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Estrutura populacional e estimação de parâmetros genéticos para características associadas ao desempenho reprodutivo em bovinos da raça Caracu / Population structure and genetic parameters estimation for economic importance traits in Caracu cattle

Barrera Carvajal, Alejandro [UNESP] 27 July 2017 (has links)
Submitted by Alejandro Barrera Carvajal null (alejandrobarreracarvajal@gmail.com) on 2017-10-05T04:26:06Z No. of bitstreams: 1 Dissertaçao_Alejandro_Barrera_Carvajal.pdf: 1237994 bytes, checksum: b3cc225c970d5d4a261bca85aee4a212 (MD5) / Approved for entry into archive by Monique Sasaki (sayumi_sasaki@hotmail.com) on 2017-10-09T16:57:38Z (GMT) No. of bitstreams: 1 barreracarvajal_a_me_jabo.pdf: 1237994 bytes, checksum: b3cc225c970d5d4a261bca85aee4a212 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-10-09T16:57:38Z (GMT). No. of bitstreams: 1 barreracarvajal_a_me_jabo.pdf: 1237994 bytes, checksum: b3cc225c970d5d4a261bca85aee4a212 (MD5) Previous issue date: 2017-07-27 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / O conhecimento da estrutura de uma população é importante quando se deseja manter a variabilidade genética em programas de melhoramento genético. As estimativas dos parâmetros genéticos permitem identificar as características de interesse econômico que podem responder a seleção direta ou indireta. Neste trabalho, objetivou-se avaliar a estrutura genética populacional e estimar os parâmetros genéticos para as características peso corporal da fêmea na entrada (PEP) e na saída (PSP) da primeira estação de monta, idade ao primeiro parto (IPP), peso corporal da vaca ao primeiro parto (PPP), peso corporal da vaca ao primeiro desmame (PPD) e perímetro escrotal aos 378 dias (PE378) em bovinos da raça Caracu, para avaliar critérios de seleção e os procedimentos de acasalamento para manter a variabilidade genética da população. A estrutura genética da população foi avaliada pelo tamanho efetivo (Ne), número efetivo de fundadores (fe), número efetivo de ancestrais (fa), intervalos de geração, coeficiente de endogamia (F), coeficiente de parentesco médio (AR) e integridade do pedigree. Os parâmetros genéticos foram estimados pelo método de máxima verossimilhança restrita (REML) por meio de modelo animal multi-característica. Os resultados obtidos para Ne na geração máxima, completa e equivalente, foram 180,90; 57,39; e 92,38, respectivamente. O valor para fe foi de 199 e para fa de 27. O coeficiente de endogamia médio e o parentesco médio foram 2,14% e 5,72%, respectivamente. Na avaliação da integridade do pedigree foram identificados 94,83% das mães e 93,82% dos pais com registros de origem. As estimativas de herdabilidade para as características de peso corporal variaram de 0,37 ± 0,09 (PPP) a 0,46 ± 0,08 (PPD). Para as características reprodutivas, as estimativas de herdabilidade foram 0,31 ± 0,10 para PE378 e 0,10 ± 0,06 para IPP. As correlações genéticas variaram de -0,37 ± 0,30 (PE378 e IPP) a 0,94 ± 0,06 (PSP e PPP). As correlações genéticas entre os pesos corporais medidos durante o primeiro ciclo reprodutivo e IPP indicaram que a seleção visando controlar o peso corporal nesse período não irá afetar a idade ao primeiro parto. A correlação genética favorável obtida entre PE378 e IPP (-0,37±0,30) indicou que a seleção para PE378 nos machos poderá favorecer a redução de idade ao primeiro parto das fêmeas. A partir dos parâmetros populacionais, concluiu-se que a variabilidade genética da população tem sido mantida, assim como os níveis de endogâmia, em decorrência do controle dos acasalamentos no decorrer das gerações. / The knowledge of the structure of the population is important to desired to maintain genetic variability in breeding programs. The genetic parameters estimates allow identifying economic interest traits that can respond to direct or indirect selection. The goal of this study was to evaluate the population genetic structure and to estimate the genetic parameters for the body weight of the cow at the beginning (WBF) and at the end (WEF) of the first breeding season, age at first calving (AFC), body weight of cow at first calving (WFC), body weight of cow at first weaning (WFW) and scrotal circumference measured at 378 days (SC378) in Caracu beef cattle, to assess the selection criteria and to indicate mating procedures to maintain the genetic diversity of the population. The genetic structure of the population was verified of the effective population size (Ne), the effective number of the founders (fe), the effective number of the ancestors (fa), the generational intervals, the inbreeding coefficient (F), the average relatedness (AR) and of the pedigree integrity. The restricted maximum likelihood method (REML) was used to estimate the genetic parameters under multitrait animal model. The maximum, complete and equivalent generation for Ne was 180.90; 57.39 and 92.38, respectively. For the fe were 199 and for fa 27. The average of the inbreeding coefficient and the AR were 2.14% and 5.72%, respectively. The integrity of the pedigree identified was 94.83% of the dam and 93.82% of the sire with known initial records Estimates of heritability for body weight traits ranged from 0.37 ± 0.09 (WFC) to 0.46 ± 0.08 (WFW). For the reproductive traits, the heritability estimates were 0.31 ± 0.10 for SC378 and 0.10 ± 0.06 for AFC. Genetic correlations ranged from -0.37 ± 0.30 (SC378 and AFC) to 0.94 ± 0.06 (WEF and WFC). Genetic correlations between body weights measured during the first reproductive cycle and the AFC indicated that selection to control body weight in this period will not affect age at first calving. The favorable genetic correlation obtained between SC378 and AFC (-0.37 ± 0.30) indicated that selection for SC378 of males may reduce the age at first calving of females. The population parameters showed that the genetic variability of the population has been maintained, as well as the levels of the inbreeding due to the control of mating during the generations.
