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Estrutura de populações e inoculações recíprocas de Xylella fastidiosa subsp. pauca com ocorrência em cultivos vizinhos de Citrus sinensis e Coffea arabica sob condições do estado de São Paulo

Francisco, Carolina Sardinha [UNESP] 25 August 2014 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2015-03-03T11:52:25Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-08-25Bitstream added on 2015-03-03T12:07:17Z : No. of bitstreams: 1 000811896.pdf: 967104 bytes, checksum: 63037b124f0b61a187940925ad4979e2 (MD5) / A pouco mais de uma década a bactéria Xylella fastidiosa passou de um organismo pouco conhecido a uns dos mais conhecidos, ao menos em termos de genômica. No Brasil esta bactéria afeta culturas de importância econômica como citros, causando a clorose variegada dos citros (CVC) e café, na qual causa a requeima da folha do cafeeiro (RFC), também conhecida como atrofia do ramo do cafeeiro (ARC). Em laranjeiras a bactéria acarreta os maiores danos econômicos, na ordem de 100 milhões de dólares anuais. Em relação às plantas de café, estudos demonstraram que a cada 1% de aumento na severidade da doença há perdas de rendimento de 1,22 a 1,34 sacos de 60kg por hectare. Ambas as culturas são afetadas pela Xylella fastidiosa subsp. pauca e transmitida pelos mesmo vetores, porém ainda são incertas as informações se o isolado que causa a CVC pode colonizar cafeeiros e causar doença e vice-versa. Além do mais, em contraste com os diversos estudos já realizados sobre populações de X. fastidiosa infectando laranjeiras, não se tinha informações sobre a diversidade genética e estrutura populacional deste patógeno quando infectando cafeeiros. Um total de 618 estirpes de X. fastidiosa foi isolado de laranjeiras e cafeeiros de quatro regiões geográficas distintas do estado de São Paulo. Esses isolados foram genotipados através de 14 marcadores microssatélites. A alta diversidade genotípica e genética, os altos índices de clonalidade, o forte desequilíbrio gamético e o elevado grau de subdivisão populacional encontrados nas populações de X. fastidiosa amostradas de cafeeiros são consistentes com predominância de um modo de reprodução clonal. Os níveis de subdivisão observados poderiam ser explicados pela migração histórica assimétrica encontrada entre as populações, indicando as populações da região Noroeste e Central como as prováveis fundadoras. Também realizamos ensaios de inoculações recíprocas ... / A little over a decade the bacterium Xylella fastidiosa has gone from a little-known body to the most popular ones, at least in terms of genomics. In Brazil this bacterium affects economically important crops such as citrus, which causes citrus variegated chlorosis (CVC) and coffee, causing coffee leaf scorch (CLS), also known as coffee stem atrophy (CSA). In orange this bacteria causes major economic losses in the order of 100 million dollars annually. Regarding the coffee plants, studies have shown that every 1% increase in the severity of disease cause loss of 1.22 to 1.34 bags of 60kg per hectare. Both cultures are affected by subsp. pauca of X. fastidiosa and are transmitted by the same vectors, but informations are still uncertain if isolated causing CVC can colonize and cause disease in coffee plants and vice versa. Moreover, in contrast of many previous work on study about population of X. fastidiosa infecting orange, we had no information about genetic diversity and population structure of this pathogen infecting coffee plants. Thus a total of 618 strains of X. fastidiosa was isolated from orange and coffee in four distinct geographic regions (Central, Northwestern, Center-western and Eastern) of the São Paulo State. These isolates were typed by fourteen microsatellite markers. The high genotypic and genetic diversity, high levels of clonality, strong gametic disequilibrium, and the population subdivision found in X. fastidiosa population are consistent with the predominance of mode of clonal reproduction. The subdivision levels observed could be explained by the asymmetric historical migration between populations, indicating the populations of Central and Northwestern region as the probable founders. We also performed tests of reciprocal inoculations among isolates from orange and coffee plants under controlled conditions. The 99 isolates from orange and 127 isolates from coffee through Bayesian analysis, were grouped on ...
