Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2016-06-30T12:28:16Z No. of bitstreams: 1 Patricia Barbosa Lima.pdf: 2085924 bytes, checksum: 888a6392d7801eac12b38066738c2705 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-06-30T12:28:16Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Patricia Barbosa Lima.pdf: 2085924 bytes, checksum: 888a6392d7801eac12b38066738c2705 (MD5) Previous issue date: 2012-02-16 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The conversion of large areas in small forest remnants directs various physical and biological changes that negatively affect the biodiversity of tropical forests, but little is known about the responses of herbaceous plants to human disturbance. Therefore, this study aimed to test the following hypotheses: (1) a fragmented area has less richness, lower diversity and greater density of herbaceous assembly of a continuous environment; (2) there is more accumulated litter, increased soil temperature and soil moisture lower in the fragmented; and (3) the floristic composition and structure of herbaceous areas are distinct from those due to environmental changes provided by forest fragmentation. The study was conducted in the Atlantic forest landscape of the Usina Serra Grande (8°30‟S and 35°50‟O), Alagoas, using the area core a 3500 ha fragment (continuous area) and ten small forest fragments ranging between 7.84 and 83.63 ha (fragmented area). The remnants are dystrophic soils (latosols and ultisols yellow-red), hot and humid tropical climate and vegetation lower montane rain forest and semideciduous. The herbaceous (all non woody plant – including vines and saprophytic) were collected between october 2010 and march 2011, 50 by plotting random plots (5×5 m) in both areas. The plots were established in the area continuously from 200 m from the edge. In the fragmented five plots were plotted near the midpoint of each remaining. We recorded the richness, density, diversity of herbaceous assembly in both areas. In each plot we collected data regarding the amount of litter accumulated, percentage of soil moisture and soil temperature. Differences between environments were evaluated with the following tests: Mann-Whitney (richness); t test of Hutcheson (diversity); t test (density, accumulated litter; soil moisture and temperature). The MDS, ANOSIM with, there a difference in the floristic composition and structure of plots distributed among habitats. Test the correlation species-environmental variable was performed a CCA. Species richness was higher in continuous ambient (97 species) than in fragmented (68), but there was no significant difference in density. The diversity and equability were higher in the continuous ambient (H‟= 3.616 nats/ind.; J‟ = 0.791) than in fragmented (H‟= 2.729 nats/ind.; J‟ = 0.647). In the area fragmented there was a greater amount of accumulated litter, higher soil temperature and lower soil moisture. The MDS showed the segregation of two groups (plots of the area continuous and plots of the area fragmented), and this result is explained by the type of environment. The CCA found that the species are distributed in the areas from a gradient, which involves greater influence of increasing soil temperature and decreased soil moisture in the area fragmented, and the opposite pattern in the area continued, explaining the preference of many species for a certain type of habitat. However, other unmeasured variables may also be acting in the assembly of herbaceous Serra Grande. These results suggest that fragmentation really contributes to the loss of biodiversity of the flora of rain forests, especially of species of herbaceous assembly of the northeastern Atlantic forest, mainly due to environmental changes generated after habitat fragmentation. Thus, it is necessary to perform additional studies in order