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Estudo de associação de polimorfismos de nucleotídeo único (SNP) com características de temperamento em bovinos da raça Nelore /

Valente, Tiago da Silva. January 2016 (has links)
Orientador: Fernando Sebastian Baldi Rey / Coorientador: Fernando Sebastián Baldi Rey / Coorientador: Lucia Galvão de Albuquerque / Banca: Marcos Vinícius Gualberto Barbosa da Silva / Banca: Joslaine Noely dos Santos Gonçalves Cyrillo / Banca: Josineudson Augusto II de Vasconcelos Silva / Banca: Nedenia Bonvino Stafuzza / Resumo: A variabilidade individual no temperamento dos bovinos é um importante fator que afeta a rentabilidade das empresas pecuárias, em função dos efeitos negativos na produção, no bem-estar animal e na segurança do trabalhador. Assim, esta característica vem despertando interesse crescente de produtores e pesquisadores, com o objetivo de entender quais os fatores genéticos e ambientais que influenciam a expressão do temperamento e os efeitos sobre o desempenho dos bovinos. Desta forma, esta tese foi desenvolvida com o objetivo de estudar a associação genômica entre polimorfismos de nucleotídeo único (SNP) com diferentes indicadores do temperamento de bovinos da raça Nelore. Os objetivos específicos foram: 1) Estudar a associação genômica entre SNP e diferentes indicadores de temperamento; 2) Avaliar a existência de regiões do genoma associadas, simultaneamente, com distintos indicadores de temperamento; 3) Identificar genes e as respectivas funções biológicas que influenciam o temperamento e; 4) Estimar parâmetros genéticos para os diferentes testes de temperamento incluindo a informação genômica. O temperamento dos bovinos foi avaliado entre 2010 e 2015, durante o manejo de pesagem aos 18 meses de idade, utilizando os seguintes indicadores: 1) escore de movimentação (MOV); 2) escore de tensão (TENS); 3) escore de agitação no tronco de contenção (CS); 4) velocidade de fuga (VF) e; 5) escore de temperamento (ET). Os animais foram genotipados utilizando painel de alta densidade com ... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The individual variability on cattle temperament is an important factor affecting the profitability of beef cattle enterprises, due to its adverse effects in production, animal welfare and labor safety. Thus, this characteristic has increasing interest of producers and researchers, who aim to understand the genetic and environmental factors affecting the expression of temperament and its effect on cattle performance. Thus, the objective of this thesis was to study the genomic association between single nucleotide polymorphisms (SNP) and temperament indicators of Nellore cattle. The specific objectives were: 1) Study the genomic association between SNP and different indicators of temperament; 2) Assess the existence of genomic regions associated, simultaneously, with distinct temperament indicators; 3) Identify genes and their biological functions that influences temperament and; 4) Estimate genetic parameters for different temperament indicators using genomic information. The temperament was evaluated between 2010 and 2015, during the weighing handling at 18 months of age, using the following indicators: 1) movement score (MOV); 2) tension score (TENS); 3) crush score (CS); 4) flight speed (FS) and; 5) temperament score (TS). The animals were genotyped using a panel with 777,962 SNP (Illumina BovineHD Beadchip). All analyses to estimate variance components and genetic parameters, as well as the genome-wide association study (GWAS), were performed using a single-step procedure... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor
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Utilização de progesterona injetável de longa ação no manejo reprodutivo de fêmeas bovinas de corte / Use of long-acting progesterone on reproductive management of beef cows

Rocha, Dimas Corrêa January 2011 (has links)
O objetivo deste estudo foi determinar a farmacocinética de uma solução injetável de progesterona concentrada de longa ação. A partir deste conhecimento, elaborar novos experimentos para testar a funcionalidade do produto em protocolos de sincronização de estro e posteriormente avaliar seus efeitos na esfera reprodutiva da fêmea bovina. O experimento 1 determinou a concentração de progesterona plasmática ao longo do tempo a partir do tratamento com uma solução injetável de progesterona concentrada de longa ação (MAD4®), variando a dose e a via de administração, no sentido de demonstrar a farmacocinética do produto. Foram utilizadas 08 vacas Braford ovariectomizadas. A concentração de progesterona utilizada nos tratamentos 1 e 2 foi 250mg por via IM e SC. No tratamento 3 utilizou-se dose de 375mg de progesterona SC. O experimento 2 analisou o efeito de um tratamento hormonal com progesterona em vacas de corte em anestro pós-parto, avaliando a dinâmica folicular, níveis plasmáticos de progesterona e taxa de prenhez final. Foram utilizadas 09 vacas Braford. O grupo controle (n=4) recebeu no dia 0 estradiol 2mg IM e 7 dias depois PGF2alfa. O grupo tratamento (n=5) recebeu o mesmo protocolo com a adição de 250mg SC de progesterona no dia 0. Todas as vacas foram entouradas a partir do dia 7. O experimento 3 avaliou a sincronização de estros e a taxa de prenhez em novilhas de corte previamente tratadas com progesterona, estradiol e prostaglandina. Utilizou-se 36 novilhas, da raça Braford. O primeiro grupo T1 (n=16), no dia 0, recebeu 2mg de estradiol IM e 125mg de progesterona IM e 7 dias depois, uma aplicação de PGF2alfa. O segundo grupo T2 (n=20), recebeu o mesmo tratamento, sendo que, no dia 0, a aplicação de 375mg SC. As novilhas foram submetidas à inseminação convencional por 5 dias após aplicação de PGF2alfa e depois repassadas com touros. O experimento 4 avaliou a taxa de prenhez em vacas de corte com cria ao pé em anestro previamente tratadas com progesterona, estradiol e prostaglandina. Utilizou-se 140 vacas Angus e 128 Braford, com 30 a 60 dias pós-parto. O grupo controle (n=136) foi colocado com touros por um período de 60 dias. O grupo tratamento, no dia 0, recebeu estradiol 2mg IM e 250mg de progesterona injetável SC, sendo que após 2 dias foram colocadas com touros por um período de 58 dias. No experimento 1, o T1 250mg IM, T2 250mg SC e o T3 375mg SC atingiram o pico de progesterona as 12hs (2,48±2,05), 24hs (3,23±2,15) e 24hs (4,98±0,57) respectivamente, mantendo níveis superiores a 1ng/ml até 24hs, 96hs e >192hs, respectivamente. No experimento 2, no dia 9 o diâmetro médio dos folículos do grupo tratamento foi maior numéricamente quando comparado ao grupo controle (9,84mm vs. 8,03mm, respectivamente), os níveis de progesterona no grupo tratamento (7,94±5,29 ng/ml) tenderam a ser maiores do que no grupo controle (1,73±2,04ng/ml), ao final do experimento (P<0,06), a taxa de prenhez foi de 80% e 25% para tratamento e controle. No experimento 3, a taxa de manifestação de estro foi maior no tratamento 1 quando comparada ao tratamento 2 (93,2 vs. 20,0%, respectivamente), P<0,05. A prenhez final foi semelhante entre os grupos. No experimento 4, avaliando os períodos de monta, houve aos 40 dias uma maior prenhez no grupo tratamento (P<0,05). A taxa de prenhez ao final da temporada de monta foi maior no grupo tratamento comparado ao grupo controle, P<0,05 (51,52 vs. 29,41 %, respectivamente). Concluindo, doses e vias diferentes apresentaram concentrações plasmáticas diferentes em alguns momentos, caracterizando cada via de administração e doses utilizadas. O diâmetro folicular, os níveis plasmáticos de progesterona e prenhez final aumentaram numericamente após tratamento de progesterona e estradiol em vacas de corte em anestro pós-parto. O tratamento de novilhas com progesterona na dose de 375mg SC foi capaz de bloquear a manifestação de estro, não sendo indicada para este tipo de sincronização. Por outro lado, a sincronização de estros com 125mg IM de progesterona associada ao estradiol e PGF2alfa foi eficiente. A taxa de prenhez final não foi afetada pelas doses de progesterona. O tratamento de vacas de corte com cria ao pé com progesterona injetável de longa ação na dose de 250mg via SC associado ao estradiol foi capaz de antecipar as concepções e