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Estudos estruturais e correlação com a síndrome urolitíase de mutantes da adenina fosforribosiltransferase humana / Structural studies and correlation with urolithiasis syndrome of mutants from human adenine phosphoribosyltransferase

Pimenta Junior, Alécio Antonio 19 April 2011 (has links)
A 2,8-DHA Urolitíase é uma doença resultante de uma desordem hereditária que leva a deficiência de atividade da enzima APRT do grupo das PRTases. Até o momento, foram encontradas 18 mutações em pacientes, das quais 7 são missense. O presente trabalho dedica-se ao estudo funcional e estrutural dessas 7 mutações e da deleção ΔF173. Construções dos mutantes D65V, L110P, M136T, R67Q, R89Q, I112F e F173G foram obtidas no vetor pET-29a(+) e clonados em E. coli. Os protocolos de expressão e purificação foram estabelecidos, onde as enzimas foram obtidas após uma etapa cromatográfica na coluna CHTTM Hidroxiapatita Cerâmica no grau de pureza necessário. A única exceção foi o mutante I112F que se mostrou insolúvel durante a expressão. Um ensaio cinético acoplado através de kit para detecção de PPi foi padronizado e permitiu a caracterização cinética da hAPRT nativa e de seu mutantes. Os mutantes apresentaram perdas de eficiência de uma ordem de magnitude, com exceção do F173G, cujos valores foram comparáveis aos da hAPRT nativa. Ensaios de cristalização foram realizados para todos os mutantes e resultaram em cristais para os mutantes F173G, R67Q e R89Q. Esses cristais foram coletados na linha de Cristalografia de Macromoléculas 2 no LNLS. Os conjuntos de dados estão sendo analisados e as estruturas estão em fase final de refinamento. / 2,8-DHA Urolithiasis is a disease resulting from an inherited disorder that leads to deficiency of APRT, an enzyme of the PRTases group. So far, 18 mutations were found in patients, 7 of which are missense. This work is dedicated to the functional and structural study of these 7 mutations and the deletion ΔF173. Mutants constructions D65V, L110P, M136T, R67Q, R89Q, I112F and F173G were obtained in the vector pET-29a (+) and cloned in E. coli. The expression and purification protocols were established and the enzymes were obtained after 1 chromatographic step using the CHTTM Hydroxyapatite Ceramics column in the required purity. The only exception was the mutant I112F that resulted insoluble during expression. A coupled kinetic assay using PPi detection kit was standardized and allowed the kinetic characterization of native hAPRT and its mutants. The mutants had an efficiency loss of an order of magnitude, with the exception of F173G, whose values were comparable to those of native hAPRT. Crystallization trials were performed for all mutants and resulted in crystals for mutants F173G, R67Q and R89Q. These crystals were collected on Macromolecules Crystallography 2 line at LNLS. The datasets are being analyzed and the structures are in the final stages of refinement.
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Avaliação metabólica em litíase urinária: papel do magnésio e sódio urinários como fatores de risco na litogênese

Amaro, Carmen Regina Petean Ruiz [UNESP] January 2003 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:31:06Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2003Bitstream added on 2014-06-13T20:21:52Z : No. of bitstreams: 1 amaro_crpr_dr_botfm.pdf: 783512 bytes, checksum: 77090e654f0b39da729c3d6aea6d8c92 (MD5) / A urolitíase é a terceira causa de afecção do trato urinário, com recorrência em torno de 50% em 5 anos após o primeiro cálculo. Afeta de 1 a 20% da população mundial, estando envolvidos fatores genéticos, epidemiológicos, diferenças geográficas, hábitos alimentares e, menos comumente, distúrbios hormonais. As investigações metabólicas têm grande importância na prevenção desta patologia. Os objetivos deste trabalho foram: diagnosticar os distúrbios metabólicos de pacientes litiásicos do Serviço de Litotripsia do Departamento de Urologia do Hospital das Clínicas da Faculdade Medicina de Botucatu-UNESP, estudar o sódio e o magnésio urinários como fatores de risco e conhecer aspectos epidemiológicos dessa população. PACIENTES E MÉTODOS: Foram estudados 158 pacientes com idade superior a 12 anos, no período de Fevereiro de 2000 a Dezembro de 2001. Foram incluidos pacientes com história e exames por imagem comprobatórios de no mínimo 2 cálculos, clearance de creatinina ≥ 60 ml/min e urocultura negativa. O protocolo consistiu da coleta não simultânea de 2 amostras de urina de 24h, para dosagens de Ca, P, AcU, Na, K, , Mg, Ox e Ci e dosagens séricas de glicemia, Ca, P, FA, AcU, Na, K, Cl, Mg, U, Cr; Realização do índice Ca/Cr urinários; índice Ca/Mg em urina 24h; índice de recorrência; pH urinário; prova de acidificação urinária. RESULTADOS: Os resultados obtidos foram: dos 158 pacientes estudados, 151 apresentaram pelo menos uma alteração metabólica. Destes,94(62,2%) apresentaram alteração metabólica isolada e 57(37,8%) alterações mistas. Os principais distúrbios encontrados foram: hipercalciúria(74,0%), hipocitratúria(37,3%), hiperoxalúria(24,1%), litíase úrica(20,2%), hiperparatireoidismo 1ario(1,8%) 2 ario (0,6%) e ATR(0,6%). A hipernatriúria esteve presente em 50% dos pacientes e a hipomagnesúria... / Urolithiasis is the third cause of urinary tract disease, with about 50% reoccurrence within five years of the first calculus. It affects between 1 and 20% of the world’s population, involving genetic and epidemiological factors, such as race; geographic differences; eating habits; and less commonly hormone disorders. Metabolic investigations are very important in preventing this pathology. The objectives of this work were to diagnose metabolic disorders in lithiasic patients from the Lithotripsy Service, Urology Department HC, FMB-UNESP, study sodium and magnesium as risk factors, and look at epidemiological aspects of this population. PATIENTS AND METHODS: We studied 158 patients all over 12 years old between February 2000 and December 2001. Patients were included with history and image exam confirmation of a minimum of 2 calculi, creatinine clearance ≥ 60 ml/min, and negative uroculture. The protocol consisted of non-simultaneous collect of two 24 hour urine samples for Ca, P, AcU, Na, K, Mg, Ox, and Ci levels, and serum levels of glycemia, Ca, P, FA, AcU, Na, K, Cl, Mg, U, and Cr; calculation of urine Ca/Cr index; 24h urine Ca/Mg index; recurrence index; urine pH; and urine acidity test. RESULTS: From the 158 patients studied, 151 presented at least one metabolic alteration; of these 94 were isolated alterations and 57 mixed. The main disorders were: hypercalciuria (74.0%); hypocitraturia (37.3%); hyperoxaluria (24.1%); uric acid lithiasis (20.2%); primary hyperparathyroidism (1.8%), secondary (0.6%); and ATR (0.6%). Hypernatriuria was present in 59% of patients and hypomagnesuria in 20.9%. Consumed water and urine volume did not show as risk factors. Hypernatriuria showed significant positive correlation in the male group only. There was no significant correlation between hypomagnesuria and...(Complete abstract click electronic address below)
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Estudos estruturais e correlação com a síndrome urolitíase de mutantes da adenina fosforribosiltransferase humana / Structural studies and correlation with urolithiasis syndrome of mutants from human adenine phosphoribosyltransferase

Alécio Antonio Pimenta Junior 19 April 2011 (has links)
A 2,8-DHA Urolitíase é uma doença resultante de uma desordem hereditária que leva a deficiência de atividade da enzima APRT do grupo das PRTases. Até o momento, foram encontradas 18 mutações em pacientes, das quais 7 são missense. O presente trabalho dedica-se ao estudo funcional e estrutural dessas 7 mutações e da deleção ΔF173. Construções dos mutantes D65V, L110P, M136T, R67Q, R89Q, I112F e F173G foram obtidas no vetor pET-29a(+) e clonados em E. coli. Os protocolos de expressão e purificação foram estabelecidos, onde as enzimas foram obtidas após uma etapa cromatográfica na coluna CHTTM Hidroxiapatita Cerâmica no grau de pureza necessário. A única exceção foi o mutante I112F que se mostrou insolúvel durante a expressão. Um ensaio cinético acoplado através de kit para detecção de PPi foi padronizado e permitiu a caracterização cinética da hAPRT nativa e de seu mutantes. Os mutantes apresentaram perdas de eficiência de uma ordem de magnitude, com exceção do F173G, cujos valores foram comparáveis aos da hAPRT nativa. Ensaios de cristalização foram realizados para todos os mutantes e resultaram em cristais para os mutantes F173G, R67Q e R89Q. Esses cristais foram coletados na linha de Cristalografia de Macromoléculas 2 no LNLS. Os conjuntos de dados estão sendo analisados e as estruturas estão em fase final de refinamento. / 2,8-DHA Urolithiasis is a disease resulting from an inherited disorder that leads to deficiency of APRT, an enzyme of the PRTases group. So far, 18 mutations were found in patients, 7 of which are missense. This work is dedicated to the functional and structural study of these 7 mutations and the deletion ΔF173. Mutants constructions D65V, L110P, M136T, R67Q, R89Q, I112F and F173G were obtained in the vector pET-29a (+) and cloned in E. coli. The expression and purification protocols were established and the enzymes were obtained after 1 chromatographic step using the CHTTM Hydroxyapatite Ceramics column in the required purity. The only exception was the mutant I112F that resulted insoluble during expression. A coupled kinetic assay using PPi detection kit was standardized and allowed the kinetic characterization of native hAPRT and its mutants. The mutants had an efficiency loss of an order of magnitude, with the exception of F173G, whose values were comparable to those of native hAPRT. Crystallization trials were performed for all mutants and resulted in crystals for mutants F173G, R67Q and R89Q. These crystals were collected on Macromolecules Crystallography 2 line at LNLS. The datasets are being analyzed and the structures are in the final stages of refinement.
