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Analise floristica e ordenação de especies arboreas da mata Atlantica atraves de dados binariosSiqueira, Marinez Ferreira de 22 December 1994 (has links)
Orientador: Fernado Roberto Martins / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-19T23:25:33Z (GMT). No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 1994 / Resumo: A Mata Atlântica, apesar de ser um dos ecossistemas mais diversificados do Brasil é, ainda pouco conhecido floristicamente. Existe muita divergência quanto a sua localização e seus limites. O objetivo principal deste trabalho é tentar encontrar algum padrão no componente arbóreo da vegetação que possa caracteriza-la como um bloco homogêneo ou como um conjunto de blocos floristicamente distintos. Foi considerada Mata Atlântica a formação florestal ocorrentes nas serras do Mar, da Mantiqueira e Geral, as matas do sul da Bahia e norte do Espírito Santo e fragmentos de vegetação no Nordeste. Para o estado de São Paulo. considerou-se também parte do Planalto Atlântico. A partir de um levantamento bibliográfico sobre a vegetação de Mata Atlântica, selecionaram-se 63 levantamentos do componente arbóreo presente nos estados de Alagoas, Bahia, Espírito Santo. Rio de Janeiro. São Paulo, Paraná. Santa Catarina e Rio Grande do Sul. Com base nos levantamentos, foi montado um banco de dados binários das espécies arbóreas ocorrentes nessas regiões. totalizando 1706 espécies. reduzidas a 1338 devido a correção e atualização dos táxons pela literatura. Foram utilizados os índices de Jaccard e de pareamento simples para medir o grau de semelhança entre as amostras. Os valores de similaridade foram submetidos a uma análise de aglomerados. As áreas foram ordenadas pelo PCO e as espécies pelo Twinspan. Cerca de 0.1% das espécies. 6% dos gêneros e 38% das famílias ocorreram em mais da metade das 63
localidades utilizadas. o que mostra a heterogeneidade da vegetação em questão. A Região Sudeste apresentou a maior riqueza de espécies (85%), seguido pelo Nordeste (22%) e o Sul com 18%. A Região Nordeste apresentou a maior concentração de táxons sem identificação a nível de espécies, gêneros e famílias. Foram identificados, de uma forma geral, dois grandes blocos floristicos na Mata Atlântica. Um presente na Região Nordeste e outro na Região Sudeste/Sul. O bloco do Nordeste divide-se em dois, um presente no estado de Alagoas e outro no estado da Bahia. A Região Sudeste/Sul divide-se, de uma forma bem menos nítida, em cinco grupos, dois no estado de São Paulo e três
na Região Sul. No estado de São Paulo, os dois blocos observados fazem uma separação nítida entre as floras próximas ao litoral (ocorrentes em planície ou em serras) e as matas do interior (ocorrentes em planalto ou em serras). As áreas pertencentes ao estado do Espírito Santo apareceram ora associadas ao bloco do Nordeste, ora ao bloco do Sudeste/Sul, ou mesmo totalmente isoladas dependendo do método utilizado. O que sugere que seja nesta região a área de sobreposição das distribuições geográficas dos dois grandes blocos floristicos, ou que seja um grande centro de diversidade de espécies da Mata Atlântica / Abstract: The floristic of the Atlantic Forest is not well know, despite being one of the most diversified ecosystems in Brazil. There is a lot of disagreement regarding it's location and boundaries. The main objective of this work is to determine a pattern on the arboreal vegetation that classifies it as a homogeneous block or a set of blocks with distinct floristics. The Atlantic Forest was considered as being the Forestry present in the mountain ridge of Mantiqueira, of Mar and Geral, plus the forests at the south of Bahia State and north of Espirito Santo State, and vegetation fragments on the northeast of Brazil. In the São Paulo State, it was included the Atlantic Plateau. Beginning with a
bibliographic survey about the Atlantic Rain Forest vegetation, 63 arboreal surveys were selected in the States of Alagoas, Bahia, Espírito Santo, Rio de Janeiro, São Paulo, Parana, Santa Catarina and Rio Grande do Sul. Based on these surveys a database was structured with binary data on the arboreal species occurring in these regions, adding 1706 species, reduced to 1338 due to taxon actualization. The Jaccard Index and Simple
