Dissertação (mestrado)-Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Instituto de Física, Instituto de Química, 2010. / Submitted by Jadiana Paiva Dantas (jadi@bce.unb.br) on 2011-07-07T00:36:02Z No. of bitstreams: 1 2010_CleoniceMiguezDiasdaSilvaBraga.pdf: 3341996 bytes, checksum: 073d8dce573790b04ac8171da42994e5 (MD5) / Approved for entry into archive by Elna Araújo(elna@bce.unb.br) on 2011-07-14T22:18:10Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2010_CleoniceMiguezDiasdaSilvaBraga.pdf: 3341996 bytes, checksum: 073d8dce573790b04ac8171da42994e5 (MD5) / Made available in DSpace on 2011-07-14T22:18:10Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2010_CleoniceMiguezDiasdaSilvaBraga.pdf: 3341996 bytes, checksum: 073d8dce573790b04ac8171da42994e5 (MD5) / A preocupação com as dificuldades no ensino e na aprendizagem da divisão celular encontrase refletida na literatura da área, com maior freqüência, em trabalhos sobre o ensino e a aprendizagem dos conteúdos da genética. Considerando o caráter abstrato de muitos conceitos envolvidos na compreensão desses conteúdos como o motivo de tais dificuldades, muitos desses trabalhos sugerem a aplicação de metodologias e práticas didáticas especialmente pensadas para o seu ensino. Nesta perspectiva, com a intenção de somar contribuições nessa área, este trabalho teve como objetivo investigar o potencial dos modelos e da modelagem como metodologia para o ensino dos processos da divisão celular. Tal investigação se deu com a aplicação de uma sequência didática fundamentada na teoria da aprendizagem significativa e teve como objeto de modelagem os cromossomos. A sequência didática, composta por quatro unidades, foi desenvolvida durante um período de três semanas, com duas aulas de 50 minutos cada, com dezessete alunos (n=17) de uma turma de 1ª série do ensino médio noturno em uma escola pública localizada a aproximadamente 20Km de Brasília. O grupo de participantes, bastante heterogêneo, era composto por alunos de baixa renda com diversas idades e diferentes histórias de vida escolar. As análises dos dados obtidos a partir das filmagens das aulas feitas pela pesquisadora, das aplicações de um pré e de um pós-teste e da realização de entrevistas semi-estruturadas com alunos do grupo de foco mostraram uma melhora na compreensão dos conteúdos propostos. Sob o ponto de vista da aprendizagem significativa, considerando em particular as condições para a sua ocorrência, o uso desta metodologia permitiu um maior engajamento dos alunos em atividades que propiciaram a reflexão crítica sobre o objeto em estudo, aumentando o potencial significativo dos conteúdos tratados. _________________________________________________________________________________ ABSTRACT / This study was an application of meaningful learning theory to the teaching and learning of cell division. There is a large body of empirical research on the difficulties students face in learning the contents of cell division due to the abstract nature of many of its concepts. Many studies also suggest the need of an innovative approach specially designed to the teaching and learning of cell division. From this perspective, and aiming at adding new contributions to this area, this study investigated the potential of models and modeling as a methodology for teaching the processes of cell division. A teaching unit focused on modeling chromosomes was first developed and then implemented for a period of 3 weeks, with two classes of 50 minutes a week, with sophomores at a public school approximately 20Km from Brasília. Seventeenth students (n=17) participated in the study. Participants came from an economically disadvantaged neighborhood, were mixed aged and had compensatory educational experiences. Data were collected through the videotape of all classes, semistudent interviews with a focus group, and a pre- and post-test. Some key findings were that the use of modeling helped the majority of the students to understand the processes of cell division on a meaningful way as well as enabled them to critically reflect on the subject under study.

