This paper analyses the South African trade data from1992 until 2006 by means of a Grubel-Lloyd index, a measurement of marginal intra-industry trade and a revealed comparative advantage (RCA) indicator. During this period a lot happened that influenced the South African trade policy, e.g. the political transition in 1994, the formation of the World Trade Organisation in 1995, the rise of China as trading power, etc. The purpose is not only to analyse the current structure of South African trade, but also to examine its structural change over time. As a result this paper shows that South Africa is principally a supplier of natural resources to both industrialised and emerging economies. With respect to its African neighbours South Africa has a more advantageous trading position. More general this paper shows that an indicator reaches significant different values, if different trading partners or industries are analysed.(author´s abstract) / Series: Department of Economics Working Paper Series

Our world is changing rapidly and factors like urbanisation, changed agricultural practices and climate change are causing losses in butterfly diversity. It is therefore of importance to understand the source of their diversity. Given the remarkable diversity of herbivorous insects compared to their non-herbivorous sister groups, changes in host use have been implicated as a promoter of speciation. This thesis looks at geographical aspects of host range evolution and the plasticity of host use. We show that butterflies in the subfamily Nymphalinae that feed on a wide range of host plants have larger geographic ranges than species with narrower host ranges. Although tropical butterflies appear to be more specialised than temperate species, this effect is lost when controlling for the differences in geographic range. Geographic variation in host plant use within Polygonia faunus, related to morphologically distinct subspecies, did not show any genetic differentiation. This suggests that the observed variation in host plant use is a plastic response to environmental differences. Reconstructing host use for the Polygonia-Nymphalis and Vanessa group shows that plasticity is also important for understanding host use at the level of butterfly genera. Using unequal transition costs and including larval feeding ability revealed that frequent colonisations of the same plant genus can often be explained by non-independent processes, such as multiple partial losses of host use, recolonisation of ancestral hosts, and parallel colonisations following a preadaptation for host use. These processes are further reflected in the conservative use of host plant orders within the butterfly family Nymphalidae. Few taxa feed on more than one host plant order, and these expansions occur at the very tips of the tree, which we argue is evidence of the transient nature of generalist host use. These insights improve our understanding of how host range evolution may promote diversification. / At the time of the doctoral defence,the following papers were unpublished and had a status as follows: Paper 3: Submitted; Papers 4 and 5: Manuscripts

The genus Torymus (Chalcidoidea: Torymidae) has very diversified parasitic strategies and adaptations to its hosts. Its larvae are ectoparasitoids and attack mostly larvae of various gall wasps (Hymenoptera: Cynipidae) and gall midges (Diptera: Cecidomyiidae). However, few species prefer also other insect groups as a host or are even phytophagous. Many hypotheses concerning evolution of insect host associations were published, but have not been satisfactorily tested using parasitic insects as a model. In this thesis I studied coevolution of the genus Torymus and its hosts. The main questions are what kind of host shifts occurred during the evolution of host strategies and whether sister species of parasitoids are specific to the related hosts/or nonrelated hosts living in the same type of habitat. I also studied changes at morphological adaptations to its hosts. To test critically these hypotheses, I constructed phylogenetic tree of selected Torymus species based on 5 genes and compared their host association within and between clades of Torymus. Key words: Torymus, Chalcidoide, parasitoid, phylogeny, host specialisation

