Submitted by PPG Direito (ppgdir@pucrs.br) on 2017-09-29T12:47:17Z No. of bitstreams: 1 SEBASTIAO_PATRICIO_MENDES_DA COSTA_TES.pdf: 1738831 bytes, checksum: 3dba20d33d4e76c56ac2dae1df8bb09f (MD5) / Rejected by Caroline Xavier (caroline.xavier@pucrs.br), reason: Devolvido devido ? falta de capa institucional no arquivo PDF, e a data de defesa cadastrada na publica??o (30/08/2017) est? diferente da data de defesa que consta na folha de aprova??o da banca (31/07/2017) do arquivo PDF. on 2017-09-29T13:39:07Z (GMT) / Submitted by PPG Direito (ppgdir@pucrs.br) on 2017-10-05T12:25:59Z No. of bitstreams: 1 SEBASTIAO_PATRICIO_MENDES_DA COSTA_TES.pdf: 1881577 bytes, checksum: d946434e09404d6801eaa7db6b8f8bb1 (MD5) / Approved for entry into archive by Caroline Xavier (caroline.xavier@pucrs.br) on 2017-10-06T11:35:36Z (GMT) No. of bitstreams: 1 SEBASTIAO_PATRICIO_MENDES_DA COSTA_TES.pdf: 1881577 bytes, checksum: d946434e09404d6801eaa7db6b8f8bb1 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-10-06T11:39:26Z (GMT). No. of bitstreams: 1 SEBASTIAO_PATRICIO_MENDES_DA COSTA_TES.pdf: 1881577 bytes, checksum: d946434e09404d6801eaa7db6b8f8bb1 (MD5) Previous issue date: 2017-07-31 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior - CAPES / The present work addresses cultural rights and seeks to investigate the protection of traditional knowledge. Increased interest in traditional knowledge by multinational biotechnology companies, and by people in developing countries, who use so-called traditional medicine and other traditional knowledge, reinforces the need to protect this knowledge in order to preserve it and to allow a fair distribution of benefits among its holders. Environmental management is also equally favored with the use of traditional knowledge together with scientific knowledge, which help preserving biodiversity. In the democratic regime, the coexistence of different groups reinforces plurality of ideas and cultural diversity. Traditional knowledge is a product of cultural diversity and reflects deep cultural differences, based on the worldviews of distinct social groups. In this work, the effectiveness of the protection of traditional knowledge was investigated through research carried out in an interdisciplinary perspective, using a diversity of sources, in order to understand as fully as possible the protection of culture and traditional knowledge. To this end, the work counted on the contributions of Law and Anthropology, in order to understand the culture and traditional knowledge and to analyze the protection of this knowledge, which is a product of the cultural identity of indigenous peoples and traditional communities. One also considered notions of Economics in order to understand the economic reasons for the interest in this knowledge. The research examined studies by authors from various regions of the world and from different specialties. Among them, the authors of Latin America, especially those of indigenous origin, stand out. The indigenous contribution in research is present at various times and complements the work with the vision of indigenous peoples and traditional communities. After extensive analysis of the protection of traditional knowledge, it was verified that such protection is not effective in Brazil, despite having recent legislation on the subject, even with the various articles of the Federal Constitution that ensure the right to culture and respect for traditional communities and indigenous peoples, even though Brazil is a signatory of relevant international treaties that protect these traditional knowledge and practices. The lack of effective protection of traditional knowledge happens for at least three reasons: 1) For the lack of effective participation of indigenous peoples and traditional communities in public policies and other matters of their interests, as verified during the process of Law no. 13.123/15, the new Brazilian biodiversity law; 2) Brazilian legislation has not concerned itself with indigenous peoples and traditional communities living simultaneously in several countries. It did not even waved to protect the knowledge produced by them or the way in which the benefits would be distributed in that situation; 3) The Brazilian policy of protection of traditional knowledge is unrelated to territorial politics. The territory has a strong connection with the identity of indigenous peoples and traditional communities, and it is there that this knowledge develops. The Brazilian regression in relation to indigenous lands and traditional communities negatively affects the production and transmission of traditional knowledge for future generations. / O presente trabalho aborda direitos culturais e busca investigar a prote??o dos conhecimentos tradicionais. O aumento do interesse pelos conhecimentos tradicionais por empresas multinacionais que trabalham com biotecnologia e pelas popula??es de pa?ses em desenvolvimento, que utilizam a chamada medicina tradicional e os demais conhecimentos tradicionais, refor?a a necessidade de prote??o desses conhecimentos para preserv?-los e permitir uma justa reparti??o dos benef?cios entre seus detentores. A gest?o ambiental ? igualmente favorecida com a utiliza??o de conhecimentos tradicionais juntamente com conhecimentos cient?ficos que auxiliam na preserva??o da biodiversidade. No regime democr?tico, a conviv?ncia de grupos diferentes refor?a a pluralidade de id?ias e a diversidade cultural. Os conhecimentos tradicionais s?o frutos da diversidade cultural e refletem diferen?as culturais profundas, baseadas nas cosmovis?es de grupos sociais distintos. Neste trabalho, investigou-se a efetividade da prote??o dos conhecimentos tradicionais atrav?s de pesquisa realizada na perspectiva interdisciplinar, com a utiliza??o de diversidade de fontes, para se compreender da forma mais completa poss?vel a prote??o da cultura e dos conhecimentos tradicionais. Para isso, o trabalho contou com contribui??es do Direito e da Antropologia para se compreender a cultura e os conhecimentos tradicionais e se analisar a prote??o a esses conhecimentos, frutos da identidade cultural de povos ind?genas e comunidades tradicionais. Considerou tamb?m no??es de Economia para entender as raz?es econ?micas para o interesse nesses conhecimentos. A pesquisa examinou estudos de autores de v?rias