Orientador : Helio Waldman / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia de Campinas / Made available in DSpace on 2018-07-17T04:25:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Lopes_Amauri_D.pdf: 6249020 bytes, checksum: 0bbadab82f4ea57305c017e2b08e1b2c (MD5) Previous issue date: 1982 / Resumo: o objetivo deste trabalho é analisar a aplicação da técnica de resposta parcial na transmissão de sinais MCP através de cabos coaxiais e telefônicos e estabelecer uma base que justifique seu avanço nesta área e que permita avaliara conveniência de sua aplicação aos sistemas brasileiros. Para isto são analisados os aspectos que identificam e evidenciam os sistema$ de resposta parcial e são seleciona dos aqueles exemplares que se distinguem por sua adequação a constituição de' canais digitais em cabos. São obtidas as características de desempenho de tais canais quando conformados segundo estes exemplares e também quando construídos segundo as particularidades do sistema convencional típico de cada tipo de cabo. Com isto torna-se possível não só o ordenamento destes exemplares segundo seu desempenho e complexidade, mas também a conclusão sobre a capacidade desta técnica em oferecer alternativas competitivas ou superiores aos sistemas convencionais. Neste estudo são enfatizados os aspectos práticos da transmissão via cabos, de forma a vincular as avaliações à realidade prática. Conclue-se que esta técnica ¿ uma alternativa vantajosa no caso coaxial e permite construir linhas MCP de primeira hierarquia com o dobro da velocidade convencional.Por fim, é descrita a construção de um filtro receptor para os repetidores de tais linhas / Abstract: Not informed / Doutorado / Doutor em Ciências

Orientador: Jose Geraldo Chiquito / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia Eletrica / Made available in DSpace on 2018-07-17T18:32:10Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Nagle_EdsonJose_M.pdf: 8908064 bytes, checksum: 5948c9dde4b8a4dfe63a9bdd3f59950a (MD5) Previous issue date: 1989 / Resumo: Não informado / Abstract: Not informed. / Mestrado / Mestre em Engenharia Elétrica

[pt] Anomalias de código podem sinalizar a degradação da arquitetura de software. No entanto, a identificação de anomalias de código arquiteturalmente relevantes (ou seja, aquelas que implicam em deficiências arquiteturais) é particularmente difícil devido: (i) a falta de compreensão sobre a relação existente entre anomalias de código e degradação arquitetural, (ii) ao fato do processo de detecção de anomalias ter como foco somente o código fonte, sem considerar como ele se relaciona com sua arquitetura, e (iii) a falta de conhecimento sobre a confiabilidade das técnicas de detecção em revelar anomalias de código que são arquiteturalmente relevantes. Esta tese apresenta técnicas para identificar anomalias de código que são arquiteturalmente relevantes. Métricas sensíveis à arquitetura e estratégias de detecção foram definidas para superar as limitações das técnicas de detecção convencionais. Estas métricas e estratégias aproveitam rastros que podem ser estabelecidos entre as visões arquiteturais e a implementação dos sistemas. A tese também documenta padrões de anomalias de código (ou seja, relações recorrentes de anomalias) que estão relacionados com problemas arquiteturais. Uma ferramenta, chamada de SCOOP, foi desenvolvida para coletar as métricas sensíveis à arquitetura, aplicar as novas estratégias de detecção, e identificar os padrões de anomalias de código. Usando esta ferramenta, a técnica proposta foi avaliada em uma série de estudos empíricos, comparando sua acurácia com técnicas convencionais de detecção durante o processo de identificação de anomalias de código que são arquiteturalmente relevantes. / [en] Code anomalies can signal software architecture degradation. However, the identification of architecturally-relevant code anomalies (i.e. code anomalies that strongly imply architectural deficiencies) is particularly challenging due to: (i) lack of understanding about the relationship between code anomalies and architectural degradation, (ii) the focus on source code anomaly detection without considering how it relates to the software architecture, and (iii) lack of knowledge about how reliable these detection techniques are when revealing architecturally-relevant code anomalies. This thesis presents techniques for identifying architecturally-relevant code anomalies. Architecture-sensitive metrics and detection strategies were defined to overcome the limitations of conventional detection strategies. These metrics and strategies leverage traces that can be established between architectural views and system implementation. The thesis also documents code anomaly patterns (i.e. recurring anomaly relationships) that are strongly related to architectural problems. A tool, called SCOOP, was developed to collect the architecture-sensitive metrics, apply the new detection strategies, and identify the documented code anomaly patterns. Using this tool, we evaluated our technique in a series of empirical studies, comparing its accuracy with that of conventional detection techniques when identifying architecturally-relevant code anomalies.

