A região objeto do presente estudo compreende uma área localizada às margens do rio Taquari, no município de Triunfo (RS), que pertence à bacia hidrográfica Taquari – Antas, com contaminação de solo específica por preservantes de madeira, cujo passivo ambiental são pentaclorofenol, creosoto e hidrosal arseniato de cobre cromado. O local é percorrido por corpos d’água associados à drenagem principal, formando sub-bacias. Através dos ensaios de microssuspensão com Salmonella/microssoma e Allium cepa, o trabalho teve por objetivo relacionar a atividade genotóxica com rotas de dispersão de poluentes. Analisando a área do sítio contaminado a partir dos extratos orgânicos do material drenado para o corpo d’água, após eventos de chuvas significantes e análises de extrato orgânico, água intersticial e sedimento bruto do rio. No teste Salmonella/microssoma, diversas linhagens permitiram avaliar diferentes danos ao DNA, como deslocamento no quadro de leitura (TA97a e TA98) e substituição de pares de base (TA100) em ausência (-S9) e presença (+S9) de ativação metabólica. No teste de Allium, foi possível verificar alterações em nível cromossômico. Respostas positivas de mutagenicidade pelo teste de Salmonella/microssoma do material exportado para fora da área do sítio indicam que este material pode estar sendo carreado para o rio Taquari. Isto pode ser evidenciado pela atividade mutagênica detectada em ambos os testes, na amostra de sedimento do rio coletada em frente ao sítio contaminado. O ponto a jusante no rio em relação ao ponto em frente ao sítio contaminado também foi avaliado e atividade mutagênica foi detectada, já o ponto de referência a montante mostrou pequena atividade mutagênica proveniente de fonte de contaminação diferente. Entretanto, tais poluentes não foram detectados no ponto abaixo. Os bioensaios empregados puderam indicar um possível risco de contaminação para o rio Taquari e mostraram ser eficientes para avaliar a mutagenicidade no material drenado do solo e no sedimento do rio. Embora a atividade mutagênica possa ser relacionada em parte à presença de hidrocarbonetos policíclicos aromáticos nos extratos orgânicos das amostras, derivados do preservante de madeira creosoto ou de fontes antrópicas diversas, outros compostos orgânicos podem ser encontrados nos extratos, uma vez que resíduos de pentaclorofenol estão presentes no sítio. Além disso, a complexidade das amostras de sedimento do rio poderia ainda sofrer a influência de traços de metais pesados. / Mutagenic activity, using Salmonella/microsome and Allium cepa bioassay, was employed as markers to detect pollutant dispersion routes in contaminated soil site covered by water bodies associated with the drainage toward the river. The site of the present study comprises an area located along the banks of the Taquari River, in the city Triunfo (RS) belonging to the Taquari - Antas river basin with identified environmental contaminants (pentachlorophenol, creosote and hydrosalt CCA). The Salmonella/microsoma test evaluated organic extracts of the material drained into the water body after significant rain events as well as Taquari River samples including organic sediment extract, interstitial water and gross sediment. In the Salmonella/microsome test, different strains enabled evaluation of different DNA mutations including frameshift (TA97a and TA98) and base pair substitution (TA100) in the absence (- S9) and presence (+S9) of metabolic activation. The Allium test allowed verification of chromosomal alterations. Positive mutagenicity results in the Salmonella/microsome assay of material from the area indicate that contaminant mixtures may have drained into the Taquari River, as indicated by mutagenic activity detected in both bioassays in sediment samples collected at the contaminated site. Mutagenic activity was also detected at a site downstream from the contaminated site. Although the reference area upstream showed low mutagenic activity originating from a different pollutant source, such pollutants were not found at the downstream sites. The bioassays employed, mainly the Salmonella/microsome assay, can indicate a possible contamination route toward the Taquari River and were proven efficient at evaluating the mutagenicity of drained soil material and sediment from the river.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:22:59Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2005-06-23Bitstream added on 2014-06-13T18:50:06Z : No. of bitstreams: 1 fernandes_tcc_me_rcla.pdf: 1353924 bytes, checksum: 844718912b1b902a5bf7849d50869538 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / O controle de plantas daninhas é fundamental para a produção agrícola, devido à sua competição pelos fatores limitantes de crescimento (nutrientes, água, luz) e aos seus efeitos alelopáticos. Pesticidas orgânicos sintéticos têm se tornado um importante elemento nas práticas de produção agrícola tecnificada, dando um grande impulso na indústria agroquímica em todo mundo. Os benefícios de tais produtos são claramente visíveis nos substanciais aumentos na produtividade. No entanto, o destino final desses compostos orgânicos, principalmente dos herbicidas, têm causado sérias preocupações, pelo grande volume utilizado. Preocupados principalmente com a possível interação desses produtos com o material genético dos organismos, nosso estudo visou compreender a ação da trifluralina, por ser este herbicida amplamente utilizado na agricultura. O presente estudo aborda avaliações toxicológicas, de mutagenicidade, genotoxicidade e carcinogenicidade do herbicida trifluralina. Também foram abordadas as características químicas, físicas, persistência, mobilidade, processo de degradação e mecanismos de ação do herbicida. Alguns dados foram obtidos junto às pesquisas realizadas na literatura científica disponível sobre o produto, mas a maioria das apresentações, aqui registradas, são decorrentes da própria investigação realizada com a aplicação do produto em organismos testes. Os dados obtidos foram comparados e discutidos, principalmente, com citações de autores especialistas no estudo da ação do produto e nas publicações da Agência de Proteção Ambiental Norte-Americana (USEPA). Aspectos da legislação brasileira dos agrotóxicos também foram sucintamente abordados. / The controlling of weed plants is fundamental for agricultural production, due to their competition by the limiting factors of growing (nutrients, water, light) and due to their alelopatics effects. Synthetic organic pesticides have becoming an important element in the practice of technical agricultural production, resulting in a great impulse in agrochemical industry around the world. The benefits from these products are clearly visible in the substantial increasing in the productivity. Otherwise, the final destination of these organic composts, mainly of the herbicides, have causing serious worrying because their high volume. Preoccupation mainly with the possible interaction of these products with the genetic organisms material, our study have the aim to examine the trifluralin action because this herbicide is widely utilized in the agriculture. The present work also looks at the toxicological interactions of mutagenicity, genotoxicity and carcinogenicity of the trifluralin herbicide as well the chemical and physical features, persistence, mobility, degradation process, and herbicide action mechanisms. Some data are from researches done in the available scientific literature about the product, but the majority of the presentation here reported is from our own investigation realized with the application of products in test organisms. The data collected were compared and discussed mainly with report of expert authors in the study of the action of the product and using publications in the United States Environmental Protection Agency (USEPA). Aspects of Brazilian agrotoxic legislation were also briefly discussed.

