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Associações genéticas entre características reprodutivas, de crescimento e produção de leite em animais Guzerá utilizando modelos de dimensão finita e infinita / Genetic associations between reproductive, growth and milk production traits in Guzerat cattle using finite and infinite dimensional modelsGama, Manuela Pires Monteiro da 19 January 2018 (has links)
Os objetivos deste trabalho foram estimar as associações genéticas entre características de crescimento e produção de leite, utilizando análises bicaracterísticas, e entre características de crescimento, perímetro escrotal e idade ao primeiro parto utilizando modelos de regressão aleatória, de animais da raça Guzerá. Para as análises bicaracterísticas foram utilizadas 252.257 informações de pesos de machos e fêmeas aos 120 dias (P120), ao desmame (PD), ao ano (P365), ao sobreano (PSOBRE) aos 24 meses de idade (P24) e 6.493 lactações encerradas (P305), pertencentes a 4.723 vacas, e os modelos incluíram como os efeitos aleatórios o genético aditivo direto, de ambiente permanente materno e residual, e como efeitos fixos os grupos de contemporâneos e a idade da vaca ao parto (efeito linear e quadrático). Para as análises com os modelos de regressão aleatória foram utilizadas 159.366 observações de pesos e 23.780 de perímetro escrotal, realizadas entre 335 e 724 dias de idade dos animais e agrupadas em classes com intervalo de 10 dias, e 63.596 observações de idade ao primeiro parto. Os efeitos aleatórios considerados foram o genético aditivo direto, de ambiente permanente e residual e como efeitos fixos os grupos de contemporâneos, a idade da vaca ao parto (efeito linear e quadrático) e a curva fixa para modelar a tendência média da população (quadrática) sobre as classes de idade. Foram testados quatro possíveis graus de polinômios de Legendre (zero, linear, quadrático e cúbico), sendo o quadrático mais adequado para descrever as variâncias das características analisadas. Para verificar a existência de diferentes padrões de crescimento e agrupar os touros com base nos seus valores genéticos para produção de carne, leite e duplo propósito, foram realizadas análises de componentes principais e de agrupamento. As herdabilidades estimadas foram 0,23; 0,14; 0,16; 0,17; 021 e 0,22 para P305, P120, PD, P365, PSOBRE e P24, respectivamente, sugerindo que para as características de pesos, as herdabilidades aumentam com o aumento da idade dos animais. Mesma tendência foi observada pelas análises de regressão aleatória, cujas herdabilidades variaram de 0,17 a 0,31. As correlações genéticas entre os pesos em diferentes idades e a produção de leite foram positivas e de magnitude moderada a baixa, variando de 0,27 a 0,38 sugerindo que a seleção para peso e P305 possa ser realizada de forma simultânea nos mesmos animais. As análises de componentes principais indicaram a mesma tendência observada pelas correlações genéticas. As análises de agrupamento mostraram que a raça Guzerá possui touros com diferentes perfis genéticos, sendo possível realizar a seleção para corte, leite ou duplo propósito. As correlações genéticas entre os pesos e perímetro escrotal foram positivas e favoráveis, variando de 0,31 a 0,47, indicando que a seleção para aumento do peso poderá resultar em animais com maior perímetro escrotal. As correlações entre peso e idade ao primeiro parto variaram de -0,56 a -0,38 e perímetro escrotal e idade ao primeiro parto variaram de -0,55 a 0,08, sugerindo que a redução da idade ao primeiro parto poderá ocorrer, a longo prazo, quando peso e perímetro escrotal forem objetivos de seleção. A eficiência relativa de seleção indicou maior resposta pela seleção indireta para idade ao primeiro parto, quando realizada a seleção para perímetro escrotal a partir dos 615 dias de idade, quando comparada com o ganho genético direto para idade ao primeiro parto. / The objectives of this study were to estimate the genetic associations between growth and milk production traits in Guzerat cattle using two-trait analysis and between growth traits, scrotal circumference and age at first calving using random regression models. For two-trait analysis, 252,257 weight records of males and females obtained at 120 days of age (W120), weaning (WW), yearling (YW), post-weaning (PWW) and 24 months of age (W24), as well as 6,493 complete lactation records (W305) of 4,723 cows, were used. The models included direct additive genetic, maternal permanent environmental and residual effects as random effects, and the contemporary groups and age of cow at calving (linear and quadratic effect) as fixed effects. For the random regression models, 159,366 observations of weight and 23,780 observations of scrotal circumference, obtained at 335 and 724 days of age of the animals and divided into classes at 10-day intervals, as well as 63,596 observations of age at first calving, were used. Random direct additive genetic, permanent environmental and residual effects and the fixed effects of contemporary group and age of cow at calving (linear and quadratic effect) were considered. A fixed curve was used to model the average trend of the population (quadratic) on the age classes. Four possible degrees of Legendre polynomials (zero, linear, quadratic and cubic) were tested and the quadratic polynomial was the most appropriate to describe the variances in the traits analyzed. Principal component and cluster analyses were performed to determine the existence of different growth patterns and to group bulls based on their breeding values for meat, milk and dual-purpose production. The estimated heritabilities were 0.23, 0.14, 0.16, 0.17, 0.21 and 0.22 for W305, W120, WW, YW, PWW and W24, respectively, suggesting that, for the growth traits, heritabilities increased with increasing age of the animals. The same trend was observed when random regression analysis was performed, with heritabilities ranging from 0.17 to 0.31. The genetic correlations between weights at different ages and milk yield were positive and of moderate to low magnitude, ranging from 0.27 to 0.38. These estimates suggest that selection for weight and W305 can be performed simultaneously in the same animals. Principal component analysis indicated the same trend as observed by the genetic correlations. Cluster analysis showed the presence of bulls with different genetic profiles in the Guzerat breed, thus permitting selection for meat, milk or dual purpose. The genetic correlations between weights and scrotal circumference were positive and favorable (0.31 to 0.47), indicating that selection for increased weight will result in animals with greater scrotal circumference. The correlations between weights and age at first calving ranged from -0.56 to -0.38 and between scrotal circumference and age at first calving from -0.55 to 0.08, suggesting that the use of weight and scrotal circumference as selection objectives will result in the long-term reduction of age at first calving. The relative efficiency of selection indicated a greater response to indirect selection for age at first calving when selecting for scrotal circumference after 615 days of age, compared to the genetic gain obtained by direct selection for age at first calving.
