Made available in DSpace on 2015-07-08T12:28:17Z (GMT). No. of bitstreams: 2 24.pdf: 3860047 bytes, checksum: f2f39055c3f43680d80b51fdb2b7cf36 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2012 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde / Microrganismos estão presentes em grande escala no ambiente domiciliar e público. Diversos relatos na literatura já demonstraram a existência de bactérias em várias superfícies em domicílios, como pias, geladeiras, toalhas e outros objetos, e em locais de livre circulação, como aeroportos, academias de ginástica, ônibus e banheiros públicos. Com a crescente atenção voltada para a contaminação e risco de infecções causadas por alimentos e produtos manufaturados contaminados, houve um aumento do uso de desinfetantes pelo público em geral, levando a maior comercialização e circulação desses produtos. No Brasil, com a criação do Mercosul, a presença de desinfetantes provenientes de outros países se acentuou, havendo a necessidade de harmonização das normas técnicas. Por essa razão, a legislação brasileira foi alterada em 2007, com a publicação da RDC nº 14, de 28 de fevereiro de 2007, que estabeleceu que para avaliação da qualidade dos produtos desinfetantes poderiam ser aceitas as metodologias preconizadas pela Association of Official Analytical Chemists (AOAC) ou pelo Comitê Europeu de Normalização (CEN). Dessa forma, surgiu a necessidade do Brasil se preparar para essa mudança na legislação, implantando as metodologias preconizadas pelo CEN. Assim, visando a preparação do único laboratório federal oficial do Brasil, o Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde, esse trabalho teve como objetivo principal implantar as metodologias baseadas nas normas do CEN para a avaliação da atividade antibacteriana de desinfetantes de uso institucional. Foi avaliado também o comportamento de bactérias isoladas do ambiente domiciliar através da aplicação em paralelo dos métodos da AOAC e do CEN. Os resultados obtidos permitiram a padronização da fase 1 e da fase 2, etapa 1 da metodologia preconizada pelo CEN, assim como os passos iniciais da fase 2, etapa 2. / Microorganisms are widely distributed in households and public environments. Several reports in the literature have just demonstrated the existence of bacteria in many households surfaces, as sinks, refrigerators, towels and other objects, and in free circulation places, as airports, gyms, buses and public bathrooms. Greater attention on contamination and infection risk caused by contaminated food and manufactured products led to increasing use of disinfectants by general population and, consequently, more commercialization and circulation of these products. In Brazil, with the foundation of “Mercosul”, the presence of disinfectants from other countries increased, leading to the necessity of technical standards harmonization. For this reason, Brazilian legislation changed in 2007 with the publication of RDC nº 14, from February 28, 2007, which established that the methodologies recommended by Association of Official Analytical Chemists (AOAC) or European Committee of Normalization (CEN) could be accepted for the quality evaluation of disinfectants. Therefore, Brazil needs to be prepared for this law change, implementing CEN methodologies. So, in order to prepare the only official federal laboratory in Brazil, “Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde”, this study aimed to implement the CEN methods for antimicrobial activity evaluation of institutional use disinfectants. It was also evaluated the behavior of environment bacteria isolated from households, through application of both AOAC and CEN methods in parallel. The results obtained allowed the standardization of phase 1 and phase 2 step 1, as well as the first steps of phase 2 step 2. It was also observed that ethyl alcohol 70% and product A, based on ammonium quaternary compounds, were considered satisfactory against all microorganisms tested (reference ones and households isolates) in both methods, while product B was not able to eliminate S. aureus by Use-Dilution method. During the study, it was found disinfectant products ready for sale presenting microbial contamination. These bacteria were identified and evidenced the presence of products with serious quality deviations in Brazilian market. These data are corroborated with reports in literature. Complementary studies are required for the complete standardization of phase 2, step 2 from CEN methodology, and for the evaluation of disinfectants based on others actives.

