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Descoberta e genotipagem por sequenciamento de SNPs em Coffea canephora e aplica????es em estudos de diversidade e estrutura gen??tica

Carneiro, Fernanda de Ara??jo 05 September 2014 (has links)
Submitted by Sara Ribeiro (sara.ribeiro@ucb.br) on 2017-06-21T18:44:08Z No. of bitstreams: 1 FernandadeAraujoCarneiroDissertacao2014.pdf: 3295341 bytes, checksum: ae61848c5cda4564d3f875fdf8b3d387 (MD5) / Approved for entry into archive by Sara Ribeiro (sara.ribeiro@ucb.br) on 2017-06-21T18:44:32Z (GMT) No. of bitstreams: 1 FernandadeAraujoCarneiroDissertacao2014.pdf: 3295341 bytes, checksum: ae61848c5cda4564d3f875fdf8b3d387 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-21T18:44:32Z (GMT). No. of bitstreams: 1 FernandadeAraujoCarneiroDissertacao2014.pdf: 3295341 bytes, checksum: ae61848c5cda4564d3f875fdf8b3d387 (MD5) Previous issue date: 2014-09-05 / Of all the different activities related to agricultural industry worldwide, coffee agribusiness is among the most important ones, both economically and socially, being the main livelihood for more than 125 million people in more than 60 countries. Commercial coffee production is mostly based on two species, Coffea arabica and C. canephora. The high genetic variability of C. canephora, due to its level of allogamy, is of great importance for breeding programs of coffee as a source of novel alleles and co-evolved genetic combinations. The molecular analysis of genetic diversity has become increasingly efficient, necessary and refined, as molecular techniques have evolved and morphological traits do not supply sufficient information to fully describe an individual. An important tool in the study of genetic diversity is the use of SNP (Single Nucleotide Polymorphism) based molecular markers. In the case of C. canephora diversity studies may benefit breeding programs in selecting individuals to optimize mating schemes or assess the diversity and relatedness of clonal varieties. This study aimed to (i) evaluate and characterize the diversity and the genetic structure of C. canephora Conilon individuals belonging to a population located at Embrapa Cerrados, by nextRAD genotyping (reductively-amplified Nextera tagmented-DNA); (ii) identify potential parents of these individuals and (iii) validate genotyping technique in genomic scale. A total of 11,230 SNPs were obtained for C. canephora Conilon individuals by technique nextRAD, of these, 573 markers were selected for the diversity analysis, kinship and genetic structure using the Cervus, adegenet and Structure. The genetic diversity (0.405) and the mean observed heterozygosity (0:41) were high considering the bi-allelic markers and more than 64% of the SNPs showed PIC values higher than 0.3. In terms of population, the two methodologies used (Bayesian method and DAPC) identified different numbers of groups formed for the same set of data. In kinship analysis some parents are more frequent in the population. The data generated for the population will be useful in upcoming association studies the development of genomic prediction models. / Dentre as diferentes atividades ligadas ao neg??cio agr??cola em n??vel mundial, o agroneg??cio cafeeiro est?? entre as de maior import??ncia econ??mica e social, sendo o principal meio de subsist??ncia para mais de 125 milh??es de pessoas e produzido em mais de 60 pa??ses. A produ????o cafeeira comercial baseia-se principalmente em duas esp??cies: Coffea arabica e Coffea canephora. A grande variabilidade gen??tica do C. canephora devido sua alogamia, ?? um fator de grande import??ncia para os programas de melhoramento do cafeeiro, pois fornece uma fonte de novos genes. O estudo molecular da diversidade gen??tica vem se demonstrando cada vez mais eficiente, necess??rio e refinado, uma vez que as t??cnicas moleculares est??o evoluindo e os descritores morfol??gicos est??o se tornando insuficientes para a descri????o de um indiv??duo. Uma ferramenta muito importante no estudo da diversidade gen??tica ?? o uso dos marcadores moleculares SNPs (Single Nucleotide Polymorphism), estes consistem na varia????o de sequ??ncia de DNA, podendo ser identificados em praticamente todos os genes. No caso de C. canephora, estudos de diversidade podem facilitar a orienta????o dos programas de melhoramento na escolha de genitores para cruzamentos ou de gen??tipos para composi????o de variedades clonais. Este trabalho objetivou (i) avaliar e caracterizar, por meio da t??cnica de genotipagem nextRAD (Nextera-tagmented reductively-amplified DNA), a diversidade e a estrutura gen??tica de indiv??duos de C. canephora Conilon, pertencentes a uma popula????o localizada na Embrapa Cerrados; (ii) identificar os poss??veis genitores desses mesmos indiv??duos e (iii) validar a t??cnica de genotipagem em escala gen??mica utilizada nesse estudo. Um total de 11.230 SNPs foram identificados em indiv??duos de C. canephora Conilon por meio da t??cnica de genotipagem nextRAD, destes, 573 marcadores foram selecionados para as an??lises de diversidade, parentesco e estrutura gen??tica utilizando os software Cervus, adegenet e Structure. A diversidade gen??tica (0.405) e a m??dia da heterozigosidade observada (0.41) foram altas considerando marcadores bial??licos e mais de 64% dos SNPs apresentaram valores de PIC superiores a 0.3. Em termos de popula????o foi poss??vel verificar que as duas metodologias utilizadas (m??todo Bayesiano e DAPC) identificaram n??meros diferentes de grupos formados para o mesmo conjunto de dados. Na an??lise de parentesco foi poss??vel identificar alguns genitores bastante frequentes na popula????o. Os dados gerados para a popula????o ser??o ??teis em estudos futuros de associa????o e no desenvolvimento de modelos de predi????o gen??mica.
