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Varia??o geogr?fica em Sporophila (Aves: thraupidae) com base em evid?ncias fenot?picas, ecol?gicas e gen?ticasRepenning, M?rcio 30 March 2017 (has links)
Submitted by Caroline Xavier (caroline.xavier@pucrs.br) on 2017-08-02T12:28:04Z
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Previous issue date: 2017-03-30 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior - CAPES / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Cient?fico e Tecnol?gico - CNPq / This work reveals the diversity of cryptic forms within the most emblematic birds from the Neotropical grasslands, the Seedeaters, Sporophila, a group with rapid diversification rate with evidence of ongoing speciation. The background question of the study is how this biological diversity is generated and maintained in this genus of birds, which are characterized by the great capacity of dispersion and low susceptibility to geographic isolation by physic brakes. Using multiple analytical tools, morphological, vocalization, biogeographic and molecular characteristics were studied to explain the extent of intra and interspecific variations and how lineages can be formed. As study model, two Sporophila superspecies with wide and concordant geographic distribution inner South America were sampled throughout of whole range, the Plumbeous Seedeater and Capuchinos. The results show marked dichotomy between the more general patterns of radiation or divergence of the lineages in each of the groups. Plumbeous Seedeeater represent a small cluster of incipient species with adaptive radiation, whereas the radiation in Capuchinos does not involve morphological adaptations. Lineages of Capuchinos diverge in allopatric/peripatric from their breeding populations and changes in vocalizations without the formation of local dialects covariate to changes in the color of the breeding plumage of males. In both groups, it was possible to detect a cryptic diagnosable diversity beyond the traditionally current known species. Divergent or differentiated lineages ongoing were corroborated by neutral genetic signals at different sorting levels. Contact of these lineages/taxa was simulated experimentally to test their skill to discriminate heterospecific closely related species provide assortative mate predisposition. The results are confronted with the knowledge about the mechanisms of speciation in birds in a natural and sexual selection scenario among populations that may have diversified after geographic isolation or via ecological speciation. Finally, a taxonomic classification useful to represent the biological diversification in the studied Sporophila is suggested. / Esta tese revela a diversidade de formas biol?gicas cr?pticas dentro de um dos g?neros mais caracter?sticos de p?ssaros de paisagens abertas da regi?o Neotropical, os papa-capins, Sporophila, grupo que apresenta uma riqueza de esp?cies expressiva dentre os Thraupidae, e com evid?ncias de que processos de especia??o ainda possam estar em curso. A quest?o que guia o estudo ? como essa diversidade biol?gica ? gerada e mantida nesse g?nero de p?ssaros, caracterizados pela grande capacidade de dispers?o e baixa propens?o ao isolamento geogr?fico por barreiras f?sicas. Utilizando m?ltiplas ferramentas anal?ticas, foram estudadas caracter?sticas morfol?gicas, de vocaliza??o, biogeogr?ficas e moleculares para descrever a extens?o das varia??es intra e interespec?ficas e como linhagens podem ser formadas. Como modelo de estudo dois complexos de esp?cies de Sporophila com ampla e concordante distribui??o geogr?fica na Am?rica do Sul foram amostrados ao longo de toda sua regi?o de ocorr?ncia, as patativas (Sporophila plumbea/beltoni) e os caboclinhos (Sporophila bouvreuil/pileata/nigrorufa). Os resultados mostram diferen?as entre os padr?es de radia??o ou diverg?ncia das linhagens em cada um dos complexos. Patativas representam um pequeno conjunto de esp?cies incipientes com radia??o adaptativa, enquanto que a radia??o nos caboclinhos n?o envolve adapta??es morfol?gicas. Linhagens de caboclinhos divergem em alopatria de suas popula??es reprodutivas e mudan?as nas vocaliza??es sem a forma??o de dialetos locais s?o acompanhadas por mudan?as no colorido da plumagem nupcial dos machos. Em ambos os grupos foi poss?vel detectar uma diversidade cr?ptica com diagnose al?m das esp?cies tradicionalmente propostas. Linhagens divergentes ou em franco processo de diferencia??o foram corroboradas por marcadores gen?ticos em diferentes n?veis de organiza??o. Experimentalmente, foi simulado o contato secund?rio das popula??es redefinidas resultando em evid?ncias quantitativas sobre o desenvolvimento de mecanismo de isolamento pr?-reprodutivo. Os resultados s?o confrontados com o conhecimento descrito sobre mecanismos de especia??o em aves num cen?rio de sele??o natural e sexual atuante em popula??es que podem ter se diversificado ap?s isolamento geogr?fico ou via especia??o ecol?gica. Por fim, sugere-se uma classifica??o taxon?mica ?til para representar a diversidade de t?xons nos Sporophila estudados.
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Identifica??o de esp?cies de carn?voros (mammalia, carn?vora) utilizando sequ?ncias de DNA e sua aplica??o em amostras n?o-invasivasChaves, Paulo Bomfim 20 March 2008 (has links)
Submitted by PPG Zoologia (zoologia-pg@pucrs.br) on 2018-05-18T17:22:44Z
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Previous issue date: 2008-03-20 / Sequ?ncias de DNA usadas na identifica??o de material biol?gico t?m alcan?ado consider?vel
popularidade nos ?ltimos anos, especialmente no contexto dos c?digos de barras de DNA. Aferir a
esp?cie de origem em amostras de pelos, penas, peles e particularmente fezes ? um passo
fundamental para quem estuda a ecologia e evolu??o de diversos animais com este tipo de amostra.
Este ? o caso em carn?voros, cujos h?bitos furtivos e baixas densidades populacionais de algumas
esp?cies evidenciam a import?ncia de estudos baseados em amostras n?o-invasivas. Entretanto a
atual escassez de ensaios padronizados de identifica??o de carn?voros freq?entemente dificulta a
aplica??o dessas amostras em larga escala e compara??es de resultados entre diferentes localidades.
