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Estudos estruturais e biofísicos da enzima purina nucleosídeo fosforilase hexamérica de Bacillus subtilis / Structural and biophysical studies of hexameric purin nucleoside phosphorylase of Bacillus subtillis

Martins, Nádia Helena, 1982- 20 August 2018 (has links)
Orientador: Mário Tyago Murakami / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-20T16:32:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Martins_NadiaHelena_D.pdf: 33217097 bytes, checksum: 6cbd9ad5dcfddd06e2357b3c680cd3f6 (MD5) Previous issue date: 2011 / Resumo: A enzima purina nucleosídeo fosforilase hexamérica de Bacillus subtilis (BsPNP233) c uma nucleosídeo fosforilase do tipo 1 , responsável pela catalise reversível da reação de guebra de urn nucleosídeo em base nitrogenada e ribose-1-fosfato na via de salvação de purinas. Essa enzima possui interesses biomédicos e biotecnológicos devido ao uso na terapia gênica em canceres sólidos e na biossíntese de análogos de nucleosídeos...Observação: O resumo, na íntegra, poderá ser visualizado no texto completo da tese digital / Abstract: The hexamcric purine nucleoside phosphorylase from Bacillus subtilis (BsPNP233) is a nucleoside phosphorylase typc-1 involved in purine salvage pathway by the nucleoside phosphorolysis resulting in purine base and ribose-1-phosphatc. The interest about this enzyme involves gene therapy application in solid cancers treatment and nucleoside analogs biosynthesis...Note: The complete abstract is available with the full electronic document / Doutorado / Genetica de Microorganismos / Doutor em Genetica e Biologia Molecular
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Determinação estrutural por difração de raios X de pirrolidinas poliidroxiladas com potencial atividade inibidora de purina nucleosídeo fosforilase / X Ray Diffraction Structural Determination of Polyhydroxylated Pyrrolidines with iInhibitory Potential of Purine Nucleoside Phosphorylase

Monsalve, Monica Soto 14 June 2017 (has links)
Foram determinadas por meio de difração de raios x as estruturas de cinco compostos azaçúcares. Foram estudadas as interações envolvidas na formação das redes cristalinas em cada um dos compostos analisados. Foi encontrado que nos compostos azaçúcares estudados, as interações principais são as ligações de hidrogênio do tipo C-H···O e C-H···π. Este comportamento foi verificado usando ferramentas como as superfícies de Hirshfeld e os gráficos de impressão digital. Realizou-se o estudo de docking molecular dos compostos azaçúcares com respeito à enzima purina nucleosídeo fosforilase (PNP). Foi determinado que estes compostos têm a capacidade de entrar no sitio ativo da PNP. O estudo das interações dos cinco azaçúcares com a PNP mostrou que estes compostos apresentam as mesmas interações presentes em inibidores da PNP já reportados. / Structures of five azasugars were determined by X-ray diffraction. Crystal network interactions were analyzed for each compound. The main interaction found for these azasugar compounds is hydrogen bond as C-H···O e C-H···π. This behavior was verified by tools as Hirshfeld surface and 2D finger print plots. Molecular docking was performed for azasugar compounds in Purine Nucleoside phosphorylase (PNP). This study confirmed that these compounds are available to enter to the PNP active site. Interactions exploration showed the same interactions for the azasugars studied and for already known PNP inhibitors.
