Submitted by Fabio Sobreira Campos da Costa (fabio.sobreira@ufpe.br) on 2016-04-19T14:26:01Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Dissertação Paulo Cabral de Oliveira.pdf: 5999501 bytes, checksum: 6b5b8f921ebc777d46a3ea57d8765e54 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-04-19T14:26:01Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Dissertação Paulo Cabral de Oliveira.pdf: 5999501 bytes, checksum: 6b5b8f921ebc777d46a3ea57d8765e54 (MD5) Previous issue date: 2015-08-25 / CNPq / A Mata do Janga é um fragmento de Mata Atlântica que se localiza na cidade do Paulista, município inserido na RMR (Região Metropolitana do Recife) capital do Estado de Pernambuco. Encontra-se protegida por lei como uma Unidade de Conservação (UC) estadual e parte dela constitui-se uma Reserva Ecológica e recategorizada como Floresta Urbana (FURB). Com uma área de 132,24 hectares, a mata vem sofrendo fortes pressões antrópicas. Em virtude de sua importância biológica objetivou-se compreender a perda de vegetação natural e o crescimento urbano e analisar as variações espaciais e temporais do uso e ocupação do solo por meio da aplicação do Índice de Vegetação por Diferença Normalizada (NDVI), tendo sido utilizadas imagens aéreas de 1985, 1995 e 2011, fotografias aéreas, ortofotocartas e imagens de satélite. Todas as análises constataram perda de vegetação mediante o crescimento urbano do município do Paulista, mais especificamente no Bairro do Janga, onde a Mata é inserida. Foram também realizadas entrevistas com moradores, com a finalidade de se obter informações da percepção ambiental da população em relação à Mata. As entrevistas sugeriram que a população não possui conhecimento acerca das legislações que regem essa UC, embora a maioria tenha relatado praticar ações de conservação da Mata, mas observa diferentes formas de impactos na área. O estudo permitiu concluir que mesmo protegida por lei, a Mata vem sofrendo impactos diretos e indiretos decorrentes das atividades antrópicas. É importante salientar que os resultados aqui obtidos poderão servir de subsídios para futuras ações de manejo, gestão e monitoramento por parte dos órgãos competentes e da sociedade. / The Forest of Janga is an Atlantic Forest fragment that is located in the city of Paulista, in the city within RMR (Metropolitan Region of Recife) capital of Pernambuco. Is protected by law as a Conservation Unit (UC) state and part of it constitutes an Ecological Reserve and recategorizada as Urban Forest (FURB). With an area of 132.24 hectares, the forest has come under strong anthropogenic pressures. Due to its biological importance aimed to understand the loss of natural vegetation and urban growth and analyze the spatial and temporal variations of soil use and occupation by applying the Vegetation Index (NDVI), have been used aerial imagery 1985, 1995 and 2011, aerial photographs, and satellite images ortofotocartas. All analyzes found loss of vegetation by the urban growth of the Paulista municipality, specifically in Janga Barrio, where the forest is located. They were also conducted interviews with residents in order to obtain information in the environmental awareness of the population regarding the forest. The interviews suggested that the population does not have knowledge of the laws governing this UC, although most reported practice of forest conservation actions, but notes different forms of impacts in the area. The study found that even protected by law, Mata has suffered direct and indirect impacts of human activities. Importantly, our findings could form the basis for future management actions, management and monitoring by the relevant authorities and society.

