Submitted by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-12-12T12:50:54Z No. of bitstreams: 1 Tese - Ariel Dotto Blind.pdf: 3270818 bytes, checksum: 9fc21867a474b40f873deee98788cee7 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-12-12T12:52:46Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Tese - Ariel Dotto Blind.pdf: 3270818 bytes, checksum: 9fc21867a474b40f873deee98788cee7 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-12-12T12:53:12Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Tese - Ariel Dotto Blind.pdf: 3270818 bytes, checksum: 9fc21867a474b40f873deee98788cee7 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-12-12T12:53:12Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Tese - Ariel Dotto Blind.pdf: 3270818 bytes, checksum: 9fc21867a474b40f873deee98788cee7 (MD5) Previous issue date: 2016-03-03 / FAPEAM - Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas / The culture of the loofah has been outstanding in the market of natural fibers for easy manipulation and applicability in various sectors of agribusiness. The study of the molecular diversity varietal level, morphological and productive within a germplasm collection are essential for the establishment of a selection and playback program that allows screening of materials with desirable characteristics for different applications. In this sense the objective of this work was to study the genetic divergence loofah access from binary data, multicategorios and quantitative, in addition to parallel correlation analysis, estimates of genetic parameters and regression analysis on performance for six months. 24 loofah access, are in the BAG-UFAM and come from the states of Amazonas, Rondônia, Pará, Federal District, São Paulo, Paraná and Santa Catarina assembled and assigned institutionally through germplasm assignment of the Federal University of Amazonas, Embrapa vegetables, Institute Agronomic of Paraná, and the Campinas Agronomic Institute. The results of the diversity at the molecular level and morphological and agronomic demonstrates that there different groups of settings both with wide variability potêncial to be explored between accesses. Regarding the qualitative and quantitative data results showed that the materials are phenotypically different for 30 descriptors analyzed with different botanical and biometric conformations of which the variable; fruit length (62.32%) was the component that contributed most to divergence found. There is a positive correlation between the variables; fruit length x fiber mass thickness x of the fibrous web. The fruit number was the parameter showed the lowest heritability (71.9%) among the analyzed carcteristicas. Regarding the productive performance, the most hits have aptitude for planting in the area may accumulate in period of six months up to 87 fruits per plant. Regression analysis on productive behavior for six months for the fruit number, the mass of fiber and the length of fruits, reveal better understanding from the fourth order in the polynomial equation, and between one harvest and another there is more seasonal or less marked. / A bucha vem se destacando no mercado de fibras naturais pela facilidade de cultivo e aplicabilidade em diversos setores da agroindustria. O estudo da diversidade varietal ao nível molecular, morfológico e produtivo, dentro de uma coleção de germoplasma são atividades essenciais para o estabelecimento de um programa de seleção e reprodução que permita triagens de genótipos com características desejáveis, para diferentes finalidades. Neste sentido o objetivo deste trabalho foi estudar a divergência genética de acessos de bucha a partir de dados bínarios, multicategórios e dados de produtividade, além de análises paralelas de correlação, e análise de regressão sobre o desempenho produtivo durante seis meses. Os 24 acessos de bucha, foram do Banco Ativo de Germoplasma-UFAM e são provenientes dos estados do Amazonas, Rondônia, Pará, Distrito Federal, São Paulo, Paraná e Santa Catarina reunidos e cedidos institucionalmente por meio de cessão de germoplasma entre a Universidade Federal do Amazonas, Embrapa Hortaliças, Instituto Agronômico do Paraná, e Instituto Agronômico de Campinas. Os resultados obtidos sobre a diversidade a nivel molecular e morfo-agronômica demostra que existe diferentes configurações de agrupamentos ambos com ampla variabilidade potêncial a ser explorada entre os acessos mesmo que dispersos geograficamente. Com relação aos dados qualitativos e quantitativos os resultados demostraram que os acessos são fenotipicamente diferentes para 30 descritores analisados com diferentes conformações botânicas e biométricas sendo que a variavel; comprimento de frutos (62,32%) foi o componente que mais contribuiu para divergência encontrada. Existe correlação positiva entre as variáveis; comprimento do fruto x massa de fibra x espessura da manta fibrosa. Com relação ao desempenho produtivo, a maioria dos acessos possue aptidão para plantio na região, podendo acumular em periodo de seis meses até 87 frutos por planta. A análise de regressão sobre o comportamento produtivo durante os seis meses, para o número de frutos, a massa de fibra e o comprimento de frutos, revelam melhor entendimento a partir da 4a ordem na equação polinomial, evidenciando que entre uma colheita e outra existe sazonalidade moderadamente acentuada.