Matching were utilized to access the similarity between samples. The similarity values were submitted to cluster analysis. The areas were ordered by PCO and the Twinspan species. About 0,1% of the species, 6% of the genera and 38% of the families occurred in more than 50% of the localities studied, which shows the heterogeneity of the vegetation. The Southeast Region presented the greatest concentration of species (85%), followed by the Northeast Region (22%) and the South Region (18%). The Northeast Region presented the greatest concentration of taxa without identification at species, genera and family leveI. Two floristic blocks were individualized in the Atlantic Forest: one in the Northeast Region and the other in the southeast and South Region of Brasil. The northeast block is divided in two parts, one in the State of Alagoas and another in the State of Bahia. The Southeast South Block is divided, less distinctly, in five parts: two in the State of São
and three in the South Region of Brasil. In the State of São Paulo, the two observed blocks separated the coast flora (occurring in plains and mountain ridges) and the interior forests (occurring in plateaus and mountain ridges). The areas in the State of Espírito Santo are associated with the northeast block, the southeast block or isolated, depending in the methodology utilized, suggesting that the region is the overlap area of the geographic distribution of the two great floristic blocks, or a biodiversity center of Atlantic Forest species / Mestrado / Ecologia / Mestre em Ciências Biológicas
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Estudos taxonomicos sobre Ouratea parviflora (DC.) Baill (Ochnaceae) e especies afins ocorrentes em florestas atlantica nas regiões sudeste e sul do BrasilYamamoto, Kikyo, 1954- 24 February 1995 (has links)
Orientador: Graziela Maciel Barroso / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-20T03:04:16Z (GMT). No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 1995 / Resumo: O presente trabalho consiste em estudos taxonômicos sobre três complexos de espécies pertencentes ao gênero Ouratea Aublet (Ochnaceae), ocorrentes em Floresta Atlântica nas regiões sudeste e sul do Brasil.Estes complexos compreendem 24 entidades taxonômicas descritas sob 55 binômios ou trinômios e sete epítetos genéricos.O trabalho é realizado basicamente com material herborizado. Oito espécies e três variedades são distinguidas através de estudos macromorfológicos clássicos apoiados por Análises de Componentes Principais (PCA) e pesquisas sobre o valor taxonômico de caracteres anatômicos de caule e de folha: (1) Ouratea parviflora (DC.) Baill. var. parviflora; (1') O. parviflora var. granulosa (Tiegh.) K. Yamamoto comb. nov.; (2) O. luschnathiana (Tiegh.) K. Yoonamoto comb. nov.; (3) O. multiflora (Pohl) Engl.; (4) O. sellowii (Planch.) Engl. var. sellowii; (4') O. sellowii var. linearis (Gray) K. Yamamoto comb. novo ; (5) O. linearifolia K. Yamamoto sp. novo ; (6) O. stipulata (Vell.) Engl. var. stipulata; (6') O. stipulata var. pentandra Planch.; (7) O. miersii (Planch.) Engl.; e (8) O. conduplicata (Klotzsch) Engl.. Além destes taxons, quatro grupos informais também são reconhecidos dentro de O. parviflora var. parviflora. Estes grupos podem ser distinguidos por pequenas diferenças morfológicas associadas a distribuições geográficas mais ou menos diferenciadas, e são equivalentes a espécies ou pares de espécies sinonimizadas: (a) grupo parviflora s.s.; (b) grupo Gaudichaudii (=Plicouratea Guadichaudi Tiegh. e P. bicolor Tiegh.); (c) grupo lucidula (= Ouratea lucidula (Turcz.) Engl. e P. Riedeli Tiegh.); e (d) grupo Conegi (= P. Conegi Tiegh.). O emprego de um método numérico de ordenamento como a PCA é defendido como uma ferramenta útil em estudos taxonômicos de complexos de espécies porque eles podem ser eficazes para mostrar padrões de variação definidos através de um número grande de caracteres. Este tipo de método é considerado especialmente valioso para evidenciar tendências de diversificação como aqueles representados pelos grupos informais distinguidos dentro de O. parviflora var. parviflora. Constatou-se também o valor taxonômico de alguns caracteres anatômicos como o tipo celular predominante em epiderme foliar (esclerificado ou não), presença de esclereídeos foliares, e presença e abundância de "células cristárquicas" no córtex caulinar. Ocorrência de hibridacão introgressiva é sugerida como possível causa de sobreposição de características entre espécies. A influência de fatores ambientais como seca e/ou baixas temperaturas sazonais também é sugerida para explicar as diferenciações anatômicas e morfológicas encontradas nos taxons estudados / Abstract: Taxonomic studies concerning of three species complexes belonging to the genus Ouratea Aublet (Ochnaceae) distributed through the Atlantic Forest in Southeast and Southern Brazil are presented. These complexes comprize 24 taxonomic enti ties described under 55 binonyms or trinonyms and seven generic epithets. The studies are mainly based upon herbarium material. Eight species and three varieties are distinguished by means of classical macromorphological studies allied to Principal Component