Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2017-06-01T17:41:58Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 132780 bytes, checksum: aa2fa3f63a6e1b87bc5ed6a8d7b379d1 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-01T17:41:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 132780 bytes, checksum: aa2fa3f63a6e1b87bc5ed6a8d7b379d1 (MD5) Previous issue date: 2004-12-06 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / As espécies vegetais cultivadas apresentam ampla variação de comportamento, quando submetidas a condições extremas de ambiente (estresses). O melhoramento genético pode manipular essa variabilidade, visando ao desenvolvimento de variedades tolerantes a condições específicas de estresse. Para isso, é necessária a utilização de metodologia que permita uma avaliação clara dos fatores limitantes e das reações das plantas de milho a elas submetidas. Neste sentido, a Embrapa milho e sorgo (CNPMS), iniciou em 1986, um trabalho de seleção massal em um composto de milho, onde, após 15 ciclos de seleção recorrente foi realizado um experimento com objetivo de avaliar alguns desses ciclos quanto às alterações fisiológicas e os ganhos de seleção obtidos ao longo da seleção. Os materiais utilizados foram: os ciclos 1, 5, 9 e 15 da variedade de milho BRS 4154-Saracura, selecionada para condição de encharcamento intermitente do solo, BR 107 sensível ao encharcamento e o híbrido simples BRS 1010, escolhido por ser bastante cultivado no Brasil. As características fisiológicas avaliadas foram: fluorescência da clorofila, teor de clorofila, área foliar, porosidade de raiz e o teor de macro e micronutrientes. Avaliaram-se também, as características genéticas de produção: altura de planta e da inserção da espiga, número de fileiras de grãos, comprimento da espiga, índice da espiga, peso de 100 sementes, número de grãos por planta e peso de grãos. O delineamento experimental utilizado foi de blocos ao acaso com 4 repetições em esquema fatorial. Os resultados permitiram concluir que a porosidade de raiz foi o principal mecanismo de tolerância utilizado pelas plantas de milho em condições de encharcamento. A característica número de grãos por planta foi o componente de produção, no ambiente encharcado, de maior efeito isolado no peso de grãos. Desta forma, a seleção para número de grãos por planta resulta em aumento da produtividade. A seleção no ambiente encharcado proporcionou um ganho no peso de grãos do ciclo 1 para o ciclo 15. / The crop species present a wide variation of performance when cultivated under extreme conditions (stresses). Plant breeding can manipulate that variability, seeking to the development of tolerant varieties to specific conditions of stress. To accomplish that, it is necessary to use a methodology that allows a clear evaluation of the factors limiting plant development. In this regard, the Embrapa CNPMS, began in 1986, a work of mass selection in a composite variety of corn, where, after 15 cycles of selection an experiment was carried out with objective of evaluating some of those cycles with relationship to the physiological alterations and genetic progress obtained along the cycles. The used materials were: the cycles 1, 5, 9 and 15 of the corn variety BRS 4154- Saracura, selected for condition of intermittent flood of the soil, BR 107 sensitive to flooding and the single hybrid BRS 1010, chosen for being widely cultivated in Brazil. The appraised physiologic characteristics were: fluorescence of chlorophyll, chlorophyll level, leaf area, root porosity and the level of macro and micronutrients. They were also evaluated the traits associated with yield: plant height and of height of the ear of corn, number of rows in the cob, number of grains, length of the ear of corn, ear index, weight of 100 seeds, number of grains per plant and weight of grains. The used experimental design was random blocks with 4 repetitions in factorial outline. The results allowed to conclude that the root porosity was the main mechanism of tolerance to flood present in corn. The trait number of grains per plant was the yield component, in flooded environment, of larger isolated effect in the weight of grains. Therefore, the selection for number of grains per plant results in increase in yield. The selection under flooding provided gain for weight of grains from cycle 1 to cycle 15.

Submitted by Cleber Casali (clebercasali@ufv.br) on 2017-06-01T18:02:06Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 453678 bytes, checksum: 7001f1d3e25059ffa579718f498bf4f1 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-01T18:02:06Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 453678 bytes, checksum: 7001f1d3e25059ffa579718f498bf4f1 (MD5) Previous issue date: 2004-04-01 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / O objetivo deste trabalho foi avaliar o viés nas expressões de predição de ganho genético com seleção de plantas (capítulo 1) e de famílias de meios- irmãos (capítulo 2) em programas de melhoramento intrapopulacional. O estudo foi feito por meio de simulação, no qual, para seleção massal, foram considerados sistemas gênicos com um e 10 genes com distribuição independente. Para seleção de famílias foi considerado apenas sistema gênico de 10 genes. Foram consideradas três classes de população (muito melhorada, pouco melhorada e com freqüências intermediárias dos genes favoráveis), três valores de herdabilidade (10, 50 e 90%) e sete graus de dominância (2 e -2, 1 e -1, 0,5 e -0,5 e 0), sendo que com grau de dominância positivo o gene favorável é dominante e com grau de dominância negativo é recessivo. Foram considerados os 10 genes com as mesmas freqüências gênicas e com freqüências diferentes. Foram avaliados o viés percentual entre ganhos teórico e predito no primeiro ciclo de seleção massal e a correlação entre os mesmos ao longo de 10 ciclos de seleção, considerando as diferentes situações. Com seleção entre as famílias de meios-irmãos a pressuposição acerca da covariância aditiva entre indivíduo na unidade de seleção e seu parente na população melhorada foi a principal causa do viés, enquanto que com seleção massal o foi apenas nos