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Análise evolutiva de processos de redução genômica em bactérias e correlação com aspectos funcionais de Mycoplasma hyopneumoniae

Carvalho, Marcos Oliveira de January 2008 (has links)
Genomas reduzidos de bactérias apresentam-se como complexos sistemas evolutivos, evidenciando diferentes propriedades genômicas de acordo com o nicho ocupado por cada organismo. Em bactérias simbiontes, genomas reduzidos apresentam uma grande estabilidade em relação a rearranjos e taxas mutacionais em comparação com genomas reduzidos de bactérias parasitas. Dentre as espécies parasitas com genoma reduzido, Mycoplasma hyopneumoniae distingue-se por apresentar, em diferentes cepas, genomas com características específicas dentro da classe Mollicutes, incluindo maior taxa mutacional, e freqüência de rearranjos. Através do desenvolvimento de um método quantitativo para avaliar a preferência de disposição preferencial de genes nas fitas senso e anti-senso de genomas de procariotos, foi possível avaliar comparativamente a estrutura genômica de espécies bacterianas em 8 filos de procariotos. Os resultados dessa análise indicam que dentre os genomas analisados as espécies de Mollicutes do grupo hominis são as que possuem a maior desorganização estrutural em relação à colocação preferencial de genes nas fita senso e anti-senso, enquanto que as espécies do grupo pneumoniae apresentam valores intermediários, o que se correlaciona com a maior sintenia observada entre genomas nesse grupo. Uma análise em grande escala de mutações sinônimas e não-sinônimas em 7 grupos de genomas reduzidos indica a ocorrência de evolução positiva em uma série de genes possivelmente relacionados a patogenicidade. Com base em dados comparativos de rearranjos, presença de recombinação, transferência horizontal e elevadas taxas de mutações sinônimas sobre não-sinônimas, um novo modelo de evolução de genomas reduzidos de parasitas foi proposto. No modelo, sugere-se que, ao contrário dos genomas de bactérias simbiontes, a redução genômica em bactérias parasitas caracteriza-se por um processo altamente turbulento, no qual a constante geração de variabilidade é um ponto crítico para o sucesso da estratégia de colonização do hospedeiro. / Reduced genomes present an interesting evolutionary system, showing different genomic properties accordingly their lifestyle as parasites or symbionts. In symbiont bacteria, reduced genomes present a great stability regarding rearrangements and mutational rates comparing with reduced genomes from parasite bacteria. Among these species, the Mycoplasma hyopneumoniae genome distinguish itself by presenting specific characteristics inside the Mollicutes class, including higher mutational and rearrangements rates. Through the development of a quantitative method of gene strand bias, was possible a comparative analysis of 8 bacterial phyla. The results of such analysis indicated that genomes of Mollicutes bacteria from the hominis group possess the most disordered genomes regarding gene position on the leading or lagging chromosome strand, while genomes from bacteria of the pneumoniae group have intermediary values, in agreement with the higher sinteny between the genomes in this group. A large-scale analysis of synonymous and non synonymous mutations in 7 groups of reduced genome bacteria determined positive evolution in several genes related to pathogenicity. Based in comparative data from rearrangements, recombination, horizontal transfer and high synonymous over non-synonymous mutational rates, a new model of evolution for parasite species with reduced genomes is proposed. In this model is suggested that, in opposition with symbionts bacteria, genome reduction of parasite prokaryotes is characterized by a high turbulent process, where the constant variability generation is a critical point for the success of the host colonization.
