Describe los eventos relacionados con la evolución molecular del VIH-1 en sujetos peruanos TS y NTS infectados de Lima y Callao. Materiales y métodos. Se realizó el análisis molecular del VIH a partir de 93 sujetos infectados, 61 fueron trabajadoras y trabajadores sexuales (TS) y 32 militares no trabajadores sexuales (NTS). Se extrajo el ADN proviral de toda la población, el cual fue sometido a PCR para la amplificación de los genes gag, env, y pol de VIH-1. Los productos fueron purificados, secuenciados y analizados. Los productos de PCR de env fueron analizados mediante ensayo de movilidad de heterodúplex (HMA) y luego clonados y secuenciados en vectores plasmídicos para la identificación de variantes genéticas virales por medio de análisis filogenético. Las secuencias fueron analizadas usando herramientas de bioinformática para la identificación de subtipos genéticos, recombinación, mutaciones en regiones conservadas, mutaciones de resistencia a los antirretrovirales (ARV), hipermutación y tropismo. Para el análisis estadístico de frecuencias, riesgo absoluto (RO) e índice de asociación se usó el programa SPSS versión 21. Se demostró que todas las muestras analizadas fueron subtipo B con evidencia de recombinación entre diferentes subtipos, siendo la forma B/D la más frecuente (28%). Se hallaron dieciocho casos de infecciones mixtas y 66% de virus con tropismo R5. Los virus restantes con tropismo X4 fueron más frecuentes en pacientes con CD4 < 200 células/mL. Asimismo, se hallaron mutaciones no conservadas en la región de MHR, principalmente en TS, incluyendo un caso de hipermutación. También se halló un índice de 24% de resistencia frente a los ARV. Dentro de ello, se encontró evidencia de resistencia primaria (17%) la cual estuvo asociada con el ejercicio del trabajo sexual (p = 0.04) y con la presencia de infecciones mixtas (p = 0.01). Se demuestra que la evolución molecular del VIH sigue trayectorias diferentes entre TS y NTS, siendo la presencia de algunos factores de riesgo como infecciones mixtas y el ejercicio del trabajo sexual determinantes en este proceso. / Tesis

Apesar do intenso interesse na regulação metabólica e evolução das vias produtoras de ATP, o porquê de a maioria dos microorganismos multicelulares metabolizarem glicose através de respiração, ao invés da fermentação, ainda permanece sem resposta. Um desses microorganismos é o fungo celulolítico Trichoderma reesei (Hypocrea jecorina. Usando análise EST e microarrays de cDNA, foi estabelecido, em T. reesei, que a expressão dos genes que codificam as enzimas do ciclo de TCA é programada de tal modo a favorecer a oxidação de piruvato pelo ciclo de TCA, ao invés de sua redução a etanol, através da fermentação. Além disso, os resultados indicam que acetaldeído pode ser convertido a acetato, e não a etanol, prevenindo a regeneração de NAD+, um produto chave requerido para o metabolismo anaeróbico. Os estudos também mostram que a maquinaria de controle regulatório por glicose, foi, provavelmente, objeto de pressão evolutiva, a qual dirigiu o fluxo metabólico à respiração, e não à fermentação. / Despite the intense interest in the metabolic regulation and evolution of the ATP-producing pathways, the long-standing question of why most multicellular microorganisms metabolize glucose by respiration rather than fermentation remains unanswered. One such microorganism is the cellulolytic fungus Trichoderma reesei (Hypocrea jecorina). Using EST analysis and cDNA microarrays, we find that in T. reesei expression of the genes encoding the enzymes of the TCA is programmed in a way that favors the oxidation of pyruvate via the TCA cycle rather than its reduction to ethanol by fermentation. Moreover, the results indicate that acetaldehyde may be channeled into acetate rather than ethanol, thus preventing the regeneration of NAD+, a pivotal product required for anaerobic metabolism. The studies also point out that the regulatory machinery controlled by glucose was most probably the target of evolutionary pressure that directed the flow of metabolites into respiratory metabolism rather than fermentation.

