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Étude des changements biochimiques post Mortem dans le muscle des volailles contribution au déterminisme de l'amplitude de la diminution du pH /

El Rammouz, Rabih. Fernandez, Xavier. January 2006 (has links)
Reproduction de : Thèse de doctorat : Sciences agronomiques : Toulouse, INPT : 2005. / Titre provenant de l'écran-titre. Bibliogr. 325 réf.
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Caractérisation génétique et étude de l'antibiorésistance d'isolats de Campylobacter retrouvés chez le porc, la volaille et l'humain

Guévremont, Èvelyne January 2004 (has links)
Thèse numérisée par la Direction des bibliothèques de l'Université de Montréal.
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Une approche dynamique des flux d'éléments et d'énergie des ateliers de production avicole avec ou sans parcours : Conception et application du modèle MOLDAVI

Meda, Bertrand 24 November 2011 (has links) (PDF)
Dans une démarche globale de durabilité, l'aviculture doit identifier des solutions pour mieux valoriser ses intrants, réduire ses rejets et minimiser ses consommations d'énergie. Pour ce faire, le développement d'un modèle des flux d'éléments et d'énergie est la démarche la plus appropriée. Cette thèse présente donc la conception et l'application de MOLDAVI, modèle dynamique à l'échelle de l'atelier de production avicole simulant les flux d'énergie et de C, N, P, K, Cu, Zn et d'eau. MOLDAVI est composé d'un module " Animal " simulant les performances de volailles de chair (croissance, ingestion, excrétion, chaleur), d'un module " Bâtiment " producteur et consommateur d'énergie et source d'émissions gazeuses (H2O, CO2, NH3, N2O, N2, CH4) et d'un module optionnel " Parcours " sur lequel une partie des déjections est excrétée et source d'émissions gazeuses. Cependant, peu de connaissances étant disponibles sur les ateliers avec parcours, des expérimentations sur deux ateliers de production biologique de poulets de chair ont été réalisées afin d'acquérir des facteurs d'émission gazeuse (NH3, N2O, CH4) en bâtiment et sur parcours ainsi que des références sur la répartition des déjections entre le bâtiment et le parcours. A l'issue de cette thèse, MOLDAVI pourra être associé à d'autres modèles à l'échelle de l'exploitation ou encore à la méthode d'Analyse du Cycle de Vie afin d'évaluer les impacts environnementaux de systèmes existants et innovants.
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Systèmes d'alimentation alternatifs pour le développement des filières volailles en régions chaudes / Alternative feeding systems for the development of the poultry value chains in tropical areas

Batonon, Dolores Isidora Fifonsi 05 December 2014 (has links)
L’objectif de ce travail était d’évaluer, les possibilités de diversification des matières premières utilisées en alimentation de la volaille et les conditions d’application des systèmes d’alimentation séquentielle et mélangée en milieu chaud. Une méta-analyse et deux expérimentations in vivo ont permis de conclure qu’il est possible de combiner sorgho/tourteau de coton et millet/sorgho dans l'aliment du poulet sans effet synergique sur les performances. Chez la poule pondeuse, une étude réalisée en milieu chaud et humide a permis de montrer que lorsque l’animal est soumis à des conditions thermiques et hygrométriques variables, les performances de production des poules en alimentation séquentielle et mélangée sont fortement affectées. En température chaude et constante, les poules en alimentation séquentielle ont une meilleure efficacité alimentaire que les poules en alimentation classique. Ce travail a permis de mettre en place des systèmes d’alimentation permettant de mieux valoriser des matières premières locales et d’améliorer l’ajustement des apports aux besoins des animaux. Les modèles présentés permettent ainsi de renforcer les liens entre filières avicole et végétale et de contribuer à leur développement. / The objective of this work was to evaluate the impact of alternative feed ingredients in poultry feeding and to determine bird’s responses to sequential and loose-mix feeding in hot climate. A meta-analysis and in vivo trials were performed on the use of millet. sorghum and cottonseed meal in poultry diets. Results showed that simple or combined utilization of these ingredients resulted in similar feed intake and growth performance as corn/soybean-based diets. In laying hens, a study conducted in warm conditions showed that when they are subjected 10 variable temperature and humidity throughout and within a day, laying and growth performance decreased in sequential and loose-mix feeding. A second study confirmed that high environmental temperature does not disable sequential feeding benefits. This work suggest feeding systems in which feed ingredients produced in hot climates could be directly included in birds diets have been proposed. This will thereby help consolidating the links between poultry and vegetable supply chains and contribute to their development.