Submitted by Amanda Silva (amanda.osilva2@ufpe.br) on 2015-03-13T12:43:57Z No. of bitstreams: 2 TESE Pedro Marcos de Almeida.pdf: 1329330 bytes, checksum: 0a1f5b52d9007cf88ae888ba85035c7c (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-03-13T12:43:58Z (GMT). No. of bitstreams: 2 TESE Pedro Marcos de Almeida.pdf: 1329330 bytes, checksum: 0a1f5b52d9007cf88ae888ba85035c7c (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Previous issue date: 2014 / Jatropha gossypiifolia L. (Euphorbiaceae) é um arbusto leitoso conhecido por suas propriedades medicinais. O presente estudo visou avaliar os efeitos tóxico, citotóxico e genotóxico do látex e dos extratos etanólico e aquoso foliares de J. gossypiifolia, utilizando o sistema-teste Allium cepa L. Sementes de A. cepa foram submetidas a diferentes concentrações do látex (1,25; 2,5; 5; 10 e 20 mL/L) e dos extratos foliares (0,001; 0,01; 0,1; 1 e 10 mg/mL), utilizando como controle negativo água destilada e como controles positivos o Metilmetanosulfonato e a trifluralina, para avaliar os parâmetros de toxicidade (crescimento radicular), citotoxicidade (índice mitótico) e de genotoxicidade (alterações cromossômicas). O látex e os extratos apresentaram reduções significativas no comprimento médio das raízes e no índice mitótico na maioria das concentrações quando comparados ao controle negativo. Alterações cromossômicas significativas, como aderências cromossômicas, C-metáfases, pontes cromossômicas foram observadas no látex e nos dois extratos. A presença de brotos nucleares e micronúcleos foram encontrados apenas nos dois extratos foliares, enquanto as perdas cromossômicas foram significativas somente no extrato etanólico. Em geral, os testes realizados indicaram toxicidade, citotoxicidade, mutagenicidade e genotoxicidade do látex e dos extratos foliares de J. gossypiifolia. Possivelmente, os danos provocados foram resultantes da presença de terpenos e/ ou flavonoides no extrato etanólico e de flavonoides e/ ou saponinas no extrato aquoso. Dessa forma, sugere-se que o uso medicinal dessa espécie seja feito com cautela.

Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2016-08-08T13:07:06Z No. of bitstreams: 1 Luiz Guilherme Medeiros Pessoa.pdf: 1220825 bytes, checksum: 8e6745e5e988261f0f80d9cf8b38686a (MD5) / Made available in DSpace on 2016-08-08T13:07:06Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Luiz Guilherme Medeiros Pessoa.pdf: 1220825 bytes, checksum: 8e6745e5e988261f0f80d9cf8b38686a (MD5) Previous issue date: 2009-03-02 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The increasing demand for food has made the use of irrigation imperative in the world, especially in semi-arid regions, such as the Northeast, where water deficit occurs in the soil during most of the year. One of the most relevant aspects, regarding the success of irrigation and agricultural practice concerns the quality of irrigation water, especially in cases of arid and semi-arid areas, where there may be an increase in the salt concentration, degrading the soil, and thus preventing the production. This study aimed to assess the development of onion (Allium cepa L.) and degradation of soils of different textures of semi-arid region of Pernambuco under irrigation with saline solutions. Two soils were studied irrigated with solutions to meet the three values of EC and six of SAR, and combined treatments of salinity. Thus the experiment consisted of a factorial arrangement 2 x 3 x 6 (two soils, three EC and six SAR), in four replicates, counting 144 experimental units. The experimental design was randomized blocks, with one repetition per block. Seedlings were used for onion cultivar IPA 11. The samples of soil, plant and leachate were performed monthly, totaling three collections at the end of the cycle of onion. There was a reduction in the variables of growth in terms of increasing the electrical conductivity of the solution irrigation in the three phases of development of the culture studied. The SAR of the irrigation water didn’t significantly affect the variables of growth of onion. There was an increase in the accumulation of elements in dry matter of onion plants with increasing salinity of irrigation solutions in all parts examined. Part of the plant where there was a greater accumulation of evidence was the root, followed by leaves and bulb. The potassium ion was predominant in the dry onion, which we observed an increase in the accumulation of sodium with increasing salinity of the irrigation water. The salinity of the leachate, and the contents of the elements examined increased significantly with increasing salinity of the irrigation solution. The sandy soil promoted a greater leaching of ions from the ground up to free sandy clay sixty days. To ninety days, there was a balance between the leachate compositions from both soils, probably due to a slower removal of the sandy clay soil free. There was a significant increase in levels of exchangeable sodium, the ESP, the SAR and the EC, with the increased salinity of the irrigation water. Among the soil, the finest textured soil had greater retention of salts than the coarse textured soil, obtaining higher values of EC and exchangeable sodium. / A crescente demanda por alimentos tornou o uso da irrigação imperativo em todo mundo, sobretudo em regiões semi-áridas, como as do Nordeste brasileiro, onde ocorre deficiência hídrica no solo durante a maior parte do ano. Um dos aspectos mais relevantes, no tocante ao sucesso da irrigação como prática agrícola diz respeito à qualidade da água de irrigação, principalmente em casos de regiões áridas e semi-áridas, onde pode haver um aumento na concentração de