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Quando vai ser? o bebê ou a coleta das células-tronco? as pedagogias do risco e a colonização molecular do futuro

Somavilla, Vera da Costa January 2014 (has links)
Esta tese abrange questões relacionadas aos discursos de risco presentes nas publicações dos depoimentos de pais e mães em sites de biobancos autólogos que coletam e armazenam células-tronco do cordão umbilical para criopreservação. Para essa tarefa, tenho as seguintes questões: como a racionalidade de risco e sua promessa de garantia biológica no futuro se constituem nos depoimentos dos pais publicados nos sites que comercializam/vendem a coleta e o armazenamento de células-tronco do cordão umbilical? Como tal racionalidade e suas práticas se constituem como uma dimensão educativa, relativa à saúde, nesses sites? Nesse empreendimento, analisei as publicações da Internet de cinco sites de biobancos, que se constituíram como material principal da análise; vou toma-los enquanto um artefato cultural. A partir das discussões de risco e hiperprevenção, noções desenvolvidas nos trabalhos de Luis David Castiel, e de biotecnologias, nos trabalhos de Nikolas Rose, estabeleci as estratégias e categorias de análise da tese, que estão apresentadas em três eixos analíticos. O primeiro aborda a exortação do discurso de risco, em que apresento de que modo a prevenção dos riscos se constitui como elemento mobilizador para aquisição desta biotecnologia, educando pais e mães para a adoção de determinadas práticas de saúde vinculadas à segurança biológica para o futuro. O segundo discute o consumo de biotecnologias, que se apresentam discursivamente nos sites como um futuro de oportunidades para prevenção de riscos e influenciam a constituição de sujeitos de consumo. No terceiro eixo, problematizo as promessas de segurança biológica para o futuro, divulgadas de forma reiterada pelos biobancos, refletindo sobre os discursos que tratam do desejo de, a partir desta biotecnologia, adquirir um tipo de seguro biológico para a saúde no futuro. Será possível observar que os depoimentos extraídos dos sites constituem discursivamente a criopreservação das células-tronco do cordão umbilical como um tipo de “segurança biológica para o futuro”. A discussão dos dados possibilita perceber que os discursos presentes nos depoimentos dos pais e mães são singulares, amplamente marcados pelas pedagogias do risco, e ajudam a compreender como os processos de medicalização e molecularização da vida vão conformando as práticas e reposicionando as famílias em relação aos cuidados de saúde dos filhos, com vistas a evitar riscos de adoecimento no futuro. / This thesis addresses issues related to risk discourses found in testimonies given by parents on websites of autologous biobanks that collect and store stem cells from umbilical cord blood for cryopreservation. Two questions have been posed: How have the risk rationality and its promise of biological guarantee constituted and functioned on websites that trade/sell the collection and storage of umbilical cord blood stem cells? How have such rationality and its practices been constituted as an educative health-related dimension on those websites? The contents of five websites of biobanks have been selected as the main research material; hence, they have been here regarded as cultural artifacts. From the discussions about the notions of risk and hyper-prevention, which have been developed by Luis David Castiel, and also about biotechnologies, as seen by Nikolas Rose, I have established the strategies and categories of analysis, which have been divided into three analytical axes. The first one approaches the exhortation of the risk discourse, in which I have evidenced how risk prevention is a mobilizing element for the acquisition of that biotechnology and teaches parents to adopt certain health care practices linked to future biological security. The second one discusses the consumption of biotechnologies which are both discursively presented in the websites as a future of opportunities for risk prevention and influence the constitution of consumption subjects. In the third axis, I have problematized the promises of future biological security that have been recurrently publicized by the biobanks. I have reflected on discourses that, by considering this biotechnology, address the desire to obtain a certain kind of biological health insurance. It is possible to notice that the testimonies extracted from the websites discursively produce the cryopreservation of umbilical cord blood stem cells as a type of “biological insurance”. Data discussion has enabled me to understand that the discourses found in parents’ testimonies are unique and highly marked by the risk pedagogy, and also help us understand how the processes of medicalization and molecularization of life have shaped some practices and repositioned the families in relation to their children health care aiming at preventing diseases from appearing in the future. / Esta tesis abarca cuestiones relacionadas a los discursos de riesgo presentes en testimonios de padres y madres publicados en sitios web pertenecientes a biobancos autólogos que colectan y almacenan células madre del cordón umbilical para criopreservación. Para esta tarea, tengo las siguientes cuestiones: ¿Cómo la racionalidad de riesgo y su promesa de garantía biológica en el futuro se constituyen y operan en los sitios web que comercializan la colecta y el almacenamiento de éstas células? ¿Cómo tal racionalidad y sus prácticas se constituyen como una dimensión educativa relativa a la salud en estos sitios? En ese emprendimiento, analicé las publicaciones web de cinco páginas de biobancos, que se constituirían en el material principal de análisis; por eso los considero como un artefacto cultural. A partir de las discusiones de riesgo e hiperprevención (nociones desarrolladas en los trabajos de Luis David Castiel), y de biotecnologías (presente en los trabajos de Nikolas Rose), establecí las estrategias y categorías de análisis de la tesis, presentadas en tres ejes analíticos. El primero aborda la exhortación del discurso de riesgo, en el que presento de qué modo la prevención de riesgos se constituye como elemento movilizador para la adquisición de esta biotecnología, educando a padres y madres para la adopción de determinadas prácticas de salud vinculadas a la seguridad biológica para el futuro. El segundo discute el consumo de biotecnologías, que se presentan discursivamente en los sitios web como un futuro de oportunidades para la prevención de riesgos e influencian a la constitución de sujetos de consumo. En el tercer eje, problematizo las promesas de seguridad biológica para el futuro divulgadas de forma reiterada por los biobancos, reflexionando sobre los discursos que tratan el deseo de, a partir de esta biotecnología, adquirir un tipo de seguro biológico para la salud en el futuro. Será posible observar que los testimonios extraídos de los sitios web constituyen discursivamente la criopreservación de células madre como un tipo de “seguridad biológica para el futuro”. La discusión de los datos posibilita percibir que los discursos presentes en las declaraciones de padres y madres son singulares, ampliamente marcados por la pedagogía de riesgo, y ayudan a comprender como los procesos de medicalización y moleculización de la vida van conformando las prácticas y reposicionando a las familias en relación a los cuidados en la salud de los hijos, con vista a evitar riesgos de enfermedades en el futuro.
