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Étude de différents indicateurs biologiques chez l'esturgeon jaune (Acipenser fulvescens) du Québec

Veillette, François 03 1900 (has links) (PDF)
Au Québec, l'esturgeon jaune (Acipenser fulvescens) fait l'objet d'une pêche commerciale importante malgré le fait qu'à l'échelle mondiale la plupart des espèces d'esturgeons sont menacées de disparition. Si les données dont disposent les intervenants dans la gestion de cette ressource les informent sur l'état des stocks, en terme de quantité, elles ne les renseignent pas sur la qualité des individus pêchés. Des doutes subsistent sur le potentiel réel de régénération et de subsistance à long terme de cette espèce. Ce travail vise à élargir nos connaissances sur l'esturgeon jaune du Québec, une espèce de poissons qui affiche des traits biologiques particuliers dont une forte longévité et une reproduction tardive à longue périodicité. L'hypothèse principale de la recherche est que certains indicateurs biologiques pourraient signaler une atteinte potentielle à la santé des esturgeons, ce qui pourrait conduire à un examen plus approfondi des phénomènes détectés. Des relevés physionomiques (âge, sexe, indices somatiques, relevés d'irrégularités morpho-pathologiques) et des analyses en laboratoire (concentrations de lipides, protéines et glycogène hépatiques, histologie du foie, cycle cellulaire des splénocytes) ont été effectuées sur des esturgeons jaunes (n=122) provenant de trois stations d'échantillonnage. Des analyses de contaminants environnementaux furent également effectuées (mercure, biphényles polychlorés (BPC), dioxines, furanes, éthers de diphényles polybrominés (PBDE), biphényles polybrominés (BPB)). Deux stations se trouvent dans le fleuve Saint-Laurent (lac Saint-Louis et archipel du lac Saint-Pierre), et la troisième se trouve en Abitibi (lac Berthelot). Un indice intégré d'examen de la santé, traité tel qu'il le fut dans le présent travail, ne constitue pas un signal préventif adéquat. Les résultats concernant les lipides hépatiques totaux ainsi que certaines observations histologiques indiquent que le suivi de l'indice hépatosomatique constitue un signal préventif d'atteinte potentielle à la santé. Les fluctuations spatiales et temporelles de la proportion d'individus présentant une valeur supérieure à 3.15 pour cet indice constitue un outil de suivi. ______________________________________________________________________________ MOTS-CLÉS DE L’AUTEUR : Poisson, Indicateurs biologiques, Histologie, Contaminants lipophiles, Esturgeon jaune.
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Les méthodes de capture-recapture pour évaluer les systèmes de surveillance des maladies animales / Capture-recapture methods for assessing surveillance systems in animal health

Vergne, Timothée 26 September 2012 (has links)
Résumé : Les méthodes de capture-recapture servent à décrire l’état d’une population et les processus qui en sous-tendent la dynamique, lorsque les méthodes d’observation et de détection de cette population sont imparfaites. En surveillance des maladies infectieuses, elles peuvent simplement être utilisées pour estimer la taille totale de la population infectée par un pathogène et estimer quantitativement la sensibilité du système de surveillance de ce pathogène. Bien qu'exploitées très largement dans le domaine de la santé publique pour répondre à cet objectif, l'utilisation des méthodes de capture-recapture (CR) en surveillance des maladies infectieuses animales peut être considérée comme récente. Parce que le contexte de surveillance des maladies animales est nettement différent de celui de la surveillance des maladies humaines, des questions demeurent quant à l'intérêt et aux limites de ces méthodes pour estimer la sensibilité des systèmes de surveillance des maladies animales. Pour tenter de répondre à ces questions, nous avons identifié quatre systèmes de surveillance différents par leur complexité, leur efficacité et leur