresh clinical (VP60) and long-term-grown isolates of T. vaginalis (30236 ATCC), followed by the NTPDase genes transcriptional analysis. The results presented demonstrate the influence of 17b-estradiol and DHEAS on nucleotidase activities and expression patterns in intact trophozoites of T. vaginalis. DHEAS significantly inhibited NTPDase activity. The NTPDase activity on 30236 isolate was inhibited in vitro and in the treatment with DHEAS for 12 hours. NTPDase activity was inhibited in the treatment with the hormone for 2 and 12 hours in VP60 isolate. The presence of the steroid hormone DHEAS during 12 hours also inhibited the transcript levels of NTPDaseA in VP60 isolate. In contrast, 17b-estradiol activated the NTPDase activity in vitro and in the treatment of the hormone during 12 hours in the VP60 isolate. The NTPDase activity on 30236 isolate was also increased by the 17b-estradiol when treated by 12 hours. However,, the treatment with 17b-estradiol by 2 hours inhibited the NTPDase activity on 30236 isolate. Considering the ecto-5´-nucleotidase activity, the results demonstrated that the treatment with DHEAS by 2 h significantly inhibited the AMP hydrolysis in VP60 and 30236 isolates. 17b-estradiol by 2 h inhibited the AMP hydrolysis in the 30236 isolate whereas did not alter the AMP hydrolysis in the VP60 isolate. The treatment with DHEAS by 12 h inhibited AMP hydrolysis. Considering that the vaginal microenvironment is a mixture of hormones with constantly changing concentrations and the effect of steroid hormones on T. vaginalis is complex and is influenced by the presence of hormones receptors on T. vaginalis, our results suggest that the modulation of extracellular ATP, ADP, and AMP levels during exposure to steroid hormones may be related with their influence in T. vaginalis colonization. / O Trichomonas vaginalis é um protozoário flagelado causador da tricomonose, a doença sexualmente transmissível (DST), não-viral mais comum. Esteróides podem influenciar a patogênese do Trichomonas vaginalis. Estes hormônios podem influenciar o sistema imune e também a suscetibilidade para doenças causadas por parasitas. Estudos têm descrito que a modulação dos níveis de nucleotídeos pode ser essencial para a sobrevivência do parasito. A colonização por T. Vaginalis pode ser influenciada pela concentração de estrogênios na vagina. O papel dos estrogênios na patogênese do T. vaginalis é controverso, e estudos contraditórios são encontrados na literatura. Considerando que o T. vaginalis não realiza síntese de novo de purinas e pirimidinas, é importante avaliar as atividades enzimáticas envolvidas na produção de adenosina na presença de hormônios esteroidais. Nós investigamos o efeito do sulfato de deidroepiandrostenediona (S-DHEA) e do 17b-estradiol nas atividades da NTPDase e da ecto-5´-nucleotidase em um isolado clínico fresco (VP60) e em um isolado cultivado por longos períodos em laboratório (30236 ATCC), seguido pela análise transcricional dos genes. Os resultados demonstrram a influência do 17b-estradiol e do S-DHEA nas atividades da NTPDase e da ecto-5´-nucleotidase e padrões de expressão das NTPDases em trofozoítos intactos de T. vaginalis.A atividade da NTPDase no isolado 30236 foi inibida no ensaio in vitro e no tratamento na presença do hormônio S-DHEA por 12 h. No isolado VP60, a atividade da NTPDase foi inibida no tratamento com este hormônio por 2 e 12 h. A presença do hormônio esteróide S-DHEA por 12 h inibiu a expressão dos níveis de mRNA da NTPDaseA no isolado VP60. Em contraste, o 17b- estradiol ativou a atividade da NTPDase no isolado VP60 no ensaio in vitro e no tratamento por 12 h. A atividade da NTPDase no isolado 30236 foi ativada na presença do 17b- estradiol quando tratado por 12 h. Por outro lado, o tratamento com o hormônio 17b- estradiol por 2 h inibiu a atividade da NTPDase no isolado 30236. O tratamento na presença do S-DHEA por 2 h inibiu a hidrólise do AMP no isolado VP60 e no isolado 30236. O 17b-estradiol, no tratamento de 2 h, diminuiu a hidrólise do AMP no isolado 30236, mas não alterou a hidrólise do AMP no isolado VP60. O tratamento por 12 h na presença do hormônio S-DHEA inibiu a hidrólise do AMP. Considerando que a vagina é um ambiente constantemente afetado pelas mudanças hormonais e que os efeitos dos hormônios esteroidais são influenciados por receptores presentes no T. vaginalis, nossos resultados sugerem que a modulação dos níveis extracelulares de ATP, ADP e AMP durante a exposição aos hormônios esteroidais pode estar relacionada com a colonização do T. vaginalis.

