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Fenologia reprodutiva e produção de sementes de Jatropha curcas L. / Phenology reproductive and production seed Jatropha curcas L.Herzog, Neusa Francisca Michelon 08 November 2012 (has links)
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Previous issue date: 2012-11-08 / Pinhão-manso (Jatropha curcas L.) belonging to the Euphorbiaceae family from Americas has been disseminated in tropical and sub-tropical regions in the globe and also largely distributed in Asiatic and African continents. This specie has its seeds as the main way of spreading itself. Generally the reproductive material (seeds and fruit) is strongly influenced by the genitor plants, by the local climatic conditions that act on the development that comprises since the pollination process, the physiological maturity of the seed, to the plantation success. Due to its importance, this research aimed to characterize the flower and fruit production of the specie in an intercropped and monocultivation system, as well as to determine the production, the physical quality of the Jatropha curcas L. seeds, in Pato Bragado city in West of Paraná state. The study assessment period took 13 months and started in December 2010. The field experiment was set in areas of intercropped with Tifton and in a monocultivation system. The emission of floral buds and the flower and fruit abortion were weekly registered computing the formed fruit and quantifying the developed seeds. The number of locules was evaluated with formed seeds in fruitage, and some aspects related to the seeds were measured such as: the weight in grams, the length and the width in centimeters. The quality tests in the seeds were: germination in sand, germination speed index and tetrazolium test. The variance was analyzed by the Sisvar program, and the statistic difference between the average were compared by the Tukey test of 5% of error probability. The monocultivation favored the productivity. Four periods of flourishing were observed and the most expressive one occurred during the August to November period. The tendency to concentrate a bigger number of female flowers was noticed since the trees got older, and the most vigorous seed were produced during August to November period / O pinhão-manso (Jatropha curcas L.) pertencente à família Euphorbiaceae, é nativo das Américas, apresenta-se disseminado nas regiões tropicais e subtropicais do globo e amplamente distribuído nos continentes Asiático e Africano. Esta espécie tem as sementes como principal forma de dispersão. De modo geral, sabe-se que o material reprodutivo (sementes e frutos) é bastante influenciado pelas características das plantas genitoras, pelas condições climáticas do local em que atua sobre o desenvolvimento, que compreende desde a polinização, maturidade fisiológica da semente, ao sucesso do plantio. Dada a sua importância, esta pesquisa objetivou caracterizar a produção de flores e frutos da espécie, em cultivo consorciado e monocultivo, determinar a produção, a qualidade física e fisiológica das sementes de Jatropha curcas L., no município de Pato Bragado no Oeste do Paraná. O período das avaliações compreendeu 13 meses, tendo início em dezembro de 2010. O experimento à campo, foi realizado em áreas de cultivo consorciado com tifton e sistema de monocultivo. Semanalmente, a emissão de botões florais e abortamento de flores e frutos, foram anotados, computando os frutos formados, abortados e quantificando as sementes desenvolvidas. Em frutos, avaliou-se o número de lóculos com sementes formadas. Mensurou-se nas sementes: massa em gramas; comprimento e largura em centímetros. Os testes de qualidade em sementes foram: germinação em areia, índice de velocidade de germinação e teste de tetrazólio. Para a análise estatística, realizou-se análise de variância pelo programa Sisvar, no caso de diferença estatística entre as médias foram comparadas pelo teste de Tukey a 5% de probabilidade de erro. A monocultura favoreceu a produtividade. Foram observados quatro períodos de florescimento, sendo que o mais expressivo ocorreu no período de agosto a novembro. Houve tendência a concentrar maior número de flores femininas á medida que as árvores ficaram mais velhas. As sementes mais vigorosas, foram produzidas no período de agosto a novembro
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Produção de ciclodextrina glicosiltransferase pela bactéria alcalófila Bacillus circulans ATCC 21783 : cultivo em batelada, batelada alimentada e estado semi-sólido / Production of cyclodextrin glycosyltransferase by alkalophilic Bacillus circulans ATCC 21783 1 : Batch, fed-batch and solid state cultivationsPinto, Flávia Santos Twardowski January 2007 (has links)
A ciclodextrina glicosiltransferase [E.C. 2.4.1.19; CGTase] é uma enzima industrialmente importante, usada para produzir ciclodextrinas. Neste trabalho foi utilizado o planejamento experimental e a metodologia de superfície de resposta a fim de identificar as melhores condições para a produção de CGTase pela bactéria alcalófila Bacillus circulans. As melhores condições de temperatura e pH, para a produção de CGTase foram, respectivamente, 36 ºC e 9,7. Em seguida, utilizando estes parâmetros otimizados, a produção de CGTase foi avaliada em cultivos submersos, batelada e batelada alimentada, e em cultivo semi-sólido (CSS), usando um resíduo fibroso de soja (SIFR) como substrato. Nos cultivos em batelada, a atividade máxima de CGTase obtida foi de 1155 U.mL-1, em aerobiose. A produção de CGTase foi bastante influenciada pelo fluxo de ar e pela agitação, sendo que uma alta produtividade enzimática (155 U.(mLh)-1) foi obtida em condições de aeração moderada (400 rpm para a velocidade de agitação e 1,7 vvm para o fluxo de ar). Com estes parâmetros otimizados, a produtividade de CGTase obtida em cultivo em batelada alimentada foi de 137 U.(mLh)-1, com uma taxa de alimentação de 0,17 g.