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Avaliação de cálculos urinários em per-operatórios por imagem digital e técnicas físico-químicas e analíticas

Branco, Carlos Henrique Diniz [UNESP] 09 1900 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:28:35Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2005-09Bitstream added on 2014-06-13T19:16:40Z : No. of bitstreams: 1 branco_chd_me_guara.pdf: 5758800 bytes, checksum: 68289304af9cb655a48382242a0d310c (MD5) / Universidade Estadual Paulista (UNESP) / O presente trabalho propõe criar uma sistema de identificação de elementos constituintes de cálculos urinários e que seja viável sua utilização durante os procedimentos cirúrgicos. Até o presente temos equipamento importados de elevado custo para a visualização endoscópica. Com nosso modelo pretendemos disponibilizar para urologistas um equipamento com configuração mínima, de baixo custo com a possibilidade de dar durante os procedimento cirúrgicos a identificação por imagem dos elementos formadores dos cálculos urinários. Para desenvolvimento do estudocoletamos amostras de cálculos urinários obtidas de pacientes que os haviam eliminado e as fotografamos utilizando-nos de um ureteroscópio, uma câmera digital de vþdeo cirurgia de um PC Pentium 133 equipado com uma placa de vídeocaptura. As fotografia foram processadas pelo programa de domínio público Image J, sendo criados histograms e, posteriorment, comparados estes histograms entre si e com os histogramas obtidos a partir de amostras preparadas em laboratório, exportando o banco de dados gerado pelo Image J para o programa Excel da Microsoft. Concomitantemente solicitamos análise cristalográfica destes cálculos para estudo de suas composições em laboratório especializado. Solicitamos, também que fossem criados artificialmente, em laboratório, cálculos puros de oxalato de cálcio para que também fossem analisados pelo método proposto. Com as medidas anteriores acreditamos que possamos correlacionar a imagem com a análise cristalográfica dos cálculos urinários através do estudo de histograms o que, sem dúvida, nos permitirá desenvolver melhores equipamentos para litotripsia. / The present work intends to create and identification system of constituent elements of urinary calculi and it's vialibility during the surgical procedures. Al this time we use imported high cost equipment for endoscopic visualization. Our model intendeds to make available for urologists and equipment with minimum configuration, low cost and the possibility to identificate through images during the surgical procedures constituent elments of the urinary calculi. In order to develop the study we captured urinary samples of urinary calculi in conventional open surgeries and photographed them using ureteroscope, a digital camera of video surgery and a PC Pentium 133 equipped with a video capture device. The pictures were processed by the program of public domain Imae J, that creaes histograms and, lately, make a comparison amog themselves and with the laboratory made calculi, exporting the database generated by Image J for the program Excel of Microsoft. Concomitantly we requested a crystallographic analysis of these urinary calculi for study of their compositions in a specialized laboratory. We requested, also that a pure calculi of calcium oxalate were created artificially so they were also analyzed by the proposed method. With these previous measures we believed that we can correlate the image with the crystallographic analysis of the urinary calculi through the study of histograms and, without a dobt, we will develop better equipments for litotripsy.
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Avaliação metabólica de homens idosos portadores de litíase urinária / Metabolic assessment of aging men with urolithiasis

Freitas Júnior, Celso Heitor de 09 December 2011 (has links)
OBJETIVOS: O aumento da expectativa de vida tem gerado um envelhecimento populacional global, fazendo com que a proporção de indivíduos com mais de 60 anos de idade cresça mais rapidamente do que as demais faixas etárias. A incidência de litíase urinária em indivíduos idosos tem aumentado nos últimos anos, principalmente em nações industrializadas. Aspectos particulares do envelhecimento orgânico aumentam a morbidade associada à litíase urinária em idosos, tornando a prevenção e o tratamento clínico ainda mais relevantes nessa faixa etária. Nosso objetivo é analisar a avaliação metabólica de homens idosos portadores de cálculos renais. MATERIAIS E MÉTODOS: Realizamos um estudo clínico tipo caso-controle. Os critérios de inclusão foram: indivíduos do sexo masculino com mais de 60 anos de idade, com antecedente de cólica renal ou diagnóstico incidental de litíase urinária após os 60 anos (grupo caso); no grupo controle foram incluídos pacientes da mesma faixa etária sem antecedente de cólica renal ou diagnóstico incidental de litíase renal. Todos os participantes foram submetidos à anamnese e aqueles selecionados realizaram perfil metabólico para diagnóstico de litíase urinária: dosagem sérica de cálcio total, cálcio ionizado, ácido úrico, fósforo, glicemia, uréia, creatinina e paratormônio (PTH); coleta de urina para urocultura e pH urinário, e amostras de urina de 24 horas para quantificação do volume e dosagem de cálcio, citrato, creatinina, ácido úrico e sódio. Foram também submetidos à radiografia simples de abdome e ultrassonografia do aparelho urinário. Os