regi?es do mundo e de diferentes especialidades. Dentre eles, ressaltam-se os autores da Am?rica Latina, em especial, os de origem ind?gena. A contribui??o ind?gena na pesquisa est? presente em diversos momentos e complementa o trabalho com a vis?o de povos ind?genas e comunidades tradicionais. Ap?s ampla an?lise da prote??o dos conhecimentos tradicionais, verificou-se que tal prote??o n?o ? efetiva no Brasil, apesar de possuir legisla??o recente sobre o tema, mesmo com os diversos artigos da Constitui??o Federal que asseguram o direito ? cultura e o respeito ?s comunidades tradicionais e povos ind?genas, ainda que o Brasil seja signat?rio de relevantes tratados internacionais que protegem esses conhecimentos e pr?ticas tradicionais. A n?o efetividade da prote??o dos conhecimentos tradicionais acontece pelo menos por tr?s motivos: 1) Pela falta de participa??o efetiva dos povos ind?genas e comunidades tradicionais em pol?ticas p?blicas e demais assuntos de seus interesses, como se verificou durante a tramita??o da Lei n. 13.123/15, a nova lei da biodiversidade brasileira; 2) A legisla??o brasileira n?o se preocupou com os povos ind?genas e comunidades tradicionais que vivem simultaneamente em v?rios pa?ses. Nem mesmo acenou para proteger os conhecimentos produzidos por eles ou para a forma que se daria a reparti??o dos benef?cios nessa situa??o; 3) A pol?tica brasileira de prote??o aos conhecimentos tradicionais ? desatrelada da pol?tica territorial. O territ?rio tem forte liga??o com a identidade de povos ind?genas e comunidades tradicionais e ? nele que esses conhecimentos se desenvolvem. O retrocesso brasileiro em rela??o ?s terras ind?genas e de comunidades tradicionais afeta negativamente a produ??o e a transmiss?o dos conhecimentos tradicionais para as gera??es futuras. Palavras-chave: Biodiversidade. Conhecimentos tradicionais. Direitos

Submitted by PPG Zoologia (zoologia-pg@pucrs.br) on 2018-05-29T13:52:52Z No. of bitstreams: 1 Tese - Santos - Fid?lis.pdf: 21234236 bytes, checksum: 6b55c8c14033601ff328f8d7bed152b9 (MD5) / Approved for entry into archive by Caroline Xavier (caroline.xavier@pucrs.br) on 2018-05-29T14:16:25Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Tese - Santos - Fid?lis.pdf: 21234236 bytes, checksum: 6b55c8c14033601ff328f8d7bed152b9 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-05-29T14:21:21Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Tese - Santos - Fid?lis.pdf: 21234236 bytes, checksum: 6b55c8c14033601ff328f8d7bed152b9 (MD5) Previous issue date: 2018-03-22 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior - CAPES / A fam?lia Anomalepididae atualmente ? constitu?da por 18 esp?cies de cobras, conhecidas como ?cobras-cegas?, fossoriais e de distribui??o geogr?fica restrita ? regi?o Neotropical. Praticamente, n?o h? informa??es a respeito da hist?ria de vida dos Anomalepididae, pois s?o animais de dif?cil coleta e a manuten??o em cativeiro para estudos com biologia ? bastante dif?cil. As informa??es dispon?veis a respeito de cobras Anomalepididae est?o concentradas em estudos anat?micos, principalmente osteologia do cr?nio, taxonomia e filogenia a n?vel de fam?lias dentro de Serpentes. Mas, desde a descri??o de Anomalepididae por Taylor em 1939, n?o houve uma revis?o taxon?mica abrangente dentro da fam?lia ou alguma infer?ncia filogen?tica com novos arranjos taxon?micos. Em rela??o ? taxonomia do grupo, a literatura ? restrita ? descri??o de novas esp?cies e revis?es taxon?micas de dois g?neros (Anomalepis e Liotyphlops). O objetivo prim?rio deste estudo foi a revis?o taxon?mica da fam?lia Anomalepididae e, para isto, foi utilizado toda a amostragem poss?vel de esp?cies e esp?cimes na aquisi??o de dados morfol?gicos, al?m do emprego da t?cnica High-Resolution X-ray Computed Tomography (HRXCT). O objetivo secund?rio foi inferir uma hip?tese filogen?tica para as esp?cies dentro de Anomalepididae com base nos caracteres anat?micos obtidos do exame de esp?cimes. Este trabalho resultou em um novo arranjo taxon?mico para Anomalepididae, com 19 esp?cies v?lidas, descri??o de duas novas esp?cies de Liotyphlops para o Brasil, sendo uma para o estado de Mato Grosso e outra para o estado de Santa Catarina e a recondu??o de Liotyphlops beui para a sinon?mia de Liotyphlops ternetzii. Al?m disto, a an?lise de parcim?nia com base em caracteres do cr?nio e da morfologia externa recuperou Anomalepididae como um t?xon monofil?tico dentro de Scolecophidia. / The family Anomalepididae currently consists of 18 species known as "blind snakes", fossorial in habit and with geographical distribution restricted to the Neotropical region. Practically, there is no information about the life history of the Anomalepididae, because they are difficult to collect and the maintenance in captivity for biology studies is quite difficult. The information available regarding Anomalepididae snakes is concentrated on anatomical studies, mainly osteology of the skull, taxonomy, and phylogeny at the level of families within Serpentes. But since the description of Anomalepididae by Taylor in 1939, there has been no comprehensive taxonomic review within the family or some phylogenetic inference with new taxonomic arrangements. In relation to the taxonomy of the group, the literature is restricted to the description of new species and taxonomic revisions of two genera (Anomalepis and Liotyphlops). The primary objective of this study was the taxonomic revision of the Anomalepididae and, for this, all possible sampling of species and specimens were used in the acquisition of morphological data, besides the use of the High-resolution X-Ray Computed Tomography (HRXCT) technique. The secondary objective was to infer a phylogenetic hypothesis for the species within Anomalepididae based on the anatomical characters obtained from the specimen examination. This work resulted in a new taxonomic arrangment for Anomalepididae, with 19 valid species, description of two new species of Liotyphlops from Brazil, being one for the state of Mato Grosso and the other for the state of Santa Catarina, and the re-conduction of Liotyphlops beui to the synonymy of Liotyphlops ternetzii. In addition, the parsimony analysis based on characters from the skull and external morphology recovered Anomalepididae as a monophyletic taxon within Scolecophidia.

