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Uso de redes de interação para testar hipóteses de diversificação dos Gyrodactylidae (Monogenoidea: Platyhelminthes)

Azambuja, Luciana Patella de 10 May 2012 (has links)
Resumo: os Gyrodactylidae são animais de grande importância econômica e biológica. É a única família de Monogenoidea a apresentar reprodução por hiperviviparidade, considerada uma inovação-chave em Gyrodactylidae. Essa família é representada por espécies vivíparas e ovíparas. Acredita-se que a origem da família esteja associada à dispersão de um ancestral marinho para um grupo de peixes de água doce da América do Sul. Espécies ovíparas são encontradas apenas na Região Neotropical. A hiperviviparidade é uma característica única do grupo e supostamente confere ao clado vivíparo uma altíssima habilidade de dispersão e troca de hospedeiros, resultando em um grande número de espécies amplamente distribuídas em todos os continentes e oceanos do mundo. Aparentemente, o clado vivíparo representa um agrupamento monofilético, enquanto que as espécies ovíparas formam um grupo parafilético basal. Acredita-se que os Gyrodactylidae vivíparos tenham sofrido uma grande diversificação devido à extensa radiação adaptativa, o que é discutido por vários autores. Outro fator que pode ter contribuído para essa diversificação é a especiação por isolamento periférico seguida de troca de hospedeiros, decorrente da habilidade dos parasitos dispersarem durante toda fase da vida. Se as previsões do modelo de Boeger et al. (2003, 2005) estiverem corretas, espécies ovíparas de Gyrodactylidae devem apresentar uma distribuição restrita (em hospedeiros Loricariidae e outras famílias próximas) e fortemente associada a processo de coespeciação, enquanto que os Gyrodactylidae vivíparos apresentarão um padrão de distribuição mais amplo e com baixa associação com eventos coevolutivos. O objetivo deste trabalho é testar essas hipóteses utilizando análises ecológicas e de coevolução. Esse estudo foi realizado através de um intenso esforço de coleta, em um único trecho do rio Marumbi-PR, Brasil, fornecendo uma amostragem dos principais representantes das famílias de hospedeiros mais comuns da região. O estudo indica que a associação ecológica entre os girodactilídeos e seus hospedeiros esta fortemente relacionada aos processos de coevolução entre essas espécies. A rede de interação de Gyrodactylidade e seus hospedeiros indicam que ocorre uma forte interação entre as espécies do grupo ovíparo de Gyrodactylidae com espécies de Loricariidae, enquanto que as espécies parasitas do clado vivíparo fazem interações com quase todos os representantes das famílias de hospedeiros amostradas. Os resultados das redes de interação entre os girodactilídeos ovíparos e vivíparos corrobora com as hipóteses sobre a diversificação propostas por Boeger et al. (2003). As espécies do grupo ovíparo mostram-se mais aninhadas quando comparadas com o grupo vivíparo, indicando que o grupo ovíparo possui maior número de interações com espécies hospedeiras. A análise de modularidade indica que as espécies do grupo ovíparo mostraram alta especificidade às espécies hospedeiras de Loricariidae, enquanto que, as espécies do clado vivíparo estão distribuídas em hospedeiros de diferentes táxons, mas ao contrário do esperado, mostram um padrão de alta especificidade com seus hospedeiros. A análise de coevolução entre as espécies de Gyrodactylidae e seus hospedeiros, está igualmente congruente à hipótese de Boeger et al.(2003). Para as espécies ovíparas, a congruência com a hipótese está diretamente associada a processos de coespeciação. Enquanto os vivíparos apresentam características que aumentam sua habilidade de colonizar novas linhagens de hospedeiros, eles aparentemente passam por um processo de especialização/adaptação à linhagem do hospedeiro. Esse processo o limita a linhagens hospedeiras mais próximas, as quais compartilham recursos semelhantes (simplesiomorfias) devido à ancestralidade mais recente. Portanto, o cenário observado na estrutura da comunidade de peixes e seus Gyrodactylidae parece estar fortemente relacionado com o processo denominado "ecological fitting", definido por Brooks e McLennan (2002).