Made available in DSpace on 2015-07-08T12:28:18Z (GMT). No. of bitstreams: 2 38.pdf: 779592 bytes, checksum: bb7860a5216579fd5bbccc4e3c3d8a6d (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2012 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde / As hortaliças como a alface (Lactuca sativa) têm sido associadas a diversos surtos de doenças de origem alimentar. Dentre os patógenos envolvidos, os norovírus (NoV) são reconhecidos como os principais agentes etiológicos de gastrenterite, sendo as estirpes do genogrupo II (GII) mais prevalentes. Dessa forma, muito esforço tem sido realizado no desenvolvimento de métodos para detecção desses vírus em hortaliças. Os estudos têm focado na padronização dos métodos e otimização das etapas de extração, concentração e detecção do ácido nucléico viral. O uso de outros vírus como controle interno também tem sido estudado, para identificação de falhas durante a análise e evitar resultados falso-negativos. O presente estudo teve como objetivo investigar a contaminação de NoV GII pelo método de concentração por filtração em membrana negativa seguida de semi-nested PCR e PCR em tempo real e avaliar a qualidade microbiológica (pesquisa de Salmonella e enumeração de coliformes) de 90 amostras de alface (30 in natura, 30 minimamente processadas e 30 de serviços de alimentação) no Estado do Rio de Janeiro.O bacteriófago PP7 foi utilizado como controle interno e uma otimização do método comparando a solução salina fosfatada tamponada (PBS) e o tampão glicina (TG) foi realizada. Nenhuma amostra apresentou contaminação por NoV GII e Salmonella. As amostras in natura apresentaram qualidade microbiológica satisfatória de acordo com a legislação. Uma amostra minimamente processada (3,3%) e seis de serviços de alimentação (20%) apresentaram condições higiênico-sanitárias insatisfatórias devido ao número de coliformes termotolerantes acima do permitido, indicando que os procedimentos de higienização realizados nos serviços de alimentação não foram eficazes para eliminação dos micro-organismos ou que a contaminação pode ocorrer, por parte dos manipuladores. / Green leafy vegetables, as lettuce (Lactuca sativa) have been linked to diverse foodborne outbreaks worldwide. Among several pathogens involved, norovirus (NoV) are recognized as one of the most important etiological agent associated with gastroenteritis, being genotype II (GII) the most prevalent. In this manner, efforts have been made to develop methods to detect these viruses in green leafy vegetables. Researches have focused on standardizing methods and optimize stages of extraction, concentration and detection of viral nucleic acid. The use of others viruses as internal control has also been studied, to identifying possible errors during analysis and avoid false-negatives results. This study aimed to verify the contamination by NoV GII through concentration methodology by negative-membrane filtration followed by detection by semi-nested PCR and quantification by Real Time PCR and microbiological quality evaluation (Salmonella research and enumeration of total and thermo tolerant coliform) of 90 samples of lettuce (30 in natura, 30 minimally processed and 30 from food services) in the state of Rio de Janeiro. Bacteriophage PP7 was utilized as internal control and a method optimization comparing phosphate buffered saline (PBS) and Glycine buffer (GB) was carried out. No sample showed contamination by NoV GII and Salmonella. Samples of in natura lettuce exhibited satisfactory microbiology quality according Brazilian resolution. One minimally processed sample (3.3%) and six (20%) from food service showed unsatisfactory hygienic-sanitary conditions because of the number of thermotolerant coliforms above of allowed, indicating that hygienic proceedings in restaurants were not effective for eliminating those microorganisms or that the contamination may occur by employers. PP7 bacteriophage was detected in 40, 86.7 and 76.7% of in natura, minimally processed and food service, respectively. Using GB increased PP7 bacteriophage recovery (p = 0.029), but did not demonstrate significant difference in NoV GII recovery (p = 0.57), and increased sensitivity of semi nested PCR technique for detecting NoV GII in samples artificially contaminated. This last one exhibited lower sensitivity than Real Time PCR for NoV GII detection. Results point out that GB is an elution buffer more efficient and that PP7 bacteriophage is applicable as an internal control of this method.

Made available in DSpace on 2015-07-08T12:28:19Z (GMT). No. of bitstreams: 2 7.pdf: 817573 bytes, checksum: a128b8a4e1e43d37a95128847a6aba9b (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2013 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde / A expressão da incerteza de medição é uma indicação quantitativa da qualidade de um resultado, demonstrando a precisão que o acompanha e acrescentando mais confiabilidade ao mesmo. Em função da CLAE ser um método amplamente utilizado no controle da qualidade de medicamentos, este projeto teve por objetivo o desenvolvimento de um instrumento metodológico para cálculo de incerteza de medição em resultados analíticos obtidos por tal metodologia. Para o desenvolvimento do projeto foi então escolhido o ensaio analítico farmacopeico para quantificação do teor de ofloxacino, um antimicrobiano usado no tratamento da tuberculose mutirresistente, doença que se apresenta como um grave problema de saúde pública em nível mundial. A elaboração do diagrama de causa e efeito demonstrou ser uma ferramenta essencial no delineamento das fontes que influenciam a incerteza. Por outro lado a elaboração de tabelas, identificando os tipos de incertezas advindas de cada fonte, foi fundamental para permitir a construção das planilhas para cálculo da incerteza padronizada e do grau de liberdade efetivo associados ao resultado, bem como do fator de abrangência e da respectiva incerteza expandida. A demonstração passo a passo da execução dos cálculos foi essencial para a compreensão destes. Com os resultados obtidos foi possível concluir que as principais contribuições para a incerteza padrão combinada do resultado analítico do teor de Ofloxacino foram a incerteza do padrão analítico, a incerteza oriunda da amostragem do lote e as incertezas de massa. O resultado obtido para o lote analisado de LFM-Ofloxacino 400 mg mostrou-se satisfatório em relação ao teor do fármaco, de acordo com a especificação farmacopeica. / The expression of uncertainty in measurement is a quantitative indication of the quality of the result, demonstrating its precision and adding more reliability to itself. In view of HPLC is a method widely used in quality control of medicines, this project aimed to the development of a methodological tool for calculating measurement uncertainty in analytical results obtained by this method. For the development of the project was chosen the analytical essay pharmacopeic to quantify the content of ofloxacin, an antimicrobial used to treat mutirresistent tuberculosis disease that presents itself as a serious worldwide public health problem. The development of the cause and effect diagram shown to be an essential tool in delineating the sources that influence the uncertainty that accompanies the analytical test result. Moreover the preparation of tables, identifying the types of uncertainty arising from each source was essential to allow the construction of spreadsheets to calculate the standard uncertainty and effective degrees of freedom associated with the test result as well as the coverage factor and the respective expanded uncertainty. The demonstration step by step implementation of the calculations was essential for understanding these. With these results we concluded that the main contribution to the combined standard uncertainty of the analytical result of the content of ofloxacin were of reference standard uncertainty, uncertainty arising from sampling and uncertainties batch of dough. The result obtained for the batch analyzed LFM-ofloxacin 400 mg was satisfactory with the contents of the drug, according to pharmacopoeial specification. This study concluded that the calculation of the expanded uncertainty interval provides knowledge about the result which covers an extensive fraction probability distribution, characterized by that result and its combined standard uncertainty, making the results more completely, allowing those who use to assess their reliability and its compliance assessment for decision making to the product analyzed.