maladie d'intérêt : nous avons retenu les systèmes de surveillance de la fièvre aphteuse au Cambodge, de l’influenza aviaire hautement pathogène (IAHP) H5N1 en Egypte, de la tremblante ovine en France et de l’IAHP H5N1 en Thaïlande. Pour chacun de ces systèmes de surveillance, nous avons déterminé le modèle de CR le plus adapté compte tenu des données générées (respectivement le modèle de CR à deux sources, le modèle log-linéaire à 4 sources, le modèle de comptage tronqué en zéro et le modèle de comptage enflé en zéro). Pour chaque application, nous avons donc estimé le nombre total d'unités épidémiologiques non détectées par les systèmes de surveillance considérés ce qui nous a permis d’apprécier la sensibilité de chaque système de surveillance considéré. Il est ressorti de ces applications que les méthodes de capture-recapture sont relativement faciles à conduire et qu’elles permettent à faible coût d’estimer l’importance réelle d’une maladie sur un territoire quand celle-ci est surveillée de manière imparfaite. Il semble cependant que les pratiques de surveillance et de contrôle des maladies animales limitent les applications à l’échelle de l’animal, et nécessitent d’élargir l’unité épidémiologique à une échelle supérieure (troupeau, commune, etc…). Cet élargissement introduit de nouvelles contraintes (notamment l’hétérogénéité d’abondance) qu’il est nécessaire de prendre en compte pour ne pas biaiser les estimations finales. Ce travail propose des perspectives d’application en épidémiologie descriptive, ainsi que des perspectives méthodologiques de recherche en statistique et en modélisation. / Abstract: Capture-recapture methods are generally used to describe populations when observation processes are imperfect. In the context of disease surveillance, they can be used simply for estimating the total size of the populations infected by a given pathogen, and hence, estimating quantitatively the sensitivity of the surveillance of this pathogen. Although they are widely used in public health, capture-recapture methods have been barely applied to the surveillance of animal diseases. Because the context of animal health is quite different from the context of public health, some questions remain concerning the benefits and the limitations of such methods for estimating the sensitivity of surveillance systems in animal health. For answering this research question, we identified four animal disease surveillance systems that differ by their complexity, their efficiency and their disease of interest. We selected the surveillance of foot-and-mouth disease in Cambodia, of highly pathogenic avian influenza (H5N1) in Egypt and Thailand, and of classical scrapie in France. For each surveillance system, we identified the most appropriate capture-recapture approach (respectively the two-source approach, the three-source approach, the zero-inflated approach and the zero-truncated approach). For each application, we estimated the total number of infected epidemiological units that remained undetected, and accessed an estimation of the sensitivity of each surveillance system. From these applications, we highlighted that these models are relatively easy to implement, and that they allow with little additional income to get an unbiased representation of the disease burden in a population when it is monitored with imperfect surveillance processes. However, it seems that practices used for the monitoring and controlling animal diseases tend to limit the applicability of these methods at the scale of the monitored unit. As a consequence, it is often necessary to enlarge the epidemiological unit (holding, commune, etc…) so that it comprises several monitored units. This enlargement introduces new constraints (abundance induced heterogeneity), that need to be taken into account in order not to bias final estimates. Finally, this work proposes surveillance perspectives for descriptive epidemiology, and methodological perspectives in statistics and modeling as well.