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"Avaliação temporal da regulação do tônus vascular e da produção de superóxido induzido por purinas em aorta isolada de ratos Wistar endotoxêmicos" / Time course evaluation of vascular tonus and superoxide production from isolated purines in aorta of endotoxemics Wistar rats

Barbeiro, Hermes Vieira 11 August 2005 (has links)
Pacientes sépticos podem evoluir para choque séptico, destes 40% sobrevivem. Caracterizamos o modelo experimental, avaliamos fatores envolvidos na inflamação e avaliamos a modulação causada por purinas (ATP/ADP) na quantificação de superóxido (O2-) e na reatividade vascular da aorta isolada. Os resultados sugerem que na aorta isolada de animais endotoxêmicos, ATP e ADP aumentam a síntese de óxido nítrico (NO), porém somente o ATP reduz a biodisponibilidade de O2-, provavelmente pelo reacoplamento da NO sintase endotelial / Septic patients can evolve for septic shock and 40% of these survive. We characterize the experimental model we evaluate involved factors in the inflammation and evaluate the modulation caused by purines (ATP/ADP) in the superoxide quantification (O2-) and in the vascular reactivity of isolated aorta. The results suggest that in isolated aorta of endotoxemics rats, ATP and ADP increase the endothelial nitric oxide synthase (NOS) however just ATP reduces the bio availability of O2-, probably for the re-couples of the endothelial NOS synthase
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Variáveis nutricionais e fisiológicas de ovinos da raça Morada Nova de diferentes classes sexuais submetidos à restrição alimentar / Nutritional and physiological measurements of Morada Nova sheep breed of different sexual classes subjected to feed restriction

Heinzen, Eduardo Luiz January 2016 (has links)
HEINZEN, Eduardo Luiz. Variáveis nutricionais e fisiológicas de ovinos da raça Morada Nova de diferentes classes sexuais submetidos à restrição alimentar. 2016. 50 f. : Dissertação (Mestrado) - Universidade Federal do Ceará, Centro de Ciências, Departamento de Zootecnia, Programa de Pós-Graduação em Zootecnia. Fortaleza-CE, 2016. / Submitted by Eric Santiago (erichhcl@gmail.com) on 2016-08-03T13:37:27Z No. of bitstreams: 1 2016_dis_elheinzen.pdf: 1285825 bytes, checksum: 32955795d549452fb81768336e0dfffc (MD5) / Approved for entry into archive by Nádja Goes (nmoraissoares@gmail.com) on 2016-08-03T13:51:24Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2016_dis_elheinzen.pdf: 1285825 bytes, checksum: 32955795d549452fb81768336e0dfffc (MD5) / Made available in DSpace on 2016-08-03T13:51:24Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2016_dis_elheinzen.pdf: 1285825 bytes, checksum: 32955795d549452fb81768336e0dfffc (MD5) Previous issue date: 2016 / This study was accomplished with the objective of determining the effects of sexual class and feed restriction on nutrient intake, digestibility, purine derivatives, nitrogen balance, feeding behavior and physiological parameters in hair sheep Morada Nova. Thirty-five animals (11 intact males, 12 castrated and 12 females) with an initial average weight of 14.5 ± 0,89kg were used in a completely randomized design in a 3x3 factorial design with three sexual classes (intact males, castrated and females) and three levels of feed restriction (ad libitum, 30 and 60%). Sexual class and feed restriction influenced (P<0.05) the intake of dry matter (DM), organic matter (OM), crude protein (CP), ether extract (EE), neutral detergent fiber corrected for ash and protein (NDFap), total carbohydrates (TC), non-fibrous carbohydrates (NFC), total digestible nutrients (TDN) and metabolied energy (ME) and the balance of nitrogen compounds. The digestibility coefficient of DM, CP and EE were influenced (P<0.05) by feed restriction, however there was no effect (P>0.05) the sexual class on the digestibility coefficients of CP, EE and NFC. There was interaction between sexual class and feed restriction (P<0.05) in digestibility of OM, NDFap and CT. Eating times (ET) and rumination times (RUT) were affected by feed restriction (P<0.05), however they were not affected by sexual class (P>0.05). The urinary volume, excretions of creatinine, allantoin, xanthine and hypoxanthine, absorption of purine derivatives (absPD), total purine derivatives (PD) and microbial protein synthesis (micCP) were not influenced (P>0.05) by sexual class. Urine output, creatinine