casos de viés percentual baixo (inferior a 100%). Nas situações de elevado viés percentual (acima de 100%) a principal fonte de viés foi o uso de variância genotípica ou herdabilidade em sentido amplo no lugar de variância aditiva ou herdabilidade em sentido restrito, respectivamente. Com sistema gênico de 10 genes as expressões foram mais precisas que com sistema gênico de apenas um gene. Verificou-se que assumir ganho predito com seleção em ambos os sexos o dobro do ganho predito com seleção em apenas um sexo é apenas uma aproximação. Comparativamente à seleção após o florescimento, a seleção antes do florescimento aumentou o viés devido à pressuposição acerca da covariância aditiva entre indivíduo na unidade de seleção e seu parente na população melhorada e diminuiu o viés devido ao uso de variância genotípica ou herdabilidade em sentido amplo no lugar de variância aditiva ou herdabilidade em sentido restrito, respectivamente, e aumentou a média das correlações entre os dois ganhos. O aumento na proporção de selecionados aumentou consideravelmente a média do viés percentual e diminuiu a média da correlação entre os ganhos teórico e predito ao longo de 10 ciclos de seleção, mas apenas com o uso de variância genotípica ou de herdabilidade em sentido amplo (estimadas ou paramétricas). Com o uso de variância genotípica ou de herdabilidade em sentido amplo estimadas, comportamento semelhante foi observado com a redução no tamanho amostral. Viés de 30% na estimativa de variância ambiental aumentou o viés percentual entre ganhos teórico e predito apenas quando utilizados valores estimados de variância genotípica ou de herdabilidade em sentido amplo. Com seleção dentro de famílias e mesmas freqüências gênicas, o uso de variância genotípica ou herdabilidade em sentido amplo foi a principal fonte de viés, quando utilizados para predição do ganho genético valores paramétricos de variância ou de herdabilidade. Com freqüências diferentes, a pressuposição acerca da covariância aditiva entre indivíduo na unidade de seleção e seu parente na população melhorada é que foi a principal fonte de viés. Quando avaliadas as três fontes de viés juntas, tanto considerando mesmas freqüências gênicas como freqüências diferentes, a principal fonte de viés foi a pressuposição acerca da covariância aditiva entre indivíduo na unidade de seleção e seu parente na população melhorada. Com seleção dentro a magnitude do viés foi mais elevada que com seleção entre. / Aim of this study was to evaluate obliquity in expressions for the prediction of genetic gains due mass (chapter 1) and half-sib families selection (chapter 2) through intrapopulational improvement programs. Genetic systems with one and 10 genes of independent distribution for mass selection were simulated. Only the 10 gene system was admitted for family selection. Three population classes (strongly improved, slightly improved, and with intermediate frequencies of favorable genes), three heritability values (10, 50, and 90%) and seven dominance degrees (2 and -2, 1 and -1, 0.5 and -0.5, and 0) were taken into consideration. With a positive dominance degree, the favorable gene is dominant, and with a negative dominance degree it is recessive. 10 genes with equal and different genetic frequencies were focused on. The percentile obliquity between theoretical and predicted genetic gains in the first cycle of mass selection and the correlation between them along the 10 selection cycles were evaluated for the different situations. In the case of selection between half- sib families, the assumption in relation to additive covariance between an individual in the selection unit and its relative in the improved population was the main cause of obliquity, while in the case of mass selection this was only true when the obliquity percentage was low (below 100%). When it was high (above 100%), the main cause of obliquity was the use of genotypic variance or broad-sense heritability instead of additive variance or heritability in the restricted sense, respectively. Expressions were more precise in the genetic system of 10 genes than the one with only one gene. Assuming a predicted gain due selection in both sexes as twice the predicted gain with selection in only one sex is merely an approximation. Selection before compared to selection after flowering increased obliquity, owing to the supposition in relation to additive covariance between the individual in the selection unit and its relative in the improved population, and decreased obliquity because of the use of genotypic variance or broad-sense heritability instead of additive variance or restricted sense heritability, respectively, and increased the correlation means between both gains. An increased percentage of the selected plants increased the mean obliquity percentage considerably and diminished the correlation mean between the theoretical and predicted along 10 selection cycles though with the use of genotypic variance or broad-sense heritability (estimative or parametric) only. When genotypic variance or broad-sense heritability were used for estimates, a similar behavior was observed for a smaller sample size. A 30% obliquity in the environmental variance estimate increased the obliquity proportion between theoretical and predicted gains only when estimated values of genotypic variance or broad-sense heritability were used. In selection within families and with equal genetic frequencies, the use of the genotypic variance or broad-sense heritability was the main source of obliquity, when parametric values in variance or heritability was used for the prediction of the genetic gain. With different frequencies, the supposition expressing additive covariance between the plant in the selection unit and its relative in the improved population was main source of obliquity. Of the three obliquity sources evaluated together, both for equal and different genetic frequencies, main obliquity source was the assumption describing additive covariance between the plant in the selection unit and its relative in the improved population. Selection within increased the magnitude of obliquity in comparison to selection between.