Orientadores: Wesley Rodrigues Silva, Natália Oliveira Leiner / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-27T03:01:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Castilho_CamilaPaulade_D.pdf: 4563279 bytes, checksum: 6f49e6d8d2326c3a15fd1ae26700259c (MD5) Previous issue date: 2015 / Resumo: A ecologia da restauração tem como principal objetivo a recuperação de ambientes degradados visando à criação de ambientes autossustentáveis. Dessa maneira, diferentes são os modelos de restauração adotados, mas poucos são os trabalhos que avaliam a resposta da comunidade de fauna em relação a essas restaurações. Este estudo tem como objetivo avaliar a resposta da comunidade de mamíferos terrestres em relação aos tratamentos de restauração presentes na fazenda Intermontes (337ha), na cidade de Ribeirão Grande, SP. Foram avaliadas a riqueza, a abundância e a composição da comunidade de pequenos, médios e grandes mamíferos em um mosaico de restauração em Mata Atlântica, incluindo áreas de pasto com regeneração arbórea e ou arbustiva na qual o plantio de restauração foi implantado, áreas de pasto com plantio, área de regeneração natural e remanescentes florestais. Tendo em vista o modelo "trait-filter", procuramos evidenciar como alguns descritores ambientais influenciaram a ocorrência das espécies, considerando como filtros a estrutura da vegetação e a disponibilidade de alimentos (frutos, artrópodes e pequenos e médios mamíferos de acordo com a espécie avaliada). Tanto para a assembleia de pequenos mamíferos, quanto médios e grandes, espécies generalistas predominaram na comunidade, ocorrendo nas diferentes unidades amostrais. Espécies especialistas foram menos abundantes e mais restritas em sua ocorrência. Para pequenos mamíferos, estas espécies estiveram restritas aos remanescentes florestais ou às unidades com maior complexidade de vegetação. Para médios e grandes mamíferos, espécies especialistas estiveram presentes em diferentes tratamentos, mas foram ocasionais. O papel dos descritores ambientais sobre cada espécie diferiu de acordo com suas necessidades ecológicas, revelando a sua importância para a ocorrência das diferentes espécies. Avaliar a resposta desta comunidade em função de medidas de restauração revelou a importância dos descritores ambientais que precisam estar presentes e ser mantidos para garantir a colonização e a permanência da comunidade de mamíferos terrestres / Abstract: Restoration ecology aims to recover degraded areas creating self-sustaining ecosystems. Different restoration techniques are being implemented nowadays but few studies are evaluating the response of the fauna community in relation to those restored areas. This study intended to evaluate the response of a terrestrial mammal community in a restored area located at Intermontes farm (337ha), in the city of Ribeirão Grande, SP. We investigate richness, abundance and composition of small, medium and large mammals in a restoration mosaic of Atlantic forest, including pasture areas with arboreal or arbustive regeneration where restoration where implemented, pasture areas with restoration, areas with natural regeneration and forest remnants. Once considering the trait-filter model, we intended to elucidate how habitat filters influenced species occurrence, considering vegetation complexity and food resources (fruits, arthropods, small and medium mammals depending on the species) as filters. To the small mammals assembly, as to the medium and large ones, generalist species predominated in the community, occurring in all different sample units. Specialized species were less abundant and were restricted in their occurrence. Small mammals were limited to the forest remnants or to those sample units with more complex vegetation. Specialist medium and large mammal species were present in different sample units, but were occasional. The habitat filter role for each species differed according to the ecological necessity of the species, revealing the importance of those aspects to species occurrence. The evaluation of the response of this mammal community to restoration showed that some habitat filters need to be present and maintained in order to guarantee the colonization and the permanence of terrestrial mammals / Doutorado / Ecologia / Doutora em Ecologia

O objetivo geral da presente Tese foi estudar a evolução de organismos da Floresta Atlântica (FA), utilizando aves florestais como modelos e sob uma perspectiva filogenética filogeográfica. As espécies estudadas foram três passeriformes: Xiphorhynchus fuscus (Dendrocolaptidae), Dendrocolaptes platyrostris (Dendrocolaptidae) e Schiffornis virescens (Tytyridae). Os marcadores utilizados foram seqüências do DNA mitocondrial e/ou um marcador nuclear. O trabalho foi dividido em seis capítulos. No primeiro é apresentado o problema geral e as principais hipóteses (basicamente refúgios, rios e geotectonismo) que foram exploradas nos capítulos dois a cinco. No segundo capítulo foi utilizado DNAmt para avaliar a estrutura genética populacional de Xiphorhynchus fuscus no sul da FA e testar algumas hipóteses de evolução das populações dessa ave. Os resultados principais do trabalho não sustentaram um modelo geotectônico como explicação para a origem da estrutura genética dessa ave, mas seriam compatíveis com o modelo de refúgios florestais. No terceiro