O vírus da imunodeficiência felina (FIV) e o vírus da leucemia felina (FeLV), pertencem à família Retroviridae, são amplamente distribuídos e induzem um efeito imunossupressor significativo em gatos domésticos (Felis catus) infectados. Proteínas que apresentam atividade contra os retrovírus são conservadas entre mamíferos e são denominadas de fatores de restrição. As citidinas deaminases da família de genes APOBEC3 são a classe mais estudada de fatores de restrição e o gene APOBEC3H (A3H) codifica duas proteínas (APOBEC3H e APOBEC3CH). Essas proteínas de felinos são os principais responsáveis pela restrição de FIV e FeLV, o que ocorre por meio de hipermutações geradas nos provírus durante a transcrição reversa. Alterações na sequência desse gene podem alterar a estabilidade e a localização celular de proteínas APOBEC3H em mamíferos. Considerando a importância do gene A3H em gatos, a investigação de sua variabilidade é relevante. Cinquenta amostras de DNA de gatos FIV e/ou FeLV positivos e cinquenta e nove amostras de gatos negativos para ambos os vírus foram usadas para amplificar duas regiões diferentes do gene, com posterior seqüunciamento e análise comparativa das sequencias. A primeira região investigada demonstrou-se conservada entre todas as amostras. Na segunda, foi possível identificar seis pontos de variação de nucleotídeos únicos, e um deles, o A65S (A65I) foi significativamente correlacionado com a suscetibilidade à infecção por FIV e/ou FeLV. Por outro lado, a análise de haplótipos mostrou que a combinação "GGGGCC " foi significativamente correlacionada com a ausência de infecção retroviral, talvez indicando um efeito protetor. Considerando que um polimorfismo na posição 65 já foi encontrado no Tigre da Indochina e dada a correlação encontrada nesta pesquisa, mais estudos sobre o efeito desses polimorfismos na atividade de fatores de restrição codificados pelo gene A3H devem ser realizados. Da mesma forma, investigações a respeito dos efeitos da combinação "GGGGCC" devem ser realizadas de modo à corroborar um possível efeito protetor sugerido no presente trabalho. / The Feline Immunodeficiency Virus (FIV) and the Feline Leukemia Virus (FeLV) belong to the Retroviridae family, are widely distributed and induce a significant immunosuppressive effect in infected domestic cats (Felis catus). Proteins with activity against retroviruses are conserved between mammals and determined as restriction factors. Cytidine deaminases of the APOBEC3 gene family are the most studied class of restriction factors and the APOBEC3H gene encodes two proteins (APOBEC3H and APOBEC3CH) that are the most responsible for this restriction among cats, through hypermutations in provirus DNA during reverse transcription. Changes on the gene sequence can alter the stability and cellular localization of homologous proteins to APOBEC3H in mammals. Considering the importance of APOBEC3H gene in cats, the investigation of its variability is relevant. Fifty DNA samples of cats FIV and/or FeLV positives and fifty-nine of negative cats to both viruses were used as template to amplify two different regions of the gene, with subsequent sequencing and analysis. The first investigated region was conserved among all samples. On the second one it was possible to identify six single nucleotide variation points, and of them, the A65S (A65I) was significantly correlated with the susceptibility to FIV and/or FeLV infection. On the other hand, the haplotype analysis showed that the combination “GGGGCC” was significantly correlated with the lack of retroviral infection, maybe indicating a protective effect. Whereas a polymorphism at position 65 have been found in Indochinese Tiger and given the correlation found in this research, more studies about the effect on the activity of restriction factors encoded by the A3H gene should be performed. Similarly, research about the effects of the combination “GGGGCC” should be carried so that we can confirm a possible protective effect shown in this work.