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Avaliação da capacidade de bioconversão de hexoses e pentoses em bioetanol por Spathaspora arborariae / Study of the bioconversion of pentoses and hexoses into bioethanol by Spathaspora arborariae

Pereira, Fernanda da Cunha January 2010 (has links)
Cada vez mais a busca por fontes de energia renováveis tem se intensificado. Isto não somente pela preocupação ambiental, mas também devido aos combustíveis fósseis serem limitados. Desta forma, o etanol de segunda geração (bioetanol) tem chamado a atenção por ser uma fonte de energia pouco poluente e que pode ser obtida a partir de resíduos agroindustriais. Resíduos lignocelulósicos agroindustriais, como a casca de arroz, são fontes abundantes e de baixo custo para produção biotecnológica de compostos de alto valor agregado. Esse processo biotecnológico tem o objetivo de promover o aproveitamento completo das frações celulósica (contém hexoses) e hemicelulósica (rica em pentoses) dos resíduos lignocelulósicos, para a obtenção de commodities. O presente trabalho teve como objetivo avaliar a capacidade de conversão de hexoses e pentoses pela levedura Spathaspora arborariae, descrita recentemente como boa conversora de pentoses a etanol. Cultivos sobre meio semissintético e hidrolisado de casca de arroz, a 180 rpm e 28oC, foram realizados em agitador orbital utilizando frascos Erlemmeyers, utilizando leveduras fermentadoras de hexoses e pentoses, como Saccharomyces cerevisiae, Candida shehatae, Pichia stipitis e Spathaspora arborariae, respectivamente, em cultivos isolados e em co-cultivo. As cepas testadas isoladamente apresentaram valores de produtividade de etanol (YP/S) entre 0,35 e 0,46 g g-1, enquanto que o rendimento dos co-cultivos variou de 0,30 e 0,77 g g-1 de etanol, sobre ambos os susbstratos. Também foram realizados ensaios em frascos agitados em aerobiose (180 rpm) e anaerobiose (100 rpm) a 28oC utilizando como meio de cultura com diferentes açúcares individualmente (glicose, xilose ou arabinose). O cultivo realizado em anaerobiose, utilizando glicose como substrato foi o que apresentou maior índices de conversão de etanol (Y P/S) 0,26 g g-1. Cultivos foram conduzidos em biorreatores submersos utilizando S. arborariae sobre meio semissintético, contendo glicose e xilose, em condições anaeróbicas (150 rpm), aeróbicas (400 rpm e 2 vvm; 150 rpm e 0,5 vvm) e microaerofilia (180 rpm e 0,33 vvm). O maior rendimento de etanol foi obtido no cultivo anaeróbico com Y P/S=0,52 g g-1. / It is increasing the search for renewable energy sources due to environmental concerns and the possibility of fossil fuels shortage in the near future. Thus, the second generation ethanol (bioethanol) has drawn attention for being a renewable energy source and can be obtained from organic residues. Lignocellulosic agroindustrial residues such as rice hulls are abundant resources and have a low cost for the biotechnological production of compounds of high added value. This biotechnological process aims to promote the full exploitation of the cellulose fractions (containing hexoses) and hemicellulose (rich in pentoses) of lignocellulosic wastes to obtain commodities such as ethanol. This study aimed at studying the capability of the yeast Spathaspora arborariae, recently discovered, of converting hexoses and pentoses into ethanol. Cultures on semi synthetic medium and hydrolyzed rice hull at 180 rpm and 28oC, were performed in shaker, using fermenting yeast hesoxes and pentoses such as Saccharomyces cerevisiae, Candida shehatae, Pichia stipitis and Spathaspora arborariae, either isolated or in co-cultivations. The strains tested alone showed values of ethanol yields (YP/S) between 0.35 and 0.46 g g-1, while the yield of co-cultures varied from 0.30 to 0.77 g g-1 ethanol on both substrates. Experiments were also carried out in shake flasks under aerobic conditions (180 rpm) and anaerobic (100 rpm) at 280C using culture medium with different sugars individually (glucose, xylose, or arabinose). The yeasts cultivated in anaerobic conditions using glucose as substrate showed the highest ethanol yields (YP/S) 0.26 g g-1. Cultures were conducted in submerged bioreactors using S. arborariae on semi-synthetic medium containing glucose and xylose under anaerobic conditions (150 rpm), aerobic (400 rpm and 2 vvm, 150 rpm and 0.5 vvm) and micro-aerobiosis (180 rpm and 0.33 vvm). The highest ethanol yield was obtained in anaerobic cultivation with YP/S = 0.52 g g-1.