Abordagens integrativas considerando diferentes dimensões da diversidade (p.ex., taxonômica, funcional, ou filogenética) cada vez mais estão sendo utilizadas para (1) avançar o nosso conhecimento sobre os mecanismos que criam e mantém a biodiversidade, e (2) elucidar a distribuição da biodiversidade tanto em áreas geográficas de interesse como dentro de áreas protegidas. De fato, entender como a biodiversidade se distribui no espaço e como ela é mantida ao longo do tempo é fundamental para embasar o planejamento de áreas protegidas e corredores ecológicos, assim como auxiliar no manejo de espécies invasoras, restauração de habitats degradados e manejo de ecossistemas. Nessa perspectiva, os objetivos centrais desta tese foram: (1) avaliar os mecanismos ecológicos e evolutivos, que potencialmente influenciam a diversidade beta taxonômica e filogenética de árvores nas florestas Atlânticas do sul do Brasil, e (2) avaliar como os componentes taxonômicos e filogenéticos se distribuem ao longo destas florestas, e como eles são representados dentro da rede regional de áreas protegidas. Para tal, utilizei modelagem de equações estruturais (capítulo 1) para testar a validade de uma rede de hipóteses ligando dados e teoria. No capítulo 1, avaliei a relação entre a diversidade beta taxonômica e filogenética, e como elas se relacionam com a riqueza de espécies, filtragem ambiental, espaço geográfico e estrutura filogenética (agrupamento filogenético). Nesse capítulo, concluí que a diversidade beta taxonômica é influenciada principalmente pelos gradientes altitudinais e climáticos, enquanto que a diversidade beta filogenética é determinada também pelo grau de agrupamento filogenético, em nível local, que provavelmente reflete o conservadorismo de nicho dentro das linhagens e distúrbio humano, que historicamente tem conduzido as florestas estudadas a um processo de homogeneização biótica. Em relação ao segundo objetivo, utilizei uma abordagem integrativa para predizer e mapear os componentes taxonômicos e filogenéticos da diversidade de árvores e, em seguida, avaliar a efetividade da rede de áreas protegidas em representar tais componentes nas florestas Atlânticas do sul Brasil. Nesse capítulo, concluí que as áreas protegidas são insuficientes para preservar adequadamente a biodiversidade de árvores nestas florestas. Sugeri que a expansão da rede em direção as áreas de alta singularidade taxonômica e filogenética, como definidas aqui, poderia aumentar, ao mesmo tempo, a representação da riqueza de espécies, da diversidade beta e da história evolutiva das espécies estudadas. Sugeri também que a inclusão de áreas de alta insubstituibilidade, em termos de história evolutiva, poderia ajudar a aumentar a proteção da diversidade de características e do potencial evolutivo das espécies. / Integrative approaches considering different dimensions of biodiversity are increasingly being used in ecology and conservation to (1) advance our knowledge about the mechanisms underlying current patterns of biological diversity, and (2) elucidate the distribution of biodiversity in geographical areas of interest, and within the protected areas. Indeed, understanding how biodiversity is distributed in space and how it is maintained over time is critical to support the planning of protected areas and ecological corridors as well as assist the management of invasive species, the restoration of degraded areas and ecosystem management. In this perspective, the central goals of this thesis were: (1) to evaluate the ecological and evolutionary mechanisms that potentially influence the tree taxonomic and phylogenetic beta diversity in Atlantic forests located in southern Brazil, and (2) to evaluate how the taxonomic and phylogenetic diversity components are distributed across these forests, and how they are represented within the regional network of protected areas. For this, I used structural equation modeling (chapter 1) to test the validity of a network of hypotheses linking data and theory. In the chapter 1, I evaluate the relationship between taxonomic and phylogenetic beta diversity, and how they are related to species richness, environmental filtering, geographical space and phylogenetic structure (phylogenetic clustering). In this chapter, I conclude that taxonomic beta diversity (at the study scale) is mainly driven by the altitudinal and climatic gradients, while phylogenetic beta diversity is also determined by the degree of phylogenetic clustering at local level, more likely reflecting niche conservatism within lineages and human disturbance that has historically conducted the studied forests to a process of biotic homogenization. In relation to the second goal, I used an integrative approach to predict and map the taxonomic and phylogenetic components of tree diversity, and to assess the effectiveness of the protected areas network in representing these components in the Atlantic forests. In this chapter, I conclude that protected areas are insufficient to adequately preserve the tree biodiversity in these forests. I suggest that expanding the network towards the areas of taxonomic and phylogenetic uniqueness, as defined here, could increase the representation of species richness, beta diversity and evolutionary history of angiosperm trees at the same time. Furthermore, the inclusion of areas of high irreplaceability in terms of evolutionary history could help to improve the protection of feature diversity and evolutionary potential of species.