Submitted by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-12-15T19:56:48Z No. of bitstreams: 1 Tese - Wagner C. Pinto.pdf: 7252697 bytes, checksum: 04b262f848b434064bd753a18afad076 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-12-15T19:57:03Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Tese - Wagner C. Pinto.pdf: 7252697 bytes, checksum: 04b262f848b434064bd753a18afad076 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-12-15T19:57:26Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Tese - Wagner C. Pinto.pdf: 7252697 bytes, checksum: 04b262f848b434064bd753a18afad076 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-12-15T19:57:26Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Tese - Wagner C. Pinto.pdf: 7252697 bytes, checksum: 04b262f848b434064bd753a18afad076 (MD5) Previous issue date: 2016-05-20 / This thesis was developed in order to analyze the environmental legibility in the cities of Manaus, Manacapuru and Rio Preto da Eva, State of Amazonas, Brazil. We sought to understand the environmental perception on the perspective of the systemic paradigm in order to highlight the imageability and legibility of urbanites elements in theses cities. This research mapped out on the multiple case study replication, relying on in interview, questionnaire, delphi technique, field diary and observation in locus. In this way, trails were set in order to not only head the collection of data by direct observation but also feed information to the diary. As to respondents, these one had opportunity to draw their respective city where they has been living, and so they might list some remarkable and essential elements to the memory of a imagery reality. Moreover, a focus of systems was given to the research enhancing the idea that they involve connectivity, integration and totality. The aim of the systemic paradigm allowed to figure out the need for legibility paradigm for the cities which have been studied and also the lack of political leadership realize certain dimension of urban and spatial planning, aiming at treasuring better ways of urbanization, afforestation, and with priority being given to the urban elements and environmental practices for a more assertive city. Furthermore, specific and free softwares were used for projecting the image of each city. This study also broaches the ecological historicity in each city under the perspective of application and understanding in the dialogical process of transformation of urban settings as well as the influence on the current design of the cities chosen for the accomplishment of this research; tabulation of data collected was done by means of the application of identification model in regards to urbanites elements mentioned by Lynch (2011): landmark, nodal point, boundaries, roads and neighborhoods. Another part of the data was analyzed following the same logic of applied instrument (questionnaire) such as: visibility, structural changes and capitalists, design of streets and qualities as to the form. At the end, the proposal brings a new conceptual episteme, which contemplates the understanding of the emergence of two matrices: one named ecocentric urban design matrix and the other capitalist urban design matrix. At last, we have the confirmation of the thesis whose assertation stands out the environmental image of the cities of Manaus, Manacapuru and Rio Preto da Eva has their legibility defined by the developmental characteristic and industrial expansion, and not effectively brings on a city environmentally "visible". This is because the legibility of them, in light of the systemic conception contradicts the imageability brought about by the logic of capitalism / Esta tese foi desenvolvida com o objetivo de analisar a legibilidade ambiental nas cidades de Manaus, Manacapuru e Rio Preto da Eva, no estado do Amazonas, Brasil. Buscou-se compreender a percepção ambiental sob a ótica do paradigma sistêmico com vista a destacar a imaginabilidade e a legibilidade de elementos citadinos nas cidades mencionadas. O delineamento da pesquisa consistiu na replicação de estudo de caso múltiplo, com auxílio de entrevista, questionário, técnica Delphi, diário de campo e observação in lócus. Foram definidas trilhas para direcionar a coleta de dados por observação direta e alimentar informação para o diário de campo. Aos entrevistados foram dadas oportunidades de desenhar a cidade onde moram, listar elementos destacáveis e essenciais para lembrança de uma realidade imagética. À pesquisa foi dado um enfoque de sistemas destacando a ideia de que eles envolvem conectividade, integração e totalidade. O enfoque do paradigma sistêmico possibilitou-nos concluir pela necessidade de um paradigma de legibilidade para as cidades estudadas e ainda, a falta de uma condução política em contemplar uma dimensão de planejamento urbano e espacial com vista a valorizar melhores formas de urbanização e arborização, e ainda, dar prioridade a elementos urbanos e práticas ambientais para uma cidade mais legível; Utilizaram-se softwares livres específicos para projetar uma imagem de cada cidade. Aborda-se também, a historicidade ecológica de cada cidade na perspectiva de aplicação e entendimento do processo dialógico de transformação de cenários urbanos, bem como a influência no design atual das cidades escolhidas para a pesquisa; a tabulação dos dados coletados deu-se pela aplicação de modelos de identificação de elementos citadinos de Lynch (2011): marco, ponto nodal, limites, vias e bairros. Outra parte dos dados foi analisada seguindo a mesma lógica do instrumento aplicado (questionário): visibilidade, mudanças estruturais e capitalistas, desenho das ruas e qualidades quanto à forma. Ao final, traz-se a proposta de uma nova episteme conceitual contemplando o entendimento do surgimento de duas matrizes: matriz de design urbano ecocêntrica e matriz de design urbano capitalista. Por fim, temos a confirmação da tese cuja assertiva consiste em afirmar que a imagem ambiental das cidades de Manaus, Manacapuru e Rio Preto da Eva tem sua legibilidade definida pela característica de desenvolvimento e expansão industrial, e não gera efetivamente uma cidade ambientalmente “visível”. Isto porque a legibilidade delas, à luz da concepção sistêmica, contradiz a imaginabilidade gerada pela lógica do capitalismo.

