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Verhalten von gentechnisch veränderten Mikroorganismen in Trink- und Flußwasserbiofilmen

Hangen, Frauke R. Unknown Date (has links) (PDF)
Techn. Universiẗat, Diss., 2001--Berlin.
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Exploring the Interface Between Macroorganisms and Microorganisms: Biochemical, Ecological, and Evolutionary Contexts

Essock-Burns, Tara January 2015 (has links)
<p>The focus of this dissertation is the extension of the innate immune response in wound healing and non-wound healing contexts. I am interested in interactions at the interface between macroorganisms and microorganisms from marine/aqueous environments. This dissertation explored two aspects of the interactions: 1) the presence and function of macroorganism secretions and 2) the role of secretions in managing microfouling on macroorganism surfaces. Particularly of interest are how barriers are biochemically reinforced to mitigate microfouling and the potential consequences of a breach in those barriers. The innate immune response, an evolutionary conserved system in vertebrates and invertebrates, provides an evolutionary context for developing the hypotheses. </p><p>In this dissertation the biochemical composition and uses of crustacean secretions are explored for barnacles, fiddler crabs and blue crabs. Fluids of interest were secretions released during barnacle settlement and metamorphosis and those collected from living adult barnacles, fluids on fiddler crab sensory appendages including dactyl washings and buccal secretions, and fluids from blue crab egg masses. The biochemical composition was determined using a combination of fluorescent probes and confocal microscopy, proteomics, and enzyme-specific substrates with a spectrophotometer. </p><p>I demonstrated that self-wounding is inherent to the critical period of settlement and metamorphosis, in barnacles. Wounding occurs during cuticle expansion and organization and generates proteinaceous secretions, which function as a secondary mode of attachment that facilitates the transition to a sessile juvenile. I showed extensive proteomic evidence for components of all categories of the innate immune response, especially coagulation and pathogen defense during attachment and metamorphosis. This work provides insight into wound healing mechanisms that facilitate coagulation of proteinaceous material and expands the knowledge of potential glue curing mechanisms in barnacles. </p><p>In order to test macroorganism secretions in a non-wound healing context, I examined fluids sampled from body parts that macroorganisms must keep free of microorganisms. I showed that two types of decapod crustaceans can physically manage microorganisms on most parts of their body, but certain parts are particularly sensitive or difficult to clean mechanically. I examined sensory regions on the fiddler crab, including dactyls that are important for chemoreception and the buccal cavity that is used to remove microorganisms from sand particles, and blue crab egg mass fluids that protect egg masses from fouling through embryo development. </p><p>This dissertation explores organismal interactions across scales in size, space, and time. The findings from the barnacle work inform mechanisms of attachment and glue curing, both central to understanding bioadhesion. The work on fiddler crabs and blue crabs contributes to our understanding of chemoreception of feeding and reproductive behaviors.</p><p>The work presented here highlights how biological secretions from macroorganisms serve multifaceted roles. In cases of physical breaches of barriers, or wounding, secretions coagulate to obstruct loss of hemolymph and have antimicrobial capabilities to prevent infection by microorganisms. In non-wounding cases, secretions remove microorganisms from surfaces, whether that is on the body of the macroorganism or in the immediate environment.</p> / Dissertation
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AVALIAÇÃO DE NOVOS COMPOSTOS ANTIMICROBIANOS NA INIBIÇÃO DA FORMAÇÃO DO BIOFILME DE Escherichia coli / EVALUATION OF NOVEL ANTIMICROBIAL COMPOUNDS IN THE INHIBITION OF ESCHERICHIA COLI BIOFILM FORMATION

Mizdal, Caren Rigon 06 August 2014 (has links)