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Estudo químico e biológico de derivados da Tiazolidina-2,4-diona e 4-Tioxo-tiazolidina-2-ona

da Silva Filho, João January 2004 (has links)
Made available in DSpace on 2014-06-12T15:50:10Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo4445_1.pdf: 1858659 bytes, checksum: 8235fc07f35fe83b5cc1aa1024e28658 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2004 / As tiazolidinonas são compostos heterocíclicos com anel de cinco membros contendo oxigênio e enxofre na estrutura. Apresentam propriedades biológicas e farmacológicas como hipoglicemiante, analgésica, antiinflamatória, anticonvulsi- vante, antimicrobiana entre outras. Este trabalho visa sintetizar novos derivados tiazolidínicos caracterizados pela substituição da posição 5 da tiazolidina-2,4-diona por radicais metilênicos e benzilidênicos, a posição 3 por 6-cloroacetil-1,4-benzoxazin-3-ona (benzoxazona) e na posição 4 pelo enxofre. Foram observadas e comparadas as atividades biológicas dos compostos segundo os radicais no núcleo tiazolidínico. Os compostos III-a e III-b, obtidos por condensação, tiveram rendimentos de 65 e 58%, Rf=0,51 e Rf=0,50, pontos de fusão de 203 e 174ºC. Os compostos IV-a, V-d e VI-c, tiveram rendimentos de 63, 36 e 3%; Rf=0,49, Rf=0,46 e Rf=0,56; pontos de fusão de 143, 175 e 141ºC, respectivamente. O composto VII-e foi preparado por reação de Nalquilação com 6-cloroacetil-1,4-benzoxazin-3-ona e apresentou rendimento de 69%, Rf=0,66 (0,90:0,1:CHCl3 / MeOH), ponto de fusão 243ºC. O composto VIII-a apresentou rendimento de 92%, Rf=0,46 (0,94:0,6: CHCl3 / MeOH), ponto de fusão 304ºC. Foram obtidos seis novos compostos e determinadas suas estruturas químicas através de métodos espectroscópicos. Estes compostos (juntamente com a benzoxazona) foram submetidos a testes biológicos para determinação das atividades antimicrobiana, citotóxica e antioxidante. A atividade antimicrobiana determinou a concentração inibitória mínima (CMI) e concentração mínima bactericida (CMB), frente a 10 microrganismos patógenos, incluindo bactérias Gram-positivas, Gram-negativas, bacilos álcool-ácido resistentes, leveduras e fungos filamentosos. A atividade citotóxica foi realizada com células de linhagem HEp-2 (Carcinoma Epidermóide de Laringe) e Linhagem NCI-H292 (Pulmão). Para a atividade antioxidante foi utilizado 0,1 mL de Tc- 99m na forma de pertecnetato de sódio (99m TcO4Na), para avaliar o potencial de ligação nas células do sangue e plasma de um rato wistar. Foi testado apenas o composto Benzoxazona, apresentando baixa ação antioxidante. Os compostos mostraram inibição citotóxica variando de 30 a 80% para as duas linhagens
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Efeito pós-antibiótico de um novo derivado 1,2,4-oxadiazol-hidrazida e suas associações frente ao Mycobacterium fortuitum e Mycobacterium smegmatis

OLIVEIRA, Renato Antonio dos Santos January 2004 (has links)
Made available in DSpace on 2014-06-12T15:50:43Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo4462_1.pdf: 969527 bytes, checksum: 2742833f24533974ca79f9689a36f81e (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2004 / A freqüente resistência das micobactérias atípicas às drogas antituberculose, a ausência de esquemas terapêuticos eficazes e os estudos concernentes à aplicação de novas moléculas sobre micobactérias motivaram a determinação do efeito pós-antibiótico (EPA) in vitro de um novo derivado 1,2,4-oxadiazol-hidrazida (HHBA) e de suas associações com o quimioterápico ofloxacino (OFLO), uma fluorquinolona, e o m-Flúor-Fenilalanina (m-FFen), um inibidor da síntese da parede celular. O EPA foi avaliado após o tempo de contato de 2 e 4 horas frente ao Mycobacterium fortuitum e ao Mycobacterium smegmatis. As drogas foram testadas em concentrações equivalentes a concentração inibitória mínima (CIM). Considerado um parâmetro farmacodinâmico de grande relevância em situações clínicas, o EPA exerce a sua maior importância na escolha do antimicrobiano, nos regimes de dosagem terapêutica e nos seus intervalos de administração. O EPA pode ser induzido pela exposição do microrganismo ao antimicrobiano por um período de tempo determinado, seguindo da rápida retirada deste antimicrobiano, e o acompanhamento do recrescimento deste microrganismo. Matematicamente, o EPA é calculado pela fórmula: EPA= T C, em que T representa o tempo necessário para que a cultura teste cresça o equivalente a 1log10 em relação à numeração efetuada logo após a retirada da droga e C representa o tempo necessário para que a cultura controle cresça igualmente de 1log10. O que concerne ao efeito