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Identification, molecular characterization and differential expression studies of genes activated during Coffea arabica L. - Hemileia vastatrix interactions Berk. & Broome / Identificação, caracterização molecular e estudos de expressão diferencial de genes ativados durante as interações Coffea arabica L. - Hemileia vastatrix Berk. & BroomeBarka, Geleta Dugassa 20 February 2017 (has links)
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Previous issue date: 2017-02-20 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / O café é uma das culturas de maior valor econômico mundial, além de proporcionar e qualidade de vida para milhões de pessoas em países em desenvolvimento. Embora existam vários programas de melhoramento para essa cultura e cultivares comerciais disponíveis que apresentam fatores de resistência a estresse biótico, verifica-se ainda prejuízos significativos devidos à ferrugem do cafeeiro causada por Hemileia vastatrix. A compreensão dos mecanismos moleculares da resistência à ferrugem desempenha papel importante na eficiência do desenvolvimento de novas cultivares resistentes. O objetivo do presente trabalho é identificar, caracterizar e compreender os padrões de expressão de genes de resistência do cafeeiro que são ativados após inoculação com H. vastatrix. Foi utilizada a metodologia de Hibridação Subtrativa de Supressão (HSS) para identificar os genes diferencialmente expressos (upregulated e dowregulated) às 12 e 24 horas após inoculação (h.a.i.) de Coffea arabica com o patógeno, em interações compatíveis e incompatíveis. A partir de 433 clones obtidos e sequenciados, 352 foram anotados e categorizados. Observou-se proporção relativamente menor de genes expressos em interação compatível. A análise RT-qPCR de sete genes de sinalização de resistência mostrou padrões de expressão semelhantes para a maioria dos genes em ambas as interações, indicando que esses genes estão envolvidos na resistência (não específica) durante a qual as reações imunes são semelhantes. Na segunda etapa do trabalho, resistance gene analogs (RGAs), que conferem resistência à ferrugem do café, foram identificados, sequenciados e caracterizados a partir de uma biblioteca BAC do cafeeiro. Cinco RGAs foram anotados e mapeados no cromossomo 0 (zero) de C. canephora. Destes, quatro RGAs são ativados na interação incompatível entre C. arabica e H. vastatrix. Os resultados obtidos no trabalho sugerem que um desses genes RGA sequenciado (gene 11) é um novo gene S H (S H 10) ainda não identificado biologicamente. Com base nesses dados, foi verificado pela primeira vez o novo gene S H (S H 10) no clone diferenciador 644/18 H. Kawisari. Foi realizado a análise comparativa entre os cincos RGAs e verificado alta similaridade entre dois destes, os quais são pertencentes à família de genes CC-NBS-LRR. Foi verificado intensa seleção diversificada promovida pela substituição não sinônima e pela recombinação genética. Foi realizada a análise filogenética de genes ortólogos para as espécies de café, tomate e uva e observou-se alta variabilidade intraespecífica destes dois genes CC-NBS-LRR para as espécies, exceto para o café. Estes genes sequenciados são as maiores e mais completas sequências disponíveis para o C. arabica. Estes resultados são de extrema importância para o melhoramento genético molecular visando a resistência à ferrugem do cafeeiro. De modo geral, a compreensão dos padrões de expressão de genes de resistência e a caracterização molecular de novos RGAs são resultados valiosos e estabelece nova base para estudos futuros. / Coffee is one of the most valued cash crops making the economies of many developing countries and sustaining the livelihoods of millions around the world. Despite many decades of breeding efforts with great achievements in incorporating resistance components into elite cultivars, coffee leaf rust (caused by Hemileia vastatrix) is increasingly damaging coffee production. Understanding the molecular mechanisms of rust resistance is believed to play a vital part in enhancing resistant cultivar development. The objective of the present work is to understand the expression patterns of resistance genes activated following pathogen inoculation and characterize some major resistance genes. Suppression subtractive hybridization (SSH) was used to identify genes differentially over expressed and repressed at 12 and 24 hours after pathogen inoculation during incompatible and compatible interactions between C. arabica and H. vastatrix. From 433 clones of expressed sequence tags (ESTs) sequenced, 352 were annotated and categorized of which the proportion of genes expressed during compatible interaction were relatively smaller. RT-qPCR analysis of seven resistance-signaling genes showed similar expression patterns for most of the genes in both interactions, indicating these genes are involved in basal (non-specific) defense during which immune reactions are similar. In another experiment, resistance gene analogs (RGAs) conferring coffee rust resistance were identified from a BAC library, sequenced and characterized. Five RGAs were annotated and mapped to chromosome 0 of C. canephora. Four of the RGAs are actively expressed during C. arabica-H. vastatrix incompatible interaction. The result obtained in this work suggests that one of the RGAs sequenced (gene 11) is a new S H gene (S H 10) not yet identified biologically. We also report an S H gene (S H 10) in differential host clone 644/18 H. Kawisari for the first time. Moreover, comparative analysis of two RGAs belonging to the CC-NBS-LRR gene family showed intense diversifying selection due to nonsynonymous substitution and genetic recombination. Phylogenetic analysis of orthologous genes showed high interaspecies variability among the two genes in related species than in coffee. Overall, differential gene expression analysis provided a compiled expression profile of genes upregulated and downregulated at 12 and 24 h. a. i. during incompatible and compatible interactions. Likewise, the NBS- LRR genes sequenced in this work are the largest and most complete gene reported in Arabica coffee to date, which makes the work extremely important for molecular breeding of coffee rust resistance.