capítulo X. fuscus foi novamente estudado, mas avaliamos a estrutura filogeográfica da espécie em toda sua distribuição e com dois marcadores genéticos independentes (DNAmt e o intron 5 do beta fibrinogênio). Alguns dos objetivos principais do estudo foram testar uma hipótese paleofitogeográfica da FA para a última glaciação e avaliar as implicações dos resultados genéticos para o status taxonômico das quatro subespécies e de X. fuscus. Os resultados genéticos sustentaram parcialmente o modelo paleofitogeográfico testado e mostraram que unicamente X. fuscus atlanticus poderia ser considerada uma espécie plena. O quarto capítulo descreve a variação da plumagem e a estrutura genética populacional (DNAmt) de D. platyrostris. Os resultados sugeriram que não existe uma continuidade recente entre as populações do domínio central da FA e as populações da diagonal aberta (Cerrado, Caatinga e Chaco). Além disso, foi estudada a relação entre a plumagem de D. platyrostris com a história das populações e encontramos que a coloração da plumagem não tem relação com a história das populações. O quinto capítulo apresenta um estudo preliminar da estrutura filogeográfica (DNAmt) de S. virescens. O estudo indicou que não há estruturação filogeográfica profunda S. virescens como encontrada em outros organismos da FA. Uma possível origem deste padrão poderia ser um gargalo populacional e expansão demográfica recente, além de altas taxas de fluxo gênico. Nossos resultados com as três espécies estudadas, assim como os de outros autores, sugerem a existência de um padrão filogeográfico comun para alguns organismos da FA. Além disso, foi sugerido um modelo da FA no qual a distribuição temporal e espacial das florestas é muito dinâmica. O norte e sul da FA seriam as regiões mais instáveis devido à influência de mudanças climáticas locais e globais. Esta dinâmica florestal pode ter contribuído na evolução dos padrões filogeográficos observados, com a evolução independente de linhagens em diferentes regiões ou refúgios. Além disso, nossos resultados e os de outros autores sugerem que a atividade geotectônica não teria sido importante na evolução recente de organismos da FA, e que alguns rios do bioma (ex. rio Doce) atuariam como barreiras secundárias e não como barreiras primárias. / This dissertation explores the evolution of Atlantic Forest (AF) organisms. Specifically, we used endemic forest birds as models and a phylogenetic phylogeographic perspective. Studied bird species are all passerines: Xiphorhynchus fuscus (Dendrocolaptidae), Dendrocolaptes platyrostris (Dendrocolaptidae) and Schiffornis virescens (Tytyridae). We used mitochondrial and nuclear DNA (mtDNA and ncDNA, resepectivelly) sequences. The dissertation was divided in six chapters. The first one explained objectives of the dissertation and presented hypotheses and problems that were addressed in the following chapters two to five. The sixth chapter presents a general discussion. We used in the second chapter mtDNA to evaluate the phylogeographic pattern of X. fuscus in southern AF. The main results indicated that a geotectonic model for the evolution of local populations was not supported and that the observed genetic pattern was compatible with the theory of refuges. In the third chapter we studied again X. fuscus, but using samples from all the species´ distribution and sequences of two independent markers (mtDNA and the the intron 5 of the beta-fibrinogen gene). Some of the main objectives of the chapter were to test a published model about the distribution of AF in the last 20,000 years and to use genetic data to address the taxonomic status of the four subspecies of X. fuscus, particularly of the endangered X. fuscus atlanticus. Results supported partially the model of forest distribution in the past and to consider X. fuscus atlanticus as a good species. In the fourth chapter we analyzed plumage and genetic (mtDNA) variation in the woodcreeper D. platyrostris. Results suggested a lack of recent genetic continuity between the Atlantic Forest central domain and the open vegetation biomes Cerrado and Caatinga. Besides, we found that plumage color variation in D. platyrostris was not related to population history, as evaluated by neutral markers. In the fifth chapter we studied the phylogeographic pattern (mtDNA) of S. virescens. Results indicated that S. virescens lack a significant phylogeographic pattern, contrarily to what was observed in several other AF organisms. Possible explanations for this pattern may be a population bottleneck followed by a demographic expansion and current high gene flow rates. Our results, in combination with results of others, permitted to describe a common phylogeographic pattern for several AF organisms. Also, we suggested a model of the AF where forest distribution is very dynamic. Specifically, the northern and southern AF regions were proposed to be the regions with the most unstable area and continuity of forests. Perhaps, this forest dynamism contributed to the evolution of the observed common phylogeographic pattern. Furthermore, our results, in combination with other similar studies, suggested for the studied birds that geotectonic activity at southeastern AF did not affect population evolution, and that some AF rivers (i.e., Doce river) act as secondary barriers instead of primary barriers.

