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Propagação semi-automática de termos Gene Ontology a proteínas com potencial biotecnológico para a produção de bioenergia / Semi-automatic propagation of Gene Ontology terms to proteins with biotechnology potential for bioenergy productionLucas Mitsuo Taniguti 18 November 2014 (has links)
O aumento no volume de dados biológicos, oriundos principalmente do surgimento de sequenciadores de segunda geração, configura um desafio para a manutenção dos bancos de dados, que devem armazenar, disponibilizar e, no caso de bancos secundários, propagar informações biológicas para sequências sem caracterização experimental. Tal propagação é crucial , pois o fluxo com que novas sequências são depositadas é muito superior ao que proteínas são experimentalmente caracterizadas. De forma análoga ao EC number (Enzyme Commission number), a organização de proteínas em famílias visa organizar e facilitar operações automáticas nos bancos de dados. Dentro desse contexto este trabalho teve como objetivos a geração de modelos computacionais para famílias de proteínas envolvidas em processos microbianos biotecnologicamente interessantes para a produção de bioenergia. Para a geração dos modelos estatísticos foram escolhidas proteínas referência analisadas a priori em colaboração com o projeto MENGO1 . A partir da proteína referência foram realizadas buscas no UniProtKB com o objetivo de encontrar proteínas representativas para cada família e descrições de função com base na literatura científica. Com a coleção de sequências primárias das proteínas selecionadas foram realizados alinhamentos múltiplos de sequências com o programa MUSCLE 3.7 e posteriormente com o programa HMMER foram gerados os modelos computacionais (perfis de cadeia oculta de Markov). Os modelos passaram por consecutivas revisões para serem utilizados na propagação dos termos do Gene Ontology com confiança.Um total de 1.233 proteínas puderam receber os termos GO. Dessas proteínas 79% não apresentavam os termos GO disponibilizados no banco de dados UniProtKB. Uma comparação dos perfis-HMM com a utilização de redes de similaridade a um E-value de 10-14 confirmou a utilidade dos modelos na propagação adequada dos termos. Uma segunda validação utilizando um banco de dados construído com sequências aleatórias com base nos modelos e na frequência de codons das proteínas anotadas do SwisProt permitiu verificar a sensibilidade da estratégia quanto a recuperar membros não pertencentes aos modelos gerados. / The increase of biological data produced mainly by the second generation technologies stands as a challenge for the biological databases, that needs to adress issues like storage, data availability and, in the case of secondary databases, to propagate biological information to sequences with no experimental characterization. The propagation is important since the flow that new sequences are submited into databases is much higher than proteins having their function described by experiments. Similarly to the EC. number (Enzyme Commission number), an organization of protein families aims to organize and help automatic processes in databases. In this context this work had as goals the generation of computational models for protein families related to microbial processes with biotechnology potential for production of bioenergy. Several proteins annotated by MENGO2, a project in collaboration, were used as seeds to the statistic models. Alignments were made on UniProtKB, querying the seeds proteins, looking for representatives for each family generated and the existence of function descriptions referenced on the cientific literature. Multiple sequence alignment were made on each collection of seeds proteins, representatives of the families, thorough the MUSCLE 3.7 program, and after were generated the computational models (profile Hidden Markov Models) with the HMMER package. The models were consecutively reviewed until the curator consider it reliable for propagation of Gene Ontology terms. A set of 1,233 proteins from UniProtKB were classified in our families, suggesting that they could be annotated by the GO terms using MENGOfams families. From those proteins, 79% were not annotated by the MENGO specific GO terms. To compare the results that would be obtained using only BLAST similarity measures and using pHMMs we generated similarity networks, using an Evaue cutoff of 10-14. The results showed that the classification results of pHMMs are valuable for biological annotation propagation because it identifies precisely members of each family. A second analysis was applied for each family, using the respective pHMMs to query a collection of sequences generated by a null model. For null model were assumed that all sequences were not homologous and could be represented just by the aminoacid frequencies observed in the SwissProt database. No non-homologous proteins were classified as members by the MENGOfams models, suggesting that they were sensitive to identify only true member sequences.
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Análise do perfil do cirurgião-dentista inserido nas estratégias de saúde da familia das cidades pertecentes à DRS VII - Campinas - São Paulo / Dentists profile analysis in the Family Health Strategies in the cities belonging to the DRS VII Campinas São PauloJorge Luís Marques Fernandes 09 February 2009 (has links)
O presente estudo teve como objetivo analisar o trabalho dos cirurgiões dentistas que atuam nas cidades do Departamento Regional de Saúde VII (DRS VII) Campinas, São Paulo e que utilizam a Estratégia de Saúde da Família (ESF) enquanto estruturante do modelo de atenção à saúde. A partir das análises desenvolvidas traçou-se o perfil dos profissionais envolvidos, bem como, a incorporação das diretrizes preconizadas pelo Ministério da Saúde para o trabalho com equipes de saúde da família. A ESF é um potente instrumento capaz de reorganizar o processo de trabalho das unidades de saúde, invertendo o modelo assistencial anteriormente centrado no profissional, direcionando o foco para os usuários do sistema. Para atuação plena em saúde da família são requeridos habilidades e conhecimentos específicos dos profissionais. Saber se os profissionais estudados possuem tais exigências, constituem num dos objetivos deste estudo. Muitos avanços foram observados a partir da implantação da ESF, como trabalho multiprofissional, incorporação dos agentes comunitários de saúde, reuniões sistemáticas das equipes, dentre outros. Porém, pudemos constatar que muitos problemas e desafios ainda precisam ser superados, dentre eles: o acesso reduzido; falta de recursos humanos; demanda excessiva; poucas ações no território; controle social pouco efetivo; carência de capacitações continuadas e condições de trabalho inadequadas. / The objective of this study was to analyze the work of the dental surgeons working in the cities of the Health Regional Department VII (DRS VII) Campinas, São Paulo, and that use the Family Health Strategy (ESF) as basis of the health care model. We verified the professionals profile and the lines of direction of implementation as per praised by the Health Ministery. The ESF is a powerful instrument capable of organizing the work process in the healthcare settings, changing the previously healthcare model that was centered in the professional, and with focus in the system\'s users. To achieve the full performance in the health family, abilities and specific knowledge are required. One of the objectives of this study is to know if the studied professionals achieve this profile. Many advances were observed, as multiprofessional work, community health agents incorporation, systematic meeting of the team, among others. However, we found that many problems and challenges must still be surpassed, as per: reduced access; lack of human resources; excess of demand; few actions in the territory; lack of effectiveness of the social control; lack of continuing team training and inadequate work conditions.