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Comportamento de cultivares de café arábica com e sem irrigação nas regiões das montanhas do Estado do Espiríto Santo / Behavior of cultivars of arabica coffee with and without irrigation in regions of the mountains of the state Espírito SantoTeixeira, Ariany das Graças 30 July 2014 (has links)
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Ariany das Gracas Teixeira.pdf: 931202 bytes, checksum: 9c4f10836190f845a454ac9873614ba5 (MD5) / Approved for entry into archive by Patricia Barros (patricia.barros@ufes.br) on 2016-07-11T18:48:32Z (GMT) No. of bitstreams: 2
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Ariany das Gracas Teixeira.pdf: 931202 bytes, checksum: 9c4f10836190f845a454ac9873614ba5 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-07-11T18:48:32Z (GMT). No. of bitstreams: 2
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Ariany das Gracas Teixeira.pdf: 931202 bytes, checksum: 9c4f10836190f845a454ac9873614ba5 (MD5) / CAPES / O estado do Espírito Santo se destaca por ser o terceiro maior produtor de Coffea arabica L., sendo seu cultivo predominantemente realizado em grande parte por agricultores familiares. Em algumas situações a baixa produtividade está relacionada ao déficit hídrico. Diversos estudos têm demonstrado a importância da irrigação para o incremento da produtividade, bem como para a melhoria da qualidade do café. Objetivou-se com esse estudo, avaliar o comportamento de quatro cultivares de cafeeiro arábica sob os sistemas de irrigação por aspersão e microjet. Foram conduzidos no Instituto Capixaba de Pesquisa, Assistência Técnica e Extensão Rural (INCAPER) dois experimentos para cada uma das quatro cultivares, um no sistema de irrigação convencional e o outro sistema de irrigação localizada microjet, em esquema de parcelas subdivididas 2 x 4, sendo as parcelas representadas pela irrigação em dois níveis (irrigado e não irrigado) e as subparcelas, pelas cultivares Catuaí Amarelo IAC 86, Rubi MG 1192, Paraíso MG 419-1 e Obatã IAC 1669 20, em um delineamento em blocos casualizados com quatro repetições, sendo cinco plantas por parcela. De acordo com os resultados obtidos, o cafeeiro apresentou produtividade acentuada para os sistemas de cultivo. Os resultados foram comparados em nível de 5% de probabilidade, pelo teste “t” de Student para as variáveis vegetativas, produtivas e parâmetros de qualidade. Para as características
vegetativas como altura da planta, número de ramos produtivos e número de rosetas por ramos não foram verificadas diferenças significativas para os sistemas de irrigação (localizada microjet e aspersão). Dessa forma, os resultados podem ter sido influenciados pelos altos índices pluviométricos ocorridos na região, induzindo semelhança entre os cultivos nos sistemas. / The Espírito Santo state stands out for being the third largest producer of Coffea arabica L., and its cultivation predominantly done largely by farmers. In some situations the low productivity is related to water deficit. Several studies have demonstrated the importance of irrigation to increase productivity and to improve the quality of coffee. Several studies have been demonstrating the importance of irrigation to increase productivity and to improve the quality of coffee. The objective with this study was to evaluate the behavior of four cultivars of Arabica coffee systems under sprinkler and microjet irrigation. Were conducted at Instituto Capixaba de Pesquisa Assistência Técnica e Extensão Rural Two experiments for each of the four cultivars, one of the conventional irrigation system and another microjet irrigation system located in split plot layout 2 x 4, being in the plots in two irrigation levels (irrigated and non-irrigated) and cultivars (Catuaí Amarelo IAC 86,Rubi MG 1192, Paraíso MG 419-1 and Obatã IAC 1669 20) as subplot a randomized block design with four replications, five plants per plot. According to the results, the coffee showed an increased productivity for cropping systems, though not differing from the non-irrigated and irrigated system. The results were compared to the 5% level of probability, the "t" of student for the vegetative, productive and quality parameters variables. For vegetative traits as plant height, number of branches and number of rosettes by branches no significant differences for the irrigation system were verified microjet located, but also to the sprinkler irrigation system. Thus allow the results justify due to heavy rainfall in the area similarity between systems.