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Évaluation de stratégies pour améliorer l'observance de la biosécurité sur les fermes avicoles au Québec

Racicot, Manon 04 1900 (has links)
La problématique de l’observance de la biosécurité est présente dans tous les types de production. Il est essentiel de définir des stratégies pour améliorer l’application des mesures de biosécurité. Cette étude décrit l’application des mesures de biosécurité à l’entrée et à la sortie de 24 bâtiments d’élevages avicoles au Québec, Canada. L’effet des audits et de caméras visibles sur l’observance a été étudié, de même que les déterminants de l’observance. De plus, la relation entre l’observance et les profils de personnalité, l’expérience et l’éducation a été décrite. L’application des mesures de biosécurité a été évaluée à l’aide de caméras cachées. L’observance à court terme (deux premières semaines) et à moyen terme (six mois plus tard) a été déterminée. Basés sur les résultats du groupe contrôle, 44 différentes erreurs lors de l’application des mesures de biosécurité ont été observées à l’entrée et la sortie des bâtiments. La plupart étaient reliées à la délimitation des zones (propre versus contaminée). La nature et la fréquence des erreurs suggèrent un manque de compréhension des principes associés aux mesures de biosécurité. Le visionnement des vidéos a révélé 3055 visites par 277 individus différents (136 employés, 123 visiteurs, 3 superviseurs et 15 éleveurs). Les résultats ont démontré que les audits n’avaient pas d’impact sur l’observance des employés. Les caméras visibles ont eu un impact, à court terme, sur le port de bottes et le respect des zones durant la visite. Par contre, six mois plus tard, l’observance avait significativement diminué, au point de ne plus être statistiquement plus élevée que le groupe contrôle. La durée et le moment de la visite, la présence de l’éleveur ou d’un observateur, la conception de l’entrée, le nombre de bâtiments, le nombre de mesures de biosécurité exigé, le type de bottes, le genre et être membre de la famille de l’éleveur étaient significativement associés à l’observance de certaines mesures. Finalement, trois traits de la personnalité étaient associés à l’observance: responsabilité, orienté vers l’action et complexité, de même que le nombre d’années d’expérience et le niveau d’éducation. Il est nécessaire d’améliorer la formation en matière de biosécurité en fournissant du matériel de formation à tous les intervenants qui démontrent pourquoi et comment appliquer les mesures de biosécurité. La formation continue devrait également aborder les problématiques reliées aux caractéristiques de visites et de fermes. Améliorer la conception des entrées de bâtiments devrait contribuer à augmenter et à maintenir l’observance. L’identification de traits de personnalité associés à l’observance peut avoir des implications sur la sélection des candidats à l’embauche ou sur l’attribution de tâches et sur la planification des programmes de formation. / Biosecurity compliance issue is present in all types of animal productions, Therefore, it is essential to define strategies to improve the implementation of biosecurity measures. This study described the application of biosecurity measures when entering and exiting 24 poultry barns in Québec, Canada. The effect of audits and visible cameras on compliance was investigated, as well as determinants of compliance. Also, the relationship between compliance and personality profiles, experience and education has been described. Application of biosecurity measures was evaluated using hidden cameras. Short term (first two weeks) and medium term (six months later) compliance were determined. Based on the control group, 44 different biosecurity breaches were observed when getting in and out of poultry barns. Most were related to area delimitation (clean versus contaminated). The nature and frequency of errors suggest a lack of understanding of biosecurity principles. Overall, video viewing revealed 3055 visits done by 277 different individuals (136 employees, 123 visitors, 3 supervisors and 15 growers). Results showed that audits did not have any impact on employee compliance. Visible cameras had a significant impact on changing boots and respecting areas during the visit for the short term period. However, six months later, compliance significantly declined and was no longer statistically higher compared to the control group. Duration and moment of the visit, presence of the grower or an observer, barn entrance design, number of barns, number of biosecurity measures requested, type of boots, gender and being a member of a grower’s family were significantly associated with compliance with some biosecurity measures. Finally, three personality traits were significantly associated with compliance: responsibility, action-oriented and complexity, as well as the number of years of experience and the level of education. There is a need to improve biosecurity training by making training material available to all poultry personnel demonstrating why and how to apply biosecurity measures. Educational meetings should also address issues related to visit and farm characteristics. Improving barn entrance design should contribute to enhance and maintain compliance. The identification of personality traits associated with compliance may have implications for the selection of job applicants or task attribution, and for developing educational materials and training programs.