Analysis (PCA) and researches about the taxonomic value of stem and leaf anatomical characters: (1) Ouratea parviflora (DC.) Baill. varo parviflora; (1') O. parviflora var. granulosa (Tiegh.) K. Yamamoto comb. nov.; (2) O. luschnathiana (Tiegh.) K. Yamamoto comb. nov.; (3) O. multiflora (Pohl) Engl.; (4) o. sellowii (Planch.) Engl. varo sellowii; (4') O. sellowii var. linearis (Gray) K. Yamamoto comb. nOV.; (5) O. linearifolia K. Yamamoto sp. nOV.; (6) O. stipulata (Vell.) Engl. Var. stipulata; (6') O. stipulata varo pentandra Planch.; (7) O. mirsii (Planch.) Engl.; and (8) O. COnduplicata (Klotzsch) Engl.. Besides these taxa, four informal groups are recognized within O. parviflora var. parviflora. They may be distinguished by some slight morphological differences associated to a more or less particular geographical distribution. Each one of them is equivalent to a synonymized species or couple of species: (a) parviflora s.s. group; (b) Gaudichaudii group (= Plicollratea Guadichaudi Tiegh. and P. bicolor Tiegh.); (c) lucidula group (= OUl'atea lucidula (Turcz.) Engl. and P. Riedeli Tiegh.); and (d) Conegi group (= P. Conegi Tiegh.). The use of a numerical ordering method such as the PCA is defended as a helpful tool in taxonomic studies of species complexes because it may be efficient to show variation patterns defined by a great number of characteres. This kind of method is considered especially valuable to show some trends of diversification as like as those represented by the informal groups recognized within O. parviflora var. parviflora. Taxonomic value is accepted for some anatomical characteres: the predominant leaf epidermal cell type (sclerified or not); the presence of leaf sclereids; and the presence and abundance of "cristarque cells" in the stem cortex. Occurence of introgressive hibridization is suggested to explain the overlapping of many characteristics between species. Otherwise, the influence of environmental factors such as seasonal drought andjor low temperatures vs. warm, humid and more or less constant climate is also suggested to explain the anatomical and morphological differentiations found among the taxa studied. / Doutorado / Biologia Vegetal / Doutor em Ciências Biológicas
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Flora das plantas trepadeiras do Parque Nacional do Catimbau, Pernambuco, BrasilDELGADO JÚNIOR, Geadelande Carolino 27 February 2014 (has links)
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Previous issue date: 2014-02-27 / CAPES / Este estudo foi realizado no Parque Nacional do Catimbau, localizado em Buíque, Tupanatinga e Imbimirim pertencente ao estado de Pernambuco, semi-árido do nordeste brasileiro. Foram registradas 107 espécies de plantas trepadeiras, pertencentes a 54 gêneros e 18 famílias. As famílias mais diversas foram Convolvulaceae (24), Apocynaceae (13), Fabaceae e Bignoniaceae com 12 cada uma, Malpighiaceae (11). Os gêneros com maior número de espécies foram Ipomoea L. (12 spp) e Jacquemontia Choisy (6), ambos pertencentes à Convolvulaceae, Ditassa R.Br. (Apocynaceae), Dioscorea L. (Dioscoreaceae), Centrosema (DC.) Benth. (Fabaceae), Passiflora L. (Passifloraceae) e Serjania Mill. (Sapindaceae) foram representados por quatro espécies cada um. As plantas trepadeiras lenhosas e herbáceas tiveram valores equivalentes, 51% e 49%, respectivamente. No que diz a respeito aos mecanismos de ascensão, a volubilidade foi o mais frequente, ocorrendo em 70% das espécies. Novas ocorrências de espécies em Pernambuco e na Caatinga foram registradas. São apresentadas chaves de identificação, descrições e comentários sobre as espécies e ilustrações de alguns caracteres de diagnóstico. / This study was undertaken in “Parque Nacional do Catimbau”, located in Pernambuco, Brazilian northeastern semiarid, where 107 species of climbing plants were recorded. They belonging to 54 genera and 18 families. The most diverse families were Convolvulaceae (24), Apocynaceae (13), Fabaceae and Bignoniaceae with 12 each one, Malpighiaceae (11). The genus with highest number of species were Ipomoea L. (12 spp) and Jacquemontia Choisy (6), both belonging to Convolvulaceae, Ditassa R.Br. (Apocynaceae), Dioscorea L. (Dioscoreaceae), Centrosema (DC.) Benth. (Fabaceae), Passiflora L. (Passifloraceae) and Serjania Mill. (Sapindaceae) were represented by four species each. The wood and herbaceous climbing plants have a equivalent values, 51% and 49% respectively. As regards the attachment mecachanisms, twining was the most frequent, occurring in 70% of the species. New occurrences of species in Pernambuco and in the Caatinga were recorded. Identification key, descriptions and comments on the species and illustrations of some diagnostic characters are presented.