Orientador: Odair José Garcia de Almeida / Resumo: Cactaceae constitui um grupo endêmico de plantas do Novo Mundo com exceção de Rhipsalis baccifera. No Brasil, a Mata Atlântica, presente nas regiões Sul, Sudeste e Nordeste, compreende um importante ecossistema para o grupo. Incluído na tribo Cereeae, subfamília Cactoideae, o gênero Cereus Mill. apresenta 48 espécies, na qual, duas têm ocorrência para o estado de São Paulo: Cereus fernambucensis Lem. e Cereus hildmannianus K.Schum. Tendo em vista a importância dos estudos anatômicos e morfológicos para solucionar questões de ordem taxonômica, este estudo analisou de modo comparativo a morfo-anatomia floral de C. fernambucensis e C. hildmannianus. Foram realizados estudos macromorfológicos e histológicos incluindo microscopia de luz e eletrônica de varredura. Os resultados revelaram 67 caracteres morfo-anatômicos, na qual 55 foram semelhantes e 12 diferentes. Foram encontrados 17 caracteres morfológicos (14 semelhantes e 3 diferentes) e 50 caracteres anatômicos (41 semelhanças e 9 diferenças). As duas espécies compartilham a maioria das características estruturais florais. Entretanto, as análises anatômicas revelaram alguns caracteres, que podem ser diagnósticos importantes para separar as duas espécies, sendo eles: o número de estratos do mesofilo no perianto tepaloide, no tubo floral, no filete; a organização do tecido transmissor no estigma e no estilete (canal estilar), o número de estratos celulares do tecido receptacular (pericarpelo) que envolve o ovário, e o número de ... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Cactaceae is an endemic group of plants of the Americas, except for Rhipsalis baccifera. In Brazil, the Atlantic Forest, present in the South, Southeast and Northeast regions, comprises an important ecosystem for the group. Included in the tribe Cereeae, subfamily Cactoideae, the genus Cereus Mill. has 48 species, in which two have occur in the São Paulo state: Cereus fernambucensis Lem. and Cereus hildmannianus K.Schum. In view of the importance of anatomical and morphological studies to solve taxonomic issues, this study compared the floral morpho-anatomy of C. fernambucensis and C. hildmannianus. Macromorphological and histological studies were performed including light and scanning electron microscopy. The results revealed 67 morpho-anatomical characters, of which 55 were similar and 12 different. There were found 17 morphological characters (14 similar and 3 different) and 50 anatomical characters (41 similarities and 9 differences). The two species share most of the structural floral characteristics. However, anatomical analyzes revealed some characters, that may be of interesting to separate the two species, namely: the number of mesophyll strata in the tepaloid perianth, in the floral tube, and in the fillet; the organization of the transmitting tissue in the stigma and the style (stylar canal), the number of cell layers in the receptacle tissue (pericarpel) that surrounds the ovary, and the number of layers in the internal integument of the eggs. The data compiled in... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Orientador: Sergio Valiengo Valeri / Banca: Miguel Luiz Menezes Freitas / Banca: Marcos Silveira Bernardes / Banca: Maria Esmeralda Soares Payão Demattê / Banca: Rinaldo César de Paula / Resumo: A Floresta Atlântica na Região Cacaueira da Bahia tem os mais significativos remanescentes florestais em áreas agricultáveis. Deve-se isso, ao plantio tradicional do cacaueiro sob o dossel da floresta que, aprimorado ao longo de 250 anos, resultou no sistema agrossilvicultural cacau-cabruca. Este trabalho objetivou descrever a estrutura fitossociológica da vegetação arbórea em três áreas de cacau-cabruca e dois fragmentos florestais remanescentes, com ênfase na conservação de espécies. O estudo foi desenvolvido em cinco áreas, três com cacau-cabruca nos municípios de Ibirapitanga, Piraí do Norte e Ubatã, e duas, em fragmentos florestais inseridos no agroecossistema cacaueiro, nos municípios de Itapé e Jussari. O método de amostragem usado foi o de quadrantes, e o critério de inclusão foi diâmetro à altura do peito (DAP) 15 cm. Na análise da estrutura, foram avaliados os descritores usuais de fitossociologia. No cacau-cabruca, inventariaram-se 101 espécies em 36 famílias; 10 espécies apresentaram ocorrência comum. As áreas apresentaram baixa similaridade entre si. Os índices de diversidade (H') foram 3,3 para Ibirapitanga, 3,2 para Piraí do Norte e 4,0 para Ubatã. Todas as áreas estudadas apresentaram alta dominância total (DoA) e densidade total acima do que a CEPLAC recomenda. Nos fragmentos florestais, foram inventariados 328 indivíduos, distribuídos entre 76 táxons, em 29 famílias botânicas. Dessas, 19 espécies apresentaram ocorrência comum às duas comunidades. A similaridade entre os fragmentos foi J' = 33%. Quanto à diversidade, em Itapé, o H' foi 3,16 e em Jussari, 3,77. O cacau-cabruca conservou remanescentes da Floresta Atlântica, tanto fragmentos florestais como indivíduos arbóreos, bem como, exemplares significativos de espécies arbóreas de diferentes estádios da sucessão, espécies raras e nobres de valor comercial... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The Atlantic Forest biome in the Bahia Cocoa Region has the most significant forest remanescents in agricultural areas. For that reason, the traditional cocoa planting under the forest canopy, which has been improved along 250 years, resulted in the agrossilvicultural cacau-cabruca system. This work describes the phytosociological structure of the arboreal vegetation in three cacaucabruca areas and two forest fragment-remanescents, with emphasis in species conservation. The study was developed in five areas, three with cocoa-cabruca in Ibirapitanga, Piraí do Norte and Ubatã municipalities, and two in forest fragments inserted in the cocoa agroecosystems of Itapé and Jussari. The sampling method used was quadrant and the inclusion criterion was chest height diameter (CHD) 15 cm. In the structure analysis the usual phytosociological descriptors were evaluated. In the cacau-cabruca 101 species in 36 families were inventoried, and nine of them showed common occurrence. The areas presented low similarity. The diversity indexes (H') were 3,3 for Ibirapitanga, 3,2 for Piraí do Norte and 4,0 for Ubatã. All areas studied showed high total dominance (DoA) and total density above the one recommended by the CEPLAC. In the forest fragments 328 individuals were inventoried, distributed among 76 taxons, in 29 botanical families. From these, 19 species presented common occurrence to both communities. The similarity between the fragments was J' = 33%. As for diversity, in Itapé H' was 3,16 and in Jussari 3,77. Cacau-cabruca conserved remanescents of the Atlantic Forest, either as fragments or shade arboreal individuals, as well as significant arboreal species at different succesional stages, rare and noble species of commercial value such as Caesalpinia echinata (pau-brasil), among others, in abundance, density and dominance. / Doutor

Orientador: Mauro Galetti Rodrigues / Resumo: Invasões biológicas são uma das principais ameaças à biodiversidade, razão pela qual é campo de interesse de investigações científicas dos ecólogos. Os Neotrópicos abrigam uma das maiores riquezas de espécies do planeta e ao longo dos últimos anos vem sofrendo um aumento expressivo no número de introduções de espécies exóticas. Uma delas é o javali Sus scrofa e suas raças cruzadas com porcos domésticos, que em sua forma silvestre e de vida livre chamamos suídeos asselvajados. Ao longo dessa tese procuro investigar algumas das consequências ecológicas da invasão dessa espécie, assim como apresentar um panorama do controle populacional empregado hoje no Brasil, buscando sempre que possível fazer uma discussão dos resultados aplicada ao manejo da espécie. No Capítulo 1 mostro como a introdução acentuada dessa espécie ocorrida nos últimos 20 anos no Brasil fez com que ela se distribuísse amplamente por todo território nacional, principalmente nas regiões Sul, Sudeste e Centro-Oeste. No Capítulo 2 eu procurei fazer uma avaliação da efetividade do papel ecológico de frugivoria e dispersão de sementes prestado por esses animais. O Capítulo 3 mostra como as paisagens agrícolas estão subsidiando a invasão dos suídeos asselvajados potencializando a expansão da espécie e no Capítulo 4 busco revelar o papel do invasor no deslocamento do nicho trófico dos pecarídeos nativos.Já o Capítulo 5 apresenta um breve relato da interação entre os suídeos asselvajados e morcegos vampiros e, ao final... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Biological invasions are one of the main threats to biodiversity, which is why it is a field of interest for scientific investigations by ecologists. The Neotropics are home to one of the planet's greatest species richness, and over the last few years it has been experiencing a significant increase in the number of exotic species introduction. One of them is the wild boar Sus scrofa and their crossed-breeds with domestic pigs, that in its free-living wild-form we call wild pigs. My effort throughout this thesis is to investigate some of the ecological consequences of the invasion of this species, as well as present an outlook of the population control employed in Brazil, always seeking to make a discussion of the results applied to the management of the species. In Chapter 1 I show how the severe introduction of this species that occurred in the last 20 years in Brazil has made it widely distributed throughout the country, especially in the South, Southeast and Midwest regions. In Chapter 2 I evaluated the effectiveness of the ecological role of frugivory and seed dispersal provided by these animals. Chapter 3 shows how agricultural landscapes are subsidizing the invasion of wild pigs enhancing the species' expansion. In Chapter 4 I seek to reveal the role of the invader in displacing the trophic niche of native peccaries and Chapter 5 presents a brief account of the interaction between wild pigs and vampire bats. In the end, Chapter 6 outlines a profile of the methods and mo... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Orientador: Laurence Marianne Vincianne Culot / Resumo: A seleção de dormitórios pelos primatas pode ser influenciada por diversos fatores, como a predação, termorregulação e defesa de território. Nosso objetivo foi investigar quais desses fatores influenciam a seleção de dormitórios pelos micos-leões-pretos e se há divergência nas características dos dormitórios entre uma floresta contínua e um fragmento. Estudamos dois grupos de mico-leões-pretos, um numa floresta contínua e um num fragmento na região do Pontal do Paranapanema, São Paulo, Brasil. Nós coletamos os dados sobre as características físicas dos dormitórios e das árvores disponíveis no habitat. Usamos testes de Mann-Whitney para comparar as características físicas dos dormitórios com as árvores disponíveis e Funções de Seleção de Recursos (RSF) para entender quais dessas características são mais importantes na escolha dos dormitórios. Os micos-leões-pretos usaram árvores mais altas, com menor número de conexões de copas e com um alto grau de cobertura de copa para dormir, quando comparado às árvores disponíveis. Os dormitórios usados pelo grupo da floresta contínua eram maiores, com as primeiras ramificações inferiores mais altas e com menor número de conexão de copas do que os dormitórios usados pelo grupo do fragmento. Nossos resultados evidenciam a presença de estratégias anti-predação pelos grupos de micos-leões-pretos, com o grupo da floresta contínua apresentando um processo de seleção de dormitórios mais refinado, no qual a seleção apenas de árvores que possuam ... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Sleeping site selection by primates can be influenced by several factors, such as predation, thermoregulation and territorial defense. Our objective was to investigate which of these factors influence the sleeping site selection by black lion tamarins and if there is divergence in the characteristics of the sleeping sites between a continuous forest and a fragment. We studied two groups of black lion tamarins, one in a continuous forest and one in a small and isolated fragment in the Pontal do Paranapanema, São Paulo, Brazil. We collected data on the physical characteristics of the sleeping sites and available trees within the both habitats. We used Mann-Whitney tests to compare the physical characteristics of the sleeping sites with available trees and Resource Selection Functions (RSF) to understand which of these characteristics are most important in choosing the sleeping sites. Black lion tamarins used taller trees, with a fewer canopy connections, and a higher degree of canopy cover compared to the available trees. The sleeping sites used by the continuous forest group were larger, with the first lower ramifications higher and with fewer number of canopy connections than the sleeping sites used by the fragment group. Our results evidenced the presence of anti-predation strategies by both black lion tamarin groups, with the continuous forest group presenting a more refined sleeping site selection process, in which the selection of only trees with a larger set of character... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Orientador: Elizabeth Moreira dos Santos Schmidt / Resumo: O Brasil possui a maior diversidade de espécies do mundo, grande parte está nos biomas Mata Atlântica e Cerrado, considerados hotspots para conservação. Os mamíferos de médio e grande porte, grupo altamente afetados pela antropização, desempenham papéis importantes na dinâmica de ecossistemas, influenciam no ciclo do carbono, agem como predadores e dispersores de sementes, polinizadores, predadores de topo de cadeia alimentar. O presente estudo teve como objetivo realizar o levantamento da mastofauna terrestre de médio e grande porte presente na área da Escola do Meio Ambiente (EMA) no município de Botucatu, São Paulo e gerar dados de riqueza, ocorrência e frequência de ocorrência de espécies encontradas no local. A área da escola é de aproximadamente 12 hectares, apresentando cobertura vegetal de remanescente de Cerrado e fragmento com fitofisionomias de Mata Atlântica. As metodologias utilizadas foram: transectos, parcelas de areia e, como método complementar, o uso de armadilha fotográfica por dois meses. Adicionalmente, entrevista com funcionários para obtenção de dados. Foram registradas vinte espécies de mamíferos. A ordem carnívora foi a que apresentou mais espécies, oito no total. A espécie de maior ocorrência foi Hydrochoerus hydrochaeris, seguida por Canis lupus familiaris. Nas entrevistas, os funcionários citaram duas espécies que não foram registradas no estudo, Cavia aperea, mamífero de pequeno porte, e Lontra longicaudis. A riqueza constatada pelo estudo enfatiz... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Brazil has the greatest diversity of species in the world, much of it in the biomes Cerrado and in the Atlantic Forest, considered hotspots for conservation. Medium and large mammals are one of the groups most affected by anthropization, play important roles in the nature of ecosystems, influence the carbon cycle, act as seed predators and seed dispersers, pollinators, top food chain predators. The present study had the objective of surveying the medium and large size terrestrial mastofauna present in Environmental School (EMA) area in the city of Botucatu, São Paulo, and to generate data on the richness, occurrence and frequency of occurrence of species found on the spot. The school area is approximately 12 hectares, presenting vegetation cover of Brazilian Savana remnant and fragment with phytophysiognomies of Atlantic Forest. Using the methodologies used were trawling for traces, sand plots and as a complementary method the use of photographic trap for two months, in addition, interview with employees to obtain additional data. Twenty species of mammals were recorded. The carnivorous order was the one that presented the most species, eight in total. The species with the highest occurrence was Hydrochoerus hydrochaeris, followed by Canis lupus familiaris. In the interviews, officials cited two species that were not recorded in the study, Cavia aperea, a small mammal, and Lontra longicaudis. The richness found by the study emphasizes the importance of the area for the persis... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