aumentar a taxa de prenhez final. / This study aimed to determine the pharmacokinetics of a long-action progesterone. To assist on new experiments testing the product on oestrus synchronization and analyzing the effects on breeding beef cattle. Experiment 1 verified serum progesterone concentration in ovariectomised cows to determine pharmacokinetics of MAD-4 ® product. A group of 08 Braford cows received 250 mg of progesterone by different routes of administration: intramuscular (treatment 1) or subcutaneous (treatment 2). In treatment 3, 375mg of progesterone was administered SC. Experiment 2 identified the effect of a hormone treatment with progesterone (MAD- 4 ®) on beef cows in postpartum anestrous, assessing the follicular dynamics, plasma levels of progesterone and following pregnancy rate. Nine braford suckling cows were used. The control group (n=4), received on day 0 estradiol 2mg IM and after 7 days an application of prostaglandin. The treatment group (n=5), received the same protocol as the control group with the addition on day 0 of 250mg progesterone SC. The cows were exposed to one bull from day 7 to day 60. Experiment 3 evaluated estrous synchronization and the rate of pregnancy in beef heifers previously treated with progesterone, estradiol and prostaglandin. Thirty six Braford heifers were used. The first group n = 16, T1, on day 0 received of estradiol 2 mg IM and 125mg of progesterone IM and after 7 days prostaglandin was administered. The second group n = 20, T2, received the same protocol with different concentration of progesterone on day 0 (375mg SC). After application of prostaglandin the heifers were inseminated for 5 days and than bred with bulls. Experiment 4 aimed to assess the pregnancy rate in multiparous suckling beef cows previously treated with progesterone, estradiol and prostaglandin. Angus (140) and Braford (128) cows with 30 to 60 days postpartum were used. The control group n = 136 was bred with bulls for a period of 60 days. The treatment group on day 0 received of estradiol 2 mg IM and 250 mg progesterone SC, and after 2 days was placed with bulls. In experiment 1, treatment 1 (250mg IM), treatment 2 ( 250mg SC) and treatment 3 (375mg SC) reached the progesterone peak at 12hs (2.48±2.05), 24hs (3.23±2.15) and 24hs (4.98±0.57), and manteined serum progesterone levels higher than 1ng/ml at 24hs, 96hs and >192hs, respectively. In experiment 2, follicular diameter on day 9 was 9.84mm vs. 8.03mm treatment and control groups respectively. The progesterone plasma levels in the treated group (7,94±5,29 ng/ml) tended to be higher than the control group (1.73±2.04 ng/ml) at the end of the experiment (P<0.06). The pregnancy rate was 25% (1/4) in the control group and 80% (4/5) in the treated group. In experiment 3 the manifestation of oestrus was superior in T1 when compared to T2 (93.2 vs. 20.0%, respectively, P < 0.05). The final pregnancy rate was similar between the groups. In experiment 4, there was a higher pregnancy rate (P < 0.05) in the treatment group at the 40th day evaluation. The pregnancy rate at the end of the breeding season was higher in the treatment group compared to the control group (51.52 vs. 29.41%, respectively, P < 0.05). Treatment of ovariectomised cows with long-acting injectable progesterone in different doses and different routes of administration resulted in significant different serum concentrations at some moments, according to route of administration and doses used. The ovarian follicular dynamics, plasma levels of progesterone and pregnancy rate showed positive numeric differences for the variables analyzed, although there was no statistical difference in postpartum beef cows. The treatment of heifers with long-acting injectable progesterone using 375mg SC was able to block the manifestation of oestrus, not being indicated for this type of synchronization. The sinchronizacion of oestrus with progesterone 125mg IM and estradiol associated to prostaglandin was efficient. The final pregnancy rate was not affected by progesterone doses. The treatment of multiparous suckling beef cows with long-acting injectable progesterone (250 mg SC) associated with estradiol was able to antecipate conception and increase the rate of pregnancy.
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Análise da eficiência bioeconômica em sistemas de produção de bovinos de corte na fronteira oeste do RS / Development of a method for efficiency evaluation bioeconomic in beef cattle production systems in border RS west

Marques, Pedro Rocha January 2015 (has links)
O objetivo do trabalho foi desenvolver uma proposta para avaliar a eficiência bioeconômica dos sistemas de produção de bovinos de corte na Fronteira Oeste do RS (capítulo II) e avaliar direcionadores de eficiência em sistemas de produção de bovinos de corte (capítulo III). Foram entrevistados 46 pecuaristas no período entre julho a dezembro de 2013, cujo sistema de produção está baseado em ciclo completo e com área maior ou igual a 900 ha. No tratamento dos dados e análises estatísticas foi utilizado o software Stastitical Analysis System 9.0 (SAS, 1999). Realizou-se a Análise de Correspondência Múltipla (ACM) para identificar a relação entre os pecuaristas e as variáveis analisadas (direcionadores e subfatores).Foram identificados três clusters, sendo estes nomeados em baixo (BNE), médio (MNE) e alto nível de eficiência (ANE).No capítulo II os subfatores resultantes de cada comparação (BNE x MNE; BNE x ANE e MNE x ANE) foram diferentes em função da comparação e da metodologia utilizada. Os pecuaristas BNE necessitam melhorar os processos básicos de produção como a gestão de tecnologias e o manejo sanitário em conjunto com a gestão financeira do sistema de produção. Os pecuaristas MNE necessitam otimizar o manejo de rotina com os animais, o manejo de pastagens e o cálculo de indicadores financeiros para tornarem-se altamente eficientes. No Capítulo III a realização da tipologia dos pecuaristas permitiu avaliar a eficiência bioeconômica dos sistemas de produção de bovinos de corte da Fronteira Oeste do RS. Os pecuaristas MNE foram mais eficientes bioeconomicamente em relação aos pecuaristas ANE em função do menor custo por hectare apresentado. A eficiência bioeconômica foi determinada pelo menor custo por hectare, pois a utilização das tecnologias não está sendo realizada da melhor forma tecnicamente. / The work's goal was to develop a proposal to evaluate the bioeconomic efficiency of beef cattle production systems in West Frontier RS (Chapter II) and evaluate drivers of efficiency in beef cattle production systems (Chapter III). We interviewed 46 ranchers in the period from July to December 2013, whose production system is based on full cycle and with an area greater than or equal to 900 ha. However, the statistical analysis considered 33 ranchers, because the other did not have the possibility to account for the productive and economic indicators for failure to record the data and were excluded from statistical analysis. In data processing and statistical analysis was used Stastitical Analysis System 9.0 (SAS, 1999) software. We performed multiple correspondence analysis (ACM) to identify the relationship between the farmers and the variables analyzed (drivers and sub-factors). Through cluster analysis, we identified the random formation of three clusters, which are named in low efficiency (LEL), average level of efficiency (MLE) and high efficiency (HLE) .In Chapter II sub-factors resulting from each comparison (LEL x MLE; LLE x HLE and MLE x HLE) were different depending on the comparison and the methodology used. Ranchers LLE need to improve the basic processes of production and management technologies and the sanitary management in conjunction with the financial management of the production system. Ranchers MLE need to optimize the routine handling with the animals, pasture management and the calculation of financial indicators to become highly efficient. In Chapter III the completion of the typology of ranchers allowed to evaluate the bioeconomic efficiency of beef cattle RS West Frontier production systems. Ranchers MLE were more efficient bioeconomically in relation to ranchers HLE due to the lower cost per hectare presented.
