Made available in DSpace on 2014-06-11T19:30:54Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2011-12-07Bitstream added on 2014-06-13T18:41:05Z : No. of bitstreams: 1 case_ah_me_sjrp_parcial.pdf: 44609 bytes, checksum: 09be4223ad11a3e6f426b148ab755c62 (MD5) Bitstreams deleted on 2014-12-19T18:32:44Z: case_ah_me_sjrp_parcial.pdf,Bitstream added on 2014-12-19T18:33:33Z : No. of bitstreams: 1 000687522.pdf: 1100203 bytes, checksum: 7839dc9ee235fad5827d8e1c7d7f7002 (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / A quitosana tem emergido na última década como um bom candidato para a entrega genética devido suas propriedades, como baixa toxicidade, biodegradabilidade e versatilidade, como vetor em administração intravenosa e oral. Além disso, possui a capacidade de condensar de forma eficiente com o DNA formando poliplexos resistentes, o que é importante para evitar a degradação por desoxirribonucleases ( DNAses). As nanopartículas resultantes têm recebido grande atenção por suas potenciais aplicações em terapia gênica não viral. Neste trabalho foi realizada a síntese, caracterização e estudo físico químico das nanopartículas formadas pela interação de derivados hidrofílicos de quitosana com DNA. As interações entre derivados de quitosana contendo os grupos fosforilcolina e os grupos poli(etileno glicol) com DNA foram investigadas com base nos efeitos da razão de cargas, pH e conteúdo dos grupos substituintes (PC e PEG) sobre o tamanho e estabilidade dos complexos. Nos estudos foram utilizadas as técnicas de fluorescência com o ensaio do brometo de etídio (EtBr), eletroforese em gel de agarose, espalhamento de luz dinâmico e microscopia de fluorescência. O tamanho e estabilidade coloidal das nanopartículas preparadas com quitosana desacetilada (CHD), quitosana-fosforilcolina (CH-PC) e quitosana-PEG (CH-PEG) mostraram-se fortemente dependentes do conteúdo dos grupos hidrofílicos, bem como, da razão de cargas e pH. A força de interação foi avaliada por meio de ensaio com EtBr. Para razões de carga (N/P) maiores que 5,0, nenhuma liberação do DNA foi observada das nanopartículas por eletroforese em gel. As nanopartículas formadas pela interação dos derivados com DNA (CH-PC-DNA e CH-PEG-DNA) em baixos valores de pH exibiram uma maior resistência à agregação quando... / Chitosan has been recognised in the past decade as a good candidate for gene delivery due to its properties as low toxicity, biodegradability and versatility as a carrier for intravenous and oral administration. Also, the ability to condense efficiently with DNA forming tight polyplexes is important to avoid the degradation by DNAses. The resulting nanoparticles have received great attention for their potential applications in nonviral gene therapy. In this work it was carried out the synthesis, characterization and physicochemical studies of nanoparticles formed by the interaction of hydrophilic derivatives of chitosan with DNA. The interactions between chitosan derivatives containing phosphorylcholine (CH-PC) and poly(ethylene glycol) (CH-PEG) moieties and calf thymus DNA (DNA) were investigated focusing on the effects of the charge ratio, the pH and phosphorylcholine content on the size and stability of the complexes using the ethidium bromide fluorescence assay, gel electrophoresis, dynamic light scattering and fluorescence microscopy. The size and colloidal stability of deacetylated chitosan (CH-DNA), CH-PC-DNA and CH-PEG-DNA complexes were strongly dependent upon phosphorylcholine (PC) and poly(ethylene glycol) contents, charge ratios and pH. The interaction strengths were evaluated by ethidium bromide fluorescence and, at N/P ratios higher than 5.0, no DNA release was observed in any synthesized CH-PC-DNA and CH-PEG-DNA polyplexes by gel electrophoresis. The CH-PC-DNA and CH-PEG-DNA polyplexes exhibited a higher resistance to aggregation compared to deacetylated chitosan (CHD) at neutral pH. At low pH values highly charged chitosan and its phosphorylcholine and PEG derivatives had strong binding affinity with DNA, whereas at higher pH values chitosan (CHD) formed... (Complete abstract click electronic access below)