O vírus da imunodeficiência felina (FIV) e o vírus da leucemia felina (FeLV), pertencem à família Retroviridae, são amplamente distribuídos e induzem um efeito imunossupressor significativo em gatos domésticos (Felis catus) infectados. Proteínas que apresentam atividade contra os retrovírus são conservadas entre mamíferos e são denominadas de fatores de restrição. As citidinas deaminases da família de genes APOBEC3 são a classe mais estudada de fatores de restrição e o gene APOBEC3H (A3H) codifica duas proteínas (APOBEC3H e APOBEC3CH). Essas proteínas de felinos são os principais responsáveis pela restrição de FIV e FeLV, o que ocorre por meio de hipermutações geradas nos provírus durante a transcrição reversa. Alterações na sequência desse gene podem alterar a estabilidade e a localização celular de proteínas APOBEC3H em mamíferos. Considerando a importância do gene A3H em gatos, a investigação de sua variabilidade é relevante. Cinquenta amostras de DNA de gatos FIV e/ou FeLV positivos e cinquenta e nove amostras de gatos negativos para ambos os vírus foram usadas para amplificar duas regiões diferentes do gene, com posterior seqüunciamento e análise comparativa das sequencias. A primeira região investigada demonstrou-se conservada entre todas as amostras. Na segunda, foi possível identificar seis pontos de variação de nucleotídeos únicos, e um deles, o A65S (A65I) foi significativamente correlacionado com a suscetibilidade à infecção por FIV e/ou FeLV. Por outro lado, a análise de haplótipos mostrou que a combinação "GGGGCC " foi significativamente correlacionada com a ausência de infecção retroviral, talvez indicando um efeito protetor. Considerando que um polimorfismo na posição 65 já foi encontrado no Tigre da Indochina e dada a correlação encontrada nesta pesquisa, mais estudos sobre o efeito desses polimorfismos na atividade de fatores de restrição codificados pelo gene A3H devem ser realizados. Da mesma forma, investigações a respeito dos efeitos da combinação "GGGGCC" devem ser realizadas de modo à corroborar um possível efeito protetor sugerido no presente trabalho. / The Feline Immunodeficiency Virus (FIV) and the Feline Leukemia Virus (FeLV) belong to the Retroviridae family, are widely distributed and induce a significant immunosuppressive effect in infected domestic cats (Felis catus). Proteins with activity against retroviruses are conserved between mammals and determined as restriction factors. Cytidine deaminases of the APOBEC3 gene family are the most studied class of restriction factors and the APOBEC3H gene encodes two proteins (APOBEC3H and APOBEC3CH) that are the most responsible for this restriction among cats, through hypermutations in provirus DNA during reverse transcription. Changes on the gene sequence can alter the stability and cellular localization of homologous proteins to APOBEC3H in mammals. Considering the importance of APOBEC3H gene in cats, the investigation of its variability is relevant. Fifty DNA samples of cats FIV and/or FeLV positives and fifty-nine of negative cats to both viruses were used as template to amplify two different regions of the gene, with subsequent sequencing and analysis. The first investigated region was conserved among all samples. On the second one it was possible to identify six single nucleotide variation points, and of them, the A65S (A65I) was significantly correlated with the susceptibility to FIV and/or FeLV infection. On the other hand, the haplotype analysis showed that the combination “GGGGCC” was significantly correlated with the lack of retroviral infection, maybe indicating a protective effect. Whereas a polymorphism at position 65 have been found in Indochinese Tiger and given the correlation found in this research, more studies about the effect on the activity of restriction factors encoded by the A3H gene should be performed. Similarly, research about the effects of the combination “GGGGCC” should be carried so that we can confirm a possible protective effect shown in this work.