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-06-02T16:26:54Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 197195 bytes, checksum: cf4ac1bed5ba3a43fddcf3f1807c57de (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-02T16:26:54Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 197195 bytes, checksum: cf4ac1bed5ba3a43fddcf3f1807c57de (MD5) Previous issue date: 2004-07-30 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Com os objetivos de elevar a produtividade e a capacidade de expansão (CE) da população de milho-pipoca Beija-Flor, em um programa de melhoramento intrapopulacional com progênies de meios-irmãos, de verificar a eficiência do processo de seleção entre famílias em dois ciclos de seleção recorrente, de estimar parâmetros genéticos da população e predizer os ganhos com seleção direta, indireta e com a utilização de índices de seleção, foram realizados dois testes de progênies, referentes ao 2o e 3o ciclos. Em cada teste foram avaliadas 196 famílias, obtidas a partir de dois lotes de recombinação, plantados em Ponte Nova, MG. Os testes foram instalados na Estação Experimental de Coimbra, MG. As progênies de meios-irmãos são provenientes da população de milho-pipoca Beija-Flor, de grãos de coloração amarela e formato pérola. Esta população é originária do Banco de Germoplasma do Programa de Melhoramento de Milho-Pipoca do Setor de Genética, do Departamento de Biologia Geral da Universidade Federal de Viçosa. Os dados obtidos nos dois ciclos foram utilizados para análises de variância e estimação de parâmetros genéticos, como variância genotípica entre famílias, variância aditiva, herdabilidade e correlação genética aditiva, visando avaliar o potencial da população para melhoramento e a eficiência da seleção entre e dentro de famílias. Verificou-se a existência de variabilidade genética nos dois testes de progênies, para vários caracteres, inclusive CE e produtividade. Em ambos verificou-se que a correlação genotípica entre CE e produção de grãos foi positiva (0,393 e 0,465), o que facilitou o processo seletivo. Os coeficientes de herdabilidade para CE e produção, nos ciclos de seleção, foram de baixa magnitude, fazendo com que o processo seletivo apresente eficiência em nível intermediário. Devido à seleção entre realizada com base nos testes, foram selecionadas as 20 melhores famílias para os lotes de recombinação. Para seleção das famílias superiores nos testes do 2o e 3o ciclos foi utilizado o índice de Mulamba e Mock, com os pesos 3 para CE e 1 para produção de grãos, pois foi o índice que levou aos melhores ganhos preditos. Verificou-se que a seleção entre e dentro de famílias de meios-irmãos foi eficiente para aumentar tanto a produtividade, quanto a CE da população. Os ganhos preditos estimados para o 1o e o 2o ciclos, para produção de grãos e CE, foram superiores aos realmente encontrados. A população Beija-Flor ciclo 2 apresentou valores de CE e produção de grãos próximos aos da variedade comercial Ângela, sendo que a produção de pipoca por hectare (l/ha) foi praticamente igual para as duas populações. Observou-se tendência de queda da variância genotípica entre famílias ao longo dos ciclos de seleção, para a maioria dos caracteres, inclusive produção de grãos e CE. / This study was carried out in order to: increase the productivity and expansion volume of the “Beija-Flor” popcorn population through an intrapopulation improvement program for half-sib progenies; verify the efficiency of the selection process among families at two recurrent selection cycles; estimate the genetic populational parameters; and to predict the gains provided by either direct and indirect selection, as well as by using the selection indexes. So, two progenies tests concerning to the 2nd and 3rd cycles were performed. In each test, a total of 196 families obtained from two recombination plots sown in an area at Ponte Nova county were evaluated. The tests were set up in Coimbra Experimental Station, MG. The half-sib progenies proceed from the “Beija-flor” popcorn population, that has yellow-colored and pearl-shaped kernels. This population comes from the Germplasm Bank of the Popcorn Improvement Program pertaining to the Genetics Sector of the General Biology Department. The data obtained in both cycles were used in variance analyses, as well as in the genetic parameter estimates such as the genotype variance among families, additive variance, heritability and additive genetic correlation in order to evaluate the potential of the population for the improvement and efficiency of the selection among and within families. Both tests showed the existence of variability for several characters, besides expansion volume and productivity. In addition, the genotype correlation between expansion volume and the kernel yield was shown to be a positive (0,393 and 0,465), which made easier the selective process. In the selection cycles, low-magnitude heritability coefficients were obtained for expansion volume and yield, therefore the selective process presented an intermediate efficiency level. Because the selective process was based on the tests, those twenty better families were selected for the recombination plots. To select the superior families in the tests of the 2nd and 3rd cycles, the Mulamba and Mock index was used with weights 3 for CE and 1 for kernel yield, since it was the index providing the best predicted gains. The selection among the half-sib families and within them showed to be efficient to increase so much the productivity and expansion volume of the population. The predicted gains estimated for the 1st and 2nd cycles of the kernel yield and expansion volume were superior to those really found. The values of expansion volume and kernel yield shown by the “Beija- Flor” population cycle 2 approximated to those of the commercial “Ângela” variety, as the popcorn yield for hectare (l/ha) was practically the same for both populations. A tendency for decreased genotype variance was observed in the families along the selection cycles for most characters, as well as for kernel yield and expansion volume.