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:30:57Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2011-11-28Bitstream added on 2014-06-13T19:40:34Z : No. of bitstreams: 1 ferraz_jaml_dr_arafcf.pdf: 1985252 bytes, checksum: 0ba79a8945f377afa95366862b572c08 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Universidade Estadual Paulista (UNESP) / Os marcadores polimórficos short tandem repeats do cromossomo X (X.STR) são de utilização recente na prática forense, sendo aplicados, principalmente, com a finalidade de complementar os dados obtidos com marcadores genéticos autossômicos. Tendo em vista a necessidade de ampliação dos dados da população brasileira em relação aos X.STRs, este projeto teve o objetivo de determinar as frequências alélicas e os parâmetros estatísticos de interesse forense para 10 X.STRs na população de São Paulo.SP, Rio de Janeiro.RJ, Belo Horizonte.BH e Vitória.ES (Sudeste do Brasil). Posteriormente, os X.STRs foram genotipados em casos deficientes de relação biológica e, com o objetivo de compilar os dados genéticos populacionais brasileiros publicados para X.STRs, este projeto desenvolveu o Banco Genético Brasileiro do Cromossomo X (BGBX). Para isso, foram analisados 1001 indivíduos não relacionados e residentes nas cidades descritas acima e 3 casos deficientes de relação biológica. Os marcadores X.STRs foram amplificados em sistema decaplex e submetidos à eletroforese em analisador genético ABI377 e ABI3500. Os programas GeneScan e GeneMapper ID.X foram utilizados para a determinação alélica e, a planilha Excel e o programa Arlequin, para a determinação das frequências alélicas, parâmetros estatísticos e análise de distância genética entre diferentes populações. Em relação aos X.STRs analisados, os marcadores DXS6809 e GATA172D05 foram os mais discriminativos, enquanto os marcadores DXS8378, DXS7133 e DXS7423 apresentaram os menores poder de discriminação. Diferenças significativas de frequências alélicas foram obtidas dentre as populações brasileiras e entre estas e demais populações estrangeiras, sendo que uma maior distância genética foi obtida em relação à população africana de Uganda... / The short tandem repeat polymorphic markers of X chromosome (X.STR) are of recent use in forensic practice, been applied mainly in order to complement the data obtained with autosomal genetic markers. Given the needs of expansion of the Brazilian population data in relation to X.STRs, this project aimed to determine the allele frequencies and the statistical parameters of forensic interest to 10 X.STRs in the population from São Paulo.SP, Rio de Janeiro.RJ, Belo Horizonte.BH e Vitória.ES (Southeast of Brazil). Subsequently, the X.STRs were genotyped in deficient kinship cases and, with the aim of compiling the Brazilian genetic population data published for X.STRs, this project developed the Brazilian Genetic Database of Chromosome X (BGBX). For this, we have analyzed 1001 unrelated individuals, residents in the cities previously described, and three deficient kinship cases. The X.STR markers were amplified in decaplex system and submitted to electrophoresis on ABI377 and ABI3500 genetic analyzers. GeneScan and GeneMapper ID.X softwares were used to determine the allele and, Excel spreadsheet and Arlequin software, for the determination of allele frequencies, statistical parameters and genetic distance analysis between different populations. Regarding the X.STRs analyzed, markers DXS6809 and GATA172D05 were the most discriminative, while the markers DXS8378, DXS7133 and DXS7423 showed the lowest discrimination power. Significant differences in allele frequencies were obtained within Brazilian populations and between these and other foreign populations, and a greater genetic distance was... (Complete abstract click electronic access below)