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Índices reprodutivos e características de desempenho em bovinos de corte infectados e não infectados pelo Herpesvírus bovino tipo 1 (HVB-1). / Reproductive rates and performance traits in beef catlle, infected and non infected by Bovine Herpesvirus 1(BHV-1).

Claudia Del Fava 05 February 2002 (has links)
O presente trabalho avaliou índices reprodutivos e características de desempenho em fêmeas bovinas de corte, infectadas e não infectadas pelo HVB-1, criadas sob manejo extensivo, em uma fazenda na região norte do Estado de São Paulo, Brasil. Animais das raças Gir, Guzerá, Nelore e Caracu foram avaliados no início da estação de monta e a ocorrência de touros e fêmeas reagentes ao HVB-1 pelo teste ELISA foi, respectivamente, 92,5% (37/40) e 54,2% (386/712), sendo o número de touros reagentes maior do que o de fêmeas (p < 0,0001). Foi verificado um aumento na proporção de fêmeas reagentes nas diferentes faixas etárias: 23,2% (32/138) de 2 a 3 anos; 45,2% (57/126) de 3 a 4 anos; 54,6% (59/108) de 4 a 5 anos e 70,0% (238/340) para &#61619; 5 anos (p < 0,0001). O número de matrizes que soroconverteram no período de um ano foi igual a 10,3% (58/561). O HVB-1 não reduziu o índice de prenhez de matrizes reagentes - 80,3% (310/386) e não reagentes - 74,5% (243/326) (p > 0,05) e nem a taxa de parição de matrizes reagentes - 97,7% (300/307) e não reagentes - 93,8% (225/240) (p < 0,05). O índice de prenhez e parição de fêmeas reagentes não diferiu segundo a raça, soroconversão, grupo genético do rebanho Nelore e faixa etária (p > 0,05). O coeficiente de natimortalidade de matrizes reagentes ao HVB-1 - 1,3% (4/300) não diferiu da encontrada para as não reagentes - 2,2% (5/225) (p > 0,05) e não foram observados efeitos de raça, soroconversão, grupo genético do rebanho Nelore e faixa etária (p > 0,05). O HVB-1 não afetou a média de algumas características de desempenho de fêmeas reagentes e não reagentes (p > 0,05), respectivamente, como ganho de peso médio diário durante a estação de monta (459,90 &#61617; 2,82 g e 466,63 &#61617; 2,87 g), condição corporal na entrada da estação de monta (6,89 &#61617; 0,08 e 6,99 &#61617; 0,08), condição corporal na saída da estação de monta (7,73 &#61617; 0,06 e 7,71 &#61617; 0,06) e peso à parição (419,17 &#61617; 3,34 kg e 425,97 &#61617; 3,22 kg). Concluiu-se que matrizes de corte infectadas pelo HVB-1 e não vacinadas, criadas sob condições adequadas de manejo zootécnico, apresentaram bons índices de prenhez, parição e natalidade, independente da raça, grupo genético e faixa etária. / This work evaluated reproductive rates and performance traits in beef cattle females, infected and non infected by BHV-1, bred under extensive management conditions, in a farm in the northern region of São Paulo State, Brazil. Gir, Guzerá, Nelore and Caracu purebred animals were monitorated at the beginning of the breeding season and the occurrence of bulls and females reagent to BHV-1 by ELISA test was, respectively, 92.5% (37/40) and 54.2% (386/712), with positive cases among bulls higher than among females (p < 0.0001). There was an increase in the proportion of reagent females in the different ages analyzed: 23.2% (32/138) from 2 to 3 years old; 45.2% (57/126) from 3 to 4 years old; 54.6% (59/108) from 4 to 5 years old and 70.0% (238/340) above 5 years old (p < 0.0001). The rate of females that seroconverted was 10,3% (58/561). BHV-1 did not interfere in the pregnancy rates of both reagent - 80.3% (310/386) and non-reagent - 74.5% (243/326) females (p > 0.05). It did not reduce the parturition rate of both reagent - 97.7% (300/307) and non-reagent - 93.8% (225/240) females, either (p < 0.05). The pregnancy and parturition rates of reagent females did not differ according to breed, seroconversion, Nelore herd genetic group and age (p > 0.05). Total rate of stillbirths in BHV-1 reagent females - 1.3% (4/300) did not differ from that found in non-reagent females - 2.2%(5/225) (p > 0.05) and did not differ acording to breed, seroconversion, Nelore herd genetic group and age (p > 0.05). BHV-1 did not affect performance traits for reagent and non-reagent females (p > 0.05), respectivelly, to daily weight gain during the breeding season (459.90 &#61617; 2.82 g and 466.63 &#61617; 2.87 g), body condition score at the beginning of the breeding season (6.89 &#61617; 0.08 and 6.99 &#61617; 0.08), body condition score at the end of the breeding season (7.73 &#61617; 0.06 and 7.71 &#61617; 0.06), weight at parturition (419.17 &#61617; 3.34 kg and 425.97 &#61617; 3.22 kg). It was concluded that non-vaccinated beef cattle females infected by BHV-1 and bred under adequate management conditions, presented good pregnancy, parturition and birth rates, no matter the breed, genetic group and age.