O tratamento com antimicrobianos é a principal estratégia de controle da tuberculose (TB). Entretanto, o aumento do número de casos de TB com cepas de Mycobacterium tuberculosis resistente aos antimicrobianos cria um cenário que dificulta a cura do paciente e o controle da doença. Embora várias mutações em loci específicos tenham sido identificadas como base de resistência, outros mecanismos, como o sistema de efluxo, podem contribuir para a resistência e o estabelecimento dessas mutações. O objetivo deste estudo foi avaliar a contribuição do mecanismo de efluxo em isolados clínicos de M. tuberculosis resistentes aos principais antimicrobianos do esquema básico (isoniazida, INH; e rifampicina, RIF) e de multirresistência (ofloxacina, OFX; e amicacina, AMK). Três clássicos inibidores de bombas de efluxo - EPI - (verapamil, VP; tioridazina, TZ; e clorpromazina, CPZ) foram selecionados para detectar o efluxo. Primeiramente, foram analisadas três cepas MDR, duas pré-XDR e a cepa sensível de referência H37Rv. Foi utilizada a metodologia de checkerboard combinada com o tetrazolium microplate-based assay para analisar a interação entre os EPIs com os fármacos. Foi observado que os EPIs diminuem efetivamente a resistência aos antibióticos utilizados, com reduções de 4 a 64 vezes. Para avaliar a atividade do efluxo em tempo real foi utilizado o método fluorimétrico com o brometo de etídio (BrEt), em presença dos EPIs. Foi demonstrado que todas as cepas apresentaram efluxo intrínseco, porém a acumulação e o efluxo do BrEt foi mais evidente na cepa pre-XDR com resistência adicional a AMK. A quantificação transcricional do RNAm dos genes de bombas de efluxo (mmpl7, mmr, Rv1258, p55, efpA, Rv2459) e do regulador transcricional whib7, quando as cepas foram expostas às concentrações subinibitórias dos antibióticos, foi analisada por RT-qPCR. Houve um aumento do nível transcricional de todos os genes em uma cepa MDR e na cepa Pre-XDR com resistência adicional a OFX, quando expostas a pelo menos um dos fármacos envolvidos na resistência. / Treatment with antimicrobials is the main TB control strategy. However, the increase in the number of TB cases with Mycobacterium tuberculosis strains resistant to antimicrobial creates a scenario that hinders patient's healing and disease control. Although several genetic mutations in specific loci involved in drug resistance have been identified as base of resistance, other mechanisms such as efflux system may contribute to resistance and to the establishment of these mutations. The main goal of this study was to assess the overall contribution of efflux mechanism in M. tuberculosis clinical isolates resistant to the main first line drugs (isoniazid, INH; and rifampicin, RIF) and second line (ofloxacin, OFX; and amikacin, AMK). Three classical inhibitors of efflux pumps -EPI- (verapamil, VP; thioridazine, TZ; and chlorpromazine, CPZ) were selected to detect the efflux. Firstly, we analyzed three MDR strains, two Pre-XDR and an H37Rv reference susceptible strain. We used the checkerboard method combined with the tetrazolium microplate-based assay to analyze the interaction between EPIs and drugs. It was observed that EPIs effectively reduce the MIC of antibiotics, with four-fold to 64-fold reduction. Efflux activity was evaluated in real-time by fluorimetric method with ethidium bromide (EtBr), in the presence of EPIs. All strains showed intrinsic efflux, however the accumulation and efflux of EtBr was evident most in the pre-XDR strain with additional resistance to AMK. The quantification of mRNA transcriptional level of efflux pump genes (mmpl7, mmr, Rv1258, p55, efpA, Rv2459) and the transcriptional regulator, whib7, when strains were exposed to antibiotics subinibitory concentrations was examined by RT-qPCR. There was an increase in the transcriptional level of all genes in a MDR strain and pre-XDR strain with additional OFX resistance, when exposed to at least one of the drugs involved in resistance, INH, RIF or OFX. However, there was no correlation between the reduction of antibiotic resistance levels with the EPI and the expression of genes encoding the pumps. Finally, in order to demonstrate the time to detection (TTD) of the bacterial growth in the antimicrobial environment in presence and absence of EPI, were applied BACTECTM MGITTM system 960 and Epicenter V5.53A equipped with software TB eXiST. Were used the MDR strains, a pre-XDR strain with additional resistance to AMK, and a monorresistant to OFX strain. In general, strains have showed a slower grew in the presence of VP, TZ and/or CPZ when combined with INH or RIF. This suggests that efflux is essential for the strain to grow faster in the presence of certain antibiotics. In addition, the efflux can act synergistically with the presence of mutations in order to reduce the biological cost of the bacteria and promoting growth at high drug concentrations. In conclusion, the described results demonstrated that the efflux system plays an important role in resistance to antibiotics used in the treatment of TB, and that the use of efflux inhibitors may potentiate the antimicrobial activity.