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Sele??o de ?rvores matrizes de mimosa caesalpiniaefolia benth para produ??o de sementes

Ara?jo, Fernando Dos Santos 16 December 2014 (has links)
Submitted by Automa??o e Estat?stica (sst@bczm.ufrn.br) on 2017-01-16T15:34:08Z No. of bitstreams: 1 FernandoDosSantosAraujo_DISSERT.pdf: 223974 bytes, checksum: a71815aa5ba64411ba939da0cc84af8d (MD5) / Approved for entry into archive by Elisangela Moura (lilaalves@gmail.com) on 2017-01-16T15:43:28Z (GMT) No. of bitstreams: 1 FernandoDosSantosAraujo_DISSERT.pdf: 223974 bytes, checksum: a71815aa5ba64411ba939da0cc84af8d (MD5) / Made available in DSpace on 2017-01-16T15:43:28Z (GMT). No. of bitstreams: 1 FernandoDosSantosAraujo_DISSERT.pdf: 223974 bytes, checksum: a71815aa5ba64411ba939da0cc84af8d (MD5) Previous issue date: 2014-12-16 / Funda??o de Amparo ? Pesquisa do Rio Grande do Norte (Fapern) / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior (CAPES) / Plantios florestais com esp?cies nativas podem ser realizados com o intuito de reverter o quadro de escassez de produtos florestais e mitigar a degrada??o ambiental no bioma Caatinga. Nestes casos, as sementes florestais de boa qualidade constituem-se em insumos importantes para a forma??o desses plantios. Assim, este trabalho teve como objetivo selecionar ?rvores matrizes de Mimosa caesalpiniaefolia em uma floresta plantada no Estado do Rio Grande do Norte com vistas a fornecer sementes para recomposi??o florestal na regi?o semi?rida do Nordeste do Brasil. Dessa ?rea foram amostradas nove ?rvores matrizes, das quais se coletaram amostras de material foliar para estimar a sua diversidade gen?tica e tamb?m sementes para avalia??o da qualidade fisiol?gica e estimar a diversidade gen?tica de prog?nies. Testes de germina??o e vigor foram utilizados para avaliar a qualidade das sementes e, para estimar a diversidade gen?tica, foram selecionados marcadores moleculares ISSR (Inter-simple sequence repeat) capazes de detectar polimorfismo gen?tico entre os indiv?duos da esp?cie. Todas as matrizes produziram sementes com elevada taxa de germina??o e emerg?ncia, por?m foram constatadas diferen?as sutis de vigor quando avaliadas pelos testes de condutividade el?trica e lixivia??o de pot?ssio, os quais s?o considerados testes promissores para estimar o desempenho das sementes em campo. Os marcadores ISSR selecionados para a esp?cie revelou que as matrizes apresentam diversidade gen?tica moderada e produzem prog?nies com diversidade tamb?m moderada. Assim, conclui-se que as nove matrizes amostradas produzem sementes com qualidade fisiol?gica e diversidade gen?tica satisfat?ria para recomposi??o florestal. / Plantios florestais com esp?cies nativas podem ser realizados com o intuito de reverter o quadro de escassez de produtos florestais e mitigar a degrada??o ambiental no bioma Caatinga. Nestes casos, as sementes florestais de boa qualidade constituem-se em insumos importantes para a forma??o desses plantios. Assim, este trabalho teve como objetivo selecionar ?rvores matrizes de Mimosa caesalpiniaefolia em uma floresta plantada no Estado do Rio Grande do Norte com vistas a fornecer sementes para recomposi??o florestal na regi?o semi?rida do Nordeste do Brasil. Dessa ?rea foram amostradas nove ?rvores matrizes, das quais se coletaram amostras de material foliar para estimar a sua diversidade gen?tica e tamb?m sementes para avalia??o da qualidade fisiol?gica e estimar a diversidade gen?tica de prog?nies. Testes de germina??o e vigor foram utilizados para avaliar a qualidade das sementes e, para estimar a diversidade gen?tica, foram selecionados marcadores moleculares ISSR (Inter-simple sequence repeat) capazes de detectar polimorfismo gen?tico entre os indiv?duos da esp?cie. Todas as matrizes produziram sementes com elevada taxa de germina??o e emerg?ncia, por?m foram constatadas diferen?as sutis de vigor quando avaliadas pelos testes de condutividade el?trica e lixivia??o de pot?ssio, os quais s?o considerados testes promissores para estimar o desempenho das sementes em campo. Os marcadores ISSR selecionados para a esp?cie revelou que as matrizes apresentam diversidade gen?tica moderada e produzem prog?nies com diversidade tamb?m moderada. Assim, conclui-se que as nove matrizes amostradas produzem sementes com qualidade fisiol?gica e diversidade gen?tica satisfat?ria para recomposi??o florestal.
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Caracteriza??o citogen?tica e molecular de acessos de maracuj? da caatinga (Passiflora cincinnata mast.)

Almeida, Larissa Emanuelle da Silva 28 February 2018 (has links)
Submitted by Jadson Francisco de Jesus SILVA (jadson@uefs.br) on 2018-09-14T21:35:37Z No. of bitstreams: 1 LARISSA EMANUELLE - CARACTERIZA??O CITOGEN?TICA E MOLECULAR DE ACESSOS DE MARACUJ? DA CAATINGA (P.pdf: 1500343 bytes, checksum: fe0bb966270a60a1929a285b717b71db (MD5) / Made available in DSpace on 2018-09-14T21:35:37Z (GMT). No. of bitstreams: 1 LARISSA EMANUELLE - CARACTERIZA??O CITOGEN?TICA E MOLECULAR DE ACESSOS DE MARACUJ? DA CAATINGA (P.pdf: 1500343 bytes, checksum: fe0bb966270a60a1929a285b717b71db (MD5) Previous issue date: 2018-02-28 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior - CAPES / Passiflora cincinnata Mast. is a native species of Brazil with a wide geographic distribution, which can be exploited as a source of resistance to biotic and abiotic stresses, presenting good productivity, as well as high nutritional quality for human consumption, besides other uses. On the other hand, both molecular and cytogenetic characterization is an important step for the conservation and use of genotypes, considering the potential genetic diversity of the species. The objective of this work was to characterize the genetic diversity among the passion fruit of the caatinga (P. cincinnata), conserved in the active bank of passion fruit germplasm of Embrapa Semi?rido, using cytogenetic techniques of conventional analysis, double CMA3/DAPI staining and using molecular markers from type ISSR. The different ISSR molecular markers showed efficiency in detecting polymorphism, revealing intraspecific variability among the accessions. Diploid chromosome numbers 2n=18 were observed, being classified in the chromosomal group with basic number x=9. The double CMA/DAPI staining allowed the identification of four CMA positive bands, semi-reticulated interphase nuclei with presence of CMA+ blocks. The colorability of the pollen grains using acetic carmine and Alexander reactive allowed to estimate high pollen viability with values above 98% for both dyes analyzed, indicating the potential use of this species in breeding programs. / Passiflora cincinnata Mast. ? uma esp?cie nativa do Brasil com ampla distribui??o geogr?fica, que pode ser explorada como fonte de resist?ncia a estresses bi?ticos e abi?ticos, apresentando boa produtividade, bem como alta qualidade nutricional para a alimenta??o humana, al?m de outros usos. Por outro lado, a caracteriza??o tanto molecular como citogen?tica ? uma etapa importante para conserva??o e uso de gen?tipos, considerando a diversidade gen?tica potencial da esp?cie. O presente trabalho objetivou caracterizar a diversidade gen?tica entre acessos de maracuj? da caatinga (P. cincinnata) conservados no Banco Ativo de Germoplasma de maracuj? da Embrapa Semi?rido, utilizando t?cnicas citogen?ticas de an?lise convencional, dupla colora??o CMA3/DAPI e utilizando marcadores moleculares do tipo ISSR. Os diferentes marcadores moleculares ISSR mostraram efici?ncia na detec??o de polimorfismo, revelando variabilidade intraespec?fica entre os acessos. Foram observados n?meros cromoss?micos diploides 2n=18, sendo classificados no grupo cromoss?mico com n?mero b?sico x=9. A dupla colora??o CMA/DAPI, permitiu identificar quatro bandas CMA positivo, n?cleos interf?sicos semirreticulados com presen?a de blocos CMA+. A colorabilidade dos gr?os de p?len utilizando carmim ac?tico e reativo de Alexander permitiu estimar uma alta viabilidade pol?nica com valores acima de 98% para ambos os corantes analisados, indicando o uso potencial dessa esp?cie em programas de melhoramento.