Made available in DSpace on 2015-07-08T12:28:20Z (GMT). No. of bitstreams: 2 5.pdf: 1093384 bytes, checksum: 9432b61bcb4cfac37f05a1600b8f2fae (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2013 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde / Haemophilus influenzae pode ser encontrado, normalmente, na microbiota do trato respiratório, do trato gênito-urinário e da cavidade oral. Porém, essa espécie inclui um dos mais importantes patógenos bacterianos em infecções principalmente pediátricas. As cepas de Hi podem ser capsuladas, variando de a-f, ou não capsuladas (não tipáveis - NT). O tipo capsular b foi o mais frequente em infecções graves infantis até a utilização da vacina conjugada contra Hib, sendo ainda considerado patogênico. No Brasil, essa vacina foi introduzida no Programa Nacional de Imunização do Ministério da Saúde em agosto de 1999, e como em outros países, promoveu uma acentuada diminuição em doenças causadas por esse agente. No entanto, estudos realizados na era pós-vacinal têm mostrado que a incidência de doenças invasivas causadas por H. influenzae não b e NT têm aumentado, inclusive no Brasil. O objetivo desse trabalho foi obter informações sobre as cepas de Hi circulantes no município do Rio de Janeiro. Utilizou-se 96 amostras de quadros infeciosos (46 invasivas e 50 não invasivas), isoladas no período pós-vacinal (2000-2012). Em relação à idade, dos 54 pacientes que tiveram esse dado, 32 tiveram doenças invasivas e 22 não invasivas. Em doenças invasivas, houve o predomínio de crianças < 5 anos. Enquanto que nas não invasivas os adultos > 70 anos predominaram. Entre as cepas obtidas, 15 foram capsuladas e 81 não capsuladas. A maioria das cepas capsuladas foi proveniente de sítios invasivos, cuja faixa etária predominante foi de < 5 anos. O tipo capsular mais isolado foi o b, seguido do a e f. As cepas Hib, predominaram no início do período de estudo, enquanto os outros sorotipos predominaram no final. No presente trabalho, não encontramos cepas mutantes deficientes de cápsula tanto Hib-, quanto Hia- / Haemophilus influenzae can be found usually in the microbiota of the respiratory tract, genitourinary tract and oral cavity. However, this species includes one of the most important bacterial pathogens mainly in pediatric infections. The strains can be capsulated Hi, (serotypes a-f), or not capsulated (nontypeable - NT). The type b capsular was the most frequent serious infection in children until the use of conjugate vaccine against Hib and is still considered pathogenic. In Brazil, this vaccine was introduced in the National Immunization Program of the Ministry of Health in August 1999, and as in other countries, promoted a significant decrease of disease caused by this agent. However, studies during the post-vaccine period have shown that the incidence of invasive disease caused by H. influenzae b and NT have increased, including in Brazil. The aim of this study was to obtain information on the Hi strains circulating in the municipality of Rio de Janeiro. We used 96 samples (46 invasive and 50 noninvasive), isolated during the post-vaccination period (2000-2012). Concerning the age of the 54 patients who had this data, 32 had invasive and 22 noninvasive disease. In invasive disease, there was a predominance of children <5 years. While in the noninvasive group, adults > 70 years predominated. Among the strains obtained, 15 were capsulated and 81 non-capsulated. Most capsulated strains originated from invasive sites whose predominant age group was <5 years. The most frequent capsular type was b, followed by a and f. Hib strains predominated at the beginning of the study period, while the other serotypes prevailed in the end. In this study, we did not found mutant strains deficient in both capsule Hib- and Hia-. NT strains accounted for the vast majority of isolates in this study, 32 strains isolated from invasive sites and 49 sites noninvasive, and were obtained from patients of all age groups. The capsulated strains were predominantly biotype I and II, while non-typeable strains were most II and III. In this study, only the NT strains were resistant to two drugs: ampicillin and trimethoprim - sulfamethoxazole. These were mostly non-invasive. Thus, none of the capsulated isolates were resistant. The PFGE patterns for the 96 strains were quite different, however eight NT strains belonged to the same genotype. Capsulated strains of the same serotype were similar, getting most isolates grouped in the same cluster. We therefore conclude that it is necessary to monitor the Hi strains circulating in Rio de Janeiro, because of the geographic and economic importance of this municipality. Such conduct should be extended to the whole country in order to understand the possible changes of serotypes today, which will certainly guide for the design of new vaccines, improvement of existing ones and the use of antibiotics, resulting in a public health impact.