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A construção do campo da dança por meio da crítica jornalística

Lima, Emanuella Teresa Kalil 16 January 2013 (has links)
Submitted by Diana Alves (ppgdancaufba.adm@gmail.com) on 2013-01-16T11:54:45Z No. of bitstreams: 1 dissertacao_emanuella_teresa_kalil_lima.pdf: 529248 bytes, checksum: 9fcaf8d4f5d68cc4525ea085c38d6674 (MD5) / Made available in DSpace on 2013-01-16T11:54:45Z (GMT). No. of bitstreams: 1 dissertacao_emanuella_teresa_kalil_lima.pdf: 529248 bytes, checksum: 9fcaf8d4f5d68cc4525ea085c38d6674 (MD5) / CAPES / Esta dissertação procura refletir sobre a corresponsabilidade da crítica jornalística na formulação do campo da dança. Partiu-se da constatação de que a crítica jornalística atualmente praticada no brasil alimenta o senso comum a respeito da dança, na medida em que os jornais não se oferecem como ambientes propícios à produção de conhecimento especializado e vinculam cada vez mais os seus cadernos culturais ao mercado de entretenimento. Propõe-se, então, refletir sobre o papel desta crítica atual, associando o seu discurso á produção de doxa (ou rumor teórico) na dinâmica de formulação do campo artístico da dança. Assim é possível reconhecer a importância do senso comum como prática teorizante sobre a dança, como propõe a filósofa francesa anne cauquelin. A autora salienta que a arte não existe isoladamente, imune a interferência do senso comum, e que por isso é preciso levar em conta vários tipos de discursos, e não apenas o acadêmico, ao se tratar de teorias da arte. O pressuposto deste entendimento é o da coevolução, segundo o qual as coisas formulam-se e modificam-se simultânea e mutuamente, a partir de processos relacionais ininterruptos-conforme formulado por richard dawkins no campo da biologia contemporânea e adotado por fabiana britto nos seus estudos sobre historiografia da dança. As ideias de tais autores ajudam a esclarecer que se a crítica jornalística é corresponsável pela formulação do campo da dança, ao ser praticada por um especialista ela teria mais chances de contribuir para construção de um senso comum mais qualificado e, deste modo, colaborar para a elaboração de um campo artístico mais complexo. Nesse sentido, esta pesquisa propõe que a crítica continue sendo veiculada no jornal- um meio de comunicação de massa que apresenta grande poder de interferência no senso comum e, por consequência, no campo artístico acompanhado-, mas que seja escrita por especialista: profissionais que tenham conhecimento aprofundado de dança e das condições de produção do jornal, e que possam criar estratégias adaptativas para a sua permanência neste ambiente. A proposta é que se continue produzindo texto jornalístico, mas com o conhecimento do profissional especializado em dança, elaborando um senso comum que possa abrir portas para a reflexão. Dessa forma colabora-se, portanto, para a construção de um campo artístico mais complexo, com mais chances de continuar existindo ao longo do tempo. / Programa de Pós Graduação em Dança-Escola de Dança
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A construção do campo da dança por meio da critica jornalística

Lima, Emanuela Teresa Kalil 29 November 2011 (has links)
Submitted by Diana Alves (ppgdancaufba.adm@gmail.com) on 2014-09-08T14:43:54Z No. of bitstreams: 1 Dissertação Emanuella Teresa Kalil Lima.pdf: 529248 bytes, checksum: 9fcaf8d4f5d68cc4525ea085c38d6674 (MD5) / Rejected by Alda Lima da Silva (sivalda@ufba.br), reason: Solicito que verifique o registro, visto que o resumo da dissertação está também colocado como título do trabalho. Grata, Alda Lima on 2014-09-08T21:07:20Z (GMT) / Submitted by Diana Alves (ppgdancaufba.adm@gmail.com) on 2014-09-09T14:10:38Z No. of bitstreams: 1 Dissertação Emanuella Teresa Kalil Lima.pdf: 529248 bytes, checksum: 9fcaf8d4f5d68cc4525ea085c38d6674 (MD5) / Approved for entry into archive by Alda Lima da Silva (sivalda@ufba.br) on 2014-09-11T17:33:02Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação Emanuella Teresa Kalil Lima.pdf: 529248 bytes, checksum: 9fcaf8d4f5d68cc4525ea085c38d6674 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-09-11T17:33:03Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertação Emanuella Teresa Kalil Lima.pdf: 529248 bytes, checksum: 9fcaf8d4f5d68cc4525ea085c38d6674 (MD5) / CAPES / Esta dissertação procura refletir sobre a corresponsabilidade da crítica jornalística na formulação do campo da dança. Partiu-se da constatação de que a crítica jornalística atualmente praticada no Brasil alimenta o senso comum a respeito da dança, na medida em que os jornais não se oferecem como ambientes propícios à produção de conhecimento especializado e vinculam cada vez mais os seus cadernos culturais ao mercado de entretenimento. Propõe-se, então, refletir sobre o papel desta crítica atual, associando o seu discurso à produção de doxa (ou rumor teórico) na dinâmica de formulação do campo artístico da dança. Assim, é possível reconhecer a importância do senso comum como prática teorizante sobre a dança, como propõe a filósofa francesa Anne Cauquelin. A autora salienta que a arte não existe isoladamente, imune à interferência do senso comum, e que por isso é preciso levar em conta vários tipos de discursos, e não apenas o acadêmico, ao se tratar de teorias da arte. O pressuposto deste entendimento é o da coevolução, segundo o qual as coisas formulam-se e modificam-se simultânea e mutuamente, a partir de processos relacionais ininterruptos – conforme formulado por Richard Dawkins no campo da biologia contemporânea e adotado por Fabiana Dultra Britto nos seus estudos sobre historiografia da dança. As ideias de tais autores ajudam a esclarecer que se a crítica jornalística é corresponsável pela formulação do campo da dança, ao ser praticada por um especialista ela teria mais chances de contribuir para a construção de um senso comum mais qualificado e, deste modo, colaborar para a elaboração de um campo artístico mais complexo. Neste sentido, esta pesquisa propõe que a crítica continue sendo veiculada no jornal – um meio de comunicação de massa que apresenta grande poder de interferência no senso comum e, por consequência, no campo artístico acompanhado –, mas que seja escrita por especialistas: profissionais que tenham conhecimento aprofundado de dança e das condições de produção do jornal, e que possam criar estratégias adaptativas para a sua permanência neste ambiente. A proposta é que se continue produzindo texto jornalístico, mas com o conhecimento do profissional especializado em dança, elaborando um senso comum que possa abrir portas para a reflexão. Dessa forma colabora-se, portanto, para a construção de um campo artístico mais complexo, com mais chances de continuar existindo ao longo do tempo.