to broaden the understanding of the factors that control the assembly of herbaceous tropical rain forest areas. / A conversão de grandes áreas florestais em pequenos remanescentes direciona diversas alterações físicas e biológicas que influenciam negativamente a biodiversidade das florestas tropicais, mas pouco se sabe sobre as respostas de plantas herbáceas à perturbação humana. Diante disso, o presente estudo objetivou testar as seguintes hipóteses: (1) uma área fragmentada possui menor riqueza, menor diversidade e maior densidade da assembléia de herbáceas do que um ambiente contínuo; (2) existe maior serapilheira acumulada, maior temperatura do solo e menor umidade do solo na área fragmentada; e (3) a composição florística e estrutural das herbáceas são distintas entre as áreas, devido às alterações ambientais proporcionadas pela fragmentação florestal. O estudo foi desenvolvido na paisagem de floresta Atlântica da Usina Serra Grande (8°30‟S e 35°50‟O), Alagoas, utilizando-se a área de interior de um fragmento de 3.500 ha (área contínua) e dez pequenos fragmentos florestais variando entre 7,84 e 83,63 ha (área fragmentada). Os remanescentes possuem solos distróficos (latossolos e argissolos amarelo-vermelho), clima tropical quente úmido e vegetação Ombrófila Aberta Submontana e Estacional Semidecidual. As herbáceas (toda planta não lenhosa – incluindo trepadeiras e saprófitas) foram coletadas entre outubro de 2010 e março de 2011, estabelecendo-se aleatoriamente 50 parcelas (5×5 m) em ambas as áreas. As parcelas da área contínua foram estabelecidas a partir de 200 m da borda. Na área fragmentada foram plotadas cinco parcelas nas proximidades do ponto central de cada um dos remanescentes. Foram registradas a riqueza, a densidade, a diversidade da assembléia de herbáceas em ambas áreas. Em cada parcela foram coletados dados referentes à quantidade de serapilheira acumulada, teor de umidade do solo e temperatura do solo. Diferenças entre os ambientes foram avaliadas com os seguintes testes: Mann Witney (riqueza); teste de t de Hutcheson (diversidade); teste T (densidade, serapilheira acumulada, umidade e temperatura do solo). O MDS, com o ANOSIM, verificaram a diferença na composição florística e estrutural das parcelas distribuídas entre os habitats. Para testar a correlação espécie-variável ambiental foi realizada uma CCA. A riqueza foi maior no ambiente contínuo (97 espécies) do que no fragmentado (68), contudo não houve diferença significativa na densidade. A diversidade e a equabilidade foram maiores no ambiente contínuo (H‟ = 3,616 nats/ind.; J‟ = 0,791) do que no fragmentado (H‟ = 2,729 nats/ind.; J‟ = 0,647). Na área fragmentada houve maior quantidade de serapilheira acumulada, maior temperatura do solo e menor umidade do solo. O MDS evidenciou a segregação de dois grupos (parcelas da área contínua e parcelas da área fragmentada), sendo este resultado explicado pelo tipo de ambiente. A CCA verificou que as espécies se distribuem nas áreas a partir de um gradiente, que envolve maior influência do aumento da temperatura do solo e da diminuição da umidade do solo na área fragmentada, e o padrão contrário na área contínua, explicando a preferência de muitas espécies por determinado tipo de habitat. Contudo, outras variáveis não mensuradas também podem estar agindo na assembléia de herbáceas de Serra Grande. Tais resultados sugerem que a fragmentação de fato contribui para a perda de biodiversidade da flora de florestas tropicais, sobretudo de espécies da assembléia de herbáceas da floresta Atlântica Nordestina, principalmente devido às modificações ambientais geradas após a fragmentação de habitats. Assim, faz-se necessária a realização de estudos adicionais a fim de se ampliar a compreensão dos fatores que controlam a assembléia de herbáceas de áreas florestais tropicais úmidas.

Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2016-07-06T13:40:41Z No. of bitstreams: 1 Vanessa Freire de Carvalho.pdf: 1141788 bytes, checksum: 4945bdc3e20df2ad857b7cd4c65618c6 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-07-06T13:40:41Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Vanessa Freire de Carvalho.pdf: 1141788 bytes, checksum: 4945bdc3e20df2ad857b7cd4c65618c6 (MD5) Previous issue date: 2013-02-06 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The impacts caused by the urbanization have led to the decline of macroalgal biodiversity worldwide. This work aimed to study the impacts of urbanization on macroalgal communities on the coast of Espírito Santo. Nine areas were chosen for the surveys, four in urban centers and five distant from urban centers. The sampling procedures were made in consolidated substrates, on the intertidal zone during low tides. Photoquadrats were used for sampling. In each area three transects were positioned parallel to the coast and 30 quadrats were plotted to determine macroalgal percent cover. In each area macroalgae samples were collected for identification. The ecological indices: Shannon-Wiener, Margalef and Pielou evenness, were calculated and this data was used to perform the analysis of similarity (ANOSIM) and analysis of variance (ANOVA). 125 species were identified, of which 75 were Rhodophyta, 30 Chlorophyta and 20 Heterokontophyta (Phaeophyceae). Species of the genus Ulva, Colpomenia sinuosa and Arthrocardia variabilis were the dominant species in urban beaches, while Palisada perforata, Amphyroa anastomosans and Codium intertextum dominated in reference areas. Both the analysis of qualitative as quantitative similarity showed significant differences between the areas. The ANOVAS showed that Ilha do Frade have the lowest species richness. Ilha do Frade and Ilha do Boi, located in Vitória city, the state capital, showed the lowest diversity. The results show differences in the composition of macroalgal communities between urban and reference beaches of the coast of Espírito Santo. / Mundialmente, os impactos causados pela urbanização tem levado ao declínio da biodiversidade de macroalgas. Este trabalho tem como objetivo apresentar estudos sobre os impactos da urbanização nas comunidades de macroalgas da costa do Espírito Santo. Foram determinadas nove praias para amostragem, quatro situadas em áreas urbanizadas e cinco em áreas pouco urbanizadas. As coletas foram feitas em substratos consolidados, na região de mesolitoral, durante as marés de sizigia. Para a amostragem com fotoquadrados, foram plotados três transectos por praia, nos quais foram lançados 30 quadrados, para posterior análise de cobertura percentual de macroalgas. Amostras de macroalgas foram coletadas para a identificação. Foram calculados os índices ecológicos de Shannon-Wiener, Margalef e equitabilidade de Pielou e esses dados foram utilizados para realizar a análise de similaridade (ANOSIM) e análise de variância (ANOVA). Foram identificadas 125 espécies, distribuídas entre 75 Rhodophyta, 30 Chlorophyta e 20 Heterokontophyta (Phaeophyceae). Espécies do gênero Ulva, Colpomenia sinuosa e Arthrocardia variabilis foram as algas predominantes nas praias urbanizadas, enquanto Palisada perforata, Amphyroa anastomosans e Codium intertextum, nas não urbanizadas. Tanto a análise de similaridade qualitativa quanto a quantitativa mostraram diferenças significativas entre as praias. A análise de variância mostrou que a Ilha do Frade apresentou menor riqueza de espécies. A Ilha do Frade e a Ilha do Boi, localizadas na cidade de Vitória, capital do estado, apresentaram a menor diversidade de espécies. Os resultados demonstram que há diferenças na composição de comunidades entre as praias urbanizadas e não urbanizadas no litoral do Espírito Santo.