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La santé de l'animal d'élevage : recherche sur l'appréhension de l'animal en droit sanitaire / Farmed animal health law : study on the understanding of the animal under health law

Cintrat, Maud 05 December 2017 (has links)
Étudier l’animal en droit permet de mettre en lumière les difficultés du droit à refléter tant sa réalité biologique que l’évolution de sa perception sociale. L’animal bouleverse les agencements traditionnels du droit, les catégories juridiques, y compris lorsqu’il est élevé par l’homme dans l’une des perspectives les plus utilitaristes qui soit : l’alimentation. L’analyse des règles de droit relatives à la santé de l’animal d’élevage a été conçue dans l’optique de déterminer si ces règles visent à satisfaire un intérêt « animalitaire ». Saisir les modalités de l’appréhension de la santé de cet animal par les règles de droit a permis de constater que, d’une part, ces règles voient leur emprise sur sa santé élargie et que, d’autre part, les sources de ces règles se sont étendues pour s’inscrire dans des organisations à vocation économique reflétant in fine son instrumentalisation par l’homme. C’est dans ce cadre que peut être mis en évidence un dualisme dans l’appréhension de l’animal à travers les règles de droit relatives à sa santé ; dualisme qui comporte, en germe, toute l’ambivalence de la question animale en droit. Saisi à la fois comme membre d’une collectivité et à la fois comme individu, l’animal d’élevage voit néanmoins la protection de sa santé soumise à la satisfaction d’intérêts anthropocentriques / Studying the animal under a legal perspective enables to highlight the issues faced by law to reflect not only its biological reality but also the evolution of its social perception. The animal disrupts the traditional legal layouts, legal categories, included when it is bred by man to achieve one of its most utilitarian goals: food. The analysis of the legislation relating to the health of the farmed animal has been designed with the intention to determine whether or not those rules aim to satisfy an “animalitarian” interest. Determining the terms under which animal health is apprehended by law has enabled to observe that, on the one hand, those rules enlarge their grip on their health and, on the other hand, the sources of those rules have been extended in order to fall within organizations with economic purpose, reflecting in fine its instrumentalization by man. In this framework, a dualism can be highlighted in the way the animal is apprehended through the legislation relating to its health. This dualism comprises the seeds of the whole ambivalence of the question of the animal in law. Caught altogether as a member of a collectivity and as an individual, the farmed animal nevertheless sees the protection of its health subject to the satisfaction of anthropocentric interests
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Activités de biotransformation et de séquestration des fusariotoxines chez les bactéries fermentaires pour la détoxification des ensilages de maïs

Niderkorn, Vincent 25 January 2007 (has links) (PDF)
La contamination des ensilages par les fusariotoxines intervient au champ, indépendamment de tout problème de conservation. L'ingestion par les animaux d'élevage de teneurs trop élevées de ces mycotoxines peut entraîner une altération des performances zootechniques et des effets sur la santé des animaux. Face au succès partiel des méthodes de prévention et à l'inadaptibilité des méthodes physiques et chimiques de détoxification, l'utilisation des propriétés de certains microorganismes apparaît comme une alternative à considérer. L'objectif de ce travail est d'explorer la capacité des bactéries fermentaires à éliminer les fusariotoxines en vue de leur utilisation comme agent de détoxification des ensilages. Le criblage de 202 souches de bactéries fermentaires pour leur capacité à biotransformer et / ou séquestrer le déoxynivalénol (DON), la zéaralénone (ZEN) et les fumonisines B1 et B2 (FB1 et FB2) a montré que la séquestration de ces ces fusariotoxines majeures est une activité répandue chez ces microorganismes, les genres Streptococcus et Enterococcus apparaissant comme les plus efficaces en éliminant jusqu'à 33%, 49%, 24% et 62% de DON, ZEN, FB1 et FB2, respectivement. Cette propriété pourrait diminuer la biodisponibilité des fusariotoxines chez l'animal et, par conséquent, réduire leur effet toxique. D'autre part, environ 5% (11/202) des souches testées ont biotransformé la ZEN en sa forme activée, l'alpha zéaralénol. Nous avons ensuite montré que la séquestration des fumonisines B1 et B2 fait intervenir le peptidoglycane de la paroi bactérienne et les bras d'acide tricarballylique (TCA) des fumonisines. La différence de séquestration de ces deux analogues (FB2>FB1) a été élucidé par une méthode de modélisation moléculaire qui a montré que le groupe hydroxyle additionnel de la FB1 forme une liaison hydrogène avec un des TCA, limitant ainsi la possibilité de séquestration. Des essais ont montré qu'une fraction importante de ZEN était aussi instantanément séquestrée par la flore du contenu ruminal, formant un complexe aussi stable dans des conditions simulant les compartiments post-ruminaux du tube digestif que celui formé entre des Streptococci et la ZEN. Ce niveau de séquestration pourrait contribuer à la plus forte résistance des ruminants aux effets des fusariotoxines. En conséquence, l'ajout de bactéries fermentaires pourrait être davantage utile à des animaux monogastriques plus sensibles comme le porc. Des essais in vivo sont cependant nécessaires pour en évaluer l'impact réel. Optimisée, la capacité des bactéries fermentaires à séquestrer les fusariotoxines pourrait compléter avantageusement les propriétés acidifiantes ou probiotiques des inoculants bactériens utilisés en nutrition animale