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Ácaro da mancha-anular do cafeeiro: controle em função da cobertura pela calda com ramais e volumes de aplicaçãoFernandes, Ana Paula [UNESP] 28 May 2008 (has links) (PDF)
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fernandes_ap_me_jabo.pdf: 367474 bytes, checksum: 6a94f715c2d4b5c0796d7e1ce3925f73 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / A cultura do café (Coffea arabica L.) é de grande importância para a economia do Brasil, que é o maior produtor mundial de café, exportando 1,44 milhão de tonelada por ano. Dentre as pragas de importância na cultura está o ácaro Brevipalpus phoencicis, relatado em cafeeiros desde a década de 1950, sendo relacionado posteriormente com a doença mancha-anular, como vetor do vírus. Esta praga, devido à sua biologia e comportamento na planta, não é atingida facilmente pelas pulverizações, exigindo estudos e critérios na tecnologia de aplicação empregada. O presente trabalho teve como objetivo avaliar a mortalidade de B. phoenicis em função da cobertura proporcionada pela calda aplicada em plantas de café, com dois tipos de ramais utilizados em pulverizadores de jato transportado e quatro volumes de aplicação. O experimento foi realizado em área de plantio comercial do café, no município de Altinópolis-SP, onde foram avaliados os efeitos do acaricida no controle do ácaro. Foi realizada uma aplicação com pulverizadores montados no terceiro ponto do trator, equipados com dois diferentes ramais de bicos, utilizando pontas de cerâmica da série JA. Os tratamentos utilizados foram a aplicação do acaricida abamectina, nos volumes de 250, 400, 550 e 700 L/ha, com dois ramais de bicos, totalizando 36 parcelas experimentais. Foram avaliadas a mortalidade do ácaro, a deposição e a cobertura da calda nas plantas de café. O delineamento experimental utilizado foi em blocos casualizados, com oito tratamentos mais uma testemunha e quatro repetições. A análise estatística foi feita no esquema fatorial 2x4+1 (2 ramais de bicos, 4 volumes de aplicação e uma testemunha). Verificou-se que não houve diferença significativa na análise estatística para o número de ácaros encontrados. Para os resultados de deposição, observa-se um aumento da deposição... / The crop of coffee (Coffea arabica L.) has been economically important in Brazil which is the biggest world producer, exporting 1.43 million ton per year. Among the important pests in the culture is the mite Brevipalpus phoencicis, reported in coffee since 1950’s, which was associated to the ring-spot disease as a virus vector. Due to the behavior of the pest and plant configuration this mite is not reached by spraying on the plant that needs establishment of the criteria for the pesticide application. The aim of the present study was to evaluate the mortality of B. phoenicis due obtained by coverage spray liquid applied on coffee plants, with two types of branches used in air assisted sprayers and of volumes from application. The experiment was carried out in area of commercial field of coffee, in Altinópolis-SP-Brazil, where the effect of the mitecide on the control of the mite had been evaluated. An application with two branches of mounted sprayers was carried out, using ceramics nozzles model JA. The treatments were the application of the mitecide abamectin, in the volumes of 250, 400, 550 and 700 L per hectare, with two branches of nozzles, totalizing 36 experimental plots. The mortality of the mite, the deposition and the coverage by spray liquid on the coffee plants had been evaluated. The experimental delineation was as randomized blocks, with eight treatments plus a check plot in four replications. The statistical analysis was in the factorial scheme 2x4+1 (2 branches of nozzles, 4 volumes of application and a check). It was no significant difference in the statistical analysis for the number of found mites. We verified an increase of deposition due the volume of application, and the top of the plants had more deposition of spray liquid. The average of efficiency for the branch duplicate was bigger (70%) than the conventional branch (50%). We concluded that the efficiency... (Complete abstract click electronic access below)
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Utilização de água residuária do processo pós-colheita do café na produção de mudas de cafeeiroMelo, Augusto Cezar de Paula e [UNESP] 13 November 2009 (has links) (PDF)
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melo_acp_me_botfca.pdf: 437778 bytes, checksum: 2372225da8d6329e86e606d6cdcf5979 (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Universidade Estadual Paulista (UNESP) / Com o intuito de alcançar maiores produtividades de café, cafeicultores começaram, a partir da década de 80, a fazer uso do processamento pós-colheita de café, a fim de garantirem uma qualidade superior de seu produto. Porém, com o processamento, houve o surgimento de outro problema a água residuária de café (ARC) que passou a contaminar rios, ribeirões, solos, lençol freático, etc. Este trabalho teve como objetivo utilizar a ARC na produção de mudas de café verificando sua viabilidade e a capacidade de a ARC em suprir as necessidades das mudas com relação ao potássio, quando estas não recebem cloreto de potássio no solo utilizado. O trabalho foi desenvolvido na Faculdade de Ciências Agronômicas – UNESP, Botucatu – SP em uma casa de vegetação localizada no Departamento de Engenharia Rural, consistiu de 10 tratamentos em um fatorial 5x2 (5 proporções de água residuária de processamento pós-colheita do café – 0%, 25%, 50%, 75% e 100% - e presença ou ausência de cloreto de potássio no solo utilizadoo), com 4 repetições dispostos em delineamento inteiramente casualizados. A ARC foi aplicada a cada 48 horas com uma lâmina de 10 mm. Após 6 meses, foram avaliadas características vegetativas das plantas e características químicas do solo e das plantas. Constatou-se que os tratamentos com a presença de cloreto de potássio foram estatisticamente inferiores aos tratamentos que não apresentavam KCl em seu solo quanto às características vegetativas. Com o aumento das proporções de água residuária, houve um decréscimo nas características vegetativas, porém um acréscimo nas características químicas do solo. Além disso, os tratamentos sem a presença de KCl e com 0% e 25% de água residuária de café foram estatisticamente iguais, mostrando a viabilidade no uso da ARC na produção... / Intending to achieve better results on coffee production, the coffee producers began, since the 80s to process the coffee post harvest, in order to ensure product´s superior quality. But, with the processing, other problem appeared, the coffee wastewater (ARC – água residuária de café), which start the contamination of rivers, creeks, soil, water tables etc. This paper had as main objective to use the ARC on the coffee plants´ production verifying its viability and to verify if the ARC is able to supply the coffee needs relating to potassium when these don’t receive potassium chloride in the composition. The work was developed at Faculdade de Ciências Agronômicas – UNESP, Botucatu – SP in a greenhouse located at Departamento de Engenharia Rural. The work consisted of 10 treatments on a 5x2 factorial (5 wastewater proportions of coffee after the harvest processing - 0%, 25%, 50%, 75% and 100% – and potassium chloride presence or absence in the soil), with 4 repetitions made in delineation entirely design. The ARC was applied each 48 hours with a blade of 10 mm. After 6 months, the plants vegetative characteristic had been evaluated as well the chemical characteristics of the soil and of the plants. We observed that the treatments with potassium chloride presence had been statistically inferior to the treatments which did not present KCl in its soil related the vegetative characteristics. Moreover, with the increase of the wastewater proportions, it happened a decrease in the vegetative characteristics, however an addition in the chemical characteristics of the soil. Also, the treatments without KCl presence and with 0% and 25% of coffee wastewater had been statistically equal, showing the viability in the use of the ARC in the production of coffee plants, since the soil does not contain KCl and that the water used in the soil was a mixture of 25% of ARC with 75% of common water.