No presente estudo n?s avaliamos dois segmentos curtos (<250 pb) de DNA mitochondrial (mtDNA)
localizados nos genes ATP sintase 6 e citocromo oxidase I com potencial de servirem como
marcadores-padr?o para identifica??o de carn?voros. Entre um e 11 indiv?duos de 66 esp?cies de
carn?voros foram seq?enciados para um ou ambos os segmentos do mtDNA e analisados usando tr?s
diferentes m?todos (?rvore de dist?ncia, dist?ncia gen?tica e an?lise de caracteres). Em geral,
indiv?duos conspec?ficos apresentaram menor dist?ncia gen?tica entre si do que em rela??o a outras
esp?cies, formando agrupamentos monofil?ticos. Exce??es foram algumas esp?cies que divergiram
recentemente, algumas das quais ainda puderam ser identificadas pelo m?todo de caracteres,
hapl?tipos esp?cie-espec?ficos, ou reduzindo a abrang?ncia geogr?fica das compara??es (restringindo
a an?lise a uma regi?o zoogeogr?fica). An?lises in silico, usando um segmento curto do citocromo b
freq?entemente empregado em carn?voros, tamb?m foram realizadas para comparar o desempenho
deste segmento em rela??o aos outros dois propostos. N?s ent?o testamos o desempenho destes
segmentos na identifica??o de fezes de carn?voros por meio de tr?s estudos de caso: (i) fezes de
felinos de zool?gico, objetivando-se verificar o potencial de contamina??o das seq?encias com DNA da
presa (coelho); (ii) fezes coletadas no Cerrado brasileiro contendo restos de presas (p?los, ossos,
penas), supostamente proveniente de lobo-guar?, objetivando-se investigar a efici?ncia de identifica??o
do predador e ocorr?ncia de interfer?ncia do DNA da presa na identifica??o; e (iii) fezes coletadas em
uma reserva na Mata Atl?ntica, tamb?m com o objetivo de avaliar a efici?ncia de identifica??o. Apesar
de diferen?as em alguns aspectos de sua performance, nossos resultados indicam que os dois
segmentos propostos t?m um bom potencial de servir como marcadores moleculares eficientes para
identifica??o acurada de amostras de carn?voros ao n?vel de esp?cie. / DNA sequences for species-level identification of biological materials have achieved considerable
popularity in the last few years, especially in the context of the DNA barcoding initiative. Species
assignment of biological samples such as hairs, feathers, pelts and particularly faeces is a crucial step
for those interested in studying ecology and evolution of many species with these samples. This is
especially the case for carnivores, whose elusive habits and low densities highlight the importance of
studies based on noninvasive samples. However, the current lack of standardized assays for
carnivore identification often poses challenges to the large-scale application of this approach, as well
as the cross-comparison of results among sites. Here we evaluate the potential of two short (<250 pb)
mitochondrial DNA (mtDNA) segments located within the genes ATP synthase 6 and cytochrome
oxidase I as standardized markers for carnivore identification. Between one and eleven individuals of
66 carnivore species were sequenced for one or both of these mtDNA segments and analyzed using
three different approaches (tree-based, distance-based and character-based), in conjunction with
sequences retrieved from public databases. In most cases, conspecific individuals had lower genetic
distances from each other relative to other species, resulting in diagnosable monophyletic clusters.
Notable exceptions were the more recently diverged species, some of which could still be identified
using diagnostic character attributes, species-specific haplotypes, or by reducing the geographic
scope of the comparison (restricting the analysis to a single zoogeographic region). Additional in silico
analyses using a short cytochrome b segment frequently employed in carnivore identification were
also performed aiming to compare performance to that of our two focal markers. We then tested the
performance of these segments in the identification of carnivore faeces via three case studies: (i) felid
faeces collected in a controlled zoo experiment, aimed at assessing whether DNA from rabbit prey
would contaminate the resulting sequences; (ii) field-collected faeces from the Brazilian Cerrado
presumed to be from maned wolves and containing prey remains (hairs, bones, feathers), aimed at
investigating the efficiency of predator identification and occurrence of prey DNA interference; and (iii)
field-collected scats from an Atlantic Forest study site, also addressing the issue of PCR success rate
and identification efficiency. In spite of some relevant differences in some aspects of their
performance, our results indicate that both of our focal segments have a good potential to serve as
efficient molecular markers for accurate species-level identification of carnivore samples.
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Efeitos de pol?meros n?o i?nicos adicionados a surfactante in vitro e em modelo experimental de aspira??o de mec?nioLuz, Jorge Hecker 28 January 2010 (has links)
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Previous issue date: 2010-01-28 / Introdu??o: a s?ndrome da aspira??o de mec?nio (SAM) ? uma das doen?as respirat?rias mais importantes no per?odo neonatal. O tratamento com surfactante ex?geno apresenta uma resposta muito modesta. O mec?nio ? um potente inibidor da fun??o surfactante. Pol?meros n?o i?nicos adicionados ao surfactante neutralizam a inibi??o causada pelo mec?nio in vitro. Os resultados do uso de surfactante em modelos experimentais n?o apresentam respostas consistentes. Objetivo: avaliar o efeito de pol?meros n?o i?nicos na fun??o surfactante in vitro e em modelo experimental de s?ndrome de aspira??o de mec?nio. M?todo: a medidas da adsor??o e da tens?o superficial m?nima de solu??es de surfactante contendo dextran e polietilenoglicol (PEG) foram avaliados pelo surfact?metro da bolha cativa. O experimento in vivo, foi realizado com 16 porcos rec?m-nascidos nos quais a aspira??o de mec?nio foi provocada pela instila??o de 5 ml/kg de mec?nio a 20%. Os animais foram divididos em tr?s grupos: l. controle (n=5); ll. surfactante 100mg/kg (n=5); lll. surfactante-polietilenoglicol 7,5% (n=6). O per?odo de observa??o foi de 6 horas. A resposta aos diversos tratamentos foi avaliada por gasometrias arteriais seriadas. Resultados: a adi??o de dextran e PEG melhorou o desempenho do surfactante avaliado pelo surfact?metro da bolha cativa. Os valores da PaO2 (m?dia ? desvio padr?o) aos 30 minutos ap?s o tratamento da SAM foram: Grupo l= 66,8 ? 21,12 mmHg; Grupo ll= 68,12 ? 19,41 mmHg; e no Grupo lll= 61,33 ? 16,18 mmHg (P= 0,817 ). Com 3 horas ap?s tratamento os valores foram: Grupo l= 90,60 ? 68,12 mmHg; Grupo ll= 72,18 ? 34,83 mmHg; Grupo lll= 69,00 ? 24,46 (P= 0,711 ). Com 6 horas ap?s tratamento, os valores foram: Grupo l= 76,60 ? 48,04 mmHg; Grupo ll= 99,00 ? 94,17 mmHg; Grupo lll= 60,83 ? 19,18 mmHg (P= 0,586). ANOVA multivariada xvi modificada para medidas repetidas n?o demonstrou diferen?a significativa entre os tr?s grupos (P= 0,560). Conclus?o: adi??o de PEG ao surfactante n?o modificou o quadro de insufici?ncia respirat?ria hipox?mica grave causada pela SAM, apesar de melhorar o desempenho do surfactante in vitro.
