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Uso de índices de reflectância foliar no monitoramento do patossistema Microcyclus ulei x seringueira /

Bevenuto, João Alberto Zago, 1983. January 2017 (has links)
Orientador: Edson Luiz Furtado / Coorientador: José Carlos Pezzoni Filho / Banca: Leo Zimback / Banca: Sérgio Campos / Banca: José Raimundo de Souza Passos / Banca: Willian Bucker Moraes / Resumo: O maior problema fitossanitário na heveicultura brasileira é a doença conhecida por mal das folhas, causada pelo fungo Microcyclus ulei, cujos sintomas ocorrem nas folhas jovens, causando intensas desfolhas, diminuindo a produção de látex e até mesmo a morte em plantas muito suscetíveis. A espécie Hevea brasiliensis possui um hábito deciduifólio completo que é um caráter importante, ou seja, o desfolhamento uniforme proporciona a recuperação da copa com folhas sadias e a redução do inóculo de patógenos que são descartados com as folhas velhas, onde as estruturas reprodutivas estão localizadas. Os objetivos deste trabalho foram: utilizar ferramentas de sensoriamento remoto para confrontar o efeito das variáveis climáticas em diferentes períodos do ano sobre interferência do mal das folhas em seis anos comparando o avanço da doença com os índices de vegetação, Índice de Vegetação com Diferença Normalizada (NDVI), Índice de Vegetação Ajustado para os Efeitos do Solo (SAVI) e Índice de Área Foliar (IAF), calculados para o período de cada ano estudado, analisar o efeito deciduifólio natural ou ocorrência do mal das folhas; e verificar a troca de folhas dos clones de seringueira em estudo comparando com a fenologia. A área utilizada para o estudo localiza-se no município de Registro, Estado de São Paulo, Brasil, na Fazenda Umuarama com plantio monoclonal de seringueira, foram avaliados seis clones diferentes: IAN 873, IAN 717; RRIM 600, Fx 3864, Fx 2261 e Fx 3844, por meio das imag... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The biggest phytosanitary problem in Brazilian heveculture is the disease known as leaf blight caused by the fungus Microcyclus ulei. Whose symptoms occur in young leaves, causing severe defoliation, reducing the production of latex and even the death in susceptible plants. Rubber tree has a deciduous habit which is an important character. Uniform defoliation of clones provides a reduction in the interior of pathogens, whose locations to reproduction occur in the old leaves. The objectives of this work were: Using remote sensing tools to compare the effect of climatic variables in different periods of the year on leaf mischief interference in six years comparing the disease progression with Normalized Difference Vegetation Index (NDVI), Soil Adjusted Vegetation Index (SAVI) and Leaf Area Index (LAI) vegetation indices, calculated for the period of each year studied, verifying the natural deciduous effect or occurrence of leaf blight; Estimate an exchange of leaves of the rubber tree clones under study, comparing them with phenology. The area used for the study is located in the municipality of Registro, São Paulo State, Brazil, at Umuarama Farm with monoclonal rubber plantation, IAM 873, IAN 717; RRIM 600, Fx 3864, Fx 2261 and Fx 3844, using Landsat 5 satellite images used in NDVI, SAVI and IAF vegetation indices. They were used for statistical analysis generalized linear model with logarithmic range distribution and binding function having as clones reflectance factors and indices. Set the same models including whether the continuous covariates measured in the field: total fallen leaves sick and fallen leaves. Compared these models through the Akaike information criterion corrected - AICC to identify the best model, verified through the deviations by degrees of freedom (scale deviance). Was compared between factors was used was the Tukey-Kramer test. Spearman correlation was performed between ... / Doutor
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Inter-relações entre nematoides, fungo e a cultura da seringueira