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Évaluation de stratégies pour améliorer l'observance de la biosécurité sur les fermes avicoles au Québec

Racicot, Manon 04 1900 (has links)
La problématique de l’observance de la biosécurité est présente dans tous les types de production. Il est essentiel de définir des stratégies pour améliorer l’application des mesures de biosécurité. Cette étude décrit l’application des mesures de biosécurité à l’entrée et à la sortie de 24 bâtiments d’élevages avicoles au Québec, Canada. L’effet des audits et de caméras visibles sur l’observance a été étudié, de même que les déterminants de l’observance. De plus, la relation entre l’observance et les profils de personnalité, l’expérience et l’éducation a été décrite. L’application des mesures de biosécurité a été évaluée à l’aide de caméras cachées. L’observance à court terme (deux premières semaines) et à moyen terme (six mois plus tard) a été déterminée. Basés sur les résultats du groupe contrôle, 44 différentes erreurs lors de l’application des mesures de biosécurité ont été observées à l’entrée et la sortie des bâtiments. La plupart étaient reliées à la délimitation des zones (propre versus contaminée). La nature et la fréquence des erreurs suggèrent un manque de compréhension des principes associés aux mesures de biosécurité. Le visionnement des vidéos a révélé 3055 visites par 277 individus différents (136 employés, 123 visiteurs, 3 superviseurs et 15 éleveurs). Les résultats ont démontré que les audits n’avaient pas d’impact sur l’observance des employés. Les caméras visibles ont eu un impact, à court terme, sur le port de bottes et le respect des zones durant la visite. Par contre, six mois plus tard, l’observance avait significativement diminué, au point de ne plus être statistiquement plus élevée que le groupe contrôle. La durée et le moment de la visite, la présence de l’éleveur ou d’un observateur, la conception de l’entrée, le nombre de bâtiments, le nombre de mesures de biosécurité exigé, le type de bottes, le genre et être membre de la famille de l’éleveur étaient significativement associés à l’observance de certaines mesures. Finalement, trois traits de la personnalité étaient associés à l’observance: responsabilité, orienté vers l’action et complexité, de même que le nombre d’années d’expérience et le niveau d’éducation. Il est nécessaire d’améliorer la formation en matière de biosécurité en fournissant du matériel de formation à tous les intervenants qui démontrent pourquoi et comment appliquer les mesures de biosécurité. La formation continue devrait également aborder les problématiques reliées aux caractéristiques de visites et de fermes. Améliorer la conception des entrées de bâtiments devrait contribuer à augmenter et à maintenir l’observance. L’identification de traits de personnalité associés à l’observance peut avoir des implications sur la sélection des candidats à l’embauche ou sur l’attribution de tâches et sur la planification des programmes de formation. / Biosecurity compliance issue is present in all types of animal productions, Therefore, it is essential to define strategies to improve the implementation of biosecurity measures. This study described the application of biosecurity measures when entering and exiting 24 poultry barns in Québec, Canada. The effect of audits and visible cameras on compliance was investigated, as well as determinants of compliance. Also, the relationship between compliance and personality profiles, experience and education has been described. Application of biosecurity measures was evaluated using hidden cameras. Short term (first two weeks) and medium term (six months later) compliance were determined. Based on the control group, 44 different biosecurity breaches were observed when getting in and out of poultry barns. Most were related to area delimitation (clean versus contaminated). The nature and frequency of errors suggest a lack of understanding of biosecurity principles. Overall, video viewing revealed 3055 visits done by 277 different individuals (136 employees, 123 visitors, 3 supervisors and 15 growers). Results showed that audits did not have any impact on employee compliance. Visible cameras had a significant impact on changing boots and respecting areas during the visit for the short term period. However, six months later, compliance significantly declined and was no longer statistically higher compared to the control group. Duration and moment of the visit, presence of the grower or an observer, barn entrance design, number of barns, number of biosecurity measures requested, type of boots, gender and being a member of a