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Comparação de três diferentes modelos animais para avaliação de patogenicidade de cepas de Pasteurella multocida isoladas de aves e suínos, e associação da patogenicidade a diferentes grupos molecularesPilatti, Roberta Marmitt January 2018 (has links)
Apesar de ser uma bactéria que compõe a microbiota respiratória, sob algumas circunstâncias pode manifestar-se como um agente patogênico primário ou secundário, causando doença em aves e outros animais. Como agente primário, P. multocida leva a grandes perdas econômicas, causando cólera em aves, rinite atrófica em suínos e septicemia hemorrágica em bovinos e bubalinos. P. multocida é uma espécie heterogênea e a patogenicidade dos isolados pode ser amplamente variável. A suscetibilidade do hospedeiro a essas cepas varia consideravelmente entre espécies. Inoculações experimentais em camundongos e aves são comumente usadas para avaliar a patogenicidade de diferentes cepas, mas os resultados são geralmente subjetivos e pouco mensuráveis. O objetivo deste trabalho foi estabelecer uma nova metodologia para classificar a patogenicidade de cepas de P. multocida, através da formulação de um índice padrão. Para determinar esse índice, foram selecionadas 97 amostras de P. multocida, isoladas de cólera em aves e rinite em suínos. Cem microlitros de uma cultura bacteriana contendo 103 UFC/mL de cada isolado de P. multocida, foram inoculados pela cavidade córioalantoide, em 3 ovos embrionados. Além da mortalidade causada pela infecção, o tempo de morte e as lesões macroscópicas foram avaliados. Diferenças significativas foram observadas entre isolados de aves e suínos em relação aos índices de patogenicidade. O número de lesões e o percentual de bactérias recuperadas dos embriões inoculados também variaram de acordo com a origem do isolado. A partir dos índices observados, os isolados foram distribuídos em três classes de patogenicidade: alta, média e baixa. A avaliação dos diferentes índices de patogenicidade, estudados neste trabalho, permitem o estabelecimento de novos modelos de avaliação de patogenicidade de isolados de P. multocida e podem ser uma alternativa aos modelos subjetivos até então utilizados. A comparação dos índices de patogenicidade obtidos nos diferentes modelos analisados nos permite afirmar que a variação esperada para os diferentes modelos não pode ser observada. A análise dos diferentes perfis genéticos obtidos para as cepas de origem aviária, a partir da clivagem do gene ompH e da técnica de PCR-RFLP também não revelou diferença estatística entre os perfis obtidos e suas respectivas patogenicidades obtidas no modelo experimental de camundongos. / Although it is a bacterium that makes up the respiratory microbiota, under some circumstances it may manifest itself as a primary or secondary pathogen, causing disease in birds and other animals. As a primary agent, P. multocida leads to severe economic losses, causing cholera in birds, atrophic rhinitis in pigs and hemorrhagic septicemia in cattle and buffaloes. P. multocida is a heterogeneous species and the pathogenicity of the isolates can be widely variable. The susceptibility of the host to these strains varies considerably between species. Experimental inoculations in mice and birds are commonly used to evaluate the pathogenicity of different strains, but the results are generally subjective and poorly measurable. The objective of this work was to establish a new methodology to classify the pathogenicity of P. multocida strains by formulating a standard index. To determine this index, 97 samples of P. multocida, isolated from cholera in birds and rhinitis in swine, were selected. One hundred microliters of a bacterial culture containing 103 CFU / mL of each P. multocida isolate were inoculated by the chorioallantoic cavity in 3 embryonated eggs. In addition to infection mortality, time of death and macroscopic lesions were assessed. Significant differences were observed between isolates of birds and pigs in relation to pathogenicity indexes. The number of lesions and the percentage of bacteria recovered from the inoculated embryos also varied according to the origin of the isolate. From the observed indices, the isolates were distributed in three pathogenicity classes: high, medium and low. The evaluation of the different pathogenicity indexes, studied in this work, allows the establishment of new pathogenicity evaluation models of P. multocida isolates and may be an alternative to the subjective models previously used. The comparison of the pathogenicity indices obtained in the different models analyzed allows us to state that the variation expected for the different models can not be observed. The analysis of the different genetic profiles obtained for the strains of avian origin, from the cleavage of the ompH gene and the PCR-RFLP technique also did not reveal statistical difference between the profiles obtained and their respective pathogenicities obtained in the experimental model of mice. Key words: Pasteurella multocida, pathogenicity index, embryonated eggs, mice, chicks.