Takahashi, Vanessa dos Santos Paes [UNESP] 03 June 2015 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2015-10-06T13:03:39Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-06-03. Added 1 bitstream(s) on 2015-10-06T13:18:15Z : No. of bitstreams: 1 000849022_20160603.pdf: 238978 bytes, checksum: b966c4b0826fa259fdb226def0fca7d4 (MD5) Bitstreams deleted on 2016-06-06T12:04:24Z: 000849022_20160603.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2016-06-06T12:05:02Z : No. of bitstreams: 1 000849022.pdf: 1254098 bytes, checksum: 93537019d11167ab0b06e28d16c5db09 (MD5) / A heveicultura assume papel de destaque no estado de São Paulo, que responde por mais da metade da produção Brasileira de borracha natural. Os nematoides são importantes patógenos que vêm causando perdas significativas à produção de diversas plantas cultivadas. Na literatura, encontram-se poucos trabalhos acerca dos nematoides na cultura da seringueira, principalmente quando se trata de Pratylenchus brachyurus, um nematoide de grande importância atual no Brasil. Neste sentido os objetivos deste trabalho foram: a) realizar um levantamento dos nematoides em viveiros de produção de mudas de seringueira do estado de São Paulo, b) avaliar a resistência e tolerância de plantas de seringueira utilizadas como porta enxertos à Pratylenchus brachyurus e Meloidogyne exigua, c) estudar a interação entre M. exigua ou P. brachyurus, e Lasiodiplodia theobromae em mudas de seringueira em duas condições hídricas. Os resultados do levantamento demonstram que os nematoides de maior frequência e densidade foram Meloidogyne e Pratylenchus. As principais espécies identificadas foram M. incognita, M. exigua, P. brachyurus e Rotylenchulus reniformis. Destes, P. brachyrus foi a espécie mais frequente nas amostras das raízes das mudas de seringueira e deve ser considerado praga chave da cultura. Este trabalho também foi primeiro relato de M. exigua no Estado de São Paulo causando danos em mudas de seringueira. O segundo experimento realizado em casa de vegetação, demonstrou que M. exigua causou reduções mais pronunciadas na altura e no diâmetro de caule dos porta-enxertos de seringueira 'GT 1', 'PB 235', 'PB 217', 'RRIM 501', 'PR 255', 'IAN 873', 'RRIM 600' e 'TJ 1', sendo todos considerados intolerantes e suscetíveis a M. exigua e P. brachyurus. E por fim, no terceiro experimento, realizado em casa de vegetação, observou-se que tanto as características biométricas, quanto os nematoides foram afetados... / The heveiculture plays an important hole in São Paulo State, which produces more than 50% of the total Brazilian natural rubber production. The nematodes are important pathogens that have been causing significant losses to the crops. In the literature there is not many papers related to nematodes in rubber trees, especially about Pratylenchus brachyurus, the nematode most important to Brazil nowadays. In this sense the objectives of this work were: a) to do a survey of the nematodes occurrence in rubber trees nurseries in São Paulo State, b) study the resistance and tolerance of rubber trees used as rootstock to Pratylenchus brachyurus and Meloidogyne exigua, c) study the interactions between M. exigua or P. brachyurus, and Lasiodiplodia theobromae in rubber trees seedlings in two moisture conditions. As the results of the survey it was found that Meloidogyne and Pratylenchus were the most frequent and in high densities at the samples. The species identified were M. incognita, M. exigua, P. brachyurus e R. reniformis. Among them, P. brachyurus was the most frequent specie found at rubber trees roots and must be consider as a key nematode to the crop. This work was also the first report of M. exigua causing damage to the rubber trees seedlings in São Paulo State. The second experiment carried out at green house conditions, have demonstrate that M. exigua caused more pronounced damage to the rubber tree rootstocks 'GT 1', 'PB 235', 'PB 217', 'RRIM 501', 'PR 255', 'IAN 873', 'RRIM 600' e 'TJ 1', and all of them were intolerant and susceptible to M. exigua e P. brachyurus. Finally, at the third experiment also carried out in green house conditions, was observed that the biometrics characteristics and the nematodes were affected by the reduction in 50% (CC) of pot capacity. There was an interaction between L. theobromae and P. brachyurus in the increase of plant diameter. There was not an interaction among ...