(Lh)-1. O crescimento celular e a síntese de CGTase, usando o resíduo fibroso de soja como substrato apresentou um rendimento de 32.776 U.g(SIFR) -1. As diferentes abordagens utilizadas neste trabalho poderão ser aplicadas para a produção de outras enzimas amilolíticas e também para a produção de CGTase com outros substratos. / Cyclodextrin glycosyltransferase [E.C. 2.4.1.19; CGTase] is an industrially important enzyme, which is used to produce cyclodextrins. In this study we report the use of experimental factorial design and response surface methodology to find the best conditions for CGTase production by alkaliphilic Bacillus circulans. The optimized calculated values for the tested variables were pH 9.7 and temperature 36oC. The CGTase production was further studied with the optimized process parameters on submerged cultivations (SC), batch or fedbatch, and solid-state cultivations (SSC) using soybean industrial fibrous residue (SIFR). The maximum CGTase activity obtained on batch cultivation was 1,155 U.mL-1 under aerobic conditions. The CGTase production was strongly affected by air flow rate and agitation speed, showing high enzyme productivity (155 U.mL-1h-1) under moderate conditions of aeration (400 rpm for speed agitation and 1.7 vvm for air flow rate). With these optimized process parameters, CGTase productivity obtained on fed-batch cultivations was 137 U.mL-1h-1, with feeding rate at 0.17 g.L-1h-1. Cell growth and CGTase synthesis in SSC using soybean industrial fibrous residue as substrate was excellent, with CGTase yield of 32,776 U.g(SIFR) -1. The different approaches used in this study may also find applications for the production of other starch-converting enzymes and also for other CGTase-producing substrates.
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Desenvolvimento de um modelo de simulação para análise de risco e viabilidade econômica da cafeicultura mineiraDUTRA, Tatiane Cristine 31 July 2017 (has links)
A cafeicultura constitui um dos setores mais dinâmicos da agricultura de Minas Gerais, tendo grande importância no cenário econômico, político e social do Estado. O café, além de ser destaque como um dos principais itens de exportação, evidencia- se também por ser geradora de grande número de empregos e fator de fixação de mão-de-obra no meio rural. Entretanto, a imprevisibilidade das variáveis climáticas, das condições de mercado e do produto, e a existência de pragas e doenças tornam o café uma das commodities mais voláteis do mercado. Logo, em razão da sua importância e dos inúmeros fatores que podem afetar este setor faz-se imprescindível esforços, estratégias, planejamento e políticas de apoio aos cafeicultores para perpetuação dos ganhos e sustentabilidade desta atividade.Deste modo, a criação de instrumentos tais como modelos de simulação de propriedades agrícolas são de grande valia, visto que estes possibilitam compreender e avaliar o impacto de alterações nos sistemas de produção e/ou manejo das lavouras, bem como os efeitos de alterações nas políticas públicas e de mercados agrícolas sobre as propriedades rurais, servindo como subsídio aos produtores e demais interessados. Assim sendo, o estudo em questão pretende desenvolver um modelo de Monte Carlo para a análise de risco e de viabilidade econômica da cafeicultura de Minas Gerais. Além do estudo por meio de indicadores de análise de viabilidade, tais como VPL, o presente estudo utilizou o método de simulação de Monte Carlo, o qual assegura diante de suas características a possibilidade de análise dos riscos deste projeto. O estudo foi realizado em dois cenários de preço – local e nacional – e, em cinco propriedades do Estado de Minas Gerais: Capelinha, Guaxupé, Manhumirim, Monte Carmelo e Santa Rita do Sapucaí. Os dados foram obtidos por meio de diversas fontes tais como CNA, CEPEA, MAPA e IBGE, sendo a TMA utilizada a de 8,5% ao ano. Os resultados apontam para a inviabilidade da implantação da atividade cafeeira na região de Minas Gerais nos dois cenários de preço, sendo Capelinha a região que apresenta piores valores de VPL e Manhumirim os melhores. Seguindo, uma segunda análise foi realizada retirando o custo de implantação tendo em vista a já existência de muitas propriedades na região e os resultados de inviabilidade observados, sendo explicitado ainda, a inviabilidade dessa atividade, apesar de melhoria nos resultados. Diante disso, foi realizado a análise de sensibilidade sobre algumas variáveis consideradas influenciadoras da rentabilidade, tais como custo, preço e produtividade, sendo, pois, constatado maior influência do variável custo sobre a rentabilidade da atividade cafeeira. Em vista disso, ressalta-se a urgência de adoção de práticas administrativas mais eficientes principalmente sobre o custo, partindo pela otimização dos recursos produtivos, pela utilização de mecanismos que minimizem os riscos de comercialização e também na busca pela ampliação da produtividade, a partir da adequada escolha e operacionalização de inovações tecnológicas. Além disso, o governo deve atuar de forma a propiciar melhor ambiente de atuação dessa atividade, bem como empregar políticas públicas assegurando e caucionando conhecimentos e ferramentas para melhoria na aplicação de técnicas de administração rural e inserção e monitoramento de tecnologia. A extensão rural e o crédito rural seriam alguma das opções. / Coffee cultivation is one of the most dynamic sectors of agriculture in Minas Gerais, having great importance in the economic, political and social scenario of the State. The coffee, besides being highlighted as one of the main export items, is also evidenced by the fact that it generates a great number of jobs and the is a factor of fixation of labor in the rural environment. However, the unpredictability of climatic variables, market conditions and product, and the existence of pests and diseases make coffee one of the most volatile commodities on the market. Therefore, because to its importance and the innumerable factors that can affect this sector, efforts, strategies, planning and policies to support coffee growers are essential, to perpetuate the gains and sustainability of this activity. Thus, the creation of instruments such as simulation models of agricultural properties are of great value since they make it possible to understand and evaluate the impact of changes in crop production and / or management systems, as well as the effects of changes in policies public and agricultural markets on rural properties, serving