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Revisão e análise cladística do gênero Plesiopelma Pocock, 1901 (Araneae, Theraphosidae). / Revision and cladistic analysis of the genus Plesiopelma pocock, 1901 (Araneae, Theraphosidae).Nagahama, Roberto Hiroaki 22 April 2010 (has links)
O gênero Plesiopelma Pocock, 1901 é revisado taxonomicamente e realizada análise cladística de suas espécies. A matriz com 30 táxons terminais e 49 caracteres foi analisada com dois programas para reconstrução filogenética, considerando tanto caracteres aditivos como não-aditivos. As quatro análises apresentaram diferenças na topologia, porém três delas demonstram que Plesiopelma é um gênero monofilético. A diagnose e a distribuição geográfica das espécies são apresentadas. São consideradas válidas as espécies P. flavohirtum (Simon, 1889), P. semiaurantiacum (Simon, 1897),P. myodes Pocock, 1901, P. insulare (Mello-Leitão, 1923), P. physopus (Mello-Leitão, 1926), P. minense (Mello-Leitão, 1943) e P. simoni (Soares e Camargo, 1948). É proposta a sinonímia de P. rectimanum (Mello-Leitão, 1923) e P. longisternale (Schiapelli e Gerschman, 1942) com P. myodes. São reconhecidas seis espécies novas para o Brasil. É proposta a transferência de P. imperatrix Piza, 1976 para o gênero Megaphobema Pocock, 1901 e P. gertschi (Caporiacco, 1955) é considerada Incertae sedis. / The genus Plesiopelma Pocock, 1901 is taxonomically revised and a cladistic analysis of its species is done. The matrix with 30 terminal taxa and 49 characters was analysed with two programs for phylogenetic reconstruction. The four analyses showed different topologies on the internal group, however, three of them show Plesiopelma being a monophyletic genus. The diagnoses and geographic distribution of all species are presented. It is herein considered valid the species P. flavohirtum (Simon, 1889), P. semiaurantiacum (Simon, 1897), P. myodes Pocock, 1901, P. insulare (Mello-Leitão, 1923), P. physopus (Mello-Leitão, 1926), P. minense (Mello-Leitão, 1943) and P. simoni (Soares e Camargo, 1948). The species P. rectimanum (Mello-Leitão, 1923) and P. longisternale (Schiapelli & Gerschman, 1942) are considered junior-synonyms of P. myodes. It is recognized six new species from Brazil. It is proposed the transfer of P. imperatrix Piza, 1976 to Megaphobema Pocock, 1901 and P. gertschi (Caporiacco, 1955) is considered Incertae sedis.
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Classificação de imagens de diversas fontes de informação com o uso de controladores de influência para as imagens e suas classes.Orlando Alves Máximo 19 December 2008 (has links)
Este trabalho aborda as técnicas de classificação supervisionada de imagens utilizando controladores de influência. Avaliou-se o desempenho do uso dos controladores de influência das imagens e também das classes presentes nas imagens. Para a determinação dos valores dos controladores de influência, foram propostos métodos para a estimativa dos controladores de influência das imagens e das suas classes. Dentre os métodos propostos, destacam-se os indicadores de separabilidade entre as classes da imagem e os provenientes do cálculo do coeficiente kappa e da Precisão Global da classificação. Apresentou-se, também, a proposta de um novo classificador que incorpora o conceito de controladores de influência através das probabilidades de ocorrência condicionais das classes presentes nas imagens. Para os testes de avaliação de desempenho do uso de controladores de influência, foram utilizados seis conjuntos de duas imagens SAR (originais e filtradas com filtros da média com janelas 3×3, 5×5 7×7, 9×9 e 11×11). O desempenho dos classificadores propostos mostrou-se superior aos Classificadores em Cascata, da Distância Euclidiana e da Distância de Mahalanobis, que não incorporam o conceito de controladores de influência em sua estrutura. Para os testes de desempenho do classificador baseado nas probabilidades de ocorrência condicional das classes, foram utilizados quatro conjuntos de imagens SAR simuladas. A análise dos resultados evidencia que o classificador proposto obteve desempenho superior ao Classificador em Cascata.