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Coevolução em redes de interação antagonista: estrutura e dinâmica / Coevolution in antagonistic interaction networks: structure and dynamics

Cecilia Siliansky de Andreazzi 28 March 2016 (has links)
As pressões seletivas impostas por interações ecológicas são uma das forças que moldam a adaptação por seleção natural em populações. Entre os resultados possíveis das pressões seletivas impostas por interações está a coevolução, isto é, mudanças evolutivas recíprocas que ocorrem nas populações das espécies que interagem. Um dos principais desafios para a ecologia evolutiva é entender se e como o processo coevolutivo ocorre quando espécies interagem com muitas outras espécies formando redes de interações. Nesta tese desenvolvi, com a ajuda de colaboradores, modelos que descrevem a coevolução entre espécies que interagem de forma antagonista. Interações antagonistas são interações ecológicas interespecíficas que resultam em consequências negativas para a aptidão de indivíduos de uma das espécies envolvidas e positivas para indivíduos da outra espécie. Busquei uma melhor compreensão sobre os mecanismos ecológicos e evolutivos responsáveis pela formação, manutenção e evolução das redes de interação antagonista. Em primeiro lugar, encontrei que a assimetria da seleção influenciou a dinâmica evolutiva em antagonismos. A dinâmica coevolutiva gerou corridas armamentistas quando a intensidade da seleção foi maior sobre as vítimas do que sobre os exploradores. Por outro lado, os valores dos fenótipos flutuaram quando a intensidade da seleção foi maior sobre os exploradores do que sobre as vítimas. No entanto, a dinâmica coevolutiva dependeu da estrutura das redes formadas por antagonistas. Redes aninhadas favoreceram a evolução de resistência em vítimas atacadas por exploradores generalistas. A dinâmica evolutiva também reorganizou as redes de interação e, especialmente em cenários nos quais a seleção favoreceu forte acoplamento fenotípico, formou módulos de espécies interagentes. Em segundo lugar, encontrei que regras de interação baseadas no acoplamento fenotípico ou em barreiras fenotípicas reproduziram a estrutura de redes antagonistas empíricas, mas as duas relações funcionais entre fenótipos e aptidão tenderam a subestimar o aninhamento e superestimar a modularidade das redes empíricas. No entanto, a evolução das características foi diferentemente moldada por essas relações funcionais, sendo mais flutuante no modelo de acoplamento fenotípico e mais direcional no modelo de barreiras fenotípicas. Portanto, a coevolução mediada por diferentes relações funcionais resultou em diferentes dinâmicas coevolutivas mas não teve impacto sobre a organização das redes de interação antagonistas. Em terceiro lugar, estudei como variações nas abundâncias e nos fenótipos estão relacionadas e encontrei que a coevolução rápida mediada por forte pressões seletivas impostas por interações ecológicas pode resultar em uma baixa variabilidade nas abundâncias das populações e alta variabilidade fenotípica. Em contraste, em cenários nos quais a seleção imposta por interações é fraca, encontrei uma alta variabilidade nos tamanhos populacionais e baixa variabilidade fenotípica. Portanto, a rápida resposta evolutiva reduziu as flutuações nos tamanhos populacionais, reduzindo extinções devido a flutuações demográficas. Porém, este resultado foi influenciado pela estrutura da rede: a modularidade aumentou a estabilidade das interações enquanto que o aninhamento esteve associado a maior flutuação demográfica. Por fim, estudei espalhamento de um parasita que infecta diferentes espécies de hospedeiros e que pode ser transmitido por meio da predação de um hospedeiro infectado ou por meio de vetores biológicos. Combinei as diferentes redes antagonistas formadas a partir das interações mediadas por cada mecanismo de transmissão em uma rede de interação múltipla espacialmente explícita. Por meio de um modelo matemático, obtive que a transmissão do parasita é maximizada quando ambos os mecanismos de transmissão são considerados ao mesmo tempo e quando os processos ocorrem com probabilidade semelhante. A análise da cartografia da rede múltipla aliada a simulações de imunização de diferentes tipos de hospedeiros mostraram que a estrutura da rede múltipla pode indicar o papel que cada espécie de hospedeiro desempenha na transmissão do parasita em um determinado ecossistema / Mutualisms are interactions in which organisms of different species exploit each other with net benefits for both interacting individuals. Multispecific mutualistic system can be depicted as interaction networks, such as those formed by plant-pollinator interactions, dispersal systems, species interacting in cleaning stations in reef environments, protective ants in plants, müllerian mimicry, and nitrogen fixing bacteria on the roots of plants. Mutualistic interaction is subject to cheating by individuals who, by means of a diversity of behavioral strategies, achieve the benefit provided by the partner offering nothing or few in return. However, the mutualistic interactions persist despite the existence of cheaters. In this work I show that the parasites of mutualistic interactions increase the resilience of mutualistic networks to disturbances in nested networks, typically found in species-rich mutualisms. Therefore the joint effect of cheating, structure and dynamics of mutualistic networks have implications for how biodiversity is maintained. I subsequently study the conditions under which tubular flowers, which suffer stronger