excretion, xanthine and hypoxanthine were not influenced by feed restriction (P>0.05), however, this factor influenced the excretion of allantoin, uric acid, absPD and PD. Physiological parameters, surficial temperature (ST) on the left of pectoral region and rectal temperature (RT), were not affected by sexual class (P>0.05). Feed restriction and the period of collect of physiological variables influenced (P<0.05) ST the left side, chest and RT. There was interaction (P<0.05) between sexual class and feed restriction ST to the right side. Intake and digestibility of nutrients are influenced by more severe dietary restrictions. Sexual class does not influence the excretion of purine derivatives and microbial protein synthesis. Feed restriction reduces heat losses by body surface of lambs. / Este estudo foi realizado com o objetivo de determinar os efeitos da classe sexual e restrição alimentar sobre o consumo de nutrientes, digestibilidade, derivados de purina, balanço de nitrogênio, comportamento ingestivo e parâmetros fisiológicos de cordeiros da raça Morada Nova. Trinta e cinco animais (11 machos inteiros, 12 castrados e 12 fêmeas), com peso médio inicial de 14,5 ± 0,89kg, foram usados em delineamento inteiramente casualizado, em esquema fatorial 3x3, sendo três classes sexuais (machos inteiros, castrados e fêmeas) e três níveis de restrição alimentar (ad libitum, 30 e 60%). A classe sexual e a restrição alimentar influenciaram (P<0,05) o consumo de matéria seca (MS), matéria orgânica (MO), proteína bruta (PB), extrato etéreo (EE), fibra em detergente neutro corrigida para cinzas e proteína (FDNcp), carboidratos totais (CT), carboidratos não fibrosos (CNF), nutrientes digestíveis totais (NDT) e de energia metabolizável (EM) e o balanço dos compostos nitrogenados. O coeficiente de digestibilidade da MS, PB e EE foram influenciados (P<0,05) pela restrição alimentar, no entanto, não houve efeito (P>0,05) da classe sexual sobre os coeficientes de digestibilidade da PB, EE e CNF. Houve interação entre a classe sexual e a restrição alimentar (P<0,05) na digestibilidade da MO, FDNcp e CT. Os tempos de alimentação (TAL) e ruminação (TRU) foram influenciados pela restrição alimentar (P<0,05), no entanto, não foram influenciados pela classe sexual (P>0,05). O volume urinário, excreções de creatinina, alantoína, xantina e hipoxantina, absorção de derivados de purina (absDP), derivados de purinas totais (DP) e síntese de proteína microbiana (PBmic) não foram influenciados (P>0,05) pela classe sexual. Volume urinário, excreções de creatinina, xantina e hipoxantina não foram influenciados pela restrição alimentar (P>0,05), no entanto, este fator influenciou as excreções de alantoína, ácido úrico, absDP e DP. Os parâmetros fisiológicos temperatura superficial (TS) do lado esquerdo, região peitoral e temperatura retal (TR) não foram influenciados pela classe sexual (P>0,05). A restrição alimentar e o período de coleta das variáveis fisiológicas influenciaram (P<0,05) a TS do lado esquerdo, peito e TR. Houve interação (P<0,05) entre classe sexual e restrição alimentar para TS do lado direito. Consumo e digestibilidade de nutrientes são influenciados por restrições alimentares mais severas. Classe sexual não influencia a excreção de derivados de purina e síntese de proteína microbiana. A restrição alimentar diminui as perdas de calor pela superfície corporal de cordeiros.
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VariÃveis nutricionais e fisiolÃgicas de ovinos da raÃa Morada Nova de diferentes classes sexuais submetidos à restriÃÃo alimentar / Nutritional and physiological measurements of Morada Nova sheep breed of different sexual classes subjected to feed restriction

Eduardo Luiz Heinzen 25 January 2016 (has links)