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Estágios foliares, fenologia da seringueira (Hevea spp.) e interação com Microcyclus ulei (mal das folhas)

Sambugaro, Rosana [UNESP] 06 February 2007 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:34:59Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2007-02-06Bitstream added on 2014-06-13T21:06:54Z : No. of bitstreams: 1 sambugaro_r_dr_botfca.pdf: 1143633 bytes, checksum: 25f9ce4aa41c21b2302d4b0e2e19e340 (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / The rubber tree is a tropical species that loses its leaves periodically. This deciduifolio habit is an important character for the rubber tree, that is, clones uniform defoliation provides a reduction in the pathogens inocule whose reproductive structures are located in the old leaves. After defoliation, it occurs the foliar renewal and it is at this stage, also known as refoliation, that the rubber tree presents susceptible leaflets in which occur most part of the foliar deseases, such as leaf blight, where the cycle of the pathogen (Microcyclus ulei (P. Henn.)v. Arx) is straightly related with the foliar stages (B, C and D). Therefore, the knowledge on these stages, clones phenologic behavior, factors that influence this character and local climate conditions is important for their selection. The objectives of this work were: characterize through quantitative and descriptive foliar morphology the stages B, C and D; characterize the phenologic behavior and the incidence of South American Leaf Blight; correlate the beginning of the defoliation period with climatic parameters, and leaf blight incidence, during the foliar renewal period, with climatic parameters. For the stages characterization, it was used the clone PB 235, from which the leaves central leaflets were collected, at different stages. It was measured the foliolar limbus lenght, width and area, and the petiole lenght and diameter. It was also determined the form of the limbus, apex and base of the foliolar lamina, as well the leaf coloration. For the other objectives, the clones Fx 3844, Fx 3864, Fx 2261, IAN 873, IAN 717 and RRIM 600 of rubber trees from Vale do Ribeira region, São Paulo state were used, being the fallen leaflets collected weekly in four baskets by clone, randomly distributed. The leaflets were totalized, separated by age and analyzed as for the incidence of the fungus Microcyclus ulei... (Complete abstract click electronic access below)
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Distribuição espacial, amostragem sequencial e dinâmica populacional de Leptopharsa heveae (Hemiptera: Tingidae) na cultura da seringueira

Simonato, Adriano Luís [UNESP] 27 May 2014 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2015-01-26T13:21:27Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-05-27Bitstream added on 2015-01-26T13:30:26Z : No. of bitstreams: 1 000802426.pdf: 4096724 bytes, checksum: 468cca6f168bbd10f4dd3e439d75457b (MD5) / Com a expansão dos seringais na região Noroeste do Estado de São Paulo, o percevejo-de-renda da seringueira, Leptopharsa heveae, alcançou níveis populacionais que provocaram e têm provocado danos à heveicultura em geral, reduzindo de forma significativa a produção de látex nos seringais. Com o objetivo de conhecer a distribuição espacial para basear ações de controle desta praga, instalaram-se experimentos em 3 áreas de seringueira plantadas com o clone RRIM 600, com idades de 4, 8 e 12 anos, em uma fazenda localizada no município de Guapiaçu–SP. Em cada área foram consideradas 100 parcelas, cada uma composta por uma linha de 3 plantas sendo amostrado 1 ramo da parte externa do terço inferior da copa da planta central de cada parcela onde foram contadas ninfas e adultos, em 27 amostragens. O nível de agregação da praga foi estudado, para cada amostragem, segundo os índices de dispersão: razão variância/média, índice de Morisita, coeficiente de Green, lei de potência de Taylor e expoente k da binomial negativa e constatou-se que, na maioria das amostragens, a população de L. heveae apresentou distribuição agregada tanto para ninfas quanto para adultos e também para a população total (ninfas + adultos) da praga. Estudou-se o ajuste às distribuições de probabilidade através do teste qui-quadrado de aderência e o modelo mais adequado para representar a distribuição espacial foi a distribuição binomial negativa para ninfas, adultos e para o total da praga. Foi construído um plano de amostragem sequencial para a população total de L. heveae e o número máximo esperado é de 21 ramos para decidir se há a necessidade ou não do controle. As maiores médias populacionais de ninfas e adultos de L. heveae