A progressão das neoplasias sólidas é um processo complexo, não segue uma seqüência universal e é caracterizada pela marcada heterogeneidade tumoral na ocasião do diagnóstico. Anormalidades cromossômicas, mutações somáticas e alterações epigenéticas estão entre as principais alterações celulares decorrentes da instabilidade do genoma destas neoplasias. Essa instabilidade tem importantes implicações clínicas, pois impõe dificuldades ao desenvolvimento de novos biomarcadores tumorais, tais como a baixa recorrência de mutações somáticas causalmente relacionadas ao desenvolvimento do câncer e a grande diversidade amostral. Neste trabalho estudamos alterações citogenéticos e moleculares com objetivo de caracterizar padrões de diversidade tumoral. Os resultados demonstraram que a diversidade cariotípica é específica para cada tipo de tumor e que os tumores de menor diversidade apresentam estatísticas populacionais com melhor sobrevida (79 tipos de tumores; n=12787). Além disso, desenvolvemos novos métodos computacionais baseados na teoria da informação com objetivo de mapear a diversidade de expressão gênica dos mecanismos de estabilização do genoma. Os resultados obtidos sugerem que redes de genes de apoptose e do sistema de reparo por excisão de nucleotídeos estão funcionalmente alteradas em neoplasias sólidas, com aumento da diversidade de expressão gênica e diminuição da abundância de transcritos (14 tipos de tumores; n=492). A implicação deste achado é que ele fornece evidências em favor da instabilidade genômica ao nível dos nucleotídeos, um tipo de disfunção que causa aumento da taxa de mutação somática e que está caracterizada apenas em modelos teóricos e experimentais ou em raros casos de desordens hereditárias. Por fim, a padronização dos métodos computacionais desenvolvidos resultou em duas patentes de invenção (aplicadas ao diagnóstico/prognóstico de neoplasias sólidas) e em dois produtos tecnológicos na forma de programas de computador distribuídos com licença de código aberto (aplicados ao estudo da diversidade citogenética e molecular). Endereço de acesso: http://lief.if.ufrgs.br/pub/biosoftwares/ / The progression of solid tumors does not follow a universal sequence and it is characterized by marked tumor heterogeneity. Chromosomal abnormalities, somatic mutations and epigenetic alterations are among the major cellular changes associated to genome stability impairments, which contribute substantially to this heterogeneity. The cancer genome instability has important clinical implications, since it imposes technical problems for tumor biomarker development, such as the low recurrence of somatic mutations causally related to cancer and the great sample diversity. Here, we considered different types of cytogenetic and molecular changes in order to characterize different patterns of tumor diversity. The results showed that the karyotypic diversity is specific to each tumor type and that tumors with lower diversity present better population statistics – five-year survival rates (79 types of tumors, n = 12787). Furthermore, we developed new computational methods based on information theory concepts in order to map the diversity of gene expression networks of genome maintenance mechanisms. The results suggest that two gene expression networks - apoptosis and nucleotide excision repair (NER) - are functionally altered in solid tumors, with increased gene expression diversity and decreased transcript abundance (14 types of tumors; n=492). The implication of this finding is that it provides evidence in favor of genomic instability at nucleotide level, a type of dysfunction that can increase the somatic mutation rate, which is soundly characterized only in theoretical and experimental models, or in rare inherited disorders. Finally, the standardization of the computational methods developed here gave rise to two patents (applied to the diagnosis / prognosis of solid tumors) and two bioinformatics applications released under open source license (designed for cytogenetic and molecular diversity studies). Availability: http://lief.if.ufrgs.br/pub/biosoftwares/

As doenças lisossômicas de depósito (DLD) são erros inatos do metabolismo causadas pela deficiência de uma proteína, normalmente uma enzima, que resulta no depósito de lipídios nos lisossomos. Neste trabalho, nos propusemos a avaliar uma metodologia para a investigação bioquímica das DLDs. Amostras em papel filtro apresentam um menor volume de sangue coletado e uma maior facilidade quanto ao transporte e acondicionamento. Tivemos por objetivos estabelecer fatores pré-analíticos em amostras de sangue em papel filtro (SPF) tais como: efeito de anticoagulantes, temperatura de armazenamento e estabilidade ao longo do tempo para as enzimas b-galactosidase (b-gal), hexosaminidase total (Hex t), alfa-galactosidase (GLA), arilsulfatase B (ASB) e alfa-glicosidase (GAA). Também foi realizada a miniaturização e a correlação das metodologias em estudo. Descrevemos ainda nossa experiência no rastreamento das DLD em SPF em uma população de alto risco. Amostras de sangue de indivíduos normais (controles) foram