Made available in DSpace on 2015-07-08T12:28:20Z (GMT). No. of bitstreams: 2 14.pdf: 2053160 bytes, checksum: 6a9f2af0a7daaa1f0f06673bc00622fc (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2013 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde / A doença meningocócica (DM) é uma enfermidade aguda, grave, de evolução rápida com taxas de mortalidade de 15 a 20% e que atinge principalmente as faixas etárias mais jovens, considerada um grave problema de saúde pública mesmo em países desenvolvidos. A DM está associada à colonização da nasofaringe de humanos, único hospedeiro, por uma bactéria Gram negativa, Neisseria meningitidis. O método considerado padrão ouro para a tipificação molecular da Neisseria meningitidis é o MLST, que consiste no sequenciamento de 7 genes Housekeeping , o MLST é uma técnica complexa que exige uma demanda de custo e tempo, tornando-se inviável sua implementação em laboratórios públicos que recebem amostras de Nm, uma estratégia que poderá contornar este obstáculo seria a PCR em tempo real que com poucas reações e em poucos dias fornecerá o perfil de MLST de isolados com alta porcentagem de confiabilidade. O objetivo do estudo é detectar os complexos clonais do MLST causadores dos grandes surtos de DM através de sondas específicas pela PCR em Tempo Real Qualitativa. A análise pelo MLST de 98 isolados estudados caracterizou todos os 15 isolados do sorogrupo B como integrantes do complexo clonal ST-32/ET-5 além de outras 11 cepas do sorogrupo C. O ST-103 foi o complexo clonal predominante entre as cepas do sorogrupo C com 43 isolados, outros STs foram encontrados para o sorogrupo C,ST-11 (n=11), ST-41/44 (n=2), ST-8/4A (n=9), ST-35 (n=1), ST-269 (n=1) e outros 5 isolados não foram associados a nenhum complexo clonal. A análise pela PCR em Tempo Real forneceu dados importantes como a caracterização de grande número dos isolados com 100% de certeza e de outros isolados com probabilidade acima de 75%. A PCR em Tempo Real qualitativa mostrou ser uma ferramenta rápida e sensível no auxílio a estudos epidemiológicos para controle de surtos regionais quando há a necessidade de ações rápidas por parte das autoridades de saúde pública. / Meningococcal disease (MD) is an acute illness, severe, rapidly evolving with mortality rates of 15 to 20% and that primarily affects younger age groups, considered a serious public health problem in developed countries. DM is associated with colonization of the nasopharynx of human host by Gram negative bacteria, Neisseria meningitidis (Nm). The method considered the "gold standard" for molecular typing of Neisseria meningitidis is the MLST, which consists in sequencing of 7 genes "Housekeeping", the MLST is a complex technique that requires a time and cost consuming, making it impractical implementation in public laboratories that receive Nm samples, a strategy that could circumvent this obstacle would be the real-time PCR with few reactions in a few days coud provide the MLST profile of isolates with a high percentage of reliability. The objective in this study is to detect the MLST clonal complexes causing major outbreaks of DM through specific probes for Real Time PCR Qualitative method. The analysis by MLST of 98 isolates studied featured all 15 isolates of serogroup B as clonal complex ST-32/ET-5 plus 11 other strains of serogroup C. The ST-103 was the predominant clonal complex among strains of serogroup C isolates with 43. Others STs were found for serogroup C, ST-11 (n=11), ST-41/44 (n=2), ST-8/4A (n=9), ST-35 (n=1), ST-269 (n=1) and other five isolates were not associated with any clonal complex. The analysis by Real Time PCR provided important data such as the characterization of large numbers of isolates with 100% certainty and other isolates with probability above 75%. The Real-Time PCR using the qualitative method proved to be a highly useful tool to aid in rapid and epidemiological studies for outbreak control is necessary when regional rapid actions of public health authorities.

Made available in DSpace on 2015-11-11T12:04:09Z (GMT). No. of bitstreams: 2 5.pdf: 2700838 bytes, checksum: fed06a8a8bafead565b639d1684828a4 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2014 / Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisas Aggeu Magalhães. Recife, PE, Brasil / As lesões e traumas por acidentes de transporte terrestre (ATT), anualmente, causam cerca de 1,2 milhões de mortes e 50 milhões de feridos no mundo. Atualmente, no Brasil, a prevenção das lesões por esses agravos não tem alcançado os impactos necessários, entre outros motivos, por que os sistemas de informações que subsidiam a elaboração de programas para sua prevenção e controle não oferecem dados sobre os casos de lesões. O objetivo do estudo foi construir um modelo conceitual de um sistema de informações para vigilância epidemiológica das lesões e traumas por ATTs. A seleção, classificação e codificação das variáveis do sistema foram realizadas de acordo com o recomendado pela OMS e com base no sistema de informação sobre ATT vigente na Secretaria de Saúde do Estado de Pernambuco. A estratégia para o desenvolvimento do sistema foi um programa em código aberto, em consonância com a Política Nacional de Informações e Informática em Saúde. O Sistema de Informações sobre Acidentes de Transporte Terrestre (SINATT) é um sistema on-line para coleta, apresentação e análise de dados provenientes de serviços de emergência dos hospitais da rede sentinela para vigilância dos ATT, que conta com quatro interfaces: o cadastro de usuários e estabelecimentos de saúde, registro eletrônico de vítimas, relatórios descritivos e download do banco de dados e um canal de comunicação e transferência de arquivos dedicados à vigilância dos acidentes e das lesões. Esta experiência é um exemplo do que pode ser feito para resolver a falta de informação sobre lesões e traumas por ATT, devendo incentivar a implementação de modelos semelhantes em nível nacional para prestar informações confiáveis e oportunas sobre a ocorrência de lesões por esse agravo