pós-antibiótico sobre o M. fortuitum após 2 horas de contato a OFLO apresentou os maiores valores de EPA, 8,60 ± 1,50 horas. Todas as associações mostraram-se antagônicas com exceção da HHBA+m-FFen que induziu a um EPA indiferente de 1,20 ± 1,20 horas. Após 4 horas de contato, a OFLO continuou apresentando a melhor atividade cujo EPA foi equivalente a 11,50 ± 2,00 horas, sua associação com a m-FFen apresentou um EPA indiferente de 11,00 ± 2,70 horas. As demais associações apresentaram-se antagônicas. O efeito pós-antibiótico do HHBA frente ao M. smegmatis após um contato de 2 horas foi de 2,40 ± 2,80 horas e a sua associação com a OFLO mostrou ser a mais efetiva cujo valor do EPA foi de 3,30± 2,80 horas. Após 4 horas de contato o EPA do HHBA não foi alterado, permanecendo em 3,30 ± 2,60 horas. O aumento do tempo de contato induziu um aumento dos valores do EPA para as drogas estudadas e suas associações, exceto o m-FFen, as associações OFLO-HHBA e OFLO-HHBA-m-FFen frente ao M. smegmatis, e o HHBA e sua associação HHBA-m-FFen, frente ao M. fortuitum. A ofloxacino foi o antimicrobiano que induziu os melhores valores de EPA para o M. fortuitum, bem como o HHBA foi o antimicrobiano que induziu os melhores valores de EPA para o M. smegmatis. O aumento do tempo de contato de 2 para 4 horas potencializou os EPAs das drogas estudadas.Todas as associações testadas apresentaram um caráter antagônico, exceto a associação OFLO-m-FFen após 4 horas de contato, frente o M. smegmatis. E os tempos de contatos escolhidos, bem como a CMI utilizada para os ensaios, foram insuficientes para que as drogas e suas associações pudessem induzir EPAs sinérgicos. Como os mecanismos do EPA ainda não estão totalmente definidos é difícil lançar hipóteses acerca do qual ou quais mecanismos estão implicados na variação dos resultados dos EPAs de drogas testadas em associação
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Atividade antagônica de actinomicetos contra Botrytis cinerea, patógeno da videira (vitis sp.)

Ribeiro de Oliveira, Sibele January 2004 (has links)
Made available in DSpace on 2014-06-12T15:50:47Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo4463_1.pdf: 666226 bytes, checksum: 57046c022a8021530a9e644b9ad46131 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2004 / O uso de produtos químicos no combate a doenças causadas por fungos fitopatogênicos, além de ter um alto custo, ocasiona problemas ao meio ambiente e ao homem, determinando graves danos à biota natural do solo, além de contribuir para o desenvolvimento da resistência microbiana. O controle biológico, utilizando actinomicetos produtores de antibióticos, é uma alternativa para estes problemas. Avaliou-se in vitro o potencial de antagonismo de actinomicetos, pertencentes a Coleção de Culturas do Departamento de Antibióticos da UFPE, com reconhecida atividade antifúngica, contra dois isolados de Botrytis cinerea, patógeno da videira (Vitis sp). A atividade antifúngica foi determinada pelos métodos do bloco de gelose, difusão em disco de papel e unidade de Waksman. Das 63 linhagens testadas, 19 apresentaram atividade, pelo teste do bloco de gelose. Destas, cinco mostraram halos iguais ou superiores a 40 mm de diâmetro para pelo menos um dos isolados e foram selecionadas para o teste de difusão em disco, em meios convencionais de produção de antibióticos (MPE e M-1) e meios alternativos utilizando resíduos das indústrias do milho (milhocina) e da cerveja (cevada). Foram formulados cinco meios alternativos, contendo diferentes concentrações de nitrogênio. As linhagens DAUFPE-8631B e DAUFPE- 11470, destacaram-se nos meios convencionais, apresentando os maiores halos de inibição nos tempos de 96 e 72 horas de fermentação, respectivamente e foram testadas com os meios alternativos. Taxonomicamente, as linhagens pertencem ao gênero Streptomyces. Os meios à base de milhocina mostraram melhores resultados, destacandose o meio Mi-2, (concentração de nitrogênio igual a do meio M1). O estudo fitoquímico do extrato bruto da linhagem DAUFPE-11470 demonstrou a predominância de fenóis, flavononas, flavonóis, xantonas e bases quaternárias. Os resultados obtidos permitem concluir que as linhagens DAUFPE-8631-B e DAUFPE-11470 de Streptomyces, são potencialmente utilizáveis no controle biológico de Botrytis cinerea, e que a milhocina pode substituir a farinha de soja como fonte de nitrogênio nos meios de produção, constituindo uma alternativa viável, na eliminação dos problemas causados pelo óleo da soja, na extração do princípio ativo
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Atividade antagônica da cultura de Saccharomyces cerevisiae UFPEDA 1015 sobre Escherichia coli : Estudo do potencial probiótico