grower’s family were significantly associated with compliance with some biosecurity measures. Finally, three personality traits were significantly associated with compliance: responsibility, action-oriented and complexity, as well as the number of years of experience and the level of education. There is a need to improve biosecurity training by making training material available to all poultry personnel demonstrating why and how to apply biosecurity measures. Educational meetings should also address issues related to visit and farm characteristics. Improving barn entrance design should contribute to enhance and maintain compliance. The identification of personality traits associated with compliance may have implications for the selection of job applicants or task attribution, and for developing educational materials and training programs.
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Etude des pratiques en antibiothérapie dans la filière poulet de chair Label Rouge / Exploring antimicrobial use on traditional free-range Label Rouge broiler farming

Adam, Cécile 24 November 2017 (has links)
La lutte contre l’antibiorésistance, à présent reconnue comme un problème public mondial majeur, passe par l’utilisation raisonnée des antimicrobiens. Diminuer leur utilisation est ainsi un défi pour l’agriculture, en particulier pour les productions animales hors sol, dont les espèces figuraient en 2013 en France parmi les plus exposées aux antimicrobiens. La recherche de leviers d’action permettant de réduire l’usage des antibiotiques constitue donc un enjeu important. L’objectif de la thèse était précisément d’identifier des leviers d’action pour diminuer l’usage des antibiotiques, en prenant pour cas d’étude une organisée : la filière poulet de chair Label Rouge. Pour cela une méthode pluridisciplinaire associant la sociologie et l’épidémiologie a été utilisée.Dans un premier temps, une étude sociologique par entretiens semi-directifs a été conduite auprès d’éleveurs, de techniciens et de vétérinaires, pour étudier les représentations et les pratiques des acteurs autour de l’antibiothérapie. Elle a permis de mettre en évidence l’adéquation de l’impératif de réduire l’usage des antibiotiques avec l’identité professionnelle des éleveurs. Outre les améliorations techniques, l’accompagnement des éleveurs par des conseillers avec qui ils ont établi une relation de confiance a permis d’aider les éleveurs à changer leurs pratiques vers moins d’antibiotiques.Ensuite, une étude pharmaco-épidémiologique de type cas témoin dans 260 lots a été menée par administration d’un questionnaire en élevage, afin d’identifier les facteurs associés à l’usage des antibiotiques. Des outils techniques utilisés en prévention depuis longtemps - comme le papier démarrage- ou depuis plus récemment –comme les produits phytothérapeutiques - se sont révélés être associés à une diminution de l’usage des antibiotiques. La perception des éleveurs de l’état de santé de leur lot était également significativement associée à l’usage d’antibiotiques. Enfin, une étude sociologique menée par entretiens semi-directifs avec des responsables techniques et des directeurs de trois organisations de production a permis d’étudier les dispositifs mis en place par les organisations de production pour diminuer leur usage d’antibiotiques. Les démarches mises en place par les OP étudiées pour diminuer l’usage des antibiotiques sont variables, récentes, et rarement constituées d’outils spécifiquement orientés vers la réduction des usages. La seule démarche étudiée constituant une véritable stratégie de réduction repose principalement sur des outils organisationnels pour enrôler l’ensemble des acteurs et coordonner les réseaux, en les incitant à mettre en place les outils techniques. L’étude montre le rôle important que jouent certaines OP dans la démédication, de par les leviers multiples dont elles disposent auprès des éleveurs.La combinaison de différentes approches dans ce travail de thèse, empruntées à la sociologie et à l’épidémiologie, a permis d’éclairer différents aspects des déterminants associés aux usages d’antibiotiques en élevage de volailles. Cette étude ouvre par ailleurs la voie à de nouvelles interrogations, en particulier concernant le rôle des acteurs privés –en particulier ceux de l’aval – sur la santé animale en générale, et l’usage des antibiotiques en particulier. / Antimicrobial resistance is now well recognized as a global and major public issue, and as such has been tackled through antibiotic stewardship. Decreasing antimicrobial use is a great challenge for livestock farming, especially for intensive production systems, which