[pt] Problemas de projeto afetam quase todo sistema de software, fazendo com que a sua manutenção seja cara e impeditiva. Como documentos de projeto raramente estão disponíveis, desenvolvedores frequentemente precisam identificar problemas de projeto a partir do código fonte. Entretanto, a identificação de problemas de projeto não é uma tarefa trivial por diversas razões. Por exemplo, a materialização de problemas de projeto tende a ser espalhada por diversos elementos de código anômalos na implementação. Infelizmente, trabalhos prévios assumiram erroneamente que cada anomalia de código individual – popularmente conhecida como code smell – pode ser usada como um indicador preciso de problema de projeto. Porém, evidências empíricas recentes mostram que diversos tipos de problemas de projeto são frequentemente relacionados a um conjunto de anomalias de código inter-relacionadas, conhecidas como aglomerações de anomalias de código. Neste contexto, esta dissertação propõe uma nova técnica para a síntese de aglomerações de anomalias de código. A técnica tem como objetivo: (i) buscar formas variadas de aglomeração em um programa, e (ii) sumarizar diferentes tipos de informação sobre cada aglomeração. A avaliação da técnica de síntese baseou-se na análise de diversos projetos de software da indústria e em um experimento controlado com desenvolvedores profissionais. Ambos estudos sugerem que o uso da técnica de síntese ajudou desenvolvedores a identificar problemas de projeto mais relevantes do que o uso de técnicas convencionais. / [en] Design problems affect almost all software projects and make their maintenance expensive and impeditive. As design documents are rarely available, programmers often need to identify design problems from the source code. However, the identification of design problems is not a trivial task for several reasons. For instance, the reification of a design problem tends to be scattered through several anomalous code elements in the implementation. Unfortunately, previous work has wrongly assumed that each single code anomaly - popularly known as code smell - can be used as an accurate indicator of a design problem. There is growing empirical evidence showing that several types of design problems are often related to a set of inter-related code anomalies, the so-called code-anomaly agglomerations, rather than individual anomalies only. In this context, this dissertation proposes a new technique for the synthesis of code-anomaly agglomerations. The technique is intended to: (i) search for varied forms of agglomeration in a program, and (ii) summarize different types of information about each agglomeration. The evaluation of the synthesis technique was based on the analysis of several industry-strength software projects and a controlled experiment with professional programmers. Both studies suggest the use of the synthesis technique helped programmers to identify more relevant design problems than the use of conventional techniques.

Made available in DSpace on 2016-04-26T20:29:20Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Rodrigo de Oliveira Caldas.pdf: 1093662 bytes, checksum: 81a5a17793794657ad68cebc475dc88b (MD5) Previous issue date: 2009-06-10 / This paper performs a detailed study of a precise rule that presides the passage from the 1916 Civil Code regime, that was valid for almost ninety years, to the 2002 Civil Code regime, valid from january 2003 on. The changing of a Civil Code brings significant consequences for the Law. In fact, the Civil Code was called once Everymen s Constitution (a clearly inadequate expression), since his norms regulate several affairs set every single day. It is not irrelevant so this event, which implies that all facts that take place after the advent of the new order will be placed under its rules. Nevertheless, according to the 5th Article, XXXVI, of Brazilian Constitution, ex post facto laws are prohibited in subject of acquired rights, perfect juridicly acts and res judicata. On the other hand, the 2.035th Article of 2002 Civil Code (10.406/2002 Act) determines that the effects of the contracts celebrated when the 1916 Civil Code was still valid will be ruled by the new order. It is necessary, then, to carefully examine the compatibility between the 2.035th Article of 2002 Civil Code (on which it concerns specifically the effects of the contracts signed before his existence) and the 5th Article, XXXVI of Brazilian Constitution. In conclusion, it can be said that, considered the acquired rights theory, which brasilian Law embraces, as well as the opinions of the brasilian Supreme Court about this