Submitted by Helena Bejio (helena.bejio@unioeste.br) on 2017-11-20T01:11:18Z No. of bitstreams: 2 Fabio_Corbari_2017.pdf: 1386794 bytes, checksum: e5e8c5540e2034674d5f706118e15bcf (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-11-20T01:11:19Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Fabio_Corbari_2017.pdf: 1386794 bytes, checksum: e5e8c5540e2034674d5f706118e15bcf (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2017-02-17 / The present work proposed an extensionist action aimed at the practice of the management of cooperatives through the digital inclusion for agents of cooperative solidarity economy of western of Paraná. The objective of this work was to promote an improvement in the knowledge and domain of family farmers in digital tools that can contribute with their everyday actions and the management of their enterprises, promoting the freedom of opportunities and knowledge in information and communication technologies. The methodology used in this work was based on an Action-Research, where initially an improvement of the practice was planned, through a deepening of the trajectory and fundamentals of solidarity economy and digital inclusion in family agriculture, contextualized and analyzed under a theoretical vision based in a bibliographic research, and carrying out a survey of problems, systematization and prioritization of demands with cooperative agents in solidarity with family agriculture. Following the knowledge of the main demands, it was acted to implement the planned improvement, through the training of digital inclusion for cooperatives and managers of solidarity economy cooperatives of the West of Paraná, teaching basic computer science, mathematics Finance, information and communication technologies, applied computing for property management and cooperatives, applied computing for environmental management, public policies for production and marketing, legislation for procurement via public procurement and marketing, and applied marketing for family agriculture, consisting of tools to assist In the management of rural properties and family agriculture cooperatives, using a methodology of easy application and understanding, based on the exchange of knowledge through dialogue and participatory communication. 150 farmers from 6 cooperatives took part in the training courses. In addition to this training process, the participating farmers and cooperatives were monitored through unsystematic observation in order to follow the learning of the actors involved in the research and the application of the proposed themes in the management actions of cooperatives and their properties, And finally, to describe the effects of the action and to evaluate the results, through the perception of day-to-day monitoring of cooperatives and the application of questionnaires and interviews, asking a sample of 50 farmers who completed all the modules on the use And mastery of the main digital tools for the management of their enterprises before the application of the training course and then, as well as the importance that they determine for each proposed theme. The results show that although they have access to computers and the internet, farmers did not have knowledge or mastery of the subjects that were proposed, even if they consider the use of digital technologies to manage their enterprises of paramount importance. After capacity building, the domains of all themes have grown considerably among all farmers, promoting the opportunity to liberate themselves through knowledge. However, actions such as these should be carried out constantly in the rural environment, updating them and enabling them to carry out the management of their enterprises with tools that contribute to a decision making with greater quality of information and communication facilitated to interact with society In general and access new marketing channels. / O presente trabalho propôs uma ação extensionista voltada para prática da gestão de cooperativas, através da inclusão digital, para agentes do cooperativismo de economia solidária do oeste do Paraná. O objetivo deste trabalho foi promover uma melhora no conhecimento e domínio de agricultores familiares em ferramentas digitais que possam contribuir com suas ações do cotidiano e a gestão de seus empreendimentos, promovendo a liberdade de oportunidades e conhecimento em tecnologias de informação e comunicação. A metodologia utilizada neste trabalho tomou por base uma Pesquisa-ação, onde inicialmente, planejou-se uma melhora da prática, através de um aprofundamento na trajetória e fundamentos de economia solidária e inclusão digital na agricultura familiar, contextualizados e analisados sob uma visão teórica baseando-se em uma pesquisa bibliográfica, e realizando um levantamento de problemas, sistematização e priorização de demandas com agentes do cooperativismo solidário da agricultura familiar. Após o conhecimento das principais demandas, agiu-se para implantar a melhora planejada, através da realização de capacitações voltadas para a inclusão digital para cooperados e gestores das cooperativas de economia solidária do Oeste do Paraná, com o ensino de temas sobre informática básica, matemática financeira, tecnologias de informação e comunicação, informática aplicada a gestão de propriedades e cooperativas, informática aplicada a gestão ambiental, políticas públicas de produção e comercialização, legislação para compras via licitação e contratos públicos e marketing aplicado para agricultura familiar, consistindo em ferramentas para auxiliar na gestão de propriedades rurais e cooperativas da agricultura familiar, utilizando uma metodologia de fácil aplicação e entendimento, embasada na troca de saberes através do diálogo e comunicação participativa. Participaram dos cursos de capacitação 150 agricultores de 6 cooperativas. Em complemento a este processo de capacitação, monitorou-se os agricultores e cooperativas participantes, através de observação assistemática, com o intuito de acompanhar o aprendizado dos atores sujeitos da pesquisa e a aplicação dos temas propostos nas ações de gestão das cooperativas e suas propriedades, e por fim, descrever os efeitos da ação e avaliar os resultados, através da percepção do acompanhamento no dia a dia das cooperativas e pela aplicação de questionários e entrevistas, perguntando, para uma amostra de 50 agricultores que concluíram todos os módulos, sobre a utilização e domínio das principais ferramentas digitais para a gestão de seus empreendimentos antes da aplicação do curso de capacitação e depois, assim como a importância que eles determinam para cada tema proposto. Os resultados visualizados demonstram que embora tenham acesso a informática e internet, os agricultores não detinham de conhecimento ou domínio dos temas que foram propostos, mesmo que considerem de suma importância a utilização das tecnologias digitais para a gestão de seus empreendimentos. Após a realização da capacitação, os domínios de todos os temas tiveram um crescimento considerável entre todos os agricultores, promovendo a oportunidade de se libertarem através do conhecimento. Entretanto, ações como estas devem ser realizadas constantemente no meio rural, atualizando-os e capacitando-os para a realização da gestão de seus empreendimentos com ferramentas que contribuam em uma tomada de decisão com maior qualidade de informação e comunicação facilitada para interagir com a sociedade em geral e acessar novos canais de comercialização.