L'évolution est-elle prédictible? Alors que la réponse habituelle est un non presque unanime, un corpus croissant de connaissances suggère qu'il est temps de revoir cette réponse. Même si les mutations sont toujours considérées comme aléatoires, la détection de patterns génétiques sous-jacents aux événements évolutifs ouvre la porte sur des stratégies potentielles permettant de prévoir les trajectoires évolutives suivies par les organismes lorsqu'ils s'adaptent à des contraintes changeantes. Quand les organismes subissent une spécialisation fonctionnelle (à travers la perte de gènes et de fonctions) pour s'adapter à des signaux environnementaux donnés, les trajectoires évolutives possibles qu'ils peuvent emprunter sont restreintes et devraient donc être plus facilement prévisibles. Dans ce contexte d'évolution réductive par spécialisation, les objectifs de cette thèse sont de mieux comprendre l'interaction entre contraintes environnementales, métabolisme, évolution génétique et adaptations fonctionnelles, et dans un deuxième temps de prédire, pour des contraintes données, les trajectoires évolutives qui seront suivies par les organismes pour s'adapter à ces contraintes. Une première approche met l'accent sur l'importance des interactions biotiques en tant que déterminants des trajectoires évolutives, et comment, en modélisant une hausse bénéfique de dépendance envers un bien commun, il est possible de prédire la dynamique d'une population subissant de tels évènements évolutifs. Une deuxième approche étudie comment les changements observés au niveau métabolique et fonctionnel et engendrés par des modifications de contraintes environnementales pourraient être prévus et testés. Sur la base d'une vision centrée sur le métabolisme, des travaux de modélisation et des travaux d’expérimentions ont été combinés pour étudier l'évolution de la spécialisation aux niveaux génétiques, métaboliques et fonctionnels. Nous montrons que les trajectoires évolutives suivies peuvent-être partiellement prédites en fonction de conditions environnementales spécifiques, mais que ces prédictions sont limitées en raison de la complexité du réseau de l'expression génétique. Ce travail exploratoire et interdisciplinaire augmente les connaissances sur les déterminants évolutifs et les trajectoires suivies par l'organisme au cours d’un phénomène de spécialisation. Il démontre également un grand potentiel de prédiction, notamment grâce à une perception métabolique des systèmes. / Is evolution predictable? While the usual response is an almost unanimous No, a growing corpus of knowledge suggests it is time to seriously revisit this answer. Even though mutations are still assumed to be random, the detection of genetic patterns underlying evolutionary events opens the door on potential strategies to forecast the evolutionary trajectories followed by organisms when they adapt to changing constraints. When organisms undergo functional specialization (through genes and function loss) to adapt to given environmental cues, the possible evolutionary paths they can take are restrained and should thus be more easily predictable. In this context of reductive evolution through specialization, the objectives of this thesis are to understand better the interaction between environmental constraints, metabolism, genetic evolution and functional adaptations, and in a second time to predict, for given environmental constraints, the evolutionary trajectories which will be followed by organisms to adapt to these constraints. A first approach focuses on the importance of biotic interactions as being determinants of evolutionary trajectories, and how by modelling a beneficial rise of dependency on a common good, we could predict the dynamic of a population undergoing such evolutionary events . A second approach investigates how changes entailed in metabolisms and functions by a change in environmental constraints could be forecast and tested. Based on a metabolic-centered view, we combined modelling and experimental work to encompass the evolution of specialization at the genetic, metabolic and functional levels. We show that evolution trajectories can partially be predicted according to specific environmental conditions, but that these predictions are limited due to the intricacy of the genetic expression network. This exploratory and interdisciplinary work increases the knowledge on evolutionary determinants and trajectories followed by organism during specialization. It also demonstrate a great potential for predictions, notably through a metabolic perception of the systems.

The vertical cliff-face habitat is renowned for many specifically adapted plant species that exhibit a high degree of local endemism. Over a period of nine years the succulents and bulbous succulents on cliff faces in South Africa and Namibia were systematically surveyed and documented. Distinction was made between succulents growing on cliffs as part of a wider habitat and those found only on cliffs (obligate cremnophytes). Most major cliff-face habitats in the study area were visited and all plants were documented. A check list and descriptions (including adaptive traits) of the 220 obligate cremnophilous taxa are provided. During the study some 45 new cremnophilous succulent taxa were discovered and named, representing almost 20% of the total and proving that cliff habitats are some of the least studied environments, not only in southern Africa but globally. Among the newly described cremnophilous taxa is the genus Dewinteria (Pedaliaceae). Using stem length, three basic cliff-face growth forms are identified - compact or cluster-forming ‘cliff huggers’, cliff shrublets or ‘cliff squatters’ and pendent ‘cliff hangers’. Compact growth (often tight clusters or mats) is mainly associated with the winter-rainfall Succulent Karoo and Thicket regions, especially Namaqualand. However, further north the same compact growth forms are associated with an increase in altitude such as the Drakensberg Escarpment and other northern mountains. Most pendent growth forms are associated with the eastern and southeastern summer-rainfall regions; a number of smaller pendent shrublets occur on the high quartzitic sandstone mountains of the Western Cape. The degree of specialisation varies from highly adapted (smaller percentage) to less specialised (often eco-forms), and some taxa have no obvious adaptations. This study revealed a general increase in succulence in most obligate cremnophilous succulent species (compared to closely related species in other habitats), a reflection of their xeric habitat, and plants tend to be more compact. Also, there is a shift in reproductive output, including an increase in vegetative reproduction (backup), wind-dispersed seed and enriched flowering associated with certain species. Most obligate cremnophilous succulent plants in the study area have cliff-adapted features, ensuring long-term survival. / Thesis (PhD)--University of Pretoria, 2012. / Plant Science / unrestricted