Submitted by Nathália Faria da Silva (nathaliafsilva.ufv@gmail.com) on 2017-07-18T11:16:30Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 410609 bytes, checksum: 7fec8323c331702cef17f030fbf1eef4 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-07-18T11:16:30Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 410609 bytes, checksum: 7fec8323c331702cef17f030fbf1eef4 (MD5) Previous issue date: 2001-03-16 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Como o objetivo do melhoramento animal é o aumento da freqüência dos alelos favoráveis relacionados com características de importância econômica, os melhores indivíduos são selecionados, de forma a transmitir esses alelos favoráveis às gerações futuras. Para este objetivo, vários métodos de seleção foram propostos e aperfeiçoados, como a seleção individual, o índice de seleção e a seleção baseada na melhor predição linear não-viesada, BLUP. Porém, nos últimos anos, avanços observados na biotecnologia têm indicado revolução nas metodologias de seleção. Isto é feito pela seleção assistida por marcadores (MAS) e seleção por genes candidatos (CGS). Apesar da seleção ser importante ferramenta, o tempo e a necessidade de animais e laboratórios que aumentam os custos, se tornam fatores limitantes, dificultando a realização de alguns trabalhos. Assim, pesquisadores utilizam técnicas de simulação, permitindo a obtenção de grande volume de dados em um curto período de tempo, sem os elevados custos de animais e de laboratórios. Este trabalho visou verificar, na condição de dez marcas moleculares polimórficas, uma característica quantitativa de herdabilidade baixa (0,10), durante 20 gerações; os desempenhos dos métodos de seleções tradicionais (individual e baseada no BLUP), dos métodos de seleções moleculares (assistida por marcadores moleculares e por genes candidatos) e da combinação dos dois (associação da seleção individual e a assistida por marcadores), na tentativa de apresentar a superioridade dos métodos de seleção moleculares. Foi simulado um genoma (GENESYS 2000) composto de 200 locos. Seis populações-base de 1000 animais cada (500 machos e 500 fêmeas) foram criadas, a partir do mesmo genoma, com alterações nos efeitos aditivos (aleatórios no intervalo de –1,258 a 1,258, fixados nos valores -2 e 2 e fixado nos valores -5 e 5) dos genes próximos aos marcadores, e da transformação dos marcadores em candidatos. Para cada população base, foi construída uma população inicial, na qual teve início o processo de avaliação genética. Os parâmetros avaliados foram: ganho fenotípico, porcentagem de homozigotos, variância genética aditiva, porcentagem de alelos desfavoráveis e favoráveis fixados e limite de seleção. Com o uso do BLUP, obtiveram -se, para os três grupos de efeitos aditivos dos genes, os maiores ganhos fenotípicos, após as 20 gerações simuladas. À medida que se fixaram os valores dos efeitos aditivos moleculares dos (seleção genes, o assistida desempenho por dos marcadores métodos e seleção de seleção por genes candidatos), melhorou, sendo superior as respostas dos métodos de seleção tradicionais até a quinta geração. Em todas as respostas analisadas, as variâncias genéticas aditivas decresceram, sendo que, a maior queda foi observada quando foram usados métodos de seleção moleculares. Os resultados das porcentagens de locos fixados com alelos desfavoráveis e favoráveis, mostraram que os métodos de seleção moleculares foram semelhantes para os grupos de efeitos aditivos dos genes e superiores aos demais métodos tanto na fixação dos locos com alelos favoráveis quanto desfavoráveis. Conclui-se que os métodos de seleção tradicionais são melhores que os de seleção moleculares, durante 20 gerações, sem genes de grande efeito aditivo. Entretanto, aumentando o efeito aditivo dos genes, os métodos de seleção moleculares são as melhores opções até cinco gerações.

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-08-28T16:56:49Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1589900 bytes, checksum: 9ca3baa9021f7a1242de8d93242fd965 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-08-28T16:56:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1589900 bytes, checksum: 9ca3baa9021f7a1242de8d93242fd965 (MD5) Previous issue date: 2017-04-04 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / O Cerrado é a segunda maior província biogeográfica do Brasil e encontra- se largamente recoberto por formações campestres e savânicas. Pressões antrópicas são as principais causas de sua degradação, contribuindo para a perda de espécies vegetais e animais, a maior parte das quais ainda mal estudadas do ponto de vista de sua história natural. Geositta poeciloptera é uma ave campestre e endêmica do cerrado que vem sofrendo diminuição em sua população ao longo dos anos. A espécie nidifica em cavidades escavadas nos barrancos. Com o objetivo de compreender como se dá a seleção dos seus locais de nidificação e também de avaliar seu sucesso reprodutivo, foi realizado um estudo na região de São João del-Rei (Campos do Alto Rio Grande) entre os anos de 2014 e 2016. Para isso foram coletadas amostras de solo próximos aos ninhos e também em locais que não continham ninhos. O horizonte C do solo foi o de maior preferência para a construção dos ninhos, o que se deve aos altos teores de silte e baixos teores de argila, facilitando o processo de escavação. A resistência do solo à penetrabilidade afetou as características físicas do ninho, sendo eles mais rasos onde os solos são mais resistentes. Também foram feitas medidas das características dos ninhos, sendo coletados dados de: (1) profundidade da cavidade do ninho; (2) altura e largura do orifício de entrada da cavidade (área do orifício); (3) distância da base do barranco até a entrada da cavidade do ninho; e (4) orientação da direção da cavidade do ninho. Foram então verificadas quais dessas variáveis interferem no sucesso reprodutivo da espécie, utilizando-se para isso o programa Mark com a abordagem de sobrevivência de ninhos. A taxa de sobrevivência diária (0.984) calculada se mostrou alta em relação à outras aves campestres e a predação foi a maior causa de perda de ninhos, os quais apresentam uma probabilidade de sobreviverem individualmente por um ciclo completo de 0,59. A espécie possui grande especificidade na escolha dos locais de nidificação e o fato de construir ninhos em cavidade contribui significativamente para seu sucesso reprodutivo. Este estudo, além de representar a primeira investigação detalhada acerca da biologia reprodutiva de um membro da família Scleruridae, revela importantes características da história de vida de G. poeciloptera, as quais serão fundamentais para a elaboração de programas voltados para o manejo e conservação desta espécie ameaçada. / The Cerrado is the second largest biogeographic province in Brazil and is largely covered by grassland and savanna formations. Anthropogenic pressures are the main causes of their degradation, contributing to the loss of plant and animal species, most of which still poorly studied from the point of view of their natural history. The Campo Miner Geositta poeciloptera is a grassland bird endemic to the Cerrado, which has suffered marked population decline over the years. The species breeds in cavity-nests excavated in dirt banks. We aimed to understand how the species selects its nesting sites and to evaluate their reproductive success. The study was conducted in the municipality of São João del-Rei, located in the Upper Rio Grande Grasslands, from 2014 to 2016. We first measured the following nest attributes: (1) tunnel depth; (2) height and width of the entrance hole (area); (3) distance from the entrance hole to the base of the dirt bank; and (4) orientation of the entrance of the cavity hole. We then collected soil samples adjacent to the nests and in sites that did not contain nests, also measuring soil resistance to penetrability in each of these sites. The soil C horizon was the most preferred for nest excavation, what is due to its high silt and low clay contents, thus facilitating excavation. Soil resistance to penetrability affected the physical characteristics of the nest, being shallower where the soils are more resistant. We then verified which of these variables affected the reproductive success of the species using the Mark program with the nests survival approach. The daily survival rate (0.984) was high compared to that exhibited by other grassland birds, and predation was the major cause of nest loss. Individual nests had a probability of 0.59 of surviving for a complete cycle. The species has great specificity in the choice of nesting sites and its cavity-nest seems to significantly contribute to its reproductive success. This study, besides representing the first detailed investigation about the reproductive biology of a member of the family Scleruridae, reveals important features of the life history of G. poeciloptera, which will be fundamental for the elaboration of management and conservation programs to this threatened species.