coletadas em tubos com anticoagulantes EDTA, heparina, ou diretamente impregnados em papel filtro e armazenadas em diferentes temperaturas (-20, 4, 25 e 37ºC) e tempos (3, 10, 17 e 180 dias). Através da determinação da atividade enzimática em SPF por técnicas fluorométricas chegamos aos seguintes resultados: não houve diferença significativa entre os diferentes métodos de coleta do estudo para nenhuma das enzimas pesquisadas. Com relação ao efeito da temperatura e do tempo foi possível determinar que aos três dias de armazenamento, em todas as temperaturas estudadas e para todas as enzimas, as atividades permaneceram estáveis. A partir deste tempo cada enzima demonstrou um efeito diferente ao longo do tempo para as diversas temperaturas estudadas. Existem aquelas que não sofrem variação em sua atividade até 180 dias de armazenamento nas temperaturas estudadas (Hex t e GLA), aquelas que só vão diminuir sua atividade aos 180 dias em todas as temperaturas (ASB) ou somente a 37°C (b-gal) ou ainda aquela que diminui constantemente sua atividade a partir de 10 dias de armazenamento em todas as temperaturas (GAA). Se o objetivo for medir a atividade de todas as enzimas no mesmo papel filtro, então o melhor será armazenar o papel filtro por no máximo 10 dias em qualquer uma das temperaturas estudadas. Este tempo pode ser estendido até 180 dias em qualquer das temperaturas se formos analisar somente as atividades enzimáticas da Hex t, GLA e b-gal. O estudo de correlação das amostras de papel filtro de 1,2mm e 3mm de diâmetro para as enzimas alfagalactosidase, arilsulfatase B e alfa-glicosidase resultou nos coeficientes 0,994; 0,900 e 0,957; respectivamente. Isto demonstra que podemos diminuir o picote de papel sem perda da qualidade do ensaio. Por fim realizamos um rastreamento para as doenças de Pompe, Fabry, Mucopolissacaridose I e VI em 205 amostras de pacientes de alto risco, onde foi observado uma freqüência de 2,9% para estas DLDs após a utilização da metodologia pesquisada. Nossos resultados mostram a viabilidade na medida da atividade enzimática em SPF, o que facilita a coleta, envio e armazenamento das amostras para a triagem destas doenças lisossômicas. / Lysosomal storage diseases (LSD) are inborn errors of metabolism caused by deficiency of a protein, usually an enzyme, which results in storage of lipids in lysosomes. In this work, we have proposed a methodology for the biochemical investigation of LSD. Dried blood spot samples on filter paper (DBS) have a lower volume of blood collected and ease about the transport and storage. The aims of the study for pre-analytical factors on DBS were: to investigate the effect of anticoagulants, storage temperature and stability over time for the enzymes b-galactosidase (b-gal), total hexosaminidase (Hex t), alphagalactosidase (GLA), arylsulfatase B (ASB) and alpha-glucosidase (GAA). We also made the miniaturization and the correlation of the methodologies under study. Also describe our experience in LSD screening on DBS in a high-risk population. Blood samples from normal individuals (controls) were collected in tubes with anticoagulant EDTA, heparin, either directly impregnated on filter paper and stored at different temperatures (-20, 4, 25 and 37ºC) and times (3, 10, 17 and 180 days). The enzymatic activities in DBS were determined by fluorometric techniques and we achieved the following results: no significant difference between the different collection methods was observed for any of the enzymes. Regarding the effect of temperature and time it was determined that the three days of storage at all temperatures studied and for all the enzymes, the activity remained stable. From this time each enzyme showed a different effect over time for various temperatures. There are enzymes that do not suffer variations in their activity until 180 days of storage at temperatures studied (t- Hex and GLA), there are those that will slow down their activity after 180 days at all temperatures only (ASB) or only at 37°C (b-gal ) or only that is constantly decreasing its activity after 10 days of storage at all temperatures (GAA). If the goal is to measure the activity of all enzymes in the same DBS, then it is best to store the DBS for a maximum of 10 days in any of the temperatures studied. This time can be extended to 180 days in any of the temperatures if we consider only the enzymatic activities of t-Hex, GLA and b-gal. The correlation study of samples of DBS of 1.2 mm and 3 mm in diameter for the enzyme GLA, ASB and GAA resulted in the coefficients 0.994, 0.900 and 0.957, respectively. This shows that we can decrease the paper punch without losing the quality of the test. Finally we performed a screening for Pompe disease, Fabry disease, Mucopolysaccharidosis I and VI in 205 samples of DBS of high-risk patients. This screening revealed a frequency of 2.9% of these LSD after using the methodology researched. Our results demonstrated the feasibility for measurement of enzymatic activity in DBS, which facilitates the collection, sending and storage of samples for the screening of these lysosomal disorders.