Made available in DSpace on 2015-11-11T12:13:56Z (GMT). No. of bitstreams: 2 marcia_castro_ioc_dout_2012.pdf: 21978043 bytes, checksum: e9eba4cae64a400b5fd4d642dfb66bf2 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2015-05-21 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / O dengue tem se apresentado como um grave problema de saúde pública no Brasil, razão pela qual, vários estudos têm sido realizados com o intuito de esclarecer aspectos da epidemiologia dessa doença em diferentes localidades, com histórias distintas de circulação dos diferentes sorotipos dos vírus dengue (DENV). A implantação de um Programa de vigilância entomológica e virológica e, que desde 1986 visa detectar e monitorar a circulação dos sorotipos e genótipos DENV, resultou em distintas oportunidades, no isolamento de amostras de DENV de vetores e de casos humanos permitindo a caracterização molecular e a análise filogenética, fornecendo informações relevantes para a compreensão da interação vetor- vírus- humanos. O entendimento da variação genética no vírus quando este replica em mosquitos, e como essas variações atuam durante a transmissão entre humanos e mosquitos permanecem desconhecidos. Portanto, visando contribuir para um melhor conhecimento dos DENV e sua interação com o mosquito vetor, realizamos neste trabalho, a caracterização molecular e análise filogenética de DENV isolados de mosquitos naturalmente infectados e de casos humanos, provenientes de epidemias ocorridas entre 1986 e 2011 no Brasil. Foi demonstrado que os métodos moleculares foram fundamentais por facilitarem a rápida identificação dos vírus e consequentemente o monitoramento dos genótipos circulantes A RT-PCR para a triagem de DENV em vetores se mostrou uma ferramenta útil para a vigilância virológica, com taxas de detecção que variaram de 0,78% a 25% no período estudado. A análise filogenética dos DENV-1 isolados de mosquitos e humanos mostrou que o genótipo V (Américas/África) continua o mesmo circulante desde a sua introdução, porém foi demonstrada a co-circulação de duas novas linhagens (II e III) no período de 2009 a 2011. O sequenciamento do genoma completo de DENV-3 isolado a partir de Ae. aegypti naturalmente infectados no Rio de Janeiro (RJ), assim como a análise da região 3´NC de vírus isolados em mosquitos e humanos, caracterizou estes vírus como pertencentes ao GIII e revelou a presença de inserções e deleções na região 3´NC do genoma. As deleções observadas na região 3´NC resultaram em estruturas secundárias porém nem todas as cepas com inserções nesta região apresentaram estrutura similar substituições exclusivas à cepa de DENV-3 isolada em mosquito foram observadas no gene NS5, incluindo a substituição que resultou na formação de um códon de terminação. O teste comercial Simplexa\2122 Dengue Real Time RT-PCR, disponível recentemente, foi utilizado pela primeira vez para detecção dos DENV e se mostrou um método molecular alternativo para as vigilâncias entomológica e virológica. O RT-PCR em Tempo Real possibilitou, pela primeira vez, a quantificação de DENV-1 e DENV-4 em fêmeas individuais naturalmente infectadas (1,6 x 104 cópias/mL e 1,08 x 103 cópias/mL, respectivamente) Considerando-se o elevado índice de infestação por Ae. aegypti em todo o país, o estudo da caracterização dos DENV circulantes torna-se de grande importância no conhecimento da relação vírus-vetor pela análise da variabilidade genética, dispersão e persistência de genótipos durante a transmissão destes vírus / Dengue has been a major public health problem in Brazil with several studies performed aiming to elucidate the disease epidemiology in geographically distinct areas with different dengue viruses (DENV) circulation. The establishment of an entomological and virological program since 1986 with the objective of detecting and monitoring DENV serotypes and genotypes resulted in distinct opportunities in DENV isolation from vectors and human cases, allowing the molecular characterization and phylogenetic analysis, providing relevant information for the understanding of the vector-virus-humans interactions. The understanding of the virus genetic variability when it replicates on mosquitoes and how those variations act during the transmission between humans and mosquitoes is not fully understood. Therefore, aiming to contribute for a better understanding of DENV and its interactions with the mosquito vector, we performed in this study the molecular characterization and phylogenetic analysis of viruses isolated from naturally infected mosquitoes and human cases, from epidemics occurred between 1986 and 2011 in Brazil. It has been shown that the molecular techniques were essential for allowing the rapid identification of the viruses and consequently the monitoring of the circulating genotypes. The RT-PCR for DENV screening in vectors has shown to be a useful tool for the virological surveillance, with detection rates varying from 0.78% to 25% in the studied period. The phylogenetic analysis from DENV-1 isolated from mosquitoes and human cases showed that genptype V (America/Africa) is still the same genotype circulating since this serotype introduction, however it was demonstrated the co-circulation of two distinct new viral lineages (II and III) from 2009 to 2011. The complete genome sequencing of a DENV-3 isolated from naturally infected Ae. aegypti in Rio de Janeiro (RJ) and the analysis of the 3´UTR region from viruses isolated from mosquitoes and humans, has characterized those viruses as belonging to genotype III (GIII) and revealed the presence of insertions and deletions in the 3´UTR region of the genome. The deletions observed in the 3´UTR region resulted in similar secondary structures, however not all strains with insertions were similar in structure. Exclusive substitutions to the DENV-3 isolated from the mosquitoes were observed in NS5, including a substitution leading to a stop codon formation. The Simplexa™ Dengue Real Time RT-PCR commercial kit, recently available, was used for the first time for DENV detection and it has been shown to be an alternative molecular method for the entomological and virological surveillances, The Real Time RT-PCR has allowed, for the first time the DENV-1 and DENV-4 quantification in single Ae. aegypti naturally infected (1.6 x 104 copies/mL e 1.08 x 103 copies/mL, respectively). Considering the high Ae. aegypti infestation index in the country, the characterization of DENV circulating is very relevant for the understanding of the virus-vector relations by the analysis of the genetic variability, spread and persistence of genotypes during the transmission of those viruses.