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Perfil de governança e a coordenação de alianças estratégicas do sistema agroindustrial da carne bovina brasileira / Governance profile and the coordination of strategic alliances of the Brazilian beef agribusiness system

Luis Otávio Bau Macedo 31 March 2009 (has links)
O estudo buscou identificar a relação entre o perfil de governança de alianças brasileiras da pecuária de corte bovina e a coordenação dos agentes. A análise utilizou o arcabouço da teoria dos custos de transação para identificar as dimensões das transações, especificidade de ativos, freqüência e incerteza, e os conceitos de escopo relativo e embeddedness para a avaliação da densidade das relações dos agentes. Realizou-se uma descrição da pecuária de corte bovina nacional que caracterizou o processo de modernização da atividade a partir da análise das práticas de produção rural, a evolução das liberações de recursos de crédito rural e a expansão da presença internacional da carne bovina brasileira. A pesquisa também levantou a literatura sobre a coordenação dos agentes do sistema agroindustrial, produtores rurais, indústria frigorífica e varejo, tanto em termos internacionais como a partir da experiência nacional. Desenvolveu-se, por fim, uma pesquisa empírica junto a quatro alianças nacionais, cada qual liderada por um agente pertencente a um elo do processo produtivo, em que se obtiveram indícios que a coordenação entre os agentes é favorecida, tanto mediante a constituição de rede de relacionamentos horizontais, sob a liderada dos produtores rurais, como através da constituição de uma rede hierárquica, sob o controle do varejo. / The research aimed at finding the link between the governance structures and the coordination in Brazilian beef alliances. The analysis is based upon the transaction cost economics to identify the transaction dimensions, investment specificity, frequency and uncertainty, and on the concepts of relative scope and embbededness in order to finding the relationships density among agents. A description of the Brazilian beef agroindustrial system was developed in order to understand its modernization process based upon the analysis of its rural production practices, the increasing pattern of rural financing operations, and the Brazilian beef exports growth at the international markets. The research also has summed up the beef agribusiness system literature about players coordination: farmers, pack industry and retailers, at international and national levels. It was performed an empirical research on four Brazilian beef alliances each one with the leadership performed by a specific agent in the production chain: farmers, pack industry and retailing. It was found evidence that agents coordination is strengthened by horizontal network of dense relationships implemented by farmers leadership, and also through retailer vertical control.
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Análise da eficiência bioeconômica em sistemas de produção de bovinos de corte na fronteira oeste do RS / Development of a method for efficiency evaluation bioeconomic in beef cattle production systems in border RS west

Marques, Pedro Rocha January 2015 (has links)
O objetivo do trabalho foi desenvolver uma proposta para avaliar a eficiência bioeconômica dos sistemas de produção de bovinos de corte na Fronteira Oeste do RS (capítulo II) e avaliar direcionadores de eficiência em sistemas de produção de bovinos de corte (capítulo III). Foram entrevistados 46 pecuaristas no período entre julho a dezembro de 2013, cujo sistema de produção está baseado em ciclo completo e com área maior ou igual a 900 ha. No tratamento dos dados e análises estatísticas foi utilizado o software Stastitical Analysis System 9.0 (SAS, 1999). Realizou-se a Análise de Correspondência Múltipla (ACM) para identificar a relação entre os pecuaristas e as variáveis analisadas (direcionadores e subfatores).Foram identificados três clusters, sendo estes nomeados em baixo (BNE), médio (MNE) e alto nível de eficiência (ANE).No capítulo II os subfatores resultantes de cada comparação (BNE x MNE; BNE x ANE e MNE x ANE) foram diferentes em função da comparação e da metodologia utilizada. Os pecuaristas BNE necessitam melhorar os processos básicos de produção como a gestão de tecnologias e o manejo sanitário em conjunto com a gestão financeira do sistema de produção. Os pecuaristas MNE necessitam otimizar o manejo de rotina com os animais, o manejo de pastagens e o cálculo de indicadores financeiros para tornarem-se altamente eficientes. No Capítulo III a realização da tipologia dos pecuaristas permitiu avaliar a eficiência bioeconômica dos sistemas de produção de bovinos de corte da Fronteira Oeste do RS. Os pecuaristas MNE foram mais eficientes bioeconomicamente em relação aos pecuaristas ANE em função do menor custo por hectare apresentado. A eficiência bioeconômica foi determinada pelo menor custo por hectare, pois a utilização das tecnologias não está sendo realizada da melhor forma tecnicamente. / The work's goal was to develop a proposal to evaluate the bioeconomic efficiency of beef cattle production systems in West Frontier RS (Chapter II) and evaluate drivers of efficiency in beef cattle production systems (Chapter III). We interviewed 46 ranchers in the period from July to December 2013, whose production system is based on full cycle and with an area greater than or equal to 900 ha. However, the statistical analysis considered 33 ranchers, because the other did not have the possibility to account for the productive and economic indicators for failure to record the data and were excluded from statistical analysis. In data processing and statistical analysis was used Stastitical Analysis System 9.0 (SAS, 1999) software. We performed multiple correspondence analysis (ACM) to identify the relationship between the farmers and the variables analyzed (drivers and sub-factors). Through cluster analysis, we identified the random formation of three clusters, which are named in low efficiency (LEL), average level of efficiency (MLE) and high efficiency (HLE) .In Chapter II sub-factors resulting from each comparison (LEL x MLE; LLE x HLE and MLE x HLE) were different depending on the comparison and the methodology used. Ranchers LLE need to improve the basic processes of production and management technologies and the sanitary management in conjunction with the financial management of the production system. Ranchers MLE need to optimize the routine handling with the animals, pasture management and the calculation of financial indicators to become highly efficient. In Chapter III the completion of the typology of ranchers allowed to evaluate the bioeconomic efficiency of beef cattle RS West Frontier production systems. Ranchers MLE were more efficient bioeconomically in relation to ranchers HLE due to the lower cost per hectare presented.
