Intervenções conservacionistas baseadas em receitas generalistas e uniformes têm eficácia comprometida por serem incapazes de incorporar as particularidades de cada ecossistema e as diferentes características regionais da atividade humana. Este trabalho teve como objetivo desenvolver uma metodologia que incorporasse a avaliação espacial do fluxo gênico contemporâneo de plantas ao planejamento territorial de paisagens fragmentadas. Adotou-se o Jatobá (Hymenaea courbaril), espécie zoocórica, como espécie guarda-chuva. Localizada no Pontal do Paranapanema, a área amostral utilizada possui 49km2, que abrigam sete sub-populações de Jatobá e 1,32 km2 de remanescentes florestais divididos em 4 fragmentos. Executamos o censo de árvores adultas e amostragem regular de indivíduos juvenis. Amostrou-se 359 indivíduos, dos quais 75 foram considerados como adultos, todos foram georreferenciados por GPS e genotipados por SSR. Analisando-se três locos de DNA genômico e um de c-DNA, foram realizados 21.225 testes de maternidade, nos quais 62 plantas jovens tiveram suas mães identificadas. A distribuição das distâncias de dispersão de sementes verificada indica que o isolamento para recolonização entre sub-populações ocorre em distâncias superiores a 1600m. Foram localizados 13 fragmentos que permaneceriam em condição de isolamento, mesmo após a recuperação de todas as APPs. Recomenda-se a inclusão do aumento de conectividade destas manchas, bem como do reflorestamento de todas as APPs, na lista de prioridades do planejamento da conservação da biodiversidade desta região. / Conservationist interventions, based on general and uniform protocols, lose effectiveness by being incapable to incorporate the particularities of each ecosystem and the different regional patterns of the human activity. This research meant to develop a method that incorporates the spatial evaluation of the contemporary gene flow of plants to the territorial planning of fragmented landscape. We adopted Hymenaea courbaril as an umbrella species. Located in the Pontal of the Paranapanema (São Paulo State, Brazil), the study area has 49km2, that shelters seven subpopulations of Hymenaea courbaril with 1,32km2 are covered by forest that is separated in four patches. We censused adult trees and also regular seedlings and juveniles were regularly sampled. A total of 359 individuals were identified and georreferencered by GPS and genotyped by SSR. Analyzing 3 loci of genomic DNA and one of c-DNA, we applied a maternity test. 62 young plants had them mothers identified. The distribution of distances of seed dispersal indicates that the isolation for recolonization between subpopulations occurs in distances greater than 1600m, indicating that the connectivity in the studied landscape is very low for Hymenaea courbaril. 13 habitat patches were located in isolation condition, even after the recuperation of all the law-protected riparian-corridor areas. These results emphasized the increase of connectivity of these spots, as well as the restoration in the protected riparian areas, as some of the top priorities in the planning of the biological conservation of this region.

Este trabalho teve como objetivo, analisar os processos utilizados na coleta de sementes e produção de mudas florestais de viveiros da região da bacia do rio Piracicaba do Estado de São Paulo e adjacentes, e o grau de conservação da biodiversidade existente destas práticas. Esta análise foi realizada a partir de levantamentos à campo, com a aplicação de questionário semi-estruturado, em 22 viveiros da região da bacia do rio Piracicaba, principalmente com ênfase no número de matrizes coletadas por espécies, formas de obtenção de sementes, espécies utilizadas, dificuldades encontradas no setor e alternativas visando aumento da biodiversidade. A maioria dos viveiros executa a coleta e compra de sementes e aproximadamente metade também troca sementes, sendo que esta troca é esporádica e apenas com outros viveiros da região. O número médio de espécies florestais produzidas entre os viveiros em 2009 foi de 149 espécies, sendo que 94% dos viveiros produzem mais de 80 espécies. Do total de 516 espécies produzidas pelos viveiros, 19% são espécies exóticas do Brasil. Da lista de espécies recomendada pela Secretaria do Meio Ambiente de São Paulo para plantios heterogêneos, 416 das 701 espécies listadas não foram produzidas por nenhum viveiro em 2009, porém, foram produzidas outras 135 espécies nativas do Brasil. Dos viveiros que coletam sementes, 48% possuem marcação e banco de dados de matrizes, 90% afirmam coletar apenas de fragmentos da região, 95% coletam em áreas restauradas e 86% coletam em áreas urbanas. Metade dos entrevistados tem conhecimento sobre a importância de se coletar sementes de um grande número de matrizes como é recomendado pela literatura, mas apenas 19% afirmaram ser para aumento da diversidade genética das espécies. Quanto à média de matrizes que são coletadas para cada espécie, apenas um viveiro afirmou coletar mais de 12 matrizes por espécie. Nas análises de correlação, a variável média de matrizes coletadas para cada espécie por viveiro apresentou moderada correlação positiva entre a variável marcação e banco de dados de matrizes e de moderada correlação negativa com a variável dos viveiros coletam em área urbana. Também foi encontrada uma moderada correlação positiva entre os viveiros que possuem marcação e banco de dados de matrizes e a quantidade de mudas produzidas. A maioria dos entrevistados (91%) afirmou que participariam de um programa de troca e mistura de sementes, visando aumentar a diversidade na produção de mudas, sendo que destes, 40% aceitariam pagar por este tipo de serviço. Para se contornar o baixo uso da diversidade intra específica nos viveiros entrevistados, torna-se necessário um maior esforço para conscientização e educação dos envolvidos na coleta de sementes e produção de mudas nativas, ressaltando-se a importância da diversidade inter e intra específica das espécies