damages when interacting with nectar robbers, can coexist with planar flowers, pollinators, and robbers through indirect effects of cheating on their reproductive success. The theft of nectar may increase the success of a plant if its interactions with robbers generate higher degrees of cross-pollination, thus increasing the reproductive success of plants that interact with both floral visitors. This study suggests a new source of continued cooperation and diversity strategies through non-linear effects of the interactions between different strategies. Finally, I study how local interactions can promote the prevalence of mimic (the cheaters) in a given population in the absence of their models. I found that prey interacting locally may favor the predominance of mimic preys and avoid predators that, after a few generations and under a non-random distribution of individuals in space, can further strengthen this unexpected effect allopatry of the mimic and its model
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Coevolution in mutualistic networks: gene flow and selection mosaics / Coevolução em redes mutualistas: fluxo gênico e mosaicos de seleção

Medeiros, Lucas Paoliello de 03 August 2017 (has links)
Ecological interactions such as predation, competition, and mutualism are important forces that influence species evolution. Coevolution is defined as reciprocal evolutionary change in interacting species. The Geographic Mosaic Theory of Coevolution (GMTC) provides a theoretical framework to explain how collections of populations should coevolve across space. Two fundamental aspects of the GMTC are gene flow among populations and the presence of selection mosaics, which are collections of localities with particular selection regimes. Several studies have explored how phenotypic trait matching between species evolves in pairs or small groups of species. However, ecological interactions frequently form large networks that connect dozens of species present in a given community. In networks of mutualisms, for instance, the organization of interactions may affect ecological and evolutionary processes. A next step in understanding the coevolutionary process is to investigate how aspects of the GMTC affect the evolution of species embedded in interaction networks. In this dissertation, we tried to fill this gap using a mathematical model of coevolution, complex networks tools, and information on empirical mutualistic networks. Our numerical simulations of the coevolutionary model allow us to draw three main conclusions. First, gene flow affects trait patterns generated by coevolution and may favor the emergence of trait matching depending on the selection mosaic. Second, the organization of mutualistic networks influences coevolution, but this effect may vanish when gene flow favors trait matching. Intimate mutualisms, such as protection of host plants by ants, form small and compartmentalized networks that generate higher trait matching than large and nested networks typical of mutualisms among free-living species, such as pollination. Third, habitat fragmentation resulting in the disruption of gene flow should reduce the reciprocal adaptations between interacting species and at the same time promote adaptations to the local abiotic environment. In conclusion, we show that a complex interplay between gene flow, the geographic structure of selection, and the organization of ecological networks shapes the evolution of large groups of species. Our results therefore allow predictions of how environmental impacts such as habitat fragmentation will modify the evolution of species interactions / Interações ecológicas como predação, competição e mutualismo são importantes forças que influenciam a evolução de espécies. Chamamos de coevolução a mudança evolutiva recíproca em espécies que interagem. A Teoria do Mosaico Geográfico da Coevolução (TMGC) fornece um arcabouço teórico para entender como conjuntos de populações coevoluem ao longo do espaço. Dois aspectos fundamentais da TMGC são o fluxo gênico entre populações e a presença de mosaicos de seleção, isto é, conjuntos de locais com regimes de seleção particulares. Diversos estudos exploraram como o acoplamento entre fenótipos de diferentes espécies evolui em pares ou pequenos grupos de espécies. Entretanto, interações ecológicas frequentemente formam grandes redes que conectam dezenas de espécies presentes em uma comunidade. Em redes de mutualismos, por exemplo, a organização das interações pode influenciar processos ecológicos e evolutivos. Um próximo passo para a compreensão do processo coevolutivo consiste em investigar como aspectos da TMGC influenciam a evolução de espécies em redes de interações. Nesta dissertação, tentamos preencher esta lacuna usando um modelo matemático de coevolução, ferramentas de redes complexas e informação sobre redes mutualistas empíricas. Nossas simulações numéricas do modelo coevolutivo apontam para três principais conclusões. Primeiro, o fluxo gênico influencia os padrões fenotípicos gerados por coevolução e pode favorecer a emergência de acoplamento fenotípico entre espécies dependendo do mosaico de seleção. Segundo, a organização de redes mutualistas influencia a coevolução, mas este efeito pode desaparecer quando o fluxo gênico favorece acoplamento fenotípico. Mutualismos íntimos, como proteção de plantas hospedeiras por formigas, formam redes pequenas e compartimentalizadas que geram um maior acoplamento fenotípico do que as redes grandes e aninhadas típicas de mutualismos entre espécies de vida livre, como polinização. Por fim, a fragmentação de habitat, ao extinguir o fluxo gênico, pode reduzir as adaptações recíprocas entre espécies e ao mesmo tempo tornar cada espécie mais adaptada ao seu ambiente abiótico local. Em suma, mostramos que interações complexas entre fluxo gênico, estrutura geográfica da seleção e organização de redes ecológicas moldam a evolução de grandes grupos de espécies. Dessa forma, podemos traçar previsões sobre como impactos ambientais como a fragmentação de habitat irão alterar a evolução de interações ecológicas