O arroz é umas das mais importantes plantas cultivadas no mundo, sendo constituinte da dieta básica de mais da metade da população humana, inclusive no Brasil. Entretanto, o arroz é um cereal nutricionalmente pobre, apresentando baixas concentrações de metais essenciais, como o ferro e o zinco. Programas de melhoramento e de engenharia genética têm sido empregados na tentativa de melhorar o teor nutritivo dos grãos de arroz. Entretanto, para se alcançar este objetivo é essencial conhecer os mecanismos que envolvem a aquisição de metais, transporte interno e armazenamento nas plantas. A literatura recente tem revelado a existência de diversas famílias de genes candidatos a desempenharem função na homeostase de metais em arroz (genes Yellow Stripe Like, IRT, FRO, MTP, etc). Entre estes, a família Yellow Stripe Like é forte candidata a possuir genes envolvidos na alocação de ferro para o grão, visto que é uma família numerosa (18 genes) de transportadores de ferro, com diferentes isoformas capazes de transportar ferro ligado a fitossideróforos ou a nicotiamina (o principal quelante de ferro intracelular), e com expressão comprovada de pelo menos uma isoforma em células de floema. No entanto, a alocação de minerais para o grão é um processo altamente regulado, que provavelmente requer a atividade de outros genes, com funções ainda desconhecidas. Neste estudo visamos avaliar a contribuição de genes YSL em plantas de arroz e identificar novos genes potencialmente envolvidos com o transporte de metais aos grãos de arroz utilizando diferentes ferramentas: análise de plantas mutantes no gene OsYSL15 por inserção do retroelemento TOS17; avaliação da expressão de genes YSL em folhas bandeira e panículas de arroz em dois estádios de desenvolvimento; construção de uma biblioteca de hibridização subtrativa (SSH) de panículas em dois estádios de desenvolvimento, visando identificar genes com expressão induzida no enchimento dos grãos. Estas diferentes abordagens nos permitiram concluir que: o gene OsYSL15 é fortemente induzido em raízes sob deficiência de ferro, mas não necessário para o desenvolvimento das plantas nas condições estudadas; a função do gene OsYSL15 provavelmente possui sobreposição com as de outros transportadores de ferro, que podem compensar a sua falta; o gene OsYSL18 é um forte candidato a participar dos processos de alocação de minerais para os grãos de arroz. Além disso, foi possível identificar um novo gene, com função ainda desconhecida, com alta expressão em panículas de arroz durante o enchimento do grão. / Rice is one of the most important crops worldwide. Although being a poor source of nutrients, such as iron and zinc, rice is the dietary basis of over half the world's population, including Brazil. Breeding and genetic engineering programs have been employed with the intent to improve the nutritive characteristics in rice grains, including the increase of mineral nutrients, such as iron and zinc. To reach this objective, it is necessary to understand how metal homeostasis occurs in plants, including rhizosphere uptake, internal transport and storage. The recent literature has revealed several families of genes which are candidates to be involved in metal homeostasis in rice (Yellow Stripe Like, IRT, FRO, MTP, etc). Among them, the Yellow Stripe Like family is a strong candidate to contain genes involved with iron allocation to the grain. This is a large family (18 genes) of iron transporters, with different isoforms being able to transport iron chelated to siderophores or to nicotianamine (the main intracellular iron ligand in plants), and with at least one isoform being expressed in phloem cells. However, mineral allocation to the grain is a highly regulated process, which probably requires the activity of other genes, with functions that are still unknown. This study aimed at the evaluation of the contribution of YSL genes and at the identification of new genes potentially involved with metal transport to the rice grain, making use of three different tools: analysis of OsYSL15 mutant plants, containing TOS17 retroelement insertion; gene expression evaluation of YSL genes in rice flag leaves and panicles during two reproductive stages; construction of a panicle subtractive library (SSH) comparing two reproductive stages, in order to identify genes up-regulated during grain filling. These diverse approaches allowed us to reach the following conclusions: the OsYSL15 gene is strongly induced in roots under iron deficiency, but is not necessary for plant development under control conditions; probably there is function overlap between the OsYSL15 gene and other iron transporters, which can compensate for its absence; the OsYSL18 gene is a strong candidate to participate in mineral allocation to the rice grain. Moreover, it was possible to identify a new gene, with still unknown function, which is highly up-regulated in panicles after anthesis.