were among the more exposed in 2013. It is of great interest to search for drivers enabling to reduce antimicrobial use. The thesis objectives were thus to identify drivers for change, in an organized production system: Label Rouge traditional free-range broiler farming. A multi-disciplinary approach, combining sociology with epidemiology was used.First, a sociological study based on semi-directive interviews with farmers, production technicians and veterinarians was carried out in order to study professionals’ perceptions and practices related to antimicrobial use. Results highlight the adequacy between the imperative of decreasing antimicrobial use and farmers’ professional identity. Besides technical improvements, the coaching of farmers by counsellors whom they trust was also found to play an important role in changing their practices towards lower antimicrobial use.Second, a pharmaco-epidemiological case-control study was carried out. 260 flocks of broilers were investigated thanks to on-farm questionnaires, in order to identify the factors associated with antimicrobial use. Preventive technical tools such as herbal drugs or chicken paper were associated to a decreased use of antimicrobials. The way farmers judge their flock health was also significantly associated to antimicrobial use.Finally, a sociological study involving semi-directive interviews with directors and production technicians from three farmer organizations enabled to study the strategies developed by farmer organizations to reduce antimicrobial use. We found that the studied farmer organizations had various and relatively new approaches, which are hardly ever constituted of tools specifically designed to decrease antimicrobial use. Only one approach was a real and complete strategy, mostly based on organizational tools aiming to enroll the actors and coordinate the networks and have them apply the technical tools. The study shows that some farmer organizations can play an important role in antimicrobial use reduction, thanks to the different drivers they have to encourage farmers to change their practices.The combination of sociological and epidemiological approaches used in this study enabled to highlight a wide range of drivers for antimicrobial use in broiler breeding. This study also raises further questions on the role played by private stakeholders – such as distributors - in animal health in general, and antimicrobial use in particular.
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Un nouveau cadre conceptuel pour évaluer la contribution des filières agricoles au développement durable des territoires – application à la filière avicole réunionnaise / A new conceptual framework to assess the contribution of agricultural supply chain to sustainable developpment of territories - case study on the main poultry supply chain in Reunion Island

Thevenot, Alexandre 23 April 2014 (has links)
Parvenir à la sécurité alimentaire dans un respect des écosystèmes planétaires et des sociétés humaines reste un des grands défis des prochaines décennies. Les filières agricoles sont potentiellement des leviers puissants pour repenser les modes de production et d'approvisionnement en produits alimentaires. Elles font donc actuellement face à de fortes pressions pour intégrer le développement durable dans leur stratégie. En ce sens, les décideurs industriels et politiques sont fortement demandeurs de méthodes pour évaluer de façon systématique à la fois les impacts et les services rendus par les filières aux écosystèmes et aux sociétés. Cette thèse propose un cadre conceptuel permettant de mesurer le progrès d'une filière agricole en matière de contribution au développement durable de son territoire. Ce cadre conceptuel comprend une analyse stratégique du territoire en vue de l'identification collective d'enjeux et de mesures d'amélioration techniques et organisationnelles. Il incite à une quantification et une spatialisation des effets dans un objectif d'équité interterritoriale. Il est recommandé d'inclure dans l'analyse les différentes parties prenantes généralement impliquées : les fournisseurs, les concurrents, l'environnement industriel et la communauté. Sur la base de théories de management stratégique des entreprises, il est possible de réduire le nombre de parties prenantes à considérer afin de concentrer l'analyse sur les plus concernées par les mesures d'amélioration. Ce cadre conceptuel intègre potentiellement de nombreuses méthodes d'évaluation déjà reconnues et disponibles dans la littérature pour peu qu'elles répondent à certains critères de compatibilité. À chaque analyse, les méthodes les plus pertinentes