e as conseqüências do uso da baixa diversidade, além da importância do uso de espécies nativas regionais na restauração florestal. Já quanto ao uso da diversidade inter específica, foi observada uma alta diversidade de espécies nos viveiros, reflexo da demanda por alta diversidade nos plantios, que é estimulada pela legislação estadual. / The goal of this work was to assess the main process associated with tree seed collection and seedling production in nurseries within and in the adjacencies of the Piracicaba river basin in the state of Sao Paulo. The degree of the existing biodiversity conservation in these practices is also investigated. This analysis is based on a field survey where semi-structured questionnaires were applied to 22 nurseries in the Piracicaba river basin region, considering the main factors: number of mother trees collected, ways of obtaining seeds, species used, difficulties in the process, and alternatives in order to increase biodiversity. Most of the nurseries collect and buy seeds, and approximately half of the nurseries also exchange seeds; however, exchanging seeds is infrequent and only happen among local nurseries. The average number of species produced by the surveyed nurseries in 2009 was 149, and 94% of the nurseries produced more than 80 species. A total of 516 species were produced by the surveyed nurseries where 19% are exotic species from Brazil. Among the 701 species recommended by the state of Sao Paulo Secretary for the Environment, 416 were not produced by any of the surveyed nurseries; in spite of that, 135 Brazilian native species that were not listed were produced. Among the nurseries that collect seeds, 48% tag and keep a data basis of the mother trees, 90% collect only in forest fragments within the nurseries area, 95% also collect from restored areas, and 86% collect seeds from urban areas. Although half of the surveyed nurseries recognize that it is important to collect seeds from a large number of mother trees, as recommend by the literature, only 19% understand that a larger number of mother trees would increase genetic diversity. Regarding the average number of mother trees, only one nursery collects from more than 12 mother trees per specie. The correlation analyses show a moderate positive correlation between the average of mother trees collected in each nursery and whether the nursery tags and keeps a data basis of mother trees, and a moderate negative correlation between the average of mother trees collected and whether the nursery collect seeds from urban areas. In addition, tagging and keeping a data basis is highly correlated with the total number of tree seedlings that are produced. Most surveyed nurseries (91%) would agree to participate in a program to exchange and mix seeds in order to increase the tree seedling diversity, and 40% of these would also agree with paying for such program. To address the issues related to the use of few mother trees, it is necessary to work on awareness and education of the professionals that collect and produce native tree seedlings. More specifically, in addition to the recommendation of using regional native species, it is necessary to emphasize the importance of both inter and intra species diversity as well as on the negative consequences of poor diversity. Regarding the diversity of species produced, it was found that a large number of different species are produced by the surveyed nurseries, mostly due to the demand for diversity, stimulated by current state laws.

A produção de banana no Vale do Ribeira, em São Paulo, está inserida numa região que abriga um fragmento remanescente da Mata Atlântica, considerada um dos principais repositórios de biodiversidade e a floresta mais devastada entre os biomas brasileiros. Medidas sustentáveis, como a adoção de práticas agrícolas alternativas, tem sido o caminho para a conservação da fauna e flora, como também para a redução do uso inapropriado de terras que consequentemente pode aumentar o índice de doenças que atacam as plantas. Apesar, do razoável conhecimento científico sobre a fisiologia pós-colheita da banana, ainda não foram elucidadas quais são as respostas fisiológicas do fruto diante das alterações do meio ambiente decorrentes das práticas agroecológicas. Principalmente quais são os mecanismos de ação de compostos específicos, relacionados com a resistência da planta contra os estresses bióticos e abióticos. Também, não há uma abordagem analítica integrada que identifique os reguladores das vias metabólicas e possibilite um estudo holístico a nível molecular. Neste trabalho, foi avaliado o efeito da proximidade da biodiversidade nativa da Mata Atlântica sobre o perfil de metabólitos da banana (Musa acuminata AAA, Cavendish, cv. Nanicão). Foram comparados os frutos da parcela Biodiversidade, o qual apresenta 60% de seu perímetro limítrofe à floresta com a parcela Controle, inserida em uma área de produção de banana convencional. Neste estudo, foram determinados os perfis de etileno, vida verde, amido, açúcares, textura, cor, metabólitos semi-voláteis e não-voláteis e poliaminas. Como resultado, ambas as parcelas avaliadas apresentaram diferenças significativas no metabolismo primário e secundário, nos frutos verdes e maduros, respectivamente. Os metabólitos com diferença significativa entre as parcelas experimentais apresentaram maior envolvimento no metabolismo primário, sobretudo na via de biossíntese de aminoácidos, compostos precursores de uma ampla faixa de metabólitos secundários. As alterações quanto à abundância destes compostos são uma referência de que as mudanças do meio modificam as respostas da planta a estresses e estímulos. / Banana production in the Ribeira Valley, in São Paulo, is set in a region that embraces a remaining fragment of the Atlantic Coastal Forest (Mata Atlântica), considered one of the main biodiversity repositories and the most devastated forest among the Brazilians´ biomes. Sustainable measures such as the adoption of alternative