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Análise de cluster para determinação dos fatores associados às alterações da composição corporal em pacientes com doença inflamatória intestinalGondo, Fernanda Futino. January 2019 (has links)
Orientador: Sérgio Alberto Rupp de Paiva / Resumo: A Doença Inflamatória Intestinal (DII) apresenta curso variável. O tratamento adequado da fase aguda pode levar à remissão clínica da doença, cujo seguimento ocorre ambulatorialmente. Nesta condição, os pacientes mantêm hábito de vida normal e alguns ainda permanecem com inflamação. Esta situação de doença e estilo de vida pode interferir na composição corporal e no estado nutricional dos pacientes. Doença de Crohn (DC) e Retocolite Ulcerativa (RCU) são doenças heterogêneas em diversos aspectos, dentre eles na composição corporal e no estado nutricional. O objetivo do estudo foi avaliar clusters relacionados à variação do estado nutricional na DIl. Foi realizado estudo transversal com pacientes com DII, submetidos a avaliação clínica (Crohn’s Disease Activity Index (CDAI), escore de Mayo e uso de medicações), nutricional (recordatório de 24 horas, International Physical Activity Questionnaire (IPAQ), peso, estatura, Índice de Massa Corporal (IMC), absorciometria por raios-X de dupla energia (DEXA), análise de bioimpedância elétrica (BIA), força de preensão manual, teste de caminhada de 6 minutos) e laboratorial (hemoglobina (Hb), hematócrito (Ht), Proteína C Reativa (PCR), velocidade de hemossedimentação (VHS), albumina). Com base nestes parâmetros, foram diagnosticados com Desnutrição (Global Leadership Initiative on Malnutrition, GLIM) e Sarcopenia (European Working Group on Sacopenia in Older People 2, EWGSOP2). Foram realizados testes estatísticos descritivos por meio do ... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Inflammatory Bowel Disease (IBD) presents a variable course. Adequate treatment of the acute phase may lead to clinical remission of the disease, which is followed in the outpatient clinic. In this condition, patients maintain normal life habit and some still remain with inflammation. Both disease and lifestyle situation may interfere with the body composition and nutritional status of the patients. Crohn's disease (CD) and ulcerative colitis (UC) are heterogeneous diseases in several aspects, including body composition and nutritional status. The aim of the study was to evaluate clusters related to the variation of the nutritional status in IBD. A cross-sectional study was performed with IBD patients, by clinical (Crohn's Disease Activity Index (CDAI), Mayo score and medications), nutritional (24-hour recall, International Physical Activity Questionnaire (IPAQ), weight, stature, Body Mass Index (BMI), dual energy X-ray absorptiometry (DEXA), electrical bioimpedance (BIA), handgrip force, 6-minute walk test) and laboratorial evaluation (hemoglobin (Hb), hematocrit (Ht), C-Reactive Protein (CRP), erythrocyte sedimentation rate (ESR), albumin). Based on these parameters, were diagnosed Malnutrition (Global Leadership Initiative on Malnutrition (GLIM) and Sarcopenia (European Working Group on Sacopenia in Older People 2, EWGSOP2). Descriptive statistical tests were performed by mean ± standard deviation for numerical variables with normal or median distribution and quartiles (Q1... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor
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VARIAÇÕES FLORÍSTICAS E ESTRUTURAIS DE UM REMANESCENTE DE FLORESTA OMBRÓFILA MISTA MONTANA EM NOVA PRATA-RS / STRUCTURAL AND FLORISTIC VARIATIONS IN A REMNANT OF MONTANE MIXED OMBROPHYLOUS FOREST IN NOVA PRATA-RSCallegaro, Rafael Marian 24 February 2012 (has links)
Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / This work aimed to analyze floristic and structure variations in a Montane Mixed Ombrophylous Forest remnant, in the county of Nova Prata, RS. It was inventoried
71 parcels with dimensions of 10 x 100 m, using the process of systematic sampling in Two Stages. It were identified and measured all individuals with circumference at
breast height ≥ 30,0 cm. The dissertation was divided into two chapters, with specific objectives to analyze the presence of floristic groups (Chapter I) and diagnostic and
diagnose structural variations between clusters (Chapter II). The plots were classified by cluster analysis, using the Ward connection method. The plots were classified into
four distinct floristic groups that present differences in specific diversity, composition and floristic similarity. The group 3 included the largest area of forest remaining and it had the highest diversity values and species number between groups, and greater floristic similarity with the forest in general. It was observed that different species
dominate ecological groups in relation to the structure, favoring the development of specific populations. The aggregate (clustered) distribution pattern was the main