sais, degradando os solos e, consequentemente, inviabilizando a produção. Este trabalho teve como objetivo, avaliar o desenvolvimento da cebola (Allium cepa L.) e as alterações de dois solos de diferentes texturas do semi-árido de Pernambuco sob irrigação com soluções salinas. O trabalho foi conduzido em casa de vegetação, estudando-se solos irrigados com soluções preparadas para corresponderem a três valores de condutividade elétrica (CE) e seis de relação de adsorção de sódio (RAS), combinados como tratamentos de salinidade. Assim, o experimento constituiu-se de um arranjo fatorial 2 x 3 x 6 (dois solos, três CE e seis RAS), em quatro repetições, contabilizando 144 unidades experimentais. O delineamento experimental adotado foi em blocos casualizados, com uma repetição por bloco. Foram utilizadas mudas de cebola da cultivar IPA 11, realizando-se coletas de solo, planta e lixiviado mensalmente, totalizando três coletas ao final do ciclo da cebola. Houve uma redução nas variáveis de crescimento em função do aumento da CE da solução de irrigação nas três fases de desenvolvimento da cultura estudadas, contudo, a RAS das águas de irrigação não afetou significativamente as variáveis de crescimento da cebola. Houve um aumento no acúmulo de elementos na matéria seca das plantas de cebola com o aumento da salinidade das soluções de irrigação, em todas as partes analisadas. A parte da planta onde houve um maior acúmulo de elementos foi a raiz, seguido das folhas e bulbo. O potássio foi o íon predominante na matéria seca da cebola, observando-se aumento no acúmulo do sódio com o aumento da salinidade da solução de irrigação. A salinidade do lixiviado, bem como os teores dos elementos analisados, aumentaram significativamente com o aumento da salinidade da água de irrigação. O solo arenoso foi caracterizado por uma maior lixiviação dos íons em relação ao solo franco argilo arenoso até os sessenta dias. Aos noventa dias, houve um equilíbrio entre a composição do lixiviado dos dois solos, provavelmente em função de uma remoção mais lenta de sais no solo franco argilo arenoso. Houve um aumento significativo nos teores de sódio trocável, da PST, da RAS e da CE com o aumento da salinidade da água de irrigação. Entre os solos, o de textura franco argilo siltosa irrigado com águas menos salinas apresentou maior retenção de sais em relação ao solo de textura franco arenosa, com maiores valores de CE e de sódio trocável.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2016-09-19T13:59:13Z No. of bitstreams: 1 Antonio Esmael Silva de Oliveira.pdf: 1089311 bytes, checksum: e93b02f0fa36f0951963b3bf1afdc9e9 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-09-19T13:59:13Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Antonio Esmael Silva de Oliveira.pdf: 1089311 bytes, checksum: e93b02f0fa36f0951963b3bf1afdc9e9 (MD5) Previous issue date: 2015-09-18 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / In the present work were estimated genetic gains in two environments due to recurrent selection practiced in population CNPH6400 for the type Valenciano, as well as parameters of adaptability and stability in five environments, with the final objective to evaluate the potential for recommendation of Valencian populations for the Sao Francisco Valley. The experiments were carried out in the municipalities of Petrolina - PE, Juazeiro - BA, and Belem San Francisco - PE, during the years 2013 to 2014. It was adopted the experimental design of randomized blocks, with three replications and twelve treatments to evaluate the genetic gain and fourteen treatments, including eight Valencianas for adaptability and stability parameters. The characteristics evaluated were total and commercial bulb yields, which were. Adjusted by covariance from the average plant stand of each experiment. Were estimated heritability, differential selection, genetic gain. Adaptability and stability parameters were estimated by the methods of Eberhart & Russel and Lin & Binns. Significant differences were observed for bulbs commercial production in the two environment, except for the population 25CA10 in Juazeiro - BA. The mean genetic gain for bulbs commercial production in the yellow Valenciana population 25CA10 were 378.88% in Petrolina - PE and 16.30% in Juazeiro - BA, while the purple population T811CR13 the gains were 340.76% to Petrolina - PE and 55 01% to Juazeiro - BA. The genetic gains were not linear to the sequence of the evaluated cycles, and these oscillations were attributed to genetic drift and selection emphasizing the thickness of cataphylls in recent cycles. It was observed genotype x environment interaction for all variables. The two methodologies presented discrepant results for the cultivar Alfa San Francisco. The Valencianas 25CA10 populations and T811CR13 showed average bulb productions close or above experiments means, combined with wide adaptability and stability, having the potential to be recommended as new cultivars for the region of the São Francisco Valley. / No presente trabalho foram estimados ganhos genéticos em dois ambientes devido a seleção recorrente praticada na população CNPH6400 para o tipo Valenciano, bem como parâmetros de adaptabilidade e estabilidade em cinco ambientes, com o objetivo final de avaliar o potencial de recomendação de populações Valencianas para o Vale do São Francisco. Os experimentos foram conduzidos nos municípios de Petrolina – PE, Juazeiro – BA, e Belém do São Francisco – PE, nos anos de 2013 a 2014. Foi adotado o delineamento experimental de blocos ao acaso, com três repetições, sendo doze tratamentos para avaliação do ganho genético e quatorze tratamentos, sendo oito Valencianas