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Entre ritmos: as habilidades perceptuais de pescadores em paisagens multiespecíficas (vila do Pontal do Leste, Cananeia - SP) / Between rhythms: perceptual skills of fishermen in multispecies landscapes (Pontal do Leste, Cananeia - SP)

Santos, Lucas Lima dos 15 May 2017 (has links)
Entre as temporalidades de diferentes processos locais, este estudo etnográfico aprofunda-se em entender como esses diferentes ritmos relacionam-se e modulam as atividades de pescadores e de outros habitantes (humanos e não-humanos) na vila do Pontal do Leste - Ilha do Cardoso, Cananeia - SP. Relações essas sempre em processo de co-constituição, co-respondencia, co-evolução entre humanos e não-humanos, nunca formados e preexistentes de antemão. As percepções desses processos são fundamentais para o entendimento do comportamento de alguns animais não-humanos e plantas, das condições de tempo, da geomorfologia insular e da ecologia eólico-hídrica local, resultando em caracterizações sensíveis, que serão desdobradas nessa etnografia. Portanto, nessa malha de relações composta por paisagens multiespécies, onde diversas linhas de movimentos são traçadas por seres e processos, o intuito deste estudo foi descrever como essas linhas encontram-se e contaminam-se. E, acima de tudo, como esses encontros são traduzidos pelos habitantes e visitantes da vila. / Among the temporalities of different local processes, this ethnographic study deepens in understanding how these different rhythms relate and modulate the activities of fishermen and other inhabitants (human and non-human) in the village of Pontal do Leste - Cardoso Island, Cananeia - SP. These relations are always in the process of co-constitution, coresponse, co-evolution between humans and nonhumans never formed and preexisting inadvance. The perceptions of these processes are fundamental to the understanding of the behavior of some non-human animals and plants, of the weather conditions, insular geomorphology and local wind-hydric ecology, resulting in sensitive characterizations that will be unfolded in this ethnography. Therefore, in this meshwork of relationships composed of multispecies landscapes, where several lines of movement are traced by beings and processes, the purpose of this study was to describe how these lines meet and become contaminated. And, above all, how these meetings are translated by the inhabitants and visitors of the village.
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Evolutionary dynamics of mimetic rings in heterogeneous ecological communities / Dinâmica evolutiva de anéis miméticos em comunidades ecológicas heterogêneas

Barros, Irina Birskis 28 June 2017 (has links)
Müllerian mimicry theory postulate that individuals of different species benefit from decreased per-capita attack risks by sharing similar warning signals. In species-rich mimetic assemblages, there is the formation of several distinct sympatric groups of species sharing the same warning signals, often color pattern, called mimetic rings. The coexistence of multiple rings seems paradoxical considering that selection among unpalatable species should favor convergence and thus reinforce a single color pattern. Different rings evolving in distinct habitats could explain the coexistence of multiple mimicry rings. However, the way species use the habitats might influence the emergence of multiple mimicry rings. We combined mathematical modeling and numerical simulations to explore how habitat heterogeneity, abiotic selection and habitat generalist species influence the formation of mimicry rings in a community. We showed that distinct selection pressures, derived from habitat heterogeneity, favored the formation of distinctive mimicry rings. Nevertheless, just the co-existence of species was enough to drive the emergence of the rings. Simulations in which there was just biotic or abiotic selection, time for convergence was faster than when both sources of selection acted together, suggesting conflicting selective pressures exerted by environment and co-existing species. In the presence of species that was habitat generalist, species converged to similar trait values, decreasing the distinctiveness of mimicry rings. A unique mimicry ring was formed if the different habitats optima in the community were very similar or when most species were habitat generalists. Our results suggest that multiple sympatric mimicry rings are formed by a complex interplay between abiotic and biotic selection and is only possible in groups of animals in which local species composition is strongly affected by habitat heterogeneity such as butterflies / No mimetismo Mülleriano, indivíduos de diferentes espécies, ao compartilharem um mesmo sinal de advertência, beneficiam-se mutuamente devido ao menor risco de predação. Em comunidades ricas em mímicos há a formação de grupos simpátricos de espécies denominados anéis miméticos, que compartilham os mesmos sinais de advertência, como por exemplo padrões de coloração. A coexistência de