Submitted by Rodrigo Martins Cruz (rodrigo.cruz@ufvjm.edu.br) on 2015-02-27T13:30:34Z No. of bitstreams: 5 39.pdf: 622297 bytes, checksum: f0b6a4c72e9ca840834c09213d059a4b (MD5) license_url: 52 bytes, checksum: 3d480ae6c91e310daba2020f8787d6f9 (MD5) license_text: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) license.txt: 2109 bytes, checksum: aa477231e840f304454a16eb85a9235f (MD5) / Approved for entry into archive by Rodrigo Martins Cruz (rodrigo.cruz@ufvjm.edu.br) on 2015-02-27T18:45:27Z (GMT) No. of bitstreams: 5 39.pdf: 622297 bytes, checksum: f0b6a4c72e9ca840834c09213d059a4b (MD5) license_url: 52 bytes, checksum: 3d480ae6c91e310daba2020f8787d6f9 (MD5) license_text: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) license.txt: 2109 bytes, checksum: aa477231e840f304454a16eb85a9235f (MD5) / Made available in DSpace on 2015-02-27T18:45:27Z (GMT). No. of bitstreams: 5 39.pdf: 622297 bytes, checksum: f0b6a4c72e9ca840834c09213d059a4b (MD5) license_url: 52 bytes, checksum: 3d480ae6c91e310daba2020f8787d6f9 (MD5) license_text: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) license.txt: 2109 bytes, checksum: aa477231e840f304454a16eb85a9235f (MD5) Previous issue date: 2011 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Cient?fico e Tecnol?gico (CNPq) / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior (Capes)/MEC / Funda??o de Amparo ? Pesquisa do estado de Minas Gerais (FAPEMIG) / Funda??o de Apoio ao Ensino, Pesquisa e Extens?o (FAEPE) / Comparou-se a efetividade de linhagens melhoradas de tomateiro, ricas em 2-tridecanona (2-TD), zingibereno (ZGB) e acila??cares (AA), ou no tocante aos n?veis de resist?ncia ? tra?a-do-tomateiro Tuta absoluta. Tamb?m verificou-se se linhagens selecionadas para maiores densidades de tricomas glandulares, presumivelmente com maiores n?veis de 2-tridecanona, ? efetiva no sentido de promover maior resist?ncia ? tra?a. Como testemunhas suscet?veis foram utilizadas as linhagens TOM-584 e TOM-679, com n?vel normal dos tr?s aleloqu?micos. A linhagem melhorada TOM-687 (com alto teor de AA) foi utilizada como linhagem resistente padr?o, por ter sua resist?ncia amplamente documentada, juntamente com o tamb?m resistente acesso selvagem PI134417 (com alto teor de 2-TD). O experimento foi instalado em casa de vegeta??o em delineamento inteiramente casualizado. O acesso selvagem PI 134417 confirmou-se como altamente resistente. TOM-622 (rica em 2-TD), ZGB-703 (rica em ZGB) e TOM-687 apresentaram diminui??es significativas na ovoposi??o da tra?a-do-tomateiro, bem como no dano geral na planta, les?o nos fol?olos e porcentagem de fol?olos atacados, comparadas ?s testemunhas TOM-584 e TOM-679. Os n?veis de resist?ncia ? tra?a em TOM-622, ZGB-703 e TOM-687 foram similares entre si. Em geral os gen?tipos selecionados para maiores densidades de tricomas glandulares apresentaram n?veis de resist?ncia tamb?m superiores aos das testemunhas suscet?veis, destacando entre eles o tratamento BPX-367D-238-02. / Disserta??o (Mestrado) ? Programa de P?s-Gradua??o em Produ??o Vegetal, Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri, 2011. / ABSTRACT In Brazil the Cactaceae is represented by 160 species from which 26% occur on the rocky fields. Cipocereus minensis is an endemic Cactaceae from the rocky fields in the Minas Gerais? portion of the Espinha?o chain. In this research it was intended to evaluate the rhythms of flower and fruit production of the species, its floral and reproductive biology, and also know the floral visitors and the likely seed dispersers, in an area of the rocky fields of the Diamantina ? MG?s plateau. Seed germination tests have been performed and the initial plant growth on different substrates was analyzed. The species had floral traits such as nocturnal anthesis, white flowers, abundant volume of nectar and rigid perianth structures that suggested pollination by bats. However daily visitors as hummingbirds were also observed. The reproductive system of C. minensis is alogamic and self incompatible and the night visitors were more efficient than the daytime ones in the formation of fruits. The phenologic pattern of flowering and fruiting is sub-annual, with peak of flowering at the beginning and middle of the dry season, in april and july, respectively. Another peak was observed in the wet season in november, with lower production of flowers, but with a higher flower/fruit conversion rate . C. minensis is well adapted to the climatic seasonality. The fruits showed significant differences with respect to collection time for the length, diameter and weight, with higher measures in the wet season. The average number of seeds per fruit was 958.63 ? 369.35, the weight of 1000 seeds was 0.53 g and the mean length of the seeds was 1.5 mm. The highest germination rates were found after nine and twelve months of storage (75% and 72%, respectively) or in fruits collected with a more advanced stage of ripening (72%).In the initial growth the plants showed a higher diameter and height on the substrate prepared in the ratio 1:1:1, composed of sand, red soil and cow dung. The store promotes germination, but also in fruits collected in a more advanced stage of maturation. Substrates with better drainage and aeration favoring better initial development of this plant species. This information will provide subsidies for the development of strategies of conservation and management of the species.