AZEVEDO, Denise Patricia Lins de January 2005 (has links)
Made available in DSpace on 2014-06-12T15:51:07Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo4472_1.pdf: 661660 bytes, checksum: c969e2f5be2692c337f82c089c2d5c06 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2005 / No Brasil, o aumento no isolamento de microrganismos resistentes aos antimicrobianos e a freqüente incidência de diarréias causadas por linhagens patogênicas de Escherichia coli ocasionam elevados gastos com hospitalização. Estes fatores têm contribuído para que vários pesquisadores busquem formas alternativas no tratamento das doenças infecciosas. Visando um provável uso de Saccharomyces cerevisiae UFPEDA 1015 como probiótico, a capacidade antagonista desta levedura sobre o crescimento das linhagens de E. coli UFPEDA 84, da coleção de cultura do Departamento de Antibióticos, LBFM10, produtora de &#946;- lactamase e uma do sorotipo entero-hemorrágica O157:H7 foi investigada. Os resultados foram comparados aos obtidos para a levedura Saccharomyces boulardii 17, cientificamente reconhecida como probiótica. Nos ensaios para avaliação do antagonismo microbiano, foram utilizadas culturas de E. coli e Saccharomyces, padronizadas em 106 e 107 UFC/mL, respectivamente. A inibição do crescimento da cultura bacteriana foi avaliada através da enumeração das células viáveis durante o período de 24 horas de incubação a 35ºC. Em todos os ensaios foram observadas reduções significativas (p<0,001) das culturas bacterianas. Ao término do experimento foram obtidas reduções superiores a 2,5 log10 UFC/mL, para E. coli UFPEDA 84 e 2,0 Log10 UFC/mL, para o sorotipo entero-hemorrágico O157:H7 e para a linhagem produtora de &#946;-lactamase. O caráter antagonista de S. cerevisiae UFPEDA 1015 sugere seu uso potencial no tratamento de diarréias causadas por E. coli, entretanto estudos adicionais para caracterização definitiva como probiótico são necessários
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Potencial de degradação hidrocarbonetos por fungos isolados poços e borra de petróleo

SANTANA, Josimas Alves de January 2003 (has links)
Made available in DSpace on 2014-06-12T15:52:10Z (GMT). No. of bitstreams: 1 license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2003 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / A biorremediação constitui uma emergente e promissora opção tecnológica para o tratamento de áreas contaminadas. Atualmente, em decorrência dos grandes acidentes marítimos, que vem ocasionando poluição ambiental por petróleo, vários estudos mostram o grande potencial dos microrganismos para melhorar a qualidade do meio ambiente através da biorremediação. Com vistas a esta aplicação, foram utilizados 21 fungos isolados da borra e 9 isolados de poços de petróleo do Canto do Amaro Bacia Petrolífera Potiguar, explorada pela Petrobras, situada a 3,5km da capital do Estado do Rio Grande do Norte - para testar a capacidade de degradar hidrocarbonetos do petróleo. Todos os fungos foram submetidos a uma seleção primária, através do método de Hanson (1993) o qual usa 2.6 Diclorofenol - Indolfenol (DCPIP), como aceptor de elétrons, para mostrar através de mudança de cor (de Azul para Incolor) do indicador a evidente oxidação microbiana de hidrocarbonetos. Neste ensaio primário, dos 30 fungos utilizados, 37% (11) da borra e 30% (9) de poços, mostraram-se capazes de degradar hidrocarbonetos do petróleo, enquanto 23% (7) demonstraram capacidade e o restante 10% (3) não demonstraram capacidade de usar os hidrocarbonetos do petróleo como fonte de Carbono. A seleção secundaria, cultivo em meio mineral solido, mostrou que 57% (17) dos fungos quando cultivados em meio solido com papel filtro na tampa, impregnado com óleo diesel, exibiram colônias com 9 cm de diâmetro após 30 dias de cultivo enquanto 33% (10) apresentaram colônias variando de 2 a 5cm e, em apenas 10% (3) não foi observado crescimento. Dos 17 fungos selecionados como os melhores nas seleções primária e secundária, 9 linhagens foram testados em meio mineral (Bushnell-Haas) com 1% de petróleo bruto e submetido a fermentação sob agitação durante 20 dias. Este primeiro resultado, obtido para fermentação em meio líquido, mostra que as linhagens DAUFPE-709, DAUFPE-738, DAUFPE-736 e DAUFPE-706 apresentaram degradação quase que total do petróleo bruto, comprovado através da cromatografia gasosa, em comparação com o controle. A linhagem DAUPE-739 que no ensaio secundário apresentou colônia com 2cm de diâmetro, comprovou sua baixa eficiência em degradar o petróleo bruto. Fermentações com concentrações de 5% e 10% do petróleo bruto para estas linhagens, mostraram, através dos perfis cromatográficos, que as linhagens DAUFPE-706, DAUFPE-709 e DAUFPE-736 apresentaram maior Capacidade em degradar hidrocarbonetos do petróleo, nas condições testadas. Podemos aferir que estas linhagens apresentam um grande potencial para degradar petróleo bruto, se mostrando promissoras para a utilização no processo de biorremediação
