Made available in DSpace on 2014-06-11T19:24:13Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-07-31Bitstream added on 2014-06-13T20:12:11Z : No. of bitstreams: 1 000736043.pdf: 9515334 bytes, checksum: 57677252bfcdb7d8d15c132edf0fd749 (MD5) / A mancha preta dos frutos cítricos, causada pelo fungo Phyllosticta citricarpa afeta quase todas as espécies de citros, provocando problemas em sua comercialização. Sua principal medida de controle é através da utilização de fungicidas, porém devido aos impactos causados por estes, técnicas alternativas foram consideradas, como por exemplo, o controle biológico. Dessa forma, neste trabalho, avaliou-se a atividade antagônica, a produção de enzimas hidrolíticas e o efeito de metabólitos voláteis, termoestáveis e livres de células produzidos por setenta isolados de Bacil/us spp. sobre o desenvolvimento micelial de Phyllosticta citricarpa. No pareamento, fungo e bactéria foram cultivados juntos e o mesmo para a produção de compostos voláteis, porém, utilizando placas de Petri bipartidas. Para a produção de compostos termoestáveis e livres de células, uma alíquota de meio cultivado com a bactéria foi adicionada ao meio de cultura e submetido à autoclavagem. Outra alíquota foi filtrada em membrana millipore e adicionada ao meio fundente. Após vertidos e solidificados os meios, discos do patógeno foram transferidos para o centro das placas e, após incubação realizou-se a medição das colônias do fungo em dois sentidos perpendiculares. No pareamento, sessenta e nove isolados de Bacil/us spp. proporcionaram mais de 25% de inibição e para os metabólitos voláteis, vinte e sete isolados da bactéria mostraram ser capazes de controlar significativamente o desenvolvimento do fungo. Todos os isolados de Bacil/us spp. produziram substâncias antifúngicas que suportaram a autoclavagem e proporcionaram até 98% de inibição e sessenta e nove isolados produziram metabólitos livres de células em quantidades suficientes para inibir o desenvolvimento do fungo... / The black spot of citrus caused by the fungus Phyllosticta citricarpa affects almost all citrus species, causing problems in their marketing. lt can be primarily controlled through the use of fungicidas, but due to impacts caused by these, alternativa techniques have been considered, such as biological control. ln this study, we have therefore evaluated the antagonistic activity, the production of hydrolytic enzymes and the effect of volatile, thermostable and free of cells metabolites, produced by seventy isolates of Bacillus spp. on mycelial growth of Phyllosticta citricarpa. ln the pairing, fungus and bacteria were grown together; the sarne was implemented for the production of volatile compounds, however, using bipartite Petri dishes. For the production of thermostable compounds, free of cells, an aliquot of the cultured medium with the bacterium was added to the cultura medium and subjected to autoclaving. Another aliquot was filtered through a millipore membrana and added to the melting medium. After the media were poured and solidified, the pathogen discs were transferred to the center of the plates and, after incubation the measurement of fungai colonies was made in two perpendicular directions. ln pairing, sixty-nine isolates of Bacillus spp. provided more than 25% inhibition and for the volatile metabolites, twenty seven different strains were shown to be capable of controlling fungai growth significantly. All isolates of Bacil/us spp. produced antifungai substances which sustained the autoclave and provided up to 98% inhibition and sixty-nine strains produced metabolites free of cells in amounts sufficient to inhibit the growth of the fungus...