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Propositions pour l'évaluation de la performance d'un système d'intelligence compétitive implanté dans une industrie du secteur de santé animale au Brésil

Marchi, Sergio 31 March 2008 (has links) (PDF)
Le marché mondial de produits pour la santé animale a brassé près de 15 milliards de dollars en 2005, notamment dans le segment d'animaux de compagnie, et il est disputé par de grandes entreprises multinationales qui sont généralement les filiales de grandes organisations exerçant leurs activités sur le marché de la santé humaine, qui investissent lourdement en recherche et développement et en actions de marketing. Dans ce contexte, la société Vallée se détache dans le marché brésilien, car elle est au nombre des cinq plus grandes entreprises du secteur. La stratégie de l'entreprise, définie au début des années 90, de spécialisation dans le marché bovin et dans la prévention de ses maladies, lui vaut aujourd'hui le leadership sur le marché de vaccins et de préparations injectables. Cette position privilégiée et l'évolution de son chiffre d'affaires supérieur à la moyenne du marché durant de nombreuses années, a amené l'entreprise à se préoccuper des mouvements de la concurrence et de l'ensembie de l'environnement concurrentiel, ce qui exigeait la mise en place d'un système efficace de veille de l'environnement concurrentiel. Afin de se prémunir contre les mouvements de la concurrence et de détecter de nouvelles opportunités de croissance, un modèle de système d'intelligence compétitive a été mis au point, à partir de 1999. L'un des soucis de Vallée, au long des années, a toujours été de mesurer ses résultats, et ce, grâce à l'intelligence compétitive. En l'absence d'un modèle universellement accepté pour cette évaluation, l'entreprise a adopté diverses initiatives pour ce faire. Nous proposons dans ce travail deux nouvelles manières de déterminer la valeur de l'intelligence compétitive pour les organisalions, l'une directe, l'autre indirecte.
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Les méthodes de capture-recapture pour évaluer les systèmes de surveillance des maladies animales

Vergne, Timothée 26 September 2012 (has links) (PDF)
Résumé : Les méthodes de capture-recapture servent à décrire l'état d'une population et les processus qui en sous-tendent la dynamique, lorsque les méthodes d'observation et de détection de cette population sont imparfaites. En surveillance des maladies infectieuses, elles peuvent simplement être utilisées pour estimer la taille totale de la population infectée par un pathogène et estimer quantitativement la sensibilité du système de surveillance de ce pathogène. Bien qu'exploitées très largement dans le domaine de la santé publique pour répondre à cet objectif, l'utilisation des méthodes de capture-recapture (CR) en surveillance des maladies infectieuses animales peut être considérée comme récente. Parce que le contexte de surveillance des maladies animales est nettement différent de celui de la surveillance des maladies humaines, des questions demeurent quant à l'intérêt et aux limites de ces méthodes pour estimer la sensibilité des systèmes de surveillance des maladies animales. Pour tenter de répondre à ces questions, nous avons identifié quatre systèmes de surveillance différents par leur complexité, leur efficacité et leur maladie d'intérêt : nous avons retenu les systèmes de surveillance de la fièvre aphteuse au Cambodge, de l'influenza aviaire hautement pathogène (IAHP) H5N1 en Egypte, de la tremblante ovine en France et de l'IAHP H5N1 en Thaïlande. Pour chacun de ces systèmes de surveillance, nous avons déterminé le modèle de CR le plus adapté compte tenu des données générées (respectivement le modèle de CR à deux sources, le modèle log-linéaire à 4 sources, le modèle de comptage tronqué en zéro et le modèle de comptage enflé en zéro). Pour chaque application, nous avons donc estimé le nombre total d'unités épidémiologiques non détectées par les systèmes de surveillance considérés ce qui nous a permis d'apprécier la sensibilité de chaque système de surveillance considéré. Il est ressorti de ces applications que les méthodes de capture-recapture sont relativement faciles à conduire et qu'elles permettent à faible coût d'estimer l'importance réelle d'une maladie sur un territoire quand celle-ci est surveillée de manière imparfaite. Il semble cependant que les pratiques de surveillance et de contrôle des maladies animales limitent les applications à l'échelle de l'animal, et nécessitent d'élargir l'unité épidémiologique à une échelle supérieure (troupeau, commune, etc...). Cet élargissement introduit de nouvelles contraintes (notamment l'hétérogénéité d'abondance) qu'il est nécessaire de prendre en compte pour ne pas biaiser les estimations finales. Ce travail propose des perspectives d'application en épidémiologie descriptive, ainsi que des perspectives méthodologiques de recherche en statistique et en modélisation.
