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Genotipagem de bactérias anaeróbias associadas às lesões da periodontite bovina /

Borsanelli, Ana Carolina. January 2017 (has links)
Orientador: Iveraldo dos Santos Dutra / Coorientador: Elerson Gaetti-Jardim Júnior / Banca: Vera Cláudia Magalhães Curci / Banca: Rita de Cássia Campebell Machado Botteon / Banca: Samir Issa Samara / Banca: Luís Antonio Mathias / Resumo: A periodontite bovina é um processo infeccioso purulento e progressivo associado com a presença de biofilme subgengival anaeróbio. De caráter sazonal e associada ao manejo do solo e à dieta, a doença tem variações na sua apresentação clínica, que inclui desde uma forma agressiva até manifestações crônicas. Os prejuízos econômicos são significativos e decorrem das dificuldades na preensão, mastigação e ruminação. O presente estudo teve como objetivo geral caracterizar a periodontite bovina e identificar por métodos moleculares os micro-organismos associados às lesões periodontais. Na avaliação da microbiota da bolsa periodontal (n=26) e do sulco subgengival (n=25) de bovinos, pela reação em cadeia da polimerase (PCR) e com o emprego de 35 iniciadores de espécies de patógenos potenciais, pôde-se associar a ocorrência de Actinobacillus naeslundii, Enterococcus faecium, Porphyromonas asaccharolytica, Porphyromonas endodontalis, Prevotella buccae, Prevotella intermedia, Prevotella melaninogenica, Prevotella nigrescens, Prevotella oralis, Treponema denticola e Treponema pectinovorum com a periodontite bovina. Em estudo complementar realizado na Escócia para verificar a ocorrência de lesões periodontais em animais abatidos, foram examinadas 200 arcadas dentárias, das quais 24 (12%) apresentaram lesões periodontais nos dentes incisivos ou mastigatórios. Este estudo inédito revela que a periodontite não é incomum em bovinos abatidos no oeste da Escócia e é claramente um problema san... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Bovine periodontitis is a progressive purulent infectious process associated with the presence of strict anaerobic subgingival biofilm. Seasonal and associated to soil and dietary management, the disease has variations in its clinical presentation, which includes since an aggressive form until chronic manifestations. The economic losses are significant and result from difficulties in gripping, chewing and rumination. The present study aimed to identify and characterize bovine periodontitis and identify the microorganisms associated with periodontal lesions by molecular methods. In the evaluation of the microbiota of the periodontal pocket (n=26) and gingival sulcus (n=25) of cattle, by polymerase chain reaction (PCR) and with the use of 35 primers of species of potential pathogens, it can be associate the occurrence of Actinobacillus naeslundii, Enterococcus faecium, Porphyromonas asaccharolytica, Porphyromonas endodontalis, Prevotella buccae, Prevotella intermedia, Prevotella melaninogenica, Prevotella nigrescens, Prevotella oralis, Treponema denticola and Treponema pectinovorum with bovine periodontitis. In a study carried out in Scotland to verify the occurrence of periodontal lesions in slaughtered animals, 200 dental arches were examined, of which 24 (12%) presented periodontal lesions in the incisors or masticatory teeth. This unpublished study reveals that periodontitis is not uncommon in cattle slaughtered in West of Scotland and is clearly a neglected health problem in animal production and welfare. At the opportunity, the risk factors associated with the disease were evaluated in a universe of 250 slaughtered animals, of which 35 had periodontal lesions and 40 were periodontally healthy. By the logistic regression analysis was evaluated the association between the independent variables, sex, age and race with periodontitis. The age (Complete abstract click electronic access below) / Doutor
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Expressão gênica de citocinas no encéfalo de cães com leishmaniose visceral /

Melo, Guilherme Dias de. January 2012 (has links)
Orientador: Gisele Fabrino Machado / Banca: Mary Marcondes / Banca: Antonio Carlos Alessi / Resumo: Para investigar a patogênese das alterações encefálicas durante a leishmaniose visceral, a expressão gênica das citocinas pró-inflamatórias IL-1, IL-6, IL-12p40, IFN-e TNF-e das citocinas anti-inflamatórias IL-10 e TGF- foi avaliada por meio de RT-qPCR no encéfalo de cães naturalmente infectados por Leishmania infantum (= chagasi). No encéfalo dos cães infectados houve aumento da expressão gênica de IL-1, IL-6, IFN- e TNF-, associada ao decréscimo da expressão de IL-10 e TGF-. Por outro lado, a expressão gênica da citocina pró-inflamatória IL-12p40 mostrou-se reduzida no encéfalo de cães com LV. Esses dados indicam a presença de um ambiente pró-inflamatório no encéfalo de cães com leishmaniose visceral, já que IL-1, IL-6 e TNF-, principalmente, é tida como um fator chave para a iniciação, manutenção e persistência da inflamação. Ainda, não foi detectada correlação entre