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2018-02-27T12:55:35Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1014245 bytes, checksum: bc632c2f8df9dc848814b664d9b50984 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-02-27T12:55:35Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1014245 bytes, checksum: bc632c2f8df9dc848814b664d9b50984 (MD5) Previous issue date: 2018-02-02 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / A principal contribuição da genética molecular no melhoramento é a utilização direta das informações de DNA no processo de identificação de indivíduos geneticamente superiores. Sob esse enfoque, idealizou-se a seleção genômica ampla (Genome Wide Selection – GWS), a qual consiste no uso de um grande número de marcadores SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms) amplamente distribuídos no genoma para predizer o mérito genético de indivíduos. Diversas abordagens estatísticas foram propostas para a predição de valores genéticos permitindo estimar os efeitos dos marcadores com base apenas na média condicional da variável dependente. Uma metodologia ainda pouco explorada em GWS é a regressão quantilica (RQ). Diferentemente das outras metodologias, a RQ permite avaliar os fenótipos de interesse em diferentes níveis da distribuição. Desta forma, este trabalho tem como objetivo apresentar duas aplicações de GWS utilizando a RQ. Na primeira aplicação foi proposto e avaliado o uso da Regressão Quantílica Regularizada (RQR) para estimar os efeitos marcadores SNPs para curvas de crescimento em suínos. O modelo proposto permitiu a descoberta, em diferentes níveis de interesse (quantils), de marcadores relevantes para cada característica e suas respectivas posições cromossômicas. Além disso, RQR permitiu a construção de curvas de crescimento genômico, que identificaram indivíduos geneticamente superiores em relação à eficiência de crescimento. Na segunda aplicação utilizou-se a RQR para predizer valores genéticos de conjuntos de dados simulados com diferentes proporções de epistasia na variância genética e valores fenótipos com distribuições simétrica e assimétrica a direita. Neste trabalho verificou-se que a RQR teve, em geral, maiores acurácias do que as outras metodologias avaliadas quando a característica é de baixa herdabilidade. Além disso, quando tem-se 100% da variância genética como sendo epistática, a RQR foi, na maioria dos casos, melhor do que os métodos tradicionais. Desta forma, avaliando as duas aplicações apresentadas, tem-se que a RQR é uma alternativa interessante em estudos de GWS, uma vez que possibilita a descoberta do modelo que melhor representa a relação entre as variáveis dependentes (fenótipos) e independentes (efeitos dos marcadores) aumentando o desempenho preditivo do modelo. / The main contribution of molecular genetics in breeding is the direct use of DNA information in the process of identifying genetically superior individuals. Under this approach, Genome Wide Selection (GWS) was idealized and consists of the use of a large number of single nucleotide polymorphisms (SNPs) widely distributed in the genome to predict the genetic merit of individuals. Several statistical approaches have been proposed for the prediction of genetic values, however they allow estimating the effects of the markers based only on the conditional mean of the dependent variable. A methodology not yet explored in GWS is quantile regression (QR). Differently from the other methodologies, the QR allows to evaluate the phenotypes of interest in different levels of the distribution. In this way, this work aims to present two applications of GWS using QR. In the first application, the Regulated Quantile Regression (RQR) was proposed and evaluated to estimate the marker effects SNPs for growth curves in pigs. The proposed model allowed the discovery, in different levels of interest (quantiles), of more relevant markers for each trait and their respective chromosomal positions. In addition, RQR allowed the construction of genomic growth curves, which identified genetically superior individuals in relation to growth efficiency. In the second application, the RQR was used to predict genetic values of simulated datasets with different proportions of epistasis in genetic variance and phenotype values with symmetric and positive asymmetric distributions. In this work it was verified that the RQR had, in general, greater accuracies than the other methodologies evaluated when the trait is low heritability. Furthermore, when 100% of the genetic variance is epistatic, RQR was, in most cases, better than traditional methods. Thus, RQR is an interesting alternative in GWS studies, since RQR allows the discovery of the model that best represents the relationship between the dependent (phenotype) and independent (markers effects) increasing the predictive performance of the model.