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The bacterial deposition on surface and also the biofilm form occurring widely in the nature as a protection strategy developed for the bacteria against the harmful external factors. Microorganism, when was in biofilm form was able to generate several problems for the public heath justly for showed a higher resistance from the action of antibacterial agents when compared with the planktonic form. Bacteria are the microorganism more involved with the biofilm production in the presence of beneficial environmental conditions. In this way, Escherichia coli were the strain more involved with the process of adhesion in the surfaces. Few studies were developed to found new antimicrobial drugs precisely because the researches presented more interest to improve the known drugs. Thus, the present study was evaluated the antibiofilm capability of sulfamethoxazole (SMTZ) alone and when complexed with metals as mercury, copper, cadmium and silver. The compounds were tested against Escherichia coli (ATCC 25922). For evaluated the inhibition of the biofilm formation we were used microplates of polystyrene to observe the turbidity through the 570 nm in an ELISA plate reader. The results presented that the sulfamethoxazole compounds had an excellent antibiofilm activity and also that the complex SMTZ-Ag showed the best inhibitory activity against E. coli biofilm formation. Therefore, we conclude that these sulfamethoxazole complexed compounds require more researches in order to expand their antimicrobial activity. / A deposição de bactérias em uma superfície e a sucessiva formação de biofilmes são fenômenos que ocorrem naturalmente na natureza, servem como estratégia de proteção frente a fatores agressivos externos. Os micro-organismos, quando em biofilme, geram grande impacto à saúde pública, pois possuem maior resistência à ação de agentes antibacterianos e métodos de desinfecção quando comparados aos micro-organismos na forma planctônica. As bactérias são os agentes microbianos que mais comumente produzem biofilmes em condições favoráveis. Neste contexto, Escherichia coli inclui-se como uma das bactérias com maior participação nos processos de adesão. Pesquisas visando a descoberta de novos antibacterianos são escassas, uma vez que os esforços estão mais direcionados no aprimoramento da das drogas já existentes. Dessa forma, o presente trabalho se propôs avaliar a capacidade antibiofilme do sulfametoxazol complexado com os metais mercúrio, cobre, cádmio e prata. Esses foram testados frente a bactéria Escherichia coli (ATCC 25922). Para avaliar o grau de inibição da formação do biofilme foram utilizadas microplacas de poliestireno e a leitura da turvação bacteriana foi realizada em densidade óptica de 570nm em leitor de ELISA. Os resultados obtidos demonstram que os compostos de sulfametoxazol apresentaram uma excelente atividade antibiofilme, sendo que o complexo SMTZ-Ag foi o que exibiu melhor atividade contra a formação do biofilme de E. coli. Em vista disso torna-se válido investir em pesquisas no sentido de ampliar as atividades desses compostos.
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Efeito da escovação na formação in situ de biofilme dentário inicial e na rugosidade superficial em cerâmica de y-tzp após vitrificação e polimento

Pereira, Priscilla Cristoforides [UNESP] 11 May 2010 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:28:57Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2010-05-11Bitstream added on 2014-06-13T20:37:54Z : No. of bitstreams: 1 pereira_pc_me_sjc.pdf: 1955962 bytes, checksum: 199a3b76eadceaedbf2923a8f9d4c65f (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / O objetivo deste estudo foi avaliar o efeito da vitrificação e do polimento na rugosidade superficial e formação in situ de biofilme dentário inicial, após simulação da escovação, em cerâmica policristalina de zircônia parcialmente estabilizada por ítrio (Cercon® Zirconia, Dentsply Ceramco). Amostras foram divididas em: (C) controle – sem tratamento; (V) vitrificadas; (PS) polidas com pontas de silicone diamantadas. Metade das amostras foi submetida à simulação de escovação (400.000 ciclos). Análises da rugosidade superficial (Ra e Rz) foram realizadas antes e após os tratamentos superficiais e escovação. Dez voluntários selecionados com adequado padrão de higiene bucal receberam dispositivos oclusais individualizados para a fixação das amostras na face vestibular. Após 8 horas em ambiente bucal, as amostras foram removidas do dispositivo e avaliadas em MEV (n=5) e MCVL (n=10). A análise em MEV foi realizada por meio da seleção aleatória de cinco campos (20 x 25 μm) para cada amostra para análise descritiva do material celular/acelular depositado e da topografia superficial. Para análise em MCVL, foram captadas imagens em lentes ópticas com aumento de 10 x/ 0.3 para visualização de toda a amostra e aumento de 63 x/ 0.3 (imagens 3D com secções ópticas de 0,8 μm) para análise de biovolume e espessura média de biofilme. O software COMSTAT quantificou as imagens obtidas em MCVL. Os dados obtidos de rugosidade (μm) foram submetidos à Análise de Variância (dois fatores) e teste de Dunnett (5%). Biovolume e espessura de biofilme foram analisados pelo teste de Kruskal-Wallis e Mann-Whitney. O grupo V apresentou maiores valores de rugosidade superficial, espessura média e biovolume de biofilme, em presença de escovação simulada. O fator escovação não foi preponderante para o aumento da rugosidade superficial. Houve correlação significativa entre... / The aim of this study was to evaluate the effect of the glaze and polishing in the surface roughness and early dental biofilm formation, after toothbrushing simulation, in tetragonal