o perfil de citocinas expresso com a manifestação clínica ou com a carga parasitária periférica de Leishmania, sugerindo que as alterações encefálicas são decorrentes da própria resposta imune do hospedeiro, independentemente da fase em que a doença se encontra / Abstract:To investigate the pathogenesis of the brain alterations during visceral leishmaniasis, the gene expression of the pro-inflammatory cytokines IL-1, IL- 6, IL-12p40, IFN-and TNF-, and the anti-inflammatory cytokines IL-10 and TGF-was evaluated in the brain of dogs naturally infected with Leishmania infantum (syn. chagasi) by means of RT-qPCR. In the brain of the infected dogs, there was noticed up-regulation of IL-1, IL-6, IFN- and TNF-gene expression, in association with down-regulation of IL-10 and TGF-. On the other hand, the gene expression of IL-12p40 was down-regulated in the brain of the dogs with visceral leishmaniasis. These data indicate the presence of a pro- inflammatory milieu in the brain of dogs with visceral leishmaniasis, since IL-1, IL-6 and TNF-are considered key factors for the initiation, maintenance and persistence of inflammation. Furthermore, it was not detected correlation between the cytokine profile with the clinical manifestation or with the peripherical parasite density of Leishmania, which suggests that the brain alterations are due to the host immune response, regardless of the stage of the disease / Mestre
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Detecção e caracterização molecular de cryptosporidium spp. em canários (serinus canaria) mantidos em cativeiro por meio de diferentes métodos de diagnóstico /

Camargo, Vinicius da Silva January 2017 (has links)
Orientador: Marcelo Vasconcelos Meireles / Banca: Sérgio Diniz Garcia / Banca: Weslen Fabrício Pires Teixeira / Resumo: Este trabalho teve como objetivos determinar a ocorrência e realizar a caracterização molecular de Cryptosporidium spp. e comparar três métodos de detecção deste protozoário em amostras fecais de canários (Serinus canaria) criados em cativeiro nas regiões Sul e Sudeste do Brasil. Um total de 498 amostras foi purificado por centrífugo-flutuação em solução de Sheather. A detecção de Cryptosporidium spp. foi realizada utilizando três métodos de diagnóstico: análise microscópica pela coloração negativa com verde malaquita, nested PCR (gene 18S rRNA), seguida de sequenciamento dos fragmentos amplificados, e PCR em duplex em tempo real (gene 18S rRNA) específica para detecção de Cryptosporidium galli e Cryptosporidium genótipo III de aves. A positividade para Cryptosporidium spp. (total de amostras positivas em pelo menos um método de diagnóstico) obtida pela análise microscópica, nested PCR e PCR duplex em tempo real foi de 13,3% (66/498). As taxas de positividade para Cryptosporidium spp. foram 2,0% (10/498) e 4,6% (23/498) por microscopia e nested PCR, respectivamente. O sequenciamento de 20 amostras amplificadas pela nested PCR identificou C. galli (3,0%;15/498), Cryptosporidium genótipo I de aves (0,8%; 4/498) e Cryptosporidium avium (0,2%; 1/498). A PCR duplex em tempo real revelou positividade de 7,8% (39/498) para C. galli e 2,4% (12/498) para Cryptosporidium genótipo III de aves. A análise microscópica diferiu significativamente da nested PCR para detecção de Cryptosporidi... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: This study used several diagnostic methods to examine the occurrence of and molecularly characterize Cryptosporidium spp. in captive canaries (Serinus canaria) in southern and southeastern Brazil. A total of 498 samples were purified by centrifugal-flotation using Sheather's solution. Cryptosporidium spp. diagnosis was performed using three diagnostic methods: malachite green negative staining, nested PCR targeting the 18S rRNA gene, followed by sequencing the amplified fragments, and duplex real-time PCR targeting the 18S rRNA specific to detect Cryptosporidium galli and Cryptosporidium avian genotype III. The overall positivity for Cryptosporidium spp. (total samples positive in at least one protocol) from the microscopic analysis, nested PCR and duplex real-time PCR protocol results was 13.3% (66/498). The positivity rates were 2.0% (10/498) and 4.6% (23/498) for Cryptosporidium spp. by microscopy and nested PCR, respectively. Sequencing of 20 samples amplified by nested PCR identified C. galli (3.0%; 15/498), Cryptosporidium avian genotype I (0.8%; 4/498) and Cryptosporidium avium (0.2%; 1/498). Duplex real-time PCR revealed a positivity of 7.8% (39/498) for C. galli and 2.4% (12/498) for avian genotype III. Malachite green negative staining differed significantly from nested PCR in detecting Cryptosporidium spp.. Duplex real-time PCR was more sensitive than nested PCR/sequencing for detecting gastric Cryptosporidium in canaries. / Mestre
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Fatores de risco e análise espacial para a leishmaniose visceral no município de Juazeiro - Bahia - Brasil /

Gomes, Ana Amélia Domingues. January 2013 (has links)