as a subsidy to producers and other stakeholders. Therefore, the study in question intends to develop a Monte Carlo model for the analysis of risk and economic viability of the coffee industry of Minas Gerais. In addition to the study through feasibility analysis indicators, such as NPV, the present study used the Monte Carlo simulation method, which ensures the possibility of analyzing the risks of this project in front of its characteristics. The study was carried out in two price scenarios - local and national - and in five properties in the State of Minas Gerais: Capelinha, Guaxupé, Manhumirim, Monte Carmelo and Santa Rita do Sapucaí. The data were obtained through several sources such as CNA, CEPEA, MAPA and IBGE, with TMA being used at 8.5% per year. The results point to non-viability of the implantation of the coffee activity in the region of Minas Gerais in the two price scenarios, Capelinha being the region that presents the worse values of VPL e and Manhumirim the best. Following, a second analysis was carried out taking out the cost of implantation in view of the existence of many properties in the region and the results of non-viability observed, being also shown the impossibility of this activity, despite improvement in results. Therefore, a sensitivity analysis was performed on some variables considered to be influencing profitability, such as cost, price and productivity,where was verified the influence of cost variable on the profitability of the coffee activity. In view of this, it is important to highlight the urgency of adopting more efficient administrative practices, mainly on cost, starting with the optimization of productive resources, the use of mechanisms that minimize the risks of commercialization and also the search for the increase of productivity, departing from the appropriate choice and operation of technological innovations. In addition, the government must act in order to provide a better environment for this activity, as well as to employ public policies ensuring and guaranteeing knowledge and tools for improvement in the application of techniques of rural administration and insertion to monitoring of technology. Rural extension and rural credit would be some of the options. / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES
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Cultivo do quiabeiro sob manejo org?nico no per?odo de outono-inverno, nas condi??es edafoclim?ticas da baixada fluminense / Cultivation of okra under organic management in the autumn-winter period, at edaphoclimatic conditions of Fluminense LowlandOLIVEIRA, Felipe Latini 25 March 2013 (has links)
Submitted by Jorge Silva (jorgelmsilva@ufrrj.br) on 2017-09-21T17:43:12Z
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Previous issue date: 2013-03-25 / This work aimed to study an organic production system of okra, grown during autumn-winter period, at the conditions of Fluminense Lowland. It was evaluated the effect of leaf spraying with liquid biofertilizer, obtained by fermented compost extract, and of dressing organic fertilization, in order to increase income for farmers of the region. The treatment were: okra (cv. Santa Cruz 47) sprayed or not with liquid biofertilizer, subjected to two doses of organic fertilization with castor cake (equivalent to 100 and 200 Kg of N-total ha-l), which were applied monthly or bimonthly, and started at 30 days after sowing. Okra was sown at double rows, with a spacing of 0.80 m inside the double row and 1.60 m between the double rows. Fruits were harvested with the size of 10 to 14 cm, according to the preference of national market. There were evaluated weight and number of produced fruits, as well as the yield estimated by the results of dry weight of fruits. Cv. Santa Cruz 47 is adapted to organic management, with mean yield of 16 Mg.ha-1. There were not detected significant differences among the evaluated treatments. This result indicates that the utilization of biofertilizer and the dressing fertilization applied monthly, in relation to bimonthly application, did not promote benefits to okra, according to the evaluated parameters. Considering edaphoclimatic conditions, the organic cultivation of okra in the autumn-winter period is viable, showing possibility to increase the income for farmers of the region. / Com objetivo de obter resultados que proporcionem alternativas vi?veis de incremento na renda dos agricultores, o presente trabalho estudou um sistema de produ??o org?nica do quiabeiro, cultivado nas esta??es de outono-inverno nas condi??es da Baixada Fluminense, avaliando-se o efeito da pulveriza??o foliar com biofertilizante l?quido, obtido a base de extrato de composto fermentado, e da aduba??o org?nica de cobertura, de forma a possibilitar uma oportunidade de renda aos agricultores da regi?o. Os tratamentos consistiram de: quiabeiro (cv. Santa Cruz 47) pulverizado ou n?o com biofertilizante l?quido, e submetidos a duas doses de aduba??o org?nica, com torta de mamona, (equivalentes a 100 e 200 Kg de N-tota.ha-l) com aplica??o mensal e bimensal, iniciada ap?s 30 dias da semeadura. A cultura foi disposta em fileiras duplas, adotando-se um espa?amento de 0,80 m dentro da fileira dupla e de 1,60 m entre as fileiras duplas. Os frutos foram colhidos ao atingirem a faixa de 10 a 14 cm, padr?o preconizado por mercados exigentes em ?mbito nacional. Foram considerados, nas avalia??es, par?metros de produtividade, como o peso e o n?mero de frutos produzidos, sendo a produtividade estimada a partir dos resultados de peso seco dos frutos.. A Cultivar Santa Cruz 47 mostrou-se adaptada ao manejo org?nico, com produtividade m?dia pr?xima de 16 Mg.ha-1. N?o foram detectadas diferen?as devido aos tratamentos avaliados. Desse modo, a utiliza??o do biofertilizante n?o surtiu qualquer efeito ben?fico ? cultura, tendo em vista as vari?veis quantificadas, assim como a aduba??o mensal em cobertura da torta de mamona, n?o acarretou benef?cio superior ao obtido com a aplica??o bimensal. Considerando as condi??es edafoclim?ticas, o cultivo org?nico do quiabeiro no per?odo de outono inverno mostrou-se vi?vel, o que evidencia possibilidades de gera??o de renda para os agricultores da regi?o.