Made available in DSpace on 2014-06-12T15:06:16Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo4614_1.pdf: 3724612 bytes, checksum: e8386a8a865465dc1cc2dcee6e7cd689 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2007 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Os fungos conidiais constituem um grupo diversificado, com cerca de 15.945 espécies. Contudo, pesquisas taxonômicas sobre esses fungos no Brasil permanecem escassas e pontuais abordando, sobretudo, os decompositores de substratos vegetais. A Serra da Jibóia, fragmento de Mata Atlântica inserido na Caatinga do Estado da Bahia, foi selecionada como prioritária para conservação da biodiversidade. Visando contribuir para o conhecimento dos fungos conidiais na área, folhas em decomposição de três indivíduos de Clusia nemorosa, e C. melchiori foram coletadas bimestralmente de outubro/2005 a junho/2006. No laboratório, as folhas foram lavadas, colocadas em câmara-úmida e os fungos identificados em nível de espécie. Lâminas semipermanentes e o material herborizado foram tombados nos Herbários HUEFS e URM. Foram identificados 01 representante dos Coelomycetes e 78 Hyphomycetes, dos quais 12 constituem novos registros para o país: Anungitea globosa, Beltraniella amoena, Dactylaria belliana, D. ficusicola, Dictyosporium bulbosum, Flosculomyces floridaensis, Guedea novae-zelandiae, Gyrothrix magica, Idriella setiformis, Kylindria pluriseptata, Pleurophragmium varieseptatum e Selenodriella fertilis e sete para a Bahia: Beltrania querna, Clonostachys compactiuscula, Dictyosporium elegans, Gyrothrix verticiclada, Pseudobotrytis terrestris, Sporendocladia bactrospora e Stachybotrys parvispora. Associados às folhas de C. melchiori e C. nemorosa foram registrados 69 e 44 táxons, respectivamente, com a similaridade de fungos entre as duas espécies alcançando 60%. A maioria das espécies identificadas apresentou freqüência esporádica e constância acidental. Os dados revelam a riqueza de fungos conidiais no substrato estudado e contribuem para ampliação do conhecimento sobre a micota da Mata Atlântica

Made available in DSpace on 2014-06-12T16:27:42Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo2129_1.pdf: 2139619 bytes, checksum: ba9f89c1eecf5f7adce809a5c2b0acaa (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2009 / Pra não dizer que não falei das flores: um estudo sobre relações e biodiversidade no semiárido pernambucano aborda a importância do trabalho desenvolvido pelas mulheres agricultoras no semiárido a partir de suas práticas, experiências e saberes no manejo e conservação da biodiversidade. Parte da constatação da existência de desigualdades de gênero construídas socialmente que negam e subvalorizam o papel reprodutivo e produtivo da mulher, em especial no meio rural, somado à necessidade de estudos e pesquisas que contribuam para a conservação da biodiversidade visando o enfrentamento da crise ambiental. Ao desafiar-se adentrar as fronteiras da interdisciplinaridade, entrecruzando essas duas temáticas, a pesquisa parte da desnaturalização da divisão sexual do trabalho e dos vínculos existentes entre as mulheres e o meio ambiente, configurando-se, enquanto estratégia social, na busca da construção de relações de gênero mais justas. Adota como referência para observação e análise, a área do quintal, ou arredor de casa , considerada socialmente como parte do espaço privado, doméstico, e, portanto, como de responsabilidade e cuidado das mulheres, e o conjunto de atividades desenvolvidas pelas mesmas no manejo dessas áreas e sua relação com a conservação da biodiversidade. Em seu processo de construção, a pesquisa adota um referencial metodológico pautado na triangulação de métodos, permitindo a articulação de múltiplas estratégias, aportes teóricos e técnicas de coleta de dados, numa abordagem de cunho quanti-qualitativa, visando captar elementos localizados em dimensões distintas, mas que se entrecruzam na análise. Nesse sentido, utiliza como instrumentais a técnica da observação participante, entrevistas e questionários, dentre outros. Do ponto de vista dos resultados, a pesquisa ratifica a existência de relações injustas entre homens e mulheres no campo, a partir do trabalho desenvolvido por ambos, da valorização e reconhecimento socialmente atribuídos de forma diferenciada. Por outro lado, constata a importância da área dos quintais, enquanto espaços extremamente diversificados em número e variedades de espécies de plantas e com múltiplos usos. Foram registradas 289 etnoespécies nas 46 áreas pesquisadas, havendo uma média de 37 etnoespécies