Propone un nuevo conjunto de 10 polimorfismos de un solo nucleótido (SNPs) utilizando un total de 249 genomas de Mycobacterium tuberculosis (MTB), que por primera vez se seleccionaron basándose en el principio de inclusión/exclusión (IE) utilizando datos de Spoligotyping y filogenia, seguido de la selección de SNPs no sinónimos presentes en clúster de grupos ortólogos (COG) más conservados de cada genotipo de MTB. La asignación del genotipo utilizando el nuevo conjunto de 10 SNPs fue validado con 34 genomas de MTB adicionales y los resultados mostraron una correlación del 100% con sus genotipos ya conocidos. Nuestro conjunto de 10 SNPs no ha sido reportado previamente y abarca los genotipos de MTB que son más prevalentes en todo el mundo. Este conjunto de SNPs proporciona una resolución superior a las técnicas actuales y podría ser utilizado en epidemiología molecular con marcadores resistentes a fármacos, determinando los factores de riesgo en la transmisión de la tuberculosis en diferentes poblaciones para desarrollar estrategias para el control de esta enfermedad. / Tesis

La presente memoria de título estudia la factibilidad de producir y vender en Chile kits de diagnóstico con tecnología PCR en tiempo real, para detectar los 40 principales patógenos humanos mediante PCR en tiempo real. Entre los que destacan el virus del sida HIV, de las hepatitis tipo B y C, meningitis viral y herpes. A partir del análisis del mercado nacional e internacional del diagnóstico molecular, se establecieron las oportunidades y amenazas, y se elaboró la cadena de valor del proceso para determinar las fortalezas y debilidades de la planta productiva. Luego de esto se analizaron dos modelos de negocio para el diagnóstico molecular: la prestación de servicios de laboratorios clínicos y el modelo de venta de kits, sin la prestación directa. Se concluye que los laboratorios clínicos presentan ventajas porque adquirirían los kits producidos para ampliar la gama de exámenes prestados por sus laboratorios sin incurrir en gastos de desarrollo, y porque éstos podrían externalizar la producción en gran escala de desarrollos propios. Se elaboró el diagrama de flujos del proceso y se buscaron las normas y reglamentaciones necesarias para la aprobación sanitaria, dada por el organismo regulador correspondiente. De esta búsqueda se estableció que el ISP es el organismo competente en estas materias, cuyas directrices en la elaboración de dispositivos médicos están dadas por la adopción de buenas prácticas de manufactura en el proceso productivo. Para una producción de 1300 kits al año (60% del mercado actual en Chile), se estableció que la inversión de capital requerida es de $593 millones, de los que $123 millones corresponden a equipos, con un precio promedio del kit (para 100 reacciones) de $336.500. El costo promedio anual de la planta es de $283 millones, con $144 millones en capital humano. Los resultados de la evaluación económica del negocio indican un valor presente neto (a la tasa del 12%), es de $1.079 millones, en un horizonte de evaluación de 10 años, con una tasa interna de retorno del 36 % y un tiempo de recuperación de la inversión de tres años. La producción de kits de diagnóstico en el marco del Plan de Negocios estudiado resulta atractiva, recomendándose fortalecer las estrategias de comercialización asociadas a los productos en el mercado favoreciendo la instalación de termocicladores en tiempo real en los laboratorios clínicos.

Se elabora una bebida formulada a base de pulpa de Physalis peruviana (12 %), Passiflora edulis (9 %) y Ananas comosus (9 %), con fibra de Avena sativa (12 %) y Linum usitatissimum (33 %), endulzada con Stevia rebaudiana (Steviamont, 1 %), la cual cumple con los parámetros fisicoquímicos, bromatológicos, microbiológicos y sensoriales para ser aptas para consumo humano. El estudio del efecto de la bebida es cuasi experimental en mujeres voluntarias entre los 21 y 39 años de edad, estudiantes de la Facultad de Farmacia y Bioquímica de la UNMSM, todas ellas presentaban sobrepeso u obesidad de acuerdo a su IMC y clasificación dictada por la OMS, que consumieron la bebida con una frecuencia de cuatro veces por semana durante el periodo de tres meses, con seguimiento mensual de mediciones antropométricas de peso, IMC y perímetro de cintura, y análisis bioquímicos de triglicéridos, colesterol total, HDL, LDL, glucosa y hemoglobina. Los resultados son analizados aplicando t-student para muestras pareadas. El nivel de significancia se considera siempre que el valor p es ≤ 0,05. Se obtienen resultados estadísticamente significativos entre la comparación inicial y final del estudio en cuanto a triglicéridos (p = 0,034) y glucosa (p = 0,002). No se observan resultados estadísticamente significativos para las mediciones antropométricas y tampoco para colesterol total, HDL, LDL y hemoglobina. Por lo tanto, la bebida elaborada posee propiedad hipolipemiante en cuanto a triglicéridos y se encontró un efecto hipoglicemiante, pero estos efectos son insuficientes para el control del sobrepeso y la obesidad. / Tesis