In various regions, the number of employees working in each sector is different. Some sectors may be in the region employ more workers than other sectors, indicating a higher degree of specialization. In each region, the degree of specialization varies, which could have a direct impact on economic growth. The aim of this study was therefore to investigate the relationship between the degree of specialization and economic growth of the region. It turns out that there is a positive relationship between the degree of specialization and economic growth, which means that the growth rate of specialization will lead to economic growth. It follows that the focus of the region, especially on one sector can lead to faster economic growth.

L'intensification de l'agriculture a amélioré de façon considérable la production alimentaire ces dernières cinquante années mais elle s'est accompagnée d'un impact croissant sur l'environnement. En particulier, la modernisation de l'agriculture a impliqué une simplification de la structure des paysages agricoles rendant nos agro-ecosystèmes plus sensibles au risque épidémique. L'utilisation de la diversité génétique des cultures est une solution prometteuse pour réduire le risque d'occurrence et de propagation des maladies des cultures. Elle nécessite cependant une gestion collective des espaces agricoles. En conséquences, l'échelle d'étude ne doit plus se focaliser sur la parcelle mais sur le paysage. Dans cette thèse, nous nous interessons aux processus se déroulant à l'échelle du paysage et au rôle de la diversité des plantes cultivées pour le contrôle des épidémies. Nous avons identifié trois questions: comment les populations pathogènes se propagent-elles dans un paysage d'hôtes hétérogène ? Comment les différents génotypes composant la population pathogène entrent-ils en compétition au sein d'une population hôte diversifiée ? et, à plus long terme, comment les populations pathogènes évoluent-elles en réponse à la structure des populations hôtes ? Chacune de ces questions a été approfondie grâce à l'analyse de données obtenues en condition de production mais aussi par des approches théoriques. Nous avons montré que la composition et la structure spatiale des populations hôtes influence fortement la population pathogène. Cependant, les recommandations que peut fournir ce travail pour gérer la diversité génétique dépendent de l'objectif visé. / Agriculture intensification has improved food production impressively in the past 50 years but this came with an increasing impact on the environment. In particular, modern agriculture has led to the simplification of the environmental structure over vast areas. As a consequence, agro-ecosystems are particularly susceptible to epidemics. The increase of crop genetic diversity is a promising way for reducing the risk of occurrence and development of diseases in crops but the technical and organisational conditions required to manage the genetic resources at this scale have not been established yet. This will require shifting the scale of crop protection investigations from the field to the agricultural landscape. In this PhD thesis we focus on landscape-scale processes and on the potential role of functional diversity in cultivated landscapes to better control plant diseases. We identified three questions: how does a pathogen population spread over a heterogeneous host landscape? How do pathogen genotypes compete in a diversified host population? And, in a longer term, how do pathogen populations evolve in response to host landscape structure? Each of these questions is investigated through the analysis of real data and the development of theoretical approaches. We demonstrate that the composition and the spatial structure of the host landscape greatly influence the pathogen population dynamics and evolution. The recommendations that this work could provide in order to practically manage the genetic resources will depend on the desired aim and will request further collaborative work withthe professional operators.

1 Abstract The public procurement market that accounts for a significant share of the Czech GDP represents an institution of high rent-seeking motive and corruption potential. Donations to political parties can be used as an indirect linkage between political parties and firms as potential suppliers of public contracts. We analyse whether connections and donations influence the number of supplied contracts, volume of supplied contracts and the number of bidders in the tendering process. Furthermore the impact of donations and connections on firms' performance and profitability is assessed. We identify significant effects on number of contracts, volume of contracts, dependence on revenues from contracts and number of bidders of both giving donations and history of employing a politically active person.