pattern of spatial distribution of species obtained in the groups, indicating that the species forming denser spots in the vegetation. The diameter and hypsometric structures proved to be different between groups indicating they have good capacity for renewal and a denser canopy bottom. In summary, the floristic groups of the Montane Mixed Ombrophylous Forest remnant had floristic and structural variations. These variations evidence the need to consider different arboreous communities in the case of an intervention. / O presente trabalho teve como objetivo geral analisar as variações florísticas e estruturais de um remanescente de Floresta Ombrófila Mista Montana, localizado no
município de Nova Prata, RS. Para isso, foram inventariadas 71 parcelas, com dimensões de 10 x 100 m, pelo processo de Amostragem Sistemática em Dois Estágios. Foram identificados e mensurados todos os indivíduos com circunferência
à altura do peito ≥ 30,0 cm. A dissertação foi dividida em dois capítulos, com os objetivos específicos de analisar a presença de grupos florísticos (Capítulo I) e diagnosticar variações estruturais entre os agrupamentos (Capítulo II). Por meio da análise de agrupamento, utilizando o método de ligação Ward, as parcelas foram classificadas em quatro grupos florísticos distintos, que apresentam diferenças de diversidade específica, composição e similaridade florística. O Grupo 3, que englobou a maior área do remanescente florestal, possui os maiores valores de
diversidade e número de espécies entre os grupos, e a maior similaridade florística com a floresta em geral. Em relação à estrutura, constatou-se que diferentes espécies dominam ecologicamente os grupos, favorecendo o desenvolvimento de
populações específicas. O principal padrão de distribuição espacial das espécies nos grupos obtidos foi o agregado (agrupado), indicando que as espécies ocorrem formando manchas mais densas na vegetação. As estruturas diamétrica e
hipsométrica mostraram-se distintas entre os grupos, e indicam que estes possuem boa capacidade de renovação e um dossel inferior mais denso. Em síntese, os grupos florísticos do remanescente de Floresta Ombrófila Mista Montana
apresentam variações florísticas e estruturais, as quais evidenciam a necessidade de se considerar as diferentes comunidades arbóreas no caso de uma intervenção.
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Classificação de anomalias e redução de falsos positivos em sistemas de detecção de intrusão baseados em rede utilizando métodos de agrupamento / Anomalies classification and false positives reduction in network intrusion detection systems using clustering methodsFerreira, Vinícius Oliveira [UNESP] 27 April 2016 (has links)
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Previous issue date: 2016-04-27 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Os Sistemas de Detecção de Intrusão baseados em rede (NIDS) são tradicionalmente divididos em dois tipos de acordo com os métodos de detecção que empregam, a saber: (i) detecção por abuso e (ii) detecção por anomalia. Aqueles que funcionam a partir da detecção de anomalias têm como principal vantagem a capacidade de detectar novos ataques, no entanto, é possível elencar algumas dificuldades com o uso desta metodologia. Na detecção por anomalia, a análise das anomalias detectadas pode se tornar dispendiosa, uma vez que estas geralmente não apresentam informações claras sobre os eventos maliciosos que representam; ainda, NIDSs que se utilizam desta metodologia sofrem com a detecção de altas taxas de falsos positivos. Neste contexto, este trabalho apresenta um modelo para a classificação automatizada das anomalias detectadas por um NIDS. O principal objetivo é a classificação das anomalias detectadas em classes conhecidas de ataques. Com essa classificação pretende-se, além da clara identificação das anomalias, a identificação dos falsos positivos detectados erroneamente pelos NIDSs. Portanto, ao abordar os principais problemas envolvendo a detecção por anomalias, espera-se equipar os analistas de segurança com melhores recursos para suas análises. / Network Intrusion Detection Systems (NIDS) are traditionally divided into two types according to the detection methods they employ, namely (i) misuse detection and (ii) anomaly detection. The main advantage in anomaly detection is its ability to detect new attacks. However, this methodology has some downsides. In anomaly detection, the analysis of the detected anomalies is expensive, since they often have no clear information about the malicious events they represent; also, it suffers with high amounts of false positives
detected. In this context, this work presents a model for automated classification of anomalies detected by an anomaly based NIDS. Our main goal is the classification of the detected anomalies in well-known classes of attacks. By these means, we intend the clear identification of anomalies as well as the identification of false positives erroneously detected by NIDSs. Therefore, by addressing the key issues surrounding anomaly based
detection, our main goal is to equip security analysts with best resources for their analyses.