particular issue, the 2.035th Article of 2002 Civil Code (10.406/2002 Act) is partialy unconstittucional / O trabalho consistirá em análise detida de uma específica regra de transição entre o Código Civil de 1916, que vigorou por quase noventa anos, e o Código Civil de 2002, que teve sua vigência a partir de janeiro de 2003. A alteração da ordem positiva civil tem reflexos significativos no tráfego jurídico. Com efeito, já houve quem se referisse ao Código Civil (valendo-se de expressão que já se reconhece inadequada) como Constituição do homem comum , tendo em vista que os dispositivos dessa lei regulam um sem número de relações jurídicas estabelecidas cotidianamente. Não é insignificante, portanto, o evento que marca a substituição de seu texto. Ocorre que, pela Constituição vigente, é vedada à lei nova a produção de efeitos que prejudiquem o ato jurídico perfeito, o direito adquirido e a coisa julgada. De outro lado, o artigo 2.035 do Código Civil de 2002 (Lei n. 10.406/2002) determina que a ele se subordinem os efeitos dos atos praticados na vigência do Código Civil de 1916. A tarefa que se propõe o trabalho, portanto, é estudar a compatibilidade entre o artigo 2.035 do Código Civil de 2002 (no que tange especificamente aos efeitos dos contratos celebrados antes de sua vigência) e o artigo 5º, XXXVI, da CF de 1988. Ao final, constata-se que, dada a filiação do direito brasileiro à teoria do direito adquirido, bem como o estágio atual da jurisprudência, sobretudo do Supremo Tribunal Federal, o artigo 2.035 do Código Civil de 2002 é parcialmente inconstitucional

Orientador: Celso Luís Marino / Banca: Rinaldo César de Paula / Banca: Ivan de Godoy Maia / Resumo: Estresses abióticos, como a seca, podem reduzir significativamente os rendimentos no cultivo de espécies comercialmente importantes, tais como o eucalipto na produção de celulose e papel. Quando submetidas às condições de déficit hídrico, as plantas desenvolvem alguns mecanismos de defesa. As betaínas participam destes mecanismos, sendo seu soluto mais comum a glicina betaína. Esta é uma amina quaternária distribuída extensamente em diversas espécies de plantas superiores, sintetizada em elevadas taxas, tendo como função, manter a turgescência celular. A identificação e estudo de genes relacionados à tolerância à seca são importantes para os programas de melhoramento florestal. Este estudo teve por objetivo identificar SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms) no gene colina monooxigenase relacionado ao metabolismo da glicina betaína em Eucalyptus. A sequência do gene em estudo foi encontrada em genomas de plantas modelos através do banco de dados GenBank, sendo as mesmas, utilizadas para a procura de similaridades no banco de dados de ESTs de eucalipto FORESTs - FAPESP. Após a constatação de homologia no banco de dados de eucalipto, foram confeccionados oito pares de "primers" para flanquear essas regiões, sendo estes, avaliados, amplificando fragmentos únicos. Depois de realizado o seqüenciamento do gene colina monooxigenase, foi utilizado a ferramenta BLAST no GenBank, confirmando com sucesso a identidade da sequência. Em seguida, as sequências foram alinhadas e os SNPs encontrados. No total, foram identificados 49 SNPs, sendo 12 em regiões codificantes e 37 em regiões UTRs e íntrons. Somente os SNPs localizados nas regiões codificantes foram utilizados neste trabalho, sendo 83,3% deles possuindo mutações sinônimas e 16,7% não-sinônimas. Em seguida, foi utilizada uma população mais abrangente composta de E. grandis... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Abiotic stress, such as drought, can reduce significantly the yield in the important commercially species crop, such as the eucalyptus in the cellulose and paper. When submitted to the water stress conditions, the plants develop some defense mechanisms. The betaines are part of these mechanisms , being their solute more common to the glycine betaine. This is a quaternary amine extensively distributed in several species of higher plants synthesized in high taxes with the function of maintaining the cellular turgescence. Identifying and studying the genes related to the drought tolerance are important for the forest improvement programs. This work aimed at identifying SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms) in choline monooxygenase related to the glycine betaine in Eucalyptus. The gene sequence was found in model plants genomes through the databank GenBank, being used for searching similarities in the databank ESTs of eucalyptus FORESTs - FAPESP. After noticing homology in the eucalyptus databank, eight