para parâmetros de adaptabilidade e estabilidade. As características avaliadas foram produção total de bulbos e produção de bulbos comerciais. Os dados da produção total foram corrigidos pela covariância a partir do stand médio de cada experimento. Foram estimadas a herdabilidade, o diferencial de seleção, o ganho genético. Parâmetros de adaptabilidade e estabilidade foram estimadas pelas metodologias de Eberhart & Russel e Lin & Binns. Nas avaliações de ganho genético foram observadas diferenças significativas para produção comercial de bulbos nos dois ambientes, exceto para a população 25CA10 em Juazeiro - BA. As médias do ganho genético para produção comercial na população Valenciana amarela 25CA10 foram 378,88% em Petrolina – PE e 16,30% em Juazeiro – BA, enquanto na população roxa T811CR13 os ganhos foram de 340,76% para Petrolina – PE e 55,01% de Juazeiro – BA. Os ganhos genéticos não foram lineares para a sequência dos ciclos avaliados, sendo essa oscilação atribuída a deriva genética e a seleção com ênfase a espessura de catáfilos nos últimos ciclos. Foi observada interação genótipo x ambiente para todas as variáveis avaliadas. As duas metodologias apresentaram resultados discrepantes para a cultivar Alfa São Francisco. As populações Valencianas 25CA10 e T811CR13 apresentaram produção de bulbos próximos ou acima das médias dos experimentos, aliadas a ampla adaptabilidade e boa estabilidade, tendo potencial para serem recomendadas como novas cultivares para a região do Vale do São Francisco.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2017-12-18T13:25:28Z No. of bitstreams: 1 Roberta Rocha Ferreira.pdf: 3077956 bytes, checksum: 0c56b291570f1a18e2eadbd875ae0b1f (MD5) / Made available in DSpace on 2017-12-18T13:25:28Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Roberta Rocha Ferreira.pdf: 3077956 bytes, checksum: 0c56b291570f1a18e2eadbd875ae0b1f (MD5) Previous issue date: 2017-07-27 / In this study was accomplished the identification of cytoplasmic types and genotyping of Ms locus in 59 onion genotypes of the Embrapa germplasm collection, as well as association of molecular observations with pollen viability tests, aiming to reduce time for identification of male-sterile lines („A‟) and their maintainers („B‟), for the development of hybrids adapted to the edafoclimatic conditions of the São Francisco Valley. 5‟cob/orfA501 and orf725 markers were used for cytoplasmic identification, whereas AcSKP1 and AcPMS1 for genotyping of Ms. The pollen viability was estimated with acetocarmine 2%, Alexander‟s staining and in vitro germination. In the molecular identification two types of male-sterile cytoplasmic („S‟ and „T‟), as well as fertile cytoplasmic („N‟) and Ms and ms alleles, both in homozygosity and heterozygosity, were identified in the evaluated genotypes. The frequencies with 5‟cob/orfA501 and orf725 and AcSKP1 and AcPMS1 markers were approximate the evaluated accessions. For Brazilian germplasm, the cytoplasmic frequencies of „N‟, „S‟ and „T‟ were approximately 0,47, 0,28 e 0,25, respectively, while the allelic frequencies were 0,52 and 0,48 for Ms and ms, respectively. The accessions Régia, EHCEB 20146, EHCEB 201427, Alvorada, Serrana, Crioula Mercosul, EHCEB 20142, BRS 367, Rainha, Juporanga and Alfa SF C-XI exhibit potential for identification of „A‟ and „B‟ lines because show mixtures of type of cytoplasmic and different Ms allelic frequencies. The accessions EHCEB 20142040/EHCEB 20141040, EHCEB 20142028/EHCEB 20141028, EHCEB 20112006/EHCEB 20111006, EHCEB 20142027/EHCEB 20141027, EHCEB 20102019/EHCEB 20101019 and Alfa SF „B‟/Alfa SF „A‟ presented all evaluated plants in the Nmsms and Smsms or Tmsms conditions. Molecular selection and pollen viability tests showed complete agreement for Alfa SF (Nmsms), BRS 367 (Tmsms), BRS 367 (Nmsms), Cascuda T7 (Nmsms), Cascuda T5 (Smsms), EHCEB 20102017 and EHCEB 20142027. For Alfa SF (Tmsms), EHCEB 20142028 (Nmsms), EHCEB 20141028 (Smsms), EHCEB 20141027 (Tmsms) and EHCEB 20141017 (Tmsms) there was no validation of molecular selection by pollen viability tests for some plants. The pollen viability evaluation methods did not present sterile and fertile classification agreement for the accessions EHCEB 20142028, EHCEB 20141028, EHCEB 20141027 and EHCEB 20141017. Six pairs of „A‟ and „B‟ lines identified in the present study, Alfa SF (Tmsms ) x Alfa SF (Nmsms), BRS 367 (Tmsms) x BRS 367 (Nmsms), Cascuda T7 (Nmsms) x Cascuda T5 (Smsms), EHCEB 20142027 (Nmsms) x EHCEB 20141027 (Tmsms), EHCEB 20102017 (Nmsms) x EHCEB 20141017 (Tmsms) and EHCEB 20142028 (Nmsms) x EHCEB 20141028 (Smsms) demonstrated potential for the development of hybrids. / No presente trabalho foi realizado a identificação dos tipos citoplasmáticos e a genotipagem do locus Ms presentes em 59 genótipos de cebola do banco de germoplasma da Embrapa, bem como associação das observações moleculares de genótipos com testes de viabilidade polínica, visando diminuir o tempo na identificação de linhas macho-estéreis („A‟) e de suas mantenedoras („B‟), para o desenvolvimento de híbridos adaptados às condições edafoclimáticas do Vale do São Francisco. Os marcadores 5‟cob/orfA501 e orf725 foram usados para identificação de citoplasma, enquanto os marcadores AcSKP1 e AcPMS1 para genotipagem do locus Ms. A viabilidade polínica foi estimada com carmim acético 2%, solução de Alexander e germinação in vitro. Na identificação molecular os dois tipos de citoplasma macho-estéreis („S‟ e „T‟), bem como o citoplasma fértil („N‟), assim como os alelos Ms e ms, tanto em homozigose como em heterozigose foram, detectados nos 59 genótipos avaliados. As frequências com os marcadores 5‟cob/orfA501 