anéis miméticos parece paradoxal, uma vez que, em teoria, a seleção favoreceria a convergência das espécies impalatáveis e, portanto, geraria um único padrão de cor. A evolução de diferentes anéis miméticos em habitats distintos poderia explicar a coexistência desses anéis em uma comunidade. No entanto, a maneira como as espécies utilizam esses habitats talvez influencie também a emergência dos múltiplos anéis miméticos. Utilizamos modelos matemáticos e simulações computacionais para melhor compreender como a heterogeneidade de habitats, a seleção ambiental e espécies generalistas de habitat influenciam a formação de anéis miméticos em uma comunidade. Demonstramos que diferentes pressões seletivas, derivadas de uma heterogeneidade de habitats, podem favorecer a formação de anéis miméticos. Porém, a simples coexistência das espécies é suficiente para a emergência de anéis. Em simulações nas quais só havia seleção imposta por espécies impalatáveis ou pelo ambiente, o tempo de convergência foi mais rápido do que quando as duas forças seletivas atuavam juntas. Isto demonstra que provavelmente há conflito entre a seleção biótica e abiótica, não favorecendo o mesmo ótimo fenotípico. A presença de uma espécie generalista de habitat favoreceu a convergência de espécies para um valor fenotípico similar, diminuindo a distinção entre os anéis. Um único anel foi formado quando os diferentes fenótipos favorecidos pela seleção imposta pelo ambiente eram muito similares entre habitats, ou quando muitas espécies eram generalistas de habitat. Nosso trabalho sugere que múltiplos anéis miméticos simpátricos são formados por uma complexa interação entre seleção biótica e abiótica e que só são possíveis em grupos no qual a diversidade é estruturada em pequenas escalas espaciais, como borboletas
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Acanthobothrium Blanchard, 1948 from the northwest Atlantic and their phylogenetic relationships with freshwater lineages / Acanthobothrium Blanchard, 1948 do Noroeste Atlântico e seu relacionamento filogenético com linhagens de água doce

Yu Golfetti 18 December 2018 (has links)
Parasite documentation has been an important tool to understand host history and co-evolutionary processes in these associations. Acanthobothrium is a worldwide genus of cestodes, and it is a parasite of sharks, skates and rays, with almost 200 nominal species. Recent studies are presenting new hypotheses on cestodes distribution and host specificity patterns. Due to their large distribution, geographical and in host taxa, Acanthobothrium seems to be a good model to evaluate these hypothesis. The Bay of Marajó is an estuarine area were freshwater stingrays of the family Potamotrygonidae share the same environment with marine dasyatid rays. There is no documentation about the dasyatid fauna of Acanthobothrium for Bay of Marajó, neither their relationships with freshwater lineages or their hosts. In our goal to understand those evolutionary events, our results revealed six new lineages of Acanthobothrium, parasites of Hypanus guttatus and Fontitrygon geijskesi, of which four are formally described. Five of those new lineages are included in a clade exclusive to Northwest Atlantic and Caribbean Sea. Acanthobothrium sp. 10 was recovered as sister of clade formed by marine Acanthobothrium sp. 9 sensu Trevisan and freshwater Acanthobothrium sp. 2 sensu Cardoso Jr. The specificity pattern of Acanthobothrium has been discussed and our results corroborate this discussion when we observed four species of Acanthobothrium sharing two different hosts of different genera. Also, host sample size may be correlated with the specificity and strict specificity patterns of the parasite to their hosts. The absence of Fontitrygon colarensis in our samples and the incongruities in comparison to Hypanus guttatus make us question the taxonomic status of F. Colarensis / A documentação de organismos parasitas tem sido uma ferramenta importante para entender a história de seus hospedeiros e os processos coevolutivos implícitos nessas associações. Acanthobothrium é um gênero de cestóideos mundialmente distribuido, parasita de tubarões, skates e raias, com quase 200 espécies nominais. Estudos recentes vem apresentando novas hipóteses sobre a distribuição e especificidade dos cestóides. Devido à sua larga distribuição geográfica e em taxons hospedeiros, Acanthobothrium parece ser um bom modelo para avaliar estas hipóteses. A Baía de Marajó é uma área estuarina onde arraias de água doce da família Potamotrygonidae compartilham o mesmo ambiente com raias marinhas, especialmente dasiatídeos. Não há documentação sobre a fauna de Dasyatidae para Acanthobothrium a Baía de Marajó, nem sobre as relações destas com linhagens de água doce e seus hospedeiros. Com o objetivo de entender esses eventos evolutivos, nossos resultados mostraram seis novas linhagens de Acanthobothrium, parasitas de Hypanus guttatus e Fontitrygon geijskesi, das quais quatro são descritas. Cinco dessas novas linhagens estão incluídas em um clado exclusivamente do Noroeste Atlântico e do Mar do Caribe. Acanthobothrium sp. 10 foi recuperado como grupo irmão de um clado formado pela linhagem marinha Acanthobothrium sp. 9 sensu Trevisan e pela linhagem de água doce Acanthobothrium sp. 2 sensu Cardoso Jr. O padrão de especificidade de Acanthobothrium tem sido discutido e nossos resultados corroboram esta discussão quando observamos quatro espécies de Acanthobothrium compartilhando duas hospedeiras de diferentes gêneros. Além disso, tamanho amostral de hospedeiros pode estar relacionado com nosso entendimento sobre os padrões de especificidade estrita do parasita aos seus hospedeiros. A ausência de F. Colarensis em nossas amostras e as incongruências em comparação com H. Guttatus nos fazem questionar o status taxonômico de F. Colarensis