por quintal, sendo que 35% dos quintais apresentaram mais de 40 etnoespécies. Cerca de 41% dessas plantas foram classificadas pelas famílias como de uso ornamental, 22% como de uso alimentício e 17% medicinal; demais 11% foram associadas ao uso madeireiro e 9% a outras formas de uso. Sendo áreas criadas e manejadas, via de regra, pelas mulheres, os quintais também se configuram enquanto importantes espaços de troca, construção e transmissão de saberes, aclimatação de espécies, estímulo às sociabilidades locais a partir das relações envolvendo doações e partilhas de sementes e mudas e um conjunto de outras contribuições do trabalho desempenhado pelas mulheres que, direta ou indiretamente, resultam em experiências positivas no manejo e conservação da biodiversidade

Made available in DSpace on 2014-06-12T16:32:08Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo6389_1.pdf: 385883 bytes, checksum: 342bac079207e6b1f952080bae6dd657 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2007 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Microrganismos endofíticos vivem intra e/ou intercelularmente em plantas hospedeiras, sem causar danos aparentes e são de grande importância biotecnológica para a indústria, agricultura e medicina. A planta medicinal Borreria verticillata, conhecida popularmente como vassourinha-de-botão é utilizada no tratamento de infecções e inflamações, além de apresentar atividade antimicrobiana contra Escherichia coli, Staphylococcus aureus e Pseudomonas aeruginosa. Folhas da base e do ápice superficialmente esterilizadas e fragmentadas foram distribuídas em placas de Petri com os meios: batata dextrose ágar para fungos; caseína amido ágar e meio folha modificado para actinobactérias e bactérias. Foram isolados 87 microrganismos dos quais 50,6% (44) fungos, 35,6% (31) bactérias e 13,8% (12) actinobactérias. A freqüência de isolamento foi maior nas folhas da base (20%) do que nas folhas do ápice (4%). Foi observado que entre os microrganismos identificados a nível de gênero, Guignardia, Methylobacteria e Microbispora respectivamente, fungo, bactéria e actinobactéria foram os de maior prevalência. Quanto a atividade antimicrobiana, fungos e actinobactérias foram selecionados através do ensaio primário por bloco de gelose . Dos 56 isolados analisados 28.57% (16) apresentaram atividade antimicrobiana contra bactérias Gram negativas, Gram positivas e leveduras, sendo 56,25% (9) fungos e 43,75% (7) actinobactérias. Com os melhores microrganismos foram desenvolvidas fermentações em diferentes meios de cultura e testados pelo método de difusão em disco. Dos microrganismos testados no ensaio secundário, oito linhagens: quatro actinobactérias pertencentes ao gênero Microbispora e os fungos filamentosos Penicillium griseofulvum, P. aurantiogriseum e Mycelia sterilia exibiram atividade antimicrobiana principalmente para Bacillus subtilis (UFPEDA-16)

Made available in DSpace on 2014-06-12T15:02:43Z (GMT). No. of bitstreams: 1 license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2008 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / O solo é considerado um dos principais habitats para a comunidade de microrganismos, dentre os quais os fungos. O Parque Nacional Serra das Confusões, Estado do Piauí, Brasil, é considerado área prioritária para a conservação da biodiversidade da Caatinga, devido à sua extrema importância biológica. Com objetivo de isolar e identificar fungos filamentos da Caatinga de modo a ampliar o conhecimento sobre a micota deste bioma, 20 amostras de solo foram coletadas até 20 cm de profundidade, no Parque, durante os períodos chuvoso (março e novembro/2006) e de estiagem (junho e outubro/2007). O solo foi processado pelo método de diluição sucessiva e semeado em meio de Sabouraud suplementado com cloranfenicol (100mg/L), permanecendo a ±28º C por 72 horas. As colônias foram isoladas, purificadas e transferidas para meios de cultura específicos e os fungos identificados por observações macroscópicas e microscópicas. Foram reconhecidos 26 gêneros: cinco Ascomycota, cinco Zygomycota e 16 anamorfos, sendo dois Coelomycetes e 14 Hyphomycetes. Penicillium e Aspergillus predominaram com 27 e oito espécies, respectivamente. Bartalinia robillardoides Tassi e Pseudorobillarda agrostis (Sprague) Nag Raj. Morgan-Jones & Kendrick constituiem primeiro isolamento em solo do semi-árido brasileiro, enquanto Pseudeurotium bakeri C.Booth é assinalado pela primeira vez na América do Sul