Orientador: Mary Marcondes / Banca: Rosemeri de Oliveira Vasconcelos / Banca: Raimundo Souza Lopes / Banca: Estevam Guilherme Lux Hoppe / Banca: José Eduardo Tolezano / Resumo: O objetivo do presente estudo foi determinar a presença de anticorpos anti-Leishmania sp. no soro e de DNA de Leishmania infantum chagasi no sangue periférico das diversas espécies de animais domésticos, residentes em um raio de 250 metros de distância de seres humanos portadores de leishmaniose visceral (LV), bem como avaliar as características ambientais, em uma região da cidade de Juazeiro (BA), na tentativa de determinar os possíveis fatores de risco para a ocorrência da doença. Para tanto, após a seleção de 21 casos humanos de LV distribuídos em seis bairros do município, realizou-se a sorologia e a reação em cadeia de polimerase em tempo real (qPCR) de soro e sangue total, respectivamente, de 498 animais, sendo 383 (76,91%) da espécie canina, 84 (16,87%) felina, 15 (3,00%) caprina, 12 (2,42%) equídea e 4 (0,80%) ovina. A prevalência de LV, considerando-se os resultados sorológicos e da qPCR, foi de 6,43% (32/498), sendo 5,75% (22/383) na população de cães e 11,90% (10/84) na de gatos. Vinte cães (5,22%) e 10 (11,90%) gatos foram sororreagentes e as outras espécies não apresentaram anticorpos anti-Leishmania sp. Apenas dois (0,40%) dos 498 animais apresentaram DNA do parasita no sangue, ambos da espécie canina e sem a presença de anticorpos séricos anti-Leishmania sp. Os gatos apresentaram duas vezes mais chances de se tornarem portadores da LV que os cães (OR=2,21; IC=1,1-4,87; p=0,043), e os felinos domiciliados apresentaram um risco 9,57 vezes maior de se infectarem que os gatos semidomiciliados (OR=9,57; IC=2,21-41,37; p=0,0006). O acesso a rua não foi associado com a doença em cães, e o sexo e a faixa etária não constituíram um risco para os animais contraírem esta zoonose. A presença de mais de um animal por domicílio aumentou em 3,46 vezes as chances de infecção na população... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The aim of the present study was to determine the presence of antibodies anti-Leishmania sp. in serum and DNA of Leishmania infantum chagasi in peripheral blood of domestic animals living within a 250 m perimeter from human cases of visceral leishmaniasis (VL), as well as to evaluate the environmental characteristics, in the region of the city of Juazeiro, Bahia, in an attempt to determine possible risk factors for the occurrence of the disease. For this, after the selection of 21 human cases of VL distributed in six neighborhoods of Juazeiro, serology and real time polymerase chain reaction (qPCR) in whole blood were performed in 498 animals, being 383 (76.91%) dogs, 84 (16.87%) cats, 15 (3%) goats, 12 (2.42%) equids, and 4 (0.8%) sheep. The prevalence of VL, considering serological and qPCR results, was 6.43% (32/498), being 5.75% (22/383) dogs and 11.9% (10/84) cats. Twenty (5.22%) dogs and 10 (11.9%) cats were seroreactive and the others species did not present antibodies anti-Leishmania sp. Only two (0.40%) out of 498 animals presented the parasite DNA in blood, both dogs without the presence of anti- Leishmania antibodies. Cats were two times more likely to have VL than dogs (OR = 2.21; 95% CI, 1.1 - 4.87; p = 0.043), and the domiciled cats were more likely to be positive for VL than semi-domiciled (OR=9.57; 95% CI, 2.21 - 41.37; p=0.0006). Access to the street was not associated to the disease in dogs, and sex and gender did not constitute a risk factor for the development of VL. The presence of more than one animal per household increased in 3.46 times the odds of infection in the population (OR=3,46; IC=1,49-8,06; p=0,0025). No significant association was found between the number of people per household, the distance from human VL cases, the type of house walls, the number of rooms, or the presence... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor
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Expressão imuno-histoquímica de KI-67, COX-2, MMP-9 e P53 nos tumores testiculares caninos /

Silva, Janete Madalena da. January 2014 (has links)
Resumo:As neoplasias testiculares caninas são achados ocasionais. São descritas como benignas, mas podem metastatizar ou mostrar características de malignidade com o avanço da idade do animal, o que torna necessário o melhor entendimento do comportamento destas neoplasias no cão. O objetivo deste estudo foi caracterizar a expressão imuno-histoquímica de Ki-67, COX-2, MMP-9 e p53 em neoplasias testiculares de 50 cães, verificar a relação entre o padrão histológico e raça, idade e posicionamento testicular e verificar a expressão imuno-histoquímica dos anticorpos avaliados nos diferentes tipos de neoplasia. A avaliação imuno-histoquímica das proteínas Ki-67, MMP-9 e p53 foi mais intensa nos seminomas, enquanto que os leydigocitomas exibiram maior marcação para COX-2. A avaliação histológica e imuno-histoquímica dos subtipos de seminomas em cães, particularmente o seminoma difuso, podem resultar em diferença significativa que permita a