Dentre as ameaças causadas pealas mudanças climáticas, é esperado um aumento na frequência e na magnitude de eventos climáticos extremos. Portanto, é de vital importância identificar características da comunidade que confiram estabilidade aos processos ecossistêmicos. Por meio de três experimentos buscamos explorar essas intrincadas relações entre alguns aspectos da biodiversidade e a estabilidade ecológica. No primeiro estudo, comparamos a produtividade primária antes e depois de uma inundação em comunidades sintéticas com diferentes valores de riqueza de espécies, diversidade e composição funcional. No segundo experimento, investigamos como alterações na intensidade de chuvas (simuladas por meio de interceptadores) afetaram os atributos funcionais, diversidade e processos ecossistêmicos de um campo nativo sob diferentes frequências de desfolhação. O terceiro estudo, consistiu em um experimento com manipulação da riqueza de espécies por meio de remoções, onde analisamos o efeito da diversidade de espécies na estabilidade nos níveis de organização de comunidade (colonizações e extinções) e ecossistema (variação na produtividade primária). Atributos funcionais e outras características da comunidade (riqueza e composição) afetaram e foram afetadas pelos distúrbios. A relação diversidade-estabilidade apresentou diferentes tendências dependendo da natureza e intensidade do distúrbio. O aumento dos recursos após a inundação favoreceu comunidades mais ricas e aquelas contendo atributos relacionados à aquisição de recursos. Além disso, a frequência de desfolhação não afetou a resposta da vegetação à manipulação de chuva. Estabilidade apresentou tendências opostas dependendo do nível de organização ecológica considerado. Maior substituição 63 de espécies em comunidades mais ricas correspondeu a uma maior estabilidade em 64 processos ecossistêmicos. / Climate change is expected to increase the frequency and magnitude of extreme weather events. It is therefore of major importance to identify the community attributes that confer stability in ecosystem processes facing such events. By means of three experiment-based studies, we aimed to explore how plant community aspects affect ecological stability. In the first study, we compared data on biomass productivity before and after a major flood in synthetic plant communities with different values of species richness, functional diversity and community weighted means of functional traits on different measures of stability. In the second experiment, we investigate how changes in rainfall (simulated by rainout-shelters) alter functional traits and diversity and ecosystem processes of a natural grassland under different defoliation frequencies. The third study consisted on a biodiversity experiment in which we manipulated species richness by removals for studying the effects of species diversity on the stability at the community (colonization and extinction) and ecosystem levels (variation in primary productivity). Functional traits and other community features (richness, composition) affected and were affected by the disturbances. Diversity-stability relationships presented different trends depending on the disturbance nature and intensity. Resource inputs following the flood favoured rich communities and the ones characterized by traits related to resource acquisition. Also, defoliation frequency did not affect the way vegetation responded to rainfall manipulation. Stability showed opposite trends when evaluated at different levels of ecological organization. Higher turnover in rich communities corresponded to increased stability in ecosystem processes.

Reduções dos níveis de sulfato nos solos vêm sendo observadas em função de práticas agrícolas e exportação de biomassa. O enxofre Elementar (S0) pode ser usado como fertilizante, contudo para ser absorvido pelas plantas deve ser antes oxidado a sulfato. A oxidação microbiológica do S0 está associada com Acidithiobacillus thiooxidans, apesar de muitos trabalhos não detectarem esta espécie nos solos. Trabalhos recentes têm mostrado uma grande diversidade de microrganismos capazes de oxidar o S0 no solo além do A. thiooxidans, entretanto, pouco se sabe sobre esta diversidade em solos brasileiros. Os objetivos deste trabalho foram determinar a taxa de oxidação do S0 em três solos brasileiros, a diversidade de Bacteria e Archaea envolvidas nesse processo, isolar bactérias oxidantes de enxofre (BOE) e avaliar seu potencial como biofertilizante. Amostras de solos foram coletadas em Anhembi/SP (ANB), Brasília, DF (BRA) e Rondonópolis, MT (RDP). Os solos foram enriquecidos com 10 g de S0 kg-1 (+S0) ou não (-S0) e incubados em microcosmos a 28 oC por 0, 6, 22, 38, 54, 67, 86 e 102 dias. A taxa de oxidação do S0 variou entre 2,8 e 3,2 ug S cm-2 dia-2 nos solos arenosos (ANB e RDP) e 1,3 ug S cm-2 dia-2 no solo argiloso (BRA) após 102 dias de incubação. A