farming practices has been the way for the conservation of fauna and flora, but also to reduce the inappropriate use of land which in turn may increase the disease index that attack plants. Although, reasonable scientific knowledge about banana postharvest physiology is available, the fruit´s physiologic response given the environment changes as a result agroecological practices has not been elucidated yet. Primarily what are the mechanisms of action of specific compounds, related to plant resistance against biotic and abiotic stresses. In addition, there is not an integrated analytical approach to identify regulators of metabolic pathways and enable a holistic study at the molecular level. In this study, we evaluated the effect of proximity to the native biodiversity of the Atlantic Forest on the banana metabolites profile (Musa acuminata AAA, Cavendish, cv. Nanicão). The fruits of Biodiversity group were compared, which has 60% of its perimeter adjacent to the forest with the Control group set in a conventional banana production area. In this study, we determined the ethylene profiles, green life, starch, sugars, texture, colour, semi- volatile and non- volatile metabolites and polyamines. As a result, both evaluated groups showed significant differences in primary and secondary metabolism, green and ripen fruits respectively. The metabolites with significant differences between treatments showed greater involvement in primary metabolism, especially in amino acid biosynthesis, precursors of secondary metabolites. Changes in the abundance of these compounds are indicators that alterations in the environment modify the plant responses to stresses and stimuli.

Este trabalho está inserido na linha de pesquisa Geografia Política e Meio Ambiente. Estuda a problemática ambiental que envolve relações com política territorial. Como tal, discute questões de acesso, controle e uso dos recursos naturais no bioma do Cerrado do Norte de Minas Gerais à margem esquerda do rio São Francisco sob o pressuposto de que a distribuição política dos recursos não corresponde à distribuição natural gerando situações de conflito, de impacto e destruição. A política territorial e ambiental proposta para a área de estudo é a implantação do Mosaico de Unidades de Conservação Sertão Veredas-Peruaçu que se constitui em política pública ambiental determinada pelo Sistema Nacional de Unidades de Conservação como forma de arranjo territorial e ambiental para o caso de conjunto de unidades de conservação em proximidade regional. A estratégia adotada para implantação do Mosaico é o Desenvolvimento Territorial de Base Conservacionista que pode significar uma transformação na característica territorial e na sociedade da área de estudo. / This paper is inserted in the line of research on Political Geography and Environment. It concerns the environmental issue that involves relations with territorial policy. It discusses matters of access, such as the control and use of natural resources at Savanna biome in the north of Minas Gerais, on the left bank of River São Francisco, under the pretext of the political distribution of resources has no relation to the natural distribution. Due to this result, it creates situations of conflict, impact and destruction. The territorial and environmental policy proposed to the study area is the implementation of Patchwork Units of Conservation of Sertão Veredas-Peruaçu that constitutes itself in environmental public policy determined by the National System of Units of Conservation as a way of territorial and environmental arrangement to the case of Units of Conservation in regional proximity. The adopted strategy to the implementation of the patchwork is the Territorial Development of Conservationist Basis which may concern a transformation in territorial characteristic and in the society of the study area.

A crescente demanda por produtos naturais desenvolvidos em bases sustentáveis tem promovido novas oportunidades de negócios na Amazônia brasileira. Como parte dessa tendência, os avanços das pesquisas na biotecnologia têm demonstrado papel fundamental na expansão desse potencial, impulsionando desse modo as cadeias produtivas das bioindústrias na região. Setores que merecem destaque na produção de bioprodutos em novas bases técnicas são representados pelas indústrias de cosméticos e fitoterápicos. Tendo como foco essas relações entre a biodiversidade, a biotecnologia e a bioindústria, o presente trabalho avalia algumas experiências em curso nesses segmentos, que envolvem um complexo sistema de parcerias entre empresas, universidades, institutos de pesquisa, agências financeiras oficiais, comunidades organizadas e cooperativas de dentro e fora da Região. Constituiu objeto de levantamento empírico, algumas indústrias de diferentes portes, centros de pesquisa e pequenos empreendimentos emergentes apoiados por Programas de Incubação de Empresas de Base Tecnológica em Belém e Manaus. / The growing demand for natural products developed by sustainable bases has created new business oportunities in the Brazilian Amazon. As part of this development, biotecnological research advances have show fundamental role in expanding its potential, pushing forward, on this way, the bioindustry productive chairs on the region. Sectors that deserve attention on the production of bioprodutcs under new tecniques bases are represented by the cosmetics and phytotherapics industries. Focusing on these relations between biodiversity, biotechnology and bioindustry, this research will evaluate on-going experiences which englobe a system of partnerships among companies, universities, research institutes, financial agencies, active local communities and unions from within and without the region. This research is empirically supported by interviews and visits to several industries, with different sizes; research centers and small scale emergent enterprises sponsored by Business Incubation Programs of Technological Bases in Belém and Manaus.