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Estima??o de par?metros gen?ticos e de diversidade em pinh?o-manso (Jatropha Curcas L.) quanto ? arquitetura de plantas com vari?veis obtidas via an?lise de imagens digitais / Estimation of genetic parameters and diversity in Jatropha curcas L. as the plant architecture with values obtained by digital image analysis

Mesquita, Daniel Zimmermann 09 July 2015 (has links)
Submitted by Celso Magalhaes (celsomagalhaes@ufrrj.br) on 2017-05-17T15:27:59Z No. of bitstreams: 1 2015 - Daniel Zimmermann Mesquita.pdf: 1282998 bytes, checksum: 279462a122004962e8bfed1dd4735013 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-17T15:27:59Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2015 - Daniel Zimmermann Mesquita.pdf: 1282998 bytes, checksum: 279462a122004962e8bfed1dd4735013 (MD5) Previous issue date: 2015-07-09 / The search for renewable energy sources such as biodiesel and ethanol, is a growing trend in Brazil and in the world due to lower environmental impacts. Among the plant species available to search, highlight the physic nut (Jatropha curcas L.), that it is a perennial species, deciduous and with great potential for biodiesel production due to their production characteristics and quality of oil . However, to date there is no available cultivars for planting, so the need for basic and applied research. Therefore, it is important to know the behavior of genotypes and several variables estimated in the culture, among these quotes to the related plant architecture. The objective of this study was a detailed study of the characteristics related to plant architecture, in order to know the diversity within and among 10 families of jatropha half brothers belonging to the Germplasm Collection UFRRJ through digital analysis images. The treatments (families) were arranged in a randomized design, with 15 replications (plants). Made to capture images, in the same measuring scale at the time the plants were in his deciduous period and subsequently through ImageJ software, the images were processed. It estimated the following variables related to plant architecture: plant height (ALT), stem diameter (DBC), crown diameter (DCO), number of branches to 50 cm (NR50), opening angle Canopy (AAB), the total number of forks in the plant (NBI), the average height of the forks (MAB), number of branches above (NRAcmab) and below (NRAbmab) of MAB, the sum length of the branches (SCR), area of the plant (APL). It was estimated also in the field, the number of fruits (NFR) and seeds (NSE), average seed weight (PMS) and grain yield per plant (PGP), and these were used only in correlation analysis with variables related to plant architecture. From these data were carried out analysis of variance, correlation, estimation of genetic parameters and analysis of diversity. Only the variable number of branches to 50 cm (NR50) was not statistically different between the evaluated progenies. ALT variables, DCO, NBI, NRAcmab, NRAbmab, SCR and APL had greater genetic influence at the expense of environmental, justifying the selection of these characteristics. The grain yield per plant (PGP) had low correlation with all variables, with SCR and NRAcmab showed the highest values respectively 0.24 and 0.20. The genetic diversity was estimated between families median ranging between 0.4 and 0.6. The diversity within families was medium to low with estimates families with more than 0.6 and less than 0.4, respectively, to the families 858, 355 and 869, and 346, 383 and 872. The number of bifurcations (NBI ), the flat area of the plant (APL) and the sum of the length of the branches (SCR) were the most important features in the estimation of diversity in this study, with the contribution of respectively 30.55%, 22.29% and 10, 65%. The family 872 showed favorable aspects related to plant architecture, such as the high average number of bifurcations (NBI) and, in general, the greatest genetic distance between the other families. Therefore, prior assessment for evidence of productive potential, family genotypes 872 may be involved in crosses when you want to explore heterosis culture. / A pesquisa por fontes renov?veis de energia, como o biodiesel e o etanol, ? uma tend?ncia crescente no Brasil e no mundo devido aos menores impactos ambientais causados. Dentre as esp?cies vegetais dispon?veis para pesquisa, destaca-se o pinh?o-manso (Jatropha curcas L.), que se trata de uma esp?cie perene, caducif?lia e com grande potencial para produ??o de biodiesel, devido a suas caracter?sticas de produ??o e qualidade de ?leo. Por?m, at? o momento n?o h? cultivares dispon?veis para o plantio, por isso a necessidade de pesquisa b?sica e aplicada. Neste sentido, ? importante conhecer o comportamento de gen?tipos e de diversas vari?veis estimadas na cultura, dentre estas cita-se ?s relacionadas a arquitetura de planta. Assim, o objetivo deste trabalho foi realizar um estudo detalhado das caracter?sticas referentes ? arquitetura de plantas, visando conhecer a diversidade entre e dentro de 10 fam?lias de meios-irm?os de pinh?o-manso pertencentes ? Cole??o de Germoplasmas da UFRRJ, atrav?s da an?lise digital de imagens. Os tratamentos (fam?lias) foram dispostos em delineamento inteiramente casualizado, com 15 repeti??es (plantas). Efetuou-se a captura das imagens, na mesma escala m?trica, no momento em que as plantas encontravam-se em seu per?odo caducif?lio, e posteriormente, atrav?s do Programa ImageJ, as imagens foram processadas. Estimou-se as seguintes vari?veis relacionadas a arquitetura de planta: altura das plantas (ALT), di?metro do caule (DBC), di?metro de copa (DCO), , n?mero de ramos aos 50 cm de altura (NR50), ?ngulo de abertura do dossel (AAB), n?mero de bifurca??es totais na planta (NBI), m?dia da altura das bifurca??es (MAB), n?mero de ramos acima (NRAcmab) e abaixo (NRAbmab) de MAB, somat?rio do comprimento dos ramos (SCR) e ?rea plana da planta (APL). Estimou-se tamb?m, no campo, o n?mero de frutos (NFR) e sementes (NSE), peso m?dio de sementes (PMS) e produ??o de gr?os por planta (PGP), sendo que estas foram utilizadas apenas nas an?lises de correla??o com as vari?veis referentes ? arquitetura de planta. A partir destes dados realizaram-se an?lises de vari?ncia, correla??es, estima??o de par?metros gen?ticos e an?lises da diversidade. Apenas a vari?vel n?mero de ramos a 50 cm (NR50) n?o foi estatisticamente diferente entre as prog?nies avaliadas. As vari?veis ALT, DCO, NBI, NRAcmab, NRAbmab, SCR e APL apresentaram maior influ?ncia gen?tica em detrimento da ambiental, o que justifica a sele??o nestas caracter?sticas. A produ??o de gr?os por planta (PGP) teve baixa correla??o com todas as vari?veis analisadas, sendo que SCR e NRAcmab apresentaram os maiores valores, respectivamente de 0,24 e 0,20. A diversidade gen?tica estimada entre fam?lias foi mediana, variando entre 0,4 e 0,6. A diversidade dentro de fam?lias foi mediana a baixa, havendo fam?lias com estimativas superiores a 0,6 e inferiores a 0,4, respectivamente, para as fam?lias 858, 355 e 869, e 346, 383 e 872. O n?mero de bifurca??es (NBI), a ?rea plana da planta (APL) e o somat?rio do comprimento dos ramos (SCR) foram as caracter?sticas mais importantes na estima??o da diversidade no presente trabalho, com a contribui??o de respectivamente 30,55%, 22,29% e 10,65%. A fam?lia 872 apresentou aspectos favor?veis relacionados ? arquitetura de plantas, como m?dia alta no n?mero de bifurca??es (NBI), bem como, de forma geral, a maior dist?ncia gen?tica entre as demais fam?lias. Portanto, mediante avalia??o pr?via para comprova??o do potencial produtivo, gen?tipos da fam?lia 872 poder?o ser envolvidos em cruzamentos quando se pretende explorar a heterose na cultura.