Cette recherche a pour objet d’examiner l'importance des facteurs technologiques dans la spécialisation internationale touristique. Le test consiste, à partir des données liées au tourisme et à la technologie, à synthétiser la corrélation existante entre tourisme et facteurs technologiques dans les dépenses du tourisme domestique et international, l’investissement touristique et les dépenses en recherche et développement (R&D), à partir d’une analyse comparative de données de 2000 à 2010, en fonction d’une classifications des pays par groupes (Pays avancés, pays en voie de développement, et pays moins avancés). Les résultats ont montré que l’investissement touristique et la dépense de R&D sont des facteurs significatifs en terme d'augmentation des recettes touristiques d'un pays. Cette interprétation, mise en évidence par la théorie de « cycle de vie du produit » de Vernon, s'est avérée être un outil fortement démonstratif quant aux avantages du niveau technologique dans la valeur ajoutée dans la qualité et le développement d’un produit. Par ailleurs, la théorie de la demande de Linder est également concernée, notamment pour déterminer la spécialisation du tourisme domestique et international. On a constaté que la plupart des pays avancés ont un secteur technologique performant et une économie d'innovation qui soutient un fort développement du tourisme. Il est évident que si les données de dépenses de R&D sont principalement présentes dans les groupes de pays avancés; cet élément influence également la qualité du développement de tourisme à long terme. Dans les pays en voie de développement, caractérisés par des populations importantes, les dépenses du tourisme domestique sont plus fortes que des dépenses du tourisme international, la population reflétant par ailleurs la taille de son marché intérieur. En revanche, la proportion des dépenses touristiques internationales est plus importante que celle des dépenses touristiques domestiques dans les pays considérés comme destination touristique à part entière. Par conséquent, ces groupes de pays attirent les touristes internationaux. Le potentiel de dépenses par les populations locales dans les pays moins avancés est également faible. En conséquence, il affecte la proportion du ratio entre dépenses domestiques et internationales. Cependant, les théories des avantages comparatifs d’Hechscher & Ohlin, et/ou des avantages absolus peuvent être ici considérées pour les pays moins avancés. Ils sont en effet un avantage pour ces destinations touristiques, qui pourraient permettre, en appliquant les technologies concernées, de maintenir la compétitivité de la destination touristique. Ceci concernerait non seulement les capitaux physiques mais il leur permettrait également d'investir dans les ressources humaines (éducation, formation, savoir-faire, et connaissance). / This research examines the importance of technological factors in international tourism specialisation. The test application consists in finding tourism data related to technology, as well as in synthesising the correlation between tourism and technological factors which appear in domestic tourism expenditures, visitor exports, tourism investment, and expenditures on research and development (R&D) in order to compare their proportions between 2000 and 2010 and analysed the information by country group classification (Advanced countries, Developing countries, and Least Developed countries). The results show that tourism investment and R&D are significant factors in enhancing the tourism receipts of a country. This interpretation relates more precisely to Vernon's “Product Life Cycle” theory which has proven to be a highly demonstrative tool as to the advantages of level technology in terms of added value in product quality and product development. The theory of Demand of Linder is also concerned in order to enhance each other between domestic and international tourism specialisation. It was found that most countries in the advanced group display a solid technological sector and an innovating economy as well as the data on R&D expenditures are mainly allocated in advanced country groups; this fact also influences the quality of tourism development in the long term. In developing countries, the domestic expenditures have shown stronger than visitor exports in countries with large population. The high population in the country reflects the size of its domestic market. In contrast, the proportion of visitor export is higher than domestic expenditures in the tourism destination countries; these country groups attract international tourists. The potential of expenditures by local populations in LDC countries is also weak, it obviously affects to the ratio of both domestic and international expenditures. The theories of Heckscher&Ohlin, Comparative advantage, and/or Absolute Advantage can be considered for LDC countries, they should take advantage of being tourist destination countries by applying the technology concerned to maintain the destination. Not only would this allocate physical capital but it would also enable them to invest in human resources (education, training, knowhow, and knowledge).