Orientador: Sandra Cecilia Botelho Costa / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciencias Medicas / Made available in DSpace on 2018-08-05T06:07:32Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Molina_RosanaMara_D.pdf: 6324359 bytes, checksum: e228946d61b59894926210942eabbc1c (MD5) Previous issue date: 2005 / Resumo: A infecção pelo HIV-1 em mulheres, tem aumentado nesses últimos anos, neste caso, torna-se importante o diagnóstico precoce do HIV-1 nas crianças nascidas de mães contaminadas. Para detectar o HIV-1 nessa população pediátrica, a ¿Nested-PCR¿ está sendo amplamente utilizada. O genoma do HIV-1 é variável e atualmente, há vários métodos para se detectar essas variações, sendo que o sequenciamento direto de fragmentos genéticos do HIV-1 é considerado padrão ouro para determinação dos subtipos do HIV-1. No presente trabalho foi incluído 58 amostras de crianças HIV-1 positivas (via perinatal), sendo que em 20 o diagnóstico foi obtido pela ¿Nested-PCR¿ para diagnóstico do HIV-1 (primers JA4 ¿ JA7, JA9 ¿ JA12, JÁ13 ¿ JA16 e JA17 ¿ JA20, com produto de 131, 341, 172 2 129 pb respectivamente, referentes aos genes gag, env ¿ 2 regiões e pol) antes da realização da genotipagem viral; as demais amostras (38) já eram crianças previamente diagnosticadas. As 58 amostras foram submetidas a ¿Nested-PCR¿ de região do gen env para posterior sequenciamento viral, com a utilização dos primers EN 70 - EN 85 e EN 80 - EN 95, com produto de amplificação de 682 pb. Posteriormente foi realizada a purificação do produto da PCR e o sequenciamento direto em seqüenciador automático MegaBace 1000R. Das 58 amostras analisadas, foi possível um sequenciamento e conseqüente subtipagem viral em 56. Dessas, 47 (83,93 %) foram portadoras do subtipo B e 9 (16,07 %) do subtipo F (F1) do HIV-1. Os resultados obtidos confirmam a predominância do subtipo B, seguido pelo F no Brasil / Abstract: The HIV-1 infection in women has been increased these recent years, this way the early diagnosis of HIV-1 infected children born to contaminated mothers becomes very important. The ¿Nested-PCR¿ has been widely utilized in order to detect the HIV-1 in this pediatric population. The HIV-1 genome is variable, and nowadays, there are several methods to detect these variations and furthermore the direct sequencing of the HIV-1 genetic fragments is considered gold pattern for the determination of the HIV-1 subtypes. In the present study 58 samples from positive HIV-1 children (perinatal via) were included, seeing that the diagnosis in 20 of them was obtained by the ¿Nested-PCR¿ to the HIV-1 diagnosis (primers JA4 ¿ JA7, JA9 ¿ JA12, JÁ13 ¿ JA16 and JA17 ¿ JA20, with product of 131, 341, 172 2 129 pb respectively relating to genes gag, env ¿ 2 regions e pol) before the performance of the viral genotyping; the rest of the samples (38) were children previously diagnosed. The 58 samples were submitted to the ¿Nested-PCR¿ of the region of the env gen to posterior viral sequencing with the utilization of the primers EN 70 - EN 85 and EN 80 - EN 95, with the amplification product of 682 bp. Afterwards the purification of the PCR was carried out and the direct sequencing in a MegaBace 1000R automatic sequencer. From the 58 samples analyzed it was possible a sequencing and posterior viral subtyping in 56. From those ones, 47 (83,92 %) were HIV-1 subtype B infected and 9 (16,07 %) subtype F infected (F1). The results obtained assure the predominance of subtype B, followed by subtype F in Brazil / Doutorado / Ciencias Basicas / Doutor em Clínica Médica

O objetivo deste trabalho foi avaliar a utilização da levedura hidrolisada como fonte de nucleotídeos para frangos de corte. As aves foram suplementadas com diferentes níveis de inclusão nas dietas iniciais de 1 a 14 dias de idade. Foram utilizados um total de 576 pintos da linhagem Ross 708, os quais foram distribuídos em 6 tratamentos com 8 repetições (12 aves por box). Os tratamentos consistiram da inclusão de 0, 2, 4, 6, 8 e 10 kg de levedura hidrolisada/tonelada de ração. A levedura hidrolisada foi adicionada na dieta no lugar do material inerte da ração. A dieta inicial foi fornecida na forma triturada enquanto as dietas de crescimento, final e de retirada foram fornecidas na forma de pellets. Durante todo o experimento o acesso à água e ração foi ad libitum. Todas as dietas foram feitas à base de milho, farelo de soja e gordura de frango e foram formuladas para atender as exigências nutricionais recomendadas pelo manual de recomendações nutricionais Ross 708. Aos 42 dias, as aves alimentadas com 1% de levedura hidrolisada tiveram maior peso corporal e ganho de peso quando comparadas aos demais tratamentos (P<0,05). Não houveram diferenças estatísticas entre os tratamentos para as variáveis mortalidade e densidade de vilos. Contudo aves que não foram suplementadas com levedura hidrolisada (tratamento controle) apresentaram menor profundidade de cripta e a suplementação de 1% de levedura resultou em maior altura de vilos. Aves as quais receberam dietas com 0,2% de inclusão de levedura hidrolisada apresentaram menor rendimento de peito que as aves que receberam os demais níveis de levedura, mas foram iguais as aves do tratamento controle. Contudo, o