ocorreram no período de julho a outubro, e verificou-se que a população de L. heveae foi significativamente influenciada pelas chuvas, independente das idades ... / With the expansion of rubber trees in the northwestern region of São Paulo state, Brazil, the rubber-tree lacebug, Leptopharsa heveae, reached population levels that caused and continues to cause damages to heveiculture, reducing significantly the rubber production in these trees. To determine the spatial distribution of the lace bug and devise measures to control this pest, experiments were established in 3 areas where RRIM 600 rubber tree clones had been planted (ages 4, 8, and 12 years old), in a farm in the city of Guapiaçu, São Paulo. In each area, 100 parcels were considered, each one made by a line of 3 plants, being sampled 1 branch from the outer section of the lower-third of the canopy of the central plant in each parcel where the number of lacebug nymphs and adults was counted in 27 sampling dates. In each sample, the level of pest aggregation was studied by the dispersion indexes: variance/mean relationship, Morisita's index, Green's coefficient, Taylor's Power Law, and k exponent of the negative binomial; thus, it was verified that, in most samples, the L. heveae population presents aggregate distribution both for nymphs and adults, as well as the pest population as a whole (nymphs plus adults). The adjustment to the probability's distributions was studied through the chi-square test; the binomial negative distribution was the most appropriate model to represent the spatial distribution of the nymphs, adults, and the total population in the 3 areas. A sequential sampling plan was developed for the whole L. heveae population, with an expected maximum of 21 branches being sampled to determine whether preventive measures are necessary. The highest population averages of nymphs and adults of L. heveae occurred from July to October. It was found that the population of L. heveae was significantly influenced by rainfall, regardless of the age of the rubber trees
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Estágios foliares, fenologia da seringueira (Hevea spp.) e interação com Microcyclus ulei (mal das folhas) /

Sambugaro, Rosana, 1976- January 2007 (has links)
Orientador: Edson Luiz Furtado / Banca: Nilton Luiz de Souza / Banca: Roberto Antonio Rodella / Banca: José Otavio Machado Menten / Banca: Adriana Martins / Abstract: The rubber tree is a tropical species that loses its leaves periodically. This deciduifolio habit is an important character for the rubber tree, that is, clones uniform defoliation provides a reduction in the pathogens inocule whose reproductive structures are located in the old leaves. After defoliation, it occurs the foliar renewal and it is at this stage, also known as refoliation, that the rubber tree presents susceptible leaflets in which occur most part of the foliar deseases, such as leaf blight, where the cycle of the pathogen (Microcyclus ulei (P. Henn.)v. Arx) is straightly related with the foliar stages (B, C and D). Therefore, the knowledge on these stages, clones phenologic behavior, factors that influence this character and local climate conditions is important for their selection. The objectives of this work were: characterize through quantitative and descriptive foliar morphology the stages B, C and D; characterize the phenologic behavior and the incidence of South American Leaf Blight; correlate the beginning of the defoliation period with climatic parameters, and leaf blight incidence, during the foliar renewal period, with climatic parameters. For the stages characterization, it was used the clone PB 235, from which the leaves central leaflets were collected, at different stages. It was measured the foliolar limbus lenght, width and area, and the petiole lenght and diameter. It was also determined the form of the limbus, apex and base of the foliolar lamina, as well the leaf coloration. For the other objectives, the clones Fx 3844, Fx 3864, Fx 2261, IAN 873, IAN 717 and RRIM 600 of rubber trees from Vale do Ribeira region, São Paulo state were used, being the fallen leaflets collected weekly in four baskets by clone, randomly distributed. The leaflets were totalized, separated by age and analyzed as for the incidence of the fungus Microcyclus ulei... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor
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Construction of a functional map for rubber tree (Hevea brasiliensis) = Construção de um mapa funcional em seringueira (Hevea brasiliensis) / Construção de um mapa funcional em seringueira (Hevea brasiliensis)

Da Silva, Carla Cristina, 1978- 25 August 2018 (has links)