zirconium polycrystal stabilized with yttrium ceramics (Cercon® Zirconia, Dentsply Ceramco). Ceramics samples were divided in three groups: control - not glazed (C); glazed (G); polishing with diamonds silica tip (ST). Half samples was submitted to toothbrushing simulation (400.000 cycles). Analyses of surface roughness (Ra and Rz) were carried before and after the superficial treatments and toothbrushing. Ten volunteers selected with high level of oral hygiene were selected for this study. Oral devices covering the crowns of the upper premolars and molars were fabricated for each participant and ceramic samples were fixed on the vestibular zones of the devices. After 8 hours in situ, the samples were removed from device and analyzed in SEM (n=5) and CLSM (n=10). To SEM analysis was selected means of the random election of five fields (20 x 25 μm) for each sample for descriptive analysis of the deposited cellular material/to acelular and the superficial topography. For analysis in CLSM were used for architecture visualization and lenses of 63x/0.13 for COMSTAT analysis and quantification. The resulting sets of confocal optical sections were collected by microscopy software as stacks of images 3-D images were obtained for analysis of biovolume and average thickness of biofilm. The data of surface roughness (μm) were submitted to analysis of variance (two factors) and Dunnett’s test (5%). Biovolume and mean thickness biofilm were analyzed by Kruskal-Wallis and Mann-Whitney’s test. The G Group presented greaters values of surface roughness, average thickness and biovolume of biofilm, in toothbrushing presence... (Complete abstract click electronic access below)
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Análise genômicae suscetibilidade de Pseudomonas aeruginosa isoladas de rede de água de consultórios odontológicos da cidade de Barretos-SP

Oliveira, Ana Claudia de [UNESP] 26 February 2010 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:54Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2010-02-26Bitstream added on 2014-06-13T20:24:18Z : No. of bitstreams: 1 oliveira_ac_dr_jabo.pdf: 650394 bytes, checksum: 3022a3790349efbed366f6fa0374267e (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Foram estudadas 180 amostras de água de 45 consultórios odontológicos da cidade de Barretos-SP, com o objetivo de isolar, identificar, determinar a contagem de isolados de Pseudomonas aeruginosa UFC/mL, determinar o perfil clonal e avaliar a diversidade genômica dos isolados e a suscetibilidade das mesmas frente a diferentes antibióticos. As amostras de água foram filtradas em filtro Millipore® e a membrana colocada sobre o centro de uma placa de Petri contendo agar cetrimida, As colônias típicas de bactérias do gênero Pseudomonas foram identificadas pelo método de Gram, inoculação em TSI agar (Triple Sugar Iron), crescimento a 42ºC, produção de pigmento, produção de alginato, oxidase, motilidade e alcalinização da acetamida. O teste utilizado para análise genômica foi o ERIC-PCR. Dos 76 (42,2%) isolados de Pseudomonas aeruginosa, 15 eram provenientes das amostras de torneira de lavagem das mãos, 18 de reservatório de garrafa pet, 23 de seringa tríplice e 20 do motor de alta rotação. Todos os isolados de Pseudomonas aeruginosa foram submetidos ao teste de suscetibilidade segundo a técnica de Kirby- Bauer. Dos antibióticos testados o que apresentou melhor resultado quanto à sensibilidade (65,8%) foi a ciprofloxacina. Quanto à similaridade genética dos isolados dos diferentes pontos analisados, foram encontrados nove “clusters” de 100% de similaridade. / The biofilm found in water supplies and lines of hospitals and dental units is extremely important because it presents a large number of bacteria, leading to risk of infection in immunocompromised patients vulnerable to opportunistic pathogens such as the Pseudomonas aeruginosa. One hundred eighty water samples from dental units of the city of Barretos-SP were evaluated. The water samples filtered in Millipore® filter were incubated in plates containing Cetrimide ágar. The bacteria colonies were identified through the gram-staining test, inoculation in agar T.S.I (triple sugar Iron), growth at 42 ° C, pigment production, production of alginate, oxidase acetamide alkalization and motility observation. All Pseudomonas aeruginosa bacteria were submitted to the susceptibility test according to the Kirby-Bauer technique. The test used for genomic analysis was the ERIC-PCR. From the total microorganisms studied, 76 (42,2%) were positive for Pseudomonas aeruginosa, isolates from 180 water samples, where 15 strains were from hand washing incoming local water supplies, 18 from PET bottled water, 23 from 3-in-1 syringes and 20 from the high speed handpiece. In relation to the antibiotics tested, the one presenting the best result with regard to sensibility was ciprofloxacin with 65.8%. The genetic similarity of isolates from different points analyzed, there were nine clusters of 100% similarity.