nÃo hà / Este estudo foi realizado com o objetivo de determinar os efeitos da classe sexual e restriÃÃo alimentar sobre o consumo de nutrientes, digestibilidade, derivados de purina, balanÃo de nitrogÃnio, comportamento ingestivo e parÃmetros fisiolÃgicos de cordeiros da raÃa Morada Nova. Trinta e cinco animais (11 machos inteiros, 12 castrados e 12 fÃmeas), com peso mÃdio inicial de 14,5  0,89kg, foram usados em delineamento inteiramente casualizado, em esquema fatorial 3x3, sendo trÃs classes sexuais (machos inteiros, castrados e fÃmeas) e trÃs nÃveis de restriÃÃo alimentar (ad libitum, 30 e 60%). A classe sexual e a restriÃÃo alimentar influenciaram (P<0,05) o consumo de matÃria seca (MS), matÃria orgÃnica (MO), proteÃna bruta (PB), extrato etÃreo (EE), fibra em detergente neutro corrigida para cinzas e proteÃna (FDNcp), carboidratos totais (CT), carboidratos nÃo fibrosos (CNF), nutrientes digestÃveis totais (NDT) e de energia metabolizÃvel (EM) e o balanÃo dos compostos nitrogenados. O coeficiente de digestibilidade da MS, PB e EE foram influenciados (P<0,05) pela restriÃÃo alimentar, no entanto, nÃo houve efeito (P>0,05) da classe sexual sobre os coeficientes de digestibilidade da PB, EE e CNF. Houve interaÃÃo entre a classe sexual e a restriÃÃo alimentar (P<0,05) na digestibilidade da MO, FDNcp e CT. Os tempos de alimentaÃÃo (TAL) e ruminaÃÃo (TRU) foram influenciados pela restriÃÃo alimentar (P<0,05), no entanto, nÃo foram influenciados pela classe sexual (P>0,05). O volume urinÃrio, excreÃÃes de creatinina, alantoÃna, xantina e hipoxantina, absorÃÃo de derivados de purina (absDP), derivados de purinas totais (DP) e sÃntese de proteÃna microbiana (PBmic) nÃo foram influenciados (P>0,05) pela classe sexual. Volume urinÃrio, excreÃÃes de creatinina, xantina e hipoxantina nÃo foram influenciados pela restriÃÃo alimentar (P>0,05), no entanto, este fator influenciou as excreÃÃes de alantoÃna, Ãcido Ãrico, absDP e DP. Os parÃmetros fisiolÃgicos temperatura superficial (TS) do lado esquerdo, regiÃo peitoral e temperatura retal (TR) nÃo foram influenciados pela classe sexual (P>0,05). A restriÃÃo alimentar e o perÃodo de coleta das variÃveis fisiolÃgicas influenciaram (P<0,05) a TS do lado esquerdo, peito e TR. Houve interaÃÃo (P<0,05) entre classe sexual e restriÃÃo alimentar para TS do lado direito. Consumo e digestibilidade de nutrientes sÃo influenciados por restriÃÃes alimentares mais severas. Classe sexual nÃo influencia a excreÃÃo de derivados de purina e sÃntese de proteÃna microbiana. A restriÃÃo alimentar diminui as perdas de calor pela superfÃcie corporal de cordeiros. / This study was accomplished with the objective of determining the effects of sexual class and feed restriction on nutrient intake, digestibility, purine derivatives, nitrogen balance, feeding behavior and physiological parameters in hair sheep Morada Nova. Thirty-five animals (11 intact males, 12 castrated and 12 females) with an initial average weight of 14.5  0,89kg were used in a completely randomized design in a 3x3 factorial design with three sexual classes (intact males, castrated and females) and three levels of feed restriction (ad libitum, 30 and 60%). Sexual class and feed restriction influenced (P<0.05) the intake of dry matter (DM), organic matter (OM), crude protein (CP), ether extract (EE), neutral detergent fiber corrected for ash and protein (NDFap), total carbohydrates (TC), non-fibrous carbohydrates (NFC), total digestible nutrients (TDN) and metabolied energy (ME) and the balance of nitrogen compounds. The digestibility coefficient of DM, CP and EE were influenced (P<0.05) by feed restriction, however there was no effect (P>0.05) the sexual class on the digestibility coefficients of CP, EE and NFC. There was interaction between sexual class and feed restriction (P<0.05) in digestibility of OM, NDFap and CT. Eating times (ET) and rumination times (RUT) were affected by feed restriction (P<0.05), however they were not affected by sexual class (P>0.05). The urinary volume, excretions of creatinine, allantoin, xanthine and hypoxanthine, absorption of purine derivatives (absPD), total purine derivatives (PD) and microbial protein synthesis (micCP) were not influenced (P>0.05) by sexual class. Urine output, creatinine excretion, xanthine and hypoxanthine were not influenced by feed restriction (P>0.05), however, this factor influenced the excretion of allantoin, uric acid, absPD and PD. Physiological parameters, surficial temperature (ST) on the left of pectoral region and rectal temperature (RT), were not affected by sexual class (P>0.05). Feed restriction and the period of collect of physiological variables influenced (P<0.05) ST the left side, chest and RT. There was interaction (P<0.05) between sexual class and feed restriction ST to the right side. Intake and digestibility of nutrients are influenced by more severe dietary restrictions. Sexual class does not influence the excretion of purine derivatives and microbial protein synthesis. Feed restriction reduces heat losses by body surface of lambs.