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Utilização de progesterona injetável de longa ação no manejo reprodutivo de fêmeas bovinas de corte / Use of long-acting progesterone on reproductive management of beef cows

Rocha, Dimas Corrêa January 2011 (has links)
O objetivo deste estudo foi determinar a farmacocinética de uma solução injetável de progesterona concentrada de longa ação. A partir deste conhecimento, elaborar novos experimentos para testar a funcionalidade do produto em protocolos de sincronização de estro e posteriormente avaliar seus efeitos na esfera reprodutiva da fêmea bovina. O experimento 1 determinou a concentração de progesterona plasmática ao longo do tempo a partir do tratamento com uma solução injetável de progesterona concentrada de longa ação (MAD4®), variando a dose e a via de administração, no sentido de demonstrar a farmacocinética do produto. Foram utilizadas 08 vacas Braford ovariectomizadas. A concentração de progesterona utilizada nos tratamentos 1 e 2 foi 250mg por via IM e SC. No tratamento 3 utilizou-se dose de 375mg de progesterona SC. O experimento 2 analisou o efeito de um tratamento hormonal com progesterona em vacas de corte em anestro pós-parto, avaliando a dinâmica folicular, níveis plasmáticos de progesterona e taxa de prenhez final. Foram utilizadas 09 vacas Braford. O grupo controle (n=4) recebeu no dia 0 estradiol 2mg IM e 7 dias depois PGF2alfa. O grupo tratamento (n=5) recebeu o mesmo protocolo com a adição de 250mg SC de progesterona no dia 0. Todas as vacas foram entouradas a partir do dia 7. O experimento 3 avaliou a sincronização de estros e a taxa de prenhez em novilhas de corte previamente tratadas com progesterona, estradiol e prostaglandina. Utilizou-se 36 novilhas, da raça Braford. O primeiro grupo T1 (n=16), no dia 0, recebeu 2mg de estradiol IM e 125mg de progesterona IM e 7 dias depois, uma aplicação de PGF2alfa. O segundo grupo T2 (n=20), recebeu o mesmo tratamento, sendo que, no dia 0, a aplicação de 375mg SC. As novilhas foram submetidas à inseminação convencional por 5 dias após aplicação de PGF2alfa e depois repassadas com touros. O experimento 4 avaliou a taxa de prenhez em vacas de corte com cria ao pé em anestro previamente tratadas com progesterona, estradiol e prostaglandina. Utilizou-se 140 vacas Angus e 128 Braford, com 30 a 60 dias pós-parto. O grupo controle (n=136) foi colocado com touros por um período de 60 dias. O grupo tratamento, no dia 0, recebeu estradiol 2mg IM e 250mg de progesterona injetável SC, sendo que após 2 dias foram colocadas com touros por um período de 58 dias. No experimento 1, o T1 250mg IM, T2 250mg SC e o T3 375mg SC atingiram o pico de progesterona as 12hs (2,48±2,05), 24hs (3,23±2,15) e 24hs (4,98±0,57) respectivamente, mantendo níveis superiores a 1ng/ml até 24hs, 96hs e >192hs, respectivamente. No experimento 2, no dia 9 o diâmetro médio dos folículos do grupo tratamento foi maior numéricamente quando comparado ao grupo controle (9,84mm vs. 8,03mm, respectivamente), os níveis de progesterona no grupo tratamento (7,94±5,29 ng/ml) tenderam a ser maiores do que no grupo controle (1,73±2,04ng/ml), ao final do experimento (P<0,06), a taxa de prenhez foi de 80% e 25% para tratamento e controle. No experimento 3, a taxa de manifestação de estro foi maior no tratamento 1 quando comparada ao tratamento 2 (93,2 vs. 20,0%, respectivamente), P<0,05. A prenhez final foi semelhante entre os grupos. No experimento 4, avaliando os períodos de monta, houve aos 40 dias uma maior prenhez no grupo tratamento (P<0,05). A taxa de prenhez ao final da temporada de monta foi maior no grupo tratamento comparado ao grupo controle, P<0,05 (51,52 vs. 29,41 %, respectivamente). Concluindo, doses e vias diferentes apresentaram concentrações plasmáticas diferentes em alguns momentos, caracterizando cada via de administração e doses utilizadas. O diâmetro folicular, os níveis plasmáticos de progesterona e prenhez final aumentaram numericamente após tratamento de progesterona e estradiol em vacas de corte em anestro pós-parto. O tratamento de novilhas com progesterona na dose de 375mg SC foi capaz de bloquear a manifestação de estro, não sendo indicada para este tipo de sincronização. Por outro lado, a sincronização de estros com 125mg IM de progesterona associada ao estradiol e PGF2alfa foi eficiente. A taxa de prenhez final não foi afetada pelas doses de progesterona. O tratamento de vacas de corte com cria ao pé com progesterona injetável de longa ação na dose de 250mg via SC associado ao estradiol foi capaz de antecipar as concepções e aumentar a taxa de prenhez final. / This study aimed to determine the pharmacokinetics of a long-action progesterone. To assist on new experiments testing the product on oestrus synchronization and analyzing the effects on breeding beef cattle. Experiment 1 verified serum progesterone concentration in ovariectomised cows to determine pharmacokinetics of MAD-4 ® product. A group of 08 Braford cows received 250 mg of progesterone by different routes of administration: intramuscular (treatment 1) or subcutaneous (treatment 2). In treatment 3, 375mg of progesterone was administered SC. Experiment 2 identified the effect of a hormone treatment with progesterone (MAD- 4 ®) on beef cows in postpartum anestrous, assessing the follicular dynamics, plasma levels of progesterone and following pregnancy rate. Nine braford suckling cows were used. The control group (n=4), received on day 0 estradiol 2mg IM and after 7 days an application of prostaglandin. The treatment group (n=5), received the same protocol as the control group with the addition on day 0 of 250mg progesterone SC. The cows were exposed to one bull from day 7 to day 60. Experiment 3 evaluated estrous synchronization and the rate of pregnancy in beef heifers previously treated with progesterone, estradiol and prostaglandin. Thirty six Braford heifers were used. The first group n = 16, T1, on day 0 received of estradiol 2 mg IM and 125mg of progesterone IM and after 7 days prostaglandin was administered. The second group n = 20, T2, received the same protocol with different concentration of progesterone on day 0 (375mg SC). After application of prostaglandin the heifers were inseminated for 5 days and than bred with bulls. Experiment 4 aimed to assess the pregnancy rate in multiparous suckling beef cows previously treated with progesterone, estradiol and prostaglandin. Angus (140) and Braford (128) cows with 30 to 60 days postpartum were used. The control group n = 136 was bred with bulls for a period of 60 days. The treatment group on day 0 received of estradiol 2 mg IM and 250 mg progesterone SC, and after 2 days was placed with bulls. In experiment 1, treatment 1 (250mg IM), treatment 2 ( 250mg SC) and treatment 3 (375mg SC) reached the progesterone peak at 12hs (2.48±2.05), 24hs (3.23±2.15) and 24hs (4.98±0.57), and manteined serum progesterone levels higher than 1ng/ml at 24hs, 96hs and >192hs, respectively. In experiment 2, follicular diameter on day 9 was 9.84mm vs. 8.03mm treatment and control groups respectively. The progesterone plasma levels in the treated group (7,94±5,29 ng/ml) tended to be higher than the control group (1.73±2.04 ng/ml) at the end of the experiment (P<0.06). The pregnancy rate was 25% (1/4) in the control group and 80% (4/5) in the treated group. In experiment 3 the manifestation of oestrus was superior in T1 when compared to T2 (93.2 vs. 20.0%, respectively, P < 0.05). The final pregnancy rate was similar between the groups. In experiment 4, there was a higher pregnancy rate (P < 0.05) in the treatment group at the 40th day evaluation. The pregnancy rate at the end of the breeding season was higher in the treatment group compared to the control group (51.52 vs. 29.41%, respectively, P < 0.05). Treatment of ovariectomised cows with long-acting injectable progesterone in different doses and different routes of administration resulted in significant different serum concentrations at some moments, according to route of administration and doses used. The ovarian follicular dynamics, plasma levels of progesterone and pregnancy rate showed positive numeric differences for the variables analyzed, although there was no statistical difference in postpartum beef cows. The treatment of heifers with long-acting injectable progesterone using 375mg SC was able to block the manifestation of oestrus, not being indicated for this type of synchronization. The sinchronizacion of oestrus with progesterone 125mg IM and estradiol associated to prostaglandin was efficient. The final pregnancy rate was not affected by progesterone doses. The treatment of multiparous suckling beef cows with long-acting injectable progesterone (250 mg SC) associated with estradiol was able to antecipate conception and increase the rate of pregnancy.