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Avaliação de biofilme de proteus mirabilis em modelo experimental de fluxo dinâmico

Camargo, Gabriela Maria Pavan de Arruda [UNESP] 21 November 2006 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:55Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2006-11-21Bitstream added on 2014-06-13T19:03:41Z : No. of bitstreams: 1 camargo_gmpa_dr_arafcf.pdf: 861757 bytes, checksum: 26d683e65ae5237b982eb2865098bad0 (MD5) / Universidade Estadual Paulista (UNESP) / O objetivo do presente trabalho foi o de verificar a formação de incrustações e o bloqueio do cateter de Foley utilizando-se um modelo laboratorial de bexiga humana. Para tanto, foram utilizadas duas urinas artificiais de diferentes composições: a) urina AS composta por dez solutos em concentrações semelhantes as encontradas na urina humana de 24 horas, acrescida de gelatina; b) urina AT composta por 4 solutos também encontrados na urina humana, mas em concentrações maiores e suplementada com ovalbumina de galinha. Também foi utilizada a urina de 24 horas de três homens. As urinas contaminadas com o P. mirabilis foram bombeadas (0,5ml/min) para o frasco em que o cateter estava inserido até a oclusão do cateter. A Microscopia Eletrônica de Varredura (MEV) foi utilizada para verificar a presença de biofilme nos segmentos dos cateteres. Foi observado uma diferença significante no peso dos segmentos dos cateteres após a canalização das urinas AS, AT e UH contaminadas com o P. mirabilis vs a canalização das urinas sem o microrganismo (p<0,05). O tempo de bloqueio dos cateteres que canalizaram a urina AS vs urina AT e UH vs urina AT também foram diferentes (p<0,05). O tempo de bloqueio dos cateteres, o número de células viáveis presentes no inóculo inicial e no momento do bloqueio do cateter, e variação no peso dos segmentos dos cateteres após a canalização com as urinas sem a adição do P. mirabilis e contaminadas com o P. mirabilis não foram diferentes para as urinas AS, AT e UH. As três urinas examinadas mostraram a estabilização do P. mirabilis e a manutenção em 108UFC/ml bem como a formação de biofilme. Os cateteres que canalizaram a urina AS e UH apresentaram tempos semelhantes de bloqueio. Os cateteres que utilizaram a urina AT foram bloqueados mais rapidamente (p<0,05). Não houve alteração de peso dos segmentos dos cateteres quando testados com o P. mirabilis entre as urinas. / The aim of the present work was to verify formation of encrustations and occlusion on Foley catheter using a laboratorial model of human bladder. Two artificial urines with different compositions were used: a) AS urine consisted by ten solutes in concentrations similar to those found in 24 hour human urine, added gelatin; b) AT urine consisted by four solutes, also found in human urine but in higher concentrations, and supplemented with chicken ovalbumin and UH 24 hour urine of three men. Urines contaminated with P. mirabilis were pumped (0,5ml/min) to flasks where the catheter was inserted reaching catheter occlusion. Scanning Electronic Microscopy (SEM) was used to check the presence of biofilms in catheter segments. The period of catheter occlusions after canalization was determined with the three urines, as well as the number of P. mirabilis viable cells present in the initial inoculum and in the end of the experiment. The period CFU/ml as well as biofilm formation. Catheters that canalized AS and HU urines showed similar occlusion periods. Catheters using AT urine were occluded faster (p<0.05). of catheter occlusions, the number of viable cells present in the initial inoculum and in the moment of catheter occlusion, as well as the variation in catheter segment weights after canalization with urines without P. mirabilis addition and with contaminated urines were not different for AS, AT and HU urines. The three examined urines showed stabilization of P. mirabilis, maintenance of 108 There was no alteration in catheter segment weights when tested with P. mirabilis among urines.