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Parâmetros fitométricos e produtivos do cafeeiro irrigado e submetido a doses de nitrogênio na Região de Garanhus / Productive parameters of the coffee plant submitted to doses of nitrogen in the area of GaranhusQUINTELA, Matheus Pires 20 February 2009 (has links)
Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2016-10-10T18:33:14Z
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Matheus Pires Quintela.pdf: 1146107 bytes, checksum: 2985401ec5abd3736c5ef1504c4140f5 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-10-10T18:33:14Z (GMT). No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 2009-02-20 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The coffee practiced in Pernambuco, today, occupies an area of 8 hectares distributed between the Mata Norte (500 ha) and 40 towns of the Wasteland (7.5 thousand hectares). Among the major producing towns stand out Taquaritinga do Norte, Garanhuns, Bom Conselho, Belo Jardim, Brejão and Triunfo. These areas are produced a volume of coffee that correspond only 23% of the state of Pernambuco. This is possibly due to the lack of actions in the past when the coffee Northeastern hadn’t incentives to plantations technically managed or specific experimental work. However, observed the importance of coffee to the State of Pernambuco, which comes to move an annual amount from R$ 8.5 million, becoming so the second largest coffee producer in the Northeast, losing only to Bahia. The development and productivity of the coffee crop are affected by several factors, among them water, that little or in excess, contributes to the reduction in crop income. Addition of water, another aspect to be observed, and that is of extreme importance, concerns the status of the plant. Thus, to there is an enhancement in the development of culture is necessary to do these all the essential nutrients and they are available in the soil solution to be fully absorbed. In this context, nitrogen is important for being highly demanded by the coffee since the beginning of its development until the time of full production, the nutrient is essential for significant increases in the crop income. After these arguments, it was aimed at by this work: evaluate the parameters phytometric of Arabic coffee (Coffea arabica L.) irrigated and submitted to nitrogen at different phenological stages; evaluate the relationship between production and nitrogen application in determining the best dose be recommended; define the critical strips of nitrogen in the coffee plant for the phases phenological; determine the amount ofnitrogen that is exported by fruits. The experiment was driven in a coffee plantation irrigated orchard 5 years old, located in Garanhuns-PE. The experimental design was completely used with six treatments (doses of nitrogen: 0, 100, 200, 300, 400 and500 kg ha-1) and four repetitions, totaling twenty-four plants that resulting data were analyzed of variance and regression at 5% significance level. In conclusion, it was determined that the treatments used in the experiment did not explain variations in the parameters phytometric (height and area index to foliate) Coffea arabica L. var. Catuaí. The productivity with the maximum economic efficiency for the coffee was of 54 bags for hectare of benefited coffee for an application of 196.43 kg ha-1 of nitrogen to the soil, which represented a 41.85% reduction in fertilizer nitrogen for maximum productivity. The critical nitrogen ranged from phenological stage of grain filling for the phenological stage of maturation, and their values, from 25.72 to 27.19 g kg-1 and 29.24 to 29.6 g kg-1. The dose of applied nitrogen to the soil that provided the largest removal of that element for the fruits was the one of 328,62 kg ha-1, where it was verified that in a hectare was removed by the production 204,31 kilograms of nitrogen. / A cafeicultura praticada em Pernambuco, hoje, ocupa uma área de 8 mil hectares distribuídas entre a Mata Norte (500 ha) e 40 municípios do Agreste (7,5 mil ha). Dentre as principais cidades produtoras destacam-se Taquaritinga do Norte, Garanhuns, Bom Conselho, Belo Jardim, Brejão e Triunfo. Dessas áreas são produzidos um volume de café que atende apenas a 23% da demanda do Estado de Pernambuco. Isso se deve, possivelmente, à falta de ações no passado em que a cafeicultura nordestina não contou com incentivos a plantios tecnicamente conduzidos ou com trabalhos experimentais específicos. Apesar disso, nota-se a importância da cafeicultura para o Estado de Pernambuco, que chega a movimentar anualmente um montante de R$ 8,5 milhões, tornando-se, portanto, o segundo maior produtor de café do Nordeste, perdendo apenas para a Bahia. O desenvolvimento e a produtividade da cultura do cafeeiro são afetados por diversos fatores, dentre eles, a água, que escassa ou em excesso, contribui para a diminuição do rendimento da cultura. Além da água, um outro aspecto a ser observado, e que é de suma importância, refere-se ao estado nutricional da planta. Dessa forma, para que haja umapotencialização no desenvolvimento da cultura é necessário que se façam presentes todos os nutrientes essenciais e que estes estejam disponíveis na solução do solo para serem plenamente absorvidos. Nesse contexto, o nitrogênio se destaca por ser altamente exigido pelo cafeeiro, desde o início de seu desenvolvimento até a época de plena produção, sendo o nutriente indispensável para aumentos significativos de produtividade da cultura. Diante desses argumentos, objetivou-se: avaliar os parâmetros fitométricos do café arábica (Coffea arabica L.) irrigado e submetido a doses de nitrogênio em diferentes fases fenológicas; avaliar a relação existente entre produção e adubação nitrogenada na determinação da melhor dose a ser recomendada;definir as faixas críticas de nitrogênio no cafeeiro para as fases fenológicas; Determinar a quantidade de nitrogênio que foi exportado pelos frutos. O experimento foi conduzido em um cafezal irrigado de 5 anos de idade, localizado em Garanhuns-PE. O delineamento experimental utilizado foi o inteiramente casualizado com seis tratamentos (doses de nitrogênio: 0, 100, 200, 300, 400 e 500 kg ha-1) e quatro repetições, totalizando vinte e quatro plantas, onde os dados resultantes foram submetidos à análise de variância e regressão ao nível 5% de significância. Como conclusões, foi possível determinar que os tratamentos usados no experimento não explicaram as variações nos parâmetros fitométricos (altura e índice de área foliar) do Coffea arabica L. var. Catuaí. A produtividade que proporcionou a máxima eficiência econômica para o cafeeiro foi a de 54 sacas por hectare de café beneficiado para uma aplicação de 196,43 kg ha-1 de nitrogênio ao solo, o que representou uma redução de 41,85% em adubação nitrogenada em relação à produtividade máxima. A faixa crítica do nitrogênio variou da fase fenológica de granação para a fase fenológica de maturação, tendo os respectivos valores, 25,72 a 27,19 g kg-1 e 29,24 a 29,60 g kg-1. A dose de nitrogênio aplicado ao solo queproporcionou a maior remoção desse elemento pelos frutos foi a de 328,62 kg ha-1, onde se constatou que em um hectare foi retirado pela produção 204,31 quilogramas de nitrogênio.