sont sélectionnées selon les enjeux du territoire. Ce cadre conceptuel a été appliqué à l'évaluation des effets de la principale filière avicole réunionnaise sur son territoire. Plusieurs scénarios d'amélioration et de croissance ont été explorés afin d'évaluer les perspectives de progression de la filière vers un état plus durable. Les effets de l'activité de la filière sur ses parties prenantes ont été calculés en mobilisant deux méthodes d'évaluation : l'analyse environnementale du cycle de vie et la méthode des effets. Les résultats montrent que les exploitations agricoles réunionnaises et la fourniture électrique sur l'île sont responsables de la majorité des impacts environnementaux sur le territoire. A l'échelle globale, ces impacts résultent avant tout des cultures de maïs, de soja et de riz et de la production d'électricité. Les impacts socio-économiques de la filière interviennent surtout sur le territoire grâce à un recours important aux services locaux hautement générateurs d'emplois et d'un soutien fort aux communautés rurales. L'analyse met en évidence les compromis qui doivent être faits entre réduction des impacts environnementaux et accroissement des bénéfices sociaux et économiques pour le territoire. Le niveau de généricité du cadre conceptuel proposé a été évalué succinctement par rapport au mode d'organisation d'autres filières. Les filières agricoles prennent des formes très diverses dans le monde et l'on évalue aujourd'hui insuffisamment leurs effets sur les territoires. Une mise en œuvre systématique et généralisée du cadre conceptuel proposé pourrait y remédier. / Increasing food security while respecting global ecosystems and human societies will be one of the major challenges of the coming decades. Agricultural supply chains are potentially powerful tools for rethinking production and food supply patterns. They are currently under pressure to include sustainability in their corporate strategy. In this context, both industry and policy makers require methods to systematically evaluate both the impact and the provision of services by supply chains to ecosystems and societies. This thesis proposes a conceptual framework to measure the progress of a supply chain in terms of its contribution to the sustainable development of the territory in which it operates. The framework includes a strategic analysis of the territory for the collective identification of issues and possible measures for technical and organizational improvement. The framework encourages the quantification and spatial differentiation of effects with a view to inter-territorial equity. The different stakeholders involved, suppliers, competitors, the industrial environment and the community, should be included in the analysis. Applying strategic management theories, the number of stakeholders to include can be reduced to focus the analysis on the stakeholders that would be most affected by improvement measures. The framework can incorporate many available evaluation methods in the literature, such as life cycle assessment and the effects method, after some methodological adjustments. In each analysis, the most relevant methods are selected depending on the issues identified in the territory concerned. The conceptual framework was used to assess the effects of the main poultry supply chain in Reunion Island. Several scenarios for improvement and growth were explored to assess the prospects for progress of the supply chain towards sustainability. The effects of the activities of the supply chain on its stakeholders were calculated using two assessment methods: environmental life cycle assessment and the effects method. The results showed that in Reunion Island, the farms and the electricity supply are responsible for the majority of environmental impacts at the territorial scale, while at the global scale, environmental impacts result primarily from the production of maize, soybean and rice and the supply of electricity. Most of the social-economic impacts of the supply chain occur within the territory, which relies heavily on services, generating local employment and strong support for rural communities. The results of the analysis also highlight the required trade-offs between reducing environmental impacts and increasing the social and economic benefits of the supply chain. The proposed conceptual framework remains to be thoroughly evaluated in other supply chains. Agricultural supply chains take very different forms in the world today and their effects on territories have not been sufficiently evaluated. The widespread implementation of a systematic conceptual framework could remedy this situation.