Submitted by Automa??o e Estat?stica (sst@bczm.ufrn.br) on 2016-01-11T20:43:50Z No. of bitstreams: 1 RicardoVictorMachadoDeAlmeida_DISSERT.pdf: 6652554 bytes, checksum: 6cdb4c4527db5842187ddfa525762e72 (MD5) / Approved for entry into archive by Arlan Eloi Leite Silva (eloihistoriador@yahoo.com.br) on 2016-01-11T20:54:52Z (GMT) No. of bitstreams: 1 RicardoVictorMachadoDeAlmeida_DISSERT.pdf: 6652554 bytes, checksum: 6cdb4c4527db5842187ddfa525762e72 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-01-11T20:54:52Z (GMT). No. of bitstreams: 1 RicardoVictorMachadoDeAlmeida_DISSERT.pdf: 6652554 bytes, checksum: 6cdb4c4527db5842187ddfa525762e72 (MD5) Previous issue date: 2014-08-28 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior - CAPES / Conselho Nacional de Desenvolvimento Cient?fico e Tecnol?gico - CNPq / O metabolismo vegetal ? composto por uma complexa rede de eventos f?sicos e qu?micos que resultam na fotoss?ntese, respira??o, e na s?ntese e degrada??o de compostos org?nicos. Isto s? ? poss?vel gra?as aos diferentes tipos de respostas a in?meras varia??es ambientais que um vegetal pode estar sujeito, adquiridas ao longo da evolu??o, levando tamb?m a conquistas de novos ambientes. O ciclo do glioxilato ? uma via metab?lica localizada nos glioxissomos de plantas, que possui papel ?nico no estabelecimento das pl?ntulas. Considerado como uma varia??o do ciclo do ?cido c?trico esta via utiliza uma mol?cula de acetil-Coenzima A, oriunda da beta-oxida??o de lip?dios para sintetizar compostos que s?o utilizados na s?ntese de carboidratos. As enzimas Malato sintase (MLS) e Isocitrato liase (ICL) s?o exclusivas deste ciclo e essenciais na regula??o da bioss?ntese de carboidratos. Devido ? aus?ncia das etapas de descarboxila??o, como fatores limitantes da velocidade, estudos mais detalhados da filogenia e evolu??o molecular dessas prote?nas permite o esclarecimento dos efeitos da presen?a desta rota nos processos evolutivos envolvidos em esp?cies vegetais. Portanto, o objetivo deste trabalho foi estudar a rela??o entre a evolu??o molecular das enzimas Isocitrato liase e Malato sintase e sua filogenia, nas plantas verdes (Viridiplantae). Para isso, foram utilizadas sequ?ncias de amino?cidos e nucleot?deos dos genes, a partir de reposit?rios online como o Genbank e Uniprot. As sequ?ncias foram alinhadas e, em seguida, submetidos ? an?lise estat?stica dos modelos de melhor ajuste de substitui??o. A filogenia foi reconstru?da por m?todos de dist?ncia (Neighbor-joining) e m?todos discretos (M?xima Verossimilhan?a, M?xima Parcim?nia e An?lise Bayesiana). O reconhecimento de padr?es estruturais na evolu??o das enzimas foi feito por predi??o e modelagem por homologia das estruturas das sequ?ncias das prote?nas obtidas. Com base nas an?lises comparativas entre modelos in silico, das enzimas, e partir dos resultados de infer?ncia filogen?tica, ambas as enzimas apresentam um padr?o de conserva??o relativamente elevado em sua estrutura e geram topologias condizentes com dois processos de sele??o e especializa??o dos seus respectivos genes. Deste modo, confirmando a relev?ncia em se realizar novos estudos para se elucidar o metabolismo vegetal sob uma perspectiva evolutiva das rela??es entre os genes e a express?o de suas enzimas / The plant metabolism consists of a complex network of physical and chemical events resulting in photosynthesis, respiration, synthesis and degradation of organic compounds. This is only possible due to the different kinds of responses to many environmental variations that a plant could be subject through evolution, leading also to conquering new surroundings. The glyoxylate cycle is a metabolic pathway found in glyoxysomes plant, which has unique role in the seedling establishment. Considered as a variation of the citric acid cycle, it uses an acetyl coenzyme A molecule, derived from lipids beta-oxidation to synthesize compounds which are used in carbohydrate synthesis. The Malate synthase (MLS) and Isocitrate lyase (ICL) enzyme of this cycle are unique and essential in regulating the biosynthesis of carbohydrates. Because of the absence of decarboxylation steps as rate-limiting steps, detailed studies of molecular phylogeny and evolution of these proteins enables the elucidation of the effects of this route presence in the evolutionary processes involved in their distribution across the genome from different plant species. Therefore, the aim of this study was to establish a relationship between the molecular evolution of the characteristics of enzymes from the glyoxylate cycle (isocitrate lyase and malate synthase) and their molecular phylogeny, among green plants (Viridiplantae). For this, amino acid and nucleotide sequences were used, from online repositories as UniProt and Genbank. Sequences were aligned and then subjected to an analysis of the best-fit substitution models. The phylogeny was rebuilt by distance methods (neighbor-joining) and discrete methods (maximum likelihood, maximum parsimony and Bayesian analysis). The identification of structural patterns in the evolution of the enzymes was made through homology modeling and structure prediction from protein sequences. Based on comparative analyzes of in silico models and from the results of phylogenetic inferences, both enzymes show significant structure conservation and their topologies in agreement with two processes of selection and specialization of the genes. Thus, confirming the relevance of new studies to elucidate the plant metabolism from an evolutionary perspective