Submitted by Puentes Torres Antônio (antoniopuentes@hotmail.com) on 2016-09-16T14:55:47Z No. of bitstreams: 1 Roberto_Rodrigues_Evangelista_Dissertacao_Final.pdf: 863544 bytes, checksum: c12c076a52548e2903e32113f742c151 (MD5) / Approved for entry into archive by Vanessa Reis (vanessa.jamile@ufba.br) on 2016-09-16T15:45:12Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Roberto_Rodrigues_Evangelista_Dissertacao_Final.pdf: 863544 bytes, checksum: c12c076a52548e2903e32113f742c151 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-09-16T15:45:12Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Roberto_Rodrigues_Evangelista_Dissertacao_Final.pdf: 863544 bytes, checksum: c12c076a52548e2903e32113f742c151 (MD5) / A Dissertação analisa as desigualdades entre pessoas brancas e pessoas negras, de acordo com a declaração de pertencimento racial feita pelas pessoas aos Censos do IBGE, quanto ao acesso às técnicas no espaço de Salvador. Compreendendo as técnicas como um conjunto de meios instrumentais e sociais que são ponto de partida para os processos de constituição e usos do território e de produção e habitação do espaço. Além de tomar as técnicas como ponto de partida para a realização dos diversos processos de trabalho realizados pelos homens e mulheres na transformação da natureza, tornando-a cada vez mais adequada para a reprodução da vida humana, o texto identifica e analisa os processos de formação sócio-espacial e de constituição e usos do território e de produção e habitação do espaço, tendo como delimitação territorial e espacial a cidade de Salvador, e como o grupo racial branco e grupo racial negro se inserem e participam nesses processos. O texto também aborda os processos de organização do espaço em Salvador, como decorrência da forma como ocorreu a inserção do território e de sua fração na divisão territorial do trabalho. Também é identificada no texto a distribuição espacial das técnicas em áreas da cidade de Salvador e como os grupos raciais que habitam essas áreas estão presentes e acessando as técnicas. As técnicas escolhidas para análise do acesso dos grupos raciais brancos e negros foram: trabalho e respectiva renda, educação, micro computador, automóvel particular, telefonia fixa, energia elétrica e coleta de lixo. / ABSTRACT The dissertation examines inequalities between white people and black people, according to the statement made by persons belonging to racial IBGE Census, as access to the techniques in the area of Salvador. Understanding the techniques as a set of instrumental and social media that are the starting point for the process of formation and uses of land and production and housing space. Besides taking techniques as a starting point for achieving the various work processes performed by men and women in the transformation of nature by making it increasingly suitable for reproduction of human life, the text identifies and analyzes the processes of formation socio-spatial formation and uses of land and production and housing space, with the space and territorial delimitation the city of Salvador, and as the white racial group and racial group are part black and part in these processes. The text also addresses the processes of spatial organization in Salvador, as a result of how the insertion occurred in the territory of his faction and the territorial division of labor. Also identified in the text is the spatial distribution of technical areas in the city of Salvador and how the racial groups that inhabit these areas are present and accessing techniques. The techniques used to analyze the access of black and white racial groups were working and their income, education, micro computer, private vehicles, fixed telephony, electricity and garbage collection.

Submitted by Programa de Pós-graduação em Biotecnologia (mebiotec.ufba@gmail.com) on 2017-09-14T14:16:25Z No. of bitstreams: 1 Dissertação final - Luciana Lima.pdf: 2423067 bytes, checksum: a4f37f089f064b722852c1a6565ea7de (MD5) / Approved for entry into archive by Edvaldo Souza (edvaldosouza@ufba.br) on 2017-10-02T20:39:39Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação final - Luciana Lima.pdf: 2423067 bytes, checksum: a4f37f089f064b722852c1a6565ea7de (MD5) / Made available in DSpace on 2017-10-02T20:39:39Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertação final - Luciana Lima.pdf: 2423067 bytes, checksum: a4f37f089f064b722852c1a6565ea7de (MD5) / Fapesb / A acidificação e a Corrosão Microbiologicamente influenciada (CMI) são os principais problemas associados às Bactérias Redutoras de Sulfato (BRS) dentro da indústria de petróleo. Como forma minimizar os problemas citados, a indústria recorre a métodos de controles diversos, dentre os quais se destaca a utilização de biocidas, que por apresentar baixa eficiência e um custo elevado nem sempre são suficientes para conter a ação corrosiva das BRS. Compreender a dinâmica populacional das BRS em campos de petróleo é fundamental, tendo em vista a possibilidade de esclarecer os processos de acidificação e corrosão que acometem os reservatórios e os sistemas de transporte. Deste modo, métodos de cultivo tradicionais são utilizados e apesar da sua importância por vezes subestimam populações complexas. Por outro lado, métodos independentes de cultivo já promoveram uma compreensão destas comunidades em ambientes extremos, quando empregados em paralelo aos métodos tradicionais. O objetivo deste estudo foi testar e validar técnicas moleculares para monitorar em tempo real BRS em amostras de água produzida (AP), a partir de quatro poços (A, B, C e D) em diferentes pontos na região do Recôncavo Baiano, utilizando os métodos FISH, DAPI e NMP (número mais provável). Os dados obtidos evidenciaram a reunião de baixas populações de BRS nos poços pesquisados, e por meio de análise de variância (ANOVA) utilizando o teste de Scott Knott, foi observada a significância estatística (p≤0,05), entre as médias avaliadas para o poço de petróleo C, quando os três métodos (DAPI, FISH e NMP) foram comparados. Os métodos DAPI e FISH também apresentaram um p≤0,05 para a avaliação do poço D, sugerindo que as limitações encontradas pelo método NMP, para o respectivo poço, foram supridas pelos métodos independentes de cultivo. O qPCR foi empregado no referido estudo para quantificar o número de cópias do gene dsrA, responsável pela redução do sulfato, através da quantificação absoluta. Entanto, foi necessário previamente bioestimular uma amostra de AP em três concentrações diferentes (20%, 40% e 60%). Os resultados evidenciaram que a amostra de AP na concentração de 60% permitiu a amplificação do DNA extraído e a validação da metodologia, uma vez que a análise de qPCR mostrou um slope -3,32, uma eficiência de 100,081% e um R2 de 0,999.