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Atividade antioxidante de extratos de café verde biotransformado pelo fungo Aspergillus oryzaePalmieri, Miguel Gontijo Siqueira 03 February 2017 (has links)
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Previous issue date: 2017-02-03 / O café verde é conhecido principalmente por suas propriedades antioxidantes e antibacterianas. Compostos fenólicos como os ácidos clorogênicos, que são formados através de ácidos hidroxicinâmicos (ácidos cafeico, ferúlico e outros) ligados ao ácido quínico, estão presentes em grandes quantidades e têm sido reconhecidos como antioxidantes naturais. Entretanto, os ácidos hidroxicinâmicos são encontrados principalmente na forma esterificada com ácidos orgânicos, açúcares, lipídeos e covalentemente ligados a parede celular, o que reduz sua biodisponibilidade. Diante disso, o objetivo deste estudo foi realizar a biotransformação da farinha de café verde utilizando o fungo Aspergillus oryzae (CCDCA102604) visando o aumento da atividade antioxidante. A farinha de café verde foi fermentada em estado sólido usando o fungo Aspergillus oryzae a 25 °C por 24, 48 e 72 horas. Após a fermentação os compostos fenólicos foram extraídos utilizando uma solução hidroetanólica. A atividade antioxidante dos extratos foi avaliada pelos métodos DPIDI-1• (2,2-difenil-1-picril-hidrazila) e poder redutor e a determinação dos teores de fenólicos totais foi realizada utilizando o método de Folin-ciocateu. Foi realizada também a quantificação de ácido clorogênico (5-ACQ), ácido cafeico e cafeína nos extratos utilizando a cromatografia líquida de alta eficiência. De acordo com os resultados ocorreu um aumento significativo de 115,7% e 66,4% da atividade antioxidante dos extratos de farinha de café verde fermentados por 24 horas em relação ao extrato de café não fermentado, determinada pelos métodos DPPI-1• e poder redutor, respectivamente. Além disso, o processo de fermentação pelo fungo A. oryzae durante 24 horas também promoveu um aumento de 68,6% na concentração de compostos fenólicos em relação aos extratos não fermentados. Os extratos fermentados por 24 horas apresentaram um aumento significativo nos teores de ácido clorogênico e ácido cafeico quando comparados aos extratos não biotransformados. O aumento da atividade antioxidante não foi observado nos extratos fermentados por 48 e 72 horas. Os resultados deste estudo demostraram que o processo de biotransformação é uma estratégia para a obtenção de um extrato enriquecido de compostos antioxidantes em suas formas livres com potencial aplicação nas indústrias alimentícias, de suplementos alimentares e cosmética. / Green coffee is known mainly for its antioxidant and antibacterial properties. Phenolic compounds such as chlorogenic acids, which are formed through hydroxycinnamic acids (caffeic, ferulic and other acids) linked to quinic acid, are present in large quantities in green coffee and have been recognized as natural antioxidants. However, hydroxycinnamic acids are found mainly in the esterified form with organic acids, sugars, lipids and are covalently bound to the cell wall, which reduces their bioavailability. Therefore, the objective of this study was to perform the biotransformation of the green coffee flour using the Aspergillus oryzae fungus aimed at increasing the antioxidant activity. The green coffee flour was fermented in solid state using the fungus Aspergillus oryzae (CCDCA102604) at 25 °C for 24, 48 and 72 hours and after fermentation the phenolic compounds were extracted using a hydroethanolic solution. The antioxidant activity of the extracts was evaluated by the DPPH• and reducing power methods, and the determination of total phenolic contents was performed using Folin-ciocateu method. Quantification of chlorogenic acid (5-ACQ), caffeic acid and caffeine in the extracts was also performed using high performance liquid chromatography. The results showed a significant increase of 115.7% and 66.4% of the antioxidant activity of the green coffee flour extracts fermented for 24 hours in relation to the unfermented coffee extract, measured by the DPPI-1• and reducing power methods, respectively. In addition, the fermentation process by the A. oryzae fungus for 24 hours also promoted a 68.6% increase in the content of phenolic compounds in relation to the unfermented extracts. The extracts fermented for 24 hours showed an increase in the content of chlorogenic acid and caffeic acid when compared to the non-biotransformed extracts. The increase in antioxidant activity was not observed in the extracts fermented for 48 and 72 hours. The results of this study showed the biotransformation process as a strategy to obtain an enriched extract of antioxidant compounds in their free forms with potential application in the food, supplementation and cosmetic industries.