Made available in DSpace on 2014-12-17T15:36:57Z (GMT). No. of bitstreams: 1 ClarissaS.pdf: 666135 bytes, checksum: 5adc078913ae424375993022424d1a68 (MD5) Previous issue date: 2009-09-18 / A presente pesquisa partiu de uma revis?o te?rica dos assuntos relacionados ? sele??o sexual proposta por Charles Darwin, passando para evolu??o dos sistemas e da psicologia do acasalamento humano. Os estudos pr?ticos, divididos em dois momentos, foram coletados numa comunidade litor?nea de baixa renda no nordeste brasileiro, na qual as mulheres tiveram pelo menos duas uni?es est?veis at? a data da coleta, no ano de 2008. Nas primeiras an?lises, foram contempladas as expectativas dessas mulheres em rela??o aos atributos dos parceiros. E posteriormente, o perfil e valor das mesmas entraram em perspectiva. De uma forma geral, foi constatado que as mulheres, no primeiro casamento, de fato realizam matrim?nios com parceiros mais parecidos com o que consideram ideal do que os posteriores. Assim como as segundas e subseq?entes uni?es apresentam uma ligeira queda no valor (no mercado de casamentos) desses homens quando comparados aos primeiros companheiros levando em considera??o indicadores biosocioecon?micos como idade, escolaridade e renda (status socioecon?mico).

Made available in DSpace on 2014-12-17T15:37:16Z (GMT). No. of bitstreams: 1 JordanaCB_DISSERT.pdf: 1974696 bytes, checksum: 07b987e745ca9340a2f8e2dcb47caf8b (MD5) Previous issue date: 2012-12-19 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Cient?fico e Tecnol?gico / Natural selection shapes body and behavior of each species. For primates, the social environment constituted one of the greatest selective pressure for the development of their cognition. When we consider gender differences, we see that sexual selection also operates through different selective pressures for men and women not only in physical terms but in terms of cognitive skills. Among these, the primary cognitive abilities - that emerge naturally - and secondary - that rely on an artificial environment for learning - develop differently for each sex, making them suitable for specific tasks in different capacities. Previous studies utilized the Wason Selection Test a conditional logic tool - to measure, among several other things, the ability to recognize violation of rules in abstract contexts and social contexts. Subjects generally had better performance in the latter, however, in these studies possible differences motivated by learning in formal logic or genre were not considered. Our study investigated these two variables, as well as the time spent to solve each task. Furthermore, we used an index to take into account the rights and wrongs of the participants in tasks. We realized that although learning in formal logic does not bring significant differences in solving tests, the gender differences are strongly observed when we consider the social contexts and abstract. Women perform better in social tasks. This can be explained due to different sexual selective pressures for this gender in terms of one-on-one relationships within the group. Men are better at tasks of abstract context and this is probably due to the same reason. Their capabilities for territory defense, habitat navigation and forming coalitions depends on primary cognitive abilities that support secondary cognitive skills of abstraction. Thus, gender differences are a factor to be taken into account in controlling future experiments with the same tool / A sele??o natural molda o corpo e o comportamento de cada esp?cie. Para os primatas, o ambiente social constituiu uma das maiores press?es seletivas para o desenvolvimento da sua cogni??o. Quando consideramos as diferen?as de g?nero, vemos que a sele??o sexual tamb?m atua atrav?s de diferentes press?es seletivas para homens e mulheres n?o s? em termos f?sicos, mas em termos de habilidades cognitivas. Dentre estas, as habilidades cognitivas prim?rias - que emergem naturalmente - e secund?rias - que dependem de um ambiente artificial de aprendizagem - se desenvolvem de forma diferente para cada sexo, tornando-os aptos para capacidades distintas em tarefas espec?ficas. Estudos anteriores utilizaram a ferramenta de l?gica condicional Teste de Sele??o de Wason para medir, dentre v?rias outros aspectos, a capacidade de reconhecimento de viola??o de regras em contextos abstratos e em contextos sociais. Os sujeitos em geral tinham um melhor desempenho neste ?ltimo, entretanto, em tais estudos n?o foram consideradas poss?veis diferen?as motivadas por aprendizagem em l?gica formal ou g?nero. Nosso trabalho investigou essas duas vari?veis, bem como o tempo gasto para a resolu??o de cada tarefa. Al?m disso, utilizamos um ?ndice para levar em conta os acertos e erros dos participantes nas tarefas. Percebemos que, embora a aprendizagem formal em l?gica n?o traga diferen?as significativas na resolu??o dos testes, as diferen?as de g?nero s?o fortemente observadas quando levamos em conta os contextos social e abstrato. Mulheres t?m melhor desempenho em tarefas sociais. Isso pode ser explicado gra?as a diferentes press?es seletivas sexuais para este g?nero em termos de rela??es individuais para suporte dentro do grupo. Homens s?o melhores em tarefas de car?ter abstrato, e isso provavelmente se deve pelo mesmo motivo. Suas capacidades para defesa de territ?rio, navega??o no habitat e forma??o de coaliz?es dependem de habilidades cognitivas prim?rias que apoiam as capacidades cognitivas secund?rias de abstra??o. Sendo assim, as diferen?as de g?nero constituem um fator a ser levado em conta no controle em experimentos futuros com a mesma ferramenta