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Estrutura de comunidades de formigas (Hymenoptera: Formicidae) do planalto do Itatiaia, Rio de Janeiro, BrasilMartins, Luciano 25 February 2011 (has links)
Submitted by Sandra Pereira (srpereira@ufrrj.br) on 2016-07-28T13:42:46Z
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Previous issue date: 2011-02-25 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior - CAPES / This study aims to compare three sampling techniques to estimate species richness of ants
(Hymenoptera: Formicidae) in ?campos of altitude? at Itatiaia National Park, in Rio de Janeiro
state. Compared richness estimates for genera and species, and curves of accumulation of species
for sardine baits, pitfall traps and manual collecting are presented for two distinct sites ("steppe
vegetation" [VE] and "rupicola vegetation" [VR]) in Itatiaia Plateau. The three techniques
collected 31 species of 10 genera belonging to four subfamilies. In VE were registered 50% of
genera and 36.4% of species collected exclusively by baits, and 20% and 50% by pitfall traps,
respectively. In VR were registered 37.5% of genera and 47.61% of species exclusive for baits,
but no one genus and species was restricted for manual collecting. In the case of ?campos de
altitude? and when only one technique can be used, the sardine bait was the most efficient sample
technique to registered richness at VE. For VR, the manual collecting was the most appropriate
technique to record species richness. However, the pitfalls (in VE) and bait (in VR) recorded an
important portion of species richness. In our data, the manual collecting were associated with
standardized data collecting protocols, and, although much criticized, have shown effectiveness
in recording species in habitats where widespread techniques cannot be used. In spite of different
physiognomies show differentiated efficiency for samples techniques, it is relevant to using more
than one technique associated to a colleting protocol well structured to potentiated the record of
the new species in environments as the ?campos de altitude?. / O presente trabalho tem por objetivo comparar tr?s t?cnicas de coleta para estimar a riqueza de
esp?cies de formigas (Hymenoptera: Formicidae) no Planalto do Itatiaia , Rio de Janeiro, Brasil.
S?o apresentados dados comparativos das estimativas da riqueza de g?neros, de esp?cies e as
curvas de acumula??o de esp?cies amostradas com iscas de sardinha, armadilhas de queda e
coletas manuais, em duas fisionomias distintas (?vegeta??o est?pica? [VE] e ?vegeta??o
rup?cola? [VR]), no Planalto do Itatiaia. Com a utiliza??o das tr?s t?cnicas foram coletadas 30
esp?cies de 11 g?neros, pertencentes a quatro subfam?lias. Para a VE foram registrados 50% dos
g?neros e 36,4% das esp?cies coletadas exclusivamente pelas iscas, e 20% e 50% pela armadilha
de queda, respectivamente. Para a VR foram registrados 37,5% e 47,61% dos g?neros e esp?cies
exclusivas para iscas, por?m nenhum g?nero e esp?cie foram restritos a coleta manual. Em se
tratando de ecossistema de campos de altitude e quando apenas uma das t?cnicas possa ser
utilizada, a isca de sardinha foi a mais eficiente para amostrar a riqueza em VE. Para VR, a coleta
manual se apresentou como a t?cnica mais apropriada para registrar sua riqueza. No entanto, as
armadilhas de queda (na VE) e as iscas (na VR) registraram uma parcela n?o t?o desprez?vel da
riqueza. Em nossos dados, as coletas manuais foram associadas a protocolos de coleta
padronizados, e, apesar de serem bastante criticadas, mostraram efici?ncia no registro de esp?cies
em habitats em que outras t?cnicas mais difundidas n?o podem ser utilizadas. Apesar de
fisionomias distintas apresentarem efici?ncia de t?cnica de coleta diferenciada, ? relevante a
utiliza??o das tr?s t?cnicas para se potencializar ainda mais o registro das esp?cies em ambientes
de campos de altitude.