Made available in DSpace on 2015-11-18T13:16:37Z (GMT). No. of bitstreams: 2 angelica_barbosa_ioc_mest_2015.pdf: 1651420 bytes, checksum: 8b26b4e04c5c264d60dcf8244f84331a (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2015-04-14 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / A leptospirose é uma zoonose endêmica no Brasil e no Estado do Rio de Janeiro caracteriza-se como uma doença infecciosa febril aguda, potencialmente fatal, principalmente na forma pulmonar. Esta doença tem manifestação proteiforme que requer diagnóstico diferencial com várias doenças infecciosas endêmicas, fato que torna seu diagnóstico difícil e complexo, em especial nos períodos de epidemias. Entre estas doenças infecciosas, destaca-se a síndrome pulmonar por hantavírus (SPH), uma zoonose emergente restrita às Américas, adquirida a partir de roedores silvestres, cujo espectro clínico varia, de doença febril aguda inespecífica a quadros pulmonares e cardiovasculares mais graves e fulminantes caracterizados por insuficiência respiratória com letalidade de 40 a 60%. Considerando que ambas as zoonoses têm os roedores como reservatórios e apresentam particularidades clínicas semelhantes, principalmente com relação à forma pulmonar da leptospirose (FPL) e a SPH, torna necessário o diagnóstico diferencial em pacientes com quadro infeccioso agudo febril com manifestação respiratória procedentes de áreas onde existam espécies de roedores silvestres infectadas Embora até a presente data nenhum caso de SPH tenha sido notificado no estado do Rio de Janeiro, roedores silvestres infectados com vírus Juquitiba, o genótipo mais frequentemente associado com a doença humana no Brasil, já foram identificados no território fluminense, na divisa com os estados de Minas Gerais e São Paulo, onde há casos de SPH, reforçam a necessidade de estudos. A proposta desse estudo retrospectivo foi (i) analisar os dados clínico-epidemiológicos das amostras de casos suspeitos de leptospirose encaminhadas para o Centro Colaborador da Organização Mundial da Saúde para Leptospirose do Instituto ix Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro, no período de 2008 a 2011 e (ii), investigar a presença de infecção por hantavírus, utilizando teste sorológico - antígeno recombinante HANTEC, em amostras de casos suspeitos, soronegativas para leptospirose, procedentes dos municípios do estado do Rio de Janeiro, onde roedores infectados por hantavírus foram identificados. Foram analisadas amostras de 108 casos suspeitos negativos sorologicamente para leptospirose, sendo 88% das amostras provenientes do Laboratório Central Noel Nutels (LACEN) e as demais procedentes de hospitais gerais O sexo masculino correspondeu a maioria, com 77% dos casos, numa faixa etária predominante dos 20-29 anos e 30-39 anos. História epidemiológica positiva para presença de roedores foi verificada em 28.7% dos casos e no período de maior precipitação pluviométrica, respeitando a sazonalidade da leptospirose. Em relação à análise clínica, a frequência das manifestações foi: mialgia (87%), icterícia (47.2%), anúria (31.5%), oligúria (31.5%), cefaleia (18.5%), congestão conjuntival (18.5%), sinais hemorrágicos (12%) e hemorragia pulmonar (6.5%). A análise sorológica dessas amostras, que atenderam aos critérios de inclusão para a pesquisa de hantavírus, mostrou-se negativa. Embora mais estudos sejam necessários, os resultados obtidos apontam para a ausência de infecção por hantavírus em amostras humanas de casos suspeitos de leptospirose na forma pulmonar em um estado onde, curiosamente, o vírus Juquitiba, identificado no roedor reservatório Oligoryzomys nigripes, se encontra, com base na análise filogenética, separado dos outros hantavírus Juquitiba identificados no território brasileiro / Leptospirosis is a n endemic zoonosis in Brazil and in the State of Rio de Janeiro that is characterized as an acute, potentially fatal febrile infectious disease, especially in the pulmonary form. This disease has a dynamic manifestation that requires differential diagnosis with several endemic infectious diseases, due to its distribution in the same geographical areas, a fact which makes its diagnosis difficult and complex, especially in periods of epidemics. Among these infectious diseases , there is the hantavirus pulmonary syndrome (HPS) , also known as hantavirus card iopulmonary syndrome (HCPS) an emerging zoonosis restricted to the Americas , acquired from wild rodents , whose clinical spectrum ranging from acute febrile illness nonspecific more severe and fulminant pulmonary and cardiovascular frames characterized by respiratory insufficiency with mortality 40 - 60 % . Whereas both zoonoses have rodents as reservoirs and present similar clinical features, mainly between the pulmonary form of leptospirosis (PFL) and HPS, differenti al diagnosis is necessary in patients wi th acute febrile infection with respiratory manifestation coming from areas where there are species of wild rodents. Although no cases of HPS have been reported in the State of Rio de Janeiro, with infected wild rodents Juquitiba virus genotype most often associated with human disease in Brazil, have been identified in Rio de Janeiro territory, whose border with the states of Minas Gerais and São Paulo, where there are cases of HPS, reinforces the need for studies. The purpose of this retrospective study wa s to ( i ) analyze the clinical and epidemiological data of samples of suspected leptospirosis forwarded to the WHO Collaborating Centre of the World Health Organization for Leptospirosis Institute Oswaldo Cruz , Rio de Janeiro case s in the period 2008 - 2011 and ( ii) investigate the presence of hantavirus infection using serologic testing - recombinant antigen in samples from suspected cases , but laboratory negative for leptospirosis , coming from the municipalities of the State of Rio de Janeiro , where rod ents infected with hantaviruses have been identified . 