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Avaliação do perfil clínico e epidemiológico dos pacientes portadores do HIV, atendidos em unidade de emergência de alta complexidade / Evaluation clinical and epidemiological profile of patients with HIVServed in High Complexity Emergency UnitEdna Aparecida Alves da Silva 22 November 2017 (has links)
A epidemia da AIDS é considerada a mais importante ocorrida no século XX, segue sendo um importante problema de saúde pública e está relacionada a múltiplos fatores clínicos e epidemiológicos. Este estudo teve os objetivos de analisar e descrever o perfil epidemiológico e clinico dos pacientes portadores HIV que são admitidos numa Unidade de Emergência em serviço de alta complexidade, descrever o perfil sociodemográfico, avaliar as causas de internações, a evolução clinica desses pacientes e a aderência aos antirretrovirais. Trata-se de um estudo transversal, realizado na Unidade de Emergências do Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo, no período de Março a Dezembro de 2016. Para verificação de associação entre variáveis foi empregado como medida de associação a Razão de Prevalência (RP) e seu Intervalo de Confiança a 95% (IC95%), inicialmente através de analises univariadas e posteriormente por analises multivariadas empregando-se regressão logística. Na comparação de medidas de tendência central, foi utilizado teste t Student para amostras independentes. Os resultados apresentados mostraram o predomínio dos pacientes do sexo masculino e da raça caucasiana, sendo em sua maioria moradora da cidade de Ribeirão Preto, com media de idade em 44 anos. As mulheres apresentaram tempo maior convivendo com o diagnostico de HIV em relação aos homens, a forma de contagio predominante foram as relações sexuais desprotegidas, os pacientes do sexo masculino apresentaram maior incidência na utilização de álcool, drogas e tabaco. Na comparação entre a carga viral e a contagem de células CD4 não houve diferenças estatísticas significantes (>0,05), na avaliação entre a carga viral e o uso da terapia antirretroviral houve diferenças estatísticas, no entanto, sendo observado que quem faz uso regular da terapia apresenta menor copias do vírus no organismo. Conclui-se que se faz necessária a melhora das políticas de saúde direcionadas à informação, educação e prevenção das DST/AIDS, bem como, adotar praticas de combate aos fatores que interferem na adesão á terapia medicamentosa. / The AIDS epidemic is considered to be the most important one occurred in the 20th century. It is still an important matter of public health and is related to multiple clinical and epidemiological factors. The objective of this study is to analyze and describe the epidemiological and clinical profile of patients with HIV who are admitted to an Emergency Unit in highly complex service, to describe the sociodemographic profile, to assess the causes of hospitalizations, clinical evolution of these patients and adherence to antiretrovirals. This is a cross-sectional study carried out at the Emergency Unit of the Clinics Hospital of Ribeirao Preto Medical School, University of Sao Paulo from March to December 2016. To verify the association between variables, the Prevalence Ratio (PR) and its Confidence Interval a 95% (95% CI) were employed as a measure of association, initially through univariate analyzes and later by multivariate analyzes using logistic regression. In the comparison of measures of central tendency, Student test for independent samples was used. The results presented showed the prevalence of male and Caucasian patients, being mostly residents of the city of Ribeirão Preto, with a mean age of 44 years, women presented greater time living with the diagnosis of HIV in relation to men, the predominant form of infection was unprotected sexual intercourse; male patients had a higher incidence of alcohol, drug and tobacco use; in the comparison between viral load and CD4 count, there was no, there were statistically significant differences between the viral load and the use of antiretroviral therapy, observing that those who regularly use the therapy have fewer copies of the virus in the body. In conclusion, it is necessary to improve health policies aimed at information, education and STD/AIDS prevention, and adopt practices to combat factors that interfere in adherence to drug therapy.