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Ocorrência de micobactérias e outros microorganismos nas águas de uma fazenda produtora de leite de búfalas, na região de São Carlos, estado de São Paulo

Jordão Junior, Cleso Mendonça [UNESP] 18 December 2008 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:55Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2008-12-18Bitstream added on 2014-06-13T19:43:46Z : No. of bitstreams: 1 jordaojunior_cm_dr_arafcf.pdf: 786872 bytes, checksum: 274f8014be73a7e236d6f75ebb8adc01 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Universidade Estadual Paulista (UNESP) / Micobacterias ambientais (MA) ou micobactérias não-tuberculosas (MNT) estão relacionadas a uma grande variedade de doenças em seres humanos. As micobactérias ambientais são saprófitas comumente encontradas em todos os ecossistemas, incluindo água, solo, alimento, poeira e aerósóis. Particularmente, essas micobactérias podem se multiplicar em diferentes fontes de águas, como por exemplo águas de superfície, recreação, residuais, subterrâneas e de torneiras. Sistemas de encanamentos fornecedores de águas são rapidamente colonizados por micobactérias e assim os biofilmes formados nos canos d´água servem como fontes desses microrganismos. Micobactérias são resistentes contra a maioria dos desinfetantes usuais e podem tolerar grandes variações de pH e temperatura, o que lhes permite a permanência nos sistemas de distribuição de água por longos períodos de tempo. O objetivo desse estudo foi isolar e identificar MNT de amostras de água e biofilmes na canalização de água de uma fazenda produtora de leite de búfalas na região de São Carlos-SP e também avaliar a qualidade da água da propriedade por meio da contagem de microrganismos heterotróficos, coliformes totais e termotolerantes e Staphylococcus aureus.Das amostras analisadas, 90,5% das amostras foram classificadas como fora dos padrões em relação a coliformes totais e 69% foram classificadas como fora dos padrões em relação a coliformes termotolerantes. Trinta e duas amostras (76,3%) de um total de 42(100%) apresentaram populações acima de 500 UFC/mL para bactérias heterotróficas. S.aureus foram isolados em 9 amostras (32,14%) de um total de 28(100%). De um total de 33 (100%)MNT isoladas nesse trabalho, 12 (36,36%) foram isoladas de biofilmes presentes nos encanamentos de água da propriedade. Esses isolados foram posteriormente identificados usando a técnica do PRA (PCR- restriction enzyme... / Environmental mycobacteria (EM) or nontuberculosis mycobacteria (NTMs) are implicated in a variety of human diseases. They are common saprophytes in all ecosystems, including water, soil, food, dust, and aerosols. In particular, EM species can multiply in numerous water sources, including wastewater, surface water, recreational water, ground water, and tap water. Piped water supplies are readily colonized by mycobacteria, and thus the biofilm in the water pipes may serve as a reservoir for these organisms. Mycobacteria are resistant against common disinfectants and can tolerate wide ranges of pH and temperature, which allows them to persist in drinking water systems for long periods of time.The aim of this study was to isolate and identify NTMs from water samples and biofilms from a dairy buffalo farm in São Carlos city, State of Sao Paulo and to evaluate the water quality of the farm using heterotrophic, faecal and total coliforms count plates. Results showed that 90.5% of the samples were considered as being out of the standards related to total coliforms and 69% of the samples were classified as being out of the standards related to faecal coliforms. From a total of 42 (100%) samples, 32 (76,3%) presented populations above of 500 CFU/mL for heterotrophic bacteria. S.aureus were isolated in 9 samples (32,14%) from a total of 28(100%).Out of 33(100%) NTMs isolated in this work, 12 (36,36) were isolated from biofilms in water pipes. These isolates were further identified using PRA (PCR- restriction enzyme analysis), as well as 16S rDNA and hsp65 DNA sequencing, and mycolic acids by thin layer chromatography (TLC). Twenty-eighty species (84,84%) were identified as M. gordonae (18 isolates from water samples and 10 from biofilms), 2 (2,06%) M. lentiflavum (biofilms), 2 (2,06%)... (Complete abstract click electronic access below)
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Avaliação de extratos de plantas medicinais em biofilmes multiespécie de Candida albicans com Streptococcus mutans, Staphylococcus aureus, Enterococcus faecalis e Pseudomonas aeruginosa / Evaluation of extracts of medicinal plants in biofilm multispecies of Candida albicans with Streptococcus mutans, Staphylococcus aureus, Enterococcus faecalis e Pseudomonas aeruginosa

Domingues, Nádia [UNESP] 07 February 2018 (has links)