Submitted by Luis Guilherme Macena (guilhermelg2004@gmail.com) on 2013-07-05T18:48:07Z No. of bitstreams: 1 Dissertação de Mestrado Shirley Castilho.pdf: 430683 bytes, checksum: 25f84349c8825f4f83837e375e956baf (MD5) / Made available in DSpace on 2013-07-05T18:48:07Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertação de Mestrado Shirley Castilho.pdf: 430683 bytes, checksum: 25f84349c8825f4f83837e375e956baf (MD5) Previous issue date: 2011 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Fernandes Figueira. Departamento de Ensino. Programa de Pós-Graduação em Saúde da Criança e da Mulher. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / O desconhecimento do grupo sanguíneo RhD fetal durante o período gestacional faz com que gestantes RhD-negativo tenham o mesmo acompanhamento pré-natal independente do feto ser RhD-positvo ou RhD-negativo. Assim, gestantes sem risco para o desenvolvimento de Doença Hemolítica Perinatal (DHPN) são mantidas no pré-natal de alto risco aumentando a taxa de ocupação destes serviços e dificultando a oferta para aquelas que realmente necessitariam de assistência especializada. Um método atual, não invasivo, a genotipagem RhDa partir do DNA fetal livre no plasma materno permite o conhecimento do grupo sanguíneo fetal antes do nascimento possibilitando excluir do pré-natal de alto risco gestantes com fetos sem risco para a DHPN (fetos RhD-negativos). Este estudo objetiva mapear o Fluxo da assistência pré-natal, em especial de gestantes RhD-negativo, no Município do Rio de Janeiro visando analisar a viabilidade da incorporação da genotipagem RhDa partir do DNA fetal livre no plasma materno na rotina pré-natal de gestantes RhD-negativo acompanhadas no SUS. Esta análise foi realizada aplicando o método de Planejamento Estratégico Situacional (PES) proposto por Carlos Matus. O método PES prevê quatro momentos para o processamento dos problemas. O Momento explicativo prevê o diagnóstico situacional, O momento normativo formula os objetivos e o prazo para executá-los, o Momento estratégico analisa a viabilidade dos planos e os atores envolvidos no processo e o momento operacional estabelece a execução dos planos e a avaliação das mudanças. Concluímos que a implantação da genotipagem RhDfetal utilizando o DNA livre no plasma materno e a PCR em tempo real, no SUS, é factível. O cenário atual é extremamente favorável. A preocupação das três esferas do governo com a assistência integral à saúde materna e infantil promove um leque de investimentos amplos neste segmento. A possível ação conjunta entre o governo e as instituições públicas, com expertise em desenvolvimento de métodos diagnóstico como Biomanguinhos, possibilitaria a implantação desta tecnologia para diferentes segmentos da saúde pública no Brasil. / The lack of knowledge about the Rhblood group during the pregnancy period make the D-negative pregnant women have the same prenatal follow-up whether the fetal blood type isD positive or D-negative. In this way, pregnant women without risk to develop Hemolytic Disease of newborn (HDN) are kept in High Risk Prenatal Care increasing the occupancy rate of the assistance servicesdecreasing the viability for who those really need it. Nowadays a non-invasive method, the RHD genotyping using free-fetal DNA from maternal plasma allows the fetal blood group knowledge before the birth. This makes possible to exclude from High Risk Prenatal Care, pregnant women with fetus without HDN risk. This study aims the understanding of prenatal care flow of D-negative pregnant women in Rio de Janeiro city trying to check the viability of the introduction of RHD genotyping test using free-fetal DNA from maternal plasma in the D-negative pregnant women in prenatal care public service. This analysiswas made using strategic-situational approach of CarlosMatus. There are four (4) moments of strategic planning, according to Carlos Matus.The analytical moment describes the stage of formulation of initial situation (diagnosis), the Normative Moment designs the aims and defines the strategy of action. The Strategic Moment analyzes the actors enrolled in the process and the viability of plans. The Operational Moment establishes the execution of plans and evaluates the changes. In conclusion, the introduction of RHD genotyping test in free-fetal DNA from maternal plasma using real-time PCR, in public services, is factual. Brazil’s Health Ministry is working on improving the public health system. The government issues about full assistance to women and children promote wide investments in this heath area. Actions joining both government and public institutions with expertise as Biomanguinhos would make possible the development of different diagnoses methods in health care in Brazil.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro Tecnológico, Programa de Pós-Graduação em Engenharia Elétrica, Florianópolis, 2016. / Made available in DSpace on 2017-05-02T04:07:30Z (GMT). No. of bitstreams: 1 345509.pdf: 3920862 bytes, checksum: aeaf7cd1e591f4dcdce7a0670516b314 (MD5) Previous issue date: 2016 / A avaliação da postura de um indivíduo pode estar associada às angulações geradas a partir da demarcação de dois referenciais ósseos em um determinado momento durante movimentos rotineiros, como andar, sentar e levantar. Sistemas de auxílio da avaliação postural são comumente desenvolvidos a partir da análise da marcha. Porém neste trabalho foi desenvolvido um sistema baseado nas atividades de sentar e levantar, pois estas atividades são pré-requisito para as demais atividades diárias. Com base neste contexto, o objetivo deste estudo é o desenvolvimento de um sistema automatizado para identificar um grupo de nove pontos anatômicos usando um protocolo de avaliação postural na vista lateral das atividades de Sentar e Levantar, permitindo a extração de informação necessária do protocolo em qualquer momento da execução da atividade. O algoritmo proposto emprega técnicas de processamento digital de imagens, como a segmentação de imagens e a predição dos pontos oclusos para identificação dos pontos anatômicos em pacientes por meio de marcadores retro reflexivos. Os resultados obtidos mostram que o sistema possui uma acurácia de 95,1% para os valores angulares calculados a partir dos vídeos obtidos. A precisão para separação das fases possui uma efetividade de 97,48%. De modo geral o sistema foi avaliado por 30 fisioterapeutas. Destes, 90% avaliaram o sistema como excelente. O algoritmo proposto auxilia o fisioterapeuta na obtenção de um método quantitativo para o acompanhamento da evolução da postura do paciente e permite revisões periódicas para ser feito mais rapidamente, com precisão e durante todo o tratamento fisioterapêutico.<br> / Abstract : The postural assessment of an individual can be related to the angles generated from the makers of two bone references at any given time during routine movements, such as walking, sitting and standing. Postural evaluation assistance systems are commonly developed from the analysis of the gait. However, in this study was developed a system based on activities of sit-to-stand as these activities are pre-requisite the other daily activities. Based on this context the objective of this study is to develop an automated system to identify a group of nine anatomical landmarks using a postural assessment protocol of the sit-to-stand and stand-to-sit activities in the lateral view, allowing the extraction of information necessary from the protocol anytime during the execution of the activity. The proposed algorithm employs digital image processing techniques such as image segmentation and the prediction of the occluded points for identification of anatomical landmarks in patients through reflective markers. The results obtained show that the system has an accuracy of 95.1% for the angular values calculated from the obtained videos. The accuracy for separation of the phases has an effectiveness of 97.48%. In general, the system 30 was evaluated by physical therapists. From these, 90% evaluated the system as excellent. The proposed algorithm assists the physical therapists in achieving a quantitative method for monitoring the evolution of the patient's posture and allows periodic reviews to be made more quickly, accurately and throughout the physiotherapeutic treatment.