A broca da erva-mate, Hedypathes betulinus (Klug,1825) (Coleoptera, Cerambycidae), constitui-se na principal praga da cultura, devido aos danos causados a ela. A larva constrói galerias no interior dos galhos, troncos e raízes, prejudicando a circulação normal da seiva e ocasionando o depauperamento da planta. A Norma Técnica Higiênico Sanitária para a erva-mate, proíbe a utilização de produtos químicos durante a manipulação e armazenagem. O mercado externo é rigoroso, não permitindo a entrada de produto que contenha resíduos químicos, restando como alternativa o controle biológico da praga. Por essa razão, foi estudada a patogenicidade de cinco linhagens de Beauveria bassiana (Sals.) Vuill., em H betulinus. Os experimentos de patogenicidade do fungo B. bassiana em laboratório foram executados em insetos adultos e larvas, coletados no campo. Os resultados de mortalidade corrigida destes, em laboratório, foram de 69,62; 66,82; 60,00; 56,61 e 37,28 %, para as linhagens 152,2629, 447, 785 e 212, respectivamente e TL50 de 9,39; 10,57; 9,00; 8,68 e 7,65 dias. Em larvas, foi testada a linhagem 152 a qual se mostrou mais promissora para adultos em laboratório, obtendo-se uma eficiência de 93,02 % de mortalidade corrigida das larvas e TL50 de 9,3-9 dias. Também realizaram-se experimentos no campo, em adultos do inseto, com as linhagens que apresentaram melhores resultados em laboratório. A linhagem 152, em campo, provocou mortalidade de 14% e TL50 de 27,15 dias, na concentração 5 X 10^6 conídios/ml, e de 22,00%, na concentração 5 X 10^7 conídios/ml e TL50 de 25,21 dias. Estatisticamente, não houve diferença significativa entre as concentrações. As linhagens 152, 447 e a testemunha, no experimento de campo apresentaram mortalidade de 2,00, 34,00 e 4,00%, na concentração de 2,76 x 10^7 conídios/ml respectivamente. A linhagem 447 apresentou TL50 de 17,14 dias. No campo a linhagem 447 se mostrou mais promissora. Foi detectado um parasitóide de larva de H. betulinus, da ordem Hymenoptera, do gênero Labena sp.

Uma das espécies mais utilizadas na arborização de Curitiba é o ipê-amarelo, Tabebuia chrysotricha (Mart, ex DC.) Standl. Em 1998, alguns problemas foram verificados em árvores de ipè-amarelo, em vias públicas de Curitiba, como a floração irregular e a pequena quantidade de frutificação. Para explicar este fato, algumas hipóteses foram formuladas: mudanças climáticas, estresse, idade das árvores e a ocorrência de doenças. Este estudo foi realizado para conhecer as principais doenças do ipê-amarelo, na cidade de Curitiba. Fez-se a patologia das sementes e a análise das doenças de mudas em viveiro e de árvores urbanas. As sementes apresentaram fungos potencialmente patogênicos como Fusarium, Alternaria, Phomopsis e Phoma. As doenças em mudas e árvores de rua foram a crostamarrom causada por Apiosphaeria guaranitica, o oídio e a fumagina. A principal doença em árvores de ruas foi a crosta-marrom, com maior incidência e severidade em locais com alto trafego de veículos.

Made available in DSpace on 2016-12-09T13:52:22Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-01-30. Added 1 bitstream(s) on 2016-12-09T13:55:27Z : No. of bitstreams: 1 000872895.pdf: 2530449 bytes, checksum: b7b0839ed7ed72df3a453cac568f274c (MD5) / A cultura do eucalipto é uma das mais importantes do Brasil, constituindo-se em fonte de energia e madeira renovável, suportando importantes processos agroindustriais, dentre eles, a produção de celulose, papel e essências. O eucalipto, como outras espécies vegetais, é infectado por diversos patógenos, principalmente fungos, desde o viveiro até plantios adultos. Neste trabalho, será estudado o agente causador do cancro basal, Chrysoporthe cubensis. Esta doença possui ampla distribuição geográfica, ocorrendo desde o extremo sul do Estado de São Paulo até a Amazônia, observando-se prejuízos em regiões de baixa altitude de Espírito Santo, do Vale do rio Doce em Minas Gerais e Recôncavo Baiano. Sua sintomatologia é bastante variada, podendo atacar plantas de cinco meses de idade até o final da rotação. As plantas jovens, por apresentarem diâmetros reduzidos, podem ser aneladas na sua base pelo cancro, sendo levadas à morte. Do ataque em plantas mais velhas resultam lesões com pouco ou