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Caracteriza??o citogen?tica e morfoagron?mica de acesso de Stylosanthes spp. (Fabaceae ? Papilionoideae) coletados no Nordeste brasileiro

Lira, Irlane Cristine de Souza Andrade 27 February 2015 (has links)
Submitted by Verena Bastos (verena@uefs.br) on 2015-08-04T00:07:37Z No. of bitstreams: 1 dissertacao.RGV.2015.1.pdf: 1835460 bytes, checksum: 8d5b6650247801f1f7f07285b2eedfe0 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-08-04T00:07:37Z (GMT). No. of bitstreams: 1 dissertacao.RGV.2015.1.pdf: 1835460 bytes, checksum: 8d5b6650247801f1f7f07285b2eedfe0 (MD5) Previous issue date: 2015-02-27 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior - CAPES / Searches related to evaluation and selection of native forages can contribute to improvement in feeding cattle in the Brazilian semiarid region, highlighting the Stylosanthes gender as an important source of forage species with great potential. This study aimed to perform morphoagronomic and cytogenetics Stylosanthes accessions, to contribute to studies that promote the inclusion of this legume in animal feed, seeking to characterize and select superior genotypes, and also select important in the characterization of germplasm of the species. To characterize morphoagronomic were evaluated 19 descriptors and of these, four were immediately discarded for not having variability among accessions, with the statistical analysis performed in the remaining 15 descriptors. The data were submitted to univariate and multivariate analyzes. Analysis of variance was performed only in quantitative descriptors NRP, CHP, Lfo, Cfo, ECAA, ECAS and CP, as to the qualitative descriptors CC, AC, PC, HC, CF, AF, PF and FF, descriptive analysis was performed. For cytogenetic characterization were obtained root tips used seed access Stylosantes 17, following the method described by War and Souza (2002). Scott and Knott test was performed for the grouping of averages, the descriptors were significant at (p ? 0.01) which allowed the formation of two groups, multivariate analysis was also performed by calculating the Mahalanobis distance using the method original Tocher, there is the formation of two groups. Group 1 consisted of 42 accesses and the group 2 only through access CPAC 4955. We observed the formation of four groups where the dendrogram also be noted that only the access CPAC 4955 did not group with any other access. This access, for long leaves that too, very thick stem and lack of body hair on the sheets. The descriptors evaluated by Singh test is observed that the main contributors to the diversity of genotypes were CP (11,64%) and NRP (10,98%) followed by HC (8,62%) and FF (8, 44%). By cytogenetic analysis were observed hits with 2n = 20 and 2n = 40 chromosomes, allowing differentiation of species S. scabra of S. seabrana with interphase nucleus of semirreticulado type, symmetrical karyotype with chromosome morphology ranging from the metacentric submetac?ntrica and size Average chromosomal around 2,5 microns. Differences were observed in the average length of the chromosomes and the total length of the genome. The analysis with double staining CMA3/DAPI enabled visualization of four CMA+ blocks, two CMA + blocks in subterminal region of the short arm of a chromosome pair submetacentric, and two blocks located in the proximal region of another metacentric pair in S. scabra, and still two blocks in the subterminal region of a metacentric pair in S. seabrana access. It was also possible to visualize DAPI and CMA+ bands in access CPAC 1261 and CPAC 5205. The accessions in this study were, in general, plants with semiereto growth habit, leaves with dark green color and hairiness, stem mostly quite branched. The differential staining of chromosomes, together with other cytogenetic markers, assists in characterizing germplasm collections access Stylosanthes spp. It was observed that there is genetic variability among the accessions studied the collection of Stylosanthes Embrapa Semi-Arid. / Pesquisas relacionadas a avalia??o e sele??o de forrageiras nativas podem contribuir para melhoria na alimenta??o dos rebanhos do Semi?rido brasileiro, destacando-se o g?nero Stylosanthes como uma importante fonte de esp?cies com grande potencial forrageiro. O presente trabalho teve por objetivo realizar caracteriza??o morfoagron?mica e citogen?tica de acessos de Stylosanthes, visando contribuir com estudos que promovam a inser??o desta leguminosa na alimenta??o animal, buscando caracterizar e selecionar gen?tipos superiores, e tamb?m selecionar descritores de import?ncia na caracteriza??o de germoplasma da esp?cie. Para caracteriza??o morfoagron?mica, foram avaliados 19 descritores e destes, quatro foram descartados imediatamente por n?o apresentarem variabilidade entre os acessos, sendo a an?lise estat?stica realizada nos 15 descritores restantes.Os dados foram submetidos ? an?lisesunivariadas e multivariadas. Foi realizada a an?lise de vari?ncia apenas nos descritores quantitativos NRP, CHP, Lfo, Cfo, ECAA, ECAS e CP, j? para os descritores qualitativos CC, AC, PC, HC, CF, AF, PF e FF, foi realizada analise descritiva. Para a caracteriza??o citogen?tica foram utilizadas pontas de ra?zes obtidas de sementes de 17 acessos de Stylosanthes, seguindo a metodologia descrita por Guerra e Souza (2002). O teste de Scott e Knott foi realizado para o agrupamento de m?dias, os descritores foram significativos a (p ? 0,01) o que possibilitou a forma??o de dois grupos, tamb?m foi realizada analise multivariadas pelo c?lculo da dist?ncia de Mahalanobis,utilizando o m?todo de Tocheroriginal,observa-se a forma??o de dois grupos.O grupo 1foi formado por 42 acessos e o grupo 2 apenas pelo acesso CPAC 4955. Observou-se a forma??o de quatro grupos onde no dendogramaobservar-se tamb?m que apenas o acesso CPAC 4955n?o agrupou com nenhum outro acesso.Este acesso apresentou folhas mais compridas que os demais, caule muito espesso e falta de pilosidade nas folhas. Dos descritores avaliados pelo teste de Singh observa-se que os que mais contribu?ram para a diversidade dos gen?tipos foram CP (11,64%) e NRP (10,98%) seguidos por HC (8,62%) e FF (8,44%). Atrav?s da an?lise citogen?tica observaram-se acessos com 2n=20 e 2n=40 cromossomos, permitindo a diferencia??o das esp?cies S. scabra da S. seabrana, com n?cleo interf?sico do tipo semirreticulado, cari?tipo sim?trico com morfologia cromoss?mica variando de metac?ntrica a submetac?ntrica e tamanho cromoss?mico m?dio em torno de 2,5 ?m.Foram observadas diferen?as no comprimento m?dio dos cromossomos e no comprimento total do genoma. A an?lise com dupla colora??o CMA3/DAPI permitiu a visualiza??o de quatro blocos CMA+, sendo dois blocos CMA+ localizados na regi?o subterminal do bra?o curto de um par cromoss?mico submetac?ntrico, e dois blocos localizados na regi?o proximal de outro par metac?ntrico em S. scabra, e ainda dois blocos na regi?o subterminal de um par metac?ntrico nos acessos de S. seabrana.Tamb?m foi poss?vel a visualiza??o de bandas DAPI+ e CMA- nos acessos CPAC 1261 e CPAC 5205.Os acessos avaliados neste estudo apresentaram,em geral,plantas com h?bito de crescimento semiereto, folhas com colora??o verde escura e com pilosidade, caule em sua maioria bastante ramificado. A colora??o diferencial de cromossomos, associados a outros marcadores citogen?ticos, auxilia na caracteriza??o de acessos de cole??es de germoplasma de Stylosanthes spp.Observou-se que h? variabilidade gen?tica entre os acessos estudados da cole??o de Stylosanthes da Embrapa Semi?rido.