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Acanthobothrium Blanchard, 1948 from the northwest Atlantic and their phylogenetic relationships with freshwater lineages / Acanthobothrium Blanchard, 1948 do Noroeste Atlântico e seu relacionamento filogenético com linhagens de água doce

Golfetti, Yu 18 December 2018 (has links)
Parasite documentation has been an important tool to understand host history and co-evolutionary processes in these associations. Acanthobothrium is a worldwide genus of cestodes, and it is a parasite of sharks, skates and rays, with almost 200 nominal species. Recent studies are presenting new hypotheses on cestodes distribution and host specificity patterns. Due to their large distribution, geographical and in host taxa, Acanthobothrium seems to be a good model to evaluate these hypothesis. The Bay of Marajó is an estuarine area were freshwater stingrays of the family Potamotrygonidae share the same environment with marine dasyatid rays. There is no documentation about the dasyatid fauna of Acanthobothrium for Bay of Marajó, neither their relationships with freshwater lineages or their hosts. In our goal to understand those evolutionary events, our results revealed six new lineages of Acanthobothrium, parasites of Hypanus guttatus and Fontitrygon geijskesi, of which four are formally described. Five of those new lineages are included in a clade exclusive to Northwest Atlantic and Caribbean Sea. Acanthobothrium sp. 10 was recovered as sister of clade formed by marine Acanthobothrium sp. 9 sensu Trevisan and freshwater Acanthobothrium sp. 2 sensu Cardoso Jr. The specificity pattern of Acanthobothrium has been discussed and our results corroborate this discussion when we observed four species of Acanthobothrium sharing two different hosts of different genera. Also, host sample size may be correlated with the specificity and strict specificity patterns of the parasite to their hosts. The absence of Fontitrygon colarensis in our samples and the incongruities in comparison to Hypanus guttatus make us question the taxonomic status of F. Colarensis / A documentação de organismos parasitas tem sido uma ferramenta importante para entender a história de seus hospedeiros e os processos coevolutivos implícitos nessas associações. Acanthobothrium é um gênero de cestóideos mundialmente distribuido, parasita de tubarões, skates e raias, com quase 200 espécies nominais. Estudos recentes vem apresentando novas hipóteses sobre a distribuição e especificidade dos cestóides. Devido à sua larga distribuição geográfica e em taxons hospedeiros, Acanthobothrium parece ser um bom modelo para avaliar estas hipóteses. A Baía de Marajó é uma área estuarina onde arraias de água doce da família Potamotrygonidae compartilham o mesmo ambiente com raias marinhas, especialmente dasiatídeos. Não há documentação sobre a fauna de Dasyatidae para Acanthobothrium a Baía de Marajó, nem sobre as relações destas com linhagens de água doce e seus hospedeiros. Com o objetivo de entender esses eventos evolutivos, nossos resultados mostraram seis novas linhagens de Acanthobothrium, parasitas de Hypanus guttatus e Fontitrygon geijskesi, das quais quatro são descritas. Cinco dessas novas linhagens estão incluídas em um clado exclusivamente do Noroeste Atlântico e do Mar do Caribe. Acanthobothrium sp. 10 foi recuperado como grupo irmão de um clado formado pela linhagem marinha Acanthobothrium sp. 9 sensu Trevisan e pela linhagem de água doce Acanthobothrium sp. 2 sensu Cardoso Jr. O padrão de especificidade de Acanthobothrium tem sido discutido e nossos resultados corroboram esta discussão quando observamos quatro espécies de Acanthobothrium compartilhando duas hospedeiras de diferentes gêneros. Além disso, tamanho amostral de hospedeiros pode estar relacionado com nosso entendimento sobre os padrões de especificidade estrita do parasita aos seus hospedeiros. A ausência de F. Colarensis em nossas amostras e as incongruências em comparação com H. Guttatus nos fazem questionar o status taxonômico de F. Colarensis
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Evolutionary dynamics of mimetic rings in heterogeneous ecological communities / Dinâmica evolutiva de anéis miméticos em comunidades ecológicas heterogêneas

Irina Birskis Barros 28 June 2017 (has links)
Müllerian mimicry theory postulate that individuals of different species benefit from decreased per-capita attack risks by sharing similar warning signals. In species-rich mimetic assemblages, there is the formation of several distinct sympatric groups of species sharing the same warning signals, often color pattern, called mimetic rings. The coexistence of multiple rings seems paradoxical considering that selection among unpalatable species should favor convergence and thus reinforce a single color pattern. Different rings evolving in distinct habitats could explain the coexistence of multiple mimicry rings. However, the way species use the habitats might influence the emergence of multiple mimicry rings. We combined mathematical modeling and numerical simulations to explore how habitat heterogeneity, abiotic selection and habitat generalist species influence the formation of mimicry rings in a community. We showed that distinct selection pressures, derived from habitat heterogeneity, favored the