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Farelo de trigo e ureia em suplementos para bezerros de corte lactentes em pastejo / Wheat bran and urea in supplements for grazing beef calves

Silva, Ághata Elins Moreira 16 July 2018 (has links)
Submitted by MARCOS LEANDRO TEIXEIRA DE OLIVEIRA (marcosteixeira@ufv.br) on 2018-10-04T14:01:24Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 793170 bytes, checksum: f6befab436af33998c401756aa277aca (MD5) / Made available in DSpace on 2018-10-04T14:01:24Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 793170 bytes, checksum: f6befab436af33998c401756aa277aca (MD5) Previous issue date: 2018-07-16 / Objetivou-se avaliar os efeitos da substituição do farelo de soja e milho pelo farelo de trigo e ureia na suplementação de bezerros de corte lactentes em pastos de Brachiaria decumbens sobre o desempenho, características nutricionais e metabólicas. Foram utilizados 52 bezerros Nelore com idade inicial de 87±4,95 dias e peso inicial médio de 111,3±5,98 kg, distribuídos em delineamento inteiramente casualizado com dupla estrutura de erro, com 4 tratamentos (13 observações por tratamento) e 2 repetições. Durante o período experimental de 140 dias os tratamento testados consistiram de progressiva substituição do farole de soja e milho por farelo de trigo e ureia (0, 50 e 100%) e um grupo controle que recebeu apenas mistura mineral. Os suplementos foram formulados para conter 200g PB/kg MS, sendo fornecidos na quantidade de 7g/kg de peso corporal. Para todos os procedimentos estatísticos foi utilizado o PROC MIXED do SAS (versão 9.4) adotando-se α = 0,10 como nível crítico para probabilidade de ocorrência do erro tipo I. O consumo de MS, MO, PB, NDT, CNF, MOD e a relação PB:MOD foi maior para os animais que receberam suplementação quando comparados aos não suplementados. Entre os animais que receberam suplemento múltiplo, observou-se efeito linear decrescente para os consumos de CNF e MOD, já para o consumo de FDNi (kg/dia e g/kg PC), FDNcp (g/kg PC) e PB:MOD foi observado efeito linear crescente. A digestibilidade de CNF foi maior para os animais que receberam suplemento, e entre estes animais observou-se resposta linear decrescente para a digestibilidade de MS, MO, CNF, e MOD. Além disso, observou- se reposta quadrática na digestibilidade FDNcp para estes animais. Observou-se diferença entre o PCF e GMD ao se comparar os animais que receberam suplementos múltiplos com os animais que receberam apenas mistura mineral. As concentrações de IGF-1 e NUS foram maiores para os animais que recebiam suplementos múltiplos. Além disso, para o IGF-1, foi observada uma redução linear na sua concentração sérica com a substituição. Recomenda-se a substituição do farelo de soja e milho pelo farelo de trigo e ureia como fonte de suplementação múltipla na quantidade de 7g/kg do peso corporal para bezerros de corte lactentes em pastagens tropicais, desde que seja mais econômico. / The aim of this study was to evaluate the effects of soybean and corn meal replacement for wheat bran and urea on the supplementation of suckling beef calves on Brachiaria decumbens pastures on performance, nutritional and metabolic characteristics. Fifty two Nellore calves with 87±4,95 days of age and initial body weight of 111,3±5.98 kg were distributed into a completely randomized design with double error structure, with 4 treatments (13 observations per treatment) and 2 replicates. During the experimental period of 140 days, the tested treatments consisted of progressive replacement of soybean and corn meal for wheat bran and urea (0, 50, and 100%) and a control group that received only mineral mixture. Supplements were formulated to contain 200g CP/kg DM, provided in the amount of 7g/kg of body weight. For all statistical procedures it was used the PROC MIXED of SAS (version 9.4), adopting α = 0,10 as the critical level for probability of occurrence for type I error. The DM, OM, CP, TDN, DOM intake and CP: DOM ratio was higher for animals receiving supplementation when compared to those not supplemented. Among the animals receiving multiple supplementation, there was a linear decreasing effect for the NFC and DOM intake, on the other hand, for the NDFi (kg/day and g/kg BW), NDFap (g/kg BW) intake and CP:DOM ratio was observed linear increasing effect. The NFC digestibility was higher for the animals that received supplement, and among these animals a linear decreasing response for the DM, OM, NFC and DOM digestibility was observed. Furthermore, it was observed a quadratic response on NDFap digestibility of these animals. Differences were observed between FBW and ADG when comparing animals receiving multiple supplements with animals receiving only mineral mix. IGF-1 and SUN concentrations were higher for animals receiving multiple supplements. In addition, for IGF-1, a linear decreasing in serum concentration was observed with the substitution. The replacement of soybean and corn meal for wheat bran and urea as a source of multiple supplementation in the amount of 7 g/kg of body weight for suckling beef calves on tropical pastures is recommended, since it is more economical.