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Abordagens de seleção de variáveis para classificação e regressão em química analítica / Feature selection approaches for classification and regression in analytical chemistrySoares, Felipe January 2017 (has links)
A utilização de técnicas analíticas para classificação de produtos ou predição de propriedades químicas tem se mostrado de especial interesse tanto na indústria quanto na academia. Através da análise da concentração elementar, ou de técnicas de espectroscopia, é possível obter-se um grande número de informações sobre as amostras em análise. Contudo, o elevado número de variáveis disponíveis (comprimentos de onda, ou elementos químicos, por exemplo) pode prejudicar a acurácia dos modelos gerados, necessitando da utilização de técnicas para seleção das variáveis mais relevantes com vistas a tornar os modelos mais robustos. Esta dissertação propõe métodos para seleção de variáveis em química analítica com propósito de classificação de produtos e predição via regressão de propriedades químicas. Para tal, inicialmente propõe-se um método de seleção de intervalos não equidistantes de comprimentos de onda em espectroscopia para classificação de combustíveis, o qual baseia-se na distância entre espectros médios de duas classes distintas; os intervalos são então utilizados em técnicas de classificação.Ao ser aplicado em dois bancos de dados de espectroscopia, o método foi capaz de reduzir o número de variáveis utilizadas para somente 23,19% e 4,95% das variáveis originais, diminuindo o erro de 13,90% para 11,63% e de 4,71% para 1,21%. Em seguida é apresentado um método para seleção dos elementos mais relevantes para classificação de vinhos provenientes de quatro países da América do Sul, baseado nos parâmetros da análise discriminante linear. O método possibilitou atingir acurácia média de 99,9% retendo em média 6,82 elementos químicos, sendo que a melhor acurácia média atingida utilizando todos os 45 elementos disponíveis foi de 91,2%. Por fim, utiliza-se o algoritmo support vector regression – recursive feature elimination (SVR-RFE) para seleção dos comprimentos de onda mais importantes na regressão por vetores de suporte. Ao serem aplicado em 12 bancos de dados juntamente com outros métodos de seleção e regressão, o SVR e o SVR-RFE obtiveram os melhores resultados em 8 deles, sendo que o SVR-RFE foi significativamente superior dentre os algoritmos de seleção. A aplicação dos métodos deseleção de variáveis propostos na presente dissertação possibilitou a realização de classificações e regressões mais robustas, bem como a redução do número de variáveis retidas nos modelos. / The use of analytical techniques in product classification or chemical properties estimation has been of great interest in both industry and academy. The employment of spectroscopy techniques, or through elemental analysis, provides a great amount of information about the samples being analyzed. However, the large number of features (e.g.: wavelengths or chemical elements) included in the models may jeopardize the accuracy, urging the employment of feature selection techniques to identify the most relevant features, producing more robust models. This dissertation presents feature selection methods focused on analytical chemistry, aiming at product classification and chemical property estimation (regression). For that matter, the first proposed method aims at identifying the most relevant wavelength intervals for fuel classification based on the distance between the average spectra of the two classes being analyzed. The identified intervals are then used as input for classifiers. When applied to two spectroscopy datasets, the proposed framework reduced the number of features to just 23.19% and 4.95% of the original ones, also reducing the misclassification error to 4.71% and 1.21%. Next, a method for identifying the most important elements for wine classification is presented, which is based on the parameters from linear discriminant analysis and aims at classifying wine samples produced in four south American countries. The method achieved average accuracy of 99.9% retaining average 8.82 chemical elements; the best accuracy using all 45 available chemical elements was 91.2%. Finally, the use of the support vector regression – recursive feature elimination (SVR-RFE) algorithm is proposed to identify the most relevant wavelengths for support vector regression. The proposed framework was applied to 12 datasets with other feature selection approaches and regression algorithms. SVR and SVR-RFE achieved the best results in 8 out of 12 datasets; SVR-RFE when compared to other feature selection algorithms proved have significantly better performance. The employment of the proposed feature selection methodsin this dissertation yield more robust classifiers and regression models, also reducing the number of features needed to produce accurate results.
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Citotaxonomia dos triatomíneos : a citogenética como ferramenta no estudo do complexo Triatoma brasiliensis e do subcomplexo Brasiliensis /Alevi, Kaio Cesar Chaboli. January 2014 (has links)