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Desenvolvimento de biossensores eletroquímico e piezelétrico de DNA para diagnósticos clínicos

José de Brito Silva, Jorge January 2004 (has links)
Made available in DSpace on 2014-06-12T15:53:13Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo5105_1.pdf: 1249968 bytes, checksum: 7bb0ccd96815e88755b0c108dfde3dc1 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2004 / No mundo investimento para o desenvolvimento de novos métodos de diagnóstico genético e de doenças infecciosas tem se tornado muito freqüente. Biossensores de DNA (genossensores) aparecem como uma nova e eficiente alternativa, com boa sensibilidade e baixo custo. Neste trabalho, o desenvolvimento de novos suportes alternativos para imobilização de ácidos nucléicos tem sido pesquisados com sucesso. A composição do grafite endurecido com polimercaptanas resultam em um suporte rígido, muito fácil de manipular, rápido endurecimento a temperatura ambiente e afinidade química com o DNA. Este suporte mostra um bom resultado da imobilização e na sensibilidade. Ao mesmo tempo foi mostrada uma nova metodologia de hibridização de probe de DNA com sua própria fita complementar, sem indicadores químicos ou métodos eletroquímicos. Uma fina camada de filme de quitosana foi preparada quimicamente e basificada com NaOH e foi usada para modificar um eletrodo de ouro a partir de um cristal de quartz microbalanceado (QCM). Este filme mostrou uma boa performance na imobilazação dos ácidos nucléicos, com uma melhor estabilidade de imobilização em comparação com ácidos nucléicos diretamente imobilizados sobre a superfície do eletrtodo (QCM). Biossensores piezoelétricos foram desenvolvidos para detecção de ácidos nucléicos de leucemia. Este aparelho mostrou uma boa performance sem modificação do eletrodo. Uma nova metodologia de hibridização via dry-adsorption em diferentes condições de temperatura mostrou excelente resultado 60°C. O biossensor LMC exibiu uma excelente especificidade quando se executou o ensaio de hibridização com diferentes seqüências de RNAs e ss-cDNA (E.coli). O biossensor LMC (QCM) é uma ferramenta satisfatória para o diagnóstico da LMC
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Processo de produção e otimização de biomassa e quitosana por Rhizopus arrhizus e aplicação biotecnológica

SILVA, Adamares Marques da 10 February 2015 (has links)
Submitted by Isaac Francisco de Souza Dias (isaac.souzadias@ufpe.br) on 2016-05-24T15:10:21Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Tese Dra. Adamares Marques.pdf: 1946328 bytes, checksum: 7e1614903239ea531ddb8e4647317cfb (MD5) / Made available in DSpace on 2016-05-24T15:10:21Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Tese Dra. Adamares Marques.pdf: 1946328 bytes, checksum: 7e1614903239ea531ddb8e4647317cfb (MD5) Previous issue date: 2015-02-10 / CAPES / A quitosana é um polissacarídeo natural, de interesse biotecnológico, ocorrendo nas paredes celulares de fungos (zygomycetes), bem como pode ser obtido da quitina através da desacetilação, formando uma maior proporção de cadeia polimérica com unidades de β1,4-2-amino-2-desoxi-D-glicose, e um menor número, de unidades β1,4-2-acetamino-2-desoxi-D-glicose da quitina. Considerando as suas propriedades fisco-químicas e bibiocompatibilidade), a quitosana é um polímero de grande interesse biotecnlógico. Visando esse interesse estudos foram realizados para a produção e otimização da produção de biomassa e quitosana por Rhizopus arrhizus, através da utilização de resíduos agroindustriais, como substratos, aplicando planejamento fatorial de 2², tendo como variáveis independentes milhocina (água de maceração de milho) e glicerina, oriunda do processamento do biodiesel, e como variáveis respostas produção de biomassa e de quitosana por R. arrhizus. Foi preparado um pré-inóculo do fungo contendo 40 discos de 6mm de diâmetro em 50mL de YMB (Yeast Malte Broth) durante 24h em Erlenmeyers de 250mL, após esse pré-inóculo foram transferidos para frascos de Erlenmeyers de 250mL contendo 100mL do meio com resíduos agroindustriais, de acordo com planejamentos, incubados a 28° C, sob agitação orbital de 150 rpm, durante 72h. A biomassa