O bioma Mata Atlântica tem sofrido com a fragmentação florestal e como forma de reestabelecer ambientes florestais são realizados plantios de restauração. Porém, por muito tempo houve preocupação somente com a composição florística das áreas e a diversidade genética foi negligenciada. Além disso, muitas áreas são implantadas a partir de sementes coletadas em áreas florestais geralmente pouco conservadas, pequenas e isoladas, o que pode comprometer a qualidade genética das mudas, produzindo indivíduos menos adaptados em decorrência da depressão endogâmica. Assim este trabalho teve como objetivo principal analisar o aspecto genético em áreas de restauração na região do Pontal do Paranapanema e área natural de referência, o Parque Estadual Morro do Diabo (PEMD), utilizando o jatobá (Hymenaea courbaril L.) como espécie modelo. No capítulo 1 com o objetivo de verificar a diversidade genética de H. courbaril em áreas de restauração florestal, foram selecionadas duas áreas de plantio com espécies nativas. Nestas áreas e no PEMD foram coletadas amostras foliares de indivíduos adultos que foram genotipadas para oito locos microssatélites. No PEMD ainda foram coletados frutos em 12 matrizes para caracterização do sistema reprodutivo. As três áreas estudadas apresentaram diversidade genética e níveis de endogamia similares. Nas três áreas de estudo foi identificada baixa estruturação genética espacial. Houve predomínio de fecundação cruzada para a produção de frutos na área natural, porém a taxa de cruzamentos entre indivíduos aparentados foi até dez vezes maior que a observada em outras populações da espécie. No capítulo 2 com o objetivo de verificar se há depressão endogâmica em progênies provenientes do PEMD foram selecionadas 320 sementes de 12 matrizes. Estas e seus frutos foram medidos. As plântulas a que deram origem também foram mensuradas, mensalmente, durante 15 meses. Todos os indivíduos foram genotipadas para oito locos microssatélites. A coancestria, foi estimada e os indivíduos separados em: não aparentados (tu), aparentados (tr) e autofecundação (s). Foi verificada diferença entre as métricas das plantas de acordo com o nível de coancestria entre indivíduos. Também foram estimados os valores de depressão endogâmica (ID). A quantidade de indivíduos irmãos de autofecundação foi muito pequena, sendo a maioria proveniente de cruzamento entre indivíduos não aparentados. A depressão endogâmica por autofecundação foi mais evidente no peso e tamanho dos frutos, e amena ou inexistente para os demais caracteres. Isto provavelmente por estas sementes terem sido coletadas em um fragmento grande e bem conservado e que ainda não sofre as consequências da depressão endogâmica. Assim, nosso trabalho mostrou que áreas de restauração florestal que seguiram as recomendações genéticas de implantação, apresentam diversidade genética suficiente para H. courbaril, podendo estas áreas serem fonte de coleta de sementes no futuro. E que os indivíduos provenientes de sementes do PEMD não apresentaram efeito de depressão endogâmica até 15 meses de desenvolvimento em viveiro. / The Brazilian Atlantic Forest was severely deforested and restoration initiatives are necessary to reestablish environments. However, for a long time there is only concern over floristic composition and the genetic diversity has been neglected. In addition, several restoration areas are planted from seeds collected in forest areas that are generally poorly preserved, small and isolated, which may compromise the genetic quality of the seedlings, producing less adapted individuals due to inbreeding depression. The aim of this work was to analyze the genetic aspects of Hymenaea courbaril L. in restoration areas in Pontal do Paranapanema region, and a natural reference forest, the Morro do Diabo State Park (PEMD), where seeds were also collected. In Chapter 1, to verify the genetic diversity of H. courbaril in areas of forest restoration, using eight microsatellites, two restoration areas were selected. In these areas and in the PEMD, leaf samples from adult individuals were collected. In the PEMD, fruits were collected in 12 seed trees for mating system characterization. The three areas presented similar genetic diversity and levels of inbreeding. Low spatial genetic structure was identified in the three studied areas. In the natural forest, fruits were mainly produced through outcrossings, but the rate of mating among relatives was up to ten times higher than the observed in other H. courbaril populations. In Chapter 2, to verify the inbreeding depression in the PEMD were selected 320 seeds from eight seed trees. The seeeds and their fruits were measured. The seedlings were also measured monthly, during 15 months. All seedlings were genotyped with eight microsatellite loci. From the pairwise coancestry the seedlings were separated into three categories: outcrossing among unrelated individuals (tu), outcrossing among related individuals (tr), and selfing (s). We verified differences among groups in the metrics of seedlings according to the level of coancestry among individuals. The values of inbreeding depression (ID) were also estimated. The number of selfed seedlings were very small, and the majority were from outcrossing among unrelated individuals. Inbreeding depression by selfing was more evident in weight and size fruit, and was insignificant or non-existent for other characters. This is probably because these seeds were collected in a large and preserved forest fragment, that does not suffer the consequences of inbreeding depression yet. Thus, our work showed that forest restoration areas that followed the genetic recommendations present enough genetic diversity for H. courbaril, and these areas may be a source of seeds for collection in the future. Besides that, seedlings from seed trees in PEMD did not present inbreeding depression effect up to 15 months of nursery development.