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Potential pathogenicity and antimicrobial resistance of Escherichia coli from pig and poultry feces on-farm and carcasses at the abattoir in Vietnam

Pham, Thu Minh 12 1900 (has links)
E. coli avec potentiel zoonotique pourrait éclore dans les réservoirs porcins et avicoles. Cette étude consiste à examiner la présence de souches E. coli porteuses de gènes virulents associés aux STEC (E. coli producteurs de Shiga-toxines), EPEC (E. coli entéropathogène), et ExPEC (E. coli pathogène extra-intestinal) chez les porcs et volailles élevés au Vietnam. Des prélèvements d’excréments et de carcasses ont été effectués dans des fermes et abattoirs porcins et avicoles sélectionnés où les animaux ont été suivis de l’élevage à l’abattage. Un total de 13,1% des souches, toutes sources confondues, ont été catégorisées comme potentiellement contaminées par ExPEC, possédant un ou plusieurs gènes de virulence iucD, tsh, papC et cnf. Peu d’isolats d’autres pathotypes ont été observés. Tous les gènes de virulence ExPEC, à l’exception de cnf, ont été identifiés plus fréquemment dans les isolats de fèces et carcasses avicoles que dans les isolats porcins. Même constatation pour le groupe du phylogénétique D. Une multirésistance aux médicaments a été régulièrement observée chez les deux isolats ExPEC. Les isolats de fèces de volailles ont souvent été associés à une résistance à l’acide nalidixique et à la ciprofloxacine (P<0.05), de même qu’au gène blaTEM, alors que les gènes qnr et aac(6’)-Ib ont peu été rencontrés des deux côtés. Cette étude démontre que les isolats ExPEC avicoles sont potentiellement plus pathogèniques que ceux porcins et que les isolats ExPEC de carcasses porcines et avicoles peuvent provenir de leurs excréments par la contamination associée au processus d'abattage. Ainsi, la volaille, particulièrement, serait un facteur de transmission de souches ExPEC zoonotiques. / Zoonotic potential pathogenic Escherichia coli could arise from poultry and pig reservoirs. The aim of this study is to investigate the occurrence of E. coli strains carrying virulence genes associated with STEC (Shiga toxin-producing E. coli), EPEC (Enteropathogenic E. coli), and ExPEC (Extraintestinal pathogenic E. coli) in pigs and poultry on-farm and at abattoirs in Vietnam. Samples of feces and carcasses were collected at selected pig and poultry farms and abattoirs, in which animals were traced from farms to the abattoir. A total of 13.1% strains from all sources were classified as potential ExPEC, possessing one or more virulence genes iucD, tsh, papC and cnf. Few isolates of other pathotypes were observed. All ExPEC virulence genes, except cnf, were more frequently found in isolates from poultry than in isolates from pigs. A higher proportion of ExPEC isolates belonging to phylogenetic group D was observed in poultry. Multi-drug resistance was frequently observed in ExPEC isolates from both pigs and poultry. Nalidixic acid and ciprofloxacin resistance were significantly associated with poultry feces isolates (P<0.05). blaTEM gene was more frequently associated with poultry isolates, whereas qnr and aac(6’)-Ib genes were present at low prevalence in pig and poultry isolates. This study demonstrates that poultry ExPEC isolates are potentially more pathogenic than pig ExPEC isolates, and ExPEC isolates in pig and poultry carcasses may originate from pig and poultry feces, due to contamination associated to slaughtering process. Thus, meats particularly from poultry, might be a vehicle for transmission of zoonotic ExPEC strains.
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Étude cas-témoins de l'épisode d'influenza aviaire hautement pathogène (H7N3) en Colombie-Britannique en 2004 utilisant des scores de biosécurité comme mesure de risque

Doucet, Annie January 2008 (has links)
Mémoire numérisé par la Division de la gestion de documents et des archives de l'Université de Montréal.

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