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Padr?es espaciais de distribui??o de esp?cies e de riqueza espec?fica ao longo de um gradiente montante-jusante e na bacia do Rio dos Sinos (RS) - BrasilPereira, Joana Jord?o 24 September 2018 (has links)
Submitted by PPG Ecologia e Evolu??o da Biodiversidade (eebpg.ciencias@pucrs.br) on 2018-10-16T17:56:11Z
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Tese - Pereira - Joana.pdf: 10961538 bytes, checksum: b96f5fee6d02e741124bc5a31abdb086 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-10-18T13:37:00Z (GMT). No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 2018-09-24 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior - CAPES / Distribution models are considered important tools in biogeography and ecology studies as they allow spatial and temporal extrapolation of species distribution from a set of occurrence data points as function of environmental predictors. In this study, we aimed to propose logistic distribution models for 50 fish species along the Sinos River Basin (Rio Grande do Sul, Brazil), by using altitude and basin area as geomorphological descriptors. Upstream-downstream richness model for entire basin by using multiple and logistic regression was also presented. The dataset derived from several sampling programs performed from 1998 to 2014, comprising 86 sampled locations with fish collections with gillnets, electric fishing or both. Two logistic models were constructed using environmental data of altitude and upstream basin area, testing linear (Model 1) and nonlinear (Model 2) factor responses for each species. Performance of the two models was evaluated using sensitivity, specificity,
AUC (Area Under Curve) and TSS (True Skill Statistical). The adjusted models presented sensitivity values ranging from 47,1 to 99,8, specificity from 49,94 to 98,10, AUC from 0,75 to 0,99 and TSS from 0,26 to 0,98. The linear response model, although simpler, proved to be effective in predicting species distribution, as observed in previous studies. The basin area had a positive effect on the distribution of most species according to the linear model, although this was not verified for nonlinear models due to the interaction between variables. In general, the nonlinear model presented higher performance values for the evaluated metrics for the majority of species, but suffered from overfitting and a patchy distribution estimation. The species richness increased along a longitudinal gradient, presenting its maximum value downstream of the basin. Of the four estimated richness models, models with six variables were the ones with the lowest residual variation. / Modelos de distribui??o s?o considerados como ferramentas importantes em estudos de biogeografia e ecologia, pois permitem a extrapola??o espacial e temporal da distribui??o de esp?cies a partir de um conjunto de dados de ocorr?ncia em fun??o de preditores ambientais. Neste estudo, objetivamos propor modelos de
distribui??o log?stica para 50 esp?cies de peixes ao longo da bacia do rio dos Sinos (Rio Grande do Sul, Brasil), utilizando altitude e ?rea da bacia como descritores geomorfol?gicos. Modelos de riqueza montante-jusante para toda a bacia usando regress?o m?ltipla e log?stica tamb?m foram propostos. O conjunto de dados derivou de v?rios programas de amostragem realizados de 1998 a 2014, compreendendo 86 locais amostrados com coleta de peixes com redes de emalhar, pesca el?trica ou ambos. Dois modelos log?sticos foram constru?dos utilizando dados ambientais de altitude e ?rea de bacia a montante, testando respostas lineares (Modelo 1) e n?o lineares (Modelo 2) para cada esp?cie. O desempenho dos modelos foi avaliado
usando sensibilidade, especificidade, AUC (Area Under Curve) e TSS (True Skill Statistical). Os modelos ajustados apresentaram valores de sensibilidade variando de 47,1 a 99,8, especificidade de 49,94 a 98,10, AUC de 0,75 a 0,99 e TSS de 0,26 a 0,98. O modelo de resposta linear, embora mais simples, mostrou-se eficaz na predi??o da distribui??o de esp?cies, como observado em estudos anteriores. A ?rea da bacia teve um efeito positivo na distribui??o da maioria das esp?cies de acordo com o modelo linear, embora isso n?o tenha sido verificado para os modelos n?o lineares devido ? intera??o entre as vari?veis. Em geral, o modelo n?o linear apresentou valores de desempenho mais altos para as m?tricas avaliadas para a maioria das esp?cies, mas sofreu de hiperajuste e uma estimativa de distribui??o fragmentada. A riqueza de esp?cies aumentou ao longo de um gradiente longitudinal, apresentando seu valor m?ximo a jusante da bacia. Dos quatro modelos estimados de riqueza, os modelos com seis vari?veis foram os que apresentaram a menor amplitude de varia??o dos res?duos.
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Composi??o e din?mica de bandos mistos de aves da Mata Atl?ntica do Baixo Sul da Bahia, BrasilFlores, Fernando Moreira 21 March 2014 (has links)
Submitted by Ricardo Cedraz Duque Moliterno (ricardo.moliterno@uefs.br) on 2015-07-31T21:39:35Z
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Previous issue date: 2014-03-21 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior - CAPES / Mixed flocks of birds are clusters of two or more species whose formation and cohesion depend on behavioral interactions among members. This study investigated the specific composition of mixed flocks in the Atlantic Forest area of Bahia, Brazil, considering the seasonal dynamics of flocks, the vertical distribution of their species, and the determination of species-nucleus, which are responsible for attracting and maintaining the cohesionof other species flocks. From August 2012 to August 2013, monthly expeditions of five days were conducted at the region of the Ecopolo I,in Pratigi Environmental Protection Area (Ibirapitanga, Bahia).The following data were recorded for each mixed-flock contacted: the specific composition, the number of individuals of each species and, when it was possible, the height of foraging, the occurrence of agonistic interactions, estimated intensity of movement and vocalization for each species. Furthermore, the contacts of mixed-flocks component species were recorded when they were seen out of the flocks, observing the foraging height and evidences of reproductive behavior.Was registered 113 contacts with mixed flocks, with a total of 51 species of birds, representing about 30% of the species recorded in the study area.In flocks, the most representative families were Thraupidae and Thamnophilidae - counting this one with two endangered species. Mixed flocks occurred throughout the whole year, being more frequent in August and less frequent from September to April.Due to the constantly rainfall throughoutyear in the study area, there was no correlation between frequency, richness and size of flocks with the monthly pluviosity. There was a negative correlation with the frequency of flocks and temperature. The richness and the size of flocks did not correlate with the temperature.The average richness in flocks was 5,1 ? 