abundante trincamento até cancros típicos, podendo ser encontrados a diversas alturas do tronco. O local escolhido para a realização do trabalho, foi a área do projeto EUCFLUX, onde estão implantadas parcelas experimentais com 16 materiais genéticos, em diferentes condições de solo e altitude. Os estudos sobre a influência de doenças no acúmulo de biomassa e fixação de carbono são escassos, sendo assim, os objetivos desse trabalho foram: a) verificar a suscetibilidade ao cancro basal dos seis clones com maior produtividade utilizados nas parcelas experimentais do EUCFLUX; b) proceder o estudo espaço-temporal da doença e c) verificar a influência do cancro basal no acúmulo de biomassa e fixação de carbono das plantas atacadas. Foram avaliadas três repetições quanto à incidência da doença, sendo que tais dados formaram a base para a análise espaço-temporal... / Eucalyptus' culture is one of the most important in Brazil being a source of renewable energy and wood. In addition, it supports important agro-industrial processes for the production of pulp, paper and essences. Eucalyptus, like any other plant species, can be infected by many pathogens, especially fungi, from nurseries to adult plantations. In this work, the causal agent of basal canker, Chrysoporthe cubensis, were studied. This disease has a wide geographical distribution, occurring from the southern end of São Paulo State to the Amazon, observing sensitive damages in low-lying regions of Espírito Santo State, Rio Doce Valley in Minas Gerais State and Reconcavo Baiano. Its symptons are quite varied and the fungi can attack plants from five months of age until the end of forest rotation. Young plants with small diameters may be girdled at their base by canker, being put to death. Attack in older plants may result in low or heavy typical cankers, that can be found at different heights of the trunk. The work was conducted in the area of EUCFLUX project, which were established with 16 clones in 10 experimental plots with different soil conditions and elevation. Studies of disease influence in carbon fixation and biomass accumulation are scarce, therefore, the objectives of this work were: a) verify the susceptibility to basal canker of the six clones with higher productivity used in experimental plots of EUCFLUX; b) conduct the spatiotemporal study of the disease and; c) verify the influence of basal canker in the accumulation of biomass and carbon fixation of the attacked plants. Incidence of the disease were evaluated in three plots and these data were the basis for spatiotemporal analysis. To determine biomass parameters, inventory was done in the same three plots and volume and biomass equations were adjusted. In addition, specific gravity of the wood and bark were calculated to healthy ...

Orientador: Edson Luiz Furtado / Resumo: O presente estudo teve como objetivos selecionar isolados de Phytophthora parasitica com alta agressividade em citros, avaliar métodos de inoculação em genótipos quanto à resistência a gomose de Phytophthora e detectar marcadores moleculares ligados a locos controladores de características quantitativas (QTLs) de resistência a gomose. Foram testados 15 isolados de P. parasitica procedentes do Estado de São Paulo. As plantas foram inoculadas por meio de contato, método do disco, inserção sob casca, agulha e palitode- dente infestado com o patógeno. Para o trabalho de detecção de marcadores e QTLs foram inoculados 98 indivíduos de uma progênie F1, obtida do cruzamento entre Citrus sunki, parental suscetível, e Poncirus trifoliata 'Rubidoux', parental altamente resistente ao patógeno. As avaliações fenotípicas da resistência a gomose da progênie foram incorporadas aos mapas de ligação de P. trifoliata 'Rubidoux' e C. sunki, estabelecidos através de 170 marcadores moleculares do tipo RAPD, usando a estratégia de 'pseudo testcross'. Os isolados apresentaram variação na agressividade quando inoculados em C. limon Burmann. e C. limonia Osbeck. com destaque para o isolado, LRS23/97. A avaliação de resistência de genótipos de citros a gomose pode ser realizada em plântulas e 'in vitro', através de inserção de agulha infestada com o patógeno e através do método do disco e da inserção sob casca em plantas com diâmetro acima de 4,0 mm. Os indivíduos da população F1, inoculados artificialmente através do método do disco, apresentaram lesões intermediárias em relação aos parentais. A herdabilidade do caráter foi de 18,7%. Foram detectados 36 marcadores moleculares associados à resistência a gomose, dos quais, 19 mapeados em P. trifoliata 'Rubidoux' e 10 em C. sunki... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo). / Abstract: The objectives of the study were to select Phytophthora parasitica isolates with high agressivity on citrus, to evaluate inoculation methods and to detect molecular markers linked to resistance QTLs to Phytophthora gummosis. Fifth teen isolates of P. parasitica from the State of São Paulo were tested. Young plants were inoculated and by contact, through the insertion of a disc and tricking infested, needle and toothpick infested with pathogen. For the markers and QTLs detection, 98 individuals of the F1 progeny obtained from Citrus sunki, (susceptible parent) and Poncirus trifoliata 'Rubidoux', (resistant) cross were inoculated. The phenotypic evaluations for Phytophthora gummosis resistance were incorporated on genetic linkage maps built with 170 RAPD markers using the pseudotestcross strategy. The isolates showed variation in agressivity when inoculated on Citrus limon Burmann. and Citrus limonia Osbeck. The LRS23/97 isolate showed more agressivity. The citrus genotypes evaluation to resistance to Phytophphtora gummosis were made in seedlings and 'in vitro' by needle insertion with pathogen, disc insertion method under bark and disc method in plants with diameter larger than 4,0 mm. The F1 hybrids, which were artificially inoculated by disc method, showed intermediates symptoms compared to the parents. The heretability of Phytophthora gummosis resistance was 18,7%. 36 molecular markers were associated to Phytophthora gummosis resistance and 19 were associated with P. trifoliata 'Rubidoux' map and 10 with C. sunki map. It was also detected 3 QTLs linked to Phytophthora gummosis resistance on I, II and V linkage groups of P. trifoliata 'Rubidoux' map and 1 QTL on II linkage group of C. sunki map. The phenotypic variation ratio explained by association markers-QTLs, was in a range of 14 to 60% for P. trifoliata 'Rubidoux' and... (Complete abstract, click electronic address below). / Doutor

Orientador: Wilson Badiali Crocomo / Resumo: Este trabalho foi realizado com o objetivo de verificar o efeito da forma de semeadura e de alguns produtos químicos sobre a incidência do percevejo castanho na cultura da soja. O delineamento experimental foi inteiramente casualizado com 2 tratamentos e 4 repetições, com parcelas de 8m de comprimento x 8 m de largura, espaçadas de 1m. Os dados foram analisados segundo o esquema fatorial (2x6). Os fatores estudados foram: 2 formas de semeadura (preparo do solo e semeadura direta) e 6 tratamentos, sendo 5 produtos químicos comerciais - Temik 150 G (aldicarb - 15kg p.c. /ha), Regent 20 G (fipronil - 200g p.c./ha), Kumulus GrD (enxofre - 50kg p.c. /ha), Cruiser 700 WS (thiamethoxam - 200g p.c. /100kg sementes), Kilval 300 CE (vamidothion - 2 L p.c. /ha) e a testemunha (sem tratamento). Inicialmente, foi realizada uma amostragem prévia da incidência de percevejos castanho nas diferentes parcelas, e após o início dos tratamentos foram realizadas avaliações semanais, num total de sete, visando o acompanhamento da população dos insetos. Foram avaliados os seguintes parâmetros vegetativos da cultura: altura de planta; número de entrenós, ramos e vagens por planta; altura de inserção da primeira vagem; número de grãos por vagem; número de plantas (determinado em uma área de 1,5 m2 - repetido 3 vezes por parcela). Após a colheita avaliou-se o peso total de grãos por parcela, percentagem de umidade e peso de 100 sementes. Os dados obtidos permitiram concluir que a forma de preparo do solo convencional, rompendo as camadas e galerias mais profundas do solo, provoca uma redução da população do percevejo castanho da raiz maior que o uso desses inseticidas químicos testados, melhorando o desenvolvimento vegetativo e a produtividade da cultura. / Abstract: This work aimed to evaluate different systems to the control of burrowing bug, Scaptocoris castanea, in soybean