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Caracteriza??o morfol?gica e molecular de gen?tipos de batata-doce / Molecular and morphological characterization of genotypes of sweet potato

Andrade, Elis?ngela Knoblauch Viega de 24 October 2014 (has links)
Submitted by Rodrigo Martins Cruz (rodrigo.cruz@ufvjm.edu.br) on 2016-01-05T12:38:46Z No. of bitstreams: 2 elisangela_knoblauch_viega_andrade.pdf: 1007346 bytes, checksum: 82e99aa23997633aaed7026a8489fe65 (MD5) license_rdf: 22974 bytes, checksum: 99c771d9f0b9c46790009b9874d49253 (MD5) / Approved for entry into archive by Rodrigo Martins Cruz (rodrigo.cruz@ufvjm.edu.br) on 2016-01-05T17:44:56Z (GMT) No. of bitstreams: 2 elisangela_knoblauch_viega_andrade.pdf: 1007346 bytes, checksum: 82e99aa23997633aaed7026a8489fe65 (MD5) license_rdf: 22974 bytes, checksum: 99c771d9f0b9c46790009b9874d49253 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-01-05T17:44:56Z (GMT). No. of bitstreams: 2 elisangela_knoblauch_viega_andrade.pdf: 1007346 bytes, checksum: 82e99aa23997633aaed7026a8489fe65 (MD5) license_rdf: 22974 bytes, checksum: 99c771d9f0b9c46790009b9874d49253 (MD5) Previous issue date: 2014 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Cient?fico e Tecnol?gico (CNPq) / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior (Capes) / Funda??o de Amparo ? Pesquisa do estado de Minas Gerais (FAPEMIG) / Objetivou-se realizar a caracteriza??o morfol?gica e molecular de gen?tipos de batata-doce do banco de germoplasma da Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri (UFVJM). Para a caracteriza??o morfol?gica, o experimento foi conduzido no Setor de Olericultura da UFVJM sendo avaliados 60 gen?tipos de batata-doce, utilizando 24 descritores morfol?gicos, tanto da parte a?rea quanto da parte radicular. As avalia??es da parte a?rea foram realizadas 60 e 90 dias ap?s o plantio, e as avalia??es da parte radicular foram realizadas ap?s a colheita aos 150 dias ap?s o plantio. Para a caracteriza??o molecular foram utilizadas amostras foliares de 60 acessos oriundos do banco de germoplasma-UFVJM. A extra??o do DNA foi realizada no Laborat?rio de Gen?tica e Biotecnologia Florestal (UFVJM), utilizando o m?todo Fenol-Clorof?rmio. Para a amplifica??o do DNA, foram utilizados onze primers microssat?lites espec?ficos para a batata-doce. A diversidade morfol?gica e molecular foi obtida por meio da gera??o de matrizes de dissimilaridade baseando-se no coeficiente de coincid?ncia simples e ?ndices de Jaccard, respectivamente. Para o estudo da diverg?ncia recorreu-se ao dendrograma ilustrativo obtido pelo m?todo UPGMA e ao agrupamento de Tocher. Para as matrizes de dissimilaridade obtida com os dados morfol?gicos e moleculares foram estimadas dist?ncias gen?ticas variando de 0,08 a 0,92 com m?dia 0,52 e 0,14 a 1, com m?dia 0,76, respectivamente. Observou-se pelos dendrogramas de dissimilaridade e pelo agrupamento de Tocher, que os acessos de batata-doce do banco de germoplasma da UFVJM apresentaram diversidade gen?tica e fenot?pica, sendo promissores em programas de melhoramento desta cultura. / Disserta??o (Mestrado) ? Programa de P?s-Gradua??o em Produ??o Vegetal, Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri, 2014. / ABSTRACT The objective was to make the morphological and molecular characterization of sweet potato genotypes of the germplasm bank of the Federal University of the Jequitinhonha and Mucuri Vales (UFVJM). For morphological characterization, the experiment was conducted in the Horticulture Sector of UFVJM being evaluated 60 sweet potato genotypes, using 24 morphological descriptors of both the shoots as the root part. The shoot evaluations were performed 60 and 90 days after planting, and ratings of roots were done after harvest at 150 days after planting. The molecular characterization leaf samples from 60 hits coming from the germplasm bank-UFVJM were used. DNA extraction was performed in Forest Genetics and Biotechnology Laboratory (UFVJM) using the phenol-chloroform method. For amplification of DNA eleven microsatellite primers specific for the sweet potato were used. The morphological diversity and Molecular was obtained by generating dissimilarity matrices based on the simple matching coefficient of Jaccard indices, respectively. To study the divergence appealed to the illustrative dendrogram by UPGMA and Tocher grouping. For dissimilarity matrices obtained with morphological and molecular data were estimated genetic distances ranging from 0,08 to 0,92 with a mean 0,52 and 0,14 to 1, with mean 0,76, respectively. It was observed by dendrograms of dissimilarity and the Tocher group, the sweet potato accessions of germplasm bank of UFVJM showed genetic and phenotypic diversity, and promising in breeding programs of this culture.