utilização destas proteínas como marcadores de prognóstico. As características histopatológicas em associação ao histórico dos animais e à expressão das proteínas estudadas podem contribuir para a caracterização do comportamento biológico nas neoplasias testiculares caninas / Abstract:testicular neoplasms are sporadic findings. They are described as benign, but they can metastasize or express malignant features with the animal ageing, which makes necessary the better understanding of theses neoplasms behavior in dogs. The aim of this study was to characterize the immunoexpression of Ki-67, COX-2, MMP-9 and p53 in testicular neoplasms of fifty dogs, to verify the relation among histological pattern of the neoplasms and breed, age and testicular localization; and also to verify the immunoexpression of these markers in different types of testicular tumours. Ki-67, MMP-9 and p53 immunostaining were more intense in seminomas, whereas COX-2 presented a more intense staining in Leydig cell tumors. The histological and immunohistochemical analyses of the subtypes of canine seminomas, especially the diffuse seminoma, may result in significant differences which would allow the use of these markers as prognostic factors. The histopathological features associated with the day-history of the animals and with these markers may contribute to the characterization of the biological behavior of canine testicular neoplasms / Orientador:Gisele Fabrino Machado / Banca:Felipe Augusto Ruiz Sueiro / Banca:Rosemary de Oliveira Vasconcelos / Mestre
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Avaliação da produção e concentração viral em pimentão infectado por tospovírus com o uso de piraclostrobina + metiram /

Spadotti, David Marques de Almeida, 1988. January 2016 (has links)
Orientador: Renate Krause-Sakate / Banca: Jorge Alberto Marques Rezende / Banca: Valdir Atsushi Yuki / Banca: Julio Massaharu Marubayashi / Banca: Marcelo Agenor Pavan / Banca: Edson Lopes Baldin / Resumo: As cultivares de pimentão (Capsicum annuum L.) são geralmente suscetíveis à infecção por vírus, destacando-se no Brasil espécies dos genêros Potyvirus, Begomovirus, Cucumovirus, Tobamovirus e Tospovirus, sendo que deste último gênero predominam as espécies GRSV (Groundnut ring spot virus) e TCSV (Tomato chlorotic spot virus) no Estado de São Paulo. Devido ao amplo número de hospedeiros infectados pelos tospovírus e a ineficiência do controle químico na transmissão do vírus pelo vetor (tripes), é imprescindível o manejo integrado da doença. Diante disso, o objetivo deste trabalho foi avaliar o uso do defensivo químico piraclostrobina + metiram (P +M) como forma alternativa de controle dos tospovírus GRSV e TCSV no híbrido de pimentão Dahra RX, avaliando-se a produção quantitativa e qualitativa da planta e a influência do produto sobre a quantidade relativa de partículas virais do GRSV. Três experimentos foram realizados paralelamente, sendo dois em campo, dos quais um recebeu pré-tratamento pela aplicação de P + M (4 g. l -1) na bandeja. No experimento em estufa, o pré-tratamento consistiu pela aplicação de P + M (4 g. l -1) no transplante em 50% das plantas (total de 120 plantas). Os tratamentos foram constituídos da inoculação do vírus de forma natural no campo e via extrato vegetal em estufa aos 0, 15, 30, 45 dias após o transplantio (DAT) com ou sem aplicação de P + M (4.0 g. l -1) durante o cultivo. A infecção pelos vírus GRSV/TCSV foi confirmada por PTA- ELISA e a concentração viral via qPCR foi avaliada para as plantas cultivadas em estufa. No experimento realizado em estufa obteve-se 98% das plantas infectadas quando inoculadas via extrato vegetal, enquanto 25% das plantas no campo foram infectadas naturalmente por GRSV ou TCSV, porém com predominância do GRSV. A infecção de plantas deste híbrido pelas espécies GRSV e TCSV até os 45 dias ... / Abstract: The cultivars of pepper (Capsicum annuum L.) are usually susceptible to virus infection, especially by the species of the genus Potyvirus, Begomovirus, Cucumovirus, Tobamovirus and Tospovirus in Brazil. GRSV (Groundnut ring spot virus) and TCSV (Tomato chlorotic spot virus) are the main tospovirus species in São Paulo state. Due to the large host circle of tospovirus and inefficient chemical vector control (thrips) in the virus transmission, the integrated management of the disease is essential. Thus, the aim of this study was to evaluate the use of chemical defensive Pyraclostrobin + Metiram (P + M) as an alternative form of control of tospoviruses GRSV and TCSV in the pepper hybrid Dahra RX, assessing the quantitative and qualitative production of the plant and the product's influence on the concentration of viral particles of GRSV. Three experiments were carried out in parallel, two in the field, one which received pre-treatment by applying P + M (4 g. L -1) on the tray. In the greenhouse experiment, the pre-treatment consisted by application of P + M (4 g. L -1) in the transplanting of 50% of the plants (total 120 plants). The treatments consisted of inoculation of the virus naturally in the field and sap transmission in greenhouse at 0, 15, 30, 45 days after transplanting (DAT) with application or not of P + M (4.0 g. L -1) during cultivation. Infection by GRSV / TCSV virus was confirmed by PTA-ELISA and virus concentration was evaluated by qPCR for plants in greenhouse. In the greenhouse experiment was obtained 98% of infected plants sap transmitted, while 25% of the plants in the field were naturally infected by GRSV or TCSV, but with predominance of GRSV. Infection of plants of this hybrid by GRSV and TCSV until 45 days after transplantation caused considerable damage in the quality and quantity of fruits produced. The use of the product during the cultivation of the hybrid did not affect ... / Doutor