Orientador: Woodruff W. Benson / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-20T23:03:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Andrade_GildaVasconcellosde_D.pdf: 12048252 bytes, checksum: 9406e92789e2a262565fbbf4f71fb243 (MD5) Previous issue date: 1995 / Resumo: Em poças temporárias são favorecidas adaptações à imprevisibilidade ambiental e às flutuações do nível da água. Neste estudo da história de vida de um anuro que ocupa poças temporárias, analiso as estratégias da reprodução e do crescimento e desenvolvimento larval de Physalaemus cuvieri, através de observação e experimentação. Realizei o estudo em 22 poças temporárias, todas formadas pelo acúmulo da água da chuva e apresentando água parada, em uma área aberta na Reserva Florestal do Sacavém, município de São Luís, MA, Brasil. Coletei dados sistemáticos sobre adultos de dezembro de 1990 a julho de 1991. De 20 de março a 31 de julho de 1992, eu anotei diariamente o número de desovas, a distância de cada desova para a desova mais próxima e, sempre que possível, o tamanho das poças e das desovas. Amostrei semanalmente os girinos e os predadores aquáticos. o ano de 1992 foi muito seco para a região (1.107 mm de chuva). Encontrei 562 desovas distribuídas em 11 das 22 poças, estando quase a metade na poça B-l O,cerca de um quarto na poça E-14 e cerca de um quarto na poça A-22. As outras oito poças totalizaram 73 desovas. O tamanho e a disponibilidade da poça influenciaram o número de desovas. ...Observação: O resumo, na íntegra, poderá ser visualizado no texto completo da tese digital / Abstract: The temporary pond habitat favors adaptations to environmental unpredictability and water leveI fluctuations. The present work is about the life history of an anuran species, Physalaemus cuvieri, living in temporary ponds, and it focuses, through observation and experimentation, on the reproduction and on growth and deve1opment strategies of the tadpoles. Twenty-two temporary standing-water ponds, created by rainfall accumulation, were selected for this study from a clearing at the Reserva Florestal do Sacavem, in Sao Luis county, Maranhao State, Brazil. Systematic data sampling, on adults, were performed from December of 1990 through July of 1991. From March 20th through July 31st of 1992, daily recording of the number of foam nests, measurement of their distance to the nearest nest and, when possible, the dimensions of ponds and size of foam nests was performed. Tadpoles and aquatic predators were sampled on a weekly basis. The year of 1992 was a specia11ydry year, with 1,107mm of rainfall. In this year I found 562 foam nests on 11 of the 22 temporary ponds. Almost half of these foam nests were found on pond B-1O, with a quarter occurring on pond E-14 and another quarter on pond A-22. The remaining eight ponds had a total of 73 foam nests. ...Note: The complete abstract is available with the full electronic digital thesis or dissertations / Doutorado / Ecologia / Doutor em Ciências Biológicas

Orientador : Fernando F. Costa / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciencias Medicas / Made available in DSpace on 2018-08-01T12:39:16Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Shitara_EdsonShusaku_M.pdf: 13377377 bytes, checksum: 8ddc98862559481b7bfb0bb363d2deb2 (MD5) Previous issue date: 2002 / Resumo:O mieloma múltiplo (MM) é uma doença neoplásica maligna que se desenvolve em células linfocitárias de linhagem B, em sua fase mais evoluída, chamada de plasmocitária. Ele é caracterizado pela tríade formada por infiltração plasmocitária de medula óssea (MO), produção de imunoglobulinas (Igs) monoclonais e lesões osteolíticas. O MM não tem ainda bem esclarecida sua patogênese e etiologia. Fatores diversos são relacionados para justificar a carcinogênese nesta patologia. Mutações no gene N-ras estão presentes em aproximadamente 20 a 30 % dos pacientes com esta doença ao diagnóstico, além de acometimento maior quando de atividade do MM. Neste trabalho, investigamos mutações no proto-oncogene N-ras em 44 pacientes com diagnóstico de MM. A metodologia utilizada foi a de amplificação do fragmento