O tema biodiversidade apresenta elevado potencial pedagógico para a abordagem não apenas de conteúdos científicos, mas de conhecimentos relativos às questões sociais, políticas e valorativas. Considerando-se que o processo educativo deve ser permeado por três dimensões da práxis humana, - conceitos, valores e formas de atuação/participação -, a temática é importante para o trabalho pedagógico com estas dimensões, aproximando a educação científica e a educação ambiental crítica. Esta pesquisa teve como objetivo compreender as dimensões referentes a conteúdos científicos, valores e formas de atuação que estão presentes no conteúdo de uma mídia audiovisual com a temática da biodiversidade, bem como nas interpretações de dois grupos de estudantes do ensino médio, antes e após a exibição desta mídia, estabelecendo aproximações e distanciamentos para a construção de uma visão mais ampla (holística) do conceito de biodiversidade pelos estudantes. Os referencias teóricos abordam a relação entre educação científica e educação ambiental crítica, a temática da biodiversidade, o uso de mídias nos processos educativos e a abordagem socio-histórica. O estudo apresenta abordagem predominantemente qualitativa, usando técnicas do grupo focal e de análise de conteúdo para a categorização e entendimento dos dados. Os resultados confirmaram a amplitude do conceito de biodiversidade quando são considerados conhecimentos que vão além das definições biológicas do termo. Conhecimentos relativos à forma de atuação foram os mais presentes nas interpretações dos estudantes dos grupos focais, enquanto que na mídia audiovisual destacaram-se os conhecimentos valorativos, sobretudo os de ordem utilitária da biodiversidade. Na esfera de conteúdos científicos, o conceito de biodiversidade referente à diversidade de espécies foi o mais citado nos grupos focais, enquanto que o vídeo abordou mais frequentemente a medição da biodiversidade enfatizando a riqueza de espécies. Na esfera de valores, a valoração utilitária da biodiversidade foi amplamente citada nos grupos focais e no vídeo. Por último, na esfera de atuação, interpretações sobre o envolvimento na preservação da biodiversidade predominaram no grupo 1; no grupo 2, a responsabilização pelos problemas socioambientais; na mídia, políticas para a preservação da biodiversidade. Constatamos, finalmente, que o uso da mídia audiovisual permitiu aproximações e distanciamentos com os conhecimentos apresentados pelos estudantes, reforçando que os indivíduos interpretam as informações da mídia de diferentes modos, já que cada um traz consigo uma bagagem de conhecimentos anteriores à vida escolar. O uso da mídia audiovisual e a promoção de debates em sala de aula pode contribuir tanto para uma educação ambiental crítica quanto para a reprodução de uma visão conservadora e pragmática, as mais frequentes nos dados estudados; daí a importância da intervenção pedagógica do professor, encaminhando a discussão para uma perspectiva crítica. / The theme biodiversity presents a great pedagogical potential in approaching not only scientific content but also the knowledge related to social, political and value issues. Considering that educational processes must be permeated by the three dimensions of human praxis - concepts, values, and forms of action/participation -, the theme is important for the pedagogical work within these dimensions, approaching scientific education and critical environmental education. This research aimed to understand the dimensions related to the scientific contents, values, and forms of action that are present in the content of an audiovisual media with the theme of biodiversity, as well as in the interpretations of two groups of high school students, before and after the media exhibition. We analyzed the transcribed contents and established approximations and distances to build a broader (holistic) view of the concept of biodiversity by students. Theoretical references deal with the relationship between scientific education and critical environmental education, the theme of biodiversity, the use of media in educational processes and the socio-historical approach. Our study presents a predominantly qualitative approach, using focal group techniques and content analysis to categorize and understand the data. The results confirmed the amplitude of the biodiversity concept when considering the knowledge that goes beyond the biological definitions of the term. Knowledge about the way of acting was the most present in the interpretations of the students of the focus groups, while in the audiovisual media the valuation knowledge was emphasized, especially those of a utilitarian order of biodiversity. In the sphere of scientific content, the biodiversity concept of species diversity was the most cited in the focus groups, while the video focused more often on measuring biodiversity by emphasizing species richness. In the sphere of values, the utilitarian valuation of biodiversity was widely cited in focus groups and in the video. At last, in the sphere of action, interpretations on involvement in the preservation of biodiversity predominated in group 1; in group 2, the responsibility for socio-environmental problems; and in the media, policies for the preservation of biodiversity. Finally, we have found that the use of audiovisual media allowed approximating and distancing with students\' knowledge, reinforcing that individuals interpret media information in different ways since each one carries with it a baggage of knowledge prior to school life. The use of audiovisual media and the promotion of classroom debates can contribute both to a critical environmental education and to the reproduction of a conservative and pragmatic view, the most frequent in the data studied; hence the importance of a pedagogical intervention of the teacher directing the discussion to a critical perspective.