VIEIRA, Elizabeth Dell' Orto. Prevalência de HPV e lesões intraepiteliais escamosas em gestantes. 2008. 86 f. Dissertação (Mestrado em Tocoginecologia)- Universidade Federal do Ceará. Faculdade de Medicina, Fortaleza, 2008. / Submitted by denise santos (denise.santos@ufc.br) on 2012-10-22T12:15:59Z No. of bitstreams: 1 2008_dis_edovieira.pdf: 724191 bytes, checksum: b154be6a33652d30ec78483a6f448800 (MD5) / Approved for entry into archive by Erika Fernandes(erikaleitefernandes@gmail.com) on 2012-10-26T15:10:19Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2008_dis_edovieira.pdf: 724191 bytes, checksum: b154be6a33652d30ec78483a6f448800 (MD5) / Made available in DSpace on 2012-10-26T15:10:19Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2008_dis_edovieira.pdf: 724191 bytes, checksum: b154be6a33652d30ec78483a6f448800 (MD5) Previous issue date: 2008 / This work studies the prevalence (cross sectional) on infection by HPV in uterine cervical of pregnant women evaluating the subgroups of HPV more prevalents and the association in relation to the development of squamous intraepithelial lesions. The methodology was constituted of questionary applied to 272 pregnant women independent of pregnant age and of being symptomatic or not in the first medical advice of prenatal besides the collect of cervico vaginal material (vaginal walls, ectocervix and endocervix) to the achievement of conventional oncotic cytology by the method of coloration proposed by Papanicolaou and the test of Capture Hybrid II®. Then it was proceeded the identification of squamous intraepithelial lesions and the presence of HPV virus of high, low and medium oncogenic risk. The results of Capture Hybrid II® were correlated with the cytologic discoveries comparing the frequency of anormal results in both methods. It was also proceeded the association with biosocial aspects which could interfere in the possible development of squamous intraepithelial lesions. The analysis of univariable and bivariable correlations were accomplished with calculus of Qui-squared of Pearson and value p<0,05. The logistic regression was used to estimate the importance of associations. The prevalence of infection by HPV and anormal oncotic cytologies was about 32,3% and 14,0% respectively. The sub groups of HPV of high risk were more prevalent (27,6%) than the ones of low and medium risk. (18,4%) and their association showed to be statistically significant (p< 0,05). The association of genital infection by HPV of high risk with squamous epithelial lesions described on conventional oncotic cytology was more prevalent (8,5%) than with HPV of low and medium risk (5,6%) and had statistical importance (p< 0,05) / Estudo de prevalência (estudo transversal) sobre infecção por HPV em colo uterino de gestantes, avaliando o(s) subgrupo(s) de HPV mais prevalentes e a associação quanto ao desenvolvimento de lesões intraepiteliais escamosas. A metodologia constituiu-se de questionário aplicado diretamente a 272 gestantes, independente da idade gestacional e de estarem sintomáticas ou não na primeira consulta de pré-natal, além da coleta de material cérvico-vaginal (paredes vaginais, ectocérvice e endocérvice) para realização de Citologia oncótica convencional pelo método de coloração proposto por Papanicolaou e do teste de Captura Híbrida II®. Procedeu-se a seguir a identificação das lesões intraepiteliais escamosas e da presença do vírus HPV de alto, baixo e médio risco oncogênico. Os achados da Captura Híbrida II® foram correlacionados com os achados citológicos, comparando-se a freqüência dos resultados anormais nos dois métodos. Procedeu-se também a associação com aspectos biossociais que pudessem interferir na infecção produzida pelo HPV e no possível desenvolvimento de lesões intraepiteliais escamosas. Realizaram-se análises de correlação univariada e bivariada, com cálculo do Qui-quadrado de Pearson e valor p< 0,05. Utilizou-se também de regressão logística para estimar a magnitude das associações. A prevalência de infecção por HPV e citologias oncóticas anormais foi de 32,3% e 14,0 % respectivamente. Os subgrupos de HPV de alto risco foram mais prevalentes (27,6%) do que os de baixo e médio risco (18,4%) e a sua associação mostrou-se estatisticamente significativa (p<0,05). A associação da infecção genital por HPV de alto risco com lesões intraepiteliais escamosas descritas na Citologia oncótica convencional foi mais prevalente (8,5%) do que com HPV de baixo de médio risco (5,6%) e teve significância estatística (p<0,05)