crops. The experimental design was entirely randomized with 12 treatments and 4 replications, using plots with 8m length x 8 m width, distant 1m. The data were analised under factorial design (2x6x4), being 2 crop systems (conventional and no till) and 6 treatments: 5 commercial insecticides - Temik G (aldicarb - 15kg p.c./ha), Regent G (fipronil - 200g p.c./ha), Kumulus GrD (sulfur - 50kg p.c./ha), Cruiser 700 WS (thiamethoxan - 200g p.c./100kg seeds), Kilval CE (vamidothion - 1.0 L p.c./ha) and the control (without treatment). Initially was made a previous sampling of the burrowing bugs incidence in each plot. During the experimental period seven evaluations were made weekly to follow the insect population development. The vegetative evaluated parameters were: plant height; internodes number, branches and pods per plant; height of insert of the first pod; number of grains per pod; number of plants (determined in an area of 1.5 m2, replicated 3 times per plot). After the harvest were evaluated the total weigth of grains per plot, humidity percentage and weigth of 100 seeds. The obtained data indicated that the conventional system, that breaks the deepest layers of the soil, reduce the burrowing bug population more than the chemical insecticides tested, increasing the vegetative development and crop protuctivity. / Mestre

Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Fitopatologia, Programa de Pós-Graduação em Fitopatologia, 2014. / Submitted by Ana Cristina Barbosa da Silva (annabds@hotmail.com) on 2015-03-05T18:27:07Z No. of bitstreams: 1 2014_MoabDianyDias_Parcial.pdf: 2058247 bytes, checksum: d818701cc16b594b8e15b992af281c8d (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana(raquelviana@bce.unb.br) on 2015-03-06T18:16:34Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2014_MoabDianyDias_Parcial.pdf: 2058247 bytes, checksum: d818701cc16b594b8e15b992af281c8d (MD5) / Made available in DSpace on 2015-03-06T18:16:34Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2014_MoabDianyDias_Parcial.pdf: 2058247 bytes, checksum: d818701cc16b594b8e15b992af281c8d (MD5) / A soja (Glycine max) é considerada a mais importante cultura do agronegócio brasileiro. Se consideradas as lavouras contíguas da Argentina, atualmente mais de 50% da produção mundial de soja é procedente da América do Sul. Dentre diversas doenças, tem aumentado a prevalência e a intensidade da antracnose, causada principalmente por Colletotrichum truncatum. Relatos de epidemias severas, com expressiva redução de produtividade, são frequentes, especialmente nos plantios da região Centro-Norte. Pouco se sabe sobre a variabilidade morfológica, cultural e molecular de C. truncatum e de outras espécies associadas à antracnose da soja no cone sul da América do Sul. Desta forma, as características morfo-moleculares de 54 isolados de C. truncatum provenientes de regiões produtoras de soja do Brasil e da Argentina foram investigadas. Estudos morfométricos e culturais de C. truncatum, assim como o uso de RAPD, confirmam a existência desta diversidade nos isolados de C. truncatum. Alguns isolados apresentaram três tipos de conidiogênese, incluindo a formação de conídios através de células conidiogênicas nas extremidades das hifas, em conidiomas no interior de esporodóquis setosos, através de setas férteis ,e forma inédita para a espécie C. truncatum. O sistema RAPD foi eficaz para detectar a diversidade genética dos isolados de C. truncatum provenientes da América do Sul e para estabelecer o grau de similaridade entre eles. Este foi maior dentro do grupo de isolados provenientes da Argentina e menor dentro do grupo de isolados do Brasil. Além disso, os resultados correlacionaram diferentes grupos com a respectiva origem geográfica, com agrupamentos exclusivos ou quase exclusivos de isolados das províncias argentinas e brasileiras em grupos distintos. Além disso, foi reportada e caracterizada a patogenicidade de Colletotrichum cliviae, espécie de conídios cilíndricos, à soja, em comparação com C. truncatum e outras espécies de Colletotrichum. Um isolado de C. clivae originário do Estado do Tocantins foi caracterizado morfologicamente e sua relação filogenética com C. truncatum e outras espécies foi estabelecida pelo sequenciamento