Submitted by Fabio Sobreira Campos da Costa (fabio.sobreira@ufpe.br) on 2016-09-20T13:30:20Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) ArthurDiegoDiasRocha.pdf: 4681451 bytes, checksum: 976cd7abe56f828ff55cbd595fdc6c6f (MD5) / Made available in DSpace on 2016-09-20T13:30:21Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) ArthurDiegoDiasRocha.pdf: 4681451 bytes, checksum: 976cd7abe56f828ff55cbd595fdc6c6f (MD5) Previous issue date: 2016-02-22 / FACEPE / O c^ancer de mama e o mais comum entre as mulheres no mundo e no Brasil, depois do de pele n~ao melanoma. De acordo com o Instituto Nacional de C^ancer, em 2013 foram registradas 14.388 mortes devido a esta mol estia. O c^ancer de mama e uma preocupa c~ao n~ao somente nacional, mas mundial. O m etodo utilizado para a sua detec c~ao e a mamogra a, que e uma t ecnica de imagem que utiliza a emiss~ao Raios-X incidentes na mama e capta a parte da radia c~ao n~ao absorvida pelos tecidos mam arios. A mamogra a e um exame de dif cil an alise pelo motivo de, em muitos casos, a densidade tecidual do tumor ser bastante parecida com a densidade de alguns tecidos saud aveis da mama. Uma abordagem interessante e a utiliza c~ao de t ecnicas computadorizadas de aux lio ao diagn ostico, ou seja, ferramentas baseadas em processamento de imagens e intelig^encia computacional projetadas para o apoio ao pro ssional radiologista. Estudos pr evios demonstram que considerar a domin^ancia tecidual mam aria nas ferramentas computacionais de apoio ao diagn ostico melhora consideravelmente as taxas de acerto. Para este trabalho, e proposta a constru c~ao de um sistema de classi ca c~ao de tumores de mama baseado descritores de Zernike como um descritor de forma das les~oes de mama, associado as m aquinas de vetor de suporte como classi cador. S~ao comparadas diferentes t ecnicas de sele c~ao de atributos com o objetivo de reduzir o custo computacional do sistema, mas sempre levando em conta a necessidade de se manter altas taxas de acerto, j a que isto pode re etir em erros de diagn ostico de c^ancer de mama. Atrav es dos dados analisados, e notado que a t ecnica linear de an alise de componentes principais (aliada a transformada de wavelets morfol ogica como etapa de pr e-processamento) se mostrou uma otima t ecnica para realiza c~ao de redu c~ao de atributos com um menor impacto nas taxas de acerto do sistema de apoio ao diagn ostico do c^ancer de mama, onde s~ao obtidas taxas de m edias de redu c~ao de acerto em torno de 2% (uma queda m edia de aproximadamente 95% para 93%), onde a redu c~ao do tamanho do vetor de atributos e de cerca de 64% (dentre os diferentes tipos de tecido, s~ao selecionados de 70 a 89 atributos do total de 224). / Breast cancer is one of the most common type of cancer among women. According to Brazil's national institute of cancer, in 2013 it was registered 14,388 deaths due to this disease. Breast cancer is not only a national but worldwide concern. The most used method to its detection is mammography which is an image technique that uses X ray emission and measures the non-absorbed radiation by the breast internal tissues. Mammography is a hard to analyze image exam, mainly because in many cases tumor's density is much alike some of the healthy tissues' density. An interesting approach is the use of computeraided techniques for diagnosis, meaning the use of image processing and computational intelligence tools designed to support and aid radiologists in their tasks. Previous studies show that considering the di erent types of breast tissue dominance improves considerably the rate of correct classi cation by these computational tools. It is proposed for this work the development of a breast tumor classi cation system based on Zernike descriptors as shape descriptors of these breast lesions along with support vector machines as machine learning algorithms for classi cation. Some feature selection techniques are compared for reducing the whole system computational cost but always taking into consideration that the classi cation rates must be kept as high as possible. Of the techniques studied in this work, principal components analysis along with morphological wavelet transform for image preprocessing has shown itself as a great technique for feature reduction with lesser impact on classi cation rates. It was achieved a mean 2% loss in those rates (from about 95% to 93% as mean values) with a mean feature reduction of about 64% (in the range of 70 to 89 features from 224).