foi obtida por centrifugação a 5.000 g, por 15 min, seguido de lavagens com água, e posterior inativação por autoclavagem a 121ºC. A eficiência da biomassa como sorbente foi avaliada no processo de descoloração do corante têxtil vermelho congo. Os resultados demonstraram uma produção otimizada da biomassa de 22,5g/L e uma habilidade de descoloração de 80,85% do corante sintético de vermelho congo. A quitosana obtida da biomassa foi caracterizada por Infravermelho por Transformada de Fourier (FTIR) e difração de raio X para determinar o índice de cristalinidade (IC). A quitosana isolada apresentou um rendimento de 44,46 mg/g de biomassa, Grau de Desacetilação (DD) de 74% e índice de cristalinidade 44%. Investigações foram realizadas com a quitosana caracterizada, avaliando a eficiência do polímero como antifúngico, na proteção de tomates (Solanum lycopersicum var. cerasiforme) pelo ataque do fitopatógeno Botrytis cinerea. Estudos das condições de cultivo do fitopatógeno B. cinerea através de microscopia de luz demonstraram que 70% apresentavam tubos germinativos com 16h de incubação. A quitosana microbiológica demonstrou um CMI (Concentração mínima inibitória) de 100μg/mL contra o fitopatógeno B. cinerea. O tratamento de tomates contra o B. cinerea com quitosana na concentração do CMI apresentou resultados satisfatórios até com 19 dias de inoculação, quando comparado aos controles. Os resultados promissores obtidos demonstraram o excelente potencial biotecnológico de R. arrhizus como sorbente na descoloração de efluente têxtil, na produção de quitosana, bem como na inibição do crescimento do fitopatógeno B. cinerea, causador da degradação de frutos e hortaliças, em especial, pós-colheita, demonstrando ser um importante bioproduto biotecnológico para aplicação pela agroindústria. / Chitosan is a natural polysaccharide of biotechnological interest occurring in the cell walls of fungi (Zygomycetes) and derived from chitin by deacetylation forming a higher proportion of polymer chain units β1,4-2-amino-2- deoxy-D-glucose, and a smaller number of units β1,4-2-acetamido-2-deoxy-D-glucose chitin. Due to structural versatility, chitosan is a polymer of great biotechnological interest, considering its solubility properties, viscosity. Lack of toxicity were performed with biocompatibility. Studies were done about Rhizopus arrhizus biomass and chitosan production and optimization, through the use of the agro-industrial wastes as substrates, applying 2² factorial design, having as independent variables corn steep liquor and glycerin derived from biodiesel process, and as a response variable biomass and chitosan by R. arrhizus. The fungus was grown in 250ml Erlenmeyer flasks containing 100ml of medium containing industrial residues, according to the planning, with the inoculum of 6 disks of 40 mm in diameter fungus grown on YMA (Yeast Malt Agar), incubated at 28°C under an orbital agitation of 150 rpm for 72 hours. The biomass was obtained by centrifugation at 5,000 g for 15 min, followed by washing with water and subsequent inactivation by autoclaving at 121°C. The efficiency of biomass as a sorbent was evaluated in the process of bleaching a textile dye congo red. The best results have demonstrated an optimized production of biomass 22,5g/l, a bleaching ability to 80.85% of the textile dye. Chitosan was obtained from biomass, characterized by Fourier transform infrared (FTIR) spectra and X-ray diffraction to determine the crystallinity index (CI). The isolated chitosan showed a yield of 44.46 mg/g biomass degree of deacetylation (DD) of 74% and 44% crystallinity index, confirming the amorphous nature of the polymer. Investigations were carried out with the chitosan characterized by evaluating the efficiency of the polymer as an antifungal in tomatoes protection (Solanum lycopersicum var. Cerasiforme) the attack of pathogen Botrytis cinerea. Cell viability study of pathogen B. cinerea by light microscopy showed that 70% had germinated tubes 16h of incubation. Microbiological chitosan showed an MIC of 100μg/ml against pathogen B. cinerea. The processing of tomatoes against B. cinerea with chitosan concentration in the MIC showed satisfactory results until 19 days after inoculation, when compared to controls. Promising results demonstrate the excellent biotechnological potential of R. arrhizus as an effluent sorbent from bleaching in the textile, in the production of chitosan, as well as in inhibiting the pathogen B. cinerea, causing degradation of fruits and vegetables, in particular postharvest, proved to be an important crop protection.

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