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Descrição da comunidade microbiana associada à rizosfera de cana-de-açúcar / Description of Microbial Community in the Rhizosphere of SugarcaneCosta, Diogo Paes da 24 January 2013 (has links)
A cana-de-açúcar é uma cultura importante no contexto agrário brasileiro, sobretudo com relação a manutenção e sustentabilidade dos agroecossistemas e da biodiversidade do solo. As comunidades microbianas associadas à canade- açúcar são participantes da manutenção dos ciclos biogeoquímicos, podendo ter sua estrutura e diversidade alteradas por mudanças no manejo da cultura e nas condições climáticas. Esse estudo teve como objetivo avaliar a diversidade microbiana associada à rizosfera de diferentes genótipos de cana-de-açúcar e empregar a metodologia de Stable Isotope Probing (DNA-SIP) para se avaliar a estrutura dos grupos responsivos a este ambiente. Para tanto, variedades de cana-de-açúcar foram selecionadas, extraindo-se o DNA total rizosférico e do bulk soil para análise por PCR-DGGE das regiões do gene 16S rDNA de bactérias, selecionando-se amostras representativas para o sequenciamento da região V6 do gene 16S rDNA através da plataforma Ion Torrent(TM). Os resultados demonstraram diferenças entre a diversidade das comunidades microbianas da rizosfera e do bulk soil, havendo a predominância dos grupos Actinobacteria, Proteobacteria e Acidobateria. Para o estudo da estrutura dos grupos responsivos na rizosfera, plantas da variedade RB86-7515 foram cultivadas sob duas concentrações de CO2 (350 e 700 ppm), realizando-se o enriquecimento com 13CO2, e posteriormente realizando a extração do DNA rizosférico para aplicação na técnica de DNA-SIP. A eficiência desta técnica foi avaliada por meio da técnica de PCR-DGGE para as regiões 16S rDNA de bactérias e ITS de fungos, onde foi verificado que após 48 horas já ocorre a incorporação de 13C pelas comunidades microbianas, havendo diferença entre os grupos que incorporaram o 13C. Diferenças foram também observadas para as distintas concentrações de CO2, indicando o DNA-SIP como uma poderosa ferramenta de estudos da ecologia das comunidades microbianas na rizosfera de cana-deaçúcar. / The sugarcane is an important crop in Brazilian agrarian context, especially in respect to maintenance and sustainability of agroecosystems and soil biodiversity. The microbial communities associated to sugarcane are involved biogeochemical cycles processes and it may have their structure and diversity changed due to crop management and climatic conditions. The aim of this study was to evaluate the microbial diversity associated to the rhizosphere of different sugarcane\'s genotypes and employ the Stable Isotope Probing tecnique (DNASIP) to evaluate the structure of the groups that are responding to this environment attributes. Therefore, some sugarcane varieties were selected and the total DNA in bulksoil and rhizosphere for analysis by PCR-DGGE of 16S rDNA gene regions of bacteria was extracted, selecting representative samples for sequencing the 16S rDNA gene of V6 region by Ion Torrent (TM) platform. The results showed differences between the diversity of microbial communities in the rhizosphere and bulk soil, with the predominance of Actinobacteria, Proteobacteria and Acidobateria groups. To study the structure of the responsive rhizosphere groups, the genotype RB86-7515 were grown under two CO2 concentrations (350 and 700 ppm), performing the 13CO2 enrichment. Afterwards, was performed the extraction of DNA for application of the SIP-rhizosphere DNA technique. The efficiency of this technique was assessed by PCR-DGGE over the regions of bacteria 16S rDNA and fungi ITS, which of these showed that occurs after 48 hours the incorporation of 13C by microbial communities, and it elucidate differences between the groups that incorporate the 13C. These differences were also observed for those different CO2 concentrations, indicating that the DNA-SIP is a powerful tool for studies of the ecology of microbial communities in the rhizosphere of sugarcane.