Submitted by Helena Bejio (helena.bejio@unioeste.br) on 2018-07-12T22:57:12Z No. of bitstreams: 2 Nanci_Dissertação nanci final -13 12 2017.pdf: 4385347 bytes, checksum: 5ea5c2a03a035804be32a7435f1c0486 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2018-07-12T22:57:12Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Nanci_Dissertação nanci final -13 12 2017.pdf: 4385347 bytes, checksum: 5ea5c2a03a035804be32a7435f1c0486 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2017-08-31 / The present research had as objective to analyze the actions of the Milk of the Children program of the state of Paraná and its beneficiaries in the context of rural development in the municipality of Cafelândia. Initially, questionnaires were applied to the beneficiaries: rural producer, plant and responsible for the children attended, concomitantly analyzed the reports of quality control of milk and prices paid to producers available on the official website. It was observed that the producers had milk production as the main monthly income, but they complained about the value paid for the product, even without knowing how to calculate the cost of this production. The plant considers the program positive, but acknowledged that there were eventually miscommunications of information provided by the secretariats involved. Most of the evaluated children were in weight appropriate for the age, given very positive for the municipality and that can serve as a guide for new actions. Regarding the quality of the milk distributed, the municipality registered the best results in the period, receiving the maximum values, that is, an increase of 1.8% per liter of milk. Given this context, it can be observed that the program studied can contribute to rural development since it improves some details: improve the technical support to producers in understanding the dynamics of costs and calculation of profits, reevaluate the financial increases for those who meet the requirements improve the communication between sectors, systematize the data recording of the producers and children served, improving the monitoring of the program and, finally, to introduce continued nutritional education to the beneficiaries. / A presente pesquisa teve como objetivo analisar as ações do programa Leite das Crianças do estado do Paraná e seus beneficiários no contexto do desenvolvimento rural no município de Cafelândia. Inicialmente, foram aplicados questionários aos beneficiários: produtor rural, usina e responsáveis pelas crianças atendidas, concomitantemente foram analisados os laudos de controle de qualidade do leite e preços pagos aos produtores disponibilizados no site oficial. Observou-se que os produtores tinham a produção de leite como a principal renda mensal, mas reclamavam do valor pago pelo produto, mesmo sem saber calcular o custo desta produção. A usina considera o programa positivo, mas reconhecia que eventualmente haviam desencontros de informações repassadas pelas secretarias envolvidas. A maioria das crianças avaliadas se encontrava em peso adequado para a idade, dado muito positivo para o município e que pode servir de direcionamento para novas ações. Quanto à qualidade do leite distribuído a usina cadastrada do município apresentou melhores resultados no periodo, recebendo os valores máximos, ou seja, acréscimo de 1,8% por litro de leite. Diante desse contexto, observa-se que o programa estudado pode contribuir com o desenvolvimento rural desde que aprimore alguns pormenores: aperfeiçoar o apoio técnico aos produtores no entendimento da dinâmica dos custos e cálculo de lucros, reavaliar os acréscimos financeiros para aqueles que atenderem aos quesitos de qualidade do produto, implantar melhorias na comunicação entre os setores, sistematizar o registro de dados dos produtores e crianças atendidas melhorando a monitorização do programa e por fim a inserir a educação nutricional continuada aos beneficiários.

Submitted by Helena Bejio (helena.bejio@unioeste.br) on 2018-11-29T09:57:30Z No. of bitstreams: 2 Marcelo_Schneider_2018.pdf: 4164082 bytes, checksum: 2703f60a7d0b369bee2678fd799fa607 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2018-11-29T09:57:30Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Marcelo_Schneider_2018.pdf: 4164082 bytes, checksum: 2703f60a7d0b369bee2678fd799fa607 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2018-07-27 / In this work, the objective was to develop an evaluative study on the implantation of Small Hydroelectric Plants - PCHs - in the Piquiri River Basin. Faced of environmental and development concerns, the following question arose: To what extent does the energy policy of SHPPs in the Rio Piquiri affect the right to sustainable regional development? The methodology used was an empirical field research with interviews, where the interviewees were qualified in three groups, being in the first group the People of the Community in General, Riverside of PCH of Cantú II. The second group is of PCH Employees. The third group is formed by public managers with the positions or functions of Secretaries of Environment and / or agriculture; president of rural unions and regional manager of IAP. It is concluded from this study that although the hydroelectric energy from PCHs is considered a renewable energy, it nevertheless contributes to the environmental impacts. Alternative sources of clean energy can be assessed according to Agenda 2030 and also the condition of financial compensation for the PCH territory, with royalties such as the large hydroelectric plants. It is a significant opportunity that contributes to Sustainable Development by providing a fundamental quality of life to every community involved. / Neste presente trabalho, objetivou-se desenvolver um estudo avaliativo sobre a implantação de Pequenas Centrais Hidrelétricas – PCHs – na Bacia Hidrográfica do Rio Piquiri. Diante das preocupações com o Meio Ambiente e o desenvolvimento, originou-se a seguinte questão: Em que medida a política energética de PCHs no Rio Piquiri impacta no direito ao desenvolvimento regional sustentável? A metodologia utilizada foi uma pesquisa de campo de base empírica com entrevistas, onde os entrevistados foram qualificados em três grupos, sendo no primeiro grupo as Pessoas da Comunidade em Geral, Ribeirinhos da PCH de Cantú II. O segundo grupo são de Funcionários de PCH. O terceiro grupo está formado por Gestores públicos com os cargos ou funções de secretários de Meio Ambiente e/ou agricultura; presidente de sindicatos rurais e gestor regional do IAP. Conclui-se deste estudo que apesar a energia hidroelétrica oriunda de PCHs ser considerada uma energia renovável, mesmo assim contribui com impactos ambientais. Pode-se avaliar as fontes alternativas de energia limpa conforme a Agenda 2030 e também a condição de se compensar financeiramente o território da PCH, com Royalties como as grandes Usinas Hidrelétricas. É uma oportunidade significativa que contribui ao Desenvolvimento Sustentável proporcionando uma qualidade de vida fundamental a toda comunidade envolvida.