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Ecologia quimica e coevolução na interface Traidini (Papilionidae)/ Aristolochia (Aristolochiaceae)

Klitzke, Clécio Fernando 06 February 1992 (has links)
Orientador : Keith S. Brown Jr / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-14T02:27:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Klitzke_ClecioFernando_M.pdf: 4073524 bytes, checksum: 8e2d5b37ea535af96e2720a7be0645d0 (MD5) Previous issue date: 1992 / Resumo: Desde a formulação da hipótese de coevolução entre plantas e borboletas por Ehrlich e Raven em 1964 poucos trabalhos têm demonstrado a sua existéncia no sentido estrito. evidenciando-se geralmente o fenomeno de colonização. O objetivo deste trabalho é estudar as interações entre um qrupo restrito de borboletas (Troidini) e suas únicas plantas de alimento larval (Aristolochia) com respeito a mediação quimica na utilização das plantas hospedeiras pelas larvas. Para isto foram criadas larvas de diferentes espécies de Troidini em diferentes espécies de (Aristolochia) encontradas na região sudeste brasileira. Com estes dados e informações da literatura foi possivel estabelecer a utilização e preferência por cada espécie vegetal por cada espécie de Troidini. A análise quimica de 11 espécies de Aristolochia mostrou a existéncia de três classes de compostos secundários mais abundantes: ácidos aristoloquicos (nitrofenantrenos), ácidos labdanóicos (diterpenos) e alcaloides (não identificados neste trabalho). A presença e ausência destes compostos permitiu a reunião destas espécies em três grupos que são utilizados diferentemente pelos Troidini. A análise quimica de 17 espécies de Troidini mostrou a presença de ácidos aristolóquicos e alcaloides. Surpreendentemente larvas de B. polydamas criadas em A. Galeata, uma especie sem acidos aristolóquicos nas folhas, apresentaram estes compostos indicando a possibilidade de sua biossintese pelas larvas. Esta especie só empupou em A. Galeata com o acréscimo de ácidos aristolóquicos. Isto indica a necessidade destes compostos para o total desenvolvimento das larvas nesta planta. Na natureza é possivel observar larvas comendo outras partes da planta que contém estes compostos tais como ramos, flores e frutos. Os ácidos labdanóicos apresentaram efeito fagoinibidor nas espécies testadas sendo que P. neophilus e B. polydamas são menos sensiveis a estes compostos. Estas duas espécies também apresentaram aumento de consumo na presença de AAs. o que indica um efeito fagoestimulante desdes compostos. Algumas frações neutras polares também apresentaram atividade fagoinibidora. Estes resultados permitem a reformulação da hipótese de coevolução entre dois grupos por Brown et. al. (1991a) / Abstract: Since Ehrlich and Raven's paper on butterflv plant coevolution (1964) few works have shown the existence of this phenomenon; generally, colonization seems responsible for present patterns of insect/plant relationships. The object of this work is the studv of chemical ecology of the Troidini/Aristolochia interface: a restricted group of herbivores specialized on a single small plant family. Larvae of many species of Troidini reared on different SE Brazilian Aristolochia species showed a variable specificity and preference in these relationships. Chemical analysis Df 11 Aristolochia species indicated three principal classes of secondary compounds: aristolochic acids (nitrophenanthrenes), labdanoic acids (diterpenes) and alkaloids. The presence or absence of these compounds permitted the division of the Aristolochia species into three groups, differentially used by Troidini species. Chemical analysis of 17 Troidini species showed the presence of aristolochic acids and alkaloids. Aristolochi acids were present in B. polydamas larvae reared on leaves of A. galeata (without these compounds) indicating the possible biosynthesis of these compounds. Larvae of B. polydamas reared on leaves of A. galeata pupated successfully only when aristolochic acids were aded in the diet, indicating that they are necessary to complete development; in nature they feed on stems, flowers or fruits which centain these compounds. Labdanoic acids have antifeedant effect on the larvae of many Troidini species: P. neophilus and B. polydamas (polyphagous species) are more tolerant of these compounds, and show stimulation of feeding by aristolochic acids. Some polar neutral fractions (glycosides?) also showed antifeedant activity. The results of the present stucly lead to a revision of the coevolutionary hypothesis at this interface, proposed by Brown et. al. (1991a) / Mestrado / Ecologia / Mestre em Ciências Biológicas
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O papel da coevolução e do comportamento de seleção de recurso na arquitetura de redes de interações antagonistas

Von Hartenthal, Francisco Westphalen January 2015 (has links)