Orientador: Maria Tercília Vilela de Azeredo Oliveira / Banca: Grasiela de Campos Dias Severi Aguiar / Banca: Hermione Elly Melara de Campos Bicudo / Resumo: As análises citogenéticas têm se mostrado como importantes ferramentas para o estudo da taxonomia dos triatomíneos. Dessa forma, a utilização de técnicas citogenéticas poderá esclarecer a problemática existente na classificação atual das espécies que compõem o subcomplexo Brasiliensis. Essas espécies foram agrupadas apenas por dados morfológicos e pela distribuição geográfica e diferem das espécies agrupadas no complexo Triatoma brasiliensis, com base em diferentes abordagens que levaram à indicação da monofilia. O presente trabalho descreve aspectos citogeneticos de T. lenti, T. sherlocki, T. melanocephala e T. vitticeps, com o intuito de avaliar a posição desses vetores no subcomplexo Brasiliensis e analisar uma possível relação de T. lenti, T. melanocephala e T. vitticeps com o complexo T. brasiliensis. Análises citogenéticas clássicas (Orceína Lacto-Acética, Impregnação por íons prata e Bandamento C) e moleculares (Hibridização in situ - FISH) foram realizadas em machos adultos. T. lenti e T. sherlocki, que apresentaram muitas características cromossômicas em comum, como o número de cromossomos (2n = 20A + XY), disposição da heterocromatina constitutiva nos autossomos (uma ou ambas as extremidades dos cromossomos) e na disposição das Regiões Organizadoras Nucleolares (RONs) (um par de autossomos). Esses insetos foram diferenciados por meio de marcações observadas nas espermátides, o que foi proposto como ferramenta citotaxonômica diagnóstica. T. melanocephala e T. vitticeps apresentaram o mesmo número de cromossomos (2n = 20A + X1X2X3Y) e as mesmas características durante a espermatogênese. No entanto, esses vetores puderam ser diferenciados pela disposição dos blocos heterocromáticos, pela disposição das RONs e pela análise da espermiogênese. Assim, com base nessas características, corroboramos a posição de T. lenti e T. sherlocki no subcomplexo Brasiliensis e propomos a ... / Abstract: Cytogenetic analyzes have shown to be important tools to study the taxonomy of the triatomines. Thus, the use of cytogenetic techniques may clarify the problems existing in the current classification of species that form the Brasiliensis subcomplex. The species in the subcomplex were grouped only by morphological data and geographical distribuition and differs from the species in the Triatoma brasiliensis complex, on the basis of on different approaches that indicate the monophyly. The present paper describes cytogenetically T. lenti, T. sherlocki, T. melanocephala and T. vitticeps, in order to evaluate the position of these vectors in the Brasiliensis subcomplex and analyze a possible relationship of T. lenti, T. melanocephala and T. vitticeps with the T. brasiliensis complex. Classical cytogenetic analysis (Lacto-acetic orcein, silver nitrate staining and C banding) and molecular (in situ hybridization - FISH) were performed in adult males. T. lenti and T. sherlocki showed several chromosomal characteristics in common, such as the number of chromosomes (2n = 20A + XY), disposition of constitutive heterochromatin in the autosomes (one or both ends of the autosomes) and the staining of nucleolar organizer regions (NORs) (a pair of autosomes). These insects were able to be differentiated by markings observed in spermatids, which were proposed as a diagnostic tool cytotaxonomic. T. melanocephala and T. vitticeps shared the chromosome number (2n = 20A + X1X2X3Y) and the same characteristics during spermatogenesis. However, these vectors were able to be differentiated by the disposition of heterochromatic blocks, by the arrangement of NORs and the examination of spermiogenesis. Thus, these characteristics corroborate the position of T. lenti and T. sherlocki on Brasiliensis subcomplex and and we propose the exclusion of T. melanocephala, T. vitticeps and T. tibiamaculata because they present fragmentation of the sex chromosome X and are ... / Mestre
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Análise da espermatogênese e do cariótipo da espécie Eptesicus furinalis (d'Orbigny, 1847) Vespertilionidae, Chiroptera/Bueno, Larissa Mayumi. January 2014 (has links)
Orientador: Eliana Morielle Versute / Banca:Wagner André Pedro / Banca: Sandra Regina de Carvalho Marchesin / Resumo: Chiroptera é a segunda maior ordem de mamíferos e possui distribuição mundial e, como consequência, apresenta uma grande diversidade de comportamento, hábito alimentar e estratégias reprodutivas. Entretanto, a maioria dos estudos relativos à reprodução é feita com espécies de morcegos de clima temperado, pouco se sabendo sobre a reprodução de morcegos de clima tropical. Vespertilionidae é a família que apresenta a maior distribuição dentro da Ordem. No Brasil, são referenciados cinco gêneros da família, entre eles, o gênero Eptesicus, com espécies exclusivamente insetívoras. São seis espécies brasileiras de Eptesicus, sendo essas simpátricas e com grande semelhança morfológica entre si, e para as quais há poucas informações sobre os aspectos reprodutivos e até mesmo sobre a variação morfológica, o que dificulta a identificação precisa de cada espécie. Eptesicus furinalis é a espécie que possui a maior distribuição entre as seis espécies brasileiras do gênero. Portanto, foram objetivos desse trabalho, analisar o processo da espermatogênese, o ciclo do epitélio seminífero e a ultraestrutura do espermatozoide, e analisar a variação morfológica do crânio, a morfologia do báculo e do cariótipo, contribuindo não só para o entendimento dos padrões reprodutivos das espécies de morcegos tropicais, mas também na taxonomia do gênero. O epitélio seminífero apresentou o padrão básico de mamíferos, e a espermiogênese pode ser dividida em sete estádios (na microscopia de luz) ou doze estádios (na microscopia eletrônica de transmissão), de acordo com os parâmetros da condensação e distribuição da cromatina e pelo método da formação do acrossomo, respectivamente. A espécie apresentou um processo de regressão testicular, similar ao observado em morcegos hibernantes de clima temperado, fato intrigante, uma vez que E. furinalis é uma espécie exclusivamente tropical e não hibernante ... / Abstract: Chiroptera is the second largest mammalian order