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Uma abordagem baseada em tipicidade e excentricidade para agrupamento e classifica??o de streams de dadosBezerra, Clauber Gomes 24 May 2017 (has links)
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ClauberGomesBezerra_TESE.pdf: 7864722 bytes, checksum: 17c21362443f4d25511a0a211d52b805 (MD5) / Approved for entry into archive by Arlan Eloi Leite Silva (eloihistoriador@yahoo.com.br) on 2017-11-23T23:24:44Z (GMT) No. of bitstreams: 1
ClauberGomesBezerra_TESE.pdf: 7864722 bytes, checksum: 17c21362443f4d25511a0a211d52b805 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-11-23T23:24:44Z (GMT). No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 2017-05-24 / Nesta tese apresentamos uma nova abordagem para realizar o agrupamento e a classifica??o
de um conjunto de dados de forma n?o supervisionada. A abordagem proposta
utiliza os conceitos de tipicidade e excentricidade usados pelo algoritmo TEDA na detec??o
de outliers. Para realizar o agrupamento e a classifica??o ? proposto um algoritmo
estat?stico chamado Auto-Cloud. As amostras analisadas pelo Auto-Cloud s?o agrupadas
em unidades chamadas de data clouds, que s?o estruturas que n?o possuem formato ou
limites definidos. O Auto-Cloud permite que cada amostra analisada possa pertencer simultaneamente
a v?rias data clouds. O Auto-Cloud ? um algoritmo aut?nomo e evolutivo,
que n?o necessita de treinamento ou qualquer conhecimento pr?vios sobre o conjunto de
dados analisado. Ele permite a cria??o e a fus?o das data clouds de forma aut?noma,
? medida que as amostras s?o lidas, sem qualquer interven??o humana. As caracter?sticas
do algoritmo fazem com que ele seja indicado para o agrupamento e classifica??o
de streams de dados e para aplica??es que requerem respostas em tempo-real. O Auto-
Cloud tamb?m ? um algoritmo recursivo, o que o torna r?pido e exige pouca quantidade
de mem?ria. J? no processo de classifica??o dos dados, o Auto-Cloud trabalha como um
classificador fuzzy, calculando o grau de pertin?ncia entre a amostra analisada e cada data
cloud criada no processo de agrupamento. A classe a que pertence cada amostra ? determinada
pela data cloud com maior grau de pertin?ncia com rela??o a amostra. Para
validar o m?todo proposto, aplicamos o mesmo em v?rios conjuntos de dados existentes
na literatura sobre o assunto. Al?m disso, o m?todo tamb?m foi validado numa aplica??o
de detec??o e classifica??o de falhas em processos industriais, onde foram utilizados
dados reais, obtidos de uma planta industrial. / In this thesis we propose a new approach to unsupervised data clustering and classification.
The proposed approach is based on typicality and eccentricity concepts. This
concepts are used by recently introduced TEDA algorithm for outlier detection. To perform
data clustering and classification, it is proposed a new statistical algorithm, called
Auto-Cloud. The data samples analyzed by Auto-Cloud are grouped in the form of unities
called data clouds, which are structures without pre-defined shape or boundaries.
Auto-Cloud allows each data sample to belong to multiple data clouds simultaneously.
Auto-Cloud is an autonomous and evolving algorithm, which does not requires previous
training or any prior knowledge about the data set. Auto-Cloud is able to create and merge
data clouds autonomously, as data samples are obtained, without any human interference.
The algorithm is suitable for data clustering and classification of online data streams and
application that require real-time response. Auto-Cloud is also recursive, which makes it
fast and with little computational effort. The data classification process works like a fuzzy
classifier using the degree of membership between the analyzed data sample to each data
cloud created in clustering process. The class to which each data sample belongs is determined
by the cloud with the highest activation with respect to that sample. To validate
the proposed method, we apply it to several existing datasets for data clustering and classification.
Moreover, the method was also used in a fault detection in industrial processes
application. In this case, we use real data obtained from a real world industrial plant.