do gene N-ras através de PCR e determinação da seqüência por meio de seqüenciamento automatizado. Em nossa investigação não encontramos nenhuma mutação do gene em qüestão. Concluímos que a ausência de mutações no gene N-ras indica, aparentemente, que seu papel não é fundamental na etiopatogenia desta população brasileira avaliada. Este resultado pode sugerir também uma peculiaridade quanto ao uso da terapia gênica que aborde N-ras nestes pacientes / Abstract: Various authors met gene ras mutation in MM patients, mainly at N- and K-ras. The incidence is variable, but a median result is 30-40% at presentation, and until 70% in cases of relapse. The aim of this study was the determination of the frequency of mutation of the hot-spots codons 12,13 and 61 N-ras proto-oncogene. We studied the bone marrow DNAfrom 44 patients with multiple myeloma. We used DNA sequencing methodology for identification of mutations at N-ras gene. The positive-control was a patient with mutation at codons 12 and 13 of N-ras gene from a previous investigation in our laboratory. We didn't find oncogenic mutational alterations. The result suggests that the mutations of N-ras gene are not fundamental importance for pathogenesis of multiple myeloma in the Brazilian population avalied. / Mestrado / Patologia Clinica / Mestre em Ciências Médicas

Orientador: Luiz Roberto Monzani / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Filosofia e Ciencias Humanas / Made available in DSpace on 2018-08-04T18:49:34Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Tripicchio_AnaCeciliaCorreiaLima_M.pdf: 8822410 bytes, checksum: 7d30d69733e58c206eedce3578aa4b56 (MD5) Previous issue date: 2005 / Resumo: Esta dissertação tem por objetivo inspecionar brevemente conexões entre alguns conceitos centrais, presentes em reflexões metafísicas sobre a História Natural e suas conseqüências epistemológicas no campo da Biologia ocidental de Aristóteles até Lamarck. Para tal, houve o rastreamento dos pilares conceituais em três paradigmas acerca do conhecimento do mundo vivo: o Fixismo Naturalista de Aristóteles, o Fixismo Criacionista de Agostinho e Tomás de Aquino e o Transformacionismo de Lamarck. A estrutura metafísica e científica que ancora essas visões parte dos conceitos principais de 'Ser animado', 'Scala Naturae', 'Teleologia em a Natureza' e 'Transformação'. Na Filosofia da Natureza de Aristóteles, esses conceitos sustentam uma metafísica continuísta ao suportarem um modelo fixista para apreensão racional dos vivos observados. O modelo epistêmico essencialista de Aristóteles e sua conseqüente concepção imanentemente estática de natureza, incluído na metafísica do criacionismo medieval, é atacado em suas fundações por Lamarck, pois seu postulado transformacionista dos seres vivos traz em seu bojo a possibilidade de modificação substancial dos corpos vivos. A ruptura metafísica e a diferença epistemológica radical das considerações fixistas ficam por conta de Lamarck, que com sua teoria integrista da Evolução, inaugura explicitamente na Biologia, uma metafísica descontinuísta que suporta uma posterior e atual visão da natureza viva também ateleótica e indeterminista / Abstract: This essay aims at briefly inspecting connections between certain central concepts which are to be found among metaphysical reflections concerning Natural History,as well as its epistemologic consequences in Western Biology, from Aristotle to Lamarck. In order to do so, the tracking of the conceptual foundations in three paradigms conceming the living world took place here: firstly the Aristotle' s Naturalíst Fixism, then St. Thomas Aquinas and St. Augustin Creationistic Fixism and finally Lamarck's Transformationism. That metaphysical as well as scientífic structure which provides support to such visions is based on the concepts of 'Movement', 'Animated Being', 'Scala Naturae', 'Teleology in the Nature' and 'Transformation'. In Aristotle's Phylosophy of Nature such concepts give support to a Continuistic of Metaphysics by supporting a Fixist Model in order to achieve a rational understanding of the observed living beings. Aristotle's essentialistic