rendimento de carcaça, sassami e gordura abdominal não foram influenciados pelos tratamentos experimentais. Estes resultados demostraram a eficácia da utilização de levedura hidrolisada na dieta de frangos de corte no período de 1 a 14 dias sobre as características de produção. / The objective of this work was to evaluate hydrolyzed yeast utilization as nucleotides source to broilers. Birds were supplemented with different inclusion levels on starter diets from 1 to 14 days of age. A total of five hundred seventy six Ross 708 chicks were allotted to 6 experimental treatments with 8 replications (12 broilers per pen). Birds were randomly distributed in following treatments: 0, 2, 4, 6, 8 and 10 kg hydrolyzed yeast/ton of feed. Hydrolyzed yeast was added to the test diet in place of filler. Starter diets were supplied in crumbled form while grower, finisher, and withdrawal were supplied in pellet form. Throughout experiment water and feed were supplied ad libitum. All diets were based on corn, soybean meal and poultry fat, and were formulated to achieve nutritional requirements from recommendations guide for Ross x Ross 708 broilers. At 42 d chicks fed 1% hydrolyzed yeast demonstrated higher body weight and body weight gain over birds fed other treatments (P<0.05). Mortality and villous density did not differ among treatments. However birds fed control treatment showed lower crypt depth and 1% hydrolyzed yeast supplementation promoted higher villous high. Birds fed 0.2% hydrolyzed yeast showed lower breast meat yield than birds received other yeast levels, but were equals to control treatment control. However, carcass and tender yield, and abdominal fat were not influenced by treatments. These results indicated efficacy of hydrolyzed yeast utilization on broiler diets from 1 to 14 on production characteristics.

Existe atualmente uma restrição muito forte ao uso de antibióticos como promotores de crescimento na alimentação avícola, uma vez que tais produtos passaram a ser vistos como fatores de risco para a saúde humana. Estudos com produtos alternativos tornaram-se necessários e, neste sentido, as leveduras vem sendo exploradas, principalmente, seu conteúdo celular. Dessa forma, o presente estudo teve como objetivo avaliar o uso de levedura hidrolisada, fonte de nucleotídeos, sobre o desempenho e imunidade de frangos de corte, suplementados no período de 1 a 14 dias de idade. Foram utilizados 576 pintos de corte, machos, linhagem Ross 308, criados até 42 dias de idade sobre cama reutilizada. O delineamento foi inteiramente casualizado com 6 tratamentos: controle negativo (sem suplementação); controle positivo (com antibiótico) e diferentes níveis de adição de levedura hidrolisada (0,25%; 0,50%; 0,75% e 1,00%), sendo 8 repetições/tratamento. Considerando-se o período total de criação, foram observados efeitos significativos para os parâmetros de ganho de peso (GP) e conversão alimentar (CA). Por sua vez, o parâmetro de consumo de ração (CR) não apresentou efeitos significativos entre os tratamentos. Com relação à imunidade, a suplementação com levedura hidrolisada apresentou efeito sobre a resposta a vacinação contra a doença de Newcastle, produção de água oxigenada, óxido nítrico e influenciou também no peso relativo dos órgãos linfóides, com destaque para o nível 0,75% de suplementação. Diante dos resultados obtidos no presente estudo, pode-se concluir que a levedura hidrolisada, suplementada durante o período de 1 a 14 dias de idade, promove efeitos significativos no desempenho durante todo o período de criação e também influencia na imunidade das aves. / There is currently a strong restriction on the usage of antibiotics as growth promoters in broiler feed, since such products were seen as risk factors for human health. Research with alternative products has became necessary, and the yeast has been exploited, particularly its cellular content. Thus, this experiment was aimed at evaluating the use of hydrolyzed yeast, source of nucleotides on performance and immunity of broiler chickens supplemented during the period of 1 to 14 days old. A total of 576 male chicks, Ross 308 were raised up to 42 days old, on reused litter. The design was completely randomized with six treatments: negative control (no supplementation), positive control (with antibiotic) and different levels of hydrolyzed yeast (0.25%; 0.50%; 0.75% e 1.00%), with 8 replicates per treatment. Considering the whole breeding period, significant effects were observed for parameters of weight gain (WG) and feed conversion (FC). However, the parameter of feed consumption (FC) had no significant effect among the treatments. Regarding to immunity, the hydrolyzed yeast supplementation had an effect on the response to vaccination against Newcastle disease, production of hydrogen peroxide, nitric oxide and also influenced the relative weight of lymphoid organs, especially the 0.75% level of supplementation. With the results obtained in this experiment it is possible to conclude that the hydrolyzed yeast supplementation, during the period of 1 to 14 days old, promotes a significant effect on performance throughout the whole rearing period and also influences the immunity of the broiler chicks.