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Divergência genética de acessos e interação genótipo x ambiente de famílias de meloeiro / Genetic divergence of access and genotype x environment interaction of melon familiesAragão, Fernando Antônio Souza de 29 April 2010 (has links)
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Previous issue date: 2010-04-29 / The Brazilian melon agribusiness is in expansion, reaching almost 500 thousand tons per year and making melon the main domestic fruit in both exported volume and value, with this activity being concentrated in the Brazilian Semiarid region. However, Brazil ranks only twelfth among the producing countries in area planted and production and the twentieth-third in productivity, demonstrating that there is still much to do on melon breeding and genetic resources of this crop. Thus, the objectives of this work were to estimate the genetic diversity of melon accessions collected from the traditional agricultural areas of the Brazilian Northeastern region by using descriptors for the fruit and microsatellite markers, and to study the nature of genotype vs. environment interaction and to estimate genetic parameters and gains by selection of melon families, in the Jaguaribe/Assú irrigation projects (Ceará and Rio Grande do Norte States, Brazil). The study of genetic diversity showed great variability among accessions, within and among the botanical groups, enabling advances in genetic improvement of fruit quality traits. Cluster analysis by fruit descriptors formed eight groups, without taxonomic criteria. The characters fruit longitudinal diameter, number of fruits per plant, cavity thickness and total soluble solids were descriptors that contributed most to the dissimilarity of the genotypes. The SSR markers amplified 41 alleles with average of 2.41 alleles and three genotypes per locus. A phylogenetic molecular analysis separated the accessions into 13 groups, also without taxonomic coherence in groups formed. The degree of association between genetic distance morpho-agronomic and molecular matrices was null. Then, there was no significant association between the descriptors and SSR markers, which was predictable due the number of distinct groups, the quantitative nature of the descriptors and the distribution of SSR markers in the genome. In the study of genotype vs. environment interaction, there was heterogeneity among the families for all traits. Heritability estimates in the combined analysis were consistently lower than those estimated for each environment. The simple part of G vs. E interaction was always above 99%, except for pulp firmness, with a predominance of the large complex part between the pairs of environments A1 and A3 and A2 and A3. The direct gains by selection were higher than the indirect gains for all traits in all environments evaluated. Gains were closer to the direct genetic gains when the selection was based on the average of the three environments. Estimates of genetic parameters associated with the simple nature of the family vs. environment interaction allowed genetic progress by simple breeding methods. As the genotype-environment interaction overestimates the coefficient of genetic variation and genetic variance among families in an environment, genotype assessments in more than one location are necessary since that selection is made considering the average of the families on the environments. Therefore, the potential of genetic improvement was demonstrated for the germplasm used in the study of genetic diversity as well as for the germplasm evaluated in the analysis of genotype-environment interaction. / O agronegócio do melão brasileiro tem se expandido bastante, alcançando quase 500 mil toneladas de frutos por ano e tornando o melão a principal fruta nacional, tanto em volume de exportação quanto em valor exportado, estando esta atividade concentrada no semiárido brasileiro. Contudo, o Brasil é apenas o décimo segundo país em produção e área plantada e vigésimo terceiro em produtividade, evidenciando que ainda existe muito por ser feito em termos do melhoramento e recursos genéticos desta cultura. Assim sendo, os objetivos deste trabalho foram estimar a divergência genética de acessos de meloeiro coletados em propriedades de agricultura tradicional do Nordeste brasileiro, tanto por descritores do fruto quanto por marcadores microssatélites e estudar a natureza da interação genótipo x ambiente (G x A) bem como estimar parâmetros genéticos e ganhos por seleção de famílias de melão, no polo Jaguaribe-CE/Assu-RN. O estudo de divergência genética mostrou grande variabilidade entre os acessos, entre e dentro dos grupos botânicos, possibilitando avanços no melhoramento genético dos caracteres de qualidade dos frutos. A análise de agrupamento por descritores do fruto formou oito grupos, sem critérios taxonômicos. Os caracteres diâmetro lateral, número de frutos por planta, espessura da cavidade e sólidos solúveis foram os descritores que mais contribuíram para a dissimilaridade dos genótipos. Os marcadores SSR amplificaram 41 alelos com média de 2,41 alelos e três genótipos por loco. A análise filogenética molecular separou os acessos em 13 grupos, também sem coerência taxonômica nos grupos formados. O grau de associação entre as matrizes de distâncias genéticas morfoagronômica e molecular foi nulo, não havendo associação entre os descritores e os marcadores SSR, o que era previsível devido ao número distinto de grupos, a natureza quantitativa dos descritores e a forma de distribuição dos marcadores SSR no genoma. No estudo de interação genótipo x ambiente, houve heterogeneidade entre as famílias para todas as características avaliadas. As herdabilidades estimadas nas análises conjuntas foram sempre inferiores àquelas estimadas em cada ambiente. A parte simples da interação G x A foi sempre superior a 99%, exceto para firmeza da polpa, com amplo predomínio da parte complexa entre pares de ambientes A1 e A3 e A2 e A3. Os ganhos diretos com seleção foram maiores do que os ganhos indiretos para todas as características, em todos os ambientes avaliados. Os ganhos foram mais próximos dos ganhos genéticos diretos quando se praticou a seleção pela média dos três ambientes. As estimativas de parâmetros genéticos associadas à natureza simples da interação família x ambiente permitem progresso genético por meio de métodos de melhoramento menos sofisticados. Como a interação genótipo x ambiente superestima o coeficiente de variação genético e a variância genética entre famílias em um ambiente, são necessárias avaliações dos genótipos em mais de um local, desde que a seleção seja praticada considerando a média das famílias nos ambientes. Portanto, ficou comprovado o potencial de melhoramento genético tanto no germoplasma utilizado no estudo de divergência genética quanto do germoplasma avaliado nas análises da interação genótipo x ambiente.