Submitted by NÁDIA DOMINGUES null (nadia.domingues@fosjc.unesp.br) on 2018-03-23T14:13:36Z No. of bitstreams: 1 Tese completa.pdf: 3393326 bytes, checksum: 5504238a789ee1c43fe177b59d548064 (MD5) / Approved for entry into archive by Silvana Alvarez null (silvana@ict.unesp.br) on 2018-04-03T21:02:08Z (GMT) No. of bitstreams: 1 domingues_n_dr_sjc.pdf: 3393326 bytes, checksum: 5504238a789ee1c43fe177b59d548064 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-04-03T21:02:08Z (GMT). No. of bitstreams: 1 domingues_n_dr_sjc.pdf: 3393326 bytes, checksum: 5504238a789ee1c43fe177b59d548064 (MD5) Previous issue date: 2018-02-07 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Os micro-organismos estão cada vez mais resistentes aos medicamentos disponíveis tanto na medicina quanto na odontologia, e esta resistência é ainda maior quando estão organizados em biofilmes mono ou multiespécies, de modo que o estudo de antimicrobianos alternativos, como fitoterápicos, estão em crescente ascensão. A interação entre leveduras e bactérias está intimamente presente na cavidade bucal, em que nichos como dentes, língua, mucosa e bolsa periodontal, nutrientes e temperatura adequados promovem condições favoráveis para formação do biofilme. Com isso, o objetivo deste trabalho foi avaliar a atividade antimicrobiana dos extratos de Pfaffia paniculata K (pfaffia), Hamamelis virginiana L. (hamamelis), Stryphnodendron barbatiman (barbatimão) e Gymnema sylvestre (gimena) em biofilmes heterotípicos de Candida albicans (ATCC 18804) com Streptococcus mutans (ATCC 35688), Staphylococcus aureus (ATCC 6538), Enterococcus faecalis (ATCC 4083) e Pseudomonas aeruginosa (ATCC 15442). Para isso, suspensões padronizadas em 107 cels/mL dos micro-organismos testes, foram distribuídos em placas de microtitulação de 96 poços, juntamente 100 µL de caldo BHI. As placas foram incubadas em estufa bacteriológica a 37ºC/48h (5% de CO2 para S. mutans) e, após, os biofilmes foram submetidos ao tratamento com os extratos por 5 min e 24 h, nas respectivas concentrações de 100 mg/mL, 50 mg/mL e 25 mg/mL. Foi utilizado solução salina 0,9% (5 min) ou caldo BHI (24 h) nos grupos controles. Após, os biofilmes foram lavados e desagregados do fundo da placa e diluições seriadas foram semeadas em ágar seletivo para cada micro-organismo. Foram realizadas contagens de UFC/mL (log10) após 24 h de incubação e analisadas estatisticamente pelo método Kruskal-Wallis suplementado pelo teste de Dun’s (p<0.05). Os resultados obtidos indicaram reduções significativas promovidas pelos extratos nos dois tempos de tratamento analisados. Foi observado que o extrato de H. virginiana apresentou redução de todos os grupos analisados no tempo de tratamento de 24 h. Conclui-se que os extratos de P. paniculata, H. virginiana, S. barbatiman e G. sylvestre apresentaram ação antimicrobiana sobre biofilmes muliespécie de C. albicans com as bactérias de interesse médico-odontológico, nos tempos de tratamento de 5 min e 24 h. / Microorganisms are increasingly resistant to drugs available in both medicine and dentistry, and this resistance is even greater when they are organized into mono or multispecies biofilms, so that the study of alternative antimicrobials, such as herbal medicines, are on the rise. The interaction between yeasts and bacteria is intimately present in the oral cavity, in which niches such as teeth, tongue, mucosa and periodontal pocket, food and adequate temperature promote adequate conditions for biofilm formation. The aim of this study was to evaluate the antimicrobial activity of extracts of Pfaffia paniculata K., Hamamelis virginiana L., Gymnema sylvestre and Stryphnodendron barbatiman M. in heterotopic biofilms of Candida albicans (ATCC 18804) with Streptococcus mutans (ATCC 35688). Staphylococcus aureus (ATCC 6538), Enterococcus faecalis (ATCC 4083), and Pseudomonas aeruginosa (ATCC 15442). Standardized suspensions at 107 cells/mL of the test microorganisms were distributed in 96 well microtiter plates together with 100 μL of BHI broth, the plates were incubated in a bacteriological oven at 37°C/48h (5% CO2 for S. mutans). After the incubation time, treatments were performed at 5 min and 24 h times, applying the respective extracts at the concentrations of 100 mg, 50 mg and 25 mg/mL and applying 0.9% saline solution or BHI broth in the control groups. After the biofilms were washed and disaggregated from the bottom of the plate, performing serial dilutions for later seeding in selective agar. UFC/ml (log10) counts were performed after 24 h of incubation and statistically analyzed Kruskal-Wallis method supplemented by the Dun's test (p<0.05%). The obtained results indicated significant reductions promoted by extracts in the two treatment times analyzed. It was observed that the extract of H. virginiana showed reduction of all the analyzed groups without treatment time of 24 h. It is concluded that the extracts of P. paniculata, H. virginiana, S. barbatiman and G. sylvestre presented antimicrobial action after analysis of the heterotypic biofilms of C. albicans with the bacteria of medical and dental interest, in the treatment times of 5 min and 24 h.