2,6 species, and the average size of 5 ? 5,2, individuals, these two variables were correlated positively (r = 0.81, p = <0.0001). The richness was different between the vegetation strato, being the understory flocks richer than the ones in canopy. However, in relation to size of individual numbers, the understory and canopy flocks didn?t present significant difference, because the canopy flocks were composed by a great number of Thraupidaespecies, that happened in large intraspecific group. Inside or outside of mixed flocks, all species foraged in the same height range of vegetation.Among the five most frequent flocks species, three were considered to be species-nucleus(Herpsilochmus rufimarginatus, Lanio cristatusandMyrmotherula urosticta),presenting a higher degree of associations between all species, and capable of recruiting more species for flocks when they took place; flocks where these species-nucleus occurred were richer, indicating that, when put together, these species increased the ability to recruit other species. / Bandos mistos de aves s?o agrupamentos de duas ou mais esp?cies cuja forma??o e coes?o se devema intera??es comportamentais entre seus integrantes. Este estudo investigou a composi??o espec?fica dos bandos mistos em uma ?rea de Mata Atl?ntica da Bahia, considerando a din?mica sazonal dos bandos, a distribui??o vertical de suas esp?cies e a determina??o das esp?cies-n?cleo, que s?o as respons?veis por atrair e manter coesas as demais esp?cies nos bandos. Foram realizadas, de agosto de 2012 a agosto de 2013, expedi??es mensais de cinco dias para a regi?o do Ecopolo I da ?rea de Prote??o Ambiental do Pratigi (Ibirapitanga, Bahia), quando eram registrados os dados de cada bando misto contatado: composi??o espec?fica, n?mero de indiv?duos de cada esp?cie e, sempre que poss?vel, a altura de forrageamento, a ocorr?ncia de agonismos e intensidades estimadas de movimenta??o e vocaliza??o de cada esp?cie; al?m disto, eram registrados os contatos com as esp?cies participantes de bandos mistos quando vistas fora destes, sendo observadas suas alturas de forrageio e evid?ncias de comportamentos reprodutivos. Foram feitos 113 contatos com bandos mistos, dos quais 51 esp?cies de aves, que representam cerca de 30% das esp?cies registradas na ?rea de estudo, participaram. Nos bandos, as fam?lias mais representadas foram Thraupidae e Thamnophilidae ? dentre esta ?ltima, duas esp?cies amea?adas de extin??o. Os bandos mistos ocorreram durante o ano todo, sendo mais frequentes no m?s de agosto e menos frequentes nos meses de setembro a abril. Devido ? ocorr?ncia de chuvas ao longo do ano todo na ?rea de estudo, n?o houve correla??o entre frequ?ncia, riqueza e tamanho dos bandos com a pluviosidade mensal; houve correla??o negativa entre a frequ?ncia dos bandos e a temperatura, n?o havendo correla??o da temperatura com riqueza e tamanho dos bandos. A riqueza m?dia nos bandos foi 5,1? 2,6esp?cies e o tamanho m?dio de,5 ? 5,2, indiv?duos, sendo estas duas vari?veis correlacionadas positivamente(r = 0,81; p = < 0,0001). Houve diferen?a na riqueza entre os estratos da vegeta??o, sendo que no sub-bosque os bandos eram mais ricos que os de dossel. No entanto, quanto ao tamanho, em n?mero de indiv?duos, os bandos de sub-bosque e dossel n?o apresentaram diferen?a significativa, pois os bandos de dossel eram compostos por um grande n?mero de esp?cies de traup?deos que ocorriam em grupos intraespec?ficos grandes. Dentro ou fora dos bandos mistos, todas as esp?cies forrageavam na mesma faixa de altura da vegeta??o. Das cinco esp?cies mais frequentes nos bandos, tr?s foram consideradas como esp?cies-n?cleo (Herpsilochmus rufimarginatus, Lanio cristatus e Myrmotherula urosticta), apresentando um maior grau de associa??es entre todas as esp?cies e capazes de arregimentar mais esp?cies para os bandos onde ocorriam; os bandos onde estas esp?cies-n?cleo ocorriam eram mais ricos, indicando que, quando juntas, estas esp?cies aumentavam a capacidade de arregimentar outras esp?cies.
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Potencial dendrocronol?gico de ?rvores da fam?lia Fabaceae Na Floresta Tropical Amaz?nica Do Peru / Dendrochronological potential of Fabaceae family trees in the Amazon rainforest of PeruPortal Cahuana, Leif Armando 21 February 2017 (has links)
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Previous issue date: 2017-02-21 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior - CAPES / The objective of this work was to determine the dendrochronological potential of five forest species of the Fabaceae family from Amazonia Peru. Five native tree species (Apuleia leiocarpa, Hymenaea oblonglifolia, Myroxylon balsamum, Amburana cearensis and Dipteryx odorata), which occur naturally in the Madre de Dios region of Peru, were used. The anatomical characteristics of the wood, growth ring characterization, dendrochronology, growth modeling and X-ray microdensitometry were determined. In the study of the anatomy and characterization of growth rings, the species H. oblonglifolia and A. cearensis presented rings of Growth to the naked eye, demarcated by the fibrous zones and the marginal parenchyma. In the study of dendrochronology the master chronological series of the H. oblonglifolia species of 1778-2013 years and A. cearensis of 1866-2013 years were constructed, and the relation with the climate of the region (precipitation and temperature), it was verified that the variable Climatic conditions in the area of study determining for the greatest growth in diameter of the trunks of the trees was the last rainfall the species presented answers common to the El Ni?o phenomenon. In the growth modeling study, the species A. cearensis was determined the minimum age according to the Law of Peru of 96 years and a technical age of 58 years and for H. oblonglifolia, it was determined the minimum age according to Law Of Peru of 123 years and a technical age of 57 years. Finally, in the study of the radial physical and anatomical variability of the tree wood of Amburana cearensis, X-ray microdensitometry provided an accurate measurement of the variations in the apparent density of A. cearensis wood, indicative of its anatomical structure and demarcating the limits of the rings Fibrous areas. / O objetivo do trabalho foi Este trabalho foi determinar o potencial dendrocronol?gico de cinco esp?cies florestais da fam?lia Fabaceae oriunda da Amaz?nia Peru. Foram utilizadas cinco esp?cies arb?reas nativas (Apuleia leiocarpa, Hymenaea oblonglifolia, Myroxylon balsamum, Amburana cearensis e Dipteryx odorata), de ocorr?ncia natural na regi?o de Madre de Dios