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2018-10-18T17:25:25Z No. of bitstreams: 1 Antoniela Morais Marinho Soares.pdf: 3446835 bytes, checksum: 8f3bf3c027cad0c078a7ae2f6dc98209 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-10-18T17:25:25Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Antoniela Morais Marinho Soares.pdf: 3446835 bytes, checksum: 8f3bf3c027cad0c078a7ae2f6dc98209 (MD5) Previous issue date: 2018-06-29 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Convolvulaceae Juss. has 59 genera and about 1900 species, with cosmopolitan distribution. Usually herbaceous plants, rarely tress or leafless parasites (Cuscuta); with alternate leaves, simple or compound; inflorescenses cymoses, racemoses or thyrses; cálix 5-merous, sepals free; corola actinomorphic, 5-merous, commonly funnel-shaped, with conspicuous midpetaline-bands; stamens are included or not; ovary superior; a simple style, two distinct styles, or gynobasic; stigma is variously divided or swollen; fruit tipically a capsule; seeds usually 4, with presence or absence of hairs. Presents various species with economic and ecological importance, that evidence the family’s potential for realization of researches. In Brazil, 24 genera and 411 species occur and Rio Grande do Norte (RN) state is identified as an important gap in taxonomic studies about Convolvulaceae in Brazil.This project aimed to study the most representative genus of Convolvulaceae and investigate this family in Área de Proteção Ambiental Jenipabu. For this, a bibliographical survey was carried out, consultation to herbaria, field expeditions, specimens identification, analysis and interpretation of the data.This dissertation is structured in three chapters: 1-“The Rediscovery of Ipomoea macedoi (Convolvulaceae)”, article published in the journal Phytotaxa. 2- “O gênero Ipomoea no estado do Rio Grande do Norte”, with 33 species, being 8 new occurrences, to be submitted in the journal Biota Neotrópica; and 3- “Convolvulaceae na APA Jenipabu, Rio Grande do Norte”, an area included in atlantic forest domain, with 9 species and 5 genera, to be submitted in the journal Rodriguésia. This study revised identities, registered new occurrences, and pointed out species before listed but not found in this inventory. The characters taxonomically more informative to delimitation of species were the indumentum, habit, morfology of leaves, sepals and gynoecium. This study has fund of the project: “Convolvulaceae da América do Sul: construir em direção ao conhecimento global.”, financed by CNPQ. / Convolvulaceae Juss. apresenta 59 gêneros e cerca de 1900 espécies, com distribuição cosmopolita. São geralmente herbáceas, raramente árvores ou parasitas áfilas (Cuscuta); com folhas alternas, simples ou compostas; inflorescências cimosas, racemosas ou tirsos; cálice 5-mero, dialissépalo; corola actinomorfa, 5-mera, comumente infundibuliforme, com áreas mesopétalas características; estames insertos ou não; ovário súpero, estilete simples, bifurcado, duplo ou ginobásico, estigma variadamente dividido ou inchado; fruto tipicamente cápsula; sementes geralmente 4, com ou sem indumento. Apresenta diversas espécies com importância econômica e ecológica, o que evidencia o potencial da família para a realização de pesquisas. No Brasil, ocorrem 24 gêneros e 411 espécies e o estado do Rio Grande do Norte (RN) é apontado como uma importante lacuna nos estudos taxonômicos da família no Brasil. Este trabalho objetivou estudar o gênero mais representativo de Convolvulaceae e investigar a família na área de Proteção Ambiental Jenipabu. Para isto, foi realizado levantamento bibliográfico, consulta a herbários, expedições de campo, identificação dos espécimes, análise e interpretação dos dados. Esta dissertação está estruturada em três capítulos: 1- “The Rediscovery of Ipomoea macedoi (Convolvulaceae)”, artigo publicado no periódico Phytotaxa. 2- “O gênero Ipomoea no estado do Rio Grande do Norte”, com 33 espécies, sendo 8 novas ocorrências, a ser submetido no periódico Biota Neotrópica; e 3- “Convolvulaceae na APA Jenipabu, Rio Grande do Norte”, uma área pertencente ao bioma da Mata Atlântica, com 9 espécies e 5 gêneros, a ser submetido ao periódico Rodriguésia. Este estudo revisou identificações, registrou novas ocorrências, e apontou espécies antes listadas mas que não foram encontradas neste inventário. Os caracteres taxonomicamemte mais informativos para delimitação das espécies foram indumento, hábito, morfologia das folhas, sépalas e do gineceu. O estudo contou com recursos financeiros do projeto “Convolvulaceae da América do Sul: construir em direção ao conhecimento global”, financiado pelo CNPQ.