Orientadora : Profª Drª Sabrina B. Lino Araújo / Co-orientador : Profª. Drª. Isabela G. Varassin / Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Ecologia e Conservação. Defesa: Curitiba, 19/06/2015 / Inclui referências : f. 47-54 / Resumo: O termo coevolução refere-se às mudanças evolutivas entre espécies que interagem e exercem pressões seletivas recíprocas. Diversos processos coevolutivos já foram descritos, mas o papel da coevolução na natureza continua sendo debatido. Uma das dificuldades para o estudo sobre coevolução vem da complexidade das interações em comunidades, com diferentes tipos e intensidades de relações ecológicas simultâneas. Obstáculo que vem sendo enfrentado com o uso da Teoria de Redes. O presente trabalho teve o objetivo principal de investigar a influência de processos coevolutivos na estrutura de redes de interações antagonistas, do tipo parasito-hospedeiro. Para isso, foi construído um modelo matemático baseado em indivíduos com interações por ajuste de fenótipos, que incorporou o comportamento de seleção de recurso pelos parasitos. Diversas combinações de intensidade de força de seleção pela interação antagonista sobre os parasitos (?) e sobre os hospedeiros (?) foram testadas em diferentes cenários de eficiência na seleção de recurso pelos parasitos. O modelo foi utilizado para simular interações entre pares, bem como em comunidades com 50 espécies em cada nível trófico. Os padrões de distribuição dos fenótipos dos indivíduos resultantes das interações entre pares foram analisados qualitativamente, como forma de verificação da dinâmica coevolutiva predominante. Os resultados das interações em comunidade foram acessados através do aninhamento (NODF), modularidade (QB), especialização (H2 ') e conectância (C) das redes. Um modelo nulo, sem coevolução e sem seleção de recurso pelos parasitos, foi usado para avaliar as redes do modelo principal. Nas interações entre pares, o modelo revelou um novo mecanismo coevolutivo antagonista, aqui chamado de padrão Assimétrico, resultante do efeito conjunto das intensidades de força de seleção pela interação sobre parasitos e hospedeiros e do comportamento de seleção de recurso pelos parasitos. Nas interações com várias espécies, sem o comportamento de seleção de recurso, interações com alta pressão de seleção antagonista deram origem a redes com estruturas equivalentes às de redes formadas por interações sem coevolução. Esse resultado foi visto também em cenários com possibilidade de seleção pelos parasitos. Portanto, a presença de coevolução não foi condição suficiente para alterar as propriedades das redes. Quando a coevolução e o comportamento de seleção de recurso alteravam a estrutura das redes, NODF e H2 ' tenderam a valores maiores do que o explicável pelo modelo nulo, QB e C a resultados menores. Apesar de condizente com o esperado para redes antagonistas, esse resultado não pôde ser diretamente relacionado ao aumento da força de seleção pela interação. Palavras-chave: Redes ecológicas. Antagonismo. Parasito-hospedeiro. Coevolução assimétrica. / Abstract: Coevolution means reciprocal evolutionary change between interacting species that impose selective strength on each other. Several coevolutionary processes are known, but the role of coevolution on natural systems is still debated. One of the major challenges for the study of coevolution comes from the complexity of interactions in communities with different types and strengths of simultaneous ecological relationships. The Network Theory is been used to face this challenge. The main goal for this work was to explore how coevolutionary processes affect the architecture of host-parasite networks. For that, a phenotype matching individualbased model (IBM) was built and the parasites' host-choice behavior was embedded on the model. Several combinations of antagonism selection strength on the parasites (?) and on the host (?) were tested in different scenarios of efficiency in host-choice by the parasites. The model also was used to simulate pairwise interactions. The pairwise interactions were qualitatively analyzed from their phenotype patterns. The networks properties were accessed by their nested (NODF), modularity (QB), specialization (H2 ') and connectance (C). A null model, with no coevolution and no host-choice behavior, was built to evaluate the main model. A new coevolutionary mechanism was revealed from the pairwise interactions, hereby named Asymmetric pattern, an outcome of the simultaneous effects due to the antagonistic selection strengths and the host-choice behavior. On the interactions among assemblages, with no choice behavior, strong antagonistic selection could result on networks equivalent to that formed with no coevolution. This outcome was also present in some scenarios with host-choice behavior. Therefore coevolution was not a sufficient condition to drive changes in the networks properties by itself. When coevolution and choice behavior together changed the network properties, NODF and H2 ' tended to high values, and QB and C to low values, than that obtained from the null model. Although expected for antagonistic networks, this outcome could not be related to the increase of selection strength. Keywords: Ecological networks. Antagonism. Host-parasite. Asymmetrical coevolution.