no Peru. Foram determinadas as caracter?sticas anat?micas do lenho, caracteriza??o dos an?is de crescimento, dendrocronologia, modelagem de crescimento e a microdensitometria de raios X. No estudo da anatomia e caracteriza??o dos an?is de crescimento, as esp?cies H. oblonglifolia e A. cearensis, apresentaram an?is de crescimento ao olho nu, demarcados pelas zonas fibrosas e o par?nquima marginal. No estudo de dendrocronologia foram constru?das as s?ries cronol?gicas mestre das esp?cies H. oblonglifolia de 1778-2013 anos e A. cearensis de 1866-2013 anos, e a rela??o com o clima da regi?o (precipita??o e temperatura), verificou-se que a vari?vel clim?tica na ?rea de estudo determinante para o maior crescimento em di?metro dos troncos das ?rvores foi a precipita??o por ?ltimo as esp?cies apresentaram respostas comuns ao fen?meno do El Ni?o. No estudo de modelagem de crescimento a esp?cie A. cearensis, determinou-se a idade m?nima em fun??o a Lei do Peru de 96 anos e uma idade t?cnica de 58 anos e para H. oblonglifolia, determinou-se a idade m?nima em fun??o a Lei do Peru de 123 anos e uma idade t?cnica de 57 anos. Por ?ltimo no estudo da variabilidade radial f?sica e anat?mica do lenho de ?rvores de Amburana cearensis, a microdensitometria de raios X proporcionou uma mensura??o acurada das varia??es da densidade aparente do lenho de A. cearensis, indicativas da sua estrutura anat?mica e demarcando os limites dos an?is pelas zonas fibrosas
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Modelagem computacional da intera??o entre discord?ncias parciais a 90 graus e a superf?cie (111) do sil?cioOLIVEIRA, Arnaldo Cesar Almeida 31 October 2014 (has links)
Submitted by Jorge Silva (jorgelmsilva@ufrrj.br) on 2017-10-13T20:23:03Z
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Previous issue date: 2014-10-31 / CAPES / Understanding the structural properties of dislocations is essential since these defects govern the processes plastic deformation of materials. Particularly in semiconductors, these studies are important given the relevance of these materials for microelectronics. In this work, our focus will be the 90o partial dislocations in silicon. For the theoretical study of atomic-scale crystal dislocations, we use simulations based on semi-empirical quantum-mechanical methods closely linked to the tight-binding treatment, since it considers in its formulation that crystalline electronic states can be described in terms of atomic orbitals: Density Matrix Method Tight-Binding Order-N (DMTB). This method has a low computational cost which allows us to work with very large systems atoms in structures representation -including thousands of sites. In short, we describe how to produce and represent the 90o partial dislocations in Si, we consider three models for its core structure: a unreconstructed where the atoms have an almost fivefold coordination; a model reconstructed with period equal to the perfect lattice; and a model with twice period comparing with the perfect lattice. Finally, we calculate the range in energy of the system with the distance between the dislocations and the free surface of Si. / Compreender as propriedades estruturais de discord?ncias cristalinas ? fundamental uma vez que estes defeitos governam os processos de deforma??o pl?stica em materiais. Particularmente em semicondutores, esses estudos s?o importantes dada a relev?ncia desses materiais para a microeletr?nica. Neste trabalho nosso foco ser?o as discord?ncias cristalinas parciais a 90o em sil?cio. Para o estudo te?rico em escala at?mica das discord?ncias cristalinas, usamos simula??es baseadas em metodologias quanto-mec?nicas semi-emp?ricas atrav?s de um m?todo intimamente ligado ao tratamento tight-binding, uma vez que considera em sua formula??o que os estados eletr?nicos cristalinos podem ser descritos em termos de orbitais at?micos: M?todo da Matriz Densidade Tight-Binding de Ordem-N (DMTB). Este m?todo tem um custo computacional baixo o que permite que trabalhemos com sistemas muito grandes de ?tomos na representa??o das estruturas ? com milhares de s?tios inclusive. Em suma, descrevemos como produzir e representar as discord?ncias parciais a 90o em Si consideramos tr?s modelos para sua estrutura de caro?o: um n?o reconstru?do onde os ?tomos possuem uma coordena??o quase qu?ntupla; um modelo reconstru?do com per?odo igual ao per?odo da rede perfeita; e um modelo com per?odo dobrado em rela??o ao da rede perfeita. Por fim, calculamos a varia??o da energia do sistema com a dist?ncia entre as discord?ncias e a superf?cie livre do Si.
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Caracteriza??o e composi??o flor?stica de uma comunidade sav?nica no Rio Grande do Norte, Brasil : subs?dios para a conserva??oOliveira, Ana Claudia Pereira de 21 February 2011 (has links)
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Previous issue date: 2011-02-21 / Studies on Brazilian biodiversity are still very few and can observe the difference of knowledge between the different regions of the country. This affirmation can be verified in the investigation to identify the rare species in Brazil and the key biodiversity areas (ACBs). In that study were identified for Brasil 2.256 rare species and 752 ACBs. The Rio Grande do Norte (RN) was the only Brazilian state that has not been identified any rare species and no ACBs, possibly due to the lack of floristic studies in this state. A particular area was selected for this study: an area of ecological tension with savanna physiognomy in Rio do Fogo, RN. This savanna community is represented in RN in a fragment and immersed in restinga and caatinga and was identified and described only through of radar imagens there are no studies to date in loco . We have prepared the following questions about this community savanna: 1) The region delimited and described by through of radar images by the RADAMBRASIL, 1976, can be associated of the Cerrado, in terms of floristic ?; 2) What is the floristic composition of this area? This area includes rare species, endemic or endangered? 