indivíduos do grupo caso realizaram dois perfis metabólicos completos de urina de 24 horas, enquanto os do grupo controle somente um perfil. Os resultados foram submetidos à análise estatística. RESULTADOS: Cento e dez indivíduos foram convocados e, após aplicação dos critérios de inclusão, 70 foram selecionados. Cinquenta e um indivíduos concluíram a investigação clínica, sendo 25 no grupo caso e 26 no controle. Cinquenta e seis por cento dos pacientes do grupo caso apresentaram hipocitratúria comparados a 15,4% do grupo controle (p=0,002). A determinação de sódio em urina de 24 horas também apresentou diferença estatisticamente significativa entre casos e controles: 64% versus 30,8%, respectivamente (p=0,017). Estes resultados foram submetidos à análise de regressão logística univariada e múltipla, respectivamente, e mantiveram seus níveis de significância. CONCLUSÃO: A hipocitratúria e a hipernatriúria são os principais distúrbios metabólicos apresentados por indivíduos idosos do sexo masculino portadores de cálculo urinário / PURPOSES: Rise in life expectancy has caused a global populational ageing and people older than 60-years have increased more than any other age group. The incidence of urinary lithiasis in aging people has increased during the last years, mainly in developed nations. Some aspects concerning organic ageing increase morbidity related to urolithiasis in older individuals making prevention and medical management of urinary stones relevant in this age group. Our objective is to evaluate metabolic parameters in men older than 60 years with urinary stones. MATERIALS AND METHODS: A case-control study was performed. Inclusion criteria were: men older than 60- years old with renal pain episodes or incidental diagnosis of urinary lithiasis beginning after 60-years old (case arm). Control group was constituted by patients older than 60 years without renal colic past or diagnosis of urolithiasis. Patients were recruited from a database from the Urologic Clinic at University of São Paulo Medical School Hospital. Each individual was submitted to anamnesis and those selected underwent a metabolic evaluation for urinary stones: serum dosages of total and ionized calcium, uric acid, phosphorus, glucose, urea, creatinine and parathyroid hormone (PTH); urine culture and urinary pH. Twenty four hour urine samples were obtained for volume quantification and for calcium, citrate, creatinine, uric acid and sodium dosages. An abdominal x-ray and ultrasonography were performed in all patients. Case arm patients underwent two complete metabolic urinary investigations while control arm individuals to only one. All results were submitted to statistical analysis. RESULTS: One hundred and ten individuals were called up for initial evaluation and 70 were selected. Fifty-one individuals concluded the whole clinical investigation: 25 in the case arm and 26 in the control arm. Hypocitraturia was present in 56% of case arm patients and 15,4% of the control arm patients (p=0,002). Hypernatriuria in 24-hour urine samples was found in 64% of case arm patients and in 30,8% of control arm patients (p=0,017). These results were submitted to univariate and multiple logistic regressions and maintained their levels of significancy. CONCLUSION: Hypocitraturia and hypernatriuria are the main metabolic disorders among aging men with urolithiasis
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Avaliação metabólica de homens idosos portadores de litíase urinária / Metabolic assessment of aging men with urolithiasis

Celso Heitor de Freitas Júnior 09 December 2011 (has links)
OBJETIVOS: O aumento da expectativa de vida tem gerado um envelhecimento populacional global, fazendo com que a proporção de indivíduos com mais de 60 anos de idade cresça mais rapidamente do que as demais faixas etárias. A incidência de litíase urinária em indivíduos idosos tem aumentado nos últimos anos, principalmente em nações industrializadas. Aspectos particulares do envelhecimento orgânico aumentam a morbidade associada à litíase urinária em idosos, tornando a prevenção e o tratamento clínico ainda mais relevantes nessa faixa etária. Nosso objetivo é analisar a avaliação metabólica de homens idosos portadores de cálculos renais. MATERIAIS E MÉTODOS: Realizamos um estudo clínico tipo caso-controle. Os critérios de inclusão foram: indivíduos do sexo masculino com mais de 60 anos de idade, com antecedente de cólica renal ou diagnóstico incidental de litíase urinária após os 60 anos (grupo caso); no grupo controle foram incluídos pacientes da mesma faixa etária sem antecedente de cólica renal ou diagnóstico incidental de litíase renal. Todos os participantes foram submetidos à anamnese e aqueles selecionados realizaram perfil metabólico para diagnóstico de litíase urinária: dosagem sérica de cálcio total, cálcio ionizado, ácido úrico, fósforo, glicemia, uréia, creatinina e paratormônio (PTH); coleta de urina para urocultura e pH urinário, e amostras de urina de 24 horas para quantificação do volume e dosagem de cálcio, citrato, creatinina, ácido úrico e sódio. Foram também submetidos à radiografia simples de abdome e ultrassonografia do aparelho urinário. Os indivíduos do grupo caso realizaram dois perfis metabólicos completos de urina de 24 horas, enquanto os do grupo controle somente um perfil. Os resultados foram submetidos à análise estatística. RESULTADOS: Cento e dez indivíduos foram convocados e, após aplicação dos critérios