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Perfil diferencial de microRNAs em células do Cummulus oophorus de mulheres inférteis com e sem endometriose submetidas à estimulação ovariana / Differential profile of microRNAs in Cumulus oophorus cells from infertile women with and without endometriosis submitted to ovarian stimulationLiliane Fabio Isidoro da Silva 27 September 2017 (has links)
Questiona-se um possível papel deletério da endometriose sobre a qualidade oocitária (QO), que é, em grande parte, condicionada pelo papel das células do cumulus. A função dessas células envolve a expressão de diversas moléculas codificadas por genes específicos, regulada a nível de transcrição, pós-transcrição e tradução. Os microRNAs atuam como reguladores póstranscricionais da expressão gênica, de modo que qualquer alteração nesse mecanismo pode levar a anormalidades no desenvolvimento oocitário. Desta forma, propusemos um estudo inédito da análise de microRNAs em células do cumulus (CC) de mulheres inférteis com e sem endometriose com o objetivo de evidenciar processos biológicos e vias de atuação correlacionados com o papel da endometriose na infertilidade e seu possível impacto na aquisição da competência oocitária. Foram incluídas no estudo 15 pacientes inférteis (5 controles com fator tubário e/ou masculino, 5 com endometriose estágios I/II e 5 com endometriose estágios III/IV) submetidas à estimulação ovariana controlada (EOC) para injeção intracitoplasmática de espermatozoide (ICSI). Imediatamente após a captação oocitária, as CCs foram isoladas e armazenadas para extração dos miRNAs. O perfil de 754 miRNAs foi analisado por meio da técnica de TaqMan®Array Human MicroRNA Cards. Considerou-se significativo p<0,05. Os miRNAs hsa-let-7f-1#, hsa-miR-1291, hsa-miR-140-5p, hsa-miR-218, hsa-miR-30b e hsa-miR-629-5p foram identificados menos expressos nas pacientes com endometriose I/II comparadas às controles. Os miRNAs hsa-miR-1291, hsa-miR-187-3p, hsamiR-30b, hsa-miR-532-3p e hsa-miR-629-5p foram identificados menos expressos nas pacientes com endometriose III/IV em relação às controles. Ao comparar-se os grupos endometriose I/II e endometriose III/IV entre si, os miRNAs hsa-miR-187-3p e hsa-miR-532- 3p foram menos expressos e os miRNAs hsa-let-7f-1# e hsa-miR-362-3p mais expressos nas pacientes com endometriose III/IV. A análise de enriquecimento identificou os genes regulados pelos miRNAs e as respectivas vias metabólicas em que estão envolvidos, sugerindo aumento de apoptose, diminuição de proliferação celular, alterações no controle do ciclo celular e no metabolismo energético das CCs de mulheres com a doença inicial e avançada. Os dados apontam para alterações na regulação pós-transcricional em CCs de mulheres inférteis com endometriose inicial e avançada, o que pode afetar processos e vias essenciais à aquisição de competência oocitária e estar envolvido na infertilidade associada à doença. Este estudo contribui para o entendimento da etiopatogênese da infertilidade relacionada à endometriose identificando mecanismos pós-transcricionais relacionados à piora da qualidade gamética nestas mulheres. / It is questioned a possible deleterious role of endometriosis on oocyte quality (OQ), which is largely conditioned by the function of cumulus cells. The role of these cells involve the expression of several molecules encoded by specific genes, regulated at transcription level, post-transcription and translation. The microRNAs act as transcriptional regulators of gene expression, thus any alteration in this mechanism can lead to abnormalities in oocyte development. In this way, we proposed an unpublished study of the microRNAs analysis in cumulus cells (CC) of infertile women with and without endometriosis, aiming to evidence the biological processes and pathways of action correlated with the presence of endometriosis in infertility and its possible impact on the acquisition of oocyte competence. Fifteen infertile patients (5 controls with tubal factor and/or male, 5 with stage I/II of endometriosis and 5 with stages III/IV of endometriosis) submitted to the controlled ovarian stimulation (EOC) for intracytoplasmic sperm injection (ICSI) were included in the study. Immediately after oocyte uptake, CCs were isolated and stored for miRNA extraction. The 754 miRNAs profile was analyzed using the TaqMan®Array Human MicroRNA Cards technique. Significant values were considered when p <0.05. The hsa-miR-218, hsa-miR-301 and hsa-miR-629-5p miRNAs were identified as less expressed in the patients with endometriosis I/II compared to controls. The miRNAs hsa-miR-1291, hsa-miR-187-3p, hsa-miR-30b, hsa-miR-532-3p and hsa-miR- 629-5p were identified as less expressed in patients with endometriosis III/IV compared to controls. Comparing the groups with endometriosis I/II and endometriosis III/IV, hsa-miR-187- 3p and hsa-miR-532-3p miRNAs were less expressed and hsa-let-7f-1# and hsa-miR-362-3p more expressed in patients with endometriosis III/IV. The enrichment analysis identified the genes regulated by the miRNAs and the respective metabolic pathways in which they are involved, suggesting apoptosis increase, decreased cell proliferation, alterations in the cell cycle control and energetic metabolism of the CCs of women with initial and advanced disease. The data point to changes in post-transcriptional regulation in CCs of infertile women with early and advanced endometriosis, which may affect processes and pathways essential for acquiring oocyte competence and resulting in infertility associated with the disease. This study contributes to the understanding of the etiopathogenesis of infertility related to endometriosis by identifying post-transcriptional mechanisms related to the deterioration of quality of gametes in these women.