formation of distinctive mimicry rings. Nevertheless, just the co-existence of species was enough to drive the emergence of the rings. Simulations in which there was just biotic or abiotic selection, time for convergence was faster than when both sources of selection acted together, suggesting conflicting selective pressures exerted by environment and co-existing species. In the presence of species that was habitat generalist, species converged to similar trait values, decreasing the distinctiveness of mimicry rings. A unique mimicry ring was formed if the different habitats optima in the community were very similar or when most species were habitat generalists. Our results suggest that multiple sympatric mimicry rings are formed by a complex interplay between abiotic and biotic selection and is only possible in groups of animals in which local species composition is strongly affected by habitat heterogeneity such as butterflies / No mimetismo Mülleriano, indivíduos de diferentes espécies, ao compartilharem um mesmo sinal de advertência, beneficiam-se mutuamente devido ao menor risco de predação. Em comunidades ricas em mímicos há a formação de grupos simpátricos de espécies denominados anéis miméticos, que compartilham os mesmos sinais de advertência, como por exemplo padrões de coloração. A coexistência de anéis miméticos parece paradoxal, uma vez que, em teoria, a seleção favoreceria a convergência das espécies impalatáveis e, portanto, geraria um único padrão de cor. A evolução de diferentes anéis miméticos em habitats distintos poderia explicar a coexistência desses anéis em uma comunidade. No entanto, a maneira como as espécies utilizam esses habitats talvez influencie também a emergência dos múltiplos anéis miméticos. Utilizamos modelos matemáticos e simulações computacionais para melhor compreender como a heterogeneidade de habitats, a seleção ambiental e espécies generalistas de habitat influenciam a formação de anéis miméticos em uma comunidade. Demonstramos que diferentes pressões seletivas, derivadas de uma heterogeneidade de habitats, podem favorecer a formação de anéis miméticos. Porém, a simples coexistência das espécies é suficiente para a emergência de anéis. Em simulações nas quais só havia seleção imposta por espécies impalatáveis ou pelo ambiente, o tempo de convergência foi mais rápido do que quando as duas forças seletivas atuavam juntas. Isto demonstra que provavelmente há conflito entre a seleção biótica e abiótica, não favorecendo o mesmo ótimo fenotípico. A presença de uma espécie generalista de habitat favoreceu a convergência de espécies para um valor fenotípico similar, diminuindo a distinção entre os anéis. Um único anel foi formado quando os diferentes fenótipos favorecidos pela seleção imposta pelo ambiente eram muito similares entre habitats, ou quando muitas espécies eram generalistas de habitat. Nosso trabalho sugere que múltiplos anéis miméticos simpátricos são formados por uma complexa interação entre seleção biótica e abiótica e que só são possíveis em grupos no qual a diversidade é estruturada em pequenas escalas espaciais, como borboletas
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Entre ritmos: as habilidades perceptuais de pescadores em paisagens multiespecíficas (vila do Pontal do Leste, Cananeia - SP) / Between rhythms: perceptual skills of fishermen in multispecies landscapes (Pontal do Leste, Cananeia - SP)

Lucas Lima dos Santos 15 May 2017 (has links)
Entre as temporalidades de diferentes processos locais, este estudo etnográfico aprofunda-se em entender como esses diferentes ritmos relacionam-se e modulam as atividades de pescadores e de outros habitantes (humanos e não-humanos) na vila do Pontal do Leste - Ilha do Cardoso, Cananeia - SP. Relações essas sempre em processo de co-constituição, co-respondencia, co-evolução entre humanos e não-humanos, nunca formados e preexistentes de antemão. As percepções desses processos são fundamentais para o entendimento do comportamento de alguns animais não-humanos e plantas, das condições de tempo, da geomorfologia insular e da ecologia eólico-hídrica local, resultando em caracterizações sensíveis, que serão desdobradas nessa etnografia. Portanto, nessa malha de relações composta por paisagens multiespécies, onde diversas linhas de movimentos são traçadas por seres e processos, o intuito deste estudo foi descrever como essas linhas encontram-se e contaminam-se. E, acima de tudo, como esses encontros são traduzidos pelos habitantes e visitantes da vila. / Among the temporalities of different local processes, this ethnographic study deepens in understanding how these different rhythms relate and modulate the activities of fishermen and other inhabitants (human and non-human) in the village of Pontal do Leste - Cardoso Island, Cananeia - SP. These relations are always in the process of co-constitution, coresponse, co-evolution between humans and nonhumans never formed and preexisting inadvance. The perceptions of these processes are fundamental to the understanding of the behavior of some non-human animals and plants, of the weather conditions, insular geomorphology and local wind-hydric ecology, resulting in sensitive characterizations that will be unfolded in this ethnography. Therefore, in this meshwork of relationships composed of multispecies landscapes, where several lines of movement are traced by beings and processes, the purpose of this study was to describe how these lines meet and become contaminated. And, above all, how these meetings are translated by the inhabitants and visitors of the village.