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Agricultura tradicional e manejo da agrobiodiversidade na Amazônia Central: um estudo de caso nos roçados de mandioca nas Reservas de Desenvolvimento Sustentável Amanã e Mamirauá, Amazonas / Traditional agriculture and agrobiodiversity management in Central Amazon: a study case in the roçados (swidden cassava`s field) in Amanã and Mamirauá Reserves, AmazonasPereira, Kayo Julio Cesar 30 July 2008 (has links)
O presente trabalho teve por objetivo compreender a dinâmica do manejo da agrobiodiversidade nos roçados de mandioca em comunidades ribeirinhas de várzea e terra firme das Reservas de Desenvolvimento Sustentável Amanã e Mamirauá, na Amazônia, e suas relações com as formas de organização da produção, do espaço e do trabalho adotadas pelos produtores. Para tal foi trabalhado um conjunto de metodologias baseados na teoria de sistemas agrários, análise de agroecossistemas, etnoecologia e análise genética utilizando microssatélites. Os resultados indicaram que: 1) Nas duas reservas existem três identidades produtivas, forjadas a partir da principal fonte de renda: agricultores, pescadores e agricultores-pescadores (desenvolvem as duas atividades com fins de comercialização); 2) Os ribeirinhos classificam diversos ambientes como aptos para a agricultura, e a partir deles diversos sistemas de cultivo, que variam em função do ecossistema (várzea ou terra-firme); 3) Existem duas racionalidades produtivas na agricultura (comercialização e auto-consumo), que moldam as racionalidades de manejo da agrobiodiversidade; 4) A diversidade específica e varietal nos roçados diminui à medida que se aumenta o grau de especialização produtiva, tanto da pesca, quanto da agricultura. Contudo, isso não se verifica do ponto de vista genético, uma vez que os genes estão bem distribuídos nas variedades e populações, independente da lógica produtiva; 5) Os roçados de mandioca da RDS Amanã e RDS Mamirauá são extremamente diversos geneticamente, apresentando altos valores de riqueza alélica, polimorfismo e heterozigosidade; 6) A diversidade genética está estruturada basicamente dentro de cada roçado, o que indica alto fluxo gênico entre as variedades de cada roçado e entre as variedades dos diferentes roçados, proporcionada principalmente pela troca de variedades entre agricultores, diminuindo a diferença entre roçados e aumentando a freqüência de diferentes alelos em cada roçado; 7) Os pescadores e as comunidades de várzea têm papel fundamental na dinâmica da agrobiodiversidade, pois abrigam grande número de espécies e variedades de mandioca nos roçados; 8) Portanto, em todas as comunidades a agricultura tem papel fundamental, o que denota que as estratégias de assessoria devem prever a dimensão de sistemas de produção em suas intervenções. / This study had the objective of understanding the agrobiodiversity management dynamics in roçados (swidden fields of cassava) in riverine communities of the Amanã and Mamirauá Sustainable Reserves in the Amazon and its relations with production, space and work management adopted by the families. The methodology adopted was based on the agrarian systems theory, agroecosystems analysis, ethnoecology and microsatellites genetic analysis. The results indicated that: 1) In the two reserves there are three productive identities, forged from the main source of economic income: agriculturists, fishing and agriculturist-fishing (they develop the two activities with commercialization aims); 2) The informers classify diverse environments as apt for agriculture, and from them diverse crop systems, that vary in function of the ecosystem (land-firm or floodplain); 3) There are two productive rationalities in agriculture (commercialization and self-consumption), which adapts to the rationalities of agrobiodiversity management; 4) The specific and varietal diversity in the roçados decreases as the level of productive specialization increases, both the fishing and agriculture. However, this is not verified in the genetic point of view, where the genes are well distributed in the varieties and populations, independent of the productive logic; 5) The roçados at the Amanã and Mamirauá SDR are extremely diverse, presenting high values of allelic diversity, polymorphism and heterozigosity; 6) The genetic diversity is structured basically within each roçado, which indicates high gene flow among the varieties of each roçado and among the varieties of the different roçados, promoted mainly by the exchange of varieties between agriculturists, diminishing the difference between roçados and increasing the frequency of different alleles in each roçado; 7) The floodplain fishing and communities have an important role in the agrobiodiversity dynamics, as they shelter a great number of species and cassava varieties in their roçados; 8) Therefore, in all the communities agriculture has an important role, which denotes that the extension strategies must foresee the production systems approach in their interventions.
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Avaliação do sistema de estabilização plasmidial toxina-antitoxina para a produção de proteínas recombinantes em Escherichia coli. / Evaluation of plasmidial stabilization system toxin-antitoxin for recombinant proteins production in Escherichia coli.Katayama, Karla Yukari 30 September 2016 (has links)
Uma abordagem promissora para a obtenção de coquetéis enzimáticos eficientes para a etapa de hidrólise na produção de etanol de 2ª geração é o enriquecimento em termos de atividades que lhes faltam, mas podem ser obtidas através de sistemas heterólogos. O trabalho teve como objetivo avaliar o sistema toxina -antitoxina (TA) para estabilização plasmidial em E. coli na produção de expansina e endoglucanase recombinantes. Os resultados indicaram que o sistema de expressão com estabilização TA é tão eficaz quanto o dependente de antibiótico para estabilização plasmidial. Além disso, mostrou-se mais eficiente pelo fato de não permitir a sobrevivência de células sem o plasmídeo. Estudos indicaram a quantidade mínima de 0,05mM de IPTG para expressão das proteínas nesta linhagem, cerca de 20 vezes menos que a concentração usualmente aplicada no momento da indução. Sendo assim, o sistema de estabilização plasmidial TA mostrou-se uma ótima ferramenta para o desenvolvimento de uma plataforma alternativa para a produção de proteínas recombinantes. / A promising approach to obtain efficient enzyme cocktails for the hydrolysis step in the production of 2nd generation ethanol is the enrichment in terms of activities that are lacking, but can be obtained by heterologous systems. The study aimed to evaluate the toxina-antitoxin (TA) system for plasmid stabilization in E. coli in the production of recombinant expansin and endoglucanase. The results indicated that the expression system with TA stabilization is as effective as the antibiotic dependent for plasmid stabilization. Moreover, it proved to be more efficient by not allo wing the survival of cells without the plasmid. Studies have indicated the minimum amount of 0.05 mM IPTG for expression of proteins in this strain, about 20 times less than the concentration usually applied for induction. Thus, the plasmid stabilization TA system proved to be a great tool for the development of an alternative platform for producing recombinant proteins.