ALVES, Maria Monique de Araújo. Caracterização morfofisiológica de genótipos de Urochloa mosambicensis como subsídio para programas de melhoramento vegetal. 2016. 57 f. Dissertação (Mestrado em Zootecnia)-Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2016. / Submitted by Aline Mendes (alinemendes.ufc@gmail.com) on 2016-08-08T19:39:36Z No. of bitstreams: 1 2016_dis_mmaalves.pdf: 1359551 bytes, checksum: e84993bcea957bcc431a66dccde3121f (MD5) / Approved for entry into archive by José Jairo Viana de Sousa (jairo@ufc.br) on 2016-08-16T16:35:31Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2016_dis_mmaalves.pdf: 1359551 bytes, checksum: e84993bcea957bcc431a66dccde3121f (MD5) / Made available in DSpace on 2016-08-16T16:35:31Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2016_dis_mmaalves.pdf: 1359551 bytes, checksum: e84993bcea957bcc431a66dccde3121f (MD5) Previous issue date: 2016 / Thirteen genotypes of Urochloa mosambicensis were characterized for morphogenic indices and evaluated for characteristics and structural components of each genotype. The accessions were exchanged from the active germplasm bank in seedlings and transplanted into pots. The experiment was conducted in a greenhouse from February to December 2014 in a randomized design with two repetitions (pots). Biomass flow was estimated during the regrowth period and thereupon it was measured the structural characteristics and components of biomass. Data were subjected to the Shapiro-Wilk and Bartlett tests, and it was applied base 10 logarithmic transformations for variables leaf elongation rate and previous leaf senescence rate. Mean values of biomass flow were tested by Tukey’s test and structural characteristics were tested by Kruskal-Wallis test, differences were considered significant at P <0.05. From the characterization, we selected the most important variables in the selection of genotypes and stood out Aust81 and Aust99P1 genotypes that were considered as the most productive to use grazing because of the highest average for the leaf elongation rate, leaf appearance rate and new green leaves. The Aust103 and Aust59P1 were considered as the most productive for use to cut, as they kept the lowest stem elongation rate and the higher total forage biomass and green leaf biomass, which is the most important component of biomass and preferably selected by the animals, reflecting positively on forage quality. With the exception of Aust99P1, all the genotypes above had the highest leaf:stem ratio, stressing that it accesses produced forage of better quality and probably the best nutritional value. The accession Aust59P1 was the most persistent genotype as it maintained the highest average for tillering that has great potential for the issuance of new tillers ensuring the pasture persistence. Considering all characteristics, it is recommended to further study the accessions Aust81, Aust103, Aust59P1 and Aust99P1. / Caracterizaram-se treze genótipos de Urochloa mosambicensis, quanto aos índices morfogênicos e avaliaram-se as características e componentes estruturais de cada genótipo. O experimento foi conduzido em casa de vegetação durante os meses de fevereiro a dezembro de 2014 em delineamento inteiramente casualizado com duas repetições. O fluxo de biomassa foi avaliado durante o período de rebrotação e logo após mensurou-se as características estruturais e componentes da biomassa. Os dados foram submetidos aos testes de Shapiro-Wilk e Bartlett, e aplicaram-se transformações logarítmicas de base 10 para as variáveis taxa de alongamento foliar e taxa de senescência foliar anterior. Aplicou-se o teste de Tukey para a comparação dos pares de médias das características do fluxo de biomassa e para as características estruturais o teste Kruskal-Wallis, com as diferenças declaradas significativas quando P<0,05. A partir da caracterização selecionaram-se as variáveis de maior impacto na seleção de genótipos e destacaram-se os genótipos Aust81 e Aust99P1 que foram classificados como mais produtivos para uso sob pastejo por terem apresentado as maiores médias quanto a taxa de alongamento foliar, taxa de aparecimento foliar e novas folhas vivas. Os acessos Aust103 e Aust59P1 foram considerados como os mais produtivos para uso sob corte, pois mantiveram as menores médias em relação à taxa de alongamento de hastes e as maiores produções de biomassa de forragem total principalmente da biomassa de lâmina foliar verde que é a fração mais importante da planta e preferencialmente selecionada pelos animais refletindo positivamente na qualidade da forragem produzida. Com exceção do Aust99P1 todos os genótipos supracitados destacaram-se no quesito qualidade, pois apresentaram as melhores relações lâmina foliar/colmo, frisando que estes acessos produziram forragem de melhor qualidade e provavelmente de melhor valor nutricional. O acesso Aust59P1 mostrou-se o genótipo mais persistente ao manter a maior média para a densidade populacional de perfilhos, mostrando que possui grande potencial para emissão de novos perfilhos, garantindo a persistência da pastagem. Considerando-se todas as características avaliadas, recomenda-se para estudos posteriores os acessos Aust81, Aust103, Aust59P1 e Aust99P1.

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2016-04-20T11:09:12Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 251735 bytes, checksum: 16d64bae7a029b52e0a18d65b3abc040 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-04-20T11:09:12Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 251735 bytes, checksum: 16d64bae7a029b52e0a18d65b3abc040 (MD5) Previous issue date: 2016-02-16 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / O Brasil é um país de clima tipicamente tropical e, por isso, apresenta uma considerável diversidade de espécies capaz de produzir óleo, como a macaúba (Acrocomia aculeata). Por ser uma cultura incipiente, têm-se poucos estudos genéticos relacionados à produção de óleo. Assim, o objetivo deste trabalho foi estimar os parâmetros relacionados ao controle genético dos caracteres físicos dos frutos, teor e produção de óleo, inferir sobre a diversidade genética, realizar o agrupamento e proceder à seleção dos acessos de macaúba. Frutos de 44 acessos de macaúba do banco ativo de germoplasma foram colhidos e levados ao laboratório de pós-colheita da Universidade Federal de Viçosa, para avaliação da: massa seca (g) da casca, polpa, endocarpo e amêndoa, teor de óleo e produção de óleo por planta. As estimativas das herdabilidades individuais no sentido restrito foram consideradas de média magnitude para todas as características avaliadas. O coeficiente de repetibilidade e a acurácia na seleção de famílias, para todas as características, foi de alta magnitude e a produção de óleo por planta apresentou o maior coeficiente de variação genética individual (77,16%). Dos 10 primeiros indivíduos selecionados pelo BLUP individual, houve uma contribuição de 5 acessos diferentes (8, 37, 49, 43, 26), sendo que os cinco melhores indivíduos para o caráter produção de óleo por planta, pertence à família do acesso 8, com destaque para o acesso 8 planta 7. O agrupamento genético dos 44 acessos, estabelecidos pelo método Tocher, baseado na distância euclidiana média, permitiu a formação de 11 grupos. O índice de média de ranks de Mulamba e Mock permitiu classificar os acessos em ordem favorável a seleção, considerando todas as características avaliadas, sendo que os acessos selecionados 43, 8, 37, 35 e 6 destacaram nas primeiras posições. / Brazil is a typical tropical climate country and, therefore, presents a considerable diversity for species capable of producing oil, such as macaw palm (Acrocomia aculeata). Few genetic studies related to oil production for this species are available, since it is an incipient crop. Thus, the main of this study was estimating genetic parameters related to genetic control of physical traits in fruits, quantifying content and oil production, inferring genetic diversity by cluster analysis and selecting macaw palm accessions. Fruits from 44 macaw palm accessions of the active germplasm bank were collected and transferred to postharvest laboratory in Universidade Federal de Viçosa, evaluating the following traits: dry mass (g) of the exocarp, mesocarp, endocarp and kernel, and oil content and production per plant. Estimated individual narrow sense heritability were classified as moderate magnitude for all traits. Coefficient of repeatability and accuracy for progenies selection were considered high magnitude for all traits and plant oil production presented the highest individual genetic variation coefficient (77.16%). Five distinct accessions (8, 37, 49, 43, 26)contributed among the first ten selected by the individual BLUP, however, the top five individuals for oil production belongs to accession 8 family, standing out the individual 7 from accession 8. The genetic cluster for the 44 accessions, performed by Tocher method based on average Euclidian distance, resulted in 11 groups formation. Mulamba and Mock average rank index allowed classifying accessions to favorable selection sequence, considering all traits evaluated, and the following accessions 43, 8, 37, 35 and 6 standed out in the top positions.