de inclusão, 70 foram selecionados. Cinquenta e um indivíduos concluíram a investigação clínica, sendo 25 no grupo caso e 26 no controle. Cinquenta e seis por cento dos pacientes do grupo caso apresentaram hipocitratúria comparados a 15,4% do grupo controle (p=0,002). A determinação de sódio em urina de 24 horas também apresentou diferença estatisticamente significativa entre casos e controles: 64% versus 30,8%, respectivamente (p=0,017). Estes resultados foram submetidos à análise de regressão logística univariada e múltipla, respectivamente, e mantiveram seus níveis de significância. CONCLUSÃO: A hipocitratúria e a hipernatriúria são os principais distúrbios metabólicos apresentados por indivíduos idosos do sexo masculino portadores de cálculo urinário / PURPOSES: Rise in life expectancy has caused a global populational ageing and people older than 60-years have increased more than any other age group. The incidence of urinary lithiasis in aging people has increased during the last years, mainly in developed nations. Some aspects concerning organic ageing increase morbidity related to urolithiasis in older individuals making prevention and medical management of urinary stones relevant in this age group. Our objective is to evaluate metabolic parameters in men older than 60 years with urinary stones. MATERIALS AND METHODS: A case-control study was performed. Inclusion criteria were: men older than 60- years old with renal pain episodes or incidental diagnosis of urinary lithiasis beginning after 60-years old (case arm). Control group was constituted by patients older than 60 years without renal colic past or diagnosis of urolithiasis. Patients were recruited from a database from the Urologic Clinic at University of São Paulo Medical School Hospital. Each individual was submitted to anamnesis and those selected underwent a metabolic evaluation for urinary stones: serum dosages of total and ionized calcium, uric acid, phosphorus, glucose, urea, creatinine and parathyroid hormone (PTH); urine culture and urinary pH. Twenty four hour urine samples were obtained for volume quantification and for calcium, citrate, creatinine, uric acid and sodium dosages. An abdominal x-ray and ultrasonography were performed in all patients. Case arm patients underwent two complete metabolic urinary investigations while control arm individuals to only one. All results were submitted to statistical analysis. RESULTS: One hundred and ten individuals were called up for initial evaluation and 70 were selected. Fifty-one individuals concluded the whole clinical investigation: 25 in the case arm and 26 in the control arm. Hypocitraturia was present in 56% of case arm patients and 15,4% of the control arm patients (p=0,002). Hypernatriuria in 24-hour urine samples was found in 64% of case arm patients and in 30,8% of control arm patients (p=0,017). These results were submitted to univariate and multiple logistic regressions and maintained their levels of significancy. CONCLUSION: Hypocitraturia and hypernatriuria are the main metabolic disorders among aging men with urolithiasis
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Caracterização de cálculos urinários humanos inteiros de rim e bexiga usando difração de raios X e microtomografia computadorizada / Characterization of human urinary calculi from bladder and kidney by X Ray diffraction and microtomography

Marcos Vinicius Colaço Gonçalves 13 October 2014 (has links)
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / A urolitíase é um problema de escala mundial, que ocorre em todas as regiões, culturas e grupos raciais. A incidência desta doença vem aumentando ao redor do mundo e dados mostram que no Brasil estima-se que são afetados 5% da população com uma taxa de recorrência de 2,5%. Conhecer a composição mineral e estrutura interna dos cálculos é um passo importante para tentar entender melhor a fisiopatologia desta doença. Quatro cálculos urinários infecciosos, íntegros de grande volume (diâmetro maior que 20 mm), sendo dois provenientes da bexiga e dois de rins, obtidos cirurgicamente no setor de urologia do Hospital Universitário Pedro Ernesto (HUPE/UERJ) foram analisados usando microtomografia (μCT) e difração de raios X por policristais (DRXP). As imagens microtomográficas foram obtidas usando tubo de raios X microfoco na estação TomoLab e radiação síncrotron (SR-μCT) na linha de Física Médica, ambos no Laboratório Síncrotron Elettra, Trieste, Itália. As medidas de DRXP foram realizadas na linha de Difração de Raios X do Laboratório Nacional de luz Síncrotron, Campinas, Brasil. Para os cálculos de bexiga foram encontradas quatro fases cristalinas: estruvita (STV), oxalato mono (COM) e dihidratado (COD) e hidroxiapatita (HAp). Nos cálculos renais foram encontrados STV e HAp, sendo predominante a primeira fase cristalina. A quantidade de material amorfo (não-cristalino) foi maior que 60% da composição das amostras. A técnica convencional utilizada foi eficaz para análise dos cálculos urinários inteiros e possibilitou a visualização de estruturas internas sem interferência de procedimentos prévios de preparação da amostra. As análises de DRXP com fonte síncrotron aliadas ao método Rietveld foram determinantes para identificação e quantificação dos minerais presentes nas varias camadas das amostras. Pode-se constatar a complementaridade entre a μCT e a DRXP para caracterização microestrutural e mineralógica de cálculos urinários