pairs of primers were made to amplify these regions, being evaluated, amplifying unique fragments. After the choline monooxygenase sequencing was performed, it was used the BLAST in the GenBank, confirming successfully the sequence identity. Then, the sequences were aligned and the SNPs were found. In the total, 49 SNPs were identified, being 12 in coding regions and 37 in UTRs and intron regions. Only the SNPs located in coding regions were used in this work, being 83.3% of the SNPs with synonymous mutation and 16.7% non-synonymous. Following, it was used a wider population made up of de E. grandis, E. Urophylla and the hybrid "Urograndis" to perform the SNPs genotyping, establishing the formation of 18 haplotypes and 16 possible haplotypical combinations which revealed that some genotypes were exclusive for the species E. grandis and E. urophylla. With the objective of decreasing costs... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

[pt] Um dos principais sintomas de declínio da qualidade arquitetural em projetos de software é a manifestação contínua de anomalias de código. Quando estas anomalias não são detectadas e removidas com antecedência, a capacidade de evoluir e manter estes sistemas pode ser comprometida, e, eventualmente, uma reestruturação completa de suas arquiteturas é inevitável. Apesar da existência de diversas técnicas e ferramentas para detecção automática de anomalias de código, a identificação de anomalias que efetivamente causam problemas arquiteturais é ainda uma tarefa desafiadora e não trivial. Ademais, estudos realizados no contexto desta dissertação ostraram que desenvolvedores tendem a refatorar mais frequentemente anomalias que não causam problemas arquiteturais. Em especial, percebeu-se que desenvolvedores priorizam a refatoração de elementos de código que não afetam a arquitetura dos sistemas, como métodos privados ou módulos internos de um componente arquitetural. Neste contexto, o presente trabalho propõe uma abordagem para priorização de anomalias de código. Esta abordagem é composta por heurísticas que exploram diferentes fatores para identificar e ordenar as anomalias detectadas de acordo com suas relevâncias arquiteturais. Tais fatores compreendem desde a quantidade de mudanças realizadas no código ao longo da evolução dos sistemas, até os papéis arquiteturais por ele desempenhados. Foi ainda implementada uma ferramenta para aplicar tais heurísticas de priorização automaticamente em projetos Java. A abordagem proposta foi avaliada em 4 projetos de software de diferentes domínios. Tal avaliação revelou que mantenedores de software poderiam ser beneficiados pelas recomendações de priorização produzidas pela ferramenta, de modo a investir seus esforços de refatoração na solução de problemas arquiteturalmente relevantes. / [en] The progressive manifestation of code anomalies in a software system is a key symptom of its architecture quality decline. When those anomalies are not detected and removed early, the maintainability of software projects can be compromised irreversibly, and, eventually, a complete redesign is inevitable. Despite the existence of many techniques and tools for code anomaly detection, identifying anomalies that are more likely to cause architecture problems remains a challenging task. In fact, studies performed in the context of this dissertation show that even when there is tool upport for detecting code anomalies, developers seem to invest more time refactoring those that are not related to architectural problems. Moreover, we also found that developers frequently prioritize refactoring of code elements that do not contribute to a better adherence to the intended software architecture. In this context, this dissertation proposes a prioritization approach for identifying which anomalies in a system implementation are more harmful to the architecture. The proposed approach is composed of heuristic strategies that exploit several software project factors to identify and rank code anomalies by their architecture relevance. These factors range from the change characteristics to the potential architecture roles of software modules. Furthermore, we implemented tool support for applying our prioritization approach in Java projects. We also evaluated the prioritization approach on 4 software projects from different application domains. Our evaluation revealed that software maintainers could benefit from the recommended rankings for identifying which code anomalies are harming architecture the most, helping them investing their refactoring efforts into solving the architecturally relevant problems.