Realiza un estudio fitoquímico y la actividad biológica de la parte aérea de la especie vegetal peruana Ephedra americana, denominada comúnmente pinco-pinco. Se ubicó y recolectó la planta en el mes de mayo de 2001 en las zonas orginarias altoandinas del departamento del Cusco, en la provincia de Calca aproximadamente a 3500 msnrn. Utiliza una muestra en polvo, para realizar la marcha fitoquímica. Determina la presencia de alcaloides, compuestos fenólicos tipo flavonoides, taninos, glicósidos, etc. Observa que los metabolitos secundarios eran de mediana y alta polaridad mediante ensayos de solubilidad. Confirma la presencia de flavonoides mediante técnicas cromatográficas. Realiza la separación de los compuestos fenólicos por cromatografia en columna rápida. Obtiene varias fracciones que fueron purificadas mediante cromatografia a escala preparativa utilizando diversos sistemas de solventes. Elucida estructuralmente cinco flavonoides de conocida actividad antioxidante: Hesperidina, Crisina, 5, 7,3' ,4' -tetrahidroxi-6,8-di-R flavona, 5, 7,3 '-trihidroxi-6, 4 '-dimetoxi flavonol y 4' -hidroxi-5, 7 -dimetoxi flavonona. Determina en el extracto etanólico, actividad inrnunoestimulante, efecto antioxidante, acción tóxica sobre la artemia salina, acción antiulcerosa, acción sobre la motilidad intestinal, actividad antiinflamatoria, su toxicidad y actividad antimicrobiana. Al realizar el estudio biológico en ratas, se observa una respuesta efectiva frente al sistema inmune, no presenta actividad tóxica para el hombre. / Tesis

Publicación a texto completo no autorizada por el autor / Establece la calidad de la chicha de jora, expendida en tres mercados de abastos representativos de Lima Metropolitana, al determinar y cuantificar la presencia de metanol, alcohol muy parecido al etanol, pero con características toxicológicas mayores que éste, ya que provocar desde una embriaguez similar a la causada por el etanol, hasta ceguera o la muerte, según sea la cantidad ingerida. Para llevar a cabo dicha investigación, se delimitó el universo de trabajo, por conveniencia, a 15 muestras por cada mercado de abastos, siendo un total de 45 muestras, analizándolas por medio de cromatografía de gases para la determinación de metanol. La cantidad de metanol hallada en todas las bebidas varía de 0,24043ppm a 6,90452ppm, concentraciones que se encuentran por debajo del límite aceptado de 3,000 ppm, según las normas oficiales mexicanas NOM-142-SSA1-1995 y NOM-053-SSA1-1193, por lo que no se considera un riesgo para los consumidores. Sin embargo, el consumo continuo de chicha de jora representa un peligro latente para sus consumidores porque dicha bebida no es sometida a controles de calidad rigurosos, siendo necesario contar con procesos de verificación de manufactura y de la calidad. / Tesis

La sección Huicungo del género Astrocaryum es un grupo de 15 especies de palmeras neotropicales, que habita la región amazónica occidental, de las cuales se conocen 4 especies endémicas de las 12 reportadas en el Perú. Las aparentes barreras hidrográficas y geomorfológicas presentes en su distribución parecen no constituir, según concluyen estudios filogenéticos realizados, barreras para su diversificación genética. A partir de este hecho, el presente estudio evalúa la importancia del clima y condiciones edafológicas en la diversificación de la sección Huicungo del género Astrocaryum, a través de reconstrucciones filogenéticas basadas en 5 marcadores moleculares nucleares y 6 cloroplastidiales, modelamiento de distribuciones potenciales y reconstrucciones de caracteres anatómicos y morfológicos ancestrales; con especial énfasis en dos clados correspondientes con las regiones norte y sur de su distribución. Los resultados soportan la idea de que la diversificación de la sección Huicungo del género Astrocaryum se corresponde con la especialización ecológica en las dos regiones características de su distribución, una asociada a la cuenca amazónica (NAFB) y la otra asociada a las vertientes orientales de la cordillera andina (CAF), esto estaría soportado por los siguientes hallazgos: 1) en los análisis filogenéticos realizados mediante máxima verosimilitud e inferencia bayesiana se distinguen los dos clados asociados a CAF y NAFB, 2) las distribuciones conocidas, contrastadas mediante un análisis de componentes principales (ACP), y análisis de distribuciones potenciales, estimadas en MAXENT, encuentran escasa intersección y se muestran como áreas con características climáticas independientes definidas por la diferentes regímenes de precipitación, principalmente 3) características anatómicas foliares ancestrales contrastantes en ambos clados como el grosor de la pared celular externa de la hipodermis (mayor en CAF, menor en NAFB) así como el tamaño de las mismas en la cara adaxial (pequeñas en CAF, del mismo tamaño en NAFB), además de la presencia de aerénquima (presente en NAFB sin A. murumuru, ausente en CAF). / Tesis