humanos. / Urolithiasis is a worldwide problem that afflicts all regions, cultures and ethnics groups. The incidence is increasing around the world and related data about Brazil estimate that affect 5% population with 2.5% recurrence rate. Knowledge of the quantitative mineralogy of urinary calculi is of fundamental importance for optimization of nephrolithiasis therapy and to prevent potential risk of recurrence. The urinary stones used in the present study were made available to us via normal surgery from patients admitted to the Hospital Universitário Pedro Ernesto (HUPE/UERJ). Structural and microstructural characterizations of four urinary calculi samples (RJ100, RJ101, RJ102 e RJ104) were determined by means of X-ray microtomography and powder diffraction. Conventional (μCT) and synchrotron radiation microtomography (SR-μCT) experiments were performed at the TOMOLAB station and SYRMEP (SYnchrotron Radiation on MEdical Physics) beamline, both at the Elettra Synchrotron Light Laboratory in Trieste (Italy), respectively. Synchrotron X-ray powder diffraction (XRPD) data were collected at the X-ray powder diffraction beamline of the National Synchrotron Light Laboratory (LNLS) in Campinas, Brazil. For the bladder stones, RJ100 and RJ104, the identified phases were struvite (STV), calcium oxalate monohydrate (COM) and dihydrate (COD) and calcium hydroxyapatite (HAp). The kidney stones RJ101 and RJ102 can be considered pure struvite stones. Moreover, the Rietveld refinement indicates the presence of more than 60 wt% of amorphous phase of all samples. The use of μCT scanning technology not only improves knowledge of internal structures of intact urinary calculi, but also allowed us to investigate efficiently specimens that run a particular risk of deformation or destruction from conventional preparation. Synchrotron X-ray powder profile-fitting structure refinement using the Rietveld method has proved to be a powerful tool in identifying and estimating the quantitative crystalline phase abundances present in the samples. This work demonstrated the capabilities of a combination ofμCT and XRP analyses for structural and microstructural characterizations of human urinary calculi samples. Moreover, the XRD data demonstrate that STV is the major constituent phase in all samples, which seems to be a tendency in Rio de Janeiro population. Clearly, there is a need for more studies on stone disease from Rio de Janeiro in order to isolate the fundamental reasons for the observed features of the kidney stones distribution.
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Caracterização de cálculos urinários humanos inteiros de rim e bexiga usando difração de raios X e microtomografia computadorizada / Characterization of human urinary calculi from bladder and kidney by X Ray diffraction and microtomography

Marcos Vinicius Colaço Gonçalves 13 October 2014 (has links)
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / A urolitíase é um problema de escala mundial, que ocorre em todas as regiões, culturas e grupos raciais. A incidência desta doença vem aumentando ao redor do mundo e dados mostram que no Brasil estima-se que são afetados 5% da população com uma taxa de recorrência de 2,5%. Conhecer a composição mineral e estrutura interna dos cálculos é um passo importante para tentar entender melhor a fisiopatologia desta doença. Quatro cálculos urinários infecciosos, íntegros de grande volume (diâmetro maior que 20 mm), sendo dois provenientes da bexiga e dois de rins, obtidos cirurgicamente no setor de urologia do Hospital Universitário Pedro Ernesto (HUPE/UERJ) foram analisados usando microtomografia (μCT) e difração de raios X por policristais (DRXP). As imagens microtomográficas foram obtidas usando tubo de raios X microfoco na estação TomoLab e radiação síncrotron (SR-μCT) na linha de Física Médica, ambos no Laboratório Síncrotron Elettra, Trieste, Itália. As medidas de DRXP foram realizadas na linha de Difração de Raios X do Laboratório Nacional de luz Síncrotron, Campinas, Brasil. Para os cálculos de bexiga foram encontradas quatro fases cristalinas: estruvita (STV), oxalato mono (COM) e dihidratado (COD) e hidroxiapatita (HAp). Nos cálculos renais foram encontrados STV e HAp, sendo predominante a primeira fase cristalina. A quantidade de material amorfo (não-cristalino) foi maior que 60% da composição das amostras. A técnica convencional utilizada foi eficaz para análise dos cálculos urinários inteiros e possibilitou a visualização de estruturas internas sem interferência de procedimentos prévios de preparação da amostra. As análises de DRXP com fonte síncrotron aliadas ao método Rietveld foram determinantes para identificação e quantificação dos minerais presentes nas varias camadas das amostras. Pode-se constatar a complementaridade entre a μCT e a DRXP para caracterização microestrutural e mineralógica de cálculos urinários humanos. / Urolithiasis is a worldwide problem that afflicts all regions, cultures and ethnics groups. The incidence is increasing around the world and related data about Brazil estimate that affect 5% population with 2.5% recurrence rate. Knowledge of the quantitative mineralogy of urinary calculi is of fundamental importance for optimization of nephrolithiasis therapy and to prevent potential risk of recurrence. The urinary stones used in the present study were made available to us via normal surgery from patients admitted to the Hospital Universitário Pedro