3) What is the geographical and phytogeographical distribution of plant species registered in this area? 4) Those plant species registered are endemic or have affinity with other areas phytoecological Brazilian? To answer these questions we performed a floristic inventory of the August 2007 to September/2009. The results are presented in two chapters (manuscripts). The first chapter, titled "The Savannah Rio Grande do Norte: floristic links with other plant formations in the Northeast and Center-West Brazil" was submitted to the Revista Brasileira de Bot?ncia. Chapter 1 discusses the phytogeographical distribution of the species, by comparing floristic studies conducted in the Cerrado, Caatinga and Restinga in the Northeast and Cerrado of the Central Brazil. The analysis of data of this study and compilation with other studies indicated that: i) the record of 94 plant species; ii) of total species, about 64% are associated with the Cerrado, the second specialized bibliography, and about 78% as the List of Species of Flora of Brazil. However, about 73% of total species (94) are also distributed in the Caatinga, the Atlantic forest 64%, the Amazon forest 64%, the Pantanal 15% and the Pampa 12%. Floristically the data show that the community studied is influenced by other floras, has a structure where grasses dominate and also because of his appearance the same savanna then be classified as a Savana gram?neo-lenhosa do tabuleiro . Chapter 2, titled "Considerations on the flora of a savanna community in Rio Grande do Norte, northeastern Brazil: Subsidy key area for conservation" was submitted to the Revista Natureza e Conserva??o. This has the objective of improve the knowledge of flora of Rio Grande do Norte and to identify possible rare species and consequently increase the key areas of biodiversity in Brazil. The data indicated that: i) of 94 species registered in the study area, 40 were new records for the Rio Grande do Norte state; ii) These citations to unpublished state, Stylosanthes montevidensis Vogel (Fabaceae) and Aristida laevis (Nees) Kunth (Poaceae) are indicated for the first time to the Northeast of Brazil; iii) are registered in the area 24 species endemic to Brazil and 63 non-endemic; iv) Aspilia procumbens Baker (Asteraceae) registered in the area is considered a restricted species and micro endemic Rio Grande do Norte, ie rare species; v) Aspilia procumbens is also cited in the category of critically endangered species and Stilpnopappus cearensis Hubber (Asteraceae) a species vulnerable to extinction. This study shows a new area phytoecological in Rio Grande do Norte and indicates the area's potential to contribute with the sites of global significance for biodiversity conservation, either locally, regionally and nationally. This will certainly contribute to respond some targets set by the Global Strategy for Plant Conservation and the Convention on Biological Diversity such as the inventory of vegetal diversity in a region with little collection, which will provide data that contributes to questions and themes related to biodiversity. / Estudos sobre a biodiversidade brasileira s?o ainda muito escassos, sendo poss?vel observar uma grande discrep?ncia de conhecimentos entre as v?rias regi?es do pa?s. Esta afirma??o est? baseada no fato de que foram identificadas para o Brasil 2.256 esp?cies raras de plantas e 752 ?reas-chave para biodiversidade (ACBs), no entanto, o Rio Grande do Norte foi o ?nico estado brasileiro que n?o apresentou nenhuma esp?cie rara e nenhuma ?rea-chave para biodiversidade, possivelmente, devido ? escassez de levantamentos flor?sticos nesse estado. O presente estudo foi realizado em um ambiente especial: uma ?rea de tens?o ecol?gica com fisionomia sav?nica localizada no munic?pio de Rio do Fogo, RN. Essa comunidade sav?nica est? representada na forma de pequena mancha e imersa entre a Caatinga e a Restinga. Foi identificado e descrito apenas com base em imagens de radar, n?o havendo, at? o presente momento, estudos in loco. Neste contexto foram elaboradas algumas perguntas sobre essa comunidade sav?nica: 1) A regi?o delimitada e descrita por meio de imagens de radar, RADAMBRASIL de 1976, pode ser do dom?nio Cerrado, do ponto de vista flor?stico?; 2) Qual ? a composi??o flor?stica dessa ?rea? Ela inclui esp?cie rara, end?mica ou amea?ada de extin??o?; 3) Qual ? a distribui??o geogr?fica e fitogeogr?fica das esp?cies vegetais registradas nessa ?rea?; 4) As esp?cies vegetais registradas s?o end?micas ou possuem afinidade com outros dom?nios fitoecol?gicos brasileiro? Visando responder a essas indaga??es foi realizado um levantamento flor?stico, no per?odo de agosto/2007 a setembro/2009. Os resultados obtidos s?o apresentados em forma de dois cap?tulos (manuscritos). O cap?tulo 1, intitulado A Savana do Rio Grande do Norte: Rela??es flor?sticas com outras forma??es vegetais do Nordeste e Centro-Oeste Brasileiro foi submetido ? Revista Brasileira de Bot?nica. Aborda a distribui??o fitogeogr?fica das esp?cies, atrav?s da compara??o com estudos flor?sticos realizados nos cerrados, caatingas e restingas do Nordeste e cerrados do Planalto Central. As an?lises dos dados obtidos no presente trabalho e, tamb?m, atrav?s de compila??o com outros estudos apresentaram: i) o registro de 94 esp?cies vegetais; ii) desse total de esp?cies, cerca de 64 % est?o associadas ao Cerrado, segundo bibliografia especializada, e cerca de 78 % conforme a Lista de Esp?cies da Flora do Brasil. Todavia, cerca de 73 % do total das esp?cies (94) registradas tamb?m se distribuem na Caatinga, 64 % na Floresta Atl?ntica, 50 % na Floresta Amaz?nica, 15 % no Pantanal e 12 % no Pampa. Floristicamente os dados apontaram que comunidade estudada recebe influ?ncia de outras floras, possui uma estrutura onde as gram?neas dominam e tamb?m devido a sua fisionomia sav?nica a mesma, ent?o, poder ser classificada como Savana gram?neo-lenhosa do tabuleiro. O cap?tulo 2, intitulado Considera??es sobre a flor?stica de uma comunidade sav?nica no Rio Grande do Norte, Nordeste do Brasil: Subs?dio de ?rea-chave para a conserva??o foi submetido ? Revista Natureza e Conserva??o. Teve como objetivo contribuir para melhorar o conhecimento sobre a flora do Rio Grande do Norte, identificando poss?veis esp?cies raras e, assim, expandir as ?reas-chave de biodiversidade no Brasil. Os dados obtidos indicaram que: i) das 94 esp?cies encontradas na ?rea de estudo, 39 foram registradas pela primeira vez para o Rio Grande do Norte; ii) dessas cita??es in?ditas para o estado, as esp?cies Stylosanthes montevidensis Vogel (Fabaceae) e Aristida laevis (Nees) Kunth (Poaceae) s?o indicadas, tamb?m, pela primeira vez para a Regi?o Nordeste do Brasil; iii) ocorrem na ?rea 24 esp?cies end?micas do Brasil; iv) Aspilia procumbens Baker (Asteraceae) registrada na ?rea ? considerada uma esp?cie restrita e microend?mica do Rio Grande do Norte, ou seja, esp?cie rara; v) Aspilia procumbens ? tamb?m apontada na categoria das esp?cies criticamente em perigo e Stilpnopappus cearensis Hubber (Asteraceae) uma esp?cie vulner?vel a extin??o. O presente estudo aponta um novo dom?nio citoecol?gico para o Rio Grande do Norte e apresenta o potencial da ?rea em contribuir com os s?tios de signific?ncia global para conserva??o de biodiversidade, seja no ?mbito local, regional e nacional. Isso contribuir? para responder alguns dos objetivos fixados pela Estrat?gia Global para a Conserva??o de Plantas e da Conven??o sobre Diversidade Biol?gica, tal como, o invent?rio da diversidade vegetal, em uma regi?o com pouca coleta, que fornecer? dados que contribuem para quest?es e temas relativos ? biodiversidade.