oxidação do S0 elevou a quantidade de sulfato e reduziu o pH principalmente nos solos arenosos. A aplicação do S0 alterou a estrutura e a diversidade da comunidade microbiana. Foram obtidas 811 seqüências do gene rRNA 16S de bactérias, sendo agrupadas em 518 Unidade Taxonômicas Operacionais (UTOs). Os principais filos nos solos foram Acidobacteria, Actinobacteria, Firmicutes e Proteobacteria. Foram obtidas 463 seqüências de rRNA 16S de Archaea, sendo agrupadas em 39 UTOs. Mais de 84% da UTOs foram classificadas como Archaea não classificadas enquanto 15% foram classificadas como Euryarchaeota. A diversidade de Archaea não foi muito afetada pelo S0. Cinqüenta BOE foram isoladas e afiliadas a Proteobacteria (68%), Actinobacteria (18%) e Firmicutes (14%) após o seqüenciamento do rRNA 16S. Os gêneros atribuídos foram: Aurantimonas, Acinetobacter, Novosphingobium, Methylobacterium. Paracoccus, Bradyrhizobium, Sphingomonas, Mycobacterium, Micrococcus e Bacillus. Esferas de alginato +S0, contendo os isolados de BOE ANB9 (Acinetobacter), RDP5 (Mycobacterium) e A. thiooxidans foram incubados em areia estéril, resultando no aumento de 111%, 430% e 5350% no SO4 2- comparado ao controle negativo após 14 dias de incubação, respectivamente. As taxas de oxidação do S0 foram 4,7 (ANB9), 18 (RDP5) e 130 (A. thiooxidans) vezes maiores do que o controle negativo após o mesmo período. As micro-esferas carregando as bactérias e o S0 foram incubadas nos solos ANB e BRA durante 54 dias. A. thiooxidans foi o oxidante de enxofre mais eficiente, apresentando a maior taxa de oxidação, aumento do SO4 2- e redução do pH em comparação com os outros isolados de BOE. As esferas de A. thiooxidans também foram capazes de solubilizar rocha fosfática. Novas informações foram geradas sobre a diversidade de bactérias envolvidas na oxidação do S0 em solos brasileiros. / Depletion of sulfur levels in soil has been observed as a result of agricultural practices and biomass harvesting. Elemental sulfur (S0) may be an interesting fertilizer, however it must be oxidized to sulfate in order to be taken up by plants. Biological oxidation of S0 is commonly associated to Acidithiobacillus thiooxidans, although many studies failed to detect them in soils. Recent efforts have shown a great diversity of microorganisms able to oxidize S0, besides A. thiooxidans. Nevertheless, no information is available for Brazilian soils. The aims of this work were to determine the S0 oxidation rates of three Brazilian soils, the bacterial and archaeal communities diversity associated to S0 oxidation, as well as, to isolate sulfur oxidizing bacteria (SOB) and evaluate its potential as a biofertilizer. Soils sampled in Anhembi, SP (ANB), Brasília, DF (BRA) and Rondonópolis, MT (RDP) were enriched with 10 g of S0 kg-1 (+S0) or not (-S0) and incubated in microcosms for 0, 6, 22, 38, 54, 67, 86 and 102 days under 28 oC. Oxidation rates of S0 were low, ranging to 2,8 and 3,2 ug S cm-2 day-2 in the sand soils (RDP and BRA) and 1,3 ug S cm-2 day-2 in the clay one (BRA) after 102 days incubation. Soil SO4 2- content was increased and pH decreased as result of S0 oxidation mainly in the sand soils. Bacterial community structure and diversity were affected by S0 amendment and time of incubation, represented by changes in the DGGE profile and phylum distribution. Were obtained 811 bacterial 16S rRNA sequences, clustered in 518 Operational Taxonomic Units (OTUs). The predominant phyla in the soils were Acidobacteria, Actinobacteria, Firmicutes and Proteobacteria. Were obtained 463 archaeal 16S rRNA sequences clustered into 39 OTUs. More than 84% of the OTUs were assembled to unclassified Archaea whereas 15% were classified as Euryarchaeota. Archaea diversity was not mostly affected by S0. Fifty SOB were isolated and affiliated to Proteobacteria (68%), Actinobacteria (18%) and Firmicutes (14%) after 16S rRNA sequencing. The assigned genera were Aurantimonas, Acinetobacter, Novosphingobium, Methylobacterium, Paracoccus, Bradyrhizobium, Sphingomonas, Mycobacterium, Micrococcus and Bacillus. Alginate beads containing the SOB isolates ANB9 (Acinetobacter), RDP5 (Mycobacterium) and A. thiooxidans plus S0 were incubated in sterile sand resulting in 111%, 430% and 5350% increment in SO4 2- comparing to negative controls after 14 days incubation, respectively. The S0 oxidation rate was 4,7 (ANB9), 18 (RDP5) and 130 (A. thiooxidans) times greater than the negative control after the same time. The entrapped bacteria with S0 were incubated in ANB and BRA soils for 54 days in microcosms. A. thiooxidans was the best S0 oxidizer, showing the highest oxidation rate, increment in SO4 2- and pH decrease comparing with the other SOB isolates. A. thiooxidans beads were also able to solubilize phosphate rock. New information was generated about the bacterial diversity involved in the S0 oxidation in Brazilian soils.