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Uso de composto de res?duo da ind?stria t?xtil e adubo organomineral em mudas e no crescimento inicial do cafeeiro / Coffee young plant production from organo-mineral fertilizer and composting of waste textile industryNeiva J?nior, Eudes 14 April 2016 (has links)
?rea de concentra??o: Produ??o Vegetal. / Submitted by Jos? Henrique Henrique (jose.neves@ufvjm.edu.br) on 2017-01-04T12:33:11Z
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Previous issue date: 2016 / Funda??o de Amparo ? pesquisa do Estado de Minas Gerias (FAPEMIG) / A aduba??o do cafeeiro, com fertilizantes minerais, comp?e um dos principais custeadores da produ??o. Al?m disso, o uso intensivo desses insumos pode contribuir para a insustentabilidade da atividade. Nesse sentido, buscar alternativas ? aduba??o convencional ? t?tica indicada atualmente. Por esse motivo, buscou-se com o trabalho avaliar a produ??o de mudas e plantas jovens de cafeeiro quanto ? fertiliza??o com composto org?nico advindo de res?duo de ind?stria t?xtil e com fertilizantes organominerais. Foram realizados dois estudos, onde no primeiro avaliou-se o crescimento de mudas de caf? ar?bica em substrato contendo uma mistura de solo e res?duos da ind?stria t?xtil, nas doses (0, 4, 8, 16 e 32%). As plantas foram avaliadas quanto ao crescimento, ac?mulo de biomassa e teor de nutrientes, nas fases de produ??o de mudas e desenvolvimento das plantas jovens. No segundo experimento, as plantas foram avaliadas ap?s cultivo em diferentes substratos: sem fertiliza??o, aduba??o convencional, mineral, org?nica e tratamentos com dosagens de organominerais peletizados. Foram avaliados atributos de crescimento e ac?mulo de biomassa. Para o primeiro experimento, observou-se que a adi??o do composto org?nico produzido a partir de res?duo da ind?stria t?xtil, se mostrou inferior ao tratamento convencional (org?nico + mineral) para a produ??o de mudas e estabelecimento de plantas no campo. O aproveitamento de res?duos da ind?stria t?xtil na agricultura apresentou-se como uma solu??o tecnicamente vi?vel, devido sua elevada concentra??o de nutrientes minerais como pot?ssio, zinco e cobre, al?m da mat?ria org?nica. J? para o segundo experimento, a aduba??o convencional proporcionou plantas com maior crescimento e biomassa em rela??o ao organomineral. Quanto maior a concentra??o do organomineral, maiores s?o os benef?cios ?s plantas de caf?, dentro da faixa avaliada. / Disserta??o (Mestrado) ? Programa de P?s-Gradua??o em Produ??o Vegetal, Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri, 2016. / The fertilization of coffee with mineral fertilizers is a major component of the production cost. Moreover, the intensive use of these materials may contribute to the activity unsustainable. In this sense, seek alternatives to conventional fertilization is a currently indicated tactic. This study aimed to evaluate the production of seedlings and young coffee plants after fertilization with organic compost from textile industry waste and organo-mineral fertilizer. Two studies were performed. The first consisted of the cropping of Arabica coffee seedlings in substrate containing a mixture of soil and compost from textile industry waste as a function of concentration (4, 8, 16 and 32%). The plants were evaluated for growth, biomass accumulation and nutrient content at the stage of seedling production and development of young plants. In the second study, the plants were evaluated after cultivation on different substrates: without fertilization, conventional fertilization, mineral, organic and four organo-mineral treatments in pellets. Attributes of growth and biomass accumulation were evaluated. It was observed that the addition of organic compound, produced from textile industry waste, was inferior to conventional treatment for the production and establishment of coffee seedlings. The use of waste from the textile industry in agriculture appeared as a technically viable solution because of its high concentration of mineral nutrients such as potassium, zinc and copper, as well as organic matter. Conventional fertilization provided plants with higher growth and biomass in relation to organo-mineral. The higher the concentrations of the organo-mineral, the greater are the benefits for coffee plants within the measured range.