Orientador: Marco Antonio de Assis / Banca: Luis Carlos Bernacci / Banca: Flaviana Maluf de Souza / Resumo: Esta investigação foi parte do projeto temático ECOFOR: "Biodiversity and Ecosystem Functioning in Degraded and Recovering Amazonian and Atlantic Forests" (NERC/FAPESP), projeto no qual se pretende compreender de maneira mais apropriada o papel das florestas tropicais alteradas pelo homem, sobretudo entender a contribuição que essas florestas possuem para a diversidade, a ciclagem de nutrientes e estoques de carbono. A Mata Atlântica é considerada um dos biomas mais diversos do mundo, posicionada entre os 25 hotspots de diversidade mundial, destacada pelo elevado grau de endemismo, a alta diversidade florística e papel importantíssimo no estoque de carbono. A intensa ocupação humana levou esse domínio fitogeográfico a um avançado processo de fragmentação com a consequente transformação da paisagem e um contínuo declínio nos serviços ambientais. Poucos estudos integram métricas da paisagem a parâmetros fitossociológicos para tentar responder qual o papel dos remanescentes florestais para a manutenção da diversidade da flora. Nesse contexto, o objetivo deste estudo foi realizar um levantamento da estrutura e da composição florística em comunidades arbóreas de seis fragmentos de Floresta Ombrófila Densa Montana e verificar se a estrutura e a composição possuem relação com o tamanho, a conectividade e o tempo de recuperação dos fragmentos. O estudo foi desenvolvido na região de São Luís do Paraitinga, Leste do Estado de São Paulo. Os fragmentos estudados possuem tamanhos variados entre 12,2 ha até 94,6 ha sendo três deles com alta conectividade e três, baixa conectividade. Para o levantamento florístico e fitossociológico, no interior de cada fragmento foi alocado um transecto (10x250 m), com 25 sub parcelas de 10x10 m, sendo amostrada a comunidade arbórea (PAP > 15 cm), incluindo palmeiras, samambaiaçus ... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: This research was part of the thematic project ECOFOR: "Biodiversity and Ecosystem Functioning in Degraded and Recovering Amazonian and Atlantic Forests" (NERC/FAPESP), in which the aim is to comprehend the role of the human-modified tropical forests (HMTFs) more appropriately, especially understanding the contribution of HMTFs to the diversity, nutrient cycling and stocks of carbon.The Atlantic Rain Forest is one of the most diverse biomes in the world, among the 25 hotspots of world diversity, highlighted by its high level of endemism, high floristic diversity and its very important role in the carbon stock. The intense human occupation took this biome to an advanced fragmentation process with the consequent landscape transformation and a continuous decline of environmental services. Few studies integrate landscape metrics to phytosociological parameters to try to find out what is the role of forest remnants to the diversity and flora maintenance. The aim of this study was to conduct a survey of the floristc structure and composition in tree communities of six fragments of Dense Ombrophilous Forest, and assess whether the structure and composition are influenced by the fragment size, connectivity and recovery time. The study was developed in the region of São Luís do Paraitinga, East of the State of São Paulo, Brazil. The studied fragments have sizes ranging from 12.2 ha to 94.6 ha, three of them with high connectivity and three with low connectivity. A transect (10x250 m) ... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Na tese, tendo os anuros do grupo de Dendropsophus microcephalus como modelo, analisamos o canto de anúncio e a morfologia de populações e espécies do grupo, buscando aumentar o conhecimento sobre essas espécies, em um contexto de taxonomia integrativa. No primeiro capítulo, \"Revisão taxonômica de Dendropsophus nanus e D. walfordi\", buscamos avaliar taxonomicamente a validade de D. walfordi em relação a D. nanus, uma vez que essas espécies vêm sendo alvo discussões taxonômicas devidos às semelhanças morfológicas e falta de dados acústicos para elucidação dessa questão. Nossas análises mostram que os cantos de D. nanus e D. walfordi são distintos e que D. walfordi deve permanecer como uma espécie válida. No segundo capítulo, \"Revisão acústica das espécies grupo de Dendropsophus decipiens com o reconhecimento de uma nova espécie da Mata Atlântica\", nós revisamos a morfologia e o canto de anúncio de D. decipiens, D. haddadi, D. oliveirai e D. berthalutzae, e caracterizamos uma população do município de Sooretama, estado do Espírito Santo, que representa uma espécie ainda não descrita. Essa última pode ser facilmente diagnosticada das outras quatro espécies mais proximamente relacionadas a partir de seu canto de anúncio com padrão de emissão de notas completamente diferente de todas as outras espécies do grupo de D. microcephalus. No terceiro capítulo, \"Canto de anúncio de três de espécies de Dendropsophus sem grupo de espécies definido: D. tintinnabulum, D. haraldschultzi e D. leali\" o objetivo é caracterizar acusticamente essas três espécies, colaborando para o detalhamento acústico delas. Nós também detalhamos a morfologia de D. tintinnabulum e D. leali a fim determinar a qual grupo essas duas espécies devem ser incluídas. Nossos resultados demonstram que D. tintinnabulum compartilha mais características com o grupo de D. microcephalus, que D. haraldschultzi apresenta padrão de coloração e morfologia que não permitem, nesse momento, alocar essa espécies em nenhum dos grupos de Dendropsophus e que D. leali compartilha características de canto e morfologia com as espécies do grupo de D. minutus. E por fim, no quarto capítulo, nós desenvolvemos uma análise acústica detalhada de 21 espécies do grupo de D. microcephalus. Para algumas dessas espécies nós apresentamos dados de mais de uma população. O objetivo é apresentar caracterizações 7 acústicas de populações e espécies do grupo de D. microcephalus que ocorrem no Brasil avaliando padrões zoogeográficos, variações intraespecíficas e identidades taxonômicas. Nossas avaliações sugerem que D. rhea é sinônimo júnior de D. jimi uma vez que as variações presentes nas populações envolvidas nesse estudo não apresentam caracteres que permitam diagnoses entre essas espécies. Verificamos de D. cruzi apresenta uma grande variação na frequência dominante de seu canto de anúncio, o que representa uma variação ainda não reportada no grupo de D. microcephalus, mas a caracterização morfológica não permite a diferenciação dessas populações, demonstrando que mais estudos, principalmente envolvendo análises genéticas, são necessários para o entendimento taxonômico dessas populações. Nossos resultados para todas as espécies e populações analisadas representam estudo um abrangente do grupo de D. microcephalus em contexto de taxonomia integrativa. / In this thesis, having the Dendropsophus microcephalus group anurans as a biological model, we analyzed the advertisement calls and morphology of populations and species of this group, seeking for increase the knowledge about those species, in integrative taxonomic context. In the first chapter, \"Taxonomic review of Dendropsophus nanus and D. walfordi\", we evaluated the validity of D. walfordi in relation to D. nanus, once those species are frequently subject of taxonomic doubts questioning the D. walfordi synonymy in relation to D. nanus due to the great morphological similarity and lack of conclusive data related to the advertisement calls of these species. In the second chapter, \"Acoustic and morphological evaluation of the Dendropsophus decipiens Group with the recognition of a new species from Atlantic Forest\", we reviewed the morphology and the advertisement calls of D. decipiens, D. haddadi, D. oliveirai and D. berthalutzae, and we characterized a population from the municipality of Sooretama, state of Espírito Santo, which represents a species not yet described. The latter can be easily diagnosed of the four other closely related species from its call with a completely different pattern of emission of note from all other species in the D. microcephalus group. In the third chapter, \"Advertisement call of three species of Dendropsophus with species group undefined: D. tintinnabulum, D. haraldschultzi e D. leali\" the purpose is characterize the call and morphology of those species in order to determine wich group of Dendropsophus those species should be included. Our results demonstrated that D. tintinnabulum shares more traits with the species of of the D. microcephalus Group, that D. haraldschultzi shows pattern of coloration and morphology that do not allow us, at that moment, to allocate this species in any of the groups of Dendropsophus and that D. leali shares characteristics of call and morphology with the species of the D. minutus Group. And finally, in the fourth chapter, we developed a detailed acoustic analysis of 21 species of the of D. microcephalus Group. For some of these species we present data from more than one population. The aim is to present acoustic characterizations of populations and species of the D. 9 microcephalus Group that occur in Brazil evaluating zoogeographic patterns, intraspecific variations and taxonomic identities. Our evaluations suggest that D. rhea is a junior synonym of D. jimi since the variations present in the populations involved in this study do not present characters that allow diagnoses between those species. We verified that D. cruzi presents a great variation in the dominant frequency of its call, which represents a variation not yet reported in the D. microcephalus Group, but the morphological characterization does not allow the differentiation of those populations, demonstrating that more studies, mainly involving genetic analyzes, are necessary for the taxonomic understanding of these populations. Our results for all species and populations analyzed represent a comprehensive study of the D. microcephalus Group in the context of integrative taxonomy.