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Filogeografia, hotspots evolutivos e conserva??o ao longo da diagonal de forma??es abertas da Am?rica do Sul

Fonseca, Emanuel Masiero da 16 February 2017 (has links)
Submitted by Automa??o e Estat?stica (sst@bczm.ufrn.br) on 2017-06-02T22:29:36Z No. of bitstreams: 1 EmanuelMasieroDaFonseca_DISSERT.pdf: 3761177 bytes, checksum: 9cdc6a52b6e1ddc96b241581dd9f53d7 (MD5) / Approved for entry into archive by Arlan Eloi Leite Silva (eloihistoriador@yahoo.com.br) on 2017-06-08T22:43:43Z (GMT) No. of bitstreams: 1 EmanuelMasieroDaFonseca_DISSERT.pdf: 3761177 bytes, checksum: 9cdc6a52b6e1ddc96b241581dd9f53d7 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-08T22:43:43Z (GMT). No. of bitstreams: 1 EmanuelMasieroDaFonseca_DISSERT.pdf: 3761177 bytes, checksum: 9cdc6a52b6e1ddc96b241581dd9f53d7 (MD5) Previous issue date: 2017-02-16 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Cient?fico e Tecnol?gico (CNPq) / Desvendar os processos e mecanismos envolvidos na gera??o e manuten??o da biodiversidade, atrav?s do tempo e espa?o, ? uma das quest?es centrais da biogeografia. O acesso as informa??es gen?ticas das esp?cies, conjuntamente com o progresso conceitual, metodol?gico e computacional t?m revolucionado a compress?o dos processos evolutivos. Como resultado, a reconstru??o da hist?ria evolutiva das esp?cies e o teste de hip?teses de diversifica??o (e.g. ref?gios, barreiras f?sicas, tempo de diversifica??o) t?m sido poss?vel em um n?vel de refinamento que outrora era irrealiz?vel. A diagonal de forma??es abertas da Am?rica do Sul estende-se de nordeste a sudoeste do continente e engloba tr?s grandes biomas: Caatinga, Cerrado e Chaco. Historicamente considerados biomas pobres e sem uma identidade evolutiva, tais regi?es tem testemunhado uma mudan?a de paradigma devido ao aumento das pesquisas e, atualmente, s?o consideradas dom?nios com uma expressiva riqueza, endemismo e hist?rias evolutivas ?nicas. Entretanto, o modo e o tempo de diversifica??o da fauna ao longo dessa regi?o ainda s?o um tanto quanto elusivos e o debate continua aberto. Essa disserta??o est? dividida em dois cap?tulos. (i) O primeiro, atrav?s de uma abordagem filogeogr?fica, testou os efeitos de eventos hist?ricos na diversifica??o ao longo da diagonal de forma??es abertas, utilizando o lagarto Polychrus acutirostris como modelo de estudo. A fim de alcan?ar tal objetivo n?s inferimos a estrutura populacional, as rela??es filogen?ticas entre as linhagens, a diversidade intraespec?fica, os padr?es de migra??o, a demografia e a hist?ria de difus?o espa?o-temporal. Finalmente, n?s testamos 12 cen?rios de diversifica??o usando computa??o Bayesiana aproximada (ABC). N?s recuperamos tr?s linhagens espacialmente estruturadas distribu?das na Caatinga, nordeste do Cerrado e sudoeste do Cerrado. A diversifica??o dessas linhagens ocorreu no Neogeno e foi marcada por um complexo cen?rio envolvendo diverg?ncia simult?nea, precoces est?gios de difus?o, um padr?o de migra??o sim?trico entre as linhagens vizinhas, mudan?as do tamanho efetivo populacional e efeitos distintos de barreiras f?sicas e ambientais. (ii) O objetivo do segundo cap?tulo foi identificar ?reas na Caatinga onde a diversidade gen?tica est? espacialmente concentrada (Evolutionary Hotspots) e propor ?reas que devam ser protegidas a fim de que a hist?ria evolutiva dessas regi?es n?o seja apagada. Com esse prop?sito, n?s utilizamos dados mitocondriais dispon?veis de seis esp?cies animais amplamente distribu?das na Caatinga, compreendendo: tr?s esp?cies de lagartos, uma de anf?bio e uma de aranha. N?s geramos, atrav?s de um m?todo de interpola??o, uma superf?cie de diversidade para cada esp?cie. Finalmente, as superf?cies de diversidade gen?tica de todas as esp?cies foram somadas a fim de determinar ?reas com alta diversidade gen?tica. No geral, as por??es sul, central e noroeste da Caatinga foram as regi?es com maiores valores de diversidade gen?tica. Entretanto, tais ?reas encontram-se fracamente protegidas por meio de unidades de conserva??o, o que ? um padr?o geral para a Caatinga. Os resultados apresentados nesse estudo real?am a complexidade da hist?ria evolutiva dentro da diagonal de forma??es abertas. Al?m disso, identificamos regi?es geneticamente diversas na Caatinga que s?o, portanto, de extrema import?ncia para conserva??o. / One of the main goals of biogeography is to unveil the processes and mechanisms involved on the generation and maintenance of biodiversity over time and space. Accessing species? genetic information, coupled with conceptual, methodological, and computational advances have revolutionized the comprehension of evolutionary process. These advances have enabled reconstructing the evolutionary history of species and testing diversification hypotheses (e.g. refugee, physical barriers, diversification time) in a refinement level that once was unfeasible. The diagonal of open formations stretches from northeast to southwest South America, encompassing three biomes: Caatinga, Cerrado, and Chaco. Historically considered speciespoor biomes with no evolutionary identity, these regions have witnessed a change in paradigm due to increase of research and, currently, are recognized as holding high levels of richness, endemism, and unique evolutionary histories. However, tempo and mode of fauna diversification throughout this region are still poorly known and the debate remains largely open. This dissertation is composed of two chapters. (i) In the first one, we used a phylogeography approach to test the effects of historical events on the diversification throughout the diagonal of open formations using the lizard Polychrus acutirostris as study model. In order to reach this goal, we inferred population structure, phylogenetic relationships between lineages, intraspecific genetic diversity, migration patterns, demography and the spatio-temporal diffusion history. Finally, we tested 12 diversification scenarios using approximate Bayesian computation (ABC). We recovered three non-overlapping lineages that are spatially structured in the Caatinga, northeastern Cerrado, and southwestern Cerrado. Diversification among lineages took place during the Neogene and was associated to a complex scenario involving simultaneous divergence, early stages of diffusion, symmetrical pattern of migration between neighbor lineages, distinct effects of physical and environmental barriers. (ii) The second chapter aimed to identify areas in the Caatinga biome where the genetic diversity is spatially restricted (Evolutionary Hotspots) and propose areas that should be protected in order to maintain the evolutionary history of those areas. For this purpose, we used available mitochondrial data for six animal species widely distributed in the Caatinga, including: three lizard species, one amphibian and one spider. We used an interpolation method to generate a genetic diversity surface for each species. Finally, we overlapped the genetic diversity surfaces of all species to determine areas that concentrate high genetic diversity. In general, southern, central and northwestern portions of Caatinga harbor the highest values of genetic diversity, despite being poorly represented within protected areas. Our results highlight the complex evolutionary history within the diagonal of open formations. Besides, we identified genetically diverse areas within the Caatinga that are of utmost importance for biodiversity conservation.