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2016-05-02T12:57:37Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 2201123 bytes, checksum: 743a7c3f7ac02c7be145088d97a8bf5b (MD5) / Made available in DSpace on 2016-05-02T12:57:37Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 2201123 bytes, checksum: 743a7c3f7ac02c7be145088d97a8bf5b (MD5) Previous issue date: 2015-07-27 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / O objetivo deste trabalho foi avaliar a eficácia da seleção recorrente fenotípica, pelo diâmetro do hipocótilo, no melhoramento da arquitetura de plantas do feijoeiro. A população base (ciclo zero – C 0 ) foi constituída por 20 populações selecionadas a partir de 48 híbridos F 1 ’s, com base em cruzamentos em esquema de dialelo parcial (6 x 8) entre 14 linhagens de feijoeiro. A população do primeiro ciclo de seleção recorrente (ciclo um – C 1 ) foi formada a partir da recombinação das plantas F 2 do ciclo C 0 que apresentaram os maiores diâmetro de hipocótilo. As 20 populações do ciclo C 0 foram recombinadas em esquema de dialelo circulante, utilizando como unidade de recombinação quatro plantas oriundas de sementes F 3 das quatro plantas que apresentaram os maiores diâmetros de hipocótilo de cada população do ciclo C 0 . Assim, foram obtidas 20 populações do ciclo C 1 . As 20 populações do ciclo C 0 e as 20 populações do ciclo C 1 foram avançadas até a geração F 4 , quando foram avaliadas em um mesmo experimento, juntamente com nove testemunhas na safra da seca de 2013. As populações foram avaliadas, em nível de plantas individuais, quanto ao diâmetro do hipocótilo e a produção de grãos; e em nível de parcela, quanto à nota de arquitetura de plantas e a produtividade de grãos. Na geração F 2 de cada uma das populações dos ciclos C 0 e C 1 foram selecionadas as 19 plantas de maior diâmetro do hipocótilo para avaliação de suas progênies, totalizando em 380 progênies do ciclo C 0 e 380 progênies do ciclo C 1 . As gerações F 2:3 e F 2:4 das 380 progênies do ciclo C 0 foram avaliadas, respectivamente, nas safras do inverno de 2011 e da seca de 2012. Já as avaliações das gerações F 2:3 e F 2:4 das 380 progênies do ciclo C 1 foram realizadas, respectivamente, nas safras do inverno de 2012 e da seca de 2014. As 380 progênies dos ciclos C 0 e C 1 foram avaliadas juntamente com 13 testemunhas. As características avaliadas foram nota de arquitetura de plantas, produtividade de grãos e aspecto comercial de grãos tipo carioca. Os dados obtidos a partir das populações e das progênies foram utilizados na estimação do progresso genético do programa de seleção recorrente fenotípico baseado no diâmetro do hipocótilo. Observou-se estimativas de progresso genético para notas de arquitetura de plantas de 4,93%, com base na avaliação das populações, e de 1,79%, com base na avaliação das progênies. Também houve ganho para diâmetro do hipocótilo na avaliação das populações (4,95%), indicando associação desta característica com arquitetura mais ereta de plantas. Observou-se que entre as dez populações que apresentaram maiores probabilidades de extração de linhagens superiores quanto à arquitetura, oito foram do ciclo C 1 e apenas duas do ciclo C 0 . Assim, conclui-se que a seleção fenotípica por meio do diâmetro do hipocótilo é eficaz no melhoramento da arquitetura do feijoeiro. / The objective of this study was to evaluate the efficacy of phenotypic recurrent selection, by hipocotyl diameter in the improvement of bean plant architecture. The base population (cycle zero - C 0 ) was composed of 20 populations selected from 48 F 1 ’s hybrids, based on partially cross dialel design (6 x 8) between 14 beans lines. The population of the first recurrent selection cycle (cycle one - C 1 ) was formed from recombination of the C 0 cycle F 2 plants that showed the highest hipocotyl diameter. The 20 populations of C 0 cycle were crossed in diallel circulating design, using as recombination unit four plants from F 3 seeds of the four plants that had the highest hypocotyl diameters of each population of C 0 cycle. Thus, it was obtained 20 populations of the C 1 cycle. The 20 populations of the C 0 cycle and C 1 cycle of 20 populations were advanced until F 4 generation, when they were evaluated in the same experiment together with nine checks in the drought season of 2013. The populations were evaluated at the level of individual plants, about the hypocotyl diameter and grain yield ; and plot level, about the architecture note of plants and grain yield. In the F 2 generation of each population of cycles C 0 and C 1 were selected the 19 plants of larger hypocotyl diameter to evaluate their progeny, totaling 380 progenies of C 0 cycle and 380 progenies of C 1 cycle. The generations F 2:3 and F 2:4 of 380 progenies of C 0 cycle were evaluated, respectively, in the winter seasons 2011 and in the drought season 2012. Already evaluations of generations F 2:3 and F 2:4 of 380 progenies C 1 cycle were, respectively, in the winter season 2012 and the drought season 2014. The 380 progenies of C 0 and C 1 cycles were evaluated together with 13 witnesses. The characteristics evaluated were note of plant architecture, grain yield and commercial aspect of carioca grain beans. The data obtained from the populations and progenies were used to estimate the genetic progress of phenotypic recurrent selection program by hypocotyl diameter. It was observed genetic progress for notes of architecture plants of 4.93%, based on the evaluation of populations, and 1.79%, based on the evaluation of the progenies. There were also gains for hypocotyl diameter in evaluation of the populations (4.95%), indicating association of this feature with architecture more erect of plants. We observed that between ten populations that have higher probabilities of extraction higher lines about the architecture, eight were in the C 1 cycle and only two of the C 0 cycle. Thus, we concluded that the phenotypic selection by hypocotyl diameter is effective in improving bean architecture.