Evalúa la relación de la concentración de los marcadores inmunometabólicos del ambiente urinario con la distribución filogenética de Escherichia coli uropatógena en adultos mayores. El estudio es analítico correlacional, en el cual se enrolaron 24 pacientes con infección del tracto urinario y 17 sin infección del tracto urinario. Primero, se cuantificó el hierro en orina por espectrofotometría, segundo, el TNF – α, tercero, la IL - 1β por enzimoinmunoensayo, cuarto, la capacidad antioxidante en la orina por las metodologías de ABTS+* y FRAP y quinto, la determinación de la filogenia de E.coli por el método de Clermont. La concentración de hierro en la orina de los pacientes con ITU por E.coli - B2 positivo fue de 193,48 ug/L y en pacientes con infección por E.coli - B2 negativos de 160,12 ug/L (p = 0.316). La concentración de TNF – α en la orina de los pacientes con ITU por E.coli - B2 positivo fue de 84,26 ug/L y en pacientes con infección por E.coli - B2 negativos de 58,12 ug/L (p = 0.168). La concentración de IL - 1β en pacientes con ITU por E.coli - B2 positivo fue de 386,96 pg/mL y de pacientes con infección por E.coli - B2 negativos 294,79 pg/mL (p = 0.245). Finalmente, la capacidad antioxidante de la orina ensayada con la técnica ABTS.+ tuvo una tendencia positiva en los pacientes con ITU por E.coli - B2 positivo (p = 0.121) en comparación con la orina de los pacientes con ITU por E.coli –B2 negativos (1636,07 vs 885,94 ug/mL). Se evidencia una tendencia diferenciada en la respuesta inmunometabólica frente a los grupos clonales de Escherichia coli uropatógena estudiados. / Tesis

Publicación a texto completo no autorizada por el autor / El documento digital no refiere asesor / Determina los resultados maternos y perinatales de la aplicación de la analgesia de parto en gestantes atendidas en el servicio de ginecología y obstetricia del Hospital Docente Madre Niño San Bartolomé en el periodo entre septiembre a diciembre del 2013. Realiza un estudio observacional, descriptivo, de casos y controles. Se revisaron 400 datos de pacientes gestantes (grupo I=controles; grupo II=casos), en el periodo que correspondió al estudio. La media de la edad en el grupo de los casos fue de 24.23+/-3.54 años; el peso fue de 72.25+/-3.73 Kgs y la edad gestacional fue de 38.7+/-1.21 semanas. A los 30 minutos el nivel de dolor descendió significativamente (p < 0,01) en el grupo de los casos manteniéndose este descenso hasta el final de la dilatación. La dilatación completa para el grupo control fue de 233 28.70 minutos y de 200.87 29.47 minutos para el grupo de los casos con una diferencia menor estadísticamente significativa. La duración del expulsivo para el grupo control fue de 23.30 + 5.31 comparado al grupo de los casos cuyo tiempo promedio fue de 27.50 + 3.65 con una diferencia mayor estadísticamente significativa para este último grupo. Concluye que la analgesia de parto con bupivacaína – fentanil es un método eficaz para el alivio del dolor de parto cuando se instala en un trabajo de parto bien establecido (dilatación 4 cm.) acortando la duración del mismo de manera significativa no interfiriendo con el reflejo de pujar y aunque la duración del expulsivo fue significativamente mayor, ello no tuvo implicancia con la obtención de productos en buenas condiciones ni aumento de manera significativa los partos instrumentados y las cesáreas. / Trabajo académico