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Genomic information for breed determination, multibreed evaluation, and estimation of variance components in large populations / Informações genômicas para determinação racial, avaliação genética multirracial e estimação de componentes de variância em grandes populações

Junqueira, Vinícius Silva 04 June 2018 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2018-08-31T11:39:58Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 845120 bytes, checksum: cda774f351f72a77d5d0898c2b153f7d (MD5) / Made available in DSpace on 2018-08-31T11:39:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 845120 bytes, checksum: cda774f351f72a77d5d0898c2b153f7d (MD5) Previous issue date: 2018-06-04 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / A disponibilidade de uso de informações genômicas trouxe grandes oportunidades de aumento do ganho genético em sistemas produtivos de gado de corte. Apesar dos benefícios já conhecidos, implementação em larga escala nas condições nacionais ainda é um grande desafio principalmente pelo relativo alto custo de genotipagem. Uma alternativa economicamente viável é o desenvolvimento de painéis de marcadores SNP customizados para objetivos de melhoramento estrategicamente estabelecidos para características de interesse. A implementação dessa proposta tem maior impacto para os animais jovens. O objetivo desse estudo foi identificar o menor número necessário de marcadores do tipo SNP para diferenciar animais das raças Hereford, Nelore, Brahman e Braford genotipados com o painel 777K chip HD para bovinos. Adicionalmente, comparou-se o impacto na predição da proporção racial utilizando-se diferentes painéis reduzidos de marcadores do tipo SNP. Para isso, foram utilizados quatro diferentes métodos para a seleção de marcadores altamente informativos para a diferenciação racial. O software Admixture foi utilizado para os cálculos de proporção racial utilizando os painéis customizados. Os resultados observados nesse estudo sugerem a possibilidade de definir indivíduos às respectivas raças utilizando um painel de 24 marcadores do tipo SNP (isto é, 8 marcadores por raça pura). Informações de pedigree são por natureza incompletas e comumente não são bem definidas porque varias das ligações genéticas existentes não são conhecidas. A genômica trouxe grandes oportunidades para o cálculo do parentesco entre os indivíduos de uma população. Um dos principais desafios em implementações genômicas é a correta definição da população referência para o uso simultâneo das informações de pedigree e genômica. O conceito de metafundadores é baseado na definição de pseudo-indivíduos que descrevem os relacionamentos entre e dentre os indivíduos da população base. O objetivo desse estudo foi avaliar os impactos do uso de metafundadores ao estimar valores genéticos e sua habilidade preditiva utilizando a metodologia single- step GBLUP (ssGBLUP) em uma população multirracial. Três diferentes cenários foram adotados nesse estudo para a estimação de componentes de variância e predição dos valores genéticos: BLUP tradicional, ssGBLUP e ssGBLUP com inclusão de metafundadores. Um total de 28 metafundadroes foram definidos no modelo ssGBLUP+metafundadores. De forma geral, os modelos genômicos apresentaram maior habilidade preditiva. Sendo o modelo com inclusão de metafundadores o que apresentou maior habilidade preditiva. O método da máxima verossimilhança restrita (REML) é um método comumente utilizado para a estimação de componentes de variância. Por ser implementado em modelos mistos, apresenta estimativas corrigidas para efeitos de seleção. De forma geral, todos os animais genotipados são utilizados nos cálculos para a predição dos valores genéticos. O objetivo desse estudo foi avaliar quantas gerações são necessárias para acurada estimação de componentes de variância com o algoritmo para animais provados e jovens (APY) em uma população simulada com restrições de seleção. O uso de menor número de gerações reduziu a habilidade do modelo BLUP em estimar a herdabilidade simulada (0.30). A redução na estimação da herdabilidade pelos modelos genomicos são menores do que os modelos baseados em informações de pedigree. Os modelos genômicos apresentaram em média maior correlação que os modelo BLUP. Os resultados desse estudo sugerem que não é necessário grande número de gerações para acurada estimação dos componentes de variância e dos valores genéticos. O algoritmo APY não afeta a estimação dos componentes de variância. Duas gerações extras de animais não genotipados são suficientes para acurado cálculo dos componentes de variância, valores genéticos e também acurácia de predição dos valores genéticos. / The knowledge on breed composition is of major importance under design of breeding schemes. With this respect, the estimation of such parameters must be as accurately as possible. Currently, most of genetic evaluation programs has been predicting breed composition based on pedigree datasets; but, such estimations only accounts for the expected (allele frequency) contributions across ancestors After the development and establishment of single nucleotide polymorphism (SNP) genotyping platforms on the last decade, an interest in genetic diversity studies has arisen and especially the study of individuals’ origin. The objective of the present study was to evaluate the minimum required number of ancestry informative markers necessary to differentiate Hereford, Nelore, Brahman and Braford breeds genotyped with 777 K Illumina Bovine HD Bead Chip. In addition, we also compared the effects of different panels size on breed composition inference under different AIMs methods. To that, it was used the high-density Illumina Bovine HD BeadChip with more than 777 K SNPs to elucidate the structure of Hereford, Nelore, Brahman and Braford populations. Three different ancestry informative marker methods were used to distinguish such populations. Additionally, random marker selection was considered. Admixture software was used to infer breed composition using very low-density SNP panels assembled with AIMs. Our results suggest that is possible to assign individuals to populations with high confidence using less than 8 SNP markers selected per breed. Although millions of SNP markers have been identified, only few of them are needed to accurately infer ancestry in a cost-effective manner. Pedigree information is by nature incomplete and commonly not well established simply because many of the true genetic ties existent between individuals are not a priori known or they can be even wrong. Genomic era brought new opportunities when calculating relationships between individuals. The challenge under genomic approaches is the correct definition of genetic base by the use of pedigree and genomic data. Genetic base may change as more individuals are included and are inadequately defined if populations are genetically structured. Metafounder concept relies on the definition of pseudo-individuals that describes some level of within and/or across genetic relationship between base population. The purpose of this study was to evaluate metafounder theory to estimate breeding values and the predictive ability under a single-step approach for a multibreed population. Three different scenarios were adopted to estimate variance components and to compute breeding values: pedigree-based model, single- step GBLUP and single-step GBLUP with addition of metafounders. A total of 28 different metafounders were included in the ssGBLUP+metafounder model. In general, it was possible to note that genomic models were able to greater ability to predict the future performance. Among genomic models, the inclusion of metafounder information could increment even more the predictive ability under cross-validation approach. Restricted maximum likelihood (REML) is a popular method for parameter estimation. Because it uses the mixed model equations, it is resistant to selection bias and efficient implementations are currently available. When genomic information is available, two versions of REML may be applicable. When only genotyped animals have phenotypes, genomic REML can be applied with a genomic relationship matrix. When only a fraction of animals is genotyped, a single-step REML is applicable. In general, it is of interest to include many genotyped animals in parameter estimation and into evaluations, to account for genomic selection or pre- selection. The aim of this study was to investigate to what extent generations truncation affects estimates for a simulated population under selection.The use of less generations reduced the ability of pedigree-based model in estimating the benchmark heritability (0.30). The decrease in heritabilities based on genomic information was less than using only pedigree relationships. Genomic models provided greater correlations than pedigree-based model; on average 25 points. Single-step genomic models do not require a deeper pedigree relationship to estimate reliable variance components and breeding values. The use of APY algorithm does not affect the estimation of variance components. An extra of 2 ungenotyped generations are sufficient to compute reliable variance components; as well as breeding values and accuracies.

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