Submitted by Caroline Xavier (caroline.xavier@pucrs.br) on 2017-05-04T17:15:51Z No. of bitstreams: 1 TES_HENRIQUE_VIEIRA_FIGUEIRO_COMPLETO.pdf: 4680551 bytes, checksum: 8695b78fe6812f4690586975941c4c31 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-04T17:15:51Z (GMT). No. of bitstreams: 1 TES_HENRIQUE_VIEIRA_FIGUEIRO_COMPLETO.pdf: 4680551 bytes, checksum: 8695b78fe6812f4690586975941c4c31 (MD5) Previous issue date: 2016-03-11 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior - CAPES / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Cient?fico e Tecnol?gico - CNPq / In the past 10 years, high throughput sequencing has revolutionized evolutionary biology. With the technical advances that emerged with the genome sequencing of model species, it is now possible to apply these techniques to taxonomic groups without any previously available genetic resources. Complete genome sequencing and reduced representation methods have enabled us to explore deeper evolutionary questions, such as detecting ancient hybridization and signatures of selection on a genomic scale. Among the groups that could benefit from these methods is the Panthera genus. The group is composed by five species (P. onca, P. tigris, P. leo, P. pardus and P. uncia), all of which are large felids that exert important ecological role as apex predators in their habitats. Their low densities, alarming rates of habitat loss and chronic conflict with humans, all of them are threatened with extinction in the wild and thus important targets for conservation. One of the species in this group, the jaguar (P. onca), is the only member of the genus currently present in the Neotropical region, and the focus of our study. The jaguar has a color pattern similar to that of the leopard, but a much more robust constitution, with massive jaws and shorter limbs. The present study aims to characterize for the first time the jaguar genome, and to perform comparative analyses with the genomes from all other Panthera species. In addition, we seek to perform population genomic analyses with Brazilian jaguar populations and search for signatures of divergent selection in different regions. We have sequenced four genomic libraries, with an estimated coverage depth of 84x. The complete genome sequence allowed the annotation of 25,441 genes and the description of other genomic features (e.g. ncRNA, microsatellites, numts). Additionally, we have sequenced the genome of a leopard at low coverage, with an estimated depth of 25x. With the addition of these two genomes, we were able obtain a genomic data set containing all five Panthera species, which was used to perform phylogenetic discordance analyses and to detect signatures of selection using a dataset encompassing 13,143 orthologous genes. We were able to demonstrate the presence of hybridization events during the speciation process of the species, as well as signatures of selection in genes potentially involved in important characteristics of these iconic animals. Among them, the jaguar?s robust build, the social behavior of lions, cold environment adaptations in the snow leopard and the tiger?s stripes. Using an exome capture approach, we performed a population genomics study targeting jaguar populations from different Brazilian biomes. In addition to assessments of genetic diversity and population structure, we detected signals of local adaptation using multiple methods. Among the obtained results is the presence of genes under selection that are related to energetic metabolism in the Amazon, body development in the Pantanal and immunity in the Atlantic Forest. Additionally, we observed several pigmentation-related genes under selection in different biomes. Those genes affect not only pigmentation, but also have pleiotropic effects in development and immunity routes. Overall, these results help to understand the evolutionary processes that have shaped the adaptation of Panthera species, and particularly the jaguar, to the environments where they currently live. / Nos ?ltimos 10 anos, o sequenciamento gen?mico de alto desempenho revolucionou a biologia evolutiva. Com os avan?os gerados pelo sequenciamento do genoma completo de esp?cies modelo, agora ? poss?vel aplicar essas t?cnicas em animais com praticamente nenhum recurso gen?tico dispon?vel. O sequenciamento completo de genomas, bem como o uso de t?cnicas de representa??o reduzida, permitem explorar quest?es evolutivas complexas como, por exemplo, detec??o de hibrida??o e assinaturas de sele??o natural em uma escala gen?mica. Dentre os grupos taxon?micos que podem se beneficiar de tais t?cnicas est? o g?nero Panthera. O grupo ? composto por cinco esp?cies atuais (P. onca, P. tigris, P. leo, P. pardus e P. uncia), todas elas apresentando grande porte e atuando como predadores de topo nos ambientes que ocupam. Devido ?s baixas densidades, alarmante perda de habitat e constantes conflitos com humanos, o n?vel de amea?a em que essas esp?cies se encontram ? preocupante. Dentre as esp?cies do grupo, est? a on?a-pintada (P. onca), ?nica integrante do g?nero na regi?o Neotropical e o principal foco deste trabalho. Nesse