108 suspected cases were serologically negative for leptospirosis, with 88 % of the samples from the Central Laboratory Noel Nutels (LACEN) and the other coming from General Hospitals. Males comprised t he majority with 77% of cases, a predominant age group of 20-29 years and 30 - 39 years, positive for the presence of rodents in 28.7 % of cases and in the period of greatest rainfall epidemiological history, respecting the seasonality of leptospirosis. In re lation to clinical analysis , the frequency of events is: myalgia ( 87%), jaundice (47.2%) , anuria (31.5%) , oliguria (31.5%), headache (18.5 %) , conjunctival injection (18.5%) , signs bleeding ( 12%) and pulmonary h emorrhage (6.5%). Serological analysis of thes e samples, which met the inclusion criteria for the detection of hantavirus was negative. Although more studies are needed, the results point to the absence of hantavirus infection in human specimens in a state where, interestingly, the Juquitiba virus ide ntified in rodent reservoir Oligoryzomys nigripes , is based on phylogenetic analysis, separate from other Juquitiba identified hantavirus in Brazil.

Made available in DSpace on 2016-03-04T13:41:29Z (GMT). No. of bitstreams: 2 279.pdf: 1884105 bytes, checksum: dfbedfcf9cd3849b728c8e11a1ea19bc (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2014 / Essa tese defende a integração da saúde mental no escopo das ações da vigilância em saúde do trabalhador (Visat) e aborda a importância do desenvolvimento de estratégias de identificação e intervenção nos fenômenos relativos ao sofrimento, em seus diferentes níveis, considerando suas fontes originadoras nos processos de trabalho. Pretendeu-se responder à demanda do atual momento histórico em que são cada vez mais evidentes e crescentes os problemas em saúde mental dos trabalhadores que trazem desafios aos serviços de saúde. Realizamos uma sistematização das abordagens teóricas e práticas existentes sobre a saúde mental dos trabalhadores investigando as perspectivas que elas abrem para as ações de vigilância. Trata-se de uma pesquisa analítico-propositiva baseada no pensamento de Michel Foucault e, sob esse referencial, buscamos compreender o modo como a saúde mental dos trabalhadores vem sendo problematizada no campo da produção de conhecimento e das ações institucionais. Efetuamos um mapeamento de saberes e práticas sobre essa temática e verificamos os elementos que emergem em práticas e recomendações como melhores empresas para trabalhar. Procedemos a análise de produções teóricas de autores de referência em saúde mental e trabalho, e de manuais, informes, cartilhas, guias de ação, documentos de acordos políticos e sociais e relatos de pesquisas de agências especializadas em saúde e segurança do trabalho. Investigamos também relatórios de diferentes fóruns coletivos em saúde do trabalhador a fim de caracterizar as práticas correntes no âmbito da Rede Nacional de Atenção Integral à Saúde do Trabalhador (Renast). / A partir dessas análises apontamos perspectivas e estratégias para a integração da saúde mental no conjunto das práticas da Visat. Tomamos como referência também os estudos de Agamben quanto à tanatopolítica, a noção de produção de subjetividade conforme Guattari, sofrimento social em Renault e o pensamento de Rorty, para discutir quais seriam as alternativas capazes de deslanchar ações de Visat que rompam com modelos medicalizantes e patologizantes no que tange ao sofrimento dos trabalhadores. Apontamos dois eixos capazes de operar a integração da saúde mental na Visat: a ideia de sujeito e suas relações no contexto de trabalho e a caracterização dos vários elementos que compõem a organização do trabalho para as intervenções. Considerando que faltam diretrizes no âmbito da Renast esse trabalho contribui para aprimorar o olhar da vigilância para a problemática da saúde mental e oferece subsídios para a criação de ações considerando a complexidade das manifestações do sofrimento. / The thesis advocates integration of mental health in the scope to worker´s health surveillance (Visat) actions and discusses how importance is developing strategies to identity and intervene in worker´s suffering, upon it´s different levels, considering their sources in labor process.We seek to answer current´s demands from actual historical moment in which it´s increasingly evident and growing problems in mental health workers, that brings challenges to health services. We did a systematization of theoretical e practical approaches in mental workers health investigating what perspectives it brings to surveillance actions.This research, analytical and propositional, it´s based on Foucault thoughts, and, under his referential, we seek to comprehend how workers mental health have being problematized in scientific and institutional sphere.Then, we did a mapping of knowledge and practices about that theme and we verified elements from recommendations and practices as Great place to work for. We analyzed theoretical productions from references authors to mental health and work and reports, manuals, political agreements, technical guides to actions produced by internacional agencies on health and security to work. We also analyzed reports of different collective forums in worker´s health in order to characterize current practices within the RENAST. ^ien / From these analyzes, we point out perspectives and strategies to mental health´s integration in the set Visat´s actions. We refer also studies regarding tanatopolítica Agamben, the subjectivity production notion as Guattari, social suffering in Renault and thought of Rorty to discuss what are alternatives to Visat be able to break medicalized and pathologizing models and actions about workers suffering.We point out two axes capable to operating the mental health integration in Visat: subject and their relations in the workplace idea and the characterization of various elements from work´s organization for interventions. Considering lack of guidelines under RENAST, this research contributes to enhance surveillance s look to the problem of worker´s mental health and provides grants to creation actions considering the suffering manifestations complexity. (AU)^ien