O Experimento foi realizado com o objetivo de avaliar a substituição parcial e total de plasma bovino por levedura hidrolisada na dieta de leitões desmamados no período de 21 a 47 dias de idade. Foram utilizados 1600 leitões da linhagem PIC, distribuídos em blocos ao acaso, com quatro tratamentos. As dietas foram divididas em quatro fases (pré-inicial I 22 a 28 dias; pré-inicial II 29 a 35 dias; inicial I - 36 a 47 dias e inicial II 48 a 63 dias). A inclusão percentual, Plasma: Levedura, nas dietas foi: T1 (6:0; 4:0; 2:0 e 0:0); T2 (3: 4; 2: 3; 1: 2 e 0: 0); T3 (1,5: 6; 1: 4,5; 0,5: 3 e 0: 0) e T4 (0: 8; 0: 6; 0: 4 e 0: 0). Cada tratamento teve 10 repetições (cinco de machos e cinco de fêmeas) totalizando 40 unidades experimentais com 40 animais cada. As variáveis zootécnicas avaliadas durante o período experimental foram: consumo de ração, ganho de peso, e conversão alimentar. Foram tomadas amostras de sangue de 5 animais por tratamento no dia de início do experimento, e de 10 animais por tratamento 25 dias depois. Foram quantificadas a IgA e a IgG. Os dados obtidos foram submetidos a análise de variância ANOVA, utilizando-se o teste Tukey para comparação das médias ao nível de significância de 5% utilizando o pacote estatístico SAS. Não houve diferença estatística nas quantidades de Ig A e Ig G circulante, nem na variação destas imunoglobulinas no tempo, entre os tratamentos. Considerando a análise dos dados conclui-se que nas condições estudadas, a utilização da relação percentual de (1,5: 6; 1: 4,5; 0,5: 3 e 0: 0) de plasma: levedura hidrolisada resultou um maior consumo de ração e ganho de peso dos animais, em comparação às outras proporções, e consequentemente podendo trazer um maior lucro para o produtor / The experiment was performed with the objective of evaluating the partial and complete substitution of bovine plasma for hydrolyzed yeast in the diet of weaned piglets from 21 to 47 days old. 1600 piglets of PIC lineage were used and randomly distributed in blocks where they received four treatments. Their diets were divided into four phases (pre-initial I: 22 to 28 days; pre-initial II- 29 to 35 days; initial I- 36 to 47 days and initial II-48 to 63 days). The percentage inclusion Plasma:Yeast in the diets were: T1 (6:0; 4:0; 2:0 and 0:0); T2 (3: 4; 2: 3; 1: 2 and 0: 0); T3 (1.5: 6; 1: 4.5; 0.5: 3 and 0: 0) and T4 (0: 8; 0: 6; 0: 4 and 0: 0). Each treatment had 10 repetitions (five times with the males and five times with the females), totaling 40 experimental units with 40 animals each. Husbandry variables evaluated during the trial period were: feed intake, body weight gain and feed conversion. Blood samples of 5 animals per treatment were taken at the beginning of the experiment day, and 10 animals per treatment 25 days later. IgA and IgG were quantified. The data obtained were analyzed by ANOVA analysis of variance, using the Tukey test to compare means at the 5% significance level, using the statistical package SAS. There was no statistical difference in the quantities of Ig A and Ig G circulating, or the variation of these immunoglobulins in the time, between treatments. Considering the analysis of the data it was concluded that the conditions studied, the percentage utilization ratio of (1.5: 6; 1: 4.5: 0.5: 3 and 0: 0) plasma: hydrolyzed yeast resulted in a higher feed intake and weight gain of animals compared to other proportions, and consequently can bring higher profits to the producer