Os micro-organismos desempenham importante papel na reciclagem dos elementos em ecossistemas de manguezais, uma vez que como produtores primários podem controlar reações químicas. O grupo particular das cianobactérias atua promovendo a entrada de carbono e nitrogênio por meio da sua capacidade de realizar fotossíntese oxigênica e fixação de nitrogênio atmosférico. No Brasil, as florestas de manguezais ocupam uma área de aproximadamente 25.000 km2 e no Estado de São Paulo, 240 km2 da área total está coberta por este ecossistema. O objetivo deste trabalho foi avaliar a diversidade de cianobactérias que colonizam as folhas de Avicennia schaueriana, Rhizophora mangle e Laguncularia racemosa do manguezal da Ilha do Cardoso, um ambiente pristino, bem como acessar e comparar a população de cianobactérias dos solos dos manguezais da Ilha do Cardoso e de Bertioga, este último contaminado com óleo bruto. Para este propósito, as técnicas de DGGE e biblioteca de clone do gene RNAr 16S, ARISA e TRFLP do gene nifH foram utilizadas. Os resultados da filosfera evidenciaram uma sutil influência do gênero de árvore na colonização das cianobactérias, entretanto, um forte efeito da localização destas dentro do manguezal foi observado. As folhas das árvores do meio da área de manguezal apresentaram uma maior diversidade de gêneros de cianobactérias. No geral, foram identificados 19 gêneros e várias sequências de cianobactérias não cultiváveis. Uma predominância de sequências com alta similaridade com representantes das ordens Nostocales e Oscillatoriales foi observada. Sequências com identidade com o gênero Symphyonemopsis (ordem Stigonematales) foram recuperadas em maiores quantidade. Com relação à diversidade no solo, os resultados de DGGE e ARISA demonstraram que a população de cianobactérias é distinta entre os manguezais estudados, porém os perfis eletroforéticos das amostras coletadas próximo ao mar se agruparam, sugerindo que a colonização é influenciada pelas condições de inundação. O perfil mais diferente foi obtido no ponto próximo à floresta no manguezal de Bertioga, local mais afetado pela contaminação de óleo. As bibliotecas de clones claramente indicaram diferenças das sequências do gene RNAr 16S entre os pontos amostrados. Um total de 99 UTOs foi obtido, com 61 “singletons”. Na localidade próxima ao mar os gêneros Procholorococcus e Synechococcus foram dominantes em ambos os manguezais. A maioria das sequências de RNAr 16S encontradas nos outros pontos foram relacionadas com cianobactérias não cultiváveis. A diversidade alfa sugeriu que o local com menor diversidade foi o meio do manguezal de Bertioga, e o maior foi em Bertioga próximo à floresta, os demais pontos tiveram valores similares. Os maiores índices de riqueza foram encontrados nos pontos próximos à floresta, enquanto menores valores foram observados nos pontos próximos ao mar. A maioria das sequências de RNAr 16S obtidas em Bertioga no meio do manguezal e próximo à floresta tiveram identidades menores do que 90% com as disponíveis no GenBank. Estas sequências podem representar novos táxons ou cianobactérias conhecidas, porém ainda não sequenciadas. O TRFLP do gene nifH indicou que os locais próximos ao mar e meio do manguezal na Ilha do Cardoso abrigaram populações de diazotróficos semelhantes, enquanto que em Bertioga estes pontos apresentaram diferenças nos perfis de TRFLP. As maiores diferenças estavam nos locais próximos à floresta em ambos os manguezais. / Microorganisms play important role in the recycling of elements in mangrove ecosystems, since as primary producers they can control chemical reactions. The particular cyanobacteria group act promoting the input of carbon and nitrogen through their ability to realize oxygenic photosynthesis and fixing atmospheric nitrogen. In Brazil, the mangrove forests occupy an area of approximately 25.000 km2, and in the total area of São Paulo State, 240 km2 are covered by this ecosystem. The aim of this work was to evaluate the cyanobacterial diversity that colonize Avicennia schaueriana, Rhizophora mangle and Laguncularia racemosa leaves from Cardoso Island mangrove, a pristine site, as well as to assess and compare the soil cyanobacterial population from both Cardoso Island and Bertioga mangroves, this last one contaminated with crude oil. For this purpose, the techniques of DGGE and clone library of 16S rRNA gene, ARISA, and TRFLP of nifH gene were used. The phyllosphere results evidenced a subtle difference of the genus of tree on the colonization of cyanobacteria, however a strong effect from tree’s location within the mangrove was observed. The tree leaves from the middle of mangrove area showed a greater diversity of cyanobacterial genera. In geral, 19 genera and several uncultivated cyanobacteria were identified. A predominance of sequences with high similarities to representatives of the order Nostocales and Oscillatoriales were observed. Sequences with similarities to the genus Symphyonemopsis (order Stigonematales) were recovered in higher quantity. Regarding to the soil diversity, DGGE and ARISA results showed that the cyanobacterial population is distinct among both mangroves studied, however the electrophoretic profiles from samples collected near to the sea grouped together, suggesting that colonization is influenced by flood conditions. The most different profile was obtained in the site near to the forest in Bertioga mangrove, location more affected by the oil contamination. Clone libraries clearly showed 16S rRNA sequences differences among sites sampled. A total of 99 OTUs were obtained, with 61 singletons. In the site near to the sea the Procholorococcus and Synechococcus genera were dominant in both mangroves. The majority of 16S rRNA sequences found in the other sites were related to uncultured cyanobacteria. Alpha diversity suggested that the site with lowest diversity was middle of the Bertioga mangrove, and the highest was Bertioga near to the forest, the remainder sites had similar values. The highest richness indices were found in the sites near to the forest, while lower values were observed in the sites near to the sea. The majority of the 16S rRNA sequences obtained from the middle of the mangrove and near to the forest in Bertioga showed identities lower than 90% with that available in the GenBank. These sequences may represent novel cyanobacterial taxa or known cyanobacteria not yet sequenced. The TRFLP of nifH gene indicated that the sites near to the sea and middle of the Cardoso Island mangrove harbored similar diazotrophic populations, while in Bertioga these sites presented differences in TRFLP profiles. The greatest differences were in the sites near to the forest in both mangroves.

Orientador: Lauri Amândio Schorn. / Co-orientador: Marcelo Diniz Vitorino. / A Ficha Catalográfica que consta nessa Dissertação foi confeccionada pela Biblioteca Universitária - FURB, porém ao anexar ao trabalho não foi mantido o padrão. / Dissertação (mestrado) - Universidade Regional de Blumenau, Centro de Ciências Tecnológicas, Programa de Pós-Graduação de Engenharia Florestal.