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:30:57Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2008-04-30Bitstream added on 2014-06-13T20:01:12Z : No. of bitstreams: 1 silva_cmb_me_botib_parcial.pdf: 2632453 bytes, checksum: 7b0a38f53d60e194e94be34ed5ece426 (MD5) Bitstreams deleted on 2015-07-02T12:35:55Z: silva_cmb_me_botib_parcial.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2015-07-02T12:37:24Z : No. of bitstreams: 1 000559463_20200701.pdf: 2631668 bytes, checksum: 5a6ac96387f5b2c6b52fdabe471406a1 (MD5) / Universidade Estadual Paulista (UNESP) / A família Characidae apresenta doze subfamílias e um conjunto de 88 gêneros não assinalados a nenhuma subfamília e, portanto, considerados incertae sedis na família. Neste grupo são inúmeros os problemas taxonômicos/filogenéticos. A maior parte destes gêneros até recentemente encontrava-se alocada na subfamília Tetragonopterinae, mas dada à falta de evidências de que Tetragonopterinae constitui um grupamento monofilético, hoje, mantém-se na subfamília apenas o gênero Tetragonopterus. O conhecimento das relações de parentesco entre os Characidae e conseqüentemente entre os antigos Tetragonopterinae tem por base principalmente características osteológicas e de partes moles. Sabe-se que as características reprodutivas podem conter sinais filogenéticos. Aqui, estudou-se a estrutura testicular, a espermatogênese, a espermiogênese e a ultraestrutura dos espermatozóides de Astyanax jordani, Astyanax bockmanni, Astyanax fasciatus, Deuterodon singularis, Hyphessobrycon anisitsi, Hyphessobrycon bifasciatus, Hyphessobrycon columbianus, Hyphessobrycon herbertaxelrodi, Hyphessobrycon sp., Inpaichthys kerri, Oligosarcus paranensis, Pristella maxillaris, Bryconella pallidifrons, Paracheirodon axelrodi, Gymnocorymbus ternetzi, Gymnocorymbus sp.n., Moenkhausia oligolepis, Moenkhausia bonita, Moenkhausia dichroura, Markiana nigripinnis, Boehlkea fredcochui, Bryconamericus exodon, Creagrutus sp. e Piabina Anhembi. A partir deste estudo gerou-se uma lista de caracteres a fim de padronizar as descrições numa análise sistematizada. A ultraestrutura dos espermatozóides das espécies analisadas é muito diversificada e reflete a complexidade do grupo conforme já apontado por diferentes autores. O espermatozóide de Tetragonopterus argenteus, com exceção de Gymnocorymbus ternetzi... / The family Characidae comprehends twelve subfamilies and a set of 88 genera not included in any subfamily and, thus, considered as incertae sedis in the family. Within this group are many taxonomic/phylogenetic problems. Most of these genera, until recently, belonged to the subfamily Tetragonopterinae, but given the lack of evidences supporting its monophyly, only Tetragonopterus, its type genus, is currently assigned to this subfamily. The knowledge of the phylogenetic relationships between Characidae and former Tetragonopterinae genera are based mainly on osteological features and soft parts. It is known that the reproductive traits may contain phylogenetic information. This study describes the structure, spermatogenesis, the espermiogênese and ultraestrutura the sperm of Astyanax jordani, Astyanax bockmanni, Astyanax fasciatus, Deuterodon singularis, Hyphessobrycon anisitsi, Hyphessobrycon bifasciatus, Hyphessobrycon columbianus, Hyphessobrycon herbertaxelrodi, Hyphessobrycon sp., Inpaichthys kerri, Oligosarcus paranensis, Pristella maxillaris, Bryconella pallidifrons, Paracheirodon axelrodi, Gymnocorymbus ternetzi, Gymnocorymbus sp.n., Moenkhausia oligolepis, Moenkhausia bonita, Moenkhausia dichroura, Markiana nigripinnis, Boehlkea fredcochui, Bryconamericus exodon, Creagrutus sp. and Piabina anhembi. With the raised data, a list of characters was provided in order to standardize the descriptions in a systematic analysis. The sperm ultrastructure of the examined species is very diverse and reflects the complexity of the group, as already pointed out by different authors. The sperm of Tetragonopterus argenteus resembles, in general, to the sperm of all other examined taxa, except for Gymnocorymbus ternetzi, Gymnocorymbus sp.n. and Bryconamericus exodon, Markiana nigripinnis, Boehlkea... (Complete abstract click electronic access below)