e orf725, bem como com os marcadores AcSKP1 e AcPMS1, foram aproximadas nos acessos de cebola avaliados. No germoplasma brasileiro, as frequências dos citoplasmas „N‟, „S‟ e „T‟ foram de 0,47, 0,28 e 0,25, respectivamente, enquanto as frequências alélicas foram de 0,52 e 0,48 para Ms e ms, respectivamente. Os acessos Régia, EHCEB 20146, EHCEB 201427, Alvorada, Serrana, Crioula Mercosul, EHCEB 20142, BRS 367, Rainha, Juporanga e Alfa SF C-XI tem potencial para identificação de linhas „A‟ e „B‟, pois apresentaram misturas para tipo de citoplasma e diferentes frequências alélicas para Ms. Os acessos EHCEB 20142040/EHCEB 20141040, EHCEB 20142028/EHCEB20141028 e EHCEB 20112006/EHCEB20111006, EHCEB 20142027/EHCEB 20141027, EHCEB 20102019/EHCEB 20101019 e Alfa SF „B‟/Alfa SF „A‟ apresentaram todas as plantas avaliadas na condição Nmsms e Smsms ou Tmsms. A seleção molecular e testes de viabilidade polínica apresentaram completa concordância para as linhagens Alfa SF (Nmsms), BRS 367 (Tmsms), BRS 367 (Nmsms), Cascuda T7 (Nmsms), Cascuda T5 (Smsms), EHCEB 20102017 e EHCEB 20142027. Para Alfa SF (Tmsms), EHCEB 20142028 (Nmsms), EHCEB 20141028 (Smsms), EHCEB 20141027 (Tmsms) e EHCEB 20141017 (Tmsms) não houve validação da seleção molecular pelos de testes de viabilidade polínica para algumas plantas. Os métodos de avaliação da viabilidade polínica não apresentaram concordância de classificação estéril e fértil para os acessos EHCEB 20142028, EHCEB 20141028, EHCEB 20141027 e EHCEB 20141017. Seis pares de linhas „A‟ e „B‟ identificados no presente estudo, Alfa SF (Tmsms) x Alfa SF (Nmsms), BRS 367 (Tmsms) x BRS 367 (Nmsms), Cascuda T7 (Nmsms) x Cascuda T5 (Smsms), EHCEB 20142027 (Nmsms) x EHCEB 20141027 (Tmsms), EHCEB 20102017 (Nmsms) x EHCEB 20141017 (Tmsms) e EHCEB 20142028 (Nmsms) x EHCEB 20141028 (Smsms), apresentam potencial para o desenvolvimento de híbridos.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2018-02-22T14:08:58Z No. of bitstreams: 1 Paulo Castelo Branco de Gouveia Filho.pdf: 1165549 bytes, checksum: 16f843e48f36122b99e932a78381d634 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-02-22T14:08:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Paulo Castelo Branco de Gouveia Filho.pdf: 1165549 bytes, checksum: 16f843e48f36122b99e932a78381d634 (MD5) Previous issue date: 2017-02-24 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Glanders is an often fatal zoonosis that affects horses, donkeys and mules, caused by Burkholderia mallei. Complement Fixation (CF) is the test prescribed by the World Organization for Animal Health (OIE) for its diagnosis. This work was conducted with the objective of evaluating the performance of CF using antigen produced with Brazilian strains of B. mallei (Biovetech, Recife Brazil) for the diagnosis of glanders compared to the antigen c.c.pro (GmbH, Oberdorla, Germany), which employs strains from Yugoslavia, India and Indonesia. The tests were performed in parallel using the protocol of cold incubation (4 ° C, 12 hours) of the serum, complement and antigen mixture. Of the 259 sera evaluated, 102 and 133 presented positive and negative results, respectively, in both tests. Twenty-four negative sera in the c.c.pro antigen test showed a positive result in the Biovetech antigen test. The calculated concordance index kappa was 0.81, considered almost perfect. / O mormo é uma zoonose frequentemente fatal que afeta equinos, asininos e muares, causada pela Burkholderia mallei. A Fixação do Complemento (FC) é o teste prescrito pela Organização Mundial de Saúde Animal (OIE) para seu o diagnóstico. Este trabalho foi conduzido com o objetivo de avaliar o desempenho da FC empregando antígeno (Biovetech, Recife Brasil), produzido com cepas brasileiras de B. mallei para diagnóstico do mormo comparativamente ao antígeno c.c.pro (GmbH, Oberdorla, Alemanha), que emprega cepas da Iuguslávia, India e Indonésia. Os testes foram realizados em paralelo utilizando o protocolo de incubação a frio (4ºC, 12 horas) da mistura soro, complemento e antígeno. Dos 259 soros avaliados, 102 e 133 apresentaram resultado positivo e negativo, respectivamente, em ambos os testes. Vinte e quatro soros negativos no teste com antígeno c.c.pro apresentaram resultado positivo no teste com antígeno Biovetech. O índice de concordância ajustada kappa calculado foi 0,81, considerado quase perfeito.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2018-06-12T14:57:27Z No. of bitstreams: 1 Fernanda Maria Lino de Moura.pdf: 1372391 bytes, checksum: 6c90eb935fc28de036099a6c3f261b2c (MD5) / Made available in DSpace on 2018-06-12T14:57:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Fernanda Maria Lino de Moura.pdf: 1372391 bytes, checksum: 6c90eb935fc28de036099a6c3f261b2c (MD5) Previous issue date: 2018-02-28 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Among foods related to foodborne diseases are dairy products, since the quality of milk produced in several regions of Brazil is still unsatisfactory, leaving it subject to microorganisms that affect milk production and consumer health. Listeria monocytogenes is considered a serious problem in food safety and due to the importance of milk production in the country and the obtaining of safe food, the objective to evaluate the biofilm formation and antimicrobial resistance profile and sanitizers of Listeria monocytogenes isolated from milk from expansion tanks. The analyzes were carried out at the Meat and Milk Inspection Laboratory (LICAL) of UFRPE. After isolation and identification from morpho-tinctorial and biochemical characteristics, L. monocytogenes colonies were submitted to eight antimicrobials: penicillin G (10U), ampicillin (10μg), cephalothin (30μg), chloramphenicol (30μg), ciprofloxacin 5μg), erythromycin (15μg), clindamycin (2μg) and tetracycline (30μg) by the disc diffusion method. Then, the biofilm formation test was performed using a 96-well microdilution plate and the biofilm forming isolates were tested with 2.5% chlorine sanitizers and 2% chlorhexidine. Listeria monocytogenes were detected in 20% of the samples (6/30). It was observed that 83.3% (5/6) and 16.6% (1/6) of the isolates presented resistance and intermediate resistance to clindamycin, respectively, and 16.6% (1/6) resistance to chloramphenicol and erythromycin. 