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Efetividade da terapia fotodinâmica associada à soluções irrigadoras frente a dois modelos de biofilme / Effectiveness of photodynamic therapy associated with irrigants against two biofilm models

Rosa, Ricardo Abreu da January 2015 (has links)
O objetivo deste estudo foi avaliar o efeito antibacteriano e a dissolução de biofilme promovido pela terapia fotodinâmica (PDT) associada com o hipoclorito de sódio (NaOCl) 2,5% e a clorexidina (CHX) sobre biofilmes mono-espécie e multi-espécies. No modelo de biofilme mono-espécie, quarenta e seis prémolares inferiores foram contaminados com cepas de Enterococcus faecalis (ATCCC 29212) por 21 dias. Os espécimes foram divididos em três grupos de acordo com a solução irrigadora utilizada: soro fisiológico, CHX 2% e NaOCl 2,5%. Após irrigação com 5 mL de cada irrigante, a PDT foi realizada. Amostras foram coletadas previamente aos protocolos de irrigação (S1), após irrigação (S2) e após PDT (S3). No modelo de biofilme multi-espécies, sessenta blocos de dentina bovina foram infectados intraoral e divididos em seis grupos: soro fisiológico, soro fisiológico/PDT, CHX, CHX/PDT, NaOCl e NaOCl/PDT. Microscopia confocal a laser foi usada para avaliar a porcentagem e o biovolume de células vivas e o volume total de biofilme. Todos os grupos reduziram as contagens de UFCs após os procedimentos de irrigação (S1-S2); porém a CHX e o NaOCl promoveram as menores contagens de UFCs (P < 0,05). A PDT diminuiu significativamente a contagem bacteriana no grupo do soro fisiológico (S2-S3; P < 0,05). No modelo de biofilme multi-espécies, a menor quantidade de células vivas foi observada nos grupos CHX, CHX/PDT, NaOCl e NaOCl/PDT, sem diferenças entre si (P > 0,05). A PDT não reduziu o volume total de biofilme (P > 0,05); porém parece diminuir o biovolume e a quantidade de células vivas após irrigação com CHX 2% e NaOCl 2,5%. A terapia fotodinâmica associada ao soro fisiológico reduziu a carga bacteriana em canais infectados com E. faecalis. A PDT parece reduzir a quantidade e o volume de células vivas, mas não o volume total de células em biofilme multiespécies induzido in situ. Finalmente, o tipo de irrigante foi decisivo para dissolver biofilme multi-espécies. / The aim of this study was to evaluate the antibacterial effect and the biofilm dissolution promoted by photodynamic therapy (PDT) associated with 2.5% NaOCl and 2% CHX over monospecies and multispecies biofilms. In monospecies biofilm model, forty-six mandibular premolars were contaminated with Enterococcus faecalis strains (ATCC 29212) broth culture for 21 days. Specimens were divided into three groups according to the irrigant used: saline, 2% of CHX and 2.5% of NaOCl. After irrigation with 5 mL of each irrigant, PDT was performed. Samples were collected at baseline (S1), after irrigation (S2) and after PDT (S3). In multispecies biofilm model, sixty bovine dentin blocs were infected intraorally, and divided into six groups: saline, saline/PDT, CHX, CHX/PDT, NaOCl and NaOCl/PDT. Confocal laser scanning microscopy was used to assess the percentage and the biovolume of live cells and the total biovolume. All groups reduced UFC’ counts after irrigation procedures (S1-S2); however CHX and NaOCl promoted the lowest UFCs counts (P < 0.05). PDT significantly reduced the bacterial counts in saline group (S2-S3; P < 0.05). In multispecies biofilm model, the lowest amount of live cells was observed in CHX, CHX/PDT, NaOCl and NaOCl/PDT groups, with no differences among them (P > 0.05). PDT did not reduce the total biovolume (P > 0.05); however it appears to decrease the biovolume and the amount of live cells after irrigation with 2% CHX and 2.5% NaOCl. PDT associated with saline reduced the bacterial load in canal infected with E. faecalis. PDT seems to reduce the amount and the biovolume of live cells, but did not reduce the total biovolume of cells in multispecies biofilm induced in situ. Finally, the irrigant was decisive to dissolve multispecies biofilm.