Orientadores: Zanoni Dias, Guilherme Pimentel Telles / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Computação / Made available in DSpace on 2018-08-23T01:03:41Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Peixoto_BrunoMalveira_M.pdf: 1497265 bytes, checksum: 9127980450af9b4a7d8fe679c48f2310 (MD5) Previous issue date: 2013 / Resumo: Metagenômica é o estudo genético de uma amostra ambiental, e permite a análise de organismos incultiváveis em laboratório. É uma área de estudo nova e possui muitos desafios computacionais, com poucas ferramentas dedicadas disponíveis. O objetivo deste trabalho é realizar um estudo metagenômico da diversidade de organismos microbianos de amostras da unidade de compostagem da Fundação Parque Zoológico de São Paulo, analisando e comparando os programas e métodos existentes. O estudo das comunidades microbianas que ali vivem é de grande importância para um melhor entendimento do papel biológico desses organismos. Dados simulados foram testados para validar os métodos utilizados com os dados reais e os resultados mostram que mesmo programas conhecidos são sensíveis aos bancos de dados de referência que utilizam / Abstract: Metagenomics is the genetic study of an environmental sample, and allows the analysis of non-culturable organisms. It is a new area of genetic study and has many computational challenges, with few dedicated tools available. The objective of this work is to realize a metagenomic study of the microbial diversity of samples from the composting unit of Fundação Parque Zoológico de São Paulo, analyzing and comparing existing programs and methods. The study of the microbial communities that live there is of great importance to a better understanding of the biological role of these organisms. Simulated data were tested to validate the methods we used with the real data and the results show that even well-known tools are biased by the reference databases it uses / Mestrado / Ciência da Computação / Mestre em Ciência da Computação

Made available in DSpace on 2014-06-12T23:00:54Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo7054_1.pdf: 7172873 bytes, checksum: 261a1de5b2ef03bb91e711638a0e1b12 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2011 / O sistema estuarino de Itamaracá (Canal de Santa Cruz e estuários dos rios Carrapicho e Botafogo) foi estudado com o objetivo de se determinar a estrutura espaço-temporal da comunidade de diatomáceas e avaliar os padrões ecológicos das espécies, bem como sua correlação com as principais variáveis ambientais. As amostras foram coletadas mensalmente no período de março/2007 a março/2008 em sete pontos fixos, nos regimes de baixa-mar e preamar e em diferentes períodos sazonais através de arrastos horizontais à superfície com duração de 3 minutos, utilizando uma rede de plâncton (64μm de abertura de malha). Foram obtidos dados ambientais como profundidade local, temperatura, transparência da água, salinidade, pH, oxigênio dissolvido e sais nutrientes. Foram inventariados 171 táxons, destacando-se como espécies dominantes: Chaetoceros curvisetus Cleve, Coscinodiscus centralis Ehrenberg, Odontella regia (Schultze) Simonsen, Meuniera membranacea (Cleve) Silva comb. nov. e Pseudosolenia calcar- avis (Schultze) Sundström com um padrão sazonal demonstrando uma definida sucessão de espécies. A maioria das espécies foram ticoplânctônicas (51,5%), resultantes da pouca profundidade dos estuários e hidrodinamismo local. Os índices de diversidade específica variaram de 0,01 bits.cél-1, mês de janeiro/08, a 4,19 bits.cél-1 Palavras-chave: biodiversidade, diatomáceas, distribuição anual, estuário, Itamaracá em agosto/07. A equitabilidade variou de 0,01, em fevereiro/08 a 0,676 no mês de outubro/07. A análise dos componentes principais mostrou que a salinidade foi o parâmetro que mais influenciou