ARAÚJO, D. C. Sistema de comunicações com sinais m-QAM não – ortogonais. 2012. 70 f. Dissertação (Mestrado em Teleinformática) - Centro de Tecnologia, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2012. / Submitted by Marlene Sousa (mmarlene@ufc.br) on 2012-10-31T13:55:48Z No. of bitstreams: 1 2012_dis_dcaraújo.pdf: 2634428 bytes, checksum: 6690780c8f07158809fc79b569af865c (MD5) / Approved for entry into archive by Marlene Sousa(mmarlene@ufc.br) on 2012-11-01T16:53:33Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2012_dis_dcaraújo.pdf: 2634428 bytes, checksum: 6690780c8f07158809fc79b569af865c (MD5) / Made available in DSpace on 2012-11-01T16:53:33Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2012_dis_dcaraújo.pdf: 2634428 bytes, checksum: 6690780c8f07158809fc79b569af865c (MD5) Previous issue date: 2012-07-23 / This work presents studies on communication systems, whose signals used for transmission of information are non-orthogonal, overlapping in frequency and carrier spacing less than the rate of symbols. The research is aimed to obtain structures of transmitter, optimal and sub-optimal receivers using modeling and mathematical analysis of systems including the channel. Furthermore, propose strategies for symbol detection and performance evaluation. Seven strategies of reception to N signals m-QAM non-orthogonal through the AWGN channel. Among the strategies of detection two are optimal and the others five are suboptimal. The two optimal receivers structures presented in this paper are: the classical receiver maximum likelihood (ML) receiver and maximum likelihood based on the Gram-Schmidt decomposition. The suboptimal receivers in this work are of two types: receivers with linear and nonlinear equalization. The first type of receiver is developed based on the criteria of minimum mean square error (MMSE) and the zero forcing (ZF). It is presented the development of analytical design of each linear receiver architectures, as well as determined the error of the estimators. The receivers with nonlinear equalization are based on successive interference cancellation (SIC). In this paper, we propose a modification to the original algorithm of SIC, resulting in a new architecture of equalization. The performance of the proposed receivers is evaluated under different number of carriers and the degree of spectral overlap using computer simulation. Finally, we present the conclusions of this work and future prospects of the research. / Este trabalho apresenta estudos sobre sistemas de comunicação cujos sinais utilizados para a transmissão das informações são não-ortogonais, superpostos em frequência, e com espaçamento entre portadoras menor do que a taxa de símbolo. As pesquisas estão direcionadas na obtenção de estruturas de transmissor e receptor ótimos e sub-ótimos, na modelagem e análise matemática dos sistemas incluindo o canal, em propostas de estratégias para detecção de símbolo, e na avaliação de desempenho. São propostas sete estratégias de recepção de N sinais m-QAM não-ortogonais através do canal AWGN. Dentre as estratégias de detecção duas são ótimas e as outras cinco são subótimas. As duas estruturas de receptores ótimos apresentados neste trabalho são: o receptor de máxima verossimilhança (ML) clássico e o receptor de máxima verossimilhança com base na decomposição de Gram-Schmidt. Os receptores sub-ótimos desenvolvidos neste trabalho são de dois tipos: receptores com equalização linear e receptores com equalização não-linear. O primeiro tipo de receptor é desenvolvido com base nos critérios de erro quadrático médio mínimo (MMSE) e o de forçagem a zero (ZF). É apresentado o desenvolvimento analítico do projeto de cada uma das arquiteturas de receptores lineares, assim como é determinado o erro dos estimadores. Os receptores com equalização não-linear são baseados no cancelamento de interferência sucessiva (SIC). Neste trabalho, é proposta uma modificação no algoritmo do SIC original, resultando em uma nova arquitetura de equalização. O desempenho dos receptores propostos é avaliado em diferentes condições de número de portadoras e de grau de superposição espectral através de simulação computacional. Por fim, são apresentados as conlusões e as perspectivas futuras de pesquisa.