A Mata Atlântica é um dos ecossistemas mais severamente afetados pelos processos de perda e fragmentação de habitats, e, apesar dessa intensa ameaça, abriga ainda grande diversidade de anfíbios e répteis. O presente estudo teve como objetivo principal relacionar a diversidade de anuros e lagartos de serapilheira com o tamanho de fragmentos florestais, assim como com características ambientais dos fragmentos e da paisagem onde os mesmos estão inseridos. A amostragem da herpetofauna foi realizada em dois anos consecutivos durante a estação chuvosa numa paisagem fragmentada nos municípios de Capão Bonito e Ribeirão Grande, adjacentes ao Parque Estadual de Intervales e Fazenda Paraíso, utilizando a área da fazenda como controle, que representa a mata contínua. Os lagartos e anuros foram amostrados por meio de armadilhas de interceptação e queda (\"pitfall traps\") instaladas em 15 fragmentos e em seis localidades na área-controle. Além das características da estrutura e configuração da paisagem, como o tamanho dos fragmentos e a conectividade, outras variáveis ambientais que podem influenciar a distribuição e a abundância desses táxons também foram analisadas. A herpetofauna encontrada na região é típica de Floresta Ombrófila Densa, mas os resultados não esclareceram se a variação na composição da taxocenose de anuros entre as paisagens é uma resposta à continuidade ou à fragmentação da mata, ou se é uma resposta à distância geográfica entre as paisagens. De maneira geral, anfíbios anuros e lagartos de serapilheira são sensíveis à modificação de seus ambientes, porém a resposta a estas modificações é específica da espécie-, variando de acordo com aspectos particulares da história natural de cada espécie. A perda de habitat e a fragmentação florestal exercem efeitos negativos sobre algumas espécies de anfíbios e, conseqüentemente, sobre a diversidade local, sendo fatores importantes a serem considerados em estratégias de conservação e na formulação de diretrizes de conservação da diversidade biológica em paisagens fragmentadas do Planalto Atlântico de São Paulo / The Atlantic Forest is severely affected by processes of habitat loss and fragmentation, but despite this intense threat it hosts an enormous diversity of amphibians and reptiles. The main goal of the present study was to correlate the diversity of leaf-litter anurans and lizards to the size of forest fragments, as well as to the environmental characteristics of the fragments and of the landscape in which they are inserted. The study area is a fragmented landscape inserted in the municipalities of Capão Bonito and Ribeirão Grande, adjacent to Parque Estadual de Intervales and Fazenda Paraíso. Sampling of the herpetofauna was conducted during the rainy season in two consecutive years. Fazenda Paraíso was used as the control and denotes continuous forest. Anurans and lizards were collected with pitfall traps installed in 15 fragments and six sites inside the control-area. Besides the characteristics of landscape structure and configuration, like the size of the fragments and their connectivity, other environment variables that may affect the distribution and abundance of these taxa were also analysed. The herpetofauna found in the region is typical of tropical rainforests, although the results did not elucidate whether the variation in the composition of the anuran assemblage found among the landscapes is a response to the continuity or fragmentation of the forest, or if it is related to the geographical distance among the landscapes. Overall, leaf-litter anurans and lizards are sensible to habitat modification. The response to such modifications is, nevertheless, species-specific and varies according to characteristics of the natural history of each species. Habitat loss and forest fragmentation exert negative effects over some species of amphibians and ultimately over the local diversity and should thus be considered as important factors in conservation strategies and in the development of conservation guidelines in fragmented landscapes of the Atlantic Plateau of São Paulo.