parcial das regiões genômicas: quitina sintetase (CHS-1), B-tubulina2 (TUB-2), gliceraldeído-3 fosfato desidrogenase (GPDH), calmodulina (CAL), Actina (ACT) e rDNA ITS (ITS) e as sequências obtidas foram comparadas com sequências de outras espécies de Colletotrichum depositadas no GeneBank. Foram evidenciados clados de Colletotrichum associados à soja através da análise filogenética gerada a partir da análise de parcimônia. A análise filogenética agrupou o isolado de Tocantins com isolados de C. cliviae, com formação de subgrupos, indicando a existência de linhagens. A patogenicidade deste isolado, juntamente com cinco outros isolados de C. truncatum foi comparada em 16 genótipos de soja e diferenças de agressividade foram detectadas. Este é o primeiro relato de C. clivae como agente etiológico da antracnose em soja e o primeiro relato da espécie no Brasil. Foi obtida a formação in vitro da fse ascógena de C. clivae, pertencente a uma espécie do gênero Glomerella. Esta descoberta reforça o conceito que a antracnose em soja é causada por um complexo de espécies de Colletotrichum, tanto de conídios falcados quanto cilíndricos. As perdas devidas à doença no Brasil permanecem inderteminadas. Ainda, são frequentes os relatos de campo sobre a baixa eficiência de fungicidas para o controle da antracnose. Desta forma, testou-se a eficácia de fungicidas atualmente registrados para a cultura, bem como foram estimadas as perdas nas condições avaliadas. Foram conduzidos ensaios em lavouras comerciais em Alvorada, TO em duas safras consecutivas, com a cv. M-Soy 9144 RR. O delineamento utilizado foi o de blocos casualizados com quatro repetições e parcelas de 18 m2 (seis linhas de seis m). Foram realizadas duas aplicações de fungicidas, nos estádios R1/R2 e R5.2, e avaliados 10 produtos comerciais registrados para a cultura. A incidência de vagens sintomáticas foi determinada em R6. Na safra 2010/2011, apenas Azoxistrobin + Ciproconazol apresentou índices de incidência da doença significativamente menores do que a testemunha, a qual não diferiu dos demais tratamentos. Na safra 2011/2012 não houve diferenças significativas entre os tratamentos e a testemunha. As incidências em vagens nas duas safras variaram entre 10.7-15.6% e 9.5-16.3% respectivamente. As produtividades variaram entre 3.288 e 3.708 Kg ha-1 nas testemunhas e máximos de 3.966 e 4.110 Kg ha-1 nas parcelas tratadas, respectivamente em 2010/2011 e 2011/2012. Foram detectadas fortes e significativas correlações negativas entre a produtividade e a incidência da antracnose (r entre 0,81 e 0,85 nas duas safras). Análise de regressão indicou que a cada 1% de incremento da doença, cerca de 90 Kg/ha de grãos foram perdidos. Conclui-se que é alta a diversidade de C. truncatum, principal agente causal da antracnose da soja na América do Sul e que populações desta espécie estão possivelmente estruturadas geograficamente; que a espécie C. clivae é patogênica à soja e ocorre em condições naturais no norte Brasil; que a doença é responsável por perdas significativas de produção e que o controle químico com fungicidas sintéticos é insuficiente como único método de manejo da doença. / Soybean (Glycine max) can be arguably considered the most important Brazilian field crop. If the contiguous Argentinian crops are included, more than 50% of the world´s production comes from South America. Among several diseases, the prevalence and intensity of anthracnose, caused mainly by Colletotrichum truncatum, is increasing. Reports of severe epidemics, with expressive yield loss are frequent, especially from North-Central Brazil, but the reasons for these are not known. Knowledge about the morphological, cultural and molecular variability of C. truncatum and other anthracnose-related species associated to soybean in South America is scarce. Therefore, the morpho-molecular characteristics of 54 South American isolates of C. truncatum were studied in Chapter I. RAPD was used for estimating the genetic variability of the isolates. Results demonstrated morphological, cultural and genetic diversity of C. truncatum. Some isolates presented three types of conidiogenesis, including conidial formation from conidiogenous cells on hyphal extremities, in conidiomas in acervuli