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Apport de l'épidémiologie dans le choix des outils d'aide à la prise de décision sanitaire en santé animale. : Evaluation des tests de dépistage en santé animale

Praud, Anne 06 November 2012 (has links) (PDF)
L'étude et le choix des stratégies décisionnelles en santé animale nécessite de disposer d'informations sur l'efficacité des outils disponibles, qu'il s'agisse d'un test unique, d'une association de plusieurs tests ou d'un ensemble de critères cliniques et épidémiologiques. La validation des tests de dépistage ou de diagnostic constitue donc un prérequis à la conception de protocoles d'aide à la prise de décisions sanitaires. Lorsqu'il existe une référence fournissant une information sur le statut infectieux des individus étudiés, l'estimation des caractéristiques des tests peut être effectuée de manière directe. En santé animale, il est toutefois fréquent de ne pas disposer de cette information, lorsqu'aucun test ne référence n'est disponible ou lorsqu'il n'a pas pu être mis en œuvre, pour des raisons pratiques, économiques ou éthiques. Dans ce cas, l'étude des tests requiert l'utilisation de méthodes statistiques adaptées, telles l'utilisation de modèles à classe latente implémentés par une approche bayésienne. Nous avons choisi, au cours de nos travaux, de nous intéresser à l'estimation de la part d'incertitude liée à l'utilisation de tests en tant qu'outils d'aide à la prise de décision. Nous exposons dans un premier chapitre les enjeux et les modalités de la lutte contre les maladies animales, les outils épidémiologiques disponibles pour l'élaboration de stratégies décisionnelles et les méthodes permettant l'évaluation de ces outils et leur comparaison. Les trois chapitres suivants constituent une application de ces méthodes, dans des contextes différents correspondant à trois types de situations dans lesquelles il existe un besoin d'aide à la décision sanitaire en santé animale : le dépistage de la brucellose porcine chez les porcs reproducteurs, le dépistage de l'épididymite contagieuse du bélier chez les béliers destinés à l'export et le dépistage de la tuberculose bovine dans les départements de Côte d'Or et de Dordogne et dans la région camarguaise. Le dernier chapitre de ce manuscrit consiste en une discussion générale sur les modalités de choix d'un outil d'aide à la décision sanitaire.