epistemic system with its essentially static vision of nature was to be included in the Medieval Creationism. It was also attacked in its very foundations by Lamarck later, since its transformationistic approach of the living beings brings in itself the possibility of a substantial modification of the living bodies. Such metaphysical rupture as well as the radical epistemologic differences from the fixist concepts are Lamarck's work. In his Evolution theory, he starts openly a descontinuistic metaphysics in Biology which provides support to a vision of living nature which would come later as it is today, which is ateleothic as well as undeterministic / Mestrado / Mestre em Filosofia

Em todo o mundo, menos de 5% dos doentes com tuberculose (TB), sejam casos novos ou previamente tratados, tem a avaliação dos isolados quanto ao perfil de sensibilidade aos antibioticos. No Rio Grande do Sul, estado localizado no sul do Brasil, cerca de 4700 casos novos de TB são registrados a cada ano, com uma taxa de cura de 68,9%, e uma taxa de abandono de 7,5%. A identificação rápida da resistência às drogas, em isolados clínicos de M. tuberculosis é importante para o estabelecimento de uma quimioterapia eficaz bem como para evitar a propagação de cepas resistentes. Os objetivos deste estudo foram caracterizar os pacientes de TB com maior risco de possuir TB-­‐MDR, analisando o perfil de resistência às drogas dos isolados e o perfil epidemiológico desses pacientes. Além disso utilizou-­‐se as amostras clínicas para avaliar o teste comercial (GenoType® MTBDRplus) e para desenvolver e padronizar um novo teste (Detect-­‐TBMR) para detectar as mutações mais frequentes associadas a resistência à INH e RIF. Uma proporção significativamente maior (75% versus 20%, p = 0,009) de pacientes do gênero masculino foi encontrada entre os casos resistentes às drogas do que entre os casos suscetíveis. 43,8% dos pacientes demoraram mais de 30 dias para procurar assistência médica e no grupo TB MDR, 25% dos casos não tinha sido submetido a qualquer tratamento prévio anti-­‐TB. Em nossas amostras, encontramos uma proporção de 48,3% de TB-­‐ MDR. A família T foi a família de spoligotipo mais frequente. Comparado com o método da proporções, a sensibilidade e especificidade do ensaio MTBDRplus foram 82% e 94% para a resistência à RIF, 60% e 94% para resistência à INH. Comparado com sequenciamento, a sensibilidade e especificidade do ensaio MTBDRplus foi 92% e 97% para a resistência à RIF e 100% e 100% para a resistência à INH, respectivamente. Para detectar resistência à RIF e INH, o ensaio Detect-­‐TBMDR mostrou sensibilidade e especificidade de 79,3% e 77,0% e 100% e 65%, respectivamente, em comparação com o método da proporções. Comparado com o sequenciamento, a sensibilidade e especificidade do ensaio Detect-­‐TBMDR foi de 81,2% e 94,7% e 100% e 96,2%, para detectar e resistência à RIF e INH, respectivamente. Ainda existem discordâncias entre o método das proporções e a abordagem molecular, particularmente em relação a resistência à INH. Contudo, estes métodos são muito importantes para o manejo mais rápido e correto dos pacientes, auxiliando na escolha do melhor esquema terapêutico. / In most parts of the world, less than 5% of new and previously treated tuberculosis (TB) patients are tested for multidrug resistance (MDR) TB. In Rio Grande do Sul state, the southern most Brazilian state; approximately 4700 new cases of TB are recorded each year, with a cure rate of 68.9%, and a noncompliance rate of 7.5%. Rapid identification of drug resistance in clinical isolates of Mycobacterium tuberculosis is important to facilitate rapid and adequate chemotherapy of TB, and to prevent the spread of resistant strains. The aim of this study was to characterize TB patients at higher risk of having MDR-TB, to analyze the drug resistance and epidemiological profile of these patients. Use the clinical samples to assess the commercial test (GenoType® MTBDRplus) and develop and standardize a new test (Detect-MDRTB) for detecting the most frequent mutations associated with resistance to INH and RIF. A significantly higher proportion (75% versus 20%, p = 0.009) of males were found among drug-resistant cases than drug susceptible cases. 