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2016-06-22T11:48:07Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 326632 bytes, checksum: 2821938b75714891360bb0a69bd920bd (MD5) / Made available in DSpace on 2016-06-22T11:48:07Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 326632 bytes, checksum: 2821938b75714891360bb0a69bd920bd (MD5) Previous issue date: 2016-02-22 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / A maioria das cultivares de feijão recomendadas no Brasil tem ciclo de aproximadamente 90 dias, portanto esta cultura já é considerada de ciclo curto. Contudo, cultivares mais precoces têm tornado-se importantes, especialmente na safra do outono/inverno, quando o feijão é cultivado na entressafra em sucessão às culturas da safra normal e da safrinha. O objetivo geral do trabalho foi estabelecer um programa de seleção recorrente fenotípica visando obter linhagens de feijão de grãos tipo carioca, precoces e com alto potencial de produção. Como objetivos específicos apontam-se: identificar genitores e populações segregantes com potencial para gerar tais linhagens e estimar o progresso genético de um ciclo de seleção recorrente para precocidade, com base no número de dias da emergência ao florescimento (DEF). Para a formação da população base (C0), visando o programa de seleção recorrente, nove linhagens de feijão foram cruzadas em esquema dialélico parcial (4x5), em que o grupo I foi composto por quatro linhagens precoces e o grupo II por cinco linhagens elites de grãos tipo carioca. As gerações F 1 , F 2 , F 3 e famílias F 3:5 do ciclo C0, bem como as gerações F 2 e F 3 do ciclo C1 foram avaliadas em Coimbra, MG, no delineamento de blocos casualizados, com três repetições. As características avaliadas foram: dias decorridos da emergência ao florescimento (DEF) e produtividade de grãos (PROD). O progresso genético foi estimado com base na avaliação das populações segregantes, gerações F 2 e F 3 . Com base na análise dialélica, a linhagem Goiano Precoce se destacou para precocidade, enquanto que RP1 e VC33 para produtividade de grãos. A população RP1/Goiano Precoce foi a mais promissora em gerar linhagens precoces, de grãos tipo carioca e alto potencial produtivo. Esta apresentou efeito negativo e significativo de CEC, tem Goiano Precoce como genitor com CGC de mesma magnitude para DEF e 13,57% de probabilidade de gerar linhagens superiores em rendimento de grãos. O ganho genético com um ciclo de seleção para florescimento precoce foi de 8,20% e 15,23%, quando se considerou as informações das gerações F 2 e F 3 , respectivamente. Para produtividade de grãos, o ganho genético foi negativo, indicando que a seleção e recombinação com base na precocidade levaram à redução na produtividade. / Most bean cultivars recommended in Brazil has cycle approximately 90 days, so this culture is already considered short cycle. However, most early cultivars have become important, especially in the autumn/winter season, when the beans are grown in the off season in succession to cultures of normal growing season and off-season. The overall objective was to establish a phenotypic recurrent selection program to obtain bean lines carioca beans, early and high production potential. As specific objectives, identify parents and segregating populations with the potential to generate such lineages and estimate the genetic progress of a recurring cycle of selection for earliness based on the number of days from emergence to flowering (DEF). For the formation of the base population (C0) targeting the recurrent selection program, nine bean lines were crossed in partial diallel (4x5), in the group I was composed by four early lines and group II by five strains elite beans carioca. F 1 , F 2 , F 3 and families F 3: 5 C 0 cycle as well as the F 2 and F 3 from cycle C 1 were evaluated in Coimbra, MG, in a randomized block design with three replications. The characteristics evaluated were: days elapsed from emergence to flowering (DEF) and grain yield (PROD). Genetic progress has been estimated based on the evaluation of segregating populations, F 2 and F 3 . Based on the diallel analysis, Goiano Precoce line stood out for precocity, while RP1 and VC33 for grain yield. The RP1/Goiano Precoce population was the most promising in generating early strains of carioca type grains and high yield potential. This had a negative and significant effect of CEC, has Goiano Precoce as parent with CGC of the same magnitude for DEF and 13.57% probability of generating superior strains on grain yield. The genetic gain from a selection cycle for early flowering was 8.20% and 15.23%, when it considered the information of F 2 and F 3 , respectively. For grain yield, the genetic gain was negative, indicating that the selection and recombination based on precocity led to a reduction in productivity.