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Eugenismo e sele??o gen?tica : a diversidade gen?tica humana como bem jur?dico-penal supraindividual

Conti, Paulo Henrique Burg 21 August 2017 (has links)
Submitted by PPG Ci?ncias Criminais (ppgccrim@pucrs.br) on 2017-10-31T11:44:46Z No. of bitstreams: 1 PAULO CONTI - Tese completa.pdf: 2609075 bytes, checksum: 97290ff28a48f55a05a3800950e6fc85 (MD5) / Approved for entry into archive by Caroline Xavier (caroline.xavier@pucrs.br) on 2017-11-10T11:50:34Z (GMT) No. of bitstreams: 1 PAULO CONTI - Tese completa.pdf: 2609075 bytes, checksum: 97290ff28a48f55a05a3800950e6fc85 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-11-10T11:54:31Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PAULO CONTI - Tese completa.pdf: 2609075 bytes, checksum: 97290ff28a48f55a05a3800950e6fc85 (MD5) Previous issue date: 2017-08-21 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior - CAPES / The main purpose of this work is to demonstrate that human genetic diversity constitutes a supraindividual interest, worthy of legal and criminal protection. Thus, in order to achieve this goal, a methodology of a deductive nature is used and a study of an interdisciplinary nature is carried out, encompassing several areas of knowledge: History, Biomedical Sciences, Bioethics and Criminal Sciences, with a special focus on Criminal Law. At first, the work seeks to determine that the use of modern genetic and reproductive technologies applied to the human being, cannot be based on an eugenics ideology of discriminatory character. Subsequently, in the bioethical analysis, the study aims to establish, as a support for the problematic scenario presented, a theoretical model based on the following principles: life, responsibility, and biomedical ethics (hierarchical). In the end, with the support of Constitutional Law and Criminal Law dogmatic, the thesis aims to determine that the sex selection and/or human genetic characteristics, in the non-therapeutic standpoint, violates constitutional principles and grounds the legitimation of legal and criminal intervention for the protection of human genetic diversity. / Este trabajo tiene como objetivo principal demostrar que la diversidad gen?tica humana constituye bien supraindividual, digno de tutela jur?dico-penal. As?, con el fin de alcanzar dicho objetivo, se utiliza una metodolog?a de car?cter deductivo y se realiza un estudio de naturaleza interdisciplinar que engloba diversas ?reas del conocimiento: Historia, Ciencias Biom?dicas, Bio?tica y Ciencias Criminales, con especial enfoque en el Derecho Penal. En un primer momento, el trabajo busca determinar que la utilizaci?n de las modernas tecnolog?as gen?ticas y reproductivas, aplicadas al ser humano, no puede estar fundamentada en una ideolog?a eugen?sica de car?cter discriminatorio. Posteriormente, adentr?ndose en el an?lisis bio?tico, el estudio pretende establecer, como sostenimiento para el escenario problem?tico presentado, un modelo te?rico pautado en los siguientes principios: vida, responsabilidad y ?tica biom?dica (jerarquizada). Al final, con el auxilio del Derecho Constitucional y de la dogm?tica del Derecho Penal, la tesis objetiva determinar que la selecci?n de sexo y/o de caracter?sticas gen?ticas humanas, en la direcci?n no terap?utica, atenta contra principios constitucionales y fundamenta la legitimaci?n de la intervenci?n jur?dico-penal para la tutela de la diversidad gen?tica humana. / Este trabalho possui como objetivo principal demonstrar que a diversidade gen?tica humana constitui bem supraindividual, digno de tutela jur?dico-penal. Assim, no intuito de alcan?ar o referido objetivo, utiliza-se uma metodologia de car?ter dedutivo e realiza-se um estudo de natureza interdisciplinar que engloba diversas ?reas do conhecimento: Hist?ria, Ci?ncias Biom?dicas, Bio?tica e Ci?ncias Criminais, com especial enfoque no Direito Penal. Num primeiro momento, o trabalho procura determinar que a utiliza??o das modernas tecnologias gen?ticas e reprodutivas, aplicadas ao ser humano, n?o pode estar fundamentada numa ideologia eugenista de car?ter discriminat?rio. Posteriormente, adentrando-se na an?lise bio?tica, o estudo visa estabelecer, como sustent?culo para o cen?rio problem?tico apresentado, um modelo te?rico pautado nos seguintes princ?pios: vida, responsabilidade e de ?tica biom?dica (hierarquizada). Ao fim, com o aux?lio do Direito Constitucional e da dogm?tica do Direito Penal, a tese objetiva determinar que a sele??o de sexo e/ou de caracter?sticas gen?ticas humanas, no vi?s n?o terap?utico, atenta contra princ?pios constitucionais e fundamenta a legitima??o da interven??o jur?dico-penal para a tutela da diversidade gen?tica humana.