sentido, o presente estudo busca caracterizar pela primeira vez o genoma da on?a-pintada, incluindo an?lises comparativas com as outras quatro esp?cies do g?nero. Al?m disso, o trabalho tem como objetivo avaliar as popula??es de on?a no Brasil e buscar assinaturas de sele??o divergente nos biomas que ela ocupa. Para o sequenciamento do genoma da esp?cie, foram utilizadas quatro bibliotecas gen?micas, com uma cobertura estimada de 84x. A sequ?ncia do genoma completo permitiu a anota??o de 25.441 genes e a descri??o de outros componentes do genoma (p.ex. ncRNA, microssat?lites, numts). Adicionalmente, foi sequenciado o genoma de um leopardo (P. pardus) com cobertura estimada de 25x. Com esses dois novos genomas, completou-se um conjunto abrangendo todas as cinco esp?cies do g?nero, permitindo a realiza??o de an?lises de discord?ncia filogen?tica para o grupo e detec??o de sele??o positiva utilizando um conjunto de 13.143 genes ort?logos. Foi poss?vel demonstrar eventos de hibrida??o durante o processo de especia??o das esp?cies do g?nero, bem como sinais de sele??o positiva em genes envolvidos em caracter?sticas que se destacam nos grandes fel?deos. Entre eles, fen?tipos potencialmente afetados por genes sob sele??o incluem o cr?nio e membros robustos da on?a-pintada, o comportamento social no le?o, adapta??o ao frio no leopardo das neves e a presen?a de listras no tigre. Com o uso de captura de exoma, que tem como objetivo o sequenciamento do conjunto de exons da esp?cie, foi poss?vel realizar uma nova avalia??o das caracter?sticas gen?ticas de popula??es de on?a-pintada, bem como a detec??o de assinaturas de adapta??o local. Entre os resultados obtidos est? a presen?a de genes sob sele??o relacionados com metabolismo energ?tico em popula??es da Amaz?nia, adapta??es relacionadas com desenvolvimento corporal no Pantanal e imunidade na Mata Atl?ntica. Adicionalmente, foram observados diversos genes de pigmenta??o com assinaturas de sele??o em diferentes biomas. Esses genes, al?m de afetarem a colora??o dos animais, possuem efeitos pleiotr?picos no desenvolvimento e imunidade da esp?cie. Esses resultados auxiliam no entendimento dos processos evolutivos que moldaram a adapta??o das esp?cies do g?nero, e em especial a on?a pintada, aos ambientes que elas ocupam atualmente.

Submitted by PPG Ci?ncias Criminais (ppgccrim@pucrs.br) on 2017-10-31T11:44:46Z No. of bitstreams: 1 PAULO CONTI - Tese completa.pdf: 2609075 bytes, checksum: 97290ff28a48f55a05a3800950e6fc85 (MD5) / Approved for entry into archive by Caroline Xavier (caroline.xavier@pucrs.br) on 2017-11-10T11:50:34Z (GMT) No. of bitstreams: 1 PAULO CONTI - Tese completa.pdf: 2609075 bytes, checksum: 97290ff28a48f55a05a3800950e6fc85 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-11-10T11:54:31Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PAULO CONTI - Tese completa.pdf: 2609075 bytes, checksum: 97290ff28a48f55a05a3800950e6fc85 (MD5) Previous issue date: 2017-08-21 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior - CAPES / The main purpose of this work is to demonstrate that human genetic diversity constitutes a supraindividual interest, worthy of legal and criminal protection. Thus, in order to achieve this goal, a methodology of a deductive nature is used and a study of an interdisciplinary nature is carried out, encompassing several areas of knowledge: History, Biomedical Sciences, Bioethics and Criminal Sciences, with a special focus on Criminal Law. At first, the work seeks to determine that the use of modern genetic and reproductive technologies applied to the human being, cannot be based on an eugenics ideology of discriminatory character. Subsequently, in the bioethical analysis, the study aims to establish, as a support for the problematic scenario presented, a theoretical model based on the following principles: life, responsibility, and biomedical ethics (hierarchical). In the end, with the support of Constitutional Law and Criminal Law dogmatic, the thesis aims to determine that the sex selection and/or human genetic characteristics, in the non-therapeutic standpoint, violates constitutional principles and grounds the legitimation of legal and criminal intervention for the protection of human genetic diversity. / Este trabajo tiene como objetivo principal demostrar que la diversidad gen?tica humana constituye bien supraindividual, digno de tutela jur?dico-penal. As?, con el fin de alcanzar dicho objetivo, se utiliza una metodolog?a de car?cter deductivo y se realiza un estudio de naturaleza interdisciplinar que engloba diversas ?reas del conocimiento: Historia, Ciencias Biom?dicas, Bio?tica y Ciencias Criminales, con especial enfoque en el Derecho Penal. En un primer momento, el trabajo busca determinar que la utilizaci?n de las modernas tecnolog?as gen?ticas y reproductivas, aplicadas al ser humano, no puede estar fundamentada en una ideolog?a eugen?sica de car?cter discriminatorio. Posteriormente, adentr?ndose en el an?lisis bio?tico, el estudio pretende establecer, como sostenimiento para el escenario problem?tico presentado, un modelo te?rico pautado en los siguientes principios: vida, responsabilidad y ?tica biom?dica (jerarquizada). Al final, con el auxilio del Derecho Constitucional y de la dogm?tica del Derecho Penal, la tesis objetiva determinar que la selecci?n de sexo y/o de caracter?sticas gen?ticas humanas, en la direcci?n no terap?utica, atenta contra principios constitucionales y fundamenta la legitimaci?n de la intervenci?n jur?dico-penal para la tutela de la diversidad gen?tica humana. / Este trabalho possui como objetivo principal demonstrar que a diversidade gen?tica humana constitui bem supraindividual, digno de tutela jur?dico-penal. Assim, no intuito de alcan?ar o referido objetivo, utiliza-se uma metodologia de car?ter dedutivo e realiza-se um estudo de natureza interdisciplinar que engloba diversas ?reas do conhecimento: Hist?ria, Ci?ncias Biom?dicas, Bio?tica e Ci?ncias Criminais, com especial enfoque no Direito Penal. Num primeiro momento, o trabalho procura determinar que a utiliza??o das modernas tecnologias gen?ticas e reprodutivas, aplicadas ao ser humano, n?o pode estar fundamentada numa ideologia eugenista de car?ter discriminat?rio. Posteriormente, adentrando-se na an?lise bio?tica, o estudo visa estabelecer, como sustent?culo para o cen?rio problem?tico apresentado, um modelo te?rico pautado nos seguintes princ?pios: vida, responsabilidade e de ?tica biom?dica (hierarquizada). Ao fim, com o aux?lio do Direito Constitucional e da dogm?tica do Direito Penal, a tese objetiva determinar que a sele??o de sexo e/ou de caracter?sticas gen?ticas humanas, no vi?s n?o terap?utico, atenta contra princ?pios constitucionais e fundamenta a legitima??o da interven??o jur?dico-penal para a tutela da diversidade gen?tica humana.

Made available in DSpace on 2015-04-14T14:51:03Z (GMT). No. of bitstreams: 1 426061.pdf: 815660 bytes, checksum: a63907607c66f42025ef148afc7c6471 (MD5) Previous issue date: 2010-04-28 / O fator neurotr?fico conhecido como BDNF tem atra?do consider?vel aten??o na literatura cient?fica, pelo seu envolvimento em processos cruciais de desenvolvimento e regula??o do sistema nervoso. Entretanto, muitos aspectos desta mol?cula s?o ainda desconhecidos, enquanto outros foram investigados apenas em humanos e organismos-modelo. Neste contexto, ferramentas de bioinform?tica podem ser muito ?teis para realizar an?lises comparativas enfocando aspectos evolutivos, estruturais e funcionais. Este projeto objetivou uma caracteriza??o de padr?es de conserva??o e varia??o desta mol?cula atrav?s da compara??o das seq??ncias codificantes deste gene em diferentes linhagens de mam?feros, assim como uma investiga??o de aspectos estruturais atrav?s da constru??o de um modelo 3D do BDNF consistente com dados experimentais. Os resultados revelam padr?es bastante interessantes de conserva??o e varia??o de sequ?ncia em diferentes linhagens, incluindo fortes evid?ncias da ocorr?ncia de sele??o natural negativa (indicando restri??o ? mudan?a devido ? relev?ncia funcional) tanto no dom?nio maduro como no dom?nio pro. Al?m disso, observou-se evid?ncia de sele??o positiva (indu??o de mudan?as possivelmente adaptativas) em diferentes linhagens, em todos os casos afetando diretamente o dom?nio pro. Estes resultados indicam que o dom?nio pro apresenta grande relev?ncia funcional, e salientam a import?ncia de focar esfor?os de investiga??o experimental nesta por??o do BDNF.

Submitted by Setor de Tratamento da Informa??o - BC/PUCRS (tede2@pucrs.br) on 2016-05-25T13:34:06Z No. of bitstreams: 1 DIS_CAROLINA_SCHAAN_PESSANO_COMPLETO.pdf: 2175468 bytes, checksum: 82a6d95131fe7b07751b67f5c90f4203 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-05-25T13:34:06Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DIS_CAROLINA_SCHAAN_PESSANO_COMPLETO.pdf: 2175468 bytes, checksum: 82a6d95131fe7b07751b67f5c90f4203 (MD5) Previous issue date: 2016-02-25 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior - CAPES / The present dissertation had as an objective to investigate how the professor?s selection occurs, within the Human Resource (HR), in an institution of Higher Education in Porto Alegre (RS). To this qualitative study, questionnaires were applied to 120 professors, they were sent by e-mail from the own institution, there were 12 responses received, two present interviews, one with a professional of HR and the other one with the principal of the institution, within different script. The qualitative dada were analyzed through the Discursive Textual Analysis methodology. Considering the got feedback in this research, the established initial objective as well, it was possible to notice that the RH field takes part in the teacher?s selection process and, not only the teacher but also the direction and the RH, know the stages and are involved in this process, with some disorders about the knowledge and participation of all the stages defined by the RH. The RH field, due to the fact that is compound of professional with specifics knowledge, has shown that it helps the other fields and the managers to identify the best candidates, to complete the interviews, and to have a more general view of the candidate, throughout some specifics tools it