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Identificação de grupos clonais, resistência aos antimicrobianos e presença de genes associados à formação de biofilmes (icaA e icaD) em Staphylococcus aureus isolados de propriedades produtoras de leite bovino

Girardini, Lilian Kolling January 2013 (has links)
Staphylococcus aureus destaca-se como principal micro-organismo associado à mastite bovina contagiosa, sendo que as infecções crônicas podem ser causadas pelo crescimento bacteriano na forma de biofilmes, o que pode estar associado à persistência desta bactéria na glândula mamária e à resistência a diversos antimicrobianos. Estudos epidemiológicos empregando técnicas como a macrorestrição seguida de eletroforese em campo pulsado (PFGE) têm sido realizados, com a finalidade de identificar clones e caracterizar as infecções por S. aureus. Os objetivos deste estudo foram: avaliar a frequência de isolamento de S. aureus em amostras de leite colhidas periodicamente em um grupo de propriedades leiteiras do Vale do Taquari, RS; avaliar o perfil de suscetibilidade aos antimicrobianos dos isolados de S. aureus identificados; classificar esses isolados em grupos clonais; avaliar a distribuição e a permanência dos grupos clonais nas propriedades leiteiras ao longo do tempo, além de verificar a presença de genes relacionados à formação de biofilmes (icaA e icaD). Foram colhidas amostras de leite de todas as vacas em lactação de 21 propriedades, amostradas semestralmente durante dois anos, totalizando 1060 amostras. A presença de S. aureus nas amostras foi detectada por isolamento e a identificação foi realizada de acordo com o National Mastitis Council. Isolados confirmados foram testados, pela técnica de disco difusão em ágar, quanto à suscetibilidade frente a treze antimicrobianos. Os isolados também foram submetidos à macrorrestrição do DNA total – PFGE e posteriormente testados pela PCR para detecção dos genes icaA e icaD. Das 1060 amostras avaliadas, 395 não apresentaram crescimento bacteriano. Staphylococcus sp. coagulase negativa foram identificados em 262 amostras, seguido de 136 amostras em que identificou-se S. aureus. A frequência de isolamento de S. aureus variou de 3,45% a 70,59% nas 17 propriedades em que este agente estava presente. No teste de suscetibilidade aos antimicrobianos, a maioria (75,7%) dos 132 isolados testados apresentaram perfil de sensibilidade, sendo a resistência mais frequente à penicilina (18,2%) e ampicilina (14,4%). Em apenas 27,3% dos isolados detectou-se os genes associados à formação de biofilmes pesquisados, sendo o gene icaD o mais prevalente, seguido da presença de ambos os genes. Os 122 isolados clivados pela enzima SmaI e submetidos à PFGE foram classificados em 38 grupos clonais. Observaram-se poucos grupos clonais persistentes, pois somente seis foram descritos consecutivamente em pelo menos duas coletas. O grupo clonal 16 foi o mais prevantente, apresentando isolados em uma mesma propriedade ao longo de dois anos. Conclui-se que Staphylococcus aureus está presente na glândula mamária de bovinos em lactação em pequenas propriedades da região. Esses isolados apresentam baixa frequência de resistência aos antimicrobianos. Há uma grande variabilidade de pulsotipos entre os isolados presentes nessas propriedades, porém poucos grupos clonais persistem nas propriedades amostradas. Não foi possível associar a permanência dos grupos clonais nos rebanhos à presença dos genes icaA e icaD ou ao perfil de resistência a antimicrobianos. / Staphylococcus aureus stands out as the main microorganism associated with bovine contagious mastitis, whereas chronic infections can be caused by bacterial growth in the form of biofilms, which can be associated with the persistence of the bacteria in the mammary gland and resistance to various antibiotics. Epidemiological studies employing techniques such as macrorestriction followed by pulsed field gel electrophoresis (PFGE) have been carried out, aiming to identify clones and characterize S. aureus infections. The objectives of this study were: to assess the frequency of S. aureus isolation in milk samples collected periodically in a group of dairy farms from Taquari Valley, RS; evaluate the profile of antimicrobial susceptibility of S. aureus identified isolates; classify these isolates in clonal groups; assess the distribution and retention of clonal groups in dairy herds over time and to verify the presence of genes related to biofilm formation (icaA and icaD). Milk samples were collected from all lactating cows from 21 properties that were sampled every six months for two years, totaling 1060 samples. The presence of S. aureus in the samples was detected by isolation and the identification was performed according to National Mastitis Council. Confirmed isolates were tested for susceptibility to thirteen antimicrobial by disk diffusion technique in agar. The isolates also underwent macro-restriction of total DNA - PFGE and were subsequently tested by PCR for detection of genes icaA and icaD. Of the 1060 samples tested, 395 showed no bacterial growth. Staphylococcus sp. coagulase-negative samples were identified at 262, followed by 136 samples in which S. aureus was identified. The frequency of isolation of S. aureus ranged from 3.45% to 70.59% in 17 properties wherein this agent was present. In antimicrobial susceptibility testing, the majority (75.7%) of the 132 isolates tested showed sensitivity profile, being most frequent resistance to penicillin (18.2%) and ampicillin (14.4%). In only 27.3% of the isolates were detected genes associated with biofilm formation surveyed and icaD was the most prevalent, followed by the presence of both genes. The 122 isolates cleaved by SmaI and submitted for PFGE were classified into 38 clonal groups. There were few persistent clonal groups, because only six groups were described consecutively in at least two collections. The clonal group 16 was the most prevalent, presenting isolates at the same property over two years. Is conclusive that Staphylococcus aureus is present in the mammary gland of lactating cattle on small farms in the region. These isolates have low frequency of antimicrobial resistance. There is great variability of pulsotypes among isolates in those properties, but few clonal groups persist in the sampled properties. It was not possible to associate the permanence of clonal groups in herds to the presence of icaA and icaD or to the profile of antimicrobial resistance.

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