Orientador: Anete Pereira de Souza. / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-25T14:31:52Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DaSilva_CarlaCristina_D.pdf: 7310053 bytes, checksum: 1acc7f4e6eb7811b25670f85f9563217 (MD5) Previous issue date: 2014 / Resumo: A seringueira (Hevea brasiliensis), espécie nativa da Amazônia, é a maior fonte de borracha natural do mundo. Programas de melhoramento genético da seringueira têm sido cruciais para a obtenção de caracteres desejáveis. Entretanto, o ciclo de melhoramento da seringueira é muito longo (cerca de 30 anos), tornando-se essencial o desenvolvimento de novas técnicas de avaliação precoce. As bibliotecas de cDNA e Expressed Sequence Tags (ESTs) são ferramentas muito importantes em biologia molecular: possibilitam identificar genes preferencialmente expressos em tecidos ou tipos celulares e também são valiosas fontes de marcadores polimórficos, instrumentos poderosos para genotipagem e mapeamento molecular. O uso de marcadores derivados de ESTs permite construir mapas funcionais, nos quais são posicionados genes transcritos ou regiões próximas aos genes. Este tipo de mapeamento é importante para estudos de associação gene-característica, e identificação de genes candidatos. Este trabalho objetivou a construção de bibliotecas de cDNA de diferentes tecidos (painel, látex e folha) e tratamentos (exposição ao frio e infecção controlada por Microcyclus ulei) de seringueira para desenvolver sequências EST e marcadores moleculares gene-direcionados a partir destas sequências, para aumentar a saturação de um mapa integrado baseado em microssatélites, no qual identificaram 18 quantitative trait loci (QTLs) para características de crescimento, construído previamente em nosso laboratório. Foram sequenciados 10.464 clones, gerando 8.551 ESTs de alta qualidade que agrupadas formaram 5.211 unigenes. Destes, 3.582 (68,7%) apresentam similaridade com uma proteína hipotética ou expressa. Foram desenvolvidos 173 marcadores EST-SSR e 43 marcadores SNP para H. brasiliensis. 150 EST-SSRs (87%) podem estar associados a genes funcionais, e 98,8% foram transferidos para outras espécies de Hevea, sugerindo que o gênero seja um complexo formado pelas diferentes espécies. Os SNPs foram identificados em 13 ESTs similares a proteínas de resposta a estresse, desenvolvimento e síntese de látex. Seis sequências foram abundantes nas bibliotecas de exposição ao frio e análises de expressão demonstraram que a expressão de cinco sequências aumentou durante o experimento, principalmente a expressão de duas sequências que foi aumentada mais de 70 vezes. Dos EST-SSRs desenvolvidos, 46 foram genotipados na população segregante F1 com 270 indivíduos, e estes marcadores foram adicionados ao mapa genético de seringueira, totalizando 330 marcadores. O programa OneMap foi usado para a construção do mapa que possui 3.068,9 cM de extensão e 22 grupos de ligação (LGs). Cinco locos foram mapeados em regiões QTL, e os transcritos de três são similares a proteínas de resposta a estresse e desenvolvimento. Estes locos podem ser genes candidatos para estudos relacionados a características de crescimento em seringueira. Até o momento, este é o primeiro trabalho em seringueira que combina análises de ESTs de diferentes tecidos e tratamentos, e análises sobre a exposição a baixas temperaturas, em vários genótipos de seringueira. Os novos marcadores adicionados ao mapa poderão auxiliar na identificação de genes de interesse e de QTLs para outras características de importância agronômica. Os vários marcadores gene-direcionados desenvolvidos serão utilizados para mapeamento e posicionamento de possíveis genes em outras populações de mapeamento que estão sendo avaliadas no Laboratório de Análise Genética e Molecular / Abstract: Rubber tree (Hevea brasiliensis), native species of the Amazon, is world¿s major source of natural rubber. Rubber tree breeding programs have been fundamental for the selection of desirable traits. However, the breeding cycle is time consuming (around 30 years), which makes the development of new techniques for early evaluation a necessity. cDNA libraries and Expressed Sequence Tags (ESTs) are very important tools in molecular biology: they enable the identification of genes preferentially expressed in tissues or cellular types and are also a valuable resource of polymorphic markers, powerful instruments for genotyping and molecular mapping. The use of EST-derived markers allows the construction of functional maps, wherein expressed genes or regions near genes are positioned. This type of mapping is important for gene-trait association studies and candidate genes