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Características da circulação e da estabilidade atmosférica no estado do Rio Grande do Norte: aplicação da análise multivariada.RIBEIRO, Roberta Everllyn Pereira. 27 August 2018 (has links)
Submitted by Lucienne Costa (lucienneferreira@ufcg.edu.br) on 2018-08-27T14:18:56Z
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Previous issue date: 2015-02-26 / CNPq / As condições atmosféricas no Estado do Rio Grande do Norte em julho de 2011 foram investigadas através da Análise em Componentes Principais (ACP) e da Análise de Agrupamentos (AA) aplicadas a dados observacionais de ar superior. Totais diários de precipitação, imagens realçadas do satélite meteorológico GOES-12, e dados de reanálise também foram utilizados. Quatro eventos de chuva foram observados na primeira quinzena do mês. Um evento de precipitação intensa registrado no dia 16 em Natal totalizou 60,4 mm na cidade. No ambiente sinótico foi diagnosticado nos baixos níveis um cavado no leste do estado e área costeira próxima, associado a confluência nos baixos níveis e difluência nos altos níveis, e movimento ascendente em toda a troposfera, na véspera do evento. A ACP aplicada separadamente aos dados dos níveis de 1000, 850, 500 e 300 hPa resultou em um modelo com três componentes. O primeiro fator às 00 UTC está relacionado com a umidade, na baixa e média troposfera, e com a temperatura, na alta troposfera. Às 12 UTC, o primeiro fator tem relação com a temperatura em 1000 e 300 hPa, e com a umidade em 850 e 500 hPa. As séries temporais dos fatores das 12 UTC mostram aumento significativo da umidade na baixa troposfera, na véspera do evento. Na aplicação da AA aos fatores obtidos na ACP, os dias foram agrupados com base em características meteorológicas similares, para cada nível isobárico e horário sinótico. A aplicação da ACP e da AA a índices de estabilidade atmosférica agrupou os dias de acordo com a probabilidade de ocorrência de tempestades. Foram identificados sete grupos para cada horário sinótico: um grupo de difícil interpretação, quatro que agruparam dias com baixa probabilidade e sem registro de precipitação, na maioria dos dias, e dois que agruparam dias com probabilidade e registro de precipitação, na maioria dos dias. / The atmospheric conditions in the Rio Grande do Norte State on July 2011 were investigated by applying Principal Component Analysis (PCA) and Cluster Analysis (CA) to observational upper air data. Daily precipitation totals, enhanced GOES-12 satellite imagery and reanalysis data were also used. Four precipitation events were observed in the first half of the month. An intense rainfall event registered on day 16 in Natal accounted for a 60.4 mm daily total in the city. The synoptic ambient was characterized by a low level trough on coastal eastern Rio Grande do Norte and the nearby oceanic area, associated with low level convergence and upper level divergence, and upward motion throughout the troposphere, on the day before the event. The PCA applied separately to data of the 1000, 850, 500 and 300 hPa levels resulted in a three component model for the isobaric levels and synoptic times analyzed. The first factor at 00 UTC is related to moisture, in the low and middle troposphere, and temperature, in the upper troposphere. At 12 UTC the first factor is related to temperature at 1000 and 300 hPa, and moisture at 850 and 500 hPa. The 12 UTC factors time series show a significant increase in moisture in the low troposphere, on the day before the event. The CA applied to the factors obtained by means of PCA resulted in days grouped on the basis of similar meteorological characteristics, for each isobaric level and synoptic time. The application of PCA and CA to atmospheric stability indices grouped the days in accordance with the probability of storm occurrence: one group of difficult interpretation, four groups with low probability and no rainfall in the majority of the days, and two groups with probability and rainfall in the majority of the days.