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Dissipação e mobilidade dos herbicidas glifosato e oxifluorfen em um solo manejado no sistema de cultivo mínimo e florestado com Eucaliptus grandis / Dissipation and mobility of the herbicides glyphosate and oxyfluorfen in soil managed by minimum cultivation and forested with Eucaliptus grandisCassamassimo, Ricardo Eugenio 13 March 2006 (has links)
O glifosato e o oxifluorfen têm sido os principais herbicidas para controle de plantas invasoras em plantações florestais. Neste contexto, constituíram em objetivos do presente estudo avaliar as taxas de degradação e de lixiviação de glifosato e oxifluorfen em Latossolo Vermelho-Amarelo Distrófico psamítico, manejados no sistema de cultivo mínimo, florestados com eucalipto. Para tal, foi conduzido um experimento em condições de campo, na Estação Experimental de Ciências Florestais de Itatinga, ESALQ/USP (Itatinga - SP), sendo as análises realizadas no Laboratório de Resíduos de Pesticidas e Análises Cromatográficas (LARP/USP). Aplicou-se o glifosato (1440g i.a. ha-1) e oxifluorfen (960g i.a. ha-1) em três repetições na dosagem recomendada (4,0 L./ha-1) para condição de campo. A dissipação dos herbicidas foi avaliada por cromatografia. Foram analisadas amostras de serapilheira, solo e solução do solo. Para a avaliação dos teores de herbicidas na serapilheira e no solo foram realizadas amostragens 3 dias antes da aplicação dos herbicidas na testemunha e, nos demais tratamentos, no dia da aplicação 0, 1, 3, 7, 15, 30, 60 e 93 dias após a aplicação dos herbicidas. Foram amostradas a serapilheira e as seguintes camadas de solo: 0-1, 1-2, 2-4, 4-6, 6-10, 10-15 e 15-30 cm. Para avaliar a lixiviação dos herbicidas, amostras de solução do solo foram coletadas em lisímetros ativado por gravidade (sem tensão) e outro por vácuo (com tensão). O lisímetro ativado por gravidade foi instalado sob a serapilheira, 15, 50 e 100 cm de profundidade e o outro lisímetro foi instalado 15, 50, 100 e 300 cm. Para avaliar a fotodegradação do oxifluorfen foram instaladas parcelas na sombra (sombrite a 80%). A meia-vida do glifosato no solo sem serapilheira foi de 10 dias e no solo sob serapilheira, de 47 dias. Sua lixiviação no solo sob serapilheira foi 36% menor do que no solo sem serapilheira. Devido a este efeito, os riscos de contaminação de solos manejados no sistema de cultivo mínimo são menores. A concentração do glifosato decresceu enquanto a do seu metabólito (AMPA) aumentou durante as duas primeiras semanas após sua aplicação. E tais resíduos foram detectados na solução do solo após 8 dias de sua aplicação, a 15 cm de profundidade. A meia-vida de oxifluorfen no solo sem serapilheira foi de 25 dias e no solo com serapilheira sua meia-vida foi reduzida para 13 dias. O oxifluorfen no solo com serapilheira lixiviou até 5cm e no solo sem serapilheira até 8cm. Em ambas as situações as concentrações foram muito baixas. O teor de oxyfluorfen sob sombra foi sempre maior do que sob pleno sol, comprovando sua fotodegradabilidade. / Glyphosate and oxyfluorfen have been the main herbicides used for the control for the weed control in forest plantations. In this context, to evaluate the degradation and the leaching of glyphosate and oxyfluorfen in red-yellow latosols (oxisol) under minimum cultivation of the soil and planted with eucalyptus were the objectives of the present study. To do so, an experiment was carried out under field conditions in the Experimental Forest Science Station at Itatinga, ESALQ/USP (Itatinga - SP). The analyses were performed under laboratory conditions at LARP/USP - a laboratory of pesticide residues and chromatographic analyses. Oxyfluorfen was applied (960g a. i. ha-1) in (three repetitions) at the recommended dosage (4.0 L./ha-1) for the field conditions. Glyphosate (1440g a. i. ha-1) and oxyfluorfen (960g a. i. ha-1) were applied in three repetitions at the recommended dosage (4.0 L./ha-1) for the filed condition. The dissipation of the herbicides was evaluated by means of chromatography. Samples of litter, soil and soil solution were analyzed. In order to evaluate the herbicide rates in litter and in soil, samplings were performed three days before the herbicides application in the control and, in the other treatments, at the day of application (0), and at 1, 3, 7, 15, 30, 60, and 93 days after the application. litter and the following soil layer were sampled: 0-1, 1-2, 2-4, 4-6, 6-10, 10-15, and 15-30 cm deep. In order to evaluate the herbicides leaching, samples of soil solution were collected in lisimeters activated by gravity (without tension) and by vacuum (with tension). The lisimeter activated by gravity was installed under the litter at 15, 50, and 100 cm deep; the other was installed at 15, 50, 100, and 300 cm deep. In order to evaluate the photodegradation of oxyfluorfen, the plots were installed under shade (shading net at 80%). The half-life of glyphosate in soil without litter was 10 days and in soil under litter was 47 days. The leaching of glyphosate in soil under litter was 36% smaller than in soil without litter. Because this effect, the risk of contamination of soils that have minimum cultivation are small. The concentration of glyphosate decrease while concentration of your principal metabolite (AMPA) increase during the first two week after application. Glyphosate was found in soil solution 8 days after application up to 15cm deep. The half-life of oxyfluorfen in soil without litter was 25 days and in soil under litter was 13 days. Oxyfluorfen was found at 5 cm deep in soil with litter and at 8 cm deep in soil without litter. In both situations the concentration was very low. Along the experiment, oxyfluorfen under shade was always higher than under sun, this proves the photo-degradation.