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Exploration du savoir écologique traditionnel atikamekw au sujet de la santé des animaux et de la sélection des prises dans un contexte de choix alimentaires

Tanguay, Nancy 08 1900 (has links) (PDF)
Pour la nation atikamekw, la préservation de la santé du territoire ancestral et la possibilité de se nourrir de ses ressources demeurent essentielles au maintien de la culture. Au cours du dernier siècle, ce territoire a été l'objet de plusieurs perturbations en lien notamment aux aménagements hydroélectriques et aux activités reliées à l'exploitation forestière. Ces transformations, ainsi que la contamination qui peut en découler, ont entraîné des inquiétudes au sein des communautés atikamekw concernant la santé des animaux et la sécurité des aliments traditionnels. En 2004, un programme de recherche a été mis sur pied afin de proposer des solutions permettant le maintien de l'alimentation traditionnelle tout en minimisant les risques de contamination. L'étude exploratoire dont il est question dans ce mémoire s'insère dans ce projet. Elle visait plus précisément à documenter les changements qui ont été observés chez les animaux par les chasseurs et les pêcheurs atikamekw, les raisons qui selon eux expliquent ces changements, ainsi que les indicateurs qui leur permettent de déterminer si une prise est propre à la consommation ou non. Afin de recueillir ce savoir, quatre groupes de discussion, regroupant un total de 36 détenteurs de savoir, ont été réalisés dans les communautés d'Opitciwan et de Manawan à l'été 2008. Les Atikamekw possèdent un savoir écologique traditionnel (SET) qui comprend non seulement des observations concernant le milieu naturel, mais aussi des croyances, des valeurs et un code éthique. Ce savoir leur permet notamment de distinguer les changements qui résultent de variations naturelles de l'environnement, de ceux, plus inquiétants, qui sont causés par des perturbations anthropiques. Afin de déterminer si une prise est comestible, les chasseurs et les pêcheurs utilisent un ensemble d'indicateurs ayant trait à l'aspect physique de l'animal, mais aussi à son comportement et à son alimentation. Ces indicateurs sont interprétés au sein d'une vision de la santé qui accorde une place prépondérante au territoire. La documentation du savoir atikamekw a permis une meilleure compréhension de la perception de la problématique de la contamination de la nourriture traditionnelle par le peuple atikamekw, ainsi que ('identification de plusieurs facteurs intervenant dans les décisions à l'égard de la consommation d'aliments traditionnels. Ceux-ci pourront être intégrés dans l'élaboration de recommandations alimentaires culturellement pertinentes. ______________________________________________________________________________ MOTS-CLÉS DE L’AUTEUR : Atikamekw, savoir écologique traditionnel (SET), indicateurs de santé animale, choix alimentaires, santé des animaux
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Herd health advisory services in organic dairy cattle farms / Le conseil sanitaire en élevage bovin laitier agrobiologique

Duval, Julie 23 September 2016 (has links)
Améliorer la santé des vaches laitières en élevage agrobiologiques (AB) est bien souvent nécessaire, pour ces élevages ne répondant pas toujours aux principes de l’AB et aux attentes des consommateurs d’avoir un niveau de santé et bien-être animal élevé. Cette thèse explore des voies d’amélioration du conseil sanitaire en vue d'améliorer la santé animale dans ces élevages. Les résultats de nos travaux montrent que les vétérinaires ont le plus souvent un rôle de thérapeute dans les élevages laitiers AB. L'obtention d'un rôle de conseiller a été entravée par des spécificités liées à l’AB, telles que les différences entre éleveurs et vétérinaires dans les objectifs de gestion de la santé des animaux et les pratiques sanitaires. Une étude d'intervention a été effectuée pour tester un dispositif de conseil dans des élevages AB en France et en Suède, basé sur l’utilisation d’outils de surveillance et prévention de maladies de production. Le dispositif a été réalisé en utilisant une approche participative, impliquant l’éleveur et le conseiller ; la flexibilité de l’outil a permis de produire un protocole de surveillance adaptée à chaque élevage. Bien qu’aucun effet sur la santé du troupeau n’a été prouvé, le dispositif a été perçu pour contribuer à la santé du troupeau par ses utilisateurs. Il a rempli la plupart de ses fonctions prévues de surveillance et de prévention des maladies et a stimulé le dialogue entre éleveurs et conseillers. Des outils qui stimulent le dialogue et qui sont adaptables à chaque élevage sont une voie à suivre pour le développement du conseil en santé animale. / Improving herd health on organic dairy farms is often needed, since organic dairy farms do not consistently meet the organic principles and consumers’ expectations of high animal health and welfare. This thesis explores ways to improve the pertinence of herd health advisory services in order to improve animal health on organic dairy farms. The results of our studies show that veterinarians mostoften have a role of therapist on organic dairy farms. Obtaining a more advisory role was hampered due to specificities of the organic sector, such as differences between farmers and veterinarians in animal health management objectives and practices. An intervention study was performed testing a Herd Health and Production Management (HHPM) program on organic dairy farms in France and Sweden, based on herd health monitoring and disease prevention activities. The program was built using a participatory approach, making farmer and advisor work together ; the adaptability of the program allowed to design farm specific herd health monitoring tools. Although no effecton herd health measured, the program was perceived to contribute to herd health by its users. The program fulfilled most of its intended functions in herd healthmonitoring and disease prevention and stimulated dialogue between farmers and their advisors. We consider that dialogue promoting and tools adaptable to farm specific situations are a possible way forward for the development of advisory services in animal health.