Made available in DSpace on 2016-03-15T14:15:00Z (GMT). No. of bitstreams: 2 356.pdf: 1644050 bytes, checksum: bcb5f7c94897b4d6eb4ea183455b9237 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2014 / A política de saúde do trabalhador, no Brasil, se intensificou a partir da Constituição Federal que consolidou a saúde e o trabalho como direitos de cidadania, culminando com a publicação da Política Nacional de Saúde do Trabalhador e da Trabalhadora, processo que se fortaleceu no Amazonas com a implantação do Centro de Referência em Saúde do Trabalhador - Cerest. A Vigilância em Saúde do Trabalhador Visat foi estabelecida como estratégia prioritária para garantir proteção à saúde dos trabalhadores. Nesse sentido, tomamos como objeto as ações da Visat no Amazonas com a finalidade de compreender sua atuação, contextualizar seu processo de desenvolvimento e refletir sobre as estratégias para a sua implementação. A tese foi construída com base em três eixos: análise de dados secundários, revisão documental e da literatura e pesquisa de campo. O método priorizado foi a hermenêutica-dialética; as técnicas, entrevista semiestruturada e grupo focal; e por categoria de análise: o conceito de Visat, a institucionalidade do Cerest, capilaridade das ações e a ética como fundamento para a construção coletiva das ações de Visat. Os resultados apresentam relativo domínio do conceito de Visat, porém contradições no que concerne ao seu campo de ação e competências. A diversidade de inserção do Cerest na estrutura organizacional das secretarias e a baixa cobertura da rede de atenção básica comprometeram a capilaridade das ações. A dualidade de políticas não foi identificada como problema, mas sim a falta de tradição estadual na elaboração de normas locais. As ações intra e intersetoriais foram identificadas como necessárias, porém sem proatividade para sua efetivação. A carência de recursos humanos, a alta rotatividade dos profissionais e as mudanças decorrentes de períodos eleitorais foram apontadas como responsáveis pela dificuldade de articulação. / O controle social foi identificado como frágil e desmobilizado, o reconhecimento do saber operário, apesar de considerado essencial, houve resistência à participação dos trabalhadores. Concluímos que a Visat não foi reconhecida como prioridade para o gestor, há um esforço para execução das ações, mas sem contemplar plenamente seus pressupostos. O Cerest não se restringiu ao papel de irradiador das ações de Visat, mas assumiu sua execução na busca de expertise para se tornar centro de inteligência em saúde do trabalhador. / The policy of workers' health in Brazil has intensified since the Federal Constitution which consolidated health and labor ascitizenship rights, culminating in the publication of National Policy on Occupational Health and Working, a process that strengthened the Amazon with the implementation of the Reference Center for Occupational Health - CerestThe Occupational Health Surveillance Visat was established as a strategic priority for ensure protection of workers' health. In this sense, the actions we take as an object in Visat Amazonin order tounderstand their actions, their process of contextualizing development and reflect on the strategies for its implementation.The thesis was built based on three axes: secondary data analysis, document review and literature, and field research. The method was prioritized hermenêutica-dialética techniques, semi interview structured interviews and focus groups, and by the analysis: the concept of Visat the institutionalization of Cerest capillary actions and ethics as the foundation for the construction of collective actions Visat.The results show the field concept Visat but contradictions in regard to its scope and powers. The diversity of the insertion Cerest organizational structure of the departments and the low coverage of basic health care network committed capillarity of the shares.The duality of policies was not identified as a problem but rather the lack of state tradition in developing local standards. The intra and intersectoral action was identified as necessary but without housekeepers for their enforcement.The lack of resources humans, the high turn over of professionals and the changes resulting from electoral periods have been identified as responsible for the difficulty of articulation. Social control was identified as frail and demobilized, the recognition of knowledge workers despite considered essential, there was resistance to employee participation. ^ien / We conclude that Visat not been recognized as a priorityfor the manager, there is an effort to implement the actions, but without fully contemplating their assumptions. The Cerest not restricted to the role of irradiator shares Visat but to ok his execution in search of expertise to become the center of intelligence in occupational health. (AU)^ien