Submitted by Amauri Alves (amauri.alves@ufv.br) on 2015-11-03T15:06:33Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1310681 bytes, checksum: ae3d027db5649c35ff8ef366ea4689e0 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-11-03T15:06:33Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1310681 bytes, checksum: ae3d027db5649c35ff8ef366ea4689e0 (MD5) Previous issue date: 2015-02-25 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Bacillus thuringiensis é uma espécie comumente associada a solos, insetos e plantas. Diversas linhagens são importantes para diferentes formas de controle biológico na agricultura e em outras áreas. Neste trabalho, foi sequenciado e anotado o genoma de B. thuringiensis BAC3151 endofítico do feijoeiro comum (Phaseolus vulgaris), um isolado que tem demonstrado atividade antimicrobiana contra bactérias patogênicas, incluindo bactérias fitopatogênicas do feijoeiro, possuindo, portanto, potencial para biocontrole de doenças nessa leguminosa. O genoma de BAC3151 e o de outros B. thuringiensis publicados forneceu a oportunidade para realizarmos análises de genômica comparativa entre diferentes linhagens dessa espécie dinâmica. A análise filogenômica utilizando os genes core das linhagens avaliadas agrupou BAC3151 com B. thuringiensis MC28 isolado de solo. Também foram identificados rearranjos cromossomais de grandes segmentos em BAC3151 e em outras linhagens, sugerindo que rearranjos podem contribuir para diferenças funcionais dessas linhagens. O genoma core das linhagens estudadas consistiu em 3413 sequências codificadoras de proteínas (CDSs) e incluiu as CDSs com funções fisiológicas gerais e de sobrevivência da espécie, enquanto as CDSs do genoma acessório foi associada a plasmídeos e a regiões cromossômicas específicas. Além disso, foram encontrados múltiplos genes potencialmente envolvidos na ação antagonista de BAC3151 contra outros micro-organismos e insetos, incluindo genes inseticidas, policetídeos sintases, bacteriocinas, peptídeos não-ribossomais sintetases, sideróforos, quitinases, N-acil homoserina lactonase e outros. Este estudo mostrou diversas variações entre linhagens de B. thuringiensis em nível genômico e também que B. thuringiensis BAC3151 endofítico do feijoeiro é potencialmente útil para o desenvolvimento de estratégias para o controle biológico de doenças nessa importante leguminosa. / Bacillus thuringiensis is a species commonly associated with soil, insects and plants. Several strains are important for different types of biological control in agriculture and other areas. In this work, was sequenced and annotated the genome of endophytic B. thuringiensis BAC3151 of common bean (Phaseolus vulgaris), an isolate that has demonstrated antimicrobial activity against pathogenic bacteria, including plant pathogenic bacteria of the common bean, having, in this way, potential for biocontrol of diseases in this legume. The genome of BAC3151 and the other B. thuringiensis published provided the opportunity to accomplish comparative genomic analysis between different strains of this dynamic species. The phylogenomic analysis using the core genes of the evaluated strains grouped BAC3151 with B. thuringiensis MC28 isolated from soil. Also, large chromosomal rearrangements were identified in BAC3151 and other strains, suggesting that rearrangements may contribute to functional differences of these strains. The core genome of the strains studied consisted of 3413 sequences encoding proteins (CDSs) and included the CDSs with general physiological functions and species survival, while the accessory genome CDSs were associated with plasmids and specific chromosomal regions. In addition, were found multiple potential genes involved in the antagonistic action of BAC3151 against other microorganisms and insects, including insecticidal genes, polyketide synthases, bacteriocins, nonribosomal peptide synthetases, siderophores, chitinases, N-acyl homoserine lactonase and others. This study showed several variations among strains of B. thuringiensis in genomic level and also that endophytic B. thuringiensis BAC3151 of common bean is potentially useful for the development of strategies for biological control in this important legume.