[pt] Este trabalho é um estudo sobre o desempenho das principais versões do protocolo TCP e de sua variação denominada STP na transmissão via satélite. Devido à grande distância da terra aos satélites geoestacionários, a transmissão via satélite se caracteriza por um grande atraso de propagação e maior ocorrência de erros em comparação com a transmissão ótica. Estes problemas causam sério impacto no desempenho do TCP pois eventuais perdas de pacote implicam em retransmissão e demorada reinicialização do protocolo. Neste estudo, abordamos especificamente o efeito dos erros no canal como fonte de perdas de pacote, considerando modelos de erros estatisticamente independentes e erros em surto. Este tipo de erro ocorre geralmente pela utilização de códigos convolucionais associados ao decodificador de Viterbi. Através de simulação em computador usando o software Matlab, foram inicialmente caracterizadas as seqüências de erros geradas por alguns codificadores convolucionais típicos. Em seguida, o efeito destas seqüências foi introduzida em simulações de uma aplicação FTP/TCP em canal satélite, comparado-se a vazão obtida com as diferentes versões do TCP. / [en] This work is a study on the performance of the main versions of protocol TCP and of its variation STP satellite transmission. Due to great distance of the land to the geostationary satellites, the satellite transmission is characterizes for a great delay of propagation and greater occurrence of errors in comparison with the optics transmission. These problems cause serious impact in the performance of the TCP therefore eventual losses of package imply in retransmission and delayed reset of the protocol. In this study, we specifically approach the effect of the errors in the canal as source of losses of package, considering models of statistically independent errors and burst errors. This type of error generally occurs for the use of convolutional code associates with Viterbi decoder. Through simulation in computer using Matlab software, we initially had been characterized the sequences of errors generated for some typical convolutional codes. After that, the effect of these sequences was introduced in simulation of an application FTP/TCP in canal satellite, compared it outflow gotten with the different versions of the TCP, using ns-2.

Made available in DSpace on 2016-04-26T20:26:19Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Claudia Ye Ho Kim Cahale.pdf: 876341 bytes, checksum: 08af973b1769d6e2a606504704ae7251 (MD5) Previous issue date: 2007-12-14 / This work aims at analyzing the intestate succession right of the spouse under the influence of the Civil Code of 2002 and their new position in the laws of succession. We have made a historic evolution starting by the Ancient Roman Law, going from the Brazilian historic changes, on the Family and Inheritance Law, to the recent codification by the Law 10.407/2002.To better introduce the theme, we have done some general research on the laws of descent and distribution, by thoroughly studying the intestate succession and the lawful successors, whereby all types of heirs and specific legal forms required for the surviving spouse to have their heritage rights recognized, include references of laws which were used in the past. We discourse upon the influence of marriage settlements and spouse position in the Brazilian descent and distribution order the moment they claim the dead person s will with descendants, regardless of the marriage settlement or the competition between the spouse and the ascendants, keeping the former an exclusive heir in third class when there is no living descendant or ascendant. No matter the class the spouse is included (first, second or even third class), the legal requirement is that marriage be legally recognized and the spouses be living together as husband and wife. We also point out the title of spouse, now, as a regular heir, and consequently their right to get the inheritance and the legally limited clause imposed by law. Throughout these studies, we have analysed the exculpatory conditions of the spouse (indignity disinheritance) and the necessity of the collation even if the new legislation does not mention it. Let us not forget that the recent transformations have brought us the necessity to ponders on some questions that reflect on the changes of the concepts and structures on succession Institute. Modest though it may seem, we have attempted to discuss those questions under the influence of the comparative Law, the law projects in procedure statements and legislative proposal alterations. Whichever the position to be studied, the true intentions of legislative members shall not be left unrecognised (the spirit of law). We defend, above all, that the spouse is the only real heir chosen by the author of the inheritance, because the other heirs are not. By providing the spouse with advantages over the inheritance the legislators have benefited the only person we choose to be part of our existence / O presente trabalho tem por finalidade analisar o direito sucessório do cônjuge sob a égide do Código Civil de 2002, sua nova posição na ordem de vocação hereditária; para tanto, fizemos uma digressão histórica, iniciando pelo direito romano antigo, passando à evolução histórica brasileira