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Coevolução molecular em canais iônicos e neurotoxinas

Pontes, Camila Ferreira Thé 11 August 2016 (has links)
Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Programa de Pós-Graduação em Biologia Molecular, 2016. / Submitted by Camila Duarte (camiladias@bce.unb.br) on 2017-02-06T13:17:03Z No. of bitstreams: 1 2016_CamilaFerreiraThéPontes.pdf: 39139838 bytes, checksum: e32ad047bc654e4f6348afd6a8a65637 (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana(raquelviana@bce.unb.br) on 2017-02-09T20:48:49Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2016_CamilaFerreiraThéPontes.pdf: 39139838 bytes, checksum: e32ad047bc654e4f6348afd6a8a65637 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-09T20:48:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2016_CamilaFerreiraThéPontes.pdf: 39139838 bytes, checksum: e32ad047bc654e4f6348afd6a8a65637 (MD5) / A peçonha de escorpiões contém diversos tipos de neurotoxinas que podem interagir entre si para modular a função de canais iônicos¹. A ação desses polipeptídeos leva à ativação de canais de sódio e inibição de canais de potássio, causando um elevado influxo de sódio e a liberação de neurotransmissores, seguida por um bloqueio da excitabilidade celular². Apesar de possuírem estrutura 3D similar, as chamadas α- e β-toxinas de escorpião afetam canais iônicos de sódio dependentes de voltagem (NaV) por meio de mecanismos diferentes: as α-toxinas interagem com o sítio 3 no domínio sensor de voltagem IV (VSD-IV) e inibem o processo de inativação rápida do canal¹, enquanto as β-toxinas interagem com o sítio 4 no VSD-II e causam a hiperativação do canal por meio de um mecanismo de aprisionamento do sensor de voltagem³. Em um contexto evolutivo, espera-se que o sistema composto por esses dois tipos de toxinas e os seus alvos moleculares, os VSD de NaV, tenham sofrido um processo de coevolução molecular. Partindo do princípio de que seja possível detectar, através da análise de sequências primárias, sinais de coevolução molecular que determinem a seletividade e afinidade entre os pares toxina-VSD, foi possível propor um um modelo evolutivo de interação e seletividade entre α- e β-toxinas de escorpião e VSD-II e -IV de NaV, o qual representa o melhor conjunto possível de interações toxina-VSD. Para tanto, foi desenvolvido um algoritmo genético capaz de otimizar, baseado em um critério de energia e acoplamento, um dado sistema composto por dois conjuntos de posições de aminoácidos, obtidos de dois alinhamentos múltiplos de sequências (MSA) de proteínas. O algoritmo genético foi desenvolvido para encontrar a melhor forma de parear as sequências do MSA1 com as sequências do MSA2 de forma a minimizar a energia de interação total dos pares. O modelo otimizado de coevolução (MOC) apresentou dois grupos bem definidos, um formado por interações entre α-toxinas e VSD-IV e o outro composto por interações entre β-toxinas e VSD-II. Esse resultado indica que o algoritmo foi capaz de encontrar uma solução realista para o problema. O modelo obtido fornece informações importantes sobre quais interações entre resíduos definem as regras para as afinidade diferenciais entre β-toxinas e VSD-II, e α-toxinas e VSD-IV. Com isso, foi possível inferir um conjunto de resíduos que caracteriza a superfície funcional de cada grupo de toxinas. Os resultados obtidos são corroborados por resultados experimentais da literatura. / Scorpion venoms contain several types of neurotoxins that might interact with each other, modulating the function of ion channels¹. The action of these polipeptides leads to the activation of sodium channels and inhibition of potassium channels, causing a high sodium influx and the liberation of neurotransmitters, followed by a blockage of cellular excitability². Regardless of their similar 3D structures, the so-called α- and β-scorpion toxins affect voltage-gated sodium channels (NaV) through very different mechanisms: α-toxins interact with the extracellular site 3 in the voltage sensor domain IV (VSD-IV) and inhibit the rapid channel inactivation process¹, while β-toxins interact with site 4 in VSD-II and cause channel hyperactivation through a voltage sensor trapping mechanism³. In an evolutionary context, it is expected that the system composed of this two types of gating modifier toxins plus the targeted NaV VSD will present some coevolution traces. Starting from the hypotheses that it is possible to detect, through sole primary sequence analysis, signals of molecular coevolution determining selectivity and specificity between pairs of interacting proteins, it was possible to propose an evolutionary model of interaction and selectivity between scorpion α- and β-toxins and NaV VSD-II and -IV, which represents the best possible arrangement of interacting pairs. To achieve that, a self-developed and implemented genetic algorithm that was able to optimize, based on an energy-coupling criterion, a given system composed of two sets of information channels coming from two different protein multiple sequence alignments (MSA) was used. Basically, the genetic algorithm was designed to find the best way of pairing the sequences coming from MSA1 with the sequences coming from MSA2 in order to minimize the overall interaction energy of the pairs. The optimized model presented two well-defined groups, one composed of α-toxins interacting with VSD-IV and the other composed of β-toxins interacting with VSDII. This result indicates that the model is probably accurate. Going one step further, we applied PCA to extract important information from the optimized model about the interacting residues in the two groups (β- toxins, VSD-II and α-toxins, VSD-IV). It was then possible to infer the set of residues responsible for the unique features observed in the two groups of toxins. The results obtained in this last step are in conformation with data coming from experimental assays.