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Flora e estrutura de remanescente de Floresta Estacional Decidual em Presidente Juscelino, MG.Oliveira, Ana Carolina Ceron 15 February 2012 (has links)
Submitted by Rodrigo Martins Cruz (rodrigo.cruz@ufvjm.edu.br) on 2015-01-23T14:01:54Z
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Previous issue date: 2012 / Este trabalho teve como objetivo conhecer a estrutura da comunidade arb?rea, diversidade, riqueza, as fun??es ecol?gicas das esp?cies, a influ?ncia das vari?veis ambientais, espaciais e os padr?es funcionais das esp?cies na distribui??o da vegeta??o em um fragmento de Floresta Estacional Decidual. O estudo foi conduzido em ?reas de reserva legal de propriedades particulares no munic?pio de Presidente Juscelino (MG), nas coordenadas 18?38?40?S e 44?04?57?W, com altitudes variando entre 600 e 890 m. O remanescente possui aproximadamente 150 ha, com relevo c?ncavo e declividades acentuadas. Foram observadas por??es ?reas com alto grau de dist?rbios antr?picos. H? evid?ncias de corte raso em uma faixa de vegeta??o, assim como de corte seletivo de algumas esp?cies de interesse comercial. Destaca-se tamb?m a exist?ncia de dist?rbios como, a alta compacta??o do solo gerada pela entrada de gado em algumas parcelas, clareiras naturais e antr?picas; solo exposto e trilhas ao longo do fragmento. Para o invent?rio florestal foram alocadas 25 parcelas permanentes de 20 ? 20 m (400 m?), totalizando ?rea amostral de 1 hectare. Nestas foram amostrados todos os indiv?duos arb?reos com circunfer?ncia ? altura do peito (CAP) > 15,7 cm, exceto lianas e indiv?duos mortos. As esp?cies amostradas foram classificadas em cinco sistemas de guildas (grupo ecol?gico, dispers?o, poliniza??o, toler?ncia ? desseca??o e densidade da madeira), a fim de formar grupos funcionais. Para a avalia??o das rela??es entre as vari?veis ambientais e a distribui??o do compartimento arb?reo, foram coletadas aleatoriamente no interior de cada parcela cinco amostras simples do solo superficial (0?20 cm), com cerca de 500 g de solo. Al?m do solo foram coletadas vari?veis de relevo, dossel e matriz de impacto (natural e antr?pico). Estas foram submetidas a uma An?lise dos Componentes Principais (PCA), onde apenas cinco das 28 vari?veis iniciais apresentaram alta correla??o: Calc?rio (Ca); Pot?ssio (k); Argila; rocha exposta e mat?ria org?nica. Tr?s das cinco esp?cies de maior valor de import?ncia apresentaram distribui??es diam?tricas relacionados com efeitos de resposta p?s-dist?rbio e a caracter?sticas da pr?pria esp?cie. Foi verificado um alto valor de H?, o que indica uma ?rea com diversidade relativamente alta e um baixo valor para J? e uma forte domin?ncia ecol?gica de esp?cies. Os resultados da an?lise de parti??o da vari?ncia a partir dos modelos de regress?o m?ltipla feita para cada eixo da an?lise NMDS mostraram que a distribui??o da vegeta??o est? altamente correlacionada com a estrutura espacial e ? influenciada em parte pelas vari?veis ambientais argila e mat?ria org?nica. A an?lise de classifica??o Twinspan definiu quatro grupos distintos entre as esp?cies avaliadas os quais se diferenciaram em rela??o ?s suas fun??es ecol?gicas. A compara??o da participa??o dos grupos de ordena??o da NMDS em rela??o aos grupos funcionais de classifica??o Twinspan, mostrou que a ?rea estudada apresenta um padr?o funcional dominado por esp?cies pioneiras a secund?rias iniciais, com dispers?o anemoc?rica e germina??o ortodoxa. O fragmento estudado encontra-se em um est?dio inicial de sucess?o secund?ria, onde as diferentes estrat?gias ecol?gicas das esp?cies ocuparam posi??es distintas ao longo do fragmento, apresentando tend?ncias adaptativas das esp?cies as condi??es do ambiente. Os resultados refor?am a hip?tese da grande import?ncia de conserva??o deste fragmento de Floresta Estacional Decidual. / Disserta??o (Mestrado) ? Programa de P?s-Gradua??o em Ci?ncia Florestal, Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri, 2012. / ABSTRACT This study aimed to know the structure of the tree community, diversity, richness, the ecological functions of species, the influence of environmental variables, spatial and functional patterns of the species in the vegetation distribution in a fragment of Deciduous Forest. The study was conducted in areas of legal reserve of private properties in the municipality of President Juscelino (MG), at coordinates 18 ? 38'40 "S and 44 ? 04'57" W, with altitudes ranging between 600 and 890 m. The remainder has approximately 150 ha, with concave topography and steep slopes. Portions were observed areas with a high degree of human disturbance. There is evidence of clear-cutting in a strip of vegetation, as well as selective logging of some species of commercial interest. Also noteworthy is the existence of disorders such as high soil compaction caused by the entry of cattle in some parts, natural and anthropogenic clearings, exposed soil and trails along the fragment. For the forest inventory were allocated 25 permanent plots of 20 ? 20 m (400 m?), a total sample area of ??1 hectare. These were all sampled trees with circumference at breast height (CAP)> 15.7 cm, except lianas and dead individuals. The sampled species were classified into five systems guilds (ecological group, dispersion, pollination, desiccation tolerance and density of the timber) to form functional groups. To assess the relationships between environmental variables and distribution of tree compartment were collected randomly within each plot five single samples of surface soil (0-20 cm), with about 500 g of soil. Apart from the soil were collected relevant variables, canopy and impact matrix (natural and man-made). These were submitted to a Principal Component Analysis (PCA), where only five of the 28 initial variables were highly correlated: Limestone (Ca), Potassium (k), Clay, exposed rock and organic matter. Three of the five species of greatest importance value showed diameter distributions related to effects of disorder and post-response characteristics of the species itself. There was a high value H ', which indicates an area with relatively high diversity and a low value for J' and a strong predominance ecological species. The results of analysis of variance partitioning from the multiple regression models made for each shaft NMDS analysis showed that the distribution of vegetation is highly correlated with the spatial structure and is partly influenced by environmental clay and organic matter. The classification analysis Twinspan identified four distinct groups among the studied species which differ in relation to their ecological functions. The comparison of the participation of groups of NMDS ordination in relation to the functional group classification Twinspan showed that the study area presents a functional pattern dominated by pioneer species to early secondary, with orthodox anemochoric and germination. The fragment is studied in an early stage of secondary succession, where the different ecological strategies species occupied different positions along the fragment, present trends adaptive species environmental conditions. The results reinforce the hypothesis of the importance of conservation of this fragment Deciduous Forest.
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