Les cellules T folliculaires helper (Tfh) jouent un rôle central dans la mise en place de réponses humorales efficaces. En effet, les Tfh participent à la sélection des lymphocytes B permettant le développement de lymphocytes B mémoires et d’anticorps de haute affinité. Les Tfh représentent ainsi une cible prometteuse pour la mise en place de nouvelles stratégies thérapeutiques, notamment pour augmenter l’efficacité de la vaccination. Ainsi, il apparaît crucial de mieux comprendre les étapes menant à leur développement, en particulier chez l’Homme. L’initiation de la polarisation Tfh se déroule dans les organes lymphoïdes secondaires et met en jeu les cellules myéloïdes mononucléaires (MMC). Les MMC présentes dans les organes lymphoïdes comprennent les macrophages résidents et trois sous populations de DC résidentes : les cDC1 (CD141+), les cDC2 (CD1c+) et les pDC. Nous nous sommes plus particulièrement intéressés au rôle respectif des sous populations de MMC humaines dans l’induction de la polarisation Tfh. Ainsi, les travaux effectués au cours de ma thèse avaient pour objectifs dans un premier temps d’analyser la capacité des différentes populations de MMC à induire la polarisation Tfh, afin de mettre en évidence de potentielles spécialisations fonctionnelles. Dans un second temps, nous nous sommes concentrés sur les mécanismes moléculaires impliqués dans l’induction par les MMC de la polarisation Tfh. Nous avons montré une spécialisation fonctionnelle des cDC2 et des macrophages des amygdales pour la polarisation Tfh. Toutefois, des différences ont été observées entre les cDC2 et macrophages, puisque les macrophages induisent la sécrétion par les lymphocytes T d’une grande quantité de CXCL13 par rapport au cDC2, qui sont plus efficaces pour induire la production d’IL21. Nous avons pu également montrer que les cDC2 et macrophages sécrétaient des cytokines précédemment identifiées comme ayant un rôle dans l’induction des Tfh telles que IL12p70, ActivinA et TGFβ. Afin de confirmer le rôle de ces cytokines dans la polarisation induite par les MMC d’amygdales, nous avons utilisé des anticorps bloquants dans nos expériences de polarisation T helper. Ainsi, nous avons confirmé le rôle de l’IL12p70, de l’Activin A et du TGFβ dans l’induction des Tfh humains. Nos résultats suggèrent également un rôle de l’Activin A et de TGFβ dans l’induction de la sécrétion de CXCL13, alors que l’IL12p70 serait impliqué dans l’induction de la sécrétion d’IL21. Nos résultats suggèrent aussi l’existence de deux sous populations de Tfh caractérisées soit par l’expression d’IL21 soit par l’expression de CXCL13. Les travaux réalisés au cours de ma thèse enrichissent ainsi les connaissances sur la spécialisation fonctionnelle des sous populations de DC et des macrophages humains, et apportent de nouveaux éléments pour la compréhension de la différenciation des Tfh humains. / T follicular helper cells (Tfh) play a key role in the establishment of efficient humoral responses. Indeed, Tfh are involved in B lymphocyte selection allowing the development of high affinity memory B cells and antibodies. Tfh are promising targets for new therapeutic strategies, especially to increase the effectiveness of vaccination. Thus, it is crucial to better understand the stages leading to their development, especially in human. Initiation of Tfh polarisation occurs in secondary lymphoid organs and involves mononuclear myeloid cells (MMC). MMC from secondary lymphoid organs include resident macrophages and three subsets of resident Dendritic Cells (DC): cDC1 (CD141+), cDC2 (CD1c+) and pDC. We were particularly interested in human MMC subsets respective roles in the induction of Tfh polarisation. Thus, the work carried out during my thesis aimed first at analysing the ability of different populations of MMC to induce Tfh polarisation, in order to highlight potential functional specialisations. In a second step, we focused on the molecular mechanisms involved in Tfh polarisation by MMC. We have shown a functional specialisation of cDC2 and tonsillar macrophages for Tfh polarisation. However, differences have been observed between cDC2 and macrophages, since macrophages induce secretion by T cells of a large amount of CXCL13 compared to cDC2, which are more effective in inducing IL21 production. We have also been able to show that cDC2 and macrophages secreted cytokines previously shown to play a role in Tfh induction such as IL12p70, ActivinA and TGFβ. In order to confirm the role of these cytokines in Tfh polarisation induced by tonsil MMCs, we used blocking antibodies in our T helper polarisation experiments. Thereby, we confirmed the role of IL12p70, Activin A and TGFβ in the induction of human Tfh. Our results also suggest a role for Activin A and TGFβ in inducing secretion of CXCL13, whereas IL12p70 would be involved in the induction of IL21 secretion. Besides, our results suggest the existence of two Tfh subsets characterised by expression of either IL21 or CXCL13. The work performed during my thesis broadens the knowledge on the functional specialisation of human DC subsets and macrophages, and provides new insight into the differentiation of human Tfh.