can get more personal information which contribute to an effective assertively on hiring teachers, as well. It was also possible to perceive by the reports that the RH guarantee the adaptation and admission of the teachers, with integration activities of this profession in the culture and in the values of the companies, those issues are identified by the teachers as a benefit of the selection with the RH contribution. However, there are still lacks regarding the range, because nor all the teachers that ingress in the institution join this activity, mainly the ones that enter in the middle of the year, due to the fact that the integration is not offered on the same way as it is in the beginning of the year. / A presente disserta??o teve como objetivo investigar como ocorre a sele??o de professores, com a participa??o do Recursos Humanos (RH), em uma Institui??o de Ensino Superior (IES) de Porto Alegre/RS. Para este estudo qualitativo, foram aplicados question?rios para 120 docentes, enviados por e-mail pela pr?pria institui??o, com retorno de 12 respostas, e duas entrevistas presenciais, uma com o profissional da ?rea de RH e outra com a diretora da institui??o, com roteiros diferentes. Os dados qualitativos foram analisados pela metodologia de An?lise Textual Discursiva. Considerando os resultados obtidos nesta pesquisa, bem como o objetivo estabelecido, foi poss?vel perceber que a ?rea de RH participa do processo de sele??o dos docentes e, tanto os docentes quanto a dire??o e o RH, conhecem as etapas e s?o envolvidos nesse processo, com algumas distor??es sobre o conhecimento e a participa??o em todas as etapas definidas pelo RH. A ?rea de RH, por ser composta de profissionais com conhecimentos espec?ficos, demonstrou que auxilia as demais ?reas e os gestores a identificar melhor os candidatos, realizando entrevistas, obtendo uma vis?o mais geral do candidato, bem como, com ferramentas espec?ficas, obter mais dados pessoais que contribuem para uma maior assertividade na contrata??o. Foi poss?vel perceber, pelas an?lises dos relatos, que o RH garante a adapta??o e ingresso dos docentes, com atividades de integra??o desses profissionais na cultura e nos valores da empresa. Essas quest?es foram identificadas pelos professores como benef?cios da sele??o com a contribui??o do RH. Por?m, ainda existem falhas com rela??o ? abrang?ncia, pois nem todos os professores que ingressam na institui??o participam dessa atividade, principalmente os que entram no meio do ano, pois este processo n?o ? oferecido da mesma forma que no in?cio do ano letivo.

Made available in DSpace on 2014-12-17T15:42:08Z (GMT). No. of bitstreams: 1 RosangelaCC_DISSERT.pdf: 3998203 bytes, checksum: f53c6aa79d4a6709116a504b71acbe98 (MD5) Previous issue date: 2013-05-17 / The aim of this study was to evaluate the potential of near-infrared reflectance spectroscopy (NIRS) as a rapid and non-destructive method to determine the soluble solid content (SSC), pH and titratable acidity of intact plums. Samples of plum with a total solids content ranging from 5.7 to 15%, pH from 2.72 to 3.84 and titratable acidity from 0.88 a 3.6% were collected from supermarkets in Natal-Brazil, and NIR spectra were acquired in the 714 2500 nm range. A comparison of several multivariate calibration techniques with respect to several pre-processing data and variable selection algorithms, such as interval Partial Least Squares (iPLS), genetic algorithm (GA), successive projections algorithm (SPA) and ordered predictors selection (OPS), was performed. Validation models for SSC, pH and titratable acidity had a coefficient of correlation (R) of 0.95 0.90 and 0.80, as well as a root mean square error of prediction (RMSEP) of 0.45?Brix, 0.07 and 0.40%, respectively. From these results, it can be concluded that NIR spectroscopy can be used as a non-destructive alternative for measuring the SSC, pH and titratable acidity in plums / O objetivo deste estudo foi avaliar a potencialidade da espectroscopia no infravermelho pr?ximo (NIRS) como um m?todo r?pido e n?o destrutivo para determina??o do teor de s?lidos sol?veis (TSS), pH e acidez titul?vel em ameixas intactas. Amostras de ameixa com teor de s?lidos sol?veis variando de 5,7 a 15%, pH de 2,72 a 3,84 e acidez de 0,88 a 3,6% foram adquiridas de supermercados em Natal - Brasil, e foram coletados espectros NIR no intervalo de 714-2500 nm. Uma compara??o de v?rias t?cnicas de calibra??o multivariada com rela??o ao pr?-processamento dos dados e algoritmos de sele??o de vari?veis, tais como m?nimos quadrados parciais por intervalos (iPLS), o algoritmo gen?tico (GA), algoritmo das proje??es sucessivas (SPA), e sele??o de previsores ordenados (OPS) foi realizada. Modelos de valida??o para o teor de s?lidos sol?veis, pH e acidez titul?vel tiveram um coeficiente de correla??o (R) de 0,95 a 0,90 e 0,80, bem como um erro m?dio quadr?tico de previs?o (RMSEP) de 0,45? Brix, 0,07 e 0,40%, respectivamente. A partir desses resultados, pode concluir-se que a espectroscopia NIR pode ser utilizada como uma alternativa n?o destrutiva para determina??o do teor de s?lidos sol?veis, pH e acidez em ameixas