66.6% (4/6) of the isolates were able to form biofilm. It was detected a more effective action of chlorine in relation to the ability to interfere in the free cells, because in 50% (2/4) it completely inhibited the adhesion and in 50% (2/4) its action allowed a poor adherence. Chlorhexidine allowed moderate adherence in 100% of the isolates. In relation to the consolidated biofilm, chlorine was 75% (3/4) more effective in reducing adherence to chlorhexidine. This work was pioneer in the isolation of Listeria monocytogenes in milk from the individual expansion tanks existing in the municipalities of Alagoas State. The occurrence of Listeria monocytogenes in the samples evaluated represents a risk to public health. The biofilm formation and the resistance presented by these strains to sanitizing products predispose to the persistence of this microorganism in the milk production chain. Thus, it is necessary to monitor this microorganism and mastitis in the herd. In addition, the correct pre and post-dipping, the sanitation of the equipment and the tank, the regular evaluation of the efficiency of the sanitizers used and the collection of the milk by the truck refrigerated in the appropriate time have relevance in the guarantee of milk quality, being essential for the provision of safe food to the population. The occurrence of antimicrobial resistant strains may compromise the treatment of human listeriosis. It is evidenced the need to carry out antimicrobial tests and adhesion periodically to monitor the profile of resistance and biofilm formation by this microorganism, in order to promote the control of Listeria monocytogenes in the herd and to prevent contamination of milk by pathogenic microorganisms. / Dentre os alimentos relacionados às doenças transmitidas por alimentos estão os lácteos, pois a qualidade do leite produzido em diversas regiões do Brasil ainda é insatisfatória, deixando-o sujeito a micro-organismos que afetam a produção leiteira e a saúde dos consumidores. Considera-se Listeria monocytogenes um sério problema na segurança de alimentos e diante da relevância da produção de leite no país e da obtenção de alimentos seguros, objetivou-se avaliar a formação de biofilme e o perfil de resistência a antimicrobianos e sanitizantes de Listeria monocytogenes isoladas de leite de tanques de expansão. As análises foram realizadas no Laboratório de Inspeção de Carne e Leite (LICAL) da UFRPE. Após isolamento e identificação a partir de características morfo-tintoriais e bioquímicas, colônias de L. monocytogenes foram submetidas a oito antimicrobianos, sendo estes penicilina G, ampicilina (10μg), cefalotina (30μg), cloranfenicol (30μg), ciprofloxacina (5μg), eritromicina (15μg), clindamicina (2μg) e tetraciclina (30μg), através do método de difusão em disco. Em seguida, realizou-se o teste de formação de biofilme utilizando-se placa de microdiluição de 96 poços e os isolados formadores de biofilme foram submetidos ao teste com os sanitizantes cloro a 2,5% e clorexidine a 2%. Detectou-se Listeria monocytogenes em 20% das amostras (6/30). Observou-se que 83,3% (5/6) e 16,6% (1/6) dos isolados apresentaram resistência e resistência intermediária a clindamicina, respectivamente e 16,6% (1/6) de resistência a cloranfenicol e eritromicina. 66,6% (4/6) dos isolados foram capazes de formar biofilme. Detectou-se ação mais eficaz do cloro em relação à capacidade de interferir nas células livres, pois em 50% (2/4) inibiu completamente a aderência e em 50% (2/4) a sua ação permitiu uma fraca aderência. O clorexidine permitiu aderência moderada em 100% dos isolados. Em relação ao biofilme consolidado o cloro foi 75% (3/4) mais eficaz na redução da aderência em relação ao clorexidine. Este trabalho foi pioneiro no isolamento de Listeria monocytogenes em leite proveniente de tanques de expansão individuais em municípios do estado de Alagoas. A ocorrência de Listeria monocytogenes nas amostras avaliadas representa um risco à saúde pública. A formação de biofilme e a resistência apresentada por estas cepas a produtos sanitizantes predispõem para a persistência deste micro-organismo na cadeia de produção de leite. Desta forma, faz-se necessário o monitoramento deste micro-organismo e da mastite no rebanho. Além disso, a realização de pré e pós-dipping de forma correta, a sanitização dos equipamentos e do tanque, a avaliação regular da eficiência dos sanitizantes utilizados e a coleta do leite pelo caminhão refrigerado no tempo adequado possuem relevância na garantia da qualidade do leite, sendo imprescindíveis para o fornecimento de alimentos seguros à população. A ocorrência de cepas resistentes a antimicrobianos pode comprometer o tratamento da listeriose humana. Evidencia-se a necessidade de realização de testes com antimicrobianos e de aderência periodicamente para monitoramento do perfil de resistência e da formação do biofilme por parte deste micro-organismo, com o intuito de promover o controle da Listeria monocytogenes no rebanho e de prevenir a contaminação do leite por micro-organismos patogênicos.