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Caracterização da expressão genica de celulas tumorais de pacientes com adenocarcinoma esporadico do colon / Characterization of gene expresiion of tumoral cells in patients with sporadic colon adenocarcinomaNascimento, Helvia 12 August 2018 (has links)
Orientador: Carmen Silvia Passos Lima, Fernando Ferreira Costa / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciencias Medicas / Made available in DSpace on 2018-08-12T11:53:50Z (GMT). No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 2007 / Resumo: Os mecanismos moleculares envolvidos na origem do adenocarcinoma de cólon esporádico (ACE) ainda não estão completamente elucidados. Recentemente, o método da análise seriada da expressão gênica (SAGE) foi descrito como eficaz para identificar a expressão total de genes de tipos celulares diversos, mas esta análise não foi realizada em células epiteliais purificadas do ACE moderadamente diferenciado. Nós caracterizamos pelo método SAGE a expressão gênica total de células epiteliais neoplásicas do cólon de um paciente com ACE moderadamente diferenciado (SAGE CC) e de células epiteliais normais do cólon de um paciente com megacólon chagásico (SAGE CN). Foram geradas, após o seqüenciamento automático, 44.004 e 43.570 tags totais das bibliotecas SAGE CC e SAGE CN, representando 16.484 e 13.479 tags únicas, respectivamente. Na comparação entre as bibliotecas, 171 transcritos diferencialmente expressos foram identificados (P< 0,001; expressão diferencial = 5), incluindo 10% de transcritos que podem representar genes não descritos. As expressões de 10 genes diferencialmente expressos foram quantificadas pela reação em cadeia da polimerase em tempo real (qPCR) na amostra de células epiteliais neoplásicas (SAGE CC), com o intuito de
validar os resultados obtidos pelo SAGE, e, posteriormente, em amostras de células epiteliais de outros cinco pacientes com o mesmo tipo de doença. As expressões foram concordantes em 80% dos genes (CEACAM6, KLK6, LYZ, PFN1, S100A8, S100A9, VIL2 e ZFHX1B) e discordantes nos demais 20% (PLA1A e ZNF277). As expressões dos genes de interesse, quantificadas pelos dois métodos, foram similares na amostra SAGE CC e nas amostras dos demais pacientes com a doença. Foram observadas expressões anormais de genes envolvidos com a proliferação e diferenciação celular e com a resposta ao stress em células epiteliais neoplásicas. Foram também visualizadas expressões anormais de genes não relacionados com a doença e de genes ainda não identificados. Em conjunto, os nossos resultados podem contribuir para a identificação de genes relacionados com a origem ou a progressão do ACE moderadamente diferenciado e, ainda, para a descoberta de agentes terapêuticos específicos que controlem a proliferação anormal das células neoplásicas. / Abstract: The molecular mechanisms involved in sporadic colon adenocarcinoma (SCA) are still not completely elucidated. Recently, the serial analysis of gene expression (SAGE) method has allowed the global analysis of genes expressed in diverse cellular types but there are no studies in purified epithelial cells of SCA moderately differenciated. We have characterized through SAGE the global gene expression of neoplastic epithelial cells from a SCA moderately differenciated patient (SAGE CC) and normal epithelial cells from a megacolon patient (SAGE CN). After automatic sequencing, a total of 44.004 tags from SAGE CC and 43.570 tags from SAGE CN profiles were generated, representing 16.484 and 13.479 unique tags, respectively. Comparing both profiles, 171 differentially expressed transcripts were identified (P< 0.001; fold = 5), including 10.0% that may represent novel transcripts. The expression of 10 selected genes was further investigated by realtime polymerase chain reaction (qPCR) in the SCA moderately differenciated epithelial cells sample (SAGE CC), with the purpose of to validate the results obtained by the SAGE method, and also in five epithelial cells samples from the same type of SCA patients. Similar expressions were seen in 80% (CEACAM6, KLK6, LYZ, PFN1, S100A8, S100A9, VIL2 e ZFHX1B) and discordant expressions were seen in 20% (PLA1A e ZNF277) of analysed genes. On SAGE CC sample and samples of the SCA patients, all genes presented similar expressions measured by both methods. We observed abnormal expression of genes involved with cell proliferation and differentiation, and with response to stress in neoplastic epithelial cells. Also, were found abnormal expressions of genes not related with the disease and not identified genes. Together, our results may contribute for the identification of genes involved in the origin or progression of SCA moderately differenciated, as well as for the discovery of new therapeutical agents, with specific action on abnormal proliferation of the neoplastic cells. / Doutorado / Ciencias Basicas / Doutor em Clínica Médica
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Dimensões da tutoria da educação a distância: perfil, formação e práticaPires, Francisca Cristina de Oliveira e 28 March 2017 (has links)
Submitted by Renata Lopes (renatasil82@gmail.com) on 2017-10-21T00:59:23Z
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Previous issue date: 2017-03-28 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Esta tese é resultado de uma pesquisa desenvolvida junto aos atores de licenciaturas de universidades federais mineiras vinculadas ao sistema UAB, com o propósito de conhecer algumas dimensões do perfil, dos processos formativos e da prática pedagógica relacionados aos tutores da EaD. Como suporte histórico, este texto traz informações sobre a regulamentação e regulação da educação a distância no Brasil, desde a sua implementação na década de 1970, até os Decretos vigentes, bem como sobre a Secretaria responsável pela modalidade de educação no País. Autores como Bernadete Gatti, Maria Luiza Belloni, Daniel Mill e Adriana Rocha Bruno compõem o referencial teórico deste trabalho, uma vez que tratam das especificidades da EaD e, consequentemente, do papel inédito delegado aos seus atores, por conta das especificidades do processo educativo relacionado a essa modalidade de ensino. Eloiza da Silva Gomes de Oliveira e Lázaro Santos, assim como Edinéia Aparecida Blum, também trazem importantes contribuições a esta pesquisa, com a discussão sobre a importância da formação dos que atuam na educação a distância, devido ao surgimento de uma nova cultura educacional, na qual uma nova prática pedagógica passa a ser estruturada, não bastando a transposição da prática pedagógica do ensino presencial para o que o ocorre virtualmente. O presente trabalho se desenvolveu tendo por base o estudo bibliográfico, a análise documental e a pesquisa de campo realizada com tutores, coordenadores