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O diálogo dança/circo na cena contemporânea brasileira

Peixoto, Bianca 15 January 2013 (has links)
Submitted by Diana Alves (ppgdancaufba.adm@gmail.com) on 2013-01-15T14:56:55Z No. of bitstreams: 1 DISSERTAÇÃO BIANCA SIMÕES.WORD.pdf: 2699938 bytes, checksum: 44f794224157f44ba3006003ac51ac6b (MD5) / Made available in DSpace on 2013-01-15T14:56:55Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DISSERTAÇÃO BIANCA SIMÕES.WORD.pdf: 2699938 bytes, checksum: 44f794224157f44ba3006003ac51ac6b (MD5) / FAPESB / Esta dissertação tem como objetivo investigar o processo de hibridização que vem ocorrendo entre os campos artísticos da dança e do circo na cena contemporânea, apoiando-se, principalmente, em estudos realizados nas áreas da Teoria do Corpomídia e do Hibridismo Cultural. Não ignorando que relações entre as duas áreas já existiam em outros períodos históricos, mas, interessados no diálogo entretecido entre estes campos na atualidade, trazemos como campo de observação para a pesquisa duas companhias brasileiras atuais, sendo elas a Companhia Picolino de Artes do Circo (BA) e a Cia Dani Lima (RJ), de dança. O recorte investigativo de tal fenômeno se dá a partir da pesquisa bibliográfica e análise de entrevistas realizadas com integrantes/fundadores dessas duas companhias a respeito de seus processos criativos, assim como da análise videográfica de dois espetáculos eleitos: Cenascotidianas@cir.pic.com, da companhia Picolino, e Vaidade, da Cia Dani Lima. Partindo do questionamento de como tais propostas artísticas constroem e problematizam relações entre dança e circo, considerando suas linguagens específicas, surgem novos tópicos de interesse da pesquisa, como, por exemplo, os entendimentos de corpo presentes nas propostas artísticas eleitas e as transformações que se dão tanto no corpo como nos campos em questão decorrentes do diálogo dança/circo vivenciado nessas companhias.
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Sobre a interação de formigas com pequi do cerrado, Caryocar Brasiliense Camb. (Caryocaraceae) : o significado ecologico de nectarios extraflorais

Oliveira, Paulo Sergio Moreira Carvalho de, 1957- 19 July 2018 (has links)
Orientador : Woodruff W. Benson / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-19T02:01:56Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Oliveira_PauloSergioMoreiraCarvalhode_D.pdf: 7424619 bytes, checksum: 2b89b7b5fb9c19606612e3ce0812b507 (MD5) Previous issue date: 1988 / Resumo: Caryocar brasliense possui nectários extraflorais (NEFs) na face externa das sépalas de seus botões florais, os quais são intensamente visitados por diversas espécies de formigas. Este estudo Investigou a interação de formigas com Caryocar, em vegetação de cerrado, rio município de Itirapina-SP. Foi registrado um total de 34 espécies (17 gêneros) de formigas visitantes de Caryocar, em Itiraplna. Tanto em número de espécies, como em número de indivíduos registrados, formigas Camponotus foram as melhor representadas nos censos realizados sobre Caryocar. Formigas dos gêneros Zacryptocerus, Azteca e Pheldole também foram comumente observadas visitando NEFs de Caryocar. Camponotus crassus, C. aff. blandus e Zacryptocerus pusllus foram as formigas mais abundantes durante o dia, enquanto que Camponotus rufipes, C.rengerl e Pheldole sp. foram as mais abundantes durante a noite. O número de plantas de Caryocar sendo visitadas por formigas foi significativamente maior que o de espécies sem NEFs. Como conseqüência disto, o número de iscas (cupins vivos) atacadas por formigas também foi maior em Caryocar que em plantas sem NEFs. Formigas forragearam preferencialmente sobre botões de Caryocar, atacando um número significativamente maior de cupins nesta região da planta do que em folhas jovens ou adultas. ...Observação: O resumo, na íntegra, poderá ser visualizado no texto completo da tese digital / Abstract: Caryocar brasliense bears extrafloral nectaries (EFNs) on the outer surface of the sepals of its buds, which are intensively visited by several ant species. This study investigated the interaction between ants and Caryocar in an area of cerrado vegetation near Itirapina-SP. A total of 34 ant species (17 genera) were recorded visiting Caryocar at Itirapina. Both in number of species and individuals Camponotus ants were the most representatives in ant censuses conducted on Caryocar. Other ant genera such as Zacryptocerus, Azteca and Pheidole were also commonly observed on the EFNs of Caryocar. Câmponotus crassus, C. aff. blandus and Zacryptocerus pusillus were the most abundant diurnal ants, while Camponotus rufipes, C. rangeri 1 and Pheidole sp. I were the most abundant nocturnal ones. The number of Caryocar plants belng visited by ants was significantly greater than that of non-nectariferous plants, resulting in many more termite-baits being attacked by ants on Caryocar than on plants without EFNs. Ants foraged more intensively on the buds of Caryocar, where a greater number of termites were attacked, as compared with young or mature leaves. ...Note: The complete abstract is available with the full electronic digital thesis or dissertations / Doutorado / Ecologia / Doutor em Ciências Biológicas
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Coevolução em redes de interação antagonista: estrutura e dinâmica / Coevolution in antagonistic interaction networks: structure and dynamics