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Caracterização de protozoários pertencentes à sub-família Toxoplasmatinae pela análise molecular do gene codificador de proteína do choque térmico (HSP70) e do espaçador interno transcrito 1 (ITS-1) / Characterization of protozoan belonging to sub-family Toxoplasmatinae through the molecular analysis from of heat shock protein (HSP70) coding gene and internal transcript spacer 1 (ITS-1)

Monteiro, Renata Molina 29 November 2006 (has links)
Os membros da sub-famíla Toxoplasmatinae conhecidos são Hammondia hammondi, Toxoplasma gondii, Neospora hughesi, Neospora caninum e Hammondia heydorni. As duas primeiras espécies têm os felídeos como hospedeiro definitivo, enquanto as duas últimas têm desenvolvimento sexual em carnívoros da família dos canídeos. O ciclo biológico de N. hughesi é pouco conhecido. Foi estudado a variabilidade nucleotídica de seqüências intercaladas entre os genes codificadores das frações ribossômicas 18S, 5.8S (ITS-1). No entanto, como estas não permitem reconstruções filogenéticas com o uso de grupo externo, em virtude da inconsistência dos alinhamentos produzidos, pesquisamos uma seqüência codificadora de proteína sendo o marcador escolhido, o gene codificador da proteína de choque térmico HSP70 (heat shock protein 70KDa). Este gene é bastante utilizado para resolução de filogenias de outros organismos como, por exemplo, aqueles pertencentes ao gênero Cryptosporidium. No presente trabalho, amplificamos por PCR e seqüenciamos 951 pares de bases (pb) do gene codificador de HSP70 de oocistos T. gondii-like (oriundos de fezes gatos), de oocistos Neospora-like (de fezes de cães) e de taquizoitos de N. caninum, N. hughesi e T. gondii mantidos em laboratório. Os primers foram desenhados a partir de seqüências consenso obtidas em pesquisa de bancos de dados de seqüências EST de N. caninum e seqüências de RNAm de T. gondii. Seqüências ITS-1 destes oocistos também foram determinadas para a confirmação da espécie de parasito estudada. Os resultados mostram que os táxons H. hammondi e T. gondii são monofiléticos e geneticamente muito próximos, mas contrariando resultados anteriores, não foi demonstrada a monofilia entre os táxons H. heydorni e N. caninum. De fato, a análise de diversidade nucleotídica de gene codificador HSP70 mostra que a distância evolutiva entre H. heydorni e N. caninum é tão grande quanto a distância de cada uma destas espécies com T. gondii. Em adição, foi possível identificar dentre as amostras de oocistos, duas linhagens divergentes de H. heydorni. Paralelamente ao estudo filogenético também foi possível desenvolver um método diagnostico diferencial para oocistos tipo Hammondia. As seqüências de gene HSP70 obtidas foram alinhadas e dois pares de primers internos a estas seqüências foram desenhados. O primeiro par amplifica 771 pb de oocistos T. gondii-like e o segundo 400 pb de oocistos Neospora-like. A clivagem do fragmento de 771 pb com enzima de restrição Hin6I produz perfis eletroforéticos distintos para amostras de T. gondii e H. hammondi. A clivagem do fragmento de 400pb com a enzima de restrição MunI também produz perfis eletroforéticos distintos entre amostras de N. caninum e H. heydornii. A diferenciação dos perfis de restrição pode ser feita em eletroforese em gel de agarose a 2,5%. / Hammondia hammondi, Toxoplasma gondii, Neospora huguesi, Neospora caninum and Hammondia heydorni are the known members of the sub-family Toxoplasmatinae. H. heydorni and N. caninum use canids as definitive hosts whereas felids are the definitive hosts from T. gondii and H. hammondi. The definitive host of N. hughesi is unknown. Here, the nucleotide diversity at internal transcribed spacer (ITS-1) and heat shock protein (HSP70 kDa) loci in the subfamily toxoplasmatinae were studied. The HSP70 coding genes are widely used for phylogenetic studies in a number of other organisms specially within the genus Cryptosporidium. In the present study, it was amplified by PCR and sequenced 951 bases pairs (bp) from HSP70 coding gene from oocysts T.gondii-like (from cat), from oocysts N. caninum-like (from dog) and tachyzoites of N. hughesi grown on cell cultures. The primers were designed based on consensus sequences within EST sequences of N. caninum sequences and RNAm sequences of