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Associação da técnica de cultivo em camada delgada contendo ágar Middlebrook 7H11 Modificado com a Reação em Cadeia de Polimerase (PCR) para identificação precoce de Mycobacterium bovis em órgãos de bovinos e bubalinos oriundos de abatedouros comerciais / Association between the modified Middlebrook 7H11 agar thin layer cultivation technique with the Polymerase Chain Reaction (PCR) on the earlier identification of Mycobacterium bovis in bovine and buffalo organs deriving from commercial slaughterhousesRosário, Tatiana Reis do 16 August 2010 (has links)
A técnica de cultivo em camada delgada contendo ágar Middlebrook 7H11 modificado foi comparada com o cultivo padrão em meio de Stonebrink, visando avaliar a sensibilidade e o tempo de detecção de Mycobacterium bovis em órgãos de bovinos e bubalinos oriundos de abatedouros comerciais. Posteriormente, a PCR foi utilizada para a confirmação do crescimento observado nos cultivos, bem como a coloração de Ziehl-Neelsen na pesquisa de bacilos álcool-ácido resistentes. As 49 amostras testadas foram descontaminadas pelo método tradicional de Petroff e trabalhadas em duas etapas. Na primeira, todas foram semeadas nas placas contendo o meio de Middlebrook 7H11 em camada delgada e nos tubos contendo o meio de Stonebrink, e as colônias observadas macroscopicamente em ambos os meios foram submetidas à PCR. Na segunda, 10 amostras cultivadas na primeira etapa foram submetidas a novo cultivo, somente em camada delgada, para observação do crescimento microscópico das colônias e também analisadas pela PCR. Os resultados obtidos demonstraram que: 1) a técnica de cultivo de Mycobacterium bovis em camada delgada no meio de Middlebrook 7H11 modificado em amostras de órgãos de bovinos e bubalinos mostrou-se viável quando comparada ao cultivo clássico no meio de Stonebrink, reduzindo o tempo de isolamento e podendo ser utilizada de forma complementar aos métodos tradicionais de diagnóstico da tuberculose bovina; 2) foi possível a identificação precoce do crescimento das micobactérias em camada delgada (entre 12º e 25º dia de crescimento) quando comparadas ao Stonebrink; 3) a PCR mostrou-se uma ferramenta complementar à somatória das técnicas de descontaminação de Petroff, coloração de Ziehl-Neelsen e cultivo em camada delgada na confirmação do diagnóstico de presença de micobactérias em amostras de órgãos de bovinos e bubalinos. / The modified thin layer Middlebrook 7H11 cultivation was compared to the standard culture technique containing Stonebrink media, in order to evaluate the sensitivity and time for the detection of Mycobacterium bovis in bovine and buffalo organs deriving from commercial slaughterhouses. The PCR was applied for confirmation of the growth observed in the cultures, as well as the Ziehl-Neelsen color technique in order to detect acid-fast bacilli. 49 samples were submitted to the classic Petroff\'s decontamination method, and worked in two stages. In the first one, all of them were sowed in plates containing modified Middlebrook 7H11 agar in thin layer and in tubes containing the Stonebrink media, and the colonies observed macroscopically in both medias were submitted to the PCR. In the second stage, 10 samples from the first stage were submitted to a new culture, only in thin layer, for microscopical growth observation of the colonies and also submitted to the PCR. The results showed that: 1) Mycobacterium bovis cultivation in modified thin layer Middlebrook 7H11 for bovine and buffalo samples were viable when compared to the classic culture in Stonebrink, reducing the time of isolation, and can be applied as a complement to the traditional bovine tuberculosis diagnosis methods; 2) earlier identification of mycobacteria growth was found in thin layer (between 12nd and 25th day of growth) when compared to the Stonebrink; 3) PCR technique showed to be a complementary tool to the sum of techniques including Petroff decontamination, Ziehl-Neelsen color and thin layer cultivation for the diagnosis confirmation of the presence of mycobacteria in bovine and buffalo organs samples .