Andreazzi, Cecilia Siliansky de 28 March 2016 (has links)
As pressões seletivas impostas por interações ecológicas são uma das forças que moldam a adaptação por seleção natural em populações. Entre os resultados possíveis das pressões seletivas impostas por interações está a coevolução, isto é, mudanças evolutivas recíprocas que ocorrem nas populações das espécies que interagem. Um dos principais desafios para a ecologia evolutiva é entender se e como o processo coevolutivo ocorre quando espécies interagem com muitas outras espécies formando redes de interações. Nesta tese desenvolvi, com a ajuda de colaboradores, modelos que descrevem a coevolução entre espécies que interagem de forma antagonista. Interações antagonistas são interações ecológicas interespecíficas que resultam em consequências negativas para a aptidão de indivíduos de uma das espécies envolvidas e positivas para indivíduos da outra espécie. Busquei uma melhor compreensão sobre os mecanismos ecológicos e evolutivos responsáveis pela formação, manutenção e evolução das redes de interação antagonista. Em primeiro lugar, encontrei que a assimetria da seleção influenciou a dinâmica evolutiva em antagonismos. A dinâmica coevolutiva gerou corridas armamentistas quando a intensidade da seleção foi maior sobre as vítimas do que sobre os exploradores. Por outro lado, os valores dos fenótipos flutuaram quando a intensidade da seleção foi maior sobre os exploradores do que sobre as vítimas. No entanto, a dinâmica coevolutiva dependeu da estrutura das redes formadas por antagonistas. Redes aninhadas favoreceram a evolução de resistência em vítimas atacadas por exploradores generalistas. A dinâmica evolutiva também reorganizou as redes de interação e, especialmente em cenários nos quais a seleção favoreceu forte acoplamento fenotípico, formou módulos de espécies interagentes. Em segundo lugar, encontrei que regras de interação baseadas no acoplamento fenotípico ou em barreiras fenotípicas reproduziram a estrutura de redes antagonistas empíricas, mas as duas relações funcionais entre fenótipos e aptidão tenderam a subestimar o aninhamento e superestimar a modularidade das redes empíricas. No entanto, a evolução das características foi diferentemente moldada por essas relações funcionais, sendo mais flutuante no modelo de acoplamento fenotípico e mais direcional no modelo de barreiras fenotípicas. Portanto, a coevolução mediada por diferentes relações funcionais resultou em diferentes dinâmicas coevolutivas mas não teve impacto sobre a organização das redes de interação antagonistas. Em terceiro lugar, estudei como variações nas abundâncias e nos fenótipos estão relacionadas e encontrei que a coevolução rápida mediada por forte pressões seletivas impostas por interações ecológicas pode resultar em uma baixa variabilidade nas abundâncias das populações e alta variabilidade fenotípica. Em contraste, em cenários nos quais a seleção imposta por interações é fraca, encontrei uma alta variabilidade nos tamanhos populacionais e baixa variabilidade fenotípica. Portanto, a rápida resposta evolutiva reduziu as flutuações nos tamanhos populacionais, reduzindo extinções devido a flutuações demográficas. Porém, este resultado foi influenciado pela estrutura da rede: a modularidade aumentou a estabilidade das interações enquanto que o aninhamento esteve associado a maior flutuação demográfica. Por fim, estudei espalhamento de um parasita que infecta diferentes espécies de hospedeiros e que pode ser transmitido por meio da predação de um hospedeiro infectado ou por meio de vetores biológicos. Combinei as diferentes redes antagonistas formadas a partir das interações mediadas por cada mecanismo de transmissão em uma rede de interação múltipla espacialmente explícita. Por meio de um modelo matemático, obtive que a transmissão do parasita é maximizada quando ambos os mecanismos de transmissão são considerados ao mesmo tempo e quando os processos ocorrem com probabilidade semelhante. A análise da cartografia da rede múltipla aliada a simulações de imunização de diferentes tipos de hospedeiros mostraram que a estrutura da rede múltipla pode indicar o papel que cada espécie de hospedeiro desempenha na transmissão do parasita em um determinado ecossistema / Mutualisms are interactions in which organisms of different species exploit each other with net benefits for both interacting individuals. Multispecific mutualistic system can be depicted as interaction networks, such as those formed by plant-pollinator interactions, dispersal systems, species interacting in cleaning stations in reef environments, protective ants in plants, müllerian mimicry, and nitrogen fixing bacteria on the roots of plants. Mutualistic interaction is subject to cheating by individuals who, by means of a diversity of behavioral strategies, achieve the benefit provided by the partner offering nothing or few in return. However, the mutualistic interactions persist despite the existence of cheaters. In this work I show that the parasites of mutualistic interactions increase the resilience of mutualistic networks to disturbances in nested networks, typically found in species-rich mutualisms. Therefore the joint effect of cheating, structure and dynamics of mutualistic networks have implications for how biodiversity is maintained. I subsequently study the conditions under which tubular flowers, which