43.8% of patients took longer than 30 days to seek medical care and in the MDR group 25% of the cases did not undergo any previous anti-TB treatment. In our samples we found a proportion of 48.3% of MDR-TB. The T family was the most frequent spoligotype family. Compared with the proportion method, the sensitivity and specificity of the MTBDRplus assay were 82% and 94% for RIF-resistance, 60% and 94% for INH resistance. Compared with sequencing, the sensitivity and specificity of the MTBDRplus assay were 92% and 97% for RIF-resistance, 100% and 100% for INHresistance. To detect RIF and INH-resistance, the Detect-TBMDR assay showed a sensitivity and specificity of 79.3% and 77.0%, and 100% and 65%, respectively, compared to proportion method. When compared with sequencing, Detect-TBMDR assay, to detect RIF and INH-resistance, showed a sensitivity and specificity of 81.2% and 94.7% and to 100% and 96.2%, respectively. Discordances still exist between the proportion method and molecular approach, particularly regarding INH-resistance. However, these methods are very important for the management faster and correct patient, helping to choose the best treatment regimen.

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2015-11-11T08:45:17Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 2070709 bytes, checksum: 8aca4e1bccb3e3a726679695fe3ab253 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-11-11T08:45:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 2070709 bytes, checksum: 8aca4e1bccb3e3a726679695fe3ab253 (MD5) Previous issue date: 2014-08-19 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Serine-Arginine Protein Kinase 2 - SRPK2 é uma cinase reguladora de fatores de splicing não-snRNPs (proteínas SR), e de fatores snRNPs (U4⁄U6-U5 tri-snRNP). SRPK2 regula as proteínas SR fosforilando-as em seus resíduos de serina e recrutando- as para a formação do spliceossomo, enquanto atua na formação do complexo U4⁄U6- U5 tri-snRNP, envolvido na seleção do sítio de splicing γ’. As interações com fatores snRNP e não-snRNP são conhecidas e bem estabelecidas funcionalmente, no entanto, pouco se sabe sobre proteínas que regulam o funcionamento da SRPK2, e sobre demais alvos de fosforilação. As proteínas SRPKs possuem seu domínio cinase divido em dois por uma região espaçadora de grande flexibilidade estrutural, passível de interação. Portanto, possível responsável pela seleção de substratos e/ou alvo de regulação. Nosso objetivo com este trabalho foi encontrar novas interações proteicas de SRPK2 através de sua região espaçadora. A técnica escolhida foi o duplo-híbrido em leveduras, no qual estas foram cotransformadas com o plasmídeo pBTM116K/S-SRPK2 trp1 e com uma biblioteca de cDNAs de leucócitos humanos em pACT2 leu2. O experimento foi processado em meio restritivo SD–TRP –LEU –HIS, acrescido de 30mM de 3AT e mantido em estufa 30°C por 120 horas. Ao final deste período, foi verificado o crescimento de 119 colônias de leveduras, submetidas a diferentes testes de ativação dos genes repórteres his3 e lacZ. Os resultados destes testes nos levaram a seleção de 42 clones, que tiveram seus DNAs plasmidiais extraídos, sequenciados e analisados pela ferramenta Blast do NCBI. As proteínas codificadas por estes genes estão funcionalmente relacionadas a processos celulares como biogênese ribossomal, migração, diferenciação, angiogênese, proliferação, sobrevivência e ciclo celular. Estes resultados sugerem novos mecanismos moleculares para a atuação da SRPK2 no processo tumorigênico. / Serine-Arginine Protein Kinase 2 - SRPK2 is a regulator kinase of non-snRNP splicing factors (SR proteins) and of snRNPs factors (U4⁄U6-U5 tri-snRNP). SRPK2 regulates SR proteins phosphorylating them on their serine and recruiting them for the formation of the spliceosome, while acts on the tri-snRNP U4/U6-U5 complex assembly, involved in the splicing γ’ site selection. The interactions with snRNP and non-snRNP factors are known and well-established functionally, however, little is known