T. gondii. ITS-1 sequences amplified from oocysts were also obtained in order to confirm the species of the parasites. The results showed that T. gondii and H. hammondi are monophyletic and genetically very close, but the monophyletic status of H. heydorni N. caninum was not demonstrated. In fact, the nucleotide diversity at the HSP70 locus has shown that the evolutionary distance between H. heydorni and N. caninum is as high as that observed between either H. heydorni or N. caninum and T. gondii., In addition, it was possible to identify two distinct groups among the H. heydorni oocysts. Concomitantly to the phylogenetic study it was also possible to standardize a diagnostic test capable of differentiate the oocysts Hammondia-like was development a diagnostic method that differ oocysts T. gondii-like and N. caninum-like. The sequences obtained from HSP70 coding gene were aligned and two new pair of PCR primers was designed. The first pair amplifies 771bp from T. gondii-like oocysts, whereas the second pair amplifies 400 bp from N. caninum-like oocysts. The restriction enzyme Hin6I used to cleave the 771 bp amplicons generated distinct profiles with samples from H. hammondi and T. gondii. The same occurred with the restriction of the fragments of 400bp cleaved by the enzyme MunI used in N. caninum e H. heydorni samples. The profiles can be differentiated by 2.5% agarose gel electrophoresis.
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Determinação da carga viral em transplantados renais como parâmetro preditivo para o desenvolvimento da doença infecciosa por Citomegalovírus /

Ruiz, Leonardo Guizilini Plazas. January 2015 (has links)
Orientador: Mauricio Lacerda Nogueira / Banca: Celso Francisco Hernandes Granato / Banca: Mario Abbud Filho / Banca: Ligia Camera Pierrotti / Banca: Emerson Quintino de Lima / Resumo: O Citomegalovírus (HCMV) representa o mais importante patógeno para os pacientes transplantados e pode ser transmitido aos receptores renais via infecção primária, na qual o vírus infecta um organismo sem contato prévio ou determinar a reinfecção endógena, onde indivíduos soropositivos apresentam reativação de latência. Adicionalmente, estes pacientes estão susceptíveis a uma reinfecção exógena quando são infectados por uma cepa diferente. Este estudo apresenta a dinâmica da replicação do HCMV após o transplante renal por meio do monitoramento do DNA HCMV em 1223 amostras de sangue total provenientes de 66 receptores, utilizando-se a metodologia de PCR em tempo real quantitativo. A quantificação da carga viral, abordagens preventivas, período de viremia e tratamento foram monitorados e relacionados às características clínicas envolvidas na evolução destes pacientes. Nossos dados demonstraram um valor preditivo da carga viral de 8.372 cópias/mL para o desenvolvimento da doença infecciosa e a efetividade das abordagens profiláticas e preemptiva. Mediante episódios de rejeição celular aguda e óbito foram determinados a maior média e pico máximo de carga viral, sugerindo uma possível correlação dos efeitos indiretos da viremia com a progressão dos quadros de choque séptico e o aumento da replicação viral mediante condições inflamatórias. Estes achados fornecem parâmetros quantitativos para o desenvolvimento e emprego de abordagens que diminuam os riscos de transmissão, desenvolvimento da doença infecciosa e os efeitos indiretos associados à viremia por HCMV / Abstract: Cytomegalovirus (HCMV) is the most important pathogen in transplant patients and can be transmitted to receivers via renal primary infection in which the virus infects an organism without prior contact or determine the endogenous reinfection, which seropositive individuals have reactivation of latency. Additionally, these patients are susceptible to get infected when exogenous reinfection by a different strain. This paper presents the dynamics of HCMV replication after transplantation by monitoring of HCMV DNA in 1223 from whole blood samples 66 receivers, using the method of quantitative real-time PCR. Quantification of viral load, preventive approaches, treatment and period of virus in blood were monitored and related to the clinical characteristics involved in the evolution of these patients. Our data demonstrated a predictive value of viral load of 8,372 copies / mL for the development of infectious disease, evidence of immune control of HCMV in transplant subjects, the effectiveness of prophylactic and preemptive approaches and suggest a possible correlation of the indirect effects of virus in blood with the progression of frames septic shock. By episodes of acute cellular rejection and death were determined and the highest average peak viral load. These findings may provide quantitative parameters for the development and use of approaches that reduce the risk of transmission, infectious disease development and the associated HCMV in blood indirect effects / Doutor
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Detecção de infecção genital por papilomavirus humano e anormalidades citologicas em mulheres jovens de baixo risco para doenças sexualmente transmissiveis