suffer stronger damages when interacting with nectar robbers, can coexist with planar flowers, pollinators, and robbers through indirect effects of cheating on their reproductive success. The theft of nectar may increase the success of a plant if its interactions with robbers generate higher degrees of cross-pollination, thus increasing the reproductive success of plants that interact with both floral visitors. This study suggests a new source of continued cooperation and diversity strategies through non-linear effects of the interactions between different strategies. Finally, I study how local interactions can promote the prevalence of mimic (the cheaters) in a given population in the absence of their models. I found that prey interacting locally may favor the predominance of mimic preys and avoid predators that, after a few generations and under a non-random distribution of individuals in space, can further strengthen this unexpected effect allopatry of the mimic and its model
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Estrutura de populações e inoculações recíprocas de Xylella fastidiosa subsp. pauca com ocorrência em cultivos vizinhos de Citrus sinensis e Coffea arabica sob condições do estado de São Paulo /

Francisco, Carolina Sardinha. January 2014 (has links)
Orientador: Paulo Cezar Ceresini / Coorientador: Helvécio Della Coletta Filho / Banca: Vitor Fernandes Oliveira de Miranda / Banca: Eduardo Seite Gomide Mizubuti / Resumo: A pouco mais de uma década a bactéria Xylella fastidiosa passou de um organismo pouco conhecido a uns dos mais conhecidos, ao menos em termos de genômica. No Brasil esta bactéria afeta culturas de importância econômica como citros, causando a clorose variegada dos citros (CVC) e café, na qual causa a requeima da folha do cafeeiro (RFC), também conhecida como atrofia do ramo do cafeeiro (ARC). Em laranjeiras a bactéria acarreta os maiores danos econômicos, na ordem de 100 milhões de dólares anuais. Em relação às plantas de café, estudos demonstraram que a cada 1% de aumento na severidade da doença há perdas de rendimento de 1,22 a 1,34 sacos de 60kg por hectare. Ambas as culturas são afetadas pela Xylella fastidiosa subsp. pauca e transmitida pelos mesmo vetores, porém ainda são incertas as informações se o isolado que causa a CVC pode colonizar cafeeiros e causar doença e vice-versa. Além do mais, em contraste com os diversos estudos já realizados sobre populações de X. fastidiosa infectando laranjeiras, não se tinha informações sobre a diversidade genética e estrutura populacional deste patógeno quando infectando cafeeiros. Um total de 618 estirpes de X. fastidiosa foi isolado de laranjeiras e cafeeiros de quatro regiões geográficas distintas do estado de São Paulo. Esses isolados foram genotipados através de 14 marcadores microssatélites. A alta diversidade genotípica e genética, os altos índices de clonalidade, o forte desequilíbrio gamético e o elevado grau de subdivisão populacional encontrados nas populações de X. fastidiosa amostradas de cafeeiros são consistentes com predominância de um modo de reprodução clonal. Os níveis de subdivisão observados poderiam ser explicados pela migração histórica assimétrica encontrada entre as populações, indicando as populações da região Noroeste e Central como as prováveis fundadoras. Também realizamos ensaios de inoculações recíprocas ... / Abstract: A little over a decade the bacterium Xylella fastidiosa has gone from a little-known body to the most popular ones, at least in terms of genomics. In Brazil this bacterium affects economically important crops such as citrus, which causes citrus variegated chlorosis (CVC) and coffee, causing coffee leaf scorch (CLS), also known as coffee stem atrophy (CSA). In orange this bacteria causes major economic losses in the order of 100 million dollars annually. Regarding the coffee plants, studies have shown that every 1% increase in the severity of disease cause loss of 1.22 to 1.34 bags of 60kg per hectare. Both cultures are affected by subsp. pauca of X. fastidiosa and are transmitted by the same vectors, but informations are still uncertain if isolated causing CVC can colonize and cause disease in coffee plants and vice versa. Moreover, in contrast of many previous work on study about population of X. fastidiosa infecting orange, we had no information about genetic diversity and population structure of this pathogen infecting coffee plants. Thus a total of 618 strains of X. fastidiosa was isolated from orange and coffee in four distinct geographic regions (Central, Northwestern, Center-western and Eastern) of the São Paulo State. These isolates were typed by fourteen microsatellite markers. The high genotypic and genetic diversity, high levels of clonality, strong gametic disequilibrium, and the population subdivision found in X. fastidiosa population are consistent with the predominance of mode of clonal reproduction. The subdivision levels observed could be explained by the asymmetric historical migration between populations, indicating the populations of Central and Northwestern region as the probable founders. We also performed tests of reciprocal inoculations among isolates from orange and coffee plants under controlled conditions. The 99 isolates from orange and 127 isolates from coffee through Bayesian analysis, were grouped on ... / Mestre

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