no direito de família e sucessões, até a recente codificação pela Lei 10.407/2002. Para melhor introduzir o tema, fizemos uma abordagem sobre o direito sucessório em geral, tratando da sucessão legítima, legitimidade sucessória que implica a todos os herdeiros, e os requisitos legais específicos exigidos para que o cônjuge supérstite tenha reconhecido o seu direito sucessório, inclusive com referência ao direito intertemporal. Na sucessão do cônjuge discorremos sobre a influência do regime matrimonial de bens na ordem de vocação hereditária; na concorrência com os descendentes e independente do regime quando concorrer com os ascendentes, permanecendo herdeiro exclusivo na terceira classe, quando não existir descendentes ou ascendentes. Mas seja qual for a classe, são exigidos o casamento de fato e de direito. Destacamos ainda a condição do cônjuge, agora herdeiro necessário, e consequentemente o direito à legítima e à limitação imposta às cláusulas restritivas de direito. No exame, tratamos da exclusão do cônjuge (indignidade deserdação) e a necessidade da colação, ainda que o Código vigente não lhe faça referência. Não se pode olvidar que as recentes alterações trouxeram a baila a necessidade de enfrentarmos algumas questões que refletem sobremaneira a mudança de conceitos e estruturas no instituto da sucessão. Ainda que de forma modesta, tentou-se enfrentar as questões à luz do direito comparado, aos projetos de leis em tramitação, enunciados e propostas de alteração legislativa. Qualquer que seja a posição a ser estudada, não se pode deixar de reconhecer a verdadeira intenção do legislador (o espírito da lei). Defendemos acima de tudo que o cônjuge é o único herdeiro legítimo escolhido pelo autor da herança, porque os demais herdeiros não o são. De modo claro ao conferir melhores e maiores vantagens ao cônjuge, prestigiou o legislador a única pessoa que escolhemos para fazer parte da nossa existência

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:30:56Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-04-27Bitstream added on 2014-06-13T19:40:30Z : No. of bitstreams: 1 ferro_m_dr_rcla_parcial.pdf: 557493 bytes, checksum: fcae382eb9a89592e907d3171f912924 (MD5) Bitstreams deleted on 2015-05-04T12:07:27Z: ferro_m_dr_rcla_parcial.pdf,Bitstream added on 2015-05-04T12:07:58Z : No. of bitstreams: 1 000713741.pdf: 1451277 bytes, checksum: 241fb4d825af417c9645365b1885c071 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / As formigas Attini são destacadas pragas agrícolas e invertebrados modelos em estudos em genômica, metagenômica, sistemática e evolução molecular. Tais estudos têm gerado milhares de sequências nucleotídicas, cuja análise demanda o uso de diferentes programas de Bioinformática em processamentos automatizados. Pensando nisso, foram desenvolvidos protocolos para análises de ESTs e de bibliotecas de sequências ITS e 16S obtidas de formigas Attini. Foi desenvolvida uma arquitetura baseada no padrão MVC e J2EE responsável por todos os processos cliente-servidor. Os protocolos foram implementados na forma de pipelines em que cada componente é um serviço web em REST acoplado a arquitetura desenvolvida. bESTscan realiza a anotação de sequências EST transcriptômicas, 16Scan e ITScan realizam análises de ecologia microbiana, para bactérias (sequências 16S) e para fungos (sequências ITS) respectivamente, bem como identifica as sequências através de pesquisas em bancos de dados públicos. O sistema computacional desenvolvido automatiza a anotação de sequências para um pequeno volume de sequências como as obtidas por Sanger ou para grande volume de dados como as geradas por Sequenciadores de Nova Geração, reduzindo o tempo de processamento e facilitando a análise dos resultados. Todos os pipelines desenvolvidos foram validados com sequências de Attini, obtidas por Sanger e Illumina, geradas a partir de diferentes projetos do nosso laboratório e estão disponíveis na web nos endereços http://evol.rc.unesp.br/lem/?q=bioinformatics / The Attini ants are agricultural pests and invertebrate models for studies on genomics, metagenomics, molecular systematics and evolution. These studies have generated thousands of nucleotide sequences whose analysis requires the use of different Bioinformatics tools and automated processing. We developed automated sequence annotation protocols for ESTs and ITS and 16S libraries analysis for Attini ants. We developed an architecture model based on J2EE and MVC patterns which is responsible for all client-server processes and each tool in the pipeline is a REST web service coupled in the architecture model developed. The bESTscan pipeline to perform the EST transcriptome annotation, 16Scan e ITScan realize microbial ecology studies for both, bacteria (16S sequences) and for fungi (ITS sequences), as well as identify sequences through public databases. The computer system developed automates the annotation for both a small volume of sequences obtained by Sanger and for a large number of data generated by the Next Generation Sequencers (NGS), reducing processing time and with high performance. Pipelines were developed and validated using sequences Sanger and Illumina generated with different projects from our laboratory and are available at http://evol.rc.unesp.br/lem/?q=bioinformatics