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Relação solo-relevo em áreas sob cultivo de café no sudoeste de Minas GeraisSanchez, Maria Gabriela Baracat [UNESP] 22 October 2009 (has links) (PDF)
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sanchez_mgb_me_jabo.pdf: 1221506 bytes, checksum: a068146637a79bdff63a05b39d8b62bd (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Os atributos físicos, químicos e de produção apresentam dependência espacial, e a distribuição dos mesmos é dependente do relevo. O mapeamento da distribuição espacial dos atributos físicos, químicos e de produtividade permite identificar zonas de manejo específico da cultura do café. O objetivo deste trabalho foi avaliar a variabilidade espacial dos atributos físicos, identificando e mapeando zona de manejo específico, para predizer a produtividade do café, com base nos atributos físicos e químicos do solo. O solo da área de estudo foi classificado como Latossolo Vermelho-Amarelo. A área produziu, exclusivamente, café nos últimos 18 anos e, atualmente, está plantada a variedade Coffea arabica (Catuaí), com espaçamento de 4,0 x 0,75 m. Na área escolhida, com representatividade fisiográfica regional, estabeleceu-se uma malha, com intervalos regulares de 50 m, perfazendo um total de 145 pontos nos 31,7 hectares. Em cada ponto do cruzamento desta malha, foram retiradas amostras de solo, nas profundidades de 0,0 - 0,20 m e 0,20 – 0,40 m, para a avaliação dos atributos físicos, granulométricos e químicos do solo. Uma unidade amostral composta por nove plantas foi construída em cada ponto amostral para a coleta dos atributos qualitativos e quantitativos do rendimento da cultura (produção, porcentagens de grãos nas peneiras 16; 17; 18 e do tipo de bebida). A área de estudo foi intensamente amostrada para a avaliação da espessura do solun, realizando tradagens profundas por meio das quais se estabeleceu o limite de 1,6 m para presença de cascalho, o que permitiu a divisão da área em dois compartimentos. Efetuou-se a análise estatística, geoestatística e multivariada para a análise dos dados. Todos os atributos físicos estudados, nas duas profundidades, apresentaram dependência espacial. Pequenas variações nas formas do relevo condicionaram variabilidade... / The physical, chemical and production attributes present spatial dependence and the distribution of the same ones is dependent of the relief. The mapping of the spatial distribution of the physical, chemical and productivity helps to identify areas of specific management of the coffee crop. The objective of this study work was to evaluate the space variability of the physical attributes identifying and mapping area of specific handing to predict the productivity of the coffee with base in the physical and chemical attributes of the soil. The soil of the study area was classified as Oxisol. The area produces exclusively coffee in the last 18 years, and is currently planted the variety Coffea Arabic (Catuaí) with spacing of 4.0 x 0.75 m. In the chosen area, with regional physiographic representativeness, a grid was established, with regular intervals of 50 m, making a total of 145 points on 31.7 hectares. In each point of the crossing of this grid, soil sample were taken in the depths of 0.0 - 0.20 m and 0.20 - 0.40 m, for the evaluation of physical, granulometric and chemical attributes. A sample unit consistes of nine plants were built at each sample point for collection of qualitative and quantitative attributes of yield (production, percentage of grain in the sieves 16, 17, 18 and the type of drink). The study area was intensively sampled to assess the thickness of solun, which established the limit of 1.6 m for the presence of gravel which allowed the division of the area into two compartments. Was made the statistical analysis, geostatistical and multivariate data analysis. All physical attributes studied at both depths, showed spatial dependence. Small variations in the forms of the relief conditioned differentiated variability of these attributes. The results of multivariate analysis showed that the study of variance of soil attributes can be summarized in the study of only a few ... (Complete abstract click access below)
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Atributos fenológicos, agronômicos e expressão gênica durante a frutificação do cafeeiro / Phenological and agronomic attributes and gene expression during the fruit development of the coffee treeGaspari-Pezzopane, Cristiana de 31 January 2008 (has links)
As características relacionadas à frutificação do cafeeiro são altamente influenciadas pelo ambiente. Portanto, a associação de análises agronômicas, fenológicas e genômicas são necessárias para o entendimento desse processo. Esses estudos fazem parte do programa de melhoramento genético do café, com o objetivo de obter plantas com maior uniformidade de maturação, duração de ciclo e bebidas específicas. Nesse contexto, os objetivos desse trabalho foram estabelecer padrões agronômicos e fenológicos comparativos entre diferentes cultivares e safras de café, caracterizar genes diferencialmente expressos durante o desenvolvimento dos frutos de cafeeiro arábica e correlacionar genes diferencialmente expressos com atributos fenológicos e agronômicos. Os estudos foram realizados no Centro de Café do IAC em Campinas, SP. As cultivares de Coffea arabica utilizadas foram: Mundo Novo, Catuaí Vermelho, Icatu Vermelho, Obatã e Icatu Precoce, nas safras de 2004/2005 e 2005/2006. Os atributos fenológicos foram avaliados com base no desenvolvimento do ciclo fenológico e na porcentagem de frutos maduros na colheita. As avaliações agronômicas foram avaliadas baseadas nas características tecnológicas do produto como, produção e rendimento, tipos de sementes e tamanho dos grãos. A expressão gênica diferencial foi avaliada por método semi-quantitativo e quantitativo RT-PCR em todos os estádios de desenvolvimento dos frutos. Seqüências de genes específicos foram identificadas por buscas em bancos de dados do Programa Genoma Café e no Genbank, possibilitando a construção de oligonucleotídeos específicos para cada gene. Em geral, os resultados das análises confirmaram a influência ambiental no desenvolvimento dos frutos do cafeeiro, especialmente as variações hídricas e de temperatura. Diferenças significativas foram identificadas entre as cultivares, em relação aos atributos fenológicos e agronômicos, principalmente na safra 2005/2006 quando foi possível discriminar as cultivares quanto à duração do ciclo fenológico. A expressão gênica durante o desenvolvimento dos frutos, seguiu padrão similar entre as cultivares, mesmo comparando diferentes anos agrícolas. Conseqüentemente, essas análises permitiram a identificação de genes candidatos a serem usados como marcadores genéticos das fases de frutificação de C. arabica, como: crescimento (PAL, CHS e manB), transição do crescimento para o início da maturação (csp1, GLA e ER5), maturação e amadurecimento (CS, AAT, ACS, ACO, ETR e ICL) e transição da maturação para o amadurecimento (PAL). Esses genes marcadores em associação com atributos agronômicos e fenológicos, podem ser utilizados como parâmetros moleculares para a definição de estádios adequados à colheita, assegurando composição final específica dos frutos e da qualidade da bebida. / Coffee fruit development and ripening are biological processes largely influenced by environmental conditions. Therefore, the association of agronomic, phenologic and genomic analyses is necessary for a broad comprehension of these processes. This type of approach is already part of coffee breeding programs, which aimed the development of coffee cultivars bearing maturation uniformity, controlled life cycle and specific cup qualities. In this context, the main objectives of this dissertation are to establish comparative patterns of fruit ripening among different coffee cultivars, to characterize gene expression during fruit development, and to correlate possible differential gene expression with agronomic and phenologic traits. All investigations were performed at the experimental field of the Coffee Center/IAC, Campinas, SP. The Coffea arabica cultivars Mundo Novo, Catuaí Vermelho, Icatu Vermelho, Obatã and Icatu Precoce, years 2004/2005 and 2005/2006, were evaluated regarding phenologic cycle and percentage of cherry fruits at harvesting time. Agronomic traits evaluated included productivity and outturn, type of seeds and grain size. Differential gene expression was evaluated through semi-quantitative and quantitative RT-PCR, in all stages of fruit development. Sequences of selected genes were identified through blast searches in the database of the Coffee Genome EST Project and the Genbank, and used to design gene-specific primers. In general, analyzed results confirmed the environmental influence over fruit development, especially temperature variations during evaluated seasons. Significant differences were identified among cultivars regarding phenologic and agronomic traits, especially in the year 2005/2006 where life cycle duration allowed cultivar discrimination. Gene expression during fruit development followed a similar pattern among evaluated cultivars, even when comparing different harvesting years. Therefore, these patterns allowed the identification of candidate genes for use as genetic markers of C. arabica fruit development phases, such as growing (PAL, CHS and manB), transition from growing to maturation (csp1, GLA, ER), maturation and ripening (CS, AAT, ACS, ACO, ETR, ICL) and transition from maturation to ripening (PAL). These gene-markers, in association with agronomic and phenological traits, may be used as molecular parameters for the definition of best colleting stage, ensuring specific final coffee fruit composition and cup quality.