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Uso de tubete e de minitubete de compósito de polihidroxibutirato mais pó de madeira na produção e no plantio de mudas seminais e clonais de eucalipto / Use of tubes and minitubes of polyhydroxybutyrate plus wood powder composite in the production and planting of eucalyptus seedlings and cuttingsArthur Junior, José Carlos 13 May 2011 (has links)
O início do uso de tubete na década de 80 revolucionou os viveiros, e hoje mesmo apresentando desvantagens, é amplamente difundido em todo o setor florestal. Esses tubetes de polipropileno, derivado do petróleo, possuem dois problemas: uso de fonte não renovável e resíduos para descarte. Uma alternativa é a substituição por plásticos biodegradáveis. Os objetivos foram avaliar: (a) a taxa de decomposição do compósito; (b) o crescimento em altura e em diâmetro do colo (DAC); (c) a produção de biomassa aérea e radicular; (d) a concentração de nutrientes nos tecidos vegetais; (e) a eficiência do uso de condições ambientais e de atributos do solo para predizer a taxa de decomposição. Os estudos no processo seminal ocorreram no viveiro da ESALQ, em Piracicaba. Para estudar a taxa de decomposição do compósito, utilizaram-se formulações com 20 e 30% (p p-1) de pó de madeira. No verão e no inverno aplicaramse 150; 225 e 300 g de N m-3 de substrato na fertilização de base. A diminuição de massa foi mensurada a cada dez dias, até 90 dias. Avaliou-se se o crescimento em altura e em DAC de mudas seminais entre 40-90 dias após a semeadura, a produção de biomassa e concentração de macronutrientes aos 90. No plantio realizado na E.E.C.F. de Anhembi, em três blocos ao acaso avaliou-se o crescimento em altura, em DAC e de produção biomassa, aos 15, 30, 45, 60, 90 e 120 dias. Para as mudas clonais utilizou-se tubete e minitubete de polipropileno, tubetes na coloração normal e na coloração escurecida, e minitubete de compósito. O estudo realizou-se em quatro viveiros e quatro plantios de Eucalyptus sp. no estado de São Paulo. No viveiro utilizouse 4 blocos casualizados. O crescimento em altura e em DAC, e a biomassa foram mensurados aos 90 dias. O plantio clonal em três blocos ao acaso foi mensurado em altura, DAC e produção de biomassa aos 15, 30, 60, 90, 120 e 150 dias. A concentração de macronutrientes foi determinada aos 150 dias. Os dados foram submetidos aos testes de normalidade, de homogeneidade de variâncias, da Análise de Variância e de Tukey. A análise da relação entre as variáveis dependentes e independentes foi realizada por meio de análises de correlação e de regressão. O aumento da dose de N e do teor de madeira não proporcionou aumento da taxa de decomposição, ao contrário da estação climática. A abertura de fissuras causou deformação do tubete, dificultando o manejo. As mudas seminais, crescimento e biomassa não diferiram no verão. Os plantios seminais não diferiram em crescimento e em biomassa. No sistema clonal crescimento e biomassa diferiram nos viveiros. No plantio clonal, crescimento e produção de biomassa não diferiram em três sítios. Tubetes e minitubete de compósito não impediram o desenvolvimento do sistema radicular. A diminuição da massa dos tubetes ou minitubete de compósito, em produção de mudas seminais ou clonal, pôde ser prevista com alta precisão em função das condições ambientais. Da mesma forma nos plantios seminais. No plantio clonal pelo menos em dois sítios houve alta relação. / The introduction of plastic tubes on 80s revolutionized nurseries, and nowadays even with disadvantages, is widespread throughout the forest sector. These polypropylene tubes, derived from petroleum, have two problems: use of a nonrenewable resource and waste for disposal. An alternative is the substitution for biodegradable plastics. The objectives were to assess: (a) the rate of decomposition of the composite, (b) the growth in height and ground level diameter (DAC), (c) the production of stem and root biomass, (d) the concentration of nutrients on plant tissues, (e) the efficiency of use of environmental conditions and soil properties to predict the rate of decomposition. Studies in the seminal case occurred in ESALQ´s nursery, Piracicaba. To study the rate of decomposition of composite were used formulations with 20 and 30% (p p-1) of wood powder. During summer and winter were applied 150, 225 and 300 g N m-3 of substrate for base fertilization. Decrease in mass was measured every ten days until 90 days. We evaluated the growth in height and DAC from seedlings between 40-90 days after sowing, the production of biomass and macronutrients at 90. On planting, held at E.E.C.F. of Anhembi in three randomized blocks, were evaluated height growth, DAC and biomass production at 15, 30, 45, 60, 90 and 120 days. For cuttings, we used minitubes and tubes of polypropylene, and tubes with normal and darkened colors, and minitubes of composite. The study took place in four nurseries and four Eucalyptus sp. plantations at state of São Paulo. At nursery we used four randomized blocks. The growth in height, DAC and biomass were measured at 90 days. The clonal plantation in three randomized blocks was measured in height, DAC and biomass production at 15, 30, 60, 90, 120 and 150 days. The concentration of macronutrients was determined at 150 days. Data were tested for normality, homogeneity of variance, analysis of variance and Tukey test. Analysis of relationship between dependent and independent variables was performed using correlation and regression. The increase of N and wood content did not increase the rate of decomposition, unlike the weather season. Opening of cracks caused deformation of the tube, making it difficult to manage. The growth and biomass of seedlings did not differ on summer. Seminal plantations did not differ in growth and biomass. At clonal system, growth and biomass differed in nurseries. In clonal plantation, growth and biomass production did not differ at three sites. Minitube and tubes of composite did not prevent the development of root system. Decrease of tube or minitube of composite masses in production from seedlings or cuttings was predicted with high accuracy, as a function of environmental conditions. Likewise in seminal plantations. In clonal planting, at least two sites, showed high relation.
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