de curso, professores, coordenadores de tutoria e alunos. As respostas obtidas foram analisadas à luz do que o referencial teórico apresenta sobre outras pesquisas realizadas, bem como o que é definido pelos documentos oficiais sobre as dimensões da tutoria. Com relação ao perfil, identificamos um engessamento, uma vez que, para o recebimento da remuneração por seus serviços, os tutores precisam atender a alguns pré-requisitos exigidos oficialmente. Sobre a formação, os dados demonstraram que, apesar de os atores afirmarem receber uma que os capacita para a prática, ela não condiz com o que a demanda exige deles. Fazemos tal afirmação baseando-nos nos problemas elencados pela tutoria, que estão relacionados a uma prática solitária, sem o envolvimento dos professores, que acabam por delegar somente a esses atores o papel de atuação no dia a dia da disciplina, não compartilhando com eles a docência. Assim, ao contrário do que ocorre com relação ao perfil, na prática, não há o atendimento ao que preveem as diretrizes oficiais, que atribuem ao professor funções relacionadas à docência; e, ao tutor, o de ser um apoio daquele. / This thesis is the result of a research carried out with the undergraduate actors of Minas Gerais federal universities linked to the UAB system, with the purpose of studying the profile, the formative processes and the pedagogical practice related to tutors of EaD (Distance Education). This text provides information on the regulation of distance education in Brazil, since its implementation in the 1970s. Authors like Bernadete Gatti, Maria Luiza Belloni, Daniel Mill and Adriana Rocha Bruno compose the theoretical reference of this study, since they deal with the specificities of EaD and, consequently, of the unpublished role delegated to its actors, due to the specificities of the educational process related to this type of teaching. Eloiza da Silva Gomes de Oliveira and Lázaro Santos, as well as Edinéia Aparecida Blum, also bring important contributions to this research, with the discussion about the importance of the training of those who work in distance education due to the emergence of a new educational culture, in which a new pedagogical practice becomes structured, not simply transposing face-to-face teaching to virtual learning. The present work was developed based on bibliographic study, documentary analysis and field research carried out with tutors, course coordinators, teachers, mentoring coordinators and students. The answers obtained were analyzed under the light of theoretical reference present in other researches already carried out, as well as of what is defined by the official Brazilian documents related to tutoring. We identified an engagement of tutors, who must meet some officially required prerequisites since in order to receive remuneration for their services. The data obtained showed that, although the tutors claim to receive a training support that enables them to practice, it does not match what is really demanded of them. Those engaged in tutoring relatet to a solitary practice, without the involvement of the teachers, who only delegate the role of acting in the day to day of the discipline, not sharing the teaching with them. Therefore, different from what happens with respect to the profile, in practice, there is the attendance to what is provided by the official guidelines that assign the teachers with functions related to teaching, while the tutor is meant to be supporttive of their practice.
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Aspectos de qualidade para caracterização de salsichas comerciais / Aspects of quality for characterization of commercial frankfurters type sausageAndrade, Juliana Cunha de 19 August 2018 (has links)
Orientador: Helena Maria André Bolini / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia de Alimentos / Made available in DSpace on 2018-08-19T15:33:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 2012 / Resumo: A industria de embutidos representa um importante segmento no setor de carnes. O preco acessivel, a praticidade no preparo, e o valor proteico desses produtos contribuem para a evolucao significativa do consumo, tornando-os parte do habito alimentar de uma parcela consideravel de consumidores brasileiros. Este estudo teve por objetivo avaliar a qualidade de salsichas comerciais com maior representatividade no mercado varejista na cidade de Campinas/SP, a fim de encontrar atributos fisicos, quimicos e sensoriais associados a aceitacao do produto pelos consumidores. Foram selecionadas seis marcas de salsicha (A, B, C, D, E e F) e avaliadas quanto ao teor de sodio, amido, nitrito, nitrato, composicao centesimal, pH, analises instrumentais de cor (sistema CIE Lab) e textura, Analise Descritiva Quantitativa (ADQ) e teste de aceitacao. Foi aplicado Analise de Variancia (ANOVA) e Teste de Media de Tukey pelo programa estatistico SAS. Utilizando o programa XLStat foram gerados o Mapa de Preferencia Interno e a Correlacao dos Quadrados Minimos Parciais. As analises fisico-quimicas indicaram que somente duas amostras (E e F) atenderam aos requisitos de amido, carboidratos totais, umidade, gordura e proteina estabelecidos pela legislacao brasileira sobre os padroes de identidade e qualidade de salsicha. Os resultados das medidas objetivas de cor indicaram que as amostras C, E e F apresentaram maiores valores de luminosidade, coloracao vermelha menos intensa, tanto na superficie externa quanto na interna. Na avaliacao instrumental de textura, os valores medios da forca de cisalhamento foram menores para as amostras C, D e F. A analise de perfil de textura evidenciou que a amostra F apresentou menores dureza e mastigabilidade. A amostra A apresentou o menor valor medio de forca de compressao. Na ADQ, 24 descritores caracterizaram as seis amostras de salsicha. As amostras D, E e F caracterizaram-se principalmente por apresentarem aroma e sabor caracteristico de salsicha e menores intensidades de aroma e sabor de frango. Por outro lado, a amostra C caracterizou-se por apresentar aroma e sabor de frango e soja. A amostra B destacou-se das demais amostras por apresentar sabor de tempero mais intenso e coloracao artificial. E a amostra A destacou-se por apresentar as maiores intensidades de aroma de frango, de soja, cor laranja, cor característica de curado, maciez, arenosidade, sabor de pimenta e de soja, e menores intensidades de aroma e sabor característico de salsicha, suculência, elasticidade e gosto salgado. A Análise de Componentes Principais segmentou as amostras em três grupos, um formado pelas amostras D, E e F, outro formado pela amostra B e o terceiro formado pelas amostras A e C. Os resultados do teste de aceitação indicaram que todas as amostras apresentaram boa aceitação, com exceção da amostra