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"Avaliação temporal da regulação do tônus vascular e da produção de superóxido induzido por purinas em aorta isolada de ratos Wistar endotoxêmicos" / Time course evaluation of vascular tonus and superoxide production from isolated purines in aorta of endotoxemics Wistar rats

Hermes Vieira Barbeiro 11 August 2005 (has links)
Pacientes sépticos podem evoluir para choque séptico, destes 40% sobrevivem. Caracterizamos o modelo experimental, avaliamos fatores envolvidos na inflamação e avaliamos a modulação causada por purinas (ATP/ADP) na quantificação de superóxido (O2-) e na reatividade vascular da aorta isolada. Os resultados sugerem que na aorta isolada de animais endotoxêmicos, ATP e ADP aumentam a síntese de óxido nítrico (NO), porém somente o ATP reduz a biodisponibilidade de O2-, provavelmente pelo reacoplamento da NO sintase endotelial / Septic patients can evolve for septic shock and 40% of these survive. We characterize the experimental model we evaluate involved factors in the inflammation and evaluate the modulation caused by purines (ATP/ADP) in the superoxide quantification (O2-) and in the vascular reactivity of isolated aorta. The results suggest that in isolated aorta of endotoxemics rats, ATP and ADP increase the endothelial nitric oxide synthase (NOS) however just ATP reduces the bio availability of O2-, probably for the re-couples of the endothelial NOS synthase
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Determinação estrutural por difração de raios X de pirrolidinas poliidroxiladas com potencial atividade inibidora de purina nucleosídeo fosforilase / X Ray Diffraction Structural Determination of Polyhydroxylated Pyrrolidines with iInhibitory Potential of Purine Nucleoside Phosphorylase

Monica Soto Monsalve 14 June 2017 (has links)
Foram determinadas por meio de difração de raios x as estruturas de cinco compostos azaçúcares. Foram estudadas as interações envolvidas na formação das redes cristalinas em cada um dos compostos analisados. Foi encontrado que nos compostos azaçúcares estudados, as interações principais são as ligações de hidrogênio do tipo C-H···O e C-H···&pi;. Este comportamento foi verificado usando ferramentas como as superfícies de Hirshfeld e os gráficos de impressão digital. Realizou-se o estudo de docking molecular dos compostos azaçúcares com respeito à enzima purina nucleosídeo fosforilase (PNP). Foi determinado que estes compostos têm a capacidade de entrar no sitio ativo da PNP. O estudo das interações dos cinco azaçúcares com a PNP mostrou que estes compostos apresentam as mesmas interações presentes em inibidores da PNP já reportados. / Structures of five azasugars were determined by X-ray diffraction. Crystal network interactions were analyzed for each compound. The main interaction found for these azasugar compounds is hydrogen bond as C-H···O e C-H···&pi;. This behavior was verified by tools as Hirshfeld surface and 2D finger print plots. Molecular docking was performed for azasugar compounds in Purine Nucleoside phosphorylase (PNP). This study confirmed that these compounds are available to enter to the PNP active site. Interactions exploration showed the same interactions for the azasugars studied and for already known PNP inhibitors.