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Géographie d’une épizootie : déterminants socio-spatiaux de la diffusion du virus de l’influenza aviaire H5N1 dans les élevages de Thaïlande / Geographical approach of an epidemic : social and spatial determinants of the spread of the highly pathogenic avian influenza (HPAI) H5N1 in poultry farms in Thailand

Paul, Mathilde 08 December 2011 (has links)
La rapidité avec laquelle le virus de l’influenza aviaire H5N1 se propage à toutes les échelles spatiales interroge sur les mécanismes qui sous-tendent la diffusion spatiale des épizooties.Ce travail de thèse montre de quelle manière une démarche de géographie de la santé permet de comprendre les mécanismes sociaux et spatiaux associés à la diffusion de l’épizootie d’influenza aviaire H5N1 en Thaïlande. L’emploi de méthodes de géographie quantitative et d’épidémiologie spatiale nous a d’abord permis de révéler l’existence de disparités spatiales dans le niveau de risque d’infection des élevages au niveau national, puis d’identifier et de hiérarchiser les facteurs de risque spatialisés. A l’échelon local, une enquête épidémiologique nous a ensuite conduits à identifier les pratiques d’élevage favorisant ou limitant le risque d’infection dans les basse-cours. Une analyse socio-économique des réseaux commerciaux liés à la volaille de basse-cour nous a permis de délimiter l’espace géographique (principalement local) de diffusion de la maladie ; elle a également montré de quelle manière les relations sociales unissant les acteurs de la filière, le contexte économique dans lequel ces acteurs évoluent, ainsi que les représentations associées aux maladies aviaires, permettent de comprendre la logique de pratiques facilitant la diffusion du virus. Enfin, notre travail a montré comment, alors que les pratiques spatiales des éleveurs de coqs de combat tendent à favoriser la diffusion du virus H5N1 sur de courtes et longues distances, les enjeux financiers et de prestige associés à ces activités conduisent ces éleveurs à mettre en place des pratiques limitant la propagation du virus. / The rapid spread of highly pathogenic avian influenza (HPAI) H5N1 has raised concerns about the mechanisms that underpin the spatial diffusion of epidemics.This thesis shows how an approach of health geography, based on the combined use of quantitative and qualitative methods from social sciences and epidemiology, can make it possible to identify the social and spatial factors which are associated with the spread of the H5N1 epidemic in poultry in Thailand.In a first step, quantitative geography and spatial epidemiology revealed spatial disparities in the risk of infection for poultry farms at a national level; they also helped at identifying and prioritizing spatial risk factors associated with the spread. In a second step, an epidemiological investigation carried out at a local level made it possible to identify the farming practices associated with the infection of backyard poultry by the H5N1 virus. Then, a socio-economic approach of poultry trade networks allowed us to delineate the geographical area (mainly local) which was relevant to the spread of the epidemic. It also showed how the social relations connecting actors in the sector, the economic context in which these actors operate, and the local perception of poultry diseases can together explain the practices facilitating the spread of the virus. At last, this work demonstrated how, while the practices of fighting cocks owners may favour the spread of the H5N1 virus over short and long distances, the financial stakes and the prestige associated with these activities led farmers to implement prevention practices that finally mitigate the spread of the virus.

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