Submitted by Amauri Alves (amauri.alves@ufv.br) on 2015-11-03T16:17:32Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 584533 bytes, checksum: fd4ac14e1e677e1fdd9f3ee4f74281df (MD5) / Made available in DSpace on 2015-11-03T16:17:32Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 584533 bytes, checksum: fd4ac14e1e677e1fdd9f3ee4f74281df (MD5) Previous issue date: 2015-02-25 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Os vírus que infectam bactérias são denominados bacteriófagos, sendo também referidos como “fagos”. Os bacteriófagos que infectam bactérias fitopatogênicas, tem despertado crescente interesse devido ao seu potencial para o biocontrole. A bactéria Gram negativa Xanthomonas campestris pv. campestris, é o agente causal da podridão negra das brássicas (Brassicaceae), sendo responsável por perdas econômicas, resultantes do difícil controle. Assim, este trabalho teve como objetivo realizar o isolamento e a caracterização biológica e molecular de bacteriófagos infectando Xanthomonas campestris pv. campestris. Para isso, plantas da família Brassicaceae apresentando sintomas da podridão negra e solo rizosférico, foram coletados em campos de cultura em Coimbra-MG e triados para a presença de bacteriófagos adotando a técnica de formação de placas de lise por meio da sobrecamada de ágar. Das nove amostras analisadas, uma amostra apresentou placas de lise persistente nos quatro ciclos de propagação. O fago foi denominado Xacp1 e apresentou cabeça icosaédrica de aproximadamente 30 ± 5 nm de diâmetro e uma cauda curta com 6 ± 0,2 nm de comprimento e 7 ± 0,2 nm de diâmetro. O bacteriófago possui ácido nucleico composto por uma única molécula de DNA fita dupla (dsDNA) com tamanho estimado em 65 Kpb. De acordo com a morfologia e tipo de genoma, o bacteriófago Xacp1 foi classificado na família Podoviridae (Ordem Caudovirales). A sequencia do genoma completo do fago está sendo analisada e será utilizada para estudar o relacionamento filogenético com outros bacteriófagos que infectam Xanthomonas campestris. O bacteriófago mostrou capacidade em infectar apenas isolados de Xanthomonas vcampestris pv. campestris no teste de susceptibilidade, apresentando placas de lise com coloração, tamanho e formato padrão. Isolados bacterianos relacionados e não relacionados a Xanthomonas campestris pv. campestres não foram suscetíveis à infecção. Em conjunto esses resultados demostram que Xacp1 apresentou características ideais de especificidade e virulência que motivam futuros estudos para sua utilização como uma ferramenta biotecnológica para a utilização no biocontrole da podridão negra em brássicas. / Viruses that infect bacteria are termed bacteriophages, and also referred to as “phage”, or “bacteriovírus”. The bacteriophages that infect bactéria plant pathogens, has attracted increasing interest due to its potential for biocontrol. The gram-negative bacterium Xanthomonas campestris pv. campestris is causal agent of black rot of crucifers (Brassicaceae), accounting for economic losses resulting from difficult to control. This study had objective perform the isolation and molecular characterization of biological and bacteriophage infecting Xanthomonas campestris pv. campestris. For this, plants of the family Brassicaceae showing symptoms of black rot and rhizosphere soil were collected in crop fields in Coimbra-MG and screened for the presence bacteriophage adopting the technique of forming plaques by agar overlay. The analyzed nine samples, one sample showed signs of Persistent lysis in four cycles of the spread. The phage was named φXacp1 and icosahedral head showed approximately 30 ± 5 nm in diameter and a tail short-± 5 nm in length and 0.7 ± 0.3 4 nm diameter. The bacteriophage has nucleic acid consists of a single double stranded DNA molecule (dsDNA) with size estimated at 65 kbp. According to the morphology and type of genome, bacteriophage φXacp1 scored in Podoviridae family (Order Caudovirales). The sequence the complete genome of the phage is being analyzed and will be used to study the phylogenetic relationships with other bacteriophages that infect Xanthomonas campestris. The bacteriophage showed ability to infect only Xanthomonas campestris pv. campestris in susceptibility testing, presenting plaques staining, size and pattern shape. Isolated bacterial related and unrelated to Xanthomonas campestris. Country were not susceptible to infection. viiTogether these results demonstrate that φXacp1 presented ideal characteristics of specificity and virulence that motivate future studies for its use as a biotechnological tool for use in biocontrol of black rot in crucifers.

Submitted by Amauri Alves (amauri.alves@ufv.br) on 2015-11-10T14:03:02Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 858318 bytes, checksum: 979bd272711d152ce5614363494bbec0 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-11-10T14:03:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 858318 bytes, checksum: 979bd272711d152ce5614363494bbec0 (MD5) Previous issue date: 2014-02-21 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Para garantir a sua sobrevivência, as plantas desenvolveram mecanismos para lidar com estresses. Trabalhos recentes tem sugerido um papel importante das giberelinas (GAs) na sobrevivência das plantas sob condições adversas. No entanto, pouco se sabe sobre as implicações fisiológicas, metabólicas e bioquímicas em plantas com alterações nos níveis endógenos de GAs quando submetidas à deficiência hídrica. Dessa forma, este trabalho teve como objetivo avaliar os efeitos fisiológicos e bioquímicos da alteração endógena nos níveis de GAs em tomateiros mutantes, gib1, gib2 e gib3, deficientes na biossíntese de GAs, em condições de deficiência hídrica. Demonstrou-se que plantas mutantes tem a capacidade de manter a água na folha por mais tempo e são capazes de recuperar a fotossíntese mais rapidamente, quando comparado ao WT, após passarem por um período de deficiência hídrica. Adicionalmente, plantas gib2 e gib1 não apresentaram murcha aparente mesmo com valores de potencial hídrico baixos. Este fenótipo foi relacionado ao nanismo, encarquilhamento e engrossamento de folhas dos genótipos mutantes. No entanto, plantas mutantes apresentaram investimento no crescimento radicular em detrimento da parte aérea. Assim, plantas menores com sistemas radiculares desenvolvidos tem a capacidade de manter a água na folha por mais tempo por utilizarem a água disponível no solo mais lentamente. A restrição do crescimento pela menor disponibilidade de GAs pode ser vantajosa em ambientes adversos, por permitir o redirecionamento de recursos energéticos para mecanismos que promovem a sobrevivência. Os resultados aqui apresentados sugerem um papel importante das GAs para respostas de aclimatação ou de tolerância à deficiência hídrica. / To ensure their survival, plants have evolved mechanisms to deal with stress. Recent work has suggested an important role of gibberellins (GAs) in plant survival under adverse conditions. However, little is known about the physiological, metabolic and biochemical implications in plants with changes in endogenous levels of GAs when subjected to water deficit. Thus, this study aimed to evaluate the physiological and biochemical effects of changes in endogenous levels of GAs in mutant tomato, gib1, gib2 and gib3, deficient in the biosynthesis of GAs in water stress conditions. It was shown that mutant plants have the ability to retain water on the sheet for a longer time and are able to recover more quickly photosynthesis when compared to WT after undergoing a period of drought stress. Additionally, gib2 and gib1 plants showed no wilting apparent even with low values of water potential. This phenotype was related to stunting, leaf curling and thickening of the mutant genotype. However, mutant plants showed investment in root growth at the expense of shoot. Thus, plants with smaller root systems have developed the capacity to retain water on the leaves for a longer time by using the available water more slowly in the soil. The growth restriction due to lower availability of GAs can be advantageous in adverse environments by allowing redirection of energy resources for mechanisms that promote survival. The results presented here suggest an important role of GAs responses to acclimation or drought tolerance.