O dendezeiro (Elaeis guineensis, Jacq.) é uma planta originaria da África, pertencente à família Arecaceae e gênero Elaeis. A Indonésia e a Malásia são os maiores produtores, responsáveis por 90% da produção, enquanto o Brasil representa apenas 0,5 %. Entretanto, esses países esgotaram sua áreas de plantio e não podem mais avançar por força de comitês internacionais de sustentabilidade que não permitem o plantio em áreas nativas. E nesse contexto, que o estado do Pará surge em potencial para assumir a produção mundial, principalmente depois do zoneamento ecológico e econômico do dendê no Brasil, proibindo os plantios em áreas nativas o que permite que a atividade cresça sem provocar o desmatamento de áreas nativas. Atualmente, os principais compradores de óleo de palma do mundo são certificados pela Roundtable Sustainable Palm Oil (RSPO) que é a instituição sem fins lucrativos que normatiza os critérios e indicadores para uma produção de óleo de palma sustentáveis sobre o ponto de vista econômico, social e ambiental. Dessa forma o objetivo da tese foi compreender melhor os atuais cenários da dendeicultura na região, possíveis entraves, empecilhos e pontos de melhoria nas empresas de óleo de palma no Pará por meio de um estudo detalhado sobre foco da sustentabilidade da agroindústria de palma no seu tripé, econômico, social e ambiental. Na sustentabilidade econômica foram avaliados os principais tributos incidentes sobre a cadeia agroindustrial de palma e sua influencia sobre os custos de produção. Na questão ambiental, foi realizado uma analise sobre o ciclo de vida (ACV), identificando os principais emissores de CO2 na cadeia agroindustrial de palma desde o viveiro ate a extração de óleo na Industria.Ainda na questão ambiental, foram avaliados os recursos genéticos dos principais plantios e indicação de variedades resistentes a doenças da região. E por ultimo na sustentabilidade social foram avaliados o programa de agricultura familiar de palma na região. E por ultimo, todas essas informações foram confrontadas com os indicadores de sustentabilidade da RSPO para avaliar a realidade dos plantios frente ao principal comitê mundial de certificação de óleo de palma no mundo. Os encargos trabalhistas e com insumos são os principais fatores onerantes sobre os custos de produção, sendo a participação da agricultura familiar ainda bastante pequena, estruturada em contratos de 25 anos com as empresas na região. A utilização do diesel e de fertilizantes são os maiores responsáveis por emissão de CO2 e são utilizadas 10 variedades de dendê distribuídas em cinco pólos centrais de produção no estado do Pará. A gestão do uso da Água e destinação final dos efluentes são os maiores entraves dentro das não conformidades dos critérios da RSPO. / The oil palm (Elaeis guineensis, Jacq.), originally from Africa, belongs to the family Arecaceae and genus Elaeis. Indonesia and Malaysia are the largest producers, accounting for 90% of the world production, while Brazil accounts for only 0.5%. However, those countries have used up their planting areas and are no longer able to expand them, under the guidelines of international committees for sustainability that do not allow the planting of native areas. In this context, the state of Pará Brazil becomes a potential to take over the world production, especially after the ecological and economic zoning of oil palm in Brazil, forbidding the cropping of native areas, which allows the activity to grow without causing deforestation of native forests. Currently, the main buyers of palm oil in the world are certified by the Roundtable Sustainable Palm Oil (RSPO), a nonprofit institution that regulates the criteria and indicators for the sustainable production of palm oil under the economic, social and environmental perspectives. Thus, the aim of this research was to better understand the current scenarios of oil palm in the region, possible barriers, obstacles and areas for improvement in palm oil companies in Pará through a detailed study on the sustainability of the industry of palm oil under the economic, social and environmental aspects. In the economic aspect, we assessed taxes on the main agro-industrial chain of palm and their influence on production costs. In terms of environmental issues, an analysis was conducted on the life cycle assessment (LCA), identifying the major CO2 releasers in the agribusiness chain from the palm nursery until the extraction of oil in the industry. We also assessed the genetic resources of the main crops and indications of disease-resistant varieties of the region. Finally, we analyzed the social sustainability of the palm oil family farming program in the region. The data were analyzed in accordance to the RSPO sustainability guidelines to assess the compliance of the actual conditions to the certifications established by the main committee for palm oil plantations worldwide. Labor costs and inputs are the major considerable factors on production costs, with the participation of family farming still quite small, structured in 25-year contracts with companies in the region. The use of diesel and fertilizers account for most CO2 emissions and 10 varieties of palm oil trees are used in five production regions in the state of Pará. Water use management and disposal of effluents are the major nonconformities to the RSPO guidelines.