Orientador: Antonia Cecilia Zacagnini Amaral / Banca: Ana Maria Gouveia Monteiro / Banca: Érica Verônica Pardo / Banca: Tânia Márcia Costa / Banca: Fosca Pedini Leite / Resumo: O presente trabalho aborda a taxonomia, distribuição batimétrica e biologia reprodutiva da classe Ophiuroidea. O material utilizado é procedente dos programas "Biodiversidade Bêntica Marinha no Estado de São Paulo"- BIOTA/FAPESP-Bentos Marinho, "Avaliação do Potencial Sustentável dos Recursos Vivos da Zona Econômica Exclusiva"- REVIZEE/Score Sul-Bentos e "Utilização Racional dos Ecossistemas Costeiros da Região Tropical Brasileira: Estado de São Paulo"- INTEGRADO/Subprojeto Bentos. A área de coleta abrange os Estados do Rio de Janeiro, São Paulo, Paraná, Santa Catarina e Rio Grande do Sul. Os ofiuróides foram amostrados na região entremarés de praias arenosas, costões rochosos e fauna associada a algas, na plataforma e talude continental, até cerca de 800 m de profundidade, com maior riqueza de espécies na região da plataforma continental. Ao todo foram analisados 28.942 ofiuróides pertencentes a 39 espécies e 8 famílias. Amphiuridae foi a família mais representativa, principalmente na região da plataforma interna, seguida por Ophiuridae, que ocorreu principalmente em áreas de maior profundidade. Quatro espécies representam novos registros para o Brasil, Amphiodia trychna, Ophiochiton ternispinus, Ophiura (Ophiuroglypha) clemens e Ophiomusium eburneum. Ophiomusium acuferum, Ophiactis lymani e Ophiactis savignyi foram redescritas e discutidas esclarecendo equívocos de identificação. O estudo da distribuição batimétrica das espécies mostrou que os padrões observados são semelhantes aos descritos na literatura e estas foram agrupadas de acordo com os ambientes e faixas batimétricas em que ocorrem. A análise histológica das gônadas de Ophioderma januarii permitiu definir o padrão reprodutivo da espécie, a qual é gonocorística, reproduz-se durante todo ano, apresenta um aumento na atividade gonadal nos meses mais quentes e tipo de desenvolvimento lecitotrófico / Abstract: The present work approached the taxonomy, bathymetric distribution and reproductive biology of the Class Ophiuroidea. All material used came from three projects: "Biodiversidade Bêntica Marinha no Estado de São Paulo"- BIOTA/FAPESP-Bentos Marinho, "Avaliação do Potencial Sustentável dos Recursos Vivos da Zona Econômica Exclusiva"- REVIZEE/Score Sul-Bentos and "Utilização Racional dos Ecossistemas Costeiros da Região Tropical Brasileira: Estado de São Paulo"- INTEGRADO/Subprojeto Bentos. Study area enclosed the Brazilian States of Rio de Janeiro, São Paulo, Paraná, Santa Catarina and Rio Grande do Sul. Ophiuroids were sampled from sandy beaches, sea shores and seaweed as associated fauna, continental shelf and continental slope (until ca. 800 m depth). It was analyzed 28.942 ophiuroids from 39 species and 8 families, and the highest species richness occurred on the continental shelf. Amphiuridae was the most representative family, mainly on the internal continental shelf, followed by Ophiuridae, which mainly occurred in greater depth areas. Four species are new registers to Brazil, Amphiodia trychna, Ophiochiton ternispinus, Ophiura (Ophiuroglypha) clemens and Ophiomusium eburneum. Ophiomusium acuferum, Ophiactis lymani and Ophiactis savignyi were redescribed and discussed, clarifying identification mistakes. The study of the bathymetric distribution of the species showed that the observed patterns were very similar to that described in other studies, and species were grouped according to the environment and bathymetric zones in which they occurred. The reproductive pattern of the gonochoric Ophioderma januarii was described by gonadal histological analysis; this species, that has a lecitotrophic development, reproduced continuously, with a gonadal activity increase during warmer months / Doutor

O alelo mutante termo-condicionalmente letal pso4-1 do gene PRP19, que codifica uma proteína associada ao spliceossoma, permitiu investigar a influência deste gene no processamento de pré-mRNA, reparação do DNA e esporulação. Fenótipos relacionados a genes portadores de introns foram correlacionados à temperatura. Sistemas repórteres para processamento de pré-mRNA e RT-PCR mostraram que eficiência de processamento de mRNA no mutante pso4-1 é inversamente correlacionada com a temperatura de crescimento. Uma mutação pontual, substituindo uma leucina por uma serina foi identificada dentro da região codificadora N-terminal do alelo Pso4-1 e afeta as propriedades bioquímicas de Pso4-1p. Entre 24 clones isolados utilizando o sistema doishíbridos, 7 foram identificados como partes dos genes RAD2, RLF2 e DBR1. RAD2 codifica uma endonuclease indispensável para a via reparação por excisão de nucleotídeos (NER), RLF2 