O avanço tecnológico dos laboratórios de biologia molecular tem proporcionado um grande aumento no volume de seqüências de nucleotídeos armazenadas em bancos de dados biológicos, introduzindo o desafio de pesquisar eficientemente estes dados. Neste contexto, a árvore de sufixo é um método de acesso utilizado por muitas aplicações que envolvem pesquisa em dados biológicos. Entretanto, o custo de construção das árvores de sufixo é alto devido ao tamanho da estrutura de indexação gerado e à necessidade da árvore de sufixo caber em memória principal para ser construída com complexidade linear em relação ao tempo. Esta dissertação propõe o Perseus, uma nova técnica para tratar árvores de sufixo persistentes. A técnica Perseus apresenta os seguintes diferenciais. Ela introduz uma abordagem que realiza a construção de árvores de sufixo persistentes cujos tamanhos podem exceder a capacidade da memória principal. Além disso, ela provê um algoritmo que constrói árvores de sufixo por meio do particionamento destas árvores somente quando necessário. Esta construção também permite que o usuário escolha quais subseqüências de uma seqüência devem ser indexadas, de acordo com os requisitos particulares de suas aplicações. Por fim, a técnica proposta também introduz um algoritmo de casamento exato que permite a busca por uma seqüência de consulta em árvores de sufixo que podem estar particionadas. A validação do Perseus foi realizada por meio de testes de desempenho considerando genomas de vários organismos, os quais possuem diferentes ordens de magnitude de tamanho. Os resultados obtidos foram comparados com a técnica Trellis+, a qual representa o estado da arte nesta linha de pesquisa. Os testes indicaram que o Perseus construiu árvores de sufixo mais rapidamente do que o Trellis+, reduzindo o tempo total gasto na construção em até 24%. Perseus também criou árvores de sufixo mais compactas, atingindo uma redução média de 27% no espaço de memória secundária utilizado. Já com relação ao tempo total gasto no processamento de consultas, Perseus sempre produziu os melhores resultados, respondendo consultas em média 49% mais rápido do que o seu principal concorrente. Com relação à indexação de subseqüências escolhidas pelo usuário, comparando os resultados obtidos com o Trellis+, os testes mostraram que Perseus proveu uma redução no tempo de construção de árvores de sufixo de 97% na média e uma redução no tempo gasto no processamento de consultas de genes de 93% na média / Due to the technological advances in molecular biology laboratories, biological databases are extremely voluminous and tend to become more voluminous as data on new genome organisms are available. This introduces the challenge of searching nucleotide sequences efficiently. The suffix tree is an access method used for several applications that search for these data. However, the cost of building suffix trees is high, since they are extremely large data structures and they should fit in the main memory to be constructed in linear time. In this masters thesis, we propose the Perseus, a novel technique that handles persistent suffix trees. The Perseus introduces the following distinctive good properties. It is based on an approach that constructs persistent suffix trees whose sizes may exceed the main memory capacity. Furthermore, it provides an algorithm that allows for users to indicate which substrings of the input string should be indexed, according to the requirements of their applications. Moreover, it proposes an extended exact matching algorithm that searches for a query string into suffix trees that may be partitioned. The Perseus was validated through performance tests using genomes of several organisms of different sizes. The results were compared with the Trellis+ technique, which represents the state-of-the-art in this field. The tests showed that the Perseus reduced the time spent on constructing suffix trees by 24%. The Perseus also constructed compacter suffix trees, providing an average reduction in the secondary memory storage of 27%. Furthermore, the Perseus reduced the time spent on query processing of nucleotide sequences by up to 49%. As for the functionality of indexing substrings according to the users requirements, the Perseus greatly improved the query performance in comparison to the Trellis+. The results showed that the Perseus reduced the time spent on constructing suffix trees by 97% on average and the time spent on query processing of genes by 93% on average