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Coevolution in mutualistic networks: gene flow and selection mosaics / Coevolução em redes mutualistas: fluxo gênico e mosaicos de seleção

Lucas Paoliello de Medeiros 03 August 2017 (has links)
Ecological interactions such as predation, competition, and mutualism are important forces that influence species evolution. Coevolution is defined as reciprocal evolutionary change in interacting species. The Geographic Mosaic Theory of Coevolution (GMTC) provides a theoretical framework to explain how collections of populations should coevolve across space. Two fundamental aspects of the GMTC are gene flow among populations and the presence of selection mosaics, which are collections of localities with particular selection regimes. Several studies have explored how phenotypic trait matching between species evolves in pairs or small groups of species. However, ecological interactions frequently form large networks that connect dozens of species present in a given community. In networks of mutualisms, for instance, the organization of interactions may affect ecological and evolutionary processes. A next step in understanding the coevolutionary process is to investigate how aspects of the GMTC affect the evolution of species embedded in interaction networks. In this dissertation, we tried to fill this gap using a mathematical model of coevolution, complex networks tools, and information on empirical mutualistic networks. Our numerical simulations of the coevolutionary model allow us to draw three main conclusions. First, gene flow affects trait patterns generated by coevolution and may favor the emergence of trait matching depending on the selection mosaic. Second, the organization of mutualistic networks influences coevolution, but this effect may vanish when gene flow favors trait matching. Intimate mutualisms, such as protection of host plants by ants, form small and compartmentalized networks that generate higher trait matching than large and nested networks typical of mutualisms among free-living species, such as pollination. Third, habitat fragmentation resulting in the disruption of gene flow should reduce the reciprocal adaptations between interacting species and at the same time promote adaptations to the local abiotic environment. In conclusion, we show that a complex interplay between gene flow, the geographic structure of selection, and the organization of ecological networks shapes the evolution of large groups of species. Our results therefore allow predictions of how environmental impacts such as habitat fragmentation will modify the evolution of species interactions / Interações ecológicas como predação, competição e mutualismo são importantes forças que influenciam a evolução de espécies. Chamamos de coevolução a mudança evolutiva recíproca em espécies que interagem. A Teoria do Mosaico Geográfico da Coevolução (TMGC) fornece um arcabouço teórico para entender como conjuntos de populações coevoluem ao longo do espaço. Dois aspectos fundamentais da TMGC são o fluxo gênico entre populações e a presença de mosaicos de seleção, isto é, conjuntos de locais com regimes de seleção particulares. Diversos estudos exploraram como o acoplamento entre fenótipos de diferentes espécies evolui em pares ou pequenos grupos de espécies. Entretanto, interações ecológicas frequentemente formam grandes redes que conectam dezenas de espécies presentes em uma comunidade. Em redes de mutualismos, por exemplo, a organização das interações pode influenciar processos ecológicos e evolutivos. Um próximo passo para a compreensão do processo coevolutivo consiste em investigar como aspectos da TMGC influenciam a evolução de espécies em redes de interações. Nesta dissertação, tentamos preencher esta lacuna usando um modelo matemático de coevolução, ferramentas de redes complexas e informação sobre redes mutualistas empíricas. Nossas simulações numéricas do modelo coevolutivo apontam para três principais conclusões. Primeiro, o fluxo gênico influencia os padrões fenotípicos gerados por coevolução e pode favorecer a emergência de acoplamento fenotípico entre espécies dependendo do mosaico de seleção. Segundo, a organização de redes mutualistas influencia a coevolução, mas este efeito pode desaparecer quando o fluxo gênico favorece acoplamento fenotípico. Mutualismos íntimos, como proteção de plantas hospedeiras por formigas, formam redes pequenas e compartimentalizadas que geram um maior acoplamento fenotípico do que as redes grandes e aninhadas típicas de mutualismos entre espécies de vida livre, como polinização. Por fim, a fragmentação de habitat, ao extinguir o fluxo gênico, pode reduzir as adaptações recíprocas entre espécies e ao mesmo tempo tornar cada espécie mais adaptada ao seu ambiente abiótico local. Em suma, mostramos que interações complexas entre fluxo gênico, estrutura geográfica da seleção e organização de redes ecológicas moldam a evolução de grandes grupos de espécies. Dessa forma, podemos traçar previsões sobre como impactos ambientais como a fragmentação de habitat irão alterar a evolução de interações ecológicas

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