BESSA, I. S. Avaliação do processamento digital de imagens como ferramenta para caracterização de agregados e misturas asfálticas. 2012. 153 f. Dissertação (Mestrado em Engenharia de Transportes) - Centro de Tecnologia, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2012. / Submitted by Zacarias Barbosa Matias Junior (zaca@det.ufc.br) on 2013-05-10T20:31:42Z No. of bitstreams: 1 2012_dis_isbessa.pdf: 5200247 bytes, checksum: b23ae09c584c3d14850fd224ae8d0e3e (MD5) / Approved for entry into archive by Marlene Sousa(mmarlene@ufc.br) on 2013-05-21T18:53:45Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2012_dis_isbessa.pdf: 5200247 bytes, checksum: b23ae09c584c3d14850fd224ae8d0e3e (MD5) / Made available in DSpace on 2013-05-21T18:53:45Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2012_dis_isbessa.pdf: 5200247 bytes, checksum: b23ae09c584c3d14850fd224ae8d0e3e (MD5) Previous issue date: 2012 / It is a general consensus that the mechanical performance of asphalt mixtures with respect to the pavements’ main distresses (permanent deformation, fatigue cracking and thermal cracking) is directly related to the aggregates’ properties used in those mixtures. The traditional methodology of characterizing aggregates, mainly in relation to shape properties, such as form, angularity and texture, can be very time-consuming. It also does not provide precise results, because it combines more than one property in a single test result. Another disadvantage is the fact that these methodologies also provide average values that may not represent well the evaluated materials. There are alread y in the literature several Digital Image Processing (DIP) techniques that can be used with the purpose of characterizing aggregates in a more complete and realistic way. One of them is the Aggregate Image Measurement System (AIMS), equipment developed to analyze properties, such as: shape, angularity, and superficial texture of coarse and fine aggregates, through different methods. It is believed that different quarries can produce aggregates with very distinct properties, due to the several used rock blasting and crushing processes, quality control activities and material storage methodology. The main objective of this research is to evaluate the potential use of DIP to analyze shape, angularity and texture of aggregates from different sources and to analyze asphalt mixtures internal structure constituted by those aggregates. Aggregates from three different quarries, all located in the State of Ceará, were obtained and characterized. The aggregates were analyzed using AIMS, for different sizes, and the results were compared. Besides that, the asphalt mixtures constituted with these aggregates were analyzed regarding their internal structure and their mechanical characteristics. The main results obtained in this study led to conclude that the aggregates used in this research are very similar in respect to their form, angularity and texture properties. With respect to the mechanical properties of the mixtures constituted by these aggregates, the results show that their behavior is also very similar, which is probably due to the similar characteristics of their aggregates. / É de conhecimento geral que o desempenho de misturas asfálticas com relação aos principais defeitos do pavimento (deformação permanente, trincamento por fadiga e trincamento térmico) está diretamente ligado às propriedades dos agregados que as constituem. A metodologia tradicional de caracterização de agregados, principalmente em relação à forma, à angularidade e à textura, pode se tornar dispendiosa e não fornecer resultados precisos, pois, além de muitas vezes combinar mais de uma propriedade em apenas um ensaio, estes parâmetros são avaliados a partir de uma média de valores que pode não representar bem os materiais estudados. Sendo assim, já existem, na literatura, diversas técnicas de Processamento Digital de Imagens (PDI) que podem ser utilizadas com o intuito de caracterizar agregados de forma mais completa e realista. Uma destas técnicas é por meio do uso do equipamento Aggregate Image Measurement System (AIMS), desenvolvido para analisar forma, angularidade e textura superficial de agregados graúdos e miúdos, através de diferentes métodos. Acredita-se que, diferentes pedreiras podem produzir agregados com propriedades distintas entre si devido aos diversos processos de desmonte, de britagem, de controle de qualidade e de armazenamento dos materiais. O objetivo geral do presente trabalho é avaliar o potencial do uso do PDI na análise das propriedades de forma, de angularidade e de textura de agregados provenientes de fontes distintas e na análise da estrutura interna de misturas asfálticas compostas por esses agregados. Foram obtidos e caracterizados agregados provenientes de três pedreiras distintas, todas localizadas no estado do Ceará. Os agregados foram analisados no AIMS separando-se os diversos tamanhos de suas partículas, e os resultados obtidos para o material proveniente de cada pedreira foram comparados entre si. Além disso, misturas asfálticas compostas por esses agregados foram analisadas em relação a sua estrutura interna e em relação a suas propriedades mecânicas. Os principais resultados obtidos levaram à conclusão de que os agregados estudados são semelhantes no que diz respeito a suas propriedades de forma, de angularidade e de textura. Em relação às propriedades mecânicas das misturas compostas por esses agregados, os resultados mostram que estas se comportaram de maneira similar, o que provavelmente se deve às características também similares de seus agregados.

CARVALHO, F. S. R. Caracterização físico-química e avaliação in vitro de diferentes formulações da solução de Carnoy sobre substratos ósseo e dentário humanos. 2017. 