A, enquanto o Mapa de Preferência Interno revelou que as amostras D, E e F foram as preferidas. Por meio da Correlação dos Quadrados Mínimos Parciais observou-se que os aspectos positivos mais importantes para a aceitação de uma amostra de salsicha foram o aroma e o sabor característico de salsicha, enquanto os aspectos negativos foram a maciez e o sabor de pimenta, sendo o sabor de pimenta considerado o mais importante para não estar presente em salsichas. O atributo arenosidade contribuiu negativamente para a aceitabilidade dos produtos / Abstract: The sausage industry represents an important segment in the meat sector. The accessible price of some brands, the convenient preparation and the protein amount in this type of product contribute to the significant increase in the consumption and has made it part of the eating habits of a considerable amount of the Brazilian consumers. This research aimed to evaluate the quality of commercial frankfurter type sausage with greater representativeness in the retail market in the city of Campinas/SP to select physical, chemical and sensory characteristics related to its acceptability by the consumers. Six sausage brands were selected and the amount of sodium, starch, nitrite, nitrate, pH value and proximate composition determined. Instrumental color (CIE Lab system), texture profile analysis, Quantitative Descriptive Analysis and acceptability were carried on. The data were subjected to analysis of variance (ANOVA) and differences between mean values were evaluated by Tukey¿s multiple range test using SAS software. Using XLStat the Internal Preference Map and Partial Least Squares correlations were obtained. The physical and chemical analysis indicated that only two samples (E and F) met the requirements of starch, total carbohydrates, moisture, fat and protein within the Brazilian Legislation on standards of identity and quality of the sausage. Objective measures of color (CIE Lab System) indicated that samples C, E and F presented the highest levels of lightness, less intense red coloring, on its external surface as well as internally. In the instrumental evaluation of texture the mean values of shear force were smaller for samples C, D and F. The texture profile analysis showed that sample F presented the lowest values for hardness and chewiness, while sample A presented the lowest average of compression force among samples. In the Quantitative Descriptive Analysis (QDA) 24 attributes characterized the six samples of sausages. Samples D, E and F, were mainly characterized by its aroma, typical sausage flavor, less intensity of chicken aroma and flavor. However, sample C was characterized by its chicken and soybean aroma and flavor. Sample B stood out due to its intense seasoning flavor and artificial color, while sample A stood out due to its intensity of the aroma of chicken, soybean, orange color, cured color, softness, sandiness (perception of tiny hard bone particles), pepper, soybean flavor and less intensity of aroma and flavor of typical sausage, juiciness, springiness and salty taste. The Principle Components Analysis divided the samples in three groups, one formed by sample D, E and F, another formed by sample B and the third formed by sample A and C. The results of the acceptance test revealed that samples D, E and F were the most preferred. All samples presented a good acceptance except for sample A. By correlation of Partial Least Squares between the samples, regarding the attributes of QDA and overall impression of the acceptance test, it was observed that the most important characteristics for the acceptance of a sample of sausage were the typical aroma and flavor of sausage, meanwhile the negative aspects were softness and the pepper flavor, which was the most important to not be present in the sausage. The attribute sandiness contributed negatively for the samples acceptance / Mestrado / Consumo e Qualidade de Alimentos / Mestre em Alimentos e Nutrição
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Validação do instrumento para mensuração do impacto da doença no cotidiano do valvopata - IDCV em pacientes com hipertensão arterial / Validation of an instrument to measure the impact of the disease in daily valvopata - CVID in patients with hypertensionPavan, Renata Bigatti Bellizzotti, 1982- 21 August 2018 (has links)
Orientadores: Maria Cecília Bueno Jayme Gallani, Roberta Cunha Matheus Rodrigues / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciências Médicas. / Made available in DSpace on 2018-08-21T06:26:24Z (GMT). No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 2012 / Resumo: Este estudo teve como objetivo avaliar a praticabilidade, a aceitabilidade, os efeitos teto e chão, a confiabilidade e validade de constructo convergente, divergente e discriminante do instrumento para mensuração do Impacto da Doença no Cotidiano do Valvopata (IDCV), em pacientes hipertensos. Fizeram parte deste estudo 137 pacientes hipertensos em seguimento ambulatorial. A praticabilidade do IDCV foi avaliada por meio do tempo despendido na entrevista e a aceitabilidade pelo percentual de itens não respondidos e proporção de pacientes que responderam a todos os itens. Para análise do efeito teto e chão foi considerada a percentagem de pacientes que pontuou nos 10% melhores e piores resultados da escala, respectivamente. A confiabilidade foi avaliada por meio da estabilidade da medida e pela consistência interna, sendo utilizados os coeficientes de correlação intraclasse e o coeficiente alfa de Cronbach, respectivamente. A validade de constructo foi estimada por meio do coeficiente de correlação Spearman entre o IDCV e as medidas genérica (The Medical Study 36-item Short Form Health Survey - SF-36) e específica (Questionário de Qualidade de Vida em Hipertensão Arterial - Minichal Brasil) de qualidade de vida relacionada à saúde (QVRS), bem como com os instrumentos de medida da capacidade física (Veterans Specific Activity Questionnaire - VSAQ), Pictograma de Fadiga e Medida Geral de Impacto. A validade discriminante do IDCV foi testada com o emprego do teste de Mann Whitney para verificar se o IDCV é capaz de discriminar diferenças no impacto da doença de hipertensos com e sem controle da pressão arterial e utilizado o teste de Kruskall-Wallis e Anova com transformação por postos seguida do teste de Tukey para localização das diferenças, para testar a capacidade do IDCV em discriminar o impacto da doença entre grupos de pacientes classificados quanto a gravidade da hipertensão. O tempo médio de aplicação do IDCV foi de 8,0 (±3,0) minutos; 100% dos itens foram respondidos por todos os pacientes. Não foram detectados efeito teto e chão para o escore total do IDCV; no entanto, 31,4% dos sujeitos pontuaram "teto" no domínio Adaptação à Doença. A estabilidade da