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[en] DATA CLUSTERING: ANALYSIS OF METHODS AND DEVELOPMENT OF APPLICATION FOR CLUSTER ANALYSIS / [pt] AGRUPAMENTOS DE DADOS: AVALIAÇÃO DE MÉTODOS E DESENVOLVIMENTO DE APLICATIVO PARA ANÁLISE DE GRUPOSMARCOS NEVES DO VALE 23 March 2006 (has links)
[pt] A enorme massa de dados que é gerada pelas diversas
empresas diariamente
pode conter informações importantes que não são fáceis de
serem extraídas. Com
isso advém a necessidade de analisá-los automaticamente,
de forma adequada,
extraindo informação útil que pode agregar algum tipo de
conhecimento. Uma das
formas de se analisar os dados automaticamente é através
da análise de
agrupamentos. Ela procura encontrar grupos de dados
semelhantes entre si. As
técnicas de análise de agrupamentos revelam como os dados
estão estruturados e
resultam em um melhor entendimento sobre o negócio. Existe
ainda hoje uma
escassez de ferramentas para esse fim. Em um problema real
de agrupamento de
dados convém analisar os dados através da utilização de
diferentes métodos, a fim
de buscar aquele que melhor se adapte ao problema. Porém,
as ferramentas
existentes hoje em dia não são integradas, onde cada
ferramenta possui um
subconjunto dos métodos existentes de agrupamento. Dessa
forma o usuário fica
limitado à utilização de uma ferramenta específica ou é
obrigado a conhecer
diversas ferramentas diferentes, de forma a melhor
analisar os dados de sua
empresa. Esta dissertação apresenta uma revisão detalhada
de todo o processo de
análise de agrupamentos e o desenvolvimento de um
aplicativo que visa não
apenas a atender as deficiências presentes na maioria das
ferramentas com esse
fim, mas também a auxiliar, de forma mais completa, todo o
processo de análise
dos grupos. O aplicativo desenvolvido é de fácil
utilização e permite que a ele
sejam incorporados outros métodos eventualmente
desenvolvidos pelo usuário. O
aplicativo foi avaliado em três estudos de casos, os quais
visam demonstrar a
facilidade de uso do aplicativo, assim como avaliar as
vantagens do uso de
métodos de natureza fuzzy em uma base de dados real. / [en] The enormous data mass that is daily generated by several
companies can
contain critical information that might not be easily
retrieved, considering that the
amount of data is generally huge and/or the target
information might be spread
through different data bases. Taking that into
consideration, it might be necessary
to properly analyze the data in an automatic way, so
useful and valuable
information can be extracted. One way of automatically
analyzing data is through
cluster analysis. This type of analysis searches for
related similar data. These
clusters settle a data structure model and with proper
analysis can reveal important
information. The techniques used in cluster analysis
disclose how data is
structured and allow a better knowledge of the business.
Still today there is a lack
of tools for this purpose. On a real situation with a data
cluster problem it is wise
to analyze the data through different methods, so we can
find the one that better
fits the problem. However, today the existing tools are
not integrated, and each
tool has a subgroup of existing cluster methods. This way
the user stays limited to
use only one specific tool or is forced to be aware of a
number of different tools,
so he would be able to better analyze the company data.
This study presents a
detailed review of the whole group analysis process and
develops an application
that not only suggests how to cover the currently lack of
tools for this purpose, but
also to help the complete cluster analysis process in a
more extended way. The
application developed is user friendly and allows other
methods developed by
users to be incorporated. The application has been
evaluated into three case
studies with the purpose of demonstrating its user
friendly, as well as evaluating
the advantages of using fuzzy methods on a true data base.
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Divergência genética em genótipos de cana-deaçúcar (Saccharum spp.) através de caracteres morfoagronômicos e por marcadores moleculares. / Genetic divergence in sugarcane genotypes (Saccharum spp.) through morphoagronomical characters and molecular markers.Silva, Paulo Pedro da 30 August 2006 (has links)
This study had as objective to estimate the genetic divergence among sugarcane
genotypes by means of morphoagronomical characters and molecular markers,
and to verify the relation between these procedures. An experiment was
conducted in Rio Largo, AL, using a randomized block design with four repetitions.
The multivariated analysis of Principal Components, the genetic divergence
based on the Mahalanobis 2
ii' D Generalized Distance, and the Average Euclidean
Distance Standardized were used for the analysis of the quantitative characters.
Based on these distances, a grouping analysis was performed by the More
Distant Neighbor method and the UPGMA method, besides Tocher for 2
ii' D .
Jaccard coefficient and UPGMA grouping were used in the evaluation of the
genetic divergence by molecular markers and morphologic characters. The
inconsistency as to formation of different groups between the Standardized
Average Euclidean Distance and 2
ii' D of Mahalanobis characterize these two
estimates as measures of different dissimilarity. In the same way, the grouping
techniques by the More Distant Neighbor method and by UPGMA show graphical
dispersions that are not coincident, with differences in relation to the number of
groups and in the grouping pattern, while the grouping by UPGMA and obtained
by Tocher showed the same agreements. The 2
ii' D Distance of Mahalanobis
corresponded to the Principal Components technique, by showing the same
groups made by Tocher and UPGMA, obtained from 2
ii' D . However, these
techniques did not indicate agreement with the Standardized Average Euclidean
Distance. The correlation between the genetic divergence through morphologic
characters and estimated by molecular markers was significant, however, from
average magnitude (r = 0,47), indicating to be complementary measurements.