with worldwide distribution and, as a result, present a great diversity of reproductive strategies. Indeed, most studies on reproduction are performed with bat species from temperate zones, and little is known about the tropical bats reproduction. Vespertilionidae is the family with the largest distribution within the Order. Five genera occur in Brazil and among them there are the genus Eptesicus, with exclusively insectivorous species. Six species of Eptesicus occur in Brazil, and these are sympatric and has great morphological resemblance to each other, and there is little information on the reproductive aspects of them and even of morphological variation, making it difficult to accurately identify each species. E. furinalis is the most disperse species of Eptesicus in Brazil. Thus, the aims of this work was to analyse the process of spermatogenesis, the seminiferous epithelium cycle and the ultrastructure of the spermatozoon, and analyse the morphological variation of the skull, baculum and karyotype, in order to increase informations about the reproductive patterns of tropical bat species and about the taxonomy of Eptesicus. The semineferous epithelium showed the basic mammalian pattern and the spermiogenesis could be divided into seven steps (light microscopy) or twelve steps (PAS method and transmission elctron microscopy), when analyzed by the parameters of the chromatin distribution and condensation and by the acrosome method, respectively. E. furinalis showed a process of testicular regression similar to testicular regression in hibernating bats of temperate zones, which is an intriguing fact, since E. furinalis is an exclusive tropical species and does not hibernates. The seminiferous epithelium cycle presented no fixed cell associations throughout the seminiferous tubule, as is expected in mammals, however, exhibited eight frequent stages when analyzed by the tubular morpholoy ... / Mestre
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Estudo morfológico, morfométrico e molecular de cinco espécies do subcomplexo Triatoma rubrovaria (Hemiptera, Reduviidae, Triatominae) /Silva, Lucas Abrantes da. January 2018 (has links)
Orientador: João Aristeu da Rosa / Banca: Cleber Galvão Ferreira / Banca: Carlos Eduardo Almeida / Resumo: O subcomplexo Triatoma rubrovaria é constituído por: T. carcavalloi, T. circummaculata, T. klugi, T. limai, T. oliverai, T. pintodiasi e T. rubrovaria, que podem veicular T. cruzi, agente etiológico da doença de Chagas. A partir de triatomíneos coletados no estado do Rio Grande do Sul e de colônias mantidas em laboratório, foram estudados caracteres morfológicos, morfométricos e moleculares de T. carcavalloi, T. circummaculata, T. pintodiasi, T. klugi e T. rubrovaria. Nos estudos morfológicos foram examinados caracteres da cabeça, tórax dorsal/ventral e abdômen. Por meio de microscopia eletrônica de varredura foram observados 17 caracteres que contribuíram para a identificação das cinco espécies do subcomplexo T. rubrovaria. Doze caracteres da cabeça, um do tórax e um do abdômen foram estudados por morfometria e avaliados por análises estatísticas. As análises morfométricas possibilitaram diferenciar as cinco espécies, entretanto T. circummaculata e T. pintodiasi mostraram-se distintas por apenas três parâmetros morfométricos. Por microscopia óptica foram desenvolvidos estudos por morfometria geométrica de cabeças e asas. Os estudos moleculares foram realizados por meio de sequenciamento e análise dos genes mitocondriais COI, Cytb, 16S e indicaram que T. circumaculata e T. pintodiasi são espécies afins e estão inseridas no subcomplexo T. rubrovaria juntamente com T. carcavalloi, T. klugi e T. rubrovaria. Em T. circumaculata e T. pintodiasi os genes mitocondriais COI e 16S são... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The subcomplex Triatoma rubrovaria is composed for T. carcavalloi, T. circummaculata, T. klugi, T. limai, T. oliverai, T. pintodiasi and T. rubrovaria, which can carry T. cruzi, etiologic agent of Chagas' disease. From triatomines collected in the state of Rio Grande do Sul and colonies kept in the laboratory, were studied morphologic, morphometric and molecular characters of T. carcavalloi, T. circummaculata, T. pintodiasi, T. klugi and T. rubrovaria. In the morphologic studies, head, ventral / dorsal thorax and abdomen. By means of scanning electron microscopy 17 characters were observed that contributed to the identification of the five species of the T. rubrovaria subcomplex. Twelve characters of the head, one of the thorax and one of the abdomen were studied by morphometric and evaluated by statistics analysis. The morphometric analysis allowed to differentiate the five species, however T. circummaculata and T. pintodiasi were distinguished by only three morphometric parameters. By optical microscopy studies were developed by geometric morphometric of heads and wings. Molecular studies were performed out by means of amplification of the mitochondrial genes COI, Cytb, 16S and indicated that T. circumaculata and T. pintodiasi are similar species and are inserted in the subcomplex T. rubrovaria together with T. carcavalloi, T. klugi and T. rubrovaria. The mitochondrial genes COI and 16S in T. circumaculata and T. pintodiasi are more evolutionarily distant from T. carcavalloi and T. klugi, whereas no mitochondrial Cytb gene a greater evolutionary distance is in relation to T. carcavalloi. The results obtained show that T. circummaculata and T. pintodiasi are similar species and morphologically differ in pronotum, scutellum, estridulatory sulcus and female external genitalia, as well as in the molecular analyzes with the three mitochondrial genes. / Mestre
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