about the proteins that regulate the functioning of SRPK2, and about other targets of phosphorylation. The SRPKs proteins have their kinase domain divided into two by a spacer region of great structural flexibility, believable of interaction. Therefore, possible responsible for selection of substrates and/or aim of regulation. Our aim with this work was to find new protein interactions of SRPK2 by its space region. The technique chose was two-hybrid yeast, in which yeasts were cotransfected with pBTM116K/S-SRPK2 trp1 plasmid and a human leukocyte cDNA library in pACT2 leu2. The experiment was processed in restrictive medium SD –TRP –LEU –HIS, plus 30 mM of 3AT and keep in a incubator 30°C for 120 hours. At the end of this period, it was found the growth of 119 yeast colonies, subjected a different tests of activation of reporter genes his3 and lacZ. The results of these tests led to the selection of 42 clones, which had its plasmid DNA extracted, sequenced and analyzed by the NCBI Blast tool. The proteins encoded by these genes are functionally related in cellular processes as ribosome biogenesis, migration, differentiation, angiogenesis, proliferation, survival and cell cycle. These results suggest new molecular mechanisms for the performance of SRPK2 in tumorigenic process. / Sem lattes

Orientador: Vital Paulino Costa / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciencias Medicas / Made available in DSpace on 2018-07-31T16:59:35Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Vasconcellos_JosePauloCabralde_D.pdf: 988691 bytes, checksum: ed9aef7fcff38c1838bfc4261d1754b0 (MD5) Previous issue date: 2001 / Doutorado

Orientador: Alfonso Trujillo Ferrari / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Matematica, Estatistica e Ciencia da Computação / Made available in DSpace on 2018-07-16T02:29:06Z (GMT). No. of bitstreams: 1 RiosVirhuez_Julio_M.pdf: 1712989 bytes, checksum: e4db2127e4470eb415ccb2d201725226 (MD5) Previous issue date: 1984 / Abstract: Not informed. / Resumen: En el proceso de enseñanza-aprendizaje de la asignatura de Biologia General, asi como en otras asignaturas de la especialidad no es usual ensayar nuevas metodologias que contribuyan a una mayor participación del estudiante en su propio aprendizaje. Lo normal es - desarrollar los temas recurriendo al método expositivo complementado con las c1ases prácticas de laboratorio, las que no siempre son suficientes para el ejercicio del pensamiento reflexivo y la conseguiente formación cientifica del estudiante. Es necesario poner especielinterés para que el estudiante realice acciones creativas resolviendo problemas específicos, tal como los relacionados con su medio. Con el fin de facilitar el trabajo en e1 aula, en el laboratorio, en el campo, etc. los estudiantes deben constituir los "pequeños grupos permanentes de trabajo" a fin de realizar las tareas mediante la cooperación de sus miembros, tomando sus acuerdos por consenso y sobre todo, asumiendo responsabilidades específicas dentre del grupo. Entre las actividades que deben desarrollarse a fin de renovar los procedimientos didácticos, se proponen además de los "pequeños grupos permanentes de trabajo" los siguientes: Los "cuestionarios dirigidos", los que son formulados por el Profesor, previa revisión de la bibliografía básica recomendada y que deben desarrollar los estudiantes con el objeto de participar activaente en cada clase. Los "trabajos de proyección a la comunidad" a fin de poner en contacto al estudiante con problemas reales de una comunidad específica, que a la vez les permitirá ejercitar el pensamiento reflexivo mediante la realización de acciones creativas. Del mismo ,odo, es necessario realizar evaluaciones para conocer el contenido de la asignatura disminuyendo las tensiones que producen los exámes tradicionales. Todos estos procedimientos didácticos asociados a las prácticas de laboratorio, incrementarán la participación del estudiante en su propio aprendizaje, mejorandose e1 relacionamiento profesor-alumno, dandole al estudiante más seguridad y confianza. / Mestrado / Ensino de Ciencias e Matematica / Mestre em Matemática