129 f. Dissertação (Mestrado em Odontologia) - Faculdade de Farmácia, Odontologia e Enfermagem, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2017. / Submitted by Erika Fernandes (erikaleitefernandes@gmail.com) on 2017-03-06T13:42:50Z No. of bitstreams: 1 2017_dis_fsrcarvalho.pdf: 4191897 bytes, checksum: a26d8a9264f70c6da4c53e87287d42f8 (MD5) / Approved for entry into archive by Erika Fernandes (erikaleitefernandes@gmail.com) on 2017-03-06T13:42:58Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2017_dis_fsrcarvalho.pdf: 4191897 bytes, checksum: a26d8a9264f70c6da4c53e87287d42f8 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-06T13:42:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2017_dis_fsrcarvalho.pdf: 4191897 bytes, checksum: a26d8a9264f70c6da4c53e87287d42f8 (MD5) Previous issue date: 2017-02-06 / The maxillofacial region may be affected by a variety of benign lesions (odontogenic and non-odontogenic), but locally invasive. The use of a conservative treatment can generate high rates of recurrence, whereas a radical approach can lead to aesthetic-functional disorders. The use of Carnoy's solution, as a complementary therapy to surgical treatment, has been described in the literature with the purpose of reducing the recurrence rates of these lesions, in addition to minimizing damages resulting from an aggressive surgical treatment. Thus, the present dissertation is constituted by two chapters that aim, respectively: 1) to characterize the physico-chemical and pharmacological properties of Carnoy's solution with and without chloroform; 2) to evaluate in vitro the effect of different formulations of Carnoy's solution on calcified human substrates. As methodological approaches, laboratory studies were performed. In Chapter 1, the physico-chemical / pharmacological properties and behavior of different formulations of the Carnoy solution used in oral and maxillofacial surgery were evaluated through Raman microspectroscopy, UV / Visible spectrophotometry, among others. The results of this study showed that the Carnoy solution presents acidic pH and, when chloroform is present, it becomes slightly more acidic, as well as giving the solution a higher viscosity. When the solutions were not filtered after preparation, precipitation of iron salts occurred after the seventh day when the chloroform was used in its composition. A study was carried out with 36 lower third molars and 18 mandibular bone fragments, both donated and collected from humans, which were divided into three groups: two groups (Group I = Carnoy solution with chloroform, Group II = Carnoy solution without chloroform) and a control group (saline solution). The samples were evaluated through Raman microspectroscopy, Knoop microhardness test and scanning electron microscopy (SEM) with X-ray dispersive energy spectrum (EDX). There was demineralization / degradation of dental structures in both the mineral matrix / organic matrix and carbonate / phosphate (GI and GII, p <0.05) and in the relationship between the collagen subtypes (GII, p <0.05). In the bone tissue degradation was observed by the reduction in the ratio between the collagen subtypes (GI and GII, p <0.05). The presence of chloroform resulted in a statistically significant reduction in the surface microhardness of dental tissue samples (p = 0.036). In the experimental groups, the MEV / EDX showed significant structural changes in all samples analyzed. As conclusions of both studies, we have: (1) Carnoy's solution is a stable solution when stored at room temperature which, in the presence of chloroform, is prone to precipitation of iron salts, increases its viscosity, And its pH becomes slightly more acidic; (2) both formulations of the Carnoy solution (with or without chloroform) exhibit demineralization ability when applied to calcified human tissues, promoting alteration in both the mineral matrix and the organic matrix; (3) the presence of chloroform in Carnoy's solution provides a greater potential for tissue demineralization and penetrability. / A região maxilofacial pode ser afetada por uma variedade de lesões benignas (odontogênicas e não-odontogênicas), mas localmente invasivas. O emprego de um tratamento conservador pode gerar altas taxas de recorrência, enquanto que uma abordagem radical pode acarretar desordens estético-funcionais. O uso da solução de Carnoy, enquanto terapia complementar ao tratamento cirúrgico, tem sido descrito na literatura com o propósito de reduzir as taxas de recorrências dessas lesões, além de minimizar danos decorrentes de um tratamento cirúrgico agressivo. Dessa forma, a presente dissertação é constituída por dois capítulos que têm como objetivo, respectivamente: 1) caracterizar as propriedades físico-químicas e farmacológicas da solução de Carnoy com e sem clorofórmio; 2) avaliar in vitro o efeito de diferentes formulações da solução de Carnoy sobre substratos humanos calcificados. Como abordagens metodológicas, foram realizados estudos laboratoriais. No Capítulo 1, procedeu-se com a avaliação das propriedades físico-químicas/farmacológicas e comportamento de diferentes formulações da solução de Carnoy utilizada em cirurgia oral e maxilo-facial através de microespectroscopia Raman, espectrofotometria UV/Visível, entre outras. Os resultados, desse estudo, evidenciaram que a solução de Carnoy apresenta pH ácido e, quando da presença do clorofórmio, esta torna-se levemente mais ácida, bem como confere à solução maior viscosidade. Quando as soluções não foram filtradas após sua preparação ocorreu precipitação de sais de ferro após o sétimo dia quando da utilização do clorofórmio em sua composição. No Capítulo 2, foi realizado um estudo com 36 terceiros molares inferiores e 18 fragmentos ósseos mandibulares, ambos doados e coletados de humanos, os quais foram divididos em três grupos: dois grupos experimentais (Grupo I = solução de Carnoy com clorofórmio; Grupo II = solução de Carnoy sem clorofórmio) e um grupo controle (solução salina). As amostras foram avaliadas através de microespectroscopia Raman, teste de microdureza Knoop e microscopia eletrônica de varredura (MEV) com análise do espectro de energia dispersiva de raios X (EDX). Houve desmineralização/degradação das estruturas dentárias tanto nas relações matriz mineral/matriz orgânica e carbonato/fosfato (GI e GII; p<0,05), quanto na relação entre os subtipos de colágeno (GII; p<0,05). No tecido ósseo foi observada degradação pela redução na relação entre os subtipos de colágeno (GI e GII; p<0,05). A presença do clorofórmio resultou em uma redução estatisticamente significante na microdureza superficial das amostras de tecidos dentários (p=0,036). Nos grupos experimentais, o MEV/EDX evidenciou significativas alterações estruturais em todas as amostras analisadas. Como conclusões de ambos os estudos, tem-se que: (1) a solução de Carnoy é uma solução estável quando armazenada em temperatura ambiente que, na presença de clorofórmio, é passível de precipitação de sais de ferro, sofre aumento de sua viscosidade, e seu pH torna-se levemente mais ácido; (2) ambas as formulações da solução de Carnoy (com ou sem clorofórmio) apresentam capacidade de desmineralização quando aplicada sobre tecidos humanos calcificados, promovendo alteração tanto na matriz mineral quanto na matriz orgânica; (3) a presença do clorofórmio na solução de Carnoy propicia um maior potencial de desmineralização e penetrabilidade teciduais.