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Uso sustent?vel da Copernicia prunifera (Miller) H. E Moore no semi?rido potiguar: valoriza??o de saberes e conserva??o dos recursos gen?ticos

Sousa, Rodrigo Ferreira de 28 March 2014 (has links)
Made available in DSpace on 2014-12-17T14:17:53Z (GMT). No. of bitstreams: 1 RodrigoFS_DISSERT.pdf: 1032742 bytes, checksum: 297b239b5ca1673f55e18c42d7327117 (MD5) Previous issue date: 2014-03-28 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior / Copernicia prunifera (Arecaceae), popularmente conhecida como carna?ba, ? nativa da regi?o nordeste do Brasil, com ocorr?ncia ao longo das margens de rios e ?reas alagadi?as. Por ser vers?til em rela??o ?s formas de usos, essa palmeira ficou conhecida como ?rvore da vida , sendo o p? cer?fero o principal produto extra?do da C. prunifera. Este estudo teve como objetivos investigar aspectos etnoecol?gicos e etnobot?nicos da C. prunifera em uma comunidade extrativista, selecionar primers ISSR (Inter Simple Sequence Repeat) para estudos de gen?tica de popula??es, e estudar a diversidade e a estrutura gen?tica de uma popula??o natural no Estado do Rio Grande do Norte, Brasil. Foram entrevistados 11 moradores considerados informantes-chaves na regi?o de Ipangua?u/RN, onde 73% dos informantes relataram a ocorr?ncia de um morfotipo diferente de carna?ba, conhecida como carna?ba branca . Dos entrevistados, 82% afirmaram que a esp?cie possui dispers?o realizada por morcegos. Na etnobot?nica, o p? cer?fero foi citado por todos como o produto mais importante extra?do da C. prunifera e a folha a parte mais usada (45%), seguida dos frutos (29%), caule e raiz (ambas com 13%). Na sele??o de primers ISSR, dos 17 que foram testados, 12 amplificaram o DNA e, destes, sete foram selecionados para caracterizar a estrutura gen?tica de 37 indiv?duos remanescentes. O primer que obteve a maior porcentagem de locos polim?rficos (LP%) foi UBC 841 (16,36%), j? o primer que teve a menor LP% foi UBC 827 (8,18%). No estudo de diversidade e estrutura gen?tica dos indiv?duos de uma popula??o natural (regenerantes = 62, jovens = 20, adultos = 19) foram utilizados sete iniciadores ISSR que permitiram a visualiza??o de 93 locos, com 100% de polimorfismo. Os regenerantes foram os que mais se destacaram em rela??o ? diversidade gen?tica (He = 0,411 e Ho = 0,599), seguido pelos jovens (He = 0,394 e Ho = 0,579) e adultos (He = 0,267 e Ho = 0,427). A AMOVA mostrou que a maior varia??o gen?tica ocorre dentro dos est?gios de vida (93,42%) quando comparado entre eles (6,58%). O dendograma (UPGMA), com base na identidade gen?tica de Nei, mostrou maior semelhan?a genot?pica entre os jovens e regenerantes (0,979). No teste de hip?tese para o gargalo gen?tico (bottleneck) foi observado elevado n?mero de locos com excesso de heterozigosidade para os dois modelos utilizados (IAM = 92 e SMM = 91), indicando redu??o do tamanho efetivo populacional. Todos os est?gios de desenvolvimento apresentaram estrutura??o gen?tica espacial (EGE), com valores de coancestrias positivos e significativos, sendo os valores de Sp de 0,04 para os regenerantes, 0,093 para os jovens, 0,15 para os adultos e 0,53 para a popula??o geral. Essa EGE ocorre, provavelmente, devido ? dispers?o restrita de sementes
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Coleta, caracteriza??o e avalia??o preliminar de acessos de Stylosanthes spp.

Oliveira, Ronaldo Sim?o de 31 January 2015 (has links)
Submitted by Ricardo Cedraz Duque Moliterno (ricardo.moliterno@uefs.br) on 2016-07-11T23:39:34Z No. of bitstreams: 1 Tese-Ronaldo SOliveira_2015.pdf: 1819214 bytes, checksum: da69b4c584e3e9304788bb2b45091d51 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-07-11T23:39:34Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Tese-Ronaldo SOliveira_2015.pdf: 1819214 bytes, checksum: da69b4c584e3e9304788bb2b45091d51 (MD5) Previous issue date: 2015-01-31 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior - CAPES / The aim of this work was to organize a Forage Germplasm Bank in the State University of Feira de Santana-BA (BGF-UEFS), to carry out a survey of the occurrence of species of Stylosanthes and do pre-breeding studies in a sample of accessions collected in the Semiarid of Bahia from 2008 and 2014. Five collection expeditions in different Semiarid regions of the State was done as an attempt to rescue the maximum genetic variability available. For the pre-breeding work, 25 accessions of Stylosanthes plus a control were utilized. The methods of analysis of variance (ANOVA) and Restricted Maximum Likelihood/Best Linear Unbiased Prediction (REML/BLUP) were used. The genetic parameters were estimated in order to choose the most precise method to select the best individuals for a breeding program. Finally, it was studied the genetic diversity in order to choose the best combinations to develop segregating populations in a breeding program of Stylosanthes. In total, 225 accessions of Stylosanthes spp. were rescued in the state of Bahia, being 61 from de Northeast of the state, 58 from the Mid North, 59 from S?o Francisco Valley, 24 from the Mid South and 23 from the Far West. The estimates of the genetic parameters showed that the methods (ANOVA and REML/BLUP) presented divergent values. The REML/BLUP estimated the genetic values with better accuracy, increased the efficiency of selection and therefore decreased the cost of a given breeding program that has the objective to increase the mass production in Stylosanthes. In a sample of the analyzed accessions, four species were found (S. scabra, S. humilis, S. viscosa and S. capitata). Genetic variability among the accessions and the clusters of Tocher and UPGMA were basically defined by the botanical species and some of them were superior for mass production (BGF08-16 and BGF06-15) and for forage quality (BGF08- 006 and BGF08-007). / O objetivo deste trabalho foi organizar um Banco de Germoplasma de Forrageiras da Universidade Estadual de Feira de Santana, BA (BGF-UEFS), realizar o levantamento da ocorr?ncia de esp?cies do g?nero Stylosanthes e conduzir um estudo de Pr?-melhoramento em uma amostra de acessos coletados no Semi?rido baiano entre os anos de 2008 a 2014. Foram realizadas cinco expedi??es de coleta em diferentes regi?es do Estado procurando resgatar o m?ximo da variabilidade gen?tica dispon?vel. Para os estudos de pr?-melhoramento foram utilizados 25 acessos de Stylosanthes mais uma testemunha. Por meio dos m?todos de an?lise de vari?ncia (ANOVA) e M?xima Verossimilhan?a Restrita/Melhor Predi??o Linear n?o Viesada (REML/BLUP) foram estimados os par?metros gen?ticos, procurando indicar qual o m?todo mais preciso na sele??o dos melhores indiv?duos para um programa de melhoramento. Por fim, realizou-se o estudo da diversidade gen?tica no intuito de indicar as melhores combina??es para formar as popula??es segregantes do programa de melhoramento gen?tico dessa forrageira. Foram resgatados 225 acessos de Stylosanthes spp. de cinco mesorregi?es da Bahia, dos quais 61 foram do Nordeste baiano, 58 do Centro Norte baiano, 59 oriundos do Vale S?o Franciscano da Bahia, 24 resgatados no Centro Sul Baiano e 23 acessos no extremo Oeste Baiano. A estimativa dos par?metros gen?ticos mostrou que os m?todos (ANOVA e REML/BLUP) apresentaram valores divergentes sendo que o REML/BLUP estima os valores gen?ticos com maior acur?cia, aumenta a efici?ncia da sele??o e consequentemente diminui os custos dos programas de melhoramento gen?tico que objetivam aumentar a produ??o de massa em Stylosanthes. Em uma amostra de acessos analisada foram identificadas quatro esp?cies (S. scabra, S. humilis, S. viscosa e S. capitata). Foi observada variabilidade gen?tica entre os acessos avaliados e os agrupamentos de Tocher e UPGMA foram definidos quase que pela identifica??o bot?nica das esp?cies, sendo que os acessos BGF08-16 e BGF06-15 se mostraram superiores para produ??o de massa e os acessos BGF08- 006 e BGF08-007 para a qualidade de forragem.

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