identification. The present study aimed at the construction of cDNA libraries from different tissues (panel, latex and leave) and treatments (cold exposure and Microcyclus ulei controlled infection) of rubber tree for the development of EST sequences and gene-targeted molecular markers, to raise the saturation of a microsatellite-based integrated genetic map previously constructed in our laboratory, in which 18 quantitative trait loci (QTLs) related to growth traits were identified. Sequencing of 10.464 clones generated 8,551 high quality ESTs that were clustered into 5,211 unigenes. Among these, 3,582 (68.7%) showed similarity to a hypothetical or expressed protein. A total of 173 EST-SSR and 43 SNP markers were developed for H. brasiliensis. 150 SSRs (87%) could be associated with functional genes, and 98.8% were transferred to other Hevea species, suggesting that the genus is a complex formed by different species. The SNP markers were identified in 13 ESTs that showed similarity to stress response, development and latex biosynthesis proteins. Six sequences were highly abundant in the cold exposure libraries and expression analyses demonstrated that five sequences were up-regulated during the exposure, with emphasis to two sequences with more than 70-fold increase in expression. From the developed EST-SSRs, 46 were genotyped in the segregating F1 population comprised of 270 plants. These markers were added to the genetic map, which know contains a total of 330 markers. The OneMap software was used for the map construction that now has 3,068.9 cM and 22 linkage groups. Five loci were mapped into QTLs, and transcripts of three of them present similarity to proteins involved in stress response and developmental processes. These loci may be candidate genes for studies related to rubber tree growth traits. To our knowledge, this is the first work in rubber tree that combines analyses of ESTs from different tissues and treatments, and to analyze sequences under cold stress, in several H. brasiliensis genotypes. The new positioned markers may help in the identification of genes of interest and QTLs for other agronomic important traits. The several gene-targeted markers developed here will be used in the mapping and positioning of possible genes in other mapping populations that are now being evaluated at Genetics and Molecular Analysis Laboratory / Doutorado / Genetica Vegetal e Melhoramento / Doutora em Genética e Biologia Molecular
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Mapeamento genético molecular em Hevea brasiliensis = Genetic linkage mapping in Hevea brasiliensis / Genetic linkage mapping in Hevea brasiliensis

Mantello, Camila Campos, 1985- 07 March 2014 (has links)
Orientadores: Anete Pereira de Souza, Antonio Augusto Franco Garcia / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-25T14:06:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Mantello_CamilaCampos_D.pdf: 14575904 bytes, checksum: 3588e88f982780fe09718e2b837d7824 (MD5) Previous issue date: 2014 / Resumo: Aproximadamente 2.500 espécies são conhecidas por produzirem borracha natural e a seringueira, [Hevea brasiliensis (Willd. ex Adr. de Juss.) Muell-Arg.], espécie nativa da Amazônia e pertencente ao gênero Hevea, é a maior fonte de borracha natural do mundo. A borracha natural é matéria prima para fabricação de mais de 40.000 produtos tendo importância fundamental na indústria de pneus. Apesar de a região Amazônica oferecer condições climáticas adequadas para seu crescimento e desenvolvimento, esta área também possui condições favoráveis à ocorrência do mal-das-folhas (Microcyclus ulei P. Henn v. Arx), doença também conhecida como mal sulamericano das folhas (South American Leaf Bligth ¿ SALB). Dessa maneira, a heveicultura se expandiu para áreas de escape que propiciam novas condições de estresse, limitando o seu crescimento e a produção de látex. O melhoramento genético vem buscando cultivares adaptados a estas regiões de escape, porém o ciclo de melhoramento da seringueira é longo e não permite o rápido desenvolvimento de novos cultivares. O desenvolvimento de ferramentas na biologia molecular permite o melhor entendimento da espécie e pode diminuir o tempo gasto nos ensaios de campo. O presente trabalho desenvolveu novos marcadores microssatélites (SSRs) a partir de bibliotecas enriquecidas em microssatélites. A caracterização destes marcadores mostrou a alta variabilidade alélica dentro de H. brasiliensis e o teste de transferibilidade dos SSRs em outras seis espécies do gênero Hevea mostrou alelos exclusivos para as mesmas e taxas de amplificação superior a 80%. Com o objetivo desenvolver novos marcadores SSRs e single nucleotide polymorphisms (SNPs) em larga escala, foi sequenciado na plataforma Illumina GAIIx o transcriptoma de painel de dois cultivares importantes para a heveicultura (GT1 e PR255). A montagem e a caracterização do transcriptoma permitiu o melhor entendimento da dinâmica do transcriptoma em H. brasiliensis e identificou novos transcritos para a espécie. As sequências do transcriptoma foram submetidas à busca de SSRs e SNPs. No transcriptoma, foram identificados 1.709 novas sequências contendo SSRs para seringueira, a uma frequência de um SSR a cada 2,8 kb. Já a busca de SNPs identificou 404.114 SNPs com frequência de um SNP a cada 125 pb. Através da anotação no Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG), foram identificadas sequências anotadas a todas as enzimas referentes às duas vias de síntese de látex (mevalonato - MVA e C-metileritritol 4-fosfato -MEP). Apesar de as vias MVA e MEP serem muitos estudadas, esta foi a primeira vez que SNPs foram identificados e validados. Os marcadores SSRs e SNPs foram então mapeados em uma população segregante F1. O mapa genético obtido contém 383 marcadores mapeados em 20 grupos de ligação. Neste trabalho foram desenvolvidos 52 SSRs e 51 SNPs do total de marcadores mapeados. Como o número de grupos de ligação esperado é 18 (2n=36), conclui-se que o mapa genético obtido mostra que ainda há uma cobertura incompleta do genoma. Devido à alta frequência de SNPs no genoma, o desenvolvimento de novos marcadores poderá saturar o mapa de forma homogênea, permitindo o agrupamento dos marcadores nos 18 grupos de ligação esperados / Abstract: Approximately 2.500 species are known to produce natural rubber. Hevea brasiliensis (Willd. ex Adr. de Juss.) Muell-Arg. also known as rubber tree is a species native to the Amazon rainforest and is the largest source of natural rubber in the world. Natural rubber has been used in more than 40,000 products and has great importance in the tire industry. Although the Amazon rainforest offers optimal conditions for growth and rubber yields due to its warm and humid climate, this region also provides optimal conditions for the fungus Microcyclus ulei P. Henn v. Arx which causes the South American Leaf Blight (SALB) disease. Thus, rubber tree plantations have expanded to escape areas that provides new stress conditions limiting their growth and latex production. The rubber tree breeding is trying to create a new cultivar that is resistant to these new conditions but the rubber tree cycle breeding is long and does not allow a rapid cultivar development. Thus, molecular biology techniques could provide a greater knowledge of H. brasiliensis genetic and could optimize field evaluation and, thus, reduce the time and area required for experiments. The present work developed new microsatellites (SSRs) markers for rubber tree from genomic enriched libraries. The new microsatellites were characterized and demonstrated a high allelic variability within H. brasiliensis genotypes. The transferability rate in other six species of the genus Hevea was greater than 80%. To develop new SSRs and single nucleotide polymorphisms (SNPs) markers, the panel transcriptome from two important cultivars (GT1 and PR255) was sequenced in Illumina GAIIx platform. The transcriptome obtained allowed a better knowledge about H. brasiliensis transcriptome and identified new transcripts for rubber tree public database. The sequences were submitted to a SSR and SNP search. The SSR frequency was one SSR each 2.8 kb and it was identified 1.709 new sequences with new SSRs for rubber tree database. A total of 404.114 putative SNPs were detected with a frequency of one SNP every 125 bp. Through Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) annotation, it was identified contigs corresponding to all the enzymes of mevalonate (MVA) and -C-methyl-D-erythritol 4-phosphate (MEP). Despite MVA and MEP pathways are being very well studied, since they are directly involved to rubber biosynthesis, this is the first time that molecular markers have been developed for such important pathways. The SSRs and SNPs developed were mapped in a full-sib population. The genetic linkage map has 383 molecular markers distributed in 20 linkage groups. This project contributed with 52 SSRs and 51 SNPs of the total mapped markers. Although the expected number of linkage groups are 18 (2n=36), the new genetic linkage map still has an incomplete coverage of the genome. Due to the high frequency of the SNPs in the genome, the development of new markers can saturate this map homogeneously / Doutorado / Genetica Vegetal e Melhoramento / Doutora em Genética e Biologia Molecular

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