o local de estudo, correlacionando-se diretamente com a profundidade, transparência da água, pH, oxigênio dissolvido e a espécie dominante Meuniera membranacea; e indiretamente com os nutrientes nitrito, nitrato e silicato. O enriquecimento de nutrientes, salinidade e ciclos marés foram os principais fatores limitantes responsáveis pela diversidade de diatomáceas na área de estudo. O ecossistema estudado apresentou leves sinais de impacto ambiental, representado pela presença de espécies dominantes no ambiente, entretanto minimizado pela dinâmica da circulação estuarina que permite uma rápida reciclagem e recuperação do ambiente

Orientador: Ricardo Jannini Sawaya / Banca: Marcio Roberto Costa Martins / Banca: Laura Rodrigues Vieira de Alencar / Banca: Fernando Rodrigues da Silva / Banca: Cristiano de Campos Nogueira / Resumo: A Mata Atlântica da América do sul é um mosaico de diferentes fitofisionomias, relacionadas a pressões seletivas correspondentes a fatores ecológicos e evolutivos distintos, os quais regulam a distribuição da biodiversidade entre os habitats. Exploramos, neste trabalho, como a diversidade de serpentes é distribuída ao longo do gradiente latitudinal da Mata Atlântica. Primeiro analisamos a associação entre a riqueza em espécies e a diversidade filogenética de serpentes com tempo para especiação e extensão geográfica ao longo do gradiente latitudinal. Nós também exploramos as amplitudes de nicho climático destas serpentes. E, finalmente, decompusemos a composição filogenética de ilhas costeiras do sudeste da Mata Atlântica no intuito de entender como área e distância com o continente poderia afetar diferentes componentes da diversidade de serpentes. Encontramos que área é o principal fator relacionado com riqueza em espécies, independentemente do tempo para especiação. Observamos a maior riqueza em espécies em linhagens mais recentes nas zonas serranas do sudeste. Amplitudes de nicho climático, associadas à precipitação, mostraram conservação filogenética, afetando a distribuição dos clados mais recentes. Em nosso exemplo de ilhas, mostramos que distintos fatores ecológicos podem afetar riqueza em espécies e diversidade filogenética diferentemente. Desta maneira, fatores idiossincráticos poderiam gerar diferentes respostas em diferentes linhagens ao longo do gradiente... / Abstract: The Atlantic Forest of South America is a mosaic of different vegetation physiognomies corresponding to distinct evolutionary and ecological factors that drive biodiversity distribution. One of these factors is climatic variation. We explored herein how snake diversity, (measured as species richness and phylogenetic diversity) is distributed along the Atlantic Forest latitudinal gradient, taking area and time-for-speciation into account. We first analyzed the association of species richness and phylogenetic diversity with time-forspeciation and geographical extent along the latitudinal gradient. We also explored climatic niche breadths. And finally, we decomposed the phylogenetic composition across coastal islands in southeastern Atlantic Forest, to understand how island area and distance from the mainland drive different components of snake diversity. We found that area is a major driver of species richness, regardless of time-for-speciation. We observed higher species richness of more recent lineages in southeastern mountain ranges. Climatic niche breadths associated to precipitation showed phylogenetic conservatism, affecting the distribution of more recent clades. In our island case study, we show that distinct ecological factors can drive species richness and phylogenetic diversity differently. In this way, idiosyncratic factors generate different responses in different lineages across environmental gradients. We hope to shed some light on ecological and historical ... / Doutor