Orientador: Maria Luiza Silveira Mello / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-13T07:52:21Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Barberio_Agnes_D.pdf: 1536569 bytes, checksum: b0e9b0bcd32d35ac2c8d2729b86b741b (MD5) Previous issue date: 2009 / Resumo: Uma das principais fontes de poluição dos ecossistemas de água doce se refere aos resíduos de efluentes industriais e urbanos. Os esgotos não tratados e excrementos humanos são considerados causa importante na deterioração da qualidade da água de países em desenvolvimento. Os poluentes ambientais têm causado uma diminuição da qualidade da água, induzindo efeitos deletérios nos organismos que estão em contato direto ou indireto com os mesmos. O efeito da exposição dos organismos a qualquer substância potencialmente tóxica, depende de sua concentração e do tempo de exposição. Um dos efeitos, freqüentemente observado pelos agentes ambientais é a alteração química do DNA. Tais modificações são prejudiciais às células, uma vez que podem afetar processos vitais, como a duplicação e a transcrição do DNA, a regulação gênica e a divisão celular, e levar ao desenvolvimento de processos patogênicos e/ou à morte celular. Nesse contexto, testes biológicos de toxicidade e genotoxicidade são indispensáveis para a avaliação das reações dos organismos vivos à poluição ambiental, como também para a identificação dos efeitos sinérgicos potenciais de vários poluentes. O rio Paraíba do Sul é um dos integrantes da bacia do rio Paraíba do Sul, de importância para a região sudeste do Brasil, pois serve ao abastecimento urbano, à irrigação, à geração de energia, e à assimilação de despejos urbanos, industriais e agrícolas nessa região. No presente trabalho foram pesquisados efeitos citotóxicos e genotóxicos em raízes de Allium cepa expostas a amostras de água do rio Paraíba do Sul, coletadas em agosto de 2005, 2006 e 2007, em pontos localizados nas cidades de Tremembé e Aparecida (SP). Foram utilizados para investigação parâmetros anátomo-morfológicos (crescimento das raízes), índices mitóticos (IM), índices de fases da divisão celular (IF), freqüência de micronúcleos (MN) e anomalias cromossômicas (AC). O comprimento das raízes de cada bulbo foi acompanhado, diariamente, ao longo de 24 a 120 h. Somente as raízes tratadas com amostras de água coletadas em 2005, na cidade de Tremembé, apresentaram um decréscimo em taxa de crescimento. Entretanto, nesse mesmo ano, houve redução no IM das raízes tratadas com água coletada em Tremembé e Aparecida. Considerando-se os dados de crescimento de raiz e especialmente os valores de IM, admite-se que em 2005 a água do rio Paraíba do Sul nas regiões de Tremembé e Aparecida tenha tido potencial citotóxico. Por outro lado, ainda nesse mesmo ano, a freqüência de MN não se mostrou alterada, o que indica que a água do rio, nos pontos mencionados, não apresentaria potencial genotóxico. Em 2007 não houve diferença no crescimento das raízes assim como os valores de IM nas raízes tratadas com água de ambos os pontos de coleta não diferiram dos valores do controle negativo. As freqüências das fases da mitose (IF) diferiram de modo significativo dos respectivos controles; as freqüências de prófase e anáfase das raízes tratadas com as águas coletadas em Tremembé e em Aparecida foram maiores e a freqüência de telófases menor do que as dos controles negativos. As freqüências de metáfase foram maiores para as raízes tratadas por água coletada em Aparecida. Foram constatados aumentos significativos de MN e de AC em raízes tratadas com água das duas regiões de coleta. A freqüência de c-mitose foi significantemente maior após tratamento com a água proveniente de Tremembé, enquanto a freqüência de pontes cromossômicas foi maior para as raízes tratadas por água coletada em Aparecida. Considerando-se a freqüência de MN, AC e IF, admite-se efeito citotóxico e genotóxico para A. cepa tratada com as amostras de água do rio Paraíba do Sul das regiões de Tremembé e Aparecida, no ano de 2007. O teste Allium mostrou ser uma ferramenta sensível na detecção de citotoxicidade e genotoxicidade promovidas pela água do rio Paraíba do Sul nos pontos nomeados. / Abstract: One of the main sources of pollution of fresh water ecosystems refers to the discharge of industrial and urban wastes. Untreated sewage is considered an important cause to the deterioration of water quality in developing countries. Environmental pollutants have caused a decrease in water quality, inducing harmful effects in organisms which are in direct or indirect contact with them. The effect of exposure of organisms to any potentially toxic substance depends on its concentration as well as exposure time. One of the effects frequently observed by environmental agents is the chemical alteration of the DNA affecting vital processes, like DNA duplication and transcription, gene regulation and cell division, and leading cells to pathologic processes and/or cell death. In this context, toxicity and genotoxicity biological tests are mandatory for the evaluation of reactions of living organisms to environmental pollution, as well as for the identification of potential synergetic effects of several pollutants. The Paraíba do Sul river is one of the components of the Paraíba do Sul basin, of importance to the southeast region of Brazil, as it serves for urban supply, irrigation, generation of energy, and assimilation of urban, industrial and agricultural discharges in the mentioned region. This work aimed at researching cytotoxic and genotoxic effects in Allium cepa roots exposed to water samples collected from the Paraíba do Sul river in August 2005, 2006 and 2007, at sites located in the cities of Tremembé and Aparecida. Anatomo-morphologic parameters (root growth), mitotic indices (MI), cell division phase indices (PI), frequency of micronuclei (MN) and chromosome anomalies (CA) were investigated. Root lengths from each bulb were evaluated daily along 24 to 120 h. Only in the roots treated with the water samples collected at Tremembé in 2005, a decrease in root growth rate was found. However, in the same year, there was reduction in the MI of the roots treated with water collected at Tremembé and Aparecida. Considering the root growth data and especially the MI values, it is assumed that the water of the Paraíba do Sul river in the regions of Tremembé and Aparecida had a cytotoxic potential in 2005. On the other hand, still in the same year, no change in MN frequency was detected, which indicates that the water at the mentioned river points had probably no genotoxic potential. In 2007, there was no difference in root growth, as the MI values for roots treated with the water collected at both sites did not differ from the values of the negative control. The frequencies of the mitosis phases differed significantly from the respective controls; the frequencies of prophases and anaphases for roots treated with water collected at Tremembé and Aparecida were higher and the frequency of telophases were lower than those of the negative controls. Frequencies of metaphases were higher for roots treated with water collected in Aparecida. A significant increase in MN and CA was found for the roots treated with water collected from both sites. The frequency of c-mitosis significantly increased after treatment with the river water collected at Tremembé, whereas the frequency of chromosome bridges increased for roots treated with water collected at Aparecida. By considering the frequencies of MN, CA and PI, a cytotoxic and genotoxic effect is supposed for A. cepa treated with the water collected from the river Paraíba do Sul at sites of Tremembé and Aparecida, in 2007. The Allium test has proved to be a sensitive tool for detecting cytotoxicity and genotoxicity effects promoted by the Paraíba do Sul water in the mentioned sites. / Doutorado / Biologia Celular / Doutor em Biologia Celular e Estrutural