Oliveira, Eliane Regina Zambelli Mesquita de 01 November 2018 (has links)
Orientadores : Sophie Françoise Mauricette Derchain, Cecilia Maria Rotelli-Martins / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciências Médicas / Made available in DSpace on 2018-11-01T13:11:07Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Oliveira_ElianeReginaZambelliMesquitade_M.pdf: 184550 bytes, checksum: 3330947a9ea0e764ec70a73074f41c97 (MD5) Previous issue date: 2002 / Resumo: Objetivo: avaliar a prevalência de infecção por Papilomavírus humano (HPV) em mulheres jovens com baixo risco para doenças sexualmente transmissíveis da região de Campinas e zona leste de São Paulo e sua relação com alterações citológicas pré-neoplásicas, segundo algumas variáveis sociodemográficas e reprodutivas. Sujeitos e métodos: foi realizado um estudo de corte transversal, entre setembro a novembro de 2000, com 600 mulheres de 15 a 25 anos com exame ginecológico aparentemente normal. Após avaliação dos critérios de inclusão e exclusão, as pacientes selecionadas responderam a um questionário relacionado aos dados demográficos. Foram submetidas à história médica e exame ginecológico com coleta de material para citologia cervical em base líquida e detecção de DNA-HPV por técnica da reação em cadeia de polimerase (PCR). Para análise estatística foram descritos como valores percentuais a prevalência do DNA-HPV e as alterações citológicas, e as associações com as variáveis sociodemográficas e reprodutivas foram mensuradas por odds ratio (OR). Resultados: a infecção genital pelo papilomavírus humano apresentou a prevalência de 29,3%, sendo que 148 (24,6%) apresentaram DNA-HPV de alto risco oncológico e 56 (9,3%) DNA-HPV de baixo risco oncológico. A presença de atipias de células escamosas de significado indeterminado (ASCUS) foi a alteração citológica mais freqüente com uma prevalência de 11,3%. A alteração citológica sugestiva de lesão de baixo grau foi detectada em 7% dos casos e a de alto grau foi detectada em 0,5%. Nas mulheres com ASCUS na citologia, o DNA-HPV mais encontrado foi o de alto risco oncológico (38,2%). Nas lesões citológicas de baixo grau, o DNA-HPV de alto risco apresentou a prevalência de 53,5% e nas alterações citológicas sugestivas de lesão de alto grau apresentou-se em 100% dos casos. Houve associação significativa entre o estado civil e o número de parceiros sexuais com a detecção do DNA-HPV. O maior número de parceiros, juntamente com menor tempo de atividade sexual da mulher (= 2 anos), aumentou significativamente a detecção do DNA-HPV (OR=19,0). O número de parceiros sexuais no último ano também esteve associado com a citologia anormal. Conclusão: Os resultados deste estudo evidenciaram a alta prevalência da infecção genital por DNA-HPV de alto risco entre pacientes jovens com baixo risco para doenças sexualmente transmissíveis, contribuindo com a caracterização do perfil desta população para futuros projetos para controle e erradicação dessa infecção com suas possíveis lesões pré-neoplásicas / Abstract: Objective: to determine the prevalence of papillomavirus infection in young women characterizes by relatively low rates of sexually transmitted diseases (STDs) among women in region of Campinas and east area of São Paulo and the relationship with cervical cytologic diagnoses according to some sexual and demographic risk factors. Subjects and methods: 600 women 15 to 25 years of age with normal cervical examination and low risk of STD were enrolled in a cross-sectional study, from September to November 2000. After inclusion and exclusion criteria for enrolment were performed, the women complete a study questionnaire concerning general personal information and medical history. The cervical samples were collected for cytology testing using liquid-based and a PCR testing was performed to detect the high-risk and low-risk HPV-DNA genotypes. Descriptive analysis was made for the association between the results of HPV-DNA and the results of cytology. The odds ratio was calculated to verify the association between risk factors and the results of HPV-DNA and cytology. The logistic regression analysis was made to show association between HPV-DNA and risk factors. Results: HPV-DNA has been detected in 176 scrapes (29.3%), 148 containing a high-risk HPV (24.6%) and 56 containing a low-risk HPV (9.3%). The thin layer cytology detected 68 (11.3%) of atypical squamous cells of undetermined significance (ASCUS) of 600 women, 42 (7%) diagnoses with low-grade squamous intraepithelial lesion (LSIL) and 3 (0,5%) with high-grade squamous intraepithelial lesion (HSIL). Cytological abnormalities reported as ASCUS, the HPV-DNA more frequent detected was the high risk (38.2%). The smears reported as LSIL also presented high risk of HPV-DNA as more frequent. All cervical smears reported as HSIL presented high risk HPV-DNA type. The marital status (OR=2.12) and the number of sexual partners (OR=2.19) were significantly associated with the