O Cerrado, classificado como hotspot de biodiversidade. As atividades humanas têm sido responsáveis pela degradação dos ecossistemas e pelas altas taxas de extinção de espécies. As Unidades de Conservação são consideradas um dos melhores instrumentos para manter a integridade dos ecossistemas. Porém, UCs, cuja paisagem esteja fragmentada, têm sido menos eficazes na conservação da biodiversidade. Também existem duvidas quanto à eficácia das categorias de UCs de uso sustentável para a conservação da biodiversidade. Neste contexto, as APAs têm a missão de conjugar a proteção dos recursos naturais com diversos usos antrópicos, o que em geral não tem repercutido positivamente para a conservação. Neste sentido, o estudo objetivou avaliar se a APA do Lago de Palmas está sendo efetiva na proteção dos seus ecossistemas e da biodiversidade regional, usando as aves como grupo bioindicador. Analisamos imagens de satélite da área, avaliando as alterações que ocorreram na paisagem da APA em dois períodos, 2000 e 2015, visando mapear e identificar alterações na cobertura vegetal nativa e no uso da terra, sendo obtidos 4 mapas. Desde a criação da UC, é perceptível uma expansão da agropecuária e da área urbana, levando a uma perda de 37.18% da vegetação. A área antropizada aumentou 83,03%. O campo e o cerrado strictu sensu são as fitofisionomias que ocupam a maior área, sendo também as mais impactadas pela perda de cobertura vegetal, o que correspondeu a 51,12% e 44,57% de sua área total, respectivamente. Foram registradas 296 espécies de aves na UC, sendo doze endêmicas do Cerrado e nove da Amazônia. Um total de 14 espécies encontram-se em algum grau de ameaça. Foram encontradas espécies ameaçadas em ambientes que vêm sendo suprimidos, o que demonstra a necessidade de se conservar diferentes componentes da paisagem na APA. Assim é primordial adotar um plano de manejo e zoneamento que sejam coerentes com os objetivos de criação desta UC. / The Cerrado, classified as a biodiversity hotspot. Human activities have been responsible for the degradation of ecosystems and the high rates of species extinction. Conservation units are considered as one of the best tools to maintain the integrity of ecosystems. However, UCs whose landscape is fragmented, has been less effective in biodiversity conservation. There are also doubts about the effectiveness of UCs sustainable use categories for biodiversity conservation. In this context, the APA, has the mission to combine the protection of natural resources with different anthropic use, which in General does not have reflected positively on the conservation. In this sense, the study aimed to assess whether the APA of the Lake of Palmas being effective in the protection of its ecosystems, and regional biodiversity using birds as bioindicator group. We analyzed satellite images of the area, evaluating the changes that have occurred in the landscape of the APA in two periods, 2000 and 2015, aiming to map and identify changes in native vegetation cover and land use, being obtained 4 maps. Since the creation of UC, is noticeable an expansion of farming and urban area, leading to a loss of 37.18% of the vegetation. The anthropic area increased 83.03%. The grassland and the cerrado sensu strict are the physiognomies that occupy the largest area in the APA, being also the most impacted by the loss of plant cover, which corresponded to 51.12% and 44.57% of your total area, respectively. 296 species of birds have been recorded at UC, being twelve endemic to the Cerrado and nine from Amazon. A total of 14 species are to some degree of threat. Endangered species were found in environments that have been suppressed, demonstrating the need to keep different components of the landscape in the APA. So it is essential to adopt a management plan and zoning that are coherent with the objectives of creation of this UC.

O objetivo desta pesquisa foi compreender, demonstrar e divulgar a importância dos acervos científicos biológicos de vertebrados do Brasil. Para esse fim foi traçado um panorama sobre a situação atual dessas coleções, sua participação na sociedade para inserção de valores, preservação da cultura, formação profissional, pesquisa e difusão do conhecimento. O levantamento de informações, necessárias à compreensão da realidade das coleções científicas do país, foi realizado através de questionários via e-mail às Instituições mantenedoras dos acervos. Além disso, foram realizados contatos telefônicos com curadores e responsáveis por coleções, além de busca de dados em sites próprios, ou plataformas de acesso a dados de coleções online. O levantamento amostrou 117 coleções representativas das 5 classes de vertebrados, vinculadas a 44 Instituições. Foram especificados o tamanho das coleções em número de espécimes ou lotes, espécies, gêneros, famílias, ordens, espécies ameaçadas e espécies-tipo. Sobre as maiores coleções de cada grupo foram detalhadas informações mais especificas e pertinentes ao entendimento de sua atuação. Porém, grandes lacunas ainda existem, principalmente relacionadas a divulgação dos dados dos acervos, além de problemas internos como falta de recursos financeiros, infraestrutura aquém das reais necessidades, falta de recursos humanos especializados, dentre outros. Por outro lado, acredita-se que esta situação poderia ser solucionada através de políticas atuantes e projetos de ações que incentivem melhorias nestes aspectos. Espera-se que esta pesquisa consiga evidenciar a importância dessas coleções, seu papel fundamental em diversas áreas do conhecimento e alertar sobre suas necessidades indispensáveis para oferecer contribuições mais efetivas à sociedade. / The purpose of this research was to understand, demonstrate and divulge the importance of biological scientific collections of vertebrates in Brazil, in order to provide an overview of the current situation of these collections, their participation in society for the insertion of values, preservation of culture, formation professional, research and diffusion of knowledge. In order to search for information needed to understand the reality of the country's scientific collections, questionnaires were sent via e-mail to the Institutions, in addition to telephone contact and search of data on its own websites, or platforms for accessing data from online collections. The survey showed 117 representative collections of the 5 classes of vertebrates, linked to 44 Institutions. The size of the collections was specified in number of specimens or lots, species, genera, families, orders, endangered species and type species. About the largest collections in each group were detailed information more specific and pertinent to the understanding of their performance. However, major gaps still exist, mainly related to the dissemination of data on the collections, in addition to internal problems such as lack of financial resources, infrastructure that falls short of actual needs, lack of specialized human resources, among others, but it is believed that this situation can be resolved through active policies and projects of actions that encourage improvements in these aspects. It is hoped that this research served to highlight the importance of these collections, their fundamental role in several areas of knowledge and to alert about their indispensable needs to offer more effective contributions to society.