Ernesto (HUPE/UERJ). Structural and microstructural characterizations of four urinary calculi samples (RJ100, RJ101, RJ102 e RJ104) were determined by means of X-ray microtomography and powder diffraction. Conventional (μCT) and synchrotron radiation microtomography (SR-μCT) experiments were performed at the TOMOLAB station and SYRMEP (SYnchrotron Radiation on MEdical Physics) beamline, both at the Elettra Synchrotron Light Laboratory in Trieste (Italy), respectively. Synchrotron X-ray powder diffraction (XRPD) data were collected at the X-ray powder diffraction beamline of the National Synchrotron Light Laboratory (LNLS) in Campinas, Brazil. For the bladder stones, RJ100 and RJ104, the identified phases were struvite (STV), calcium oxalate monohydrate (COM) and dihydrate (COD) and calcium hydroxyapatite (HAp). The kidney stones RJ101 and RJ102 can be considered pure struvite stones. Moreover, the Rietveld refinement indicates the presence of more than 60 wt% of amorphous phase of all samples. The use of μCT scanning technology not only improves knowledge of internal structures of intact urinary calculi, but also allowed us to investigate efficiently specimens that run a particular risk of deformation or destruction from conventional preparation. Synchrotron X-ray powder profile-fitting structure refinement using the Rietveld method has proved to be a powerful tool in identifying and estimating the quantitative crystalline phase abundances present in the samples. This work demonstrated the capabilities of a combination ofμCT and XRP analyses for structural and microstructural characterizations of human urinary calculi samples. Moreover, the XRD data demonstrate that STV is the major constituent phase in all samples, which seems to be a tendency in Rio de Janeiro population. Clearly, there is a need for more studies on stone disease from Rio de Janeiro in order to isolate the fundamental reasons for the observed features of the kidney stones distribution.
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Avaliação dos efeitos da vitamina c em ovinos submetidos à dieta calculogênica / Evaluation of the effects of vitamin c in sheep submitted to calculogenic diet

MACIEL, Thiago Arcoverde 27 February 2015 (has links)
Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2017-04-26T12:32:52Z No. of bitstreams: 1 Thiago Arcoverde Maciel.pdf: 2765936 bytes, checksum: b2a040b8c8b92a2259f8f141af305868 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-26T12:32:52Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Thiago Arcoverde Maciel.pdf: 2765936 bytes, checksum: b2a040b8c8b92a2259f8f141af305868 (MD5) Previous issue date: 2015-02-27 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Urolithiasis is a metabolic disease of complex and multifactorial etiology, characterized by uroliths formation in the urinary system. It becomes clinically important when obstruction occurs, with little chance of reversal, and prevention is the best option for maintaining the integrity of the reproductive capacity. For this, one must know the biochemical profile of animals and fix the possible factors that may be related to the formation of uroliths. Morphometric study in turn, enables the comparative observation and description of changes and can therefore be used as a method of diagnostic. Urinary acidification is cited as an efficient alternative for the prevention, so vitamin C was used. In this study, 20 healthy sheep, male (not neutered), Santa Ines breed, aged approximately 90 days, were divided into three groups (G1 n=7 - calculogenic diet without vitamin C, G2 n=7 - calculogenic diet with vitamin C and G3 n=6 - control). To analyze the biochemical profiles groups 1 and 2 were compared and the morphometric analysis the three groups were compared. Animals were examined weekly, allowing direct observation of clinical signs, such as prostration/restlessness, penile exposure, abdomen kicking, urethral process congestion, among others. Analysis of biochemical profiles of urine and serum revealed hyperproteinemia (8.99g/dL) and proteinuria (43.82g/dL) in 57.14% aciduria (G1) and 71.43% (G2) and the presence of erythrocytes, leukocytes, bacteria and sperm to the urinary sediment. There was an important increase of phosphorus and magnesium e there was a substantial decrease of calcium which was present in 50% of uroliths samples analyzed. At the end of the experimental time animals were slaughtered and necropsy of them was followed by morphometry of the organs of the urinary system. Necrosis of urethral process and bladder with extensive bleeding area were observed during the necropsy procedure. The width of the kidneys and ureters were higher in G2, which may have contributed to lower retention of uroliths on this site. / Urolitíase é uma doença metabólica de etiologia complexa e multifatorial, caracterizada pela formação de urólitos no sistema urinário. Torna-se clinicamente importante quando ocorre obstrução, havendo poucas chances de reversão do quadro, sendo a prevenção a melhor opção para manutenção da capacidade reprodutiva. Para isso, deve-se conhecer o perfil bioquímico dos animais e corrigir os possíveis fatores que estão relacionados à formação dos urólitos. O estudo morfométrico por sua vez, possibilita a observação comparativa e descrição de alterações podendo ser empregado como método de auxílio diagnóstico. A acidificação urinária é citada como alternativa eficiente para a prevenção, por