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Efeito da imunização com enzimas recombinantes do metabolismo de nucleotídeos de Schistosoma mansoni sobre o desenvolvimento da esquistossomose mansônica experimental

Neris, Débora Meira 29 August 2012 (has links)
Made available in DSpace on 2016-08-17T18:39:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 5245.pdf: 1568165 bytes, checksum: 9fc25ff9dc83339e50628c08854efd2c (MD5) Previous issue date: 2012-08-29 / Universidade Federal de Sao Carlos / Schistosimiasis mansoni is a neglected chronic parasitic disease that affects thousands of people worldwide, caused by the trematode Schistosoma mansoni. In the infected host the disease is characterized by the presence of granuloma, imunnopathological response of the cellular infiltration against egg antigens. Thus, the host-parasite relation favors hepatosplenomegaly, acite and hepatic fibrosis. Current chemotherapy is based on the use of Praziquantel (PZQ), used against all species of Schistosoma spp for over 30 years. The main issue is that the PZQ is practically inactive against immature schistosomula and favors the resistance growth of the existent lineages, which makes the study for new drugs and vaccines that can contribute to the control of this disease even more urgent. One of the paths on the search for new therapeutic targets is the study of essential enzymes to the S. mansoni. In particular, it is known that the enzymes Adenylate Kinase 1 and 2 (ADK), Uridine cytidine Kinase 1 and 2 (UCK), Hypoxanthine guanine phosphoribosyltransferase (HGPRT) e Purine nucleoside phosphorilase 1 (PNP) are found on the metabolic pathways of the parasite s nucleotide, participating in the metabolism of purines and pyrimidines. Our goals in this study were to assess the immunization with these enzymes, using the S. mansoni cercariae infected murine model, and subsequently analyze the acting in oviposition and growth of adult worms. Our results showed that the immunization in Balb/c mice with the UCK enzyme was capable of inducing a specific immune response, which favored a significant reduction of the parasitic load (adult worms). However, it was not possible to observe significant reduction in the number of eliminated eggs. Regarding the immunization with PNP and HGPRT enzymes, the mice had a reduction in the number of eggs per gram of feces. The data obtained are considered interesting and can be new targets for immunotherapy against schistosomiasis mansoni. Thereby, new assays must be made with different dosages of the enzymes for a better assessment on how these enzymes modulate the parasitic load through the eggs reduction, reduction in the adult worms retrieving, as well as the antibody levels during the murine infection by the S.mansoni. / A esquistossomose mansônica é uma doença parasitária, crônica e negligenciada que afeta milhares de pessoas ao redor do mundo, causada pelo trematódeo Schistosoma mansoni. No hospedeiro infectado a doença é caracterizada pela presença do granuloma, resultado imunopatológico do infiltrado celular contra antígenos dos ovos A quimioterapia atual é baseada no uso do Praziquantel (PZQ), usado contra todas as espécies de Schistosoma spp há mais de 30 anos. O principal problema é que o PZQ é praticamente inativo contra esquistossomulos imaturos e favorece o desenvolvimento de resistência das linhagens existentes. Um dos caminhos na busca por novos alvos terapêuticos é o estudo de enzimas que são essenciais para o S. mansoni. Em especial, sabe-se que as enzimas Adenilato Quinase 1 e 2 (ADK), Uridina Citidina Quinase 1 e 2 (UCK), Hipoxantina-guanina fosforibosiltransferase (HGPRT) e Purina Nucleosídeo Fosforilase 1 (PNP) são encontradas nas vias metabólicas de nucleotídeos do parasito, participando do metabolismo de purinas e pirimidinas. A estratégia de utilizar enzimas do parasito na esquistossomose mansônica murina foi de avaliar uma resposta induzida por estas enzimas quando aplicadas em camundongos BALB/c e desafiados com cercarias de S. mansoni. Desta forma, avaliamos a fase crônica de camundongos imunizados e infectados com S. mansoni, onde foram analisadas amostras parasitológicas, hematológicas, sorológicas e fluidos da cavidade peritoneal. Nosso objetivo neste estudo foi avaliar a imunização com essas enzimas, usando o modelo murino infectado com cercarias de S. mansoni e posteriormente avaliar a ação na oviposição e desenvolvimento de vermes adultos. Nossos resultados demonstraram que a imunização em camundongos Balb&#8725;c com a enzima UCK foi capaz de induzir uma resposta imune específica, a qual favoreceu a diminuição significativa da carga parasitária (vermes adultos). No entanto, não foi possível observar redução significativa no número de ovos eliminados. Em relação à imunização com as enzimas PNP e HGPRT os camundongos que receberam as imunizações com PNP e HGPRT tiveram redução no número de ovos por grama de fezes. Os dados obtidos são considerados interessantes e podem ser considerados novos alvos para a imunoterapia contra a esquistosomose mansônica. Dessa forma, novos ensaios deverão ser realizados com diferentes doses das enzimas para melhor avaliar como essas enzimas modulam a carga parasitária através da redução de ovos, diminuição na recuperação de vermes adultos, assim como os níveis de anticorpos durante a infecção murina pelo S. mansoni.

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