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Forest and landscape restoration at Pontal do Paranapanema: ecological attributes of forest restoration in a coffee agroforestry system / Restauração da paisagem florestal no Pontal do Paranapanema: indicadores ecológicos em sistemas agroflorestais com café sombreadoBadari, Carolina Giudice 12 February 2019 (has links)
A direct consequence of disorganized human population growth and the indiscriminate use of natural resources are the reduction of area and the fragmentation of native ecosystems, as they transform into agricultural areas. In this scenario, agroforestry systems (AFS) may be an alternative to reconcile restoration, conservation and local agricultural production. However, there is a diversity of AFS, and its use as a forest restoration strategy is still uncertain, mainly because we lack evaluations based on ecological indicators from those systems. Thus, we compared ecological indicators measured in a coffee agroforestry system in the Pontal do Paranapanema with those inform conventional restoration plantings of the same age and with regional reference ecosystems. We measured natural regeneration density and richness; canopy cover by native species and aboveground biomass and compared among sites using an ANOVA, followed by Tukey\'s test for mean comparison. Aiming to understand the factors influencing the ecological indicators of forest restoration in coffee AFS, we performed generalized linear models (GLM) using density of coffee and native trees, biomass, percentage of animal-dispersed trees, distance to the nearest forest remnant and richness of tree species as predictor variables and percentage of canopy cover and density and richness of natural regeneration as response variables. The reference forests had the highest values for forest structure indicators, followed by AFS and finally by the conventional restoration plantings. However, we found a greater diversity of tree species planted in the AFS and a natural regeneration similar to that found in the reference ecosystems. Despite coffee density in the AFS negatively influencing natural regeneration, the coffee AFS had greater ecological performance than the conventional restoration, being a viable alternative for forest restoration. We conclude that AFS with coffee and native tree species play an important ecological role in the FLR in Pontal do Paranapanema, reconciling productivity with forest restoration. / Um reflexo direto do crescimento desordenado da população humana e das atividades antrópicas é a diminuição e a fragmentação da área ocupada por ecossistemas nativos e sua substituição por áreas agrícolas. Neste cenário, os sistemas agroflorestais (SAF) podem ser uma alternativa para conciliar restauração, conservação e produção agrícola local. No entanto, tendo em vista a diversidade de SAFs, sua adoção como estratégia de restauração florestal ainda carece de estudos que avaliem os níveis de indicadores ecológicos de cada sistema. Neste sentido, comparamos os indicadores ecológicos de sistemas agroflorestais com café e espécies arbóreas nativas no Pontal do Paranapanema, com os de plantios convencionais de restauração florestal de mesma idade (12-15 anos) e ecossistemas de referência regionais. Medimos a densidade e a riqueza da regeneração natural, a cobertura do solo por espécies nativas e a biomassa acima do solo e as comparamos entre as áreas pela análise de variância ANOVA seguida da comparação de médias pelo teste de Tukey. Buscando compreender os fatores que influenciam os indicadores ecológicos da restauração florestal no SAF, analisamos modelos lineares generalizados, tendo biomassa, porcentagem de árvores zoocóricas, distância do remanescente florestal mais próximo, densidades de café, riqueza e densidade de árvores nativas como variáveis preditoras, e porcentagem de cobertura do dossel, densidade e riqueza da regeneração natural como variáveis respostas. As florestas de referência tiveram os maiores valores para indicadores de estrutura florestal, seguidas pelos SAFs e pelos plantios convencionais de restauração florestal. Entretanto, encontramos elevada diversidade de espécies arbóreas nos SAFs e valores próximos aos das florestas de referência para a diversidade da regeneração natural. Embora a densidade de plantas de café influencie negativamente a regeneração natural, os SAFs apresentaram um melhor desempenho ecológico que as áreas de restauração convencional, correspondendo à uma alternativa viável para restauração florestal. Desta forma, concluímos que os sistemas agroflorestais estudados desempenham um papel ecológico importante na restauração da paisagem florestal no Pontal do Paranapanema, conciliando produção com restauração florestal.
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