Reduções dos níveis de sulfato nos solos vêm sendo observadas em função de práticas agrícolas e exportação de biomassa. O enxofre Elementar (S0) pode ser usado como fertilizante, contudo para ser absorvido pelas plantas deve ser antes oxidado a sulfato. A oxidação microbiológica do S0 está associada com Acidithiobacillus thiooxidans, apesar de muitos trabalhos não detectarem esta espécie nos solos. Trabalhos recentes têm mostrado uma grande diversidade de microrganismos capazes de oxidar o S0 no solo além do A. thiooxidans, entretanto, pouco se sabe sobre esta diversidade em solos brasileiros. Os objetivos deste trabalho foram determinar a taxa de oxidação do S0 em três solos brasileiros, a diversidade de Bacteria e Archaea envolvidas nesse processo, isolar bactérias oxidantes de enxofre (BOE) e avaliar seu potencial como biofertilizante. Amostras de solos foram coletadas em Anhembi/SP (ANB), Brasília, DF (BRA) e Rondonópolis, MT (RDP). Os solos foram enriquecidos com 10 g de S0 kg-1 (+S0) ou não (-S0) e incubados em microcosmos a 28 oC por 0, 6, 22, 38, 54, 67, 86 e 102 dias. A taxa de oxidação do S0 variou entre 2,8 e 3,2 ug S cm-2 dia-2 nos solos arenosos (ANB e RDP) e 1,3 ug S cm-2 dia-2 no solo argiloso (BRA) após 102 dias de incubação. A oxidação do S0 elevou a quantidade de sulfato e reduziu o pH principalmente nos solos arenosos. A aplicação do S0 alterou a estrutura e a diversidade da comunidade microbiana. Foram obtidas 811 seqüências do gene rRNA 16S de bactérias, sendo agrupadas em 518 Unidade Taxonômicas Operacionais (UTOs). Os principais filos nos solos foram Acidobacteria, Actinobacteria, Firmicutes e Proteobacteria. Foram obtidas 463 seqüências de rRNA 16S de Archaea, sendo agrupadas em 39 UTOs. Mais de 84% da UTOs foram classificadas como Archaea não classificadas enquanto 15% foram classificadas como Euryarchaeota. A diversidade de Archaea não foi muito afetada pelo S0. Cinqüenta BOE foram isoladas e afiliadas a Proteobacteria (68%), Actinobacteria (18%) e Firmicutes (14%) após o seqüenciamento do rRNA 16S. Os gêneros atribuídos foram: Aurantimonas, Acinetobacter, Novosphingobium, Methylobacterium. Paracoccus, Bradyrhizobium, Sphingomonas, Mycobacterium, Micrococcus e Bacillus. Esferas de alginato +S0, contendo os isolados de BOE ANB9 (Acinetobacter), RDP5 (Mycobacterium) e A. thiooxidans foram incubados em areia estéril, resultando no aumento de 111%, 430% e 5350% no SO4 2- comparado ao controle negativo após 14 dias de incubação, respectivamente. As taxas de oxidação do S0 foram 4,7 (ANB9), 18 (RDP5) e 130 (A. thiooxidans) vezes maiores do que o controle negativo após o mesmo período. As micro-esferas carregando as bactérias e o S0 foram incubadas nos solos ANB e BRA durante 54 dias. A. thiooxidans foi o oxidante de enxofre mais eficiente, apresentando a maior taxa de oxidação, aumento do SO4 2- e redução do pH em comparação com os outros isolados de BOE. As esferas de A. thiooxidans também foram capazes de solubilizar rocha fosfática. Novas informações foram geradas sobre a diversidade de bactérias envolvidas na oxidação do S0 em solos brasileiros. / Depletion of sulfur levels in soil has been observed as a result of agricultural practices and biomass harvesting. Elemental sulfur (S0) may be an interesting fertilizer, however it must be oxidized to sulfate in order to be taken up by plants. Biological oxidation of S0 is commonly associated to Acidithiobacillus thiooxidans, although many studies failed to detect them in soils. Recent efforts have shown a great diversity of microorganisms able to oxidize S0, besides A. thiooxidans. Nevertheless, no information is available for Brazilian soils. The aims of this work were to determine the S0 oxidation rates of three Brazilian soils, the bacterial and archaeal communities diversity associated to S0 oxidation, as well as, to isolate sulfur oxidizing bacteria (SOB) and evaluate its potential as a biofertilizer. Soils sampled in Anhembi, SP (ANB), Brasília, DF (BRA) and Rondonópolis, MT (RDP) were enriched with 10 g of S0 kg-1 (+S0) or not (-S0) and incubated in microcosms for 0, 6, 22, 38, 54, 67, 86 and 102 days under 28 oC. Oxidation rates of S0 were low, ranging to 2,8 and 3,2 ug S cm-2 day-2 in the sand soils (RDP and BRA) and 1,3 ug S cm-2 day-2 in the clay one (BRA) after 102 days incubation. Soil SO4 2- content was increased and pH decreased as result of S0 oxidation mainly in the sand soils. Bacterial community structure and diversity were affected by S0 amendment and time of incubation, represented by changes in the DGGE profile and phylum distribution. Were obtained 811 bacterial 16S rRNA sequences, clustered in 518 Operational Taxonomic Units (OTUs). The predominant phyla in the soils were Acidobacteria, Actinobacteria, Firmicutes and Proteobacteria. Were obtained 463 archaeal 16S rRNA sequences clustered into 39 OTUs. More than 84% of the OTUs were assembled to unclassified Archaea whereas 15% were classified