codifica a subunidade maior do fator de montagem da cromatina I, cuja deleção resulta em sinsibilidade à radiação UVC, enquanto que DBR1 codifica uma enzima que atua sobre substratos de RNA na forma lariat, degradando estruturas lariat em introns durante o processamento de mRNA. A caracterização dos fenótipos após tratamentos com mutágenos em linhagens mutantes simples e duplos de rad2∆, rlf2∆ e pso4-1 mostraram sensibilidade aumentada para para mutantes rad2∆/pso4-1 e rlf2∆/pso4-1, sugerindo uma interferência funcional destas proteínas no processo dereparação do DNA em Saccharomyces cerevisiae. O mecanismo exato de reparação de pontes inter-cadeia (ICL) em S. cerevisiae não é ainda totalmente conhecido. Identificando novos fenótipos e isolando proteínas potencialmente capazes de interagir com Pso2p através da técnica do sistema dois-híbridos, foi possível extender a caracterização deste gene específica para reparação de pontes intercadeia. Tratamentos com acetaldeído (ACA), um metabólito natural da via glicolítica, foi mais tóxico a linhagem mutante pso2 em comparação com a linhagem selvagem e também capaz de induzir a expressão da fusão contendo o promotor de PSO2 à lacZ (PSO2-lacZ) por um fator comparável à tratamentos com outros agentes indutores de ICLs, indicando que o metabólito natural ACA pode causar danos do tipo ICL em S. cerevisiae. A utilização do sistema dois-híbridos permitiu isolar partes de proteínas codificadas por nove diferentes genes, entre eles a proteína quinase Pak1p, um supressor de mutações termosensíveis da DNA Polimerase alfa. Pak1p interage com a extremidade C-terminal conservada de Pso2p, uma região da proteína recentemente nomeada β-CASP entre v ortólogos conhecidos do gene PSO2. A integridade do domínio β-CASP é essencial para a reparaçãode DNA proficiente como demonstrado em ensaios de complementação com mutantes pso2 ∆. Comparação da sobrevivência após tratamento com agentes mutagênicos de simples mutantes pso2 ∆ e pak1 ∆ assim com o dulpo mutante pso2 ∆/pak1 ∆ revelaram que o gene PAK1 é necessário para reparação do DNA proficiente como na linhagem selvagem. A interação epistática dos dois alelos mutantes na linhagem duplo mutante sugere que Pak1p atua na mesma via de reparação a qual PSO2 pertence e que PAK1 constitui um novo locus envolvido na reparação do DNA em S. cerevisiae.

Submitted by Jorge Cativo (jcativo@gmail.com) on 2018-05-08T17:05:23Z No. of bitstreams: 2 Módulo VI - Atividade proposta.pdf: 616796 bytes, checksum: d25776bfa6980b2e006d3068e6f54065 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2018-05-08T17:05:23Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Módulo VI - Atividade proposta.pdf: 616796 bytes, checksum: d25776bfa6980b2e006d3068e6f54065 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2018-05-08 / Testetestetestestestestetestetestestesteste. Testetestetestestestestetestetestestesteste. Testetestetestestestestetestetestestesteste. Testetestetestestestestetestetestestesteste. / Testetestetestestestestetestetestestesteste. Testetestetestestestestetestetestestesteste. Testetestetestestestestetestetestestesteste. Testetestetestestestestetestetestestesteste.

Submitted by Jorge Cativo (jcativo@gmail.com) on 2018-05-23T15:52:25Z No. of bitstreams: 2 Repositórios institucionais - diretrizes para políticas de informaçãoHelena.pdf: 184583 bytes, checksum: 17f01e30422231b5549ac098444edb7c (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2018-05-23T15:52:25Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Repositórios institucionais - diretrizes para políticas de informaçãoHelena.pdf: 184583 bytes, checksum: 17f01e30422231b5549ac098444edb7c (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2018-02-08 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - FAPESP / Test without summary / Teste sem resumo

Orientador: Edson Schroeder. / Com: Produto Educacional: Ilhas interdisciplinares de racionalidade: contribuições para a aplicação da metodologia e o desenvolvimento da alfabetização científica. / Dissertação (mestrado) - Universidade Regional de Blumenau, Centro de Ciências Exatas e Naturais, Programa de Pós-Graduação em Ensino de Ciências Naturais e Matemática.

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