Submitted by Amauri Alves (amauri.alves@ufv.br) on 2015-11-23T15:39:38Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1177179 bytes, checksum: dec9ea9972e24062fd20a5915e37c787 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-11-23T15:39:38Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1177179 bytes, checksum: dec9ea9972e24062fd20a5915e37c787 (MD5) Previous issue date: 2015-07-17 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / A estocagem de leite cru sob temperatura de refrigeração não impede o crescimento de bactérias psicrotróficas produtoras de proteases termorresistentes que comprometem a qualidade e reduzem a vida de prateleira de produtos lácteos. Para minimizar os problemas tecnológicos resultantes da atividade proteolítica, é desejável que proteases sejam detectadas e quantificadas em leite cru por um método rápido. No entanto, não existe um método eficiente para este fim. Este trabalho teve como objetivos identificar as espécies psicrotróficas com potencial de deterioração predominantes em leite cru brasileiro; identificar e caracterizar as proteases resistentes ao calor produzidas por esta microbiota e desenvolver um método rápido para detectar estas proteases em amostras de leite. As condições de armazenamento sob refrigeração foram simuladas e as bactérias psicrotróficas proteolíticas foram isoladas. As bactérias produtoras de proteases termorresistentes foram agrupadas após análise por Rep-PCR. Os testes bioquímicos e o sequenciamento dos genes rDNA 16S e rpoB foram utilizados para identificar representantes de cada grupo. Uma protease termorresistente produzida por Serratia liquefaciens foi caracterizada e o gene que codifica esta enzima foi identificado após análise dos peptídeos trípticos da protease por espectrometria de massa. Placas de microtitulação revestidas com caseína marcada com biotina foram utilizadas para quantificar a atividade proteolítica de amostras de leite e de proteases diluídas em solução tampão. Os isolados bacterianos altamente proteolíticos foram separados em oito grupos diferentes e quatro padrões únicos. Os isolados com potencial proteolítico são correspondentes à espécie Serratia liquefaciens e ao gênero Pseudomonas. Isolados de S. liquefaciens podem produzir uma metaloprotease termorresistente ao tratamento de 95 °C por 8,45 min, identificada como Ser2, com massa molar de, aproximadamente, 52 kDa e semelhante à protease AprX de Pseudomonas spp. Embora sequências de nucleotídeos do gene ser2 sejam conservadas entre os isolados de S. liquefaciens, o potencial de deterioração das estirpes é heterogêneo indicando diferenças nos níveis de expressão gênica, enzima viii ou modificações pós-transcricionais. O imunoensaio desenvolvido neste estudo foi eficiente para a quantificação da atividade de tripsina, papaína, pepsina, termolisina e protease de pâncreas bovino. No entanto, novas pesquisas devem ser realizadas para minimizar a influência dos componentes da amostra de leite nesta técnica para permitir a detecção acurada de proteases. Este trabalho destaca o elevado potencial de deterioração da microbiota encontrada em amostras de leite cru, além do desenvolvimento de um ensaio promissor, útil para a indústria de lacticínios, para detecção e quantificação de atividade proteolítica resultante das práticas agrícolas inadequadas nas propriedades produtoras de leite. / The storage of raw milk at cold temperatures does not prevent growth of psychrotrophic bacteria, which can produce heat-resistant proteases that compromise the quality and reduce the shelf life of dairy products. To minimize the technological problems resulting from proteolytic activity, these enzymes should be detected and quantified in raw milk before processing by a rapid method. However, there is no efficient method for this purpose. This work aimed to identify the predominant psychrotrophic species with spoilage potential in Brazilian raw milk, to identify and characterize the heat-resistant proteases produced by this microbiota and to developed a rapid method to detect these proteases in raw milk samples. The cold storage conditions were simulated and the psychrotrophic proteolytic bacteria isolated. The heat-resistant protease-producing bacteria were typing by Rep-PCR and clustered. Biochemical tests, 16S rDNA and rpoB gene sequencing were used for identifying one representative isolate from each cluster. The heat-resistant protease produced by Serratia liquefaciens was characterized. The encoding gene was identified after mass spectrometry analysis of tryptic peptides from the heat-resistant protease. The biotinylated casein was coated on microtiter plates and used as substrate to quantify proteolytic activity in solution and milk samples. Highly proteolytic strains were identified and characterized. The isolates were separated into eight different clusters and four solitary fingerprints. The most proteolytic isolates belonged to Serratia liquefaciens and Pseudomonas species. The S. liquefaciens isolates may produce Ser2, which is a a metalloprotease resistant to the heat treatment of 95 °C for 8.45 min. This metalloprotease showed a molecular weight of approximately, 52 kDa and a heat- resistance similar to AprX from Pseudomonas spp. Although nucleotide sequences of ser2 gene were conserved among S. liquefaciens isolates, the spoilage potential among them was heterogeneous indicating differences in enzyme expression levels or post-transcriptional modifications. The developed immunoassay was efficient for quantification of trypsin, papain, pepsin, thermolysin and protease from bovine x pancreas activity. However, further research should be performed to minimize the influence of milk components on the developed assay for detecting proteases in milk samples. This work highlighted the poor conditions of hygiene in milk farms and the high spoilage potential of the microbiota found in raw milk samples besides the development of a promising assay for detection and quantification of proteolytic activity useful for dairy industry.

Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2016-12-19T11:37:21Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 310792 bytes, checksum: caf82302a4ecf7f0e277766716624795 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-12-19T11:37:21Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 310792 bytes, checksum: caf82302a4ecf7f0e277766716624795 (MD5) Previous issue date: 2003-11-28 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Este trabalho teve como objetivo discutir alguns aspectos relativos aos modelos utilizados na regulação florestal, tanto de florestas eqüiâneas quanto de povoamentos mistos, bem como propor modelos alternativos para ambas as situações. Para tal, este trabalho foi realizado em dois capítulos, sendo o primeiro referente aos modelos de regulação de florestas eqüiâneas e o segundo, à regulação de povoamentos mistos. No primeiro capítulo foi feita uma análise dos métodos de controle por área e por volume e proposto um modelo de controle por área estratificada. No caso do controle por área, obteve-se rapidamente a regulação, porém com a flutuação da produção. No controle por volume, conseguiu-se uma produção constante, porém com a flutuação da área colhida em cada período. O modelo proposto de controle por área estratificada mostrou-se eficiente, pois foi possível estabilizar as variáveis área colhida e produção. No segundo capítulo, analisou-se o modelo proposto tradicional, apresentado por BRUM NETO (2001), de implantação e regulação de povoamentos mistos, bem como sugeriu-se um modelo alternativo de implantação das culturas, objetivando antecipar a ocupação da terra e a regulação florestal. O método de estabelecimento desses povoamentos mistos tem como base a implantação de culturas em seqüência, o que configura uma rotação de culturas, de modo que, ao colher a última cultura da seqüência, implanta-se novamente a primeira, dando início a um novo ciclo. Esses povoamentos aproximam-se um pouco mais das características de uma floresta natural, sem perder características típicas de florestas homogêneas, como a possibilidade de aplicação de tratos culturais e a alta produtividade. A proposta apresentada neste trabalho de implantação simultânea de toda a seqüência de culturas em vários talhões mostrou-se eficiente, pois possibilitou a ocupação mais rápida da área e antecipou a regulação florestal dos povoamentos em questão. A análise econômica foi feita com base no Valor Esperado do Solo (VES) proporcionado por cada um dos modelos. Na situação hipotética aqui mostrada, de três culturas, com dois, três e cinco anos, respectivamente, o modelo alternativo apresentou a vantagem de ocupar a terra em um período de tempo mais curto e alcançar a regulação na metade do tempo gasto pelo modelo tradicional, além de vantagens em relação ao VES do modelo tradicional. / The objective of this work was to discuss some aspects relative to the models used in forest regulation, in both pure and mixed forests, as well as to propose alternative models for the two conditions. In order to do so, the work was carried out in two chapters, with the first concerning the pure forest regulation models and the second the mixed forest establishment regulation. In the first chapter, an analysis of control methods by area and volume was completed and a control model by stratified area was proposed. In the case of control by area, the regulation was quickly obtained, however, with production fluctuation. In the control by volume, a constant production was obtained, however, with fluctuation of the harvested area in each period. The control model by stratified area proposed was proved efficient, because it was possible to stabilize the variables harvested area and production. In the second chapter, the traditional proposed model, presented by BRUM NETO (2001), of implantation and regulation of mixed forests was analyzed, as well as it was suggested an alternative model of tree crop implantation aiming to advance land occupation and forest regulation. The method of establishing those mixed forests is based on sequential crop implantation, which characterizes crop rotation, so that after the last crop of the sequence is harvested, the first is again implanted starting off a new cycle. Those communities come a little closer the characteristics of a natural forest without losing typical features of homogeneous forests, as the possibility of applying cultivation and high productivity techniques. The proposal presented in this work to implant simultaneously the whole sequence of crops in several stands was proved efficient because it made it possible a faster land occupation and advanced forest regulation of those communities. The economical analysis was carried out based on the Expected Soil Value (VES) given by each model. In the hypothetical situation presented here, three crops with two, three and five years old respectively, the alternative model had the advantage of occupying the land in less time and attaining the regulation in half of the time spent by the traditional model, in addition to the advantages compared to VES of the traditional model.