as Euryarchaeota. Archaea diversity was not mostly affected by S0. Fifty SOB were isolated and affiliated to Proteobacteria (68%), Actinobacteria (18%) and Firmicutes (14%) after 16S rRNA sequencing. The assigned genera were Aurantimonas, Acinetobacter, Novosphingobium, Methylobacterium, Paracoccus, Bradyrhizobium, Sphingomonas, Mycobacterium, Micrococcus and Bacillus. Alginate beads containing the SOB isolates ANB9 (Acinetobacter), RDP5 (Mycobacterium) and A. thiooxidans plus S0 were incubated in sterile sand resulting in 111%, 430% and 5350% increment in SO4 2- comparing to negative controls after 14 days incubation, respectively. The S0 oxidation rate was 4,7 (ANB9), 18 (RDP5) and 130 (A. thiooxidans) times greater than the negative control after the same time. The entrapped bacteria with S0 were incubated in ANB and BRA soils for 54 days in microcosms. A. thiooxidans was the best S0 oxidizer, showing the highest oxidation rate, increment in SO4 2- and pH decrease comparing with the other SOB isolates. A. thiooxidans beads were also able to solubilize phosphate rock. New information was generated about the bacterial diversity involved in the S0 oxidation in Brazilian soils.

A constante perda da diversidade biológica frente às pressões antrópicas tem concentrado atenções sobre a necessidade de se conhecer a diversidade genética das espécies que ainda restam como um primeiro passo para o desenvolvimento de estratégias de manejo. Técnicas de genética molecular fornecem uma estimativa do número de formas distintas numa área, bem como medidas de quão diferentes elas são. Dentre estas técnicas, o sequenciamento de DNA mitocondrial e nuclear, aliado à análise de seqüências microssatélite, geram informações potencialmente capazes de evidenciar a variação contida entre indivíduos, sendo uma ferramenta excelente para ser utilizada em análise filogenética, diferenciação interespecífica e intraespecífica. Neste trabalho utilizamos 1670pb de uma região do DNA mitocondrial incluindo o citocromo b e uma parte da região controle e 630pb do gene nuclear c-mos Para analisar a relação filogenética entre as espécies de crocodilianos brasileiros. Marcadores produzidos por PCR-RFLP baseados em seqüência do gene citocromo b no DNA mitocondrial foram desenvolvidos para a identificação molecular das seis espécies brasileiras de crocodilianos. Esta técnica além de importante na identificação das espécies poderá ser utilizada como metodologia oficial de controle da comercialização e exportação de carne e couro de jacaré. O Caiman latirostris apresenta a mais extensa distribuição geográfica entre todos os crocodilianos. No presente trabalho utilizamos marcadores microssatélites para testar a hipótese da variação genética ser relacionada com distância geográfica, em pequena e grande escala, e se a variabilidade genética das espécies esta correlacionada com diferentes sub-biomas no litoral e interior. Não foi possível a transferência de marcadores microssatélites para a espécie Paleosuchus trigonatus, sendo assim novos marcadores genéticos foram caracterizados para espécie pela construção de bibliotecas enriquecidas de DNA microssatélite. / Constant loss of biological diversity due to antropic pressure has concentrated attention upon the need to know the genetic diversity of remaining species as the first step in developing management strategies. Molecular techniques provide an estimate of the number of distinct forms, as well as measurements of the extent of their differences. Among these techniques, mitochondrial and nuclear DNA sequencing along with microsatellite sequences provide information that is potentially capable of detecting any variation between individuals, which makes it an excellent tool for phylogenetic analyses, as well as inter and intraspecific differentiation. In the present work, we used a 1670bp region of mitochondrial DNA including cytochrome b and a 630bp portion of the nuclear gene c-mos to analyze the phylogenetic relationship among Brazilian crocodilian species. PCR-RFLP markers based on cytochrome b mitochondrial DNA were developed for the molecular identification of six Brazilian crocodilian species. This technique is not only important for the identification of species, but it is also useful as an official methodology for controlling commercialization and exportation of crocodilian meat and leather. Broad-snouted caimans (Caiman latirostris) geographic distribution comprises one of the widest latitudinal ranges among all crocodilians. In the present study, we used microsatellite markers to test the hypothesis that genetic variation is related to geographic distance, on a small and large scale, and if the genetic variability of a species is correlated to coastal and inland subbiomes. It was not possible to transfer microsatellite markers to Paleosuchus trigonatus, so new genetic markers were characterized for the species by constructing a microsatellite enriched DNA library.