medida foi evidenciada para o escore total (ICC=0,99) e para todos os domínios. Foram constatadas evidências de consistência interna do IDCV total ('alfa'=0,83) e para os domínios Impacto Físico da Doença - Sintomas ('alfa'=0,78) e Impacto Social e Emocional da Doença ('alfa'=0,74). O IDCV total foi moderadamente correlacionado com todas as dimensões do SF-36, Minichal e Pictograma de Fadiga. Os domínios similares do IDCV, Minichal e SF-36 foram correlacionados. Correlações de moderada magnitude foram observadas entre: Impacto Social e Emocional do IDCV com a Capacidade Funcional, Dor, Estado Geral de Saúde e Vitalidade do SF-36. Além disso, indivíduos que apresentam pressão arterial não controlada tiveram escores significativamente maiores no IDCV do que aqueles com pressão controlada. O IDCV foi incapaz de discriminar os sujeitos classificados de acordo com a gravidade da hipertensão. Conclui-se que o IDCV é um instrumento de fácil aplicação e compreensão, com evidências de confiabilidade e validade de constructo convergente, divergente e discriminante em hipertensos / Abstract: This study aimed at evaluating the practicability, acceptability, ceiling and floor effects, reliability and convergent, divergent, discriminant validity of the Instrument for Measuring the Impact of Valve Heart Disease (IDCV), in hypertensive patients. One hundred thirty seven hypertensive outpatients were enrolled in the study. The practicability of IDCV was assessed by time spent in the interview and acceptance by the percentage of unanswered items and proportion of patients who answered to all items. To analyze the ceiling and floor effect it was considered the percentage of patients in the 10% best and worst results of the scale, respectively. The reliability was assessed according to the stability of the measure and internal consistency, using intraclass correlation coefficient (ICC) and Cronbach's alpha coefficient, respectively. The property of convergent/divergent validity was investigated by testing the correlation (Spearman coefficients) between the total and domains' scores of IDCV and of the Medical Outcomes Trust Short-form Health Survey (SF-36), Short Form of the Hypertension Quality of life Questionnaire (Minichal); Veterans Specific Activity Questionnaire (VSAQ), Fatigue Pictogram and General Measure of the Disease Impact. Discriminative validity of IDCV was evaluated according to the criteria of hypertension severity and control of blood pressure. The average application of IDCV was 8.0 (± 3.0) minutes; 100% of items were answered by all patients. It was not detected ceiling and floor effect for the total score of IDCV, however, 31.4% of subjects scored "ceiling" in the domain Adjustment to the Disease. The measurement stability was observed for the total score (ICC = 0.99) and for all domains. We found evidence of internal consistency IDCV total ('alpha' = 0.83) and for the domains Physical Impact of the Disease ('alpha' = 0.78) and Social and Emotional Impact of the Disease ('alpha' = 0.74). The total score of the IDCV were moderately correlated to all dimensions of the SF-36, the Minichal Questionnaire and Fatigue Pictogram total score. Similar domains on the IDCV, Minichal and SF-36 were correlated: Social and Emotional Impact of the IDCV with the Emotional domains and the Mental Health of the SF-36; and with Mental State of the Minichal; Physical Impact - Symptoms of the IDCV with Physical Functioning and Pain of the SF-36 and Somatic Manifestation of the Minichal. Correlations of moderate magnitude were also observed between: Social and Emotional Impact of the IDCV with Physical Functioning, Pain, General Health and Vitality of the SF-36. Additionally, individuals presenting uncontrolled blood pressure had statistically significantly higher IDCV scores than those with controlled levels blood pressure. The IDCV was unable to discriminate the subjects classified according to the severity of hypertension / Mestrado / Enfermagem e Trabalho / Mestra em Ciências da Saúde
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Néctar de manga (Mangífera indica L.) adoçado com diferentes edulcorantes : perfil sensorial descritivo, tempo-intensidade e estudos de consumidor / Mango nectar sweetened with high intensity sweeteners : descriptive sensory profile, time-intensity analysis and consumer researchCadena, Rafael Silva, 1983 21 August 2018 (has links)
Orientador: Helena Maria André Bolini / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia de Alimentos / Made available in DSpace on 2018-08-21T16:30:20Z (GMT). No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 2012 / Resumo: O consumo de frutas e vegetais tem sido associado com a baixa incidência de doenças degenerativas, pois efeitos protetores estão associados com componentes antioxidantes contidos nestes alimentos. Atrelado a isto, o mercado de sucos e néctares de frutas está sob um aumento significativo, o que tem atraído a atenção de agricultores, distribuidores e da indústria deste produto para saciar esta demanda. Entretanto, estes produtos estão associados à alta ingestão de sacarose proveniente da adição em sua elaboração, o que pode acarretar o desenvolvimento de doenças relacionadas ao consumo excessivo de calorias. A partir disto, este estudo objetivou analisar a aplicação de novos edulcorantes de em néctar de manga pelo estudo de perfil sensorial e físico-químico ao longo do tempo de estocagem. Neste estudo foram utilizadas amostras de néctar de manga elaboradas com polpa de manga congelada e água (1:1) adoçadas com sacarose, sucralose, estévia com 97% de rebaudiosídeo, neotame, blend acessulfame-K/sucralose/neotame (100:50:1) e blend taumatina/sucralose (1:1), totalizando 6 amostras. O perfil físico-químico foi determinado por meio da análise de pH, acidez titulável, cor (L*, a*, b*) e sólidos solúveis (ºBrix). A análise sensorial foi composta por testes descritivos, Análise Descritiva Quantitativa (ADQ) e Análise Tempo-intensidade, além de testes afetivos com escala hedônica e escala do ideal. Além destes, para o estabelecimento de equivalência de doçura foi utilizado o teste sensorial Estimação de Magnitude. A análise estatística foi composta por Análise de Variância (ANOVA), Teste de média de Tukey com nível de significância de 5% para as análises físico-químicas, ADQ, análise tempointensidade e teste afetivo com escala hedônica. O teste com escala do ideal foi analisado por distribuição em histogramas e os dados de estimação de magnitude utilizaram regressão linear em sua análise. Os provadores estabeleceram o valor de 6,8% de sacarose como a quantidade ideal para a intensidade de gosto doce. O neotame foi o edulcorante que apresentou maior poder adoçante, sendo 6026 mais doce que a sacarose, seguindo pela sucralose (627), blend