isso a vitamina C foi utilizada. Nesse estudo foram utilizados 20 ovinos hígidos, da raça Santa Inês, machos (não castrados), com idade aproximada de 90 dias, distribuídos em três grupos (G1 n=7 – dieta calculogênica sem vitamina C, G2 n=7 – dieta calculogênica com vitamina C e G3 n=6 – controle). Para análise dos perfis bioquímicos foram confrontados os grupos 1 e 2, e para a morfometria foram comparados os três grupos. Os animais foram examinados semanalmente, permitindo a imediata observação dos sinais clínicos, como prostração/inquietação, exposição peniana, escoiceamento do abdômen, congestão de processo uretral. A bioquímica sérica e urinária revelou hiperproteinemia (8,99g/dL) e proteinúria (4,38g/dL), acidúria em 57,14% (G1) e 71,43% (G2) e presença de hemácias, leucócitos, bactérias e espermatozóides ao exame do sedimento urinário. Houve elevação expressiva do fósforo e do magnésio e diminuição substancial do cálcio que esteve presente em 50% das amostras de urólitos analisadas. Ao término do experimento foi realizado o abate e necropsia dos animais seguindo-se a morfometria dos órgãos do sistema urinário. Necrose de processo uretral e bexiga repleta com extensa área de hemorragia foram observados durante necropsia. Os rins e ureteres apresentaram valores morfométricos distintos entre os grupos, sendo maiores no G2, o que pode ter contribuído para uma menor retenção de cálculos neste local.
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Composição de urólitos vesicais de cães determinada por espectroscopia de energia dispersiva (EDS) e análise química / Dog bladder uroliths composition determined by energy dispersive spectroscopy (EDS) and chemical analysis

Ariza , Paula Costa 04 November 2014 (has links)
Submitted by Cláudia Bueno (claudiamoura18@gmail.com) on 2015-10-15T20:57:59Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Paula Costa Ariza - 2014.pdf: 2597495 bytes, checksum: e1ee58eb0f7e1510104c7b8960099df6 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2015-10-16T11:12:05Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Paula Costa Ariza - 2014.pdf: 2597495 bytes, checksum: e1ee58eb0f7e1510104c7b8960099df6 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-10-16T11:12:05Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Paula Costa Ariza - 2014.pdf: 2597495 bytes, checksum: e1ee58eb0f7e1510104c7b8960099df6 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2014-11-04 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Urolithiasis is frequently and recurrently observerd on dogs.. Uroliths are crystalline concretions that form in the lumen of the urinary tract due to urine oversaturation by minerals. They may lead to serious consequences, such as obstruction of the urinary flow. An efficient treatment depends on the compositional analysis of the uroliths This study aimed to evaluate the composition of dog’s urinary calculi in the city of Goiânia, by using chemical analysis and energy dispersive spectroscopy – EDS. Comparisons between the composition found and individual and clinical characteristics of the patients were made, as well as comparisons between both techniques. Analysis were held on 55 surgical removed uroliths fom the bladder of dogs. Struvite was present in 51 of the uroliths (15 isolatedly), calcium phosphate in 32 (always associated to struvite), calcium oxalate in five (two isolatedly), urate in five (two isolatedly) and silica was present in four (none of the uroliths was composed only by silica). The most common combination of compounds was that of struvite and calcium phosphate. EDS permitted both the evaluation of the different regions of the uroliths and the microscopical observation of the sample structure, but didn’t allow the correct identification of the urate. The association between both techniques was efficient on evaluating the calculi composition. / A urolitíase acomete frequentemente e de maneira recorrente os cães. Os urólitos são concreções cristalinas que se formam no lúmen do trato urinário devido à supersaturação da urina por minerais. Podem levar a graves consequências, como a obstrução do fluxo urinário. O tratamento eficaz depende da análise adequada da composição dos urólitos presentes. Com o presente estudo objetivou-se avaliar a composição de cálculos urinários de cães atendidos no Município de Goiânia, fazendo uso de análise química por meio o uso de reagentes comerciais e da espectroscopia de energia dispersiva – EDS, de modo a estabelecer a relação entre a composição dos urólitos e características individuais e clínicas dos animais, bem como a comparação entre ambas as técnicas. Foram analisados 55 urólitos cirurgicamente removidos da vesícula urinária de cães. Dos cálculos analisados, 51 apresentaram estruvita (15 de maneira isolada), 32 fosfato de cálcio (todos associados à estruvita), cinco oxalato de cálcio (dois apenas com esse mineral), cinco urato (dois apenas com esse mineral) e quatro sílica (nenhum apresentava sílica isoladamente em sua composição). A combinação mais comum foi a de estruvita com fosfato de cálcio. O EDS permitiu a avaliação da composição das diferentes regiões dos cálculos de maneira independente, bem como a análise microscópica da estrutura do mesmo, mas não possibilitou a identificação específica do urato. Desse modo a sua associação à técnica química a torna uma técnica eficiente para a análise dos urólitos.

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