detection of HPV-DNA. Logistic regression analysis showed a significant association between HPV-DNA and the number of sexual partners. This association was more pronounced when the interval between the first sexual intercourse and examination was less than two years. The number of sexual partners at the last year, were significantly associated with an abnormal Pap test. The number of sexual partners at the last year was significantly associated with abnormal smears. Conclusion: The results of this study indicate the high prevalence of high-risk HPV among women with low risk of STD. The implication of these findings will contribute to characterize these young women population to development projects to the control of the genital human papillomavirus infection and yours squamous intraepithelial lesions / Mestrado / Tocoginecologia / Mestre em Tocoginecologia
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Caracterização morfológica, morfométrica e molecular de Hepatozoon spp. (Apicomplexa, Hepatozoidae) de serpentes brasileiras naturalmente infectadas

Moço, Tatiana Cristina [UNESP] 02 March 2012 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:30:57Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-03-02Bitstream added on 2014-06-13T20:40:56Z : No. of bitstreams: 1 moco_tc_dr_botib.pdf: 3113609 bytes, checksum: bb55dca1b241f126ee1a2e4127e578fd (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Hepatozoon spp. são os protozoários intracelulares mais frequentemente encontrados em serpentes. Tendo em vista a variedade de formas parasitando tais animais e as divergências dos dados encontrados em literatura, o objetivo deste estudo foi tentar separar espécies de Hepatozoon de serpentes, testando oligonucleotídeos que amplifiquem regiões genômicas menos conservadas, detectando diferenças entre as espécies, bem como realizar as caracterizações morfológicas, morfométricas e moleculares de Hepatozoon spp. de serpentes naturalmente infectadas. Para tal, foram utilizadas serpentes doadas ao Centro de Estudos de Venenos e Animais Peçonhentos (CEVAP) da Universidade Estadual Paulista de Botucatu que, em exames de rotina, mostraram-se positivos para tais parasitas. O sangue foi coletado por punção da veia caudal, foram confeccionados esfregaços sanguíneos e uma alíquota foi congelada a -20°C, para posterior extração do DNA. As caracterizações morfológicas e morfométricas foram realizadas utilizando um software especializado para análise de imagens. Dos 215 espécimes investigados, foram eleitos cinco exemplares de Crotalus durissus terrificus, nos quais foi visualizado um tipo de gamonte em cada espécime. Pela análise morfológica e morfométrica, estes gamontes foram agrupados em três populações. As alterações provocadas por tais parasitas, nas hemácias, também foram analisadas. Para a caracterização molecular das espécies de Hepatozoon através de sequenciamento genético, foram testados sete pares de oligonucleotídeos que amplificam regiões distintas do gene rDNA utilizando-se a técnica da PCR. Os testes realizados apontaram os pares de oligonucleotídeos HepF300/Hep900 e HEMO1/HEMO2 como eficientes em amplificar e caracterizar regiões genômicas Hepatozoon spp. de serpentes... / Hepatozoon spp. are the most frequent intracellular protozoa found in snakes. Given the variety of forms parasitizing these animals and differences of the data found in literature, the aim of this study was to attempt to separate Hepatozoon species of snakes, testing oligonucleotides that amplify less reliable genomic regions, detecting differences among species, as well as perform the morphological, morphometric and molecular characterization of Hepatozoon spp. of naturally infected snakes. For this purpose, were used snakes donated to Center for the Study of Venoms and Venomous Animals of the São Paulo State University/Botucatu (CEVAP) that, in routine were detected positive for such parasites. Blood was collected by the tail vein puncturing, blood smears were prepared and an aliquot was frozen at -20° C for subsequent DNA extraction. The morphological and morphometric characterization were performed by using a specialized image analysis software. Of the 215 investigated animals, five specimens of Crotalus durissus terrificus were elected, in which were found five parasitic forms that, by morphometric analysis, were grouped into three populations. The changes caused by these parasites in red blood cells were also analyzed. For the molecular characterization of Hepatozoon species through genetic sequencing, were tested seven pairs of primers that amplify different regions of the rDNA gene using the PCR technique. Only the primers HepF300/Hep900 and HEMO1/HEMO2 were efficient in amplifying and characterizing genomic regions of snakes Hepatozoon spp.. The best results were achieved when the sequences amplified from the both primers were analyzed together and the results were associated with the morphology and... (Complete abstract click electronic access below)

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