Submitted by Maryse Santos (maryseeu4@gmail.com) on 2016-09-02T15:23:02Z No. of bitstreams: 1 Dissertação Final Paula Taquita Serra.pdf: 5828635 bytes, checksum: 30c415dfffb3ecb7f7e2e64439a68ae5 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-09-16T12:20:04Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação Final Paula Taquita Serra.pdf: 5828635 bytes, checksum: 30c415dfffb3ecb7f7e2e64439a68ae5 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-09-16T12:24:12Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação Final Paula Taquita Serra.pdf: 5828635 bytes, checksum: 30c415dfffb3ecb7f7e2e64439a68ae5 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-09-16T12:24:12Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertação Final Paula Taquita Serra.pdf: 5828635 bytes, checksum: 30c415dfffb3ecb7f7e2e64439a68ae5 (MD5) Previous issue date: 2013-09-04 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Introduction: Shigellosis is a bacillary dysentery caused by Shigella, a gramnegative intracellular human pathogen. One of most common animal models to evaluate Shigella’s immune response is mice pulmonary infection due easy manipulation and similar gut responses. At this study, we have hypothesized how clinical strains isolated from Shigellosis patients had differential immune response expression when compared to standards strains (M90T). Our main proposition was analyze four clinical Shigella strains with distinct virulence genes and M90T immune responses at murine invasion after 24 and 48h infection. Methods: Shigella Clinical Strains were selected through presence of specific virulence genes by PCR. Primers related to immune system were designed. Clinical strains and M90T Shigella were submitted to expression at Fluidigm (Bioamark Platform). Results were analyzed in statistical software R. Results: We grouped analyzed mRNA in five gene sets: Pro Inflammatory (CXCL15, IL-1β, IL-6, IFN-β, TNF-α), Anti Inflammatory (TGF-β1, TGF- β2 e TGF-β3), Innate Response (NOD 1, NOD 2, TLR4 e TLR9), Adaptive Response (Th1-like, IFN-γ, IL-17A e IL-17B) and Macrophage (NOS, H2 -Aβ1, H2-Eβ, H2-K1, MHC-like 2). As main results, all clinical strains displayed a moderate mRNA expression in 24h infection which gets higher in 48h, while M90T standard had opposite regulation with lower mRNA rates in 48h infection, suggesting major differences between well characterized standards and clinical strains. Clinical strain #5 did not alter mRNA expression in 24 and 48h at adaptive immune response genes, suggesting low invasion rates and host control at initial steps of infection. Clinical strain #11 demonstrates high macrophage activity by superior expression levels of IFN-γ and NOS. Strains #14 and #27 suggest potential of Th1 protection through high MHC-like II and Th1 mRNA expression when compared to all other strains and standard control. Presence of IL-17 high expression in strain #27 demonstrates a possible relation with Th17 cells. The immunological potential of strain #27 may have relationship with Shigella enterotoxins (shET1A, shET1B, and shET2). Enterotoxins presence was confirmed by PCR and results shows this complete set is absent in all other strains studied. Conclusion: The differences between clinical strains and standards were evident at this study. Clinical strain 27 appears as a great candidate to future studies and may provide new perspectives about differences among invasion and immune response seen in the clinical practice. / Shigelose é uma disenteria bacilar causada pela Shigella, um patógeno Gram negativo e intracelular. Um dos modelos animais mais comuns para avaliar a resposta imune da Shigella é a infecção pulmonar em camundongos devido a fácil manipulação e similaridade com as respostas intestinais. Neste estudo, nós levantamos a hipótese de como cepas clínicas isoladas de pacientes com shigelose possuem expressão de resposta imune diferencial quando comparados com cepas padrões (M90T). Nossa principal proposta foi analisar quatro cepas de Shigella clínicas com diferentes genes de virulência e a cepa padrão M90T quanto as respostas imunes após invasão murina em 24 e 48h. Métodos: Cepas clínicas de Shigella foram selecionadas pela presença de genes de virulência específicos por PCR. Primers relacionados ao sistema imune foram desenvolvidos. As cepas clínicas e a padrão foram submetidas à análise de expressão gênica pelo Fluidigm (Bioamark Platform). Os resultados foram analisados em programa estatístico R. Resultados: Nós agrupamos os mRNA em cinco grupos: Pró Inflamatórios (CXCL15, IL-1β, IL-6, IFN-β, TNF-α), Anti Inflamatórios (TGF-β1, TGF-β2 e TGF-β3), Resposta Inata (NOD 1, NOD 2, TLR4 e TLR9), Resposta adaptativa (Th1-like, IFN- γ, IL-17A e IL-17B) e Macrófago (NOS, H2 -Aβ1, H2-Eβ, H2-K1, MHC-like 2). Como principais resultados, todas as amostras clínicas demonstraram uma expressão mRNA em 24h de infecção que foi gradativamente aumentado após 48h, enquanto a cepa padrão M90T teve a regulação oposta com taxas de mRNA em 48h, sugerindo grandes diferenças entre as respostas a cepas clínicas e a padrões bem caracterizados. A cepa clínica #5 não alterou a expressão de mRNA em 24 e 48h nos genes da resposta adaptativa, sugerindo baixas taxas de invasão e controle do hospedeiro nas etapas iniciais da infecção. A cepa clínica #11 demonstrou alta atividade macrofágica devido a maior expressão de IFN-γ e NOS. A cepa #14 e #27 demonstraram um possível potencial de proteção Th1 devido a alta expressão mRNA para MHC-like II e Th1 quando comparado a outras cepas e o controle positivo. A presença de alta expressão de IL-17 na cepa #27 relação com células Th17. O potencial imunológico da cepa #27 pode ter relação com as enterotoxinas (shET1A, shET1B e shET2). A presença do conjunto completos destas enterotoxinas foi confirmado na cepa #27 por PCR. Conclusão: As diferenças entre cepas clínicas e padrões foram evidentes neste estudo. Cepa clínica 27 parece ser uma ótima candidata para estudos futuros e pode prover novas perspectivas para as diferenças de invasão e resposta imune vista nos hospitais.