There was not significant correlation for the divergence obtained through
quantitative characteristics with the morphologic characters and molecular
markers obtained by the different estimators, as well as between Standardized
Average Euclidean Distance and the Mahalanobis 2
ii' D , which indicates clearly that
there is no relation between these estimates. / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Este trabalho teve como objetivos a estimação da divergência genética entre
genótipos de cana-de-açúcar, por meio de caracteres morfoagronômicos e
marcadores moleculares, e verificar a relação entre esses procedimentos. Foi
conduzido um experimento em Rio Largo, AL, utilizando o delineamento em
blocos casualisados com quatro repetições. Para a análise dos caracteres
quantitativos foi utilizada a análise multivariada de Componentes Principais,
divergência genética a partir da Distância Generalizada 2
ii' D de Mahalanobis e
Distância Euclidiana Média Padronizada. Com base nestas distâncias, realizaramse
análise de agrupamento pelo método Hierárquico do Vizinho mais Distante e
método UPGMA, além de Tocher para 2
ii' D . Na avaliação da divergência genética
por meio de marcadores moleculares e caracteres morfológicos, utilizou-se o
coeficiente de Jaccard e agrupamento UPGMA. As inconsistências quanto à
formação de diferentes grupos entre a Distância Euclidiana Média Padronizada e
a Distância 2
ii' D de Mahalanobis caracterizam estas duas estimativas como
medidas de dissimilaridade distintas. Da mesma forma as técnicas de
agrupamento pelo método do Vizinho mais Distante e por UPGMA evidenciam
dispersões gráficas não coincidentes, com diferenças quanto ao número de
grupos e ao padrão de agrupamento, ao passo que o agrupamento por UPGMA e
obtido por Tocher apresentaram a mesma concordância. A Distância 2
ii' D de
Mahalanobis correspondeu à técnica de Componentes Principais, por
apresentarem os mesmos grupos formados por Tocher e UPGMA, obtidos a partir
de 2
ii' D . No entanto, estas técnicas não indicaram concordância com a Distância
Euclidiana Média Padronizada. A correlação entre a divergência genética através
de caracteres morfológicos e a estimada por marcadores moleculares foi
significativa, porém, de média magnitude (r = 0,47), indicando serem medidas
complementares. Não houve correlação significativa para a divergência obtida por
meio de características quantitativas com os caracteres morfológicos e
marcadores moleculares, obtida pelos diferentes estimadores, assim como, entre
a Distância Euclidiana Média Padronizada e a 2
ii' D de Mahalanobis, o que indica
claramente não existir qualquer relação entre estas estimativas.
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Reconstrução de Sinais em Redes de Sensores sem Fios com Técnicas de Geoestatística. / Signal Reconstruction in Wireless Sensor Networks with Geotatistics Techniches.Vieira, Bruno Lopes 28 May 2010 (has links)
Wireless sensor networks are formed by mobile devices that collect and process data from
an enviroment, and transmit them to a data center wich is responsible for taking decisions.
This work aims to analyze the signal reconstruction in these networks using geostatistic
techniques. Three processes of kriging are used: simple, ordinary and bayesian. Three approaches
to simple krigingwere found in the literature, according to the way themean of the
data is estimated,were assessed themall. A newBayesian approach is proposed: use general
least square to estimate the mean, and set it as a constant into the Bayesian inference. The
effect of clustering techniques is assessed, namely without clusters and with clusters formed
by LEACH and SKATER algorithms. Bayesian kriging presents the best qualitative results in
almost all scenarios, but it is not available to systems that require fast aswers; in this case
we recommend ordinary kriging. The proposed variant of Bayesian kriging reduces the time
required, without hampering the quality of the reconstructed signal, but the time reduction
is not enough for real-time systems / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / As Redes de Sensores sem Fios (RSsF) são conjuntos de dispositivos que obtêmamostras de
fenômenos ambientais, sejam eles naturais (como, por exemplo, temperatura, pressão atmosférica,
intensidade de iluminação, concentração de substâncias em cursos d água) ou
antrópicos (qualidade do ar em sinais de trânsito, pressão ao longo de um oleoduto). Esses
dispositivos têm despertadomuito interesse, tanto pelas suas potenciais aplicações quanto
pelos desafios teóricos e tecnológicos que seu uso otimizado oferece. O objetivo deste trabalho
trata da análise da reconstrução de sinais nessas redes, com base em técnicas de geoestatística.
Analisam-se três processos de kriging: simples, ordinário e bayesiano. Ao simples,
analisam-se três abordagens encontradas na literatura para estimação ou informação do parâmetro
damédia e ao bayesiano propõe-se uma variante capaz de reduzir o tempo de processamento
necessário, estimando a média por mínimos quadrados generalizados, sendo
uma constante na inferência bayesiana. Leva-se em consideração o processo de agrupamento
dos nós sensores, com simulações sem agrupamento e com os sensores agrupados
pelos algoritmos LEACH e SKATER. O algoritmo de kriging bayesiano apresenta osmelhores
resultados qualitativos namaioria dos casos,mas se torna inviável para sistemas que necessitemde
respostas rápidas. Nesses casos, recomenda-se o algoritmo de kriging ordinário. A
variante proposta para o kriging bayesiano reduz o tempo de computação, mas não o suficiente
para sistemas de tempo real
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