taumatina/sucralose (549), blend acessulfame-K/sucralose/neotame (259) e estévia (134). Os testes físico-químicos e, em especial, a ADQ identificaram a sucralose como o edulcorante que melhor substituiu a sacarose, pois foi o aditivo que apresentou o menor número de diferenças em relação à amostra controle. A análise tempo-intensidade e os testes afetivos também identificaram a amostra sucralose com o melhor perfil relacionado ao estímulo gosto doce, com grande semelhança ao ocorrido com a sacarose e sendo esta a amostra com maior grau de aceitação no tempo zero e a única que se manteve desta forma após os 120 dias de estocagem. Em conclusão, a estévia apresentou melhorias em seu perfil quando comparadas a outros estudos, mas ainda abaixo do esperado para um substituinte de sacarose. A taumatina, uma proteína de origem vegetal apresentou bom perfil e é um aditivo que necessita de maiores estudos para melhoria de sua tecnologia. E, por fim, a sucralose, como já afirmado em outros trabalhos, é o edulcorante que melhor substitui a sacarose em sucos tropicais, sem sofrer alterações significativas após processamento térmico e ao longo do tempo de estocagem / Abstract: The consumption of fruits and vegetable has been associated with low incidence of degenerative diseases, because protective effects has been linked with antioxidant compounds contained in these foods. Attached to this, the consumer market of fruit juices and nectars under a significant increase, which has attracted the attention of producers of these products to satisfy this demand. However, these products are associated with the high ingestion of sucrose from de addition in the elaboration, which may result in the development of diseases associated with the high consumption of calorie. From that, this study aimed to analyze the application of high intensity sweeteners in mango nectar by the sensory and physical-chemical profile during the storage time. Mango nectar samples were prepared with unsweetened mango frozen pulp and water (1:1). The samples were sweetened with different high intensity sweeteners and sucrose. The sweeteners were: Neotame; Sucralose; Stevia with 97% of Rebaudioside; 1:1 Thaumatin/Sucralose blend; 100:50:1 Acesulfame-K/Sucralose/Neotame blend. The physical-chemical profile was determined by: pH, titratable acidity, color (L*, a*, b*), solids soluble (ºBrix). The sensory analysis was composed by descriptive analysis, Quantitative Descriptive Analysis (QDA) and Time-intensity Analysis (T-I), also consumer test with hedonic scale e just-about-right (JAR) scale. Magnitude estimation method was applied to establish the relative sweetness with sucrose. Statistical analysis was composed by analysis of variance and Tukey means test with 5% of significant level to physical-chemical, QDA, T-I analysis, and consumer test. The JAR scale test was analyzed by histograms distribution and the results of magnitude estimation method through linear regression. The ideal sweetness analysis revealed that 6.8% was the ideal concentration of sucrose in the mango nectar. The relative sweetness analysis showed that Neotame presented the highest sweetening power, being 6026 times sweeter than sucrose, followed by Sucralose (627), Thaumatin/Sucralose blend 1:1 (549), Acesulfame-K/Sucralose/Neotame blend 100:50:1 (259) and Stevia (134). The physical-chemical analysis and, in special, the QDA identified sucralose as the best sweetener which best sucrose substitutes, since this additive presented less differences in relation to control sample. T-I analysis and consumers test also identified the sample sucralose with best profile in relation to the sweet stimulus, with great similarity to control sample and being the sample with higher acceptability in initial time and the only one that has remained this way after 120 days of storage. In conclusion, the stevia presented improvements in its sensory profile when compared with others studies,although still lower than expected to a sucrose substitute. The thaumatin, a vegetal protein, presented good sensory profile and is a additive that requires more studies to improve its knowledges. The sucralose, as founded in other studies, is the sweetener that best replace sucrose in tropical fruit juice, with no significant change after heat treatment and during the storage time / Doutorado / Consumo e Qualidade de Alimentos / Doutor em Alimentos e Nutrição
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Aplicação da teoria fractal à quantificação da rugosidade e efeito escala da rugosidade / Fractal theory application to roughness quantification and roughness scale effectHenry Willy Revilla Amezquita 21 January 2005 (has links)
O objetivo do presente trabalho é a aplicação da teoria fractal na quantificação de perfis de rugosidade de juntas rochosas. Para esta quantificação digitalizaram-se perfis de rugosidade encontrados na literatura e posteriormente determinou-se a dimensão fractal de cada perfil utilizando três métodos. Dentre estes, estabeleceu-se que o método modificado do divisor é o mais adequado para determinar a dimensão fractal. Verificou-se também a importância do parâmetro de intersecção, que também pode quantificar o perfil de rugosidade. De uma análise comparativa se estabeleceu que o parâmetro de intersecção quantifica melhor o perfil que a dimensão fractal. Para uso prático, este parâmetro foi adimensionalizado e o novo parâmetro foi denominado como peso fractal. Este último junto com a dimensão fractal quantificam melhor o perfil de rugosidade. Avaliou-se também o comportamento da dimensão fractal, parâmetro de intersecção e peso fractal no efeito escala da rugosidade. Estes têm uma dependência do comprimento do perfil. / The purpose of the present work is the application of the fractal theory to the quantification of rock joint roughness. Rock joint roughness profiles available in the literature were digitized in order to allow quantitative analysis. The fractal dimension was determined for each profile using three different methods. Among those methods, it was found that the modified divider method is the most adequate. The importance of the intercept parameter was also found for the fractal dimension determination and roughness quantification. Based on a comparative analysis, the intercept parameter was found to be better for roughness quantification than the fractal dimension. For practical purposes, a dimensionless form of the intercept parameter was established. The new parameter was called the fractal weight. The joint use of both fractal dimension and fractal weight was found to be the most effective way to quantify rock joint roughness profiles. The influence of the three mentioned parameters on joint strength scale effect was also analyzed.
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