and in a yet-unreported manner for C. truncatum, directly from fertile setae. RAPD was efficient in detecting the genetic diversity present in the collection of C. truncatum isolates from South America, and was capable of establishing the degree of intra-group similarity, which is greater in the group of Argentinian isolates as compared to the group of Brazilian isolates. Furthermore, the results evidenced the correlation of geographical origin with molecular grouping, with the exclusive or semi-exclusive assembling of Brazilian and Argentinian isolates in distinct clades. Chapter 2 aimed at the description and pathogenic characterization of Colletotrichum cliviae (a cylindrical conidia species), as a yet unreported soybean pathogen, in contrast with C. truncatum. One isolate of C. clivae, from the state of Tocantins was characterized morphologically and its phylogenetic relation to C. truncatum and other Colletotrichum species was established, by means of comparison of fragments of the genomic region of the following genes: chitin synthetase (CHS-1), B-tubulin 2 (TUB-2), glyceraldehyde-3 phosphate dehydrogenase (GPDH), calmodulin (CAL), Actin (ACT) and rDNA ITS (ITS), which were compared to the deposited sequences of several species of Colletotrichum at the GeneBank. Several clades of Colletotrichum associated to soybean were detected through parsimony analysis. The phylogenetic analysis clustered the TO isolate with other C. cliviae isolates, albeit with the formation of subgroups, indicating the presence of fungal lines. Pathogenicity and aggressiveness of the C. clivae isolate was compared with other five C. truncatum isolates, on 10 soybean genotypes, and differences in aggressiveness were detected. This is the first report of C. clivae as an etiological agent of soybean anthracnose, and the first report of the species in Brazil. The teleomorph of C. clivae was obtained in vitro and corresponds to the genus Glomerella. This finding reinforces the concept that the etiology of soybean anthracnose is complex, involves several Colletotrichum species, including species with falcate and cylindrical conidia. A systematic study of soybean losses due to anthracnose has not been attempted in Brazil. However, field reports of low fungicide efficiency against the disease are frequent. Therefore, the objective of Chapter 3 was to elucidate the level of efficiency of present-day fungicides to control the disease and estimate grain yield lost due to anthracnose. Field studies were carried out for two consecutive years in commercial crops in Alvorada County, TO, on cv. M-Soy 9144 RR. A complete randomized experimental design was used, with four replicates and 18 sq-m plots (six 6-m lines). Fungicides were applied twice, at phenological stages R1/R2 and R5.2. Ten commercial formulas, approved for use in soybean were evaluated. The incidence of symptomatic pods was determined at R6. In the 2010/2011 season, only Azoxistrobin + Cyproconazole resulted in disease levels significantly lower than in the non-sprayed control plots, but it did not differed significantly from the other treatments. In the 2011/2012 season, there were no differences among synthetic fungicide treatments and the non-sprayed control plots. The incidences of symptomatic pods varied between 10.7-15.6% and 9.5-16.3% in each respective planting season. Grain yields varied between 3,288 and 3,708 Kg ha-1 in the non-sprayed plots and maxima between 3,966 and 4,110 Kg ha-1 in treated plots, in 2010/2011 and 2011/2012, respectively. There were strong and statistically significant negative relations between grain yield and anthracnose incidence (r between 0.81 and 0.85 in the two seasons). Regression analysis indicated that for each 1% increment in disease incidence, c. 90 Kg of grain is lost per hectare. The following conclusions are offered: Populations of C. truncatum, the main etiological agent of soybean anthracnose in South America, are diverse and possibly geographically structured; C. clivae is pathogenic to soybean, and occurs naturally in field crops of Northern Brazil; Anthracnose is responsible to significant yield losses and chemical control by synthetic fungicides is insufficient for disease manage as the sole method of control.

Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Fitopatologia, 2012. / Submitted by Elna Araújo (elna@bce.unb.br) on 2012-06-29T22:14:08Z No. of bitstreams: 1 2012_ThiagoAlvesSantosdeOliveira.pdf: 2178317 bytes, checksum: 7bd5d4f7fc3d58c0cf01b09cc94e55b8 (MD5) / Approved for entry into archive by Jaqueline Ferreira de Souza(jaquefs.braz@gmail.com) on 2012-07-05T18:11:08Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2012_ThiagoAlvesSantosdeOliveira.pdf: 2178317 bytes, checksum: 7bd5d4f7fc3d58c0cf01b09cc94e55b8 (MD5) / Made available in DSpace on 2012-07-05T18:11:08Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2012_ThiagoAlvesSantosdeOliveira.pdf: 2178317 bytes, checksum: 7bd5d4f7fc3d58c0cf01b09cc94e55b8 (MD5) / O panorama mundial da fruticultura é bastante dinâmico, influenciado, sobretudo, pelas mudanças edafoclimáticas e pelas doenças de pré e pós-colheita. O mamoeiro (Carica papaya L.) é apreciado no mundo todo e produzido nos países tropicais, principalmente nos estados brasileiros da Bahia e Espírito Santo. Os prejuízos pós-colheita são causados por doenças fúngicas, com destaque para a podridão dos frutos, causada por Phytophthora palmivora, de patossistema pouco estudado. Considerando que o controle químico geralmente é oneroso e impactante ao ambiente, procederam-se neste trabalho, estudos de componentes epidemiológicos e de controle alternativo da podridão dos frutos na pré e pós-colheita. Vinte um isolados de P. palmivora da Coleção de Phytophthora Arnaldo Gomes Medeiros do Centro de Pesquisa da Lavoura Cacaueira (CEPLAC), foram avaliados quanto ao índice e potencial de velocidade de crescimento micelial, produção e potencial de produção de esporos; influência da temperatura, período de molhamento, concentração de inóculo, método de inoculação e estádio de maturação de P. palmivora na severidade da podridão dos frutos de mamoeiro na pós-colheita, assim como o biocontrole da doença com Trichoderma spp. e o controle com fosfitos e Acibenzolar-S-Metil. Os resultados obtidos sugeriram que os isolados de P. palmivora 356 e 1060 foram os mais agressivos e mais virulentos nos estudos in vitro e in vivo. O estádio de maturação e a concentração de inóculo influenciaram no aumento das lesões causadas por P. palmivora, assim como o período de molhamento entre 60-72 horas e a temperatura entre 25-30 °C. Entre os biocontroladores testados, o isolado de Trichoderma spp. 4088 apresentou 88,64% de controle, comportamento estatisticamente semelhante ao fungicida. Já o fosfito de potássio 240 g L-1 de K2O, 340 g L-1 de P2O5 e 5% de C7H6O3 (Reforce® + Acido Salicílico) foi eficiente no controle da doença quando aplicado aos 6 Dias Antes da Colheita (DAC) reduzindo a severidade da doença por meio de retardo na maturação na fruta, diferente do Acibenzolar-S-Metil cuja eficiência foram verificadas quando aplicados depois da colheita. _________________________________________________________________________________ ABSTRACT / The global picture of the horticulture is quite dynamic. This picture is influenced by climatic changes and the prevalence of pre and postharvest diseases. Papaya (Carica papaya L.) is produced and appreciated worldwide. This plant is cultivated in tropical countries, such as Brazil. Bahia and Espirito Santo are the most important Brazilian states in papaya production. Postharvest fungal diseases are the main cause of papaya fruit losses. Papaya fruit rot, caused by Phytophthora palmivora, is one of those important diseases. This study was conducted considering the importance of disease and the environmental and economic cost of the chemical control for this disease. Therefore, the main objectives of this work were: to understand the effects of epidemiological factors on disease development and evaluate alternative methods to chemical control. Twenty-one strains of P. palmivora [Laboratory of Phytophthora Collection, Arnaldo Medeiros, Centro de Pesquisa da Lavoura Cacaueira (CEPLAC)] were evaluated, considering the following variables: the index and speed potential of mycelial growth, spore production, production potential and growth spores, assessment of virulence through the injured area, latent period, lesion area, sporulation capacity, influence of temperature, wetness, inoculum concentration, method of inoculation of P. palmivora and fruit maturation stages in the severity of the papaya fruit rot, the effects of biocontrol by Trichoderma spp., and control by phosphites and Acibenzolar-S-Methyl (ASM). The results suggested that P. palmivora isolates 356 and 1060 were the most aggressive. Increases fruit maturation stage, pathogen concentration of inoculum, wet period from 60 to 72 hours, and temperature between 25-30 °C favored increments in disease. Trichoderma isolate 4088 showed 88.64% of disease control. Potassium phosphite 240 g L-1 de K2O, 340 g L-1 de P2O5 e 5% de C7H6O3 (Reforce® + Salicylic Acid) was effective in disease control when applied to the 6 Harvester Day Before (HDB). However, Acibenzolar-S-Methyl was effective when applied in postharvest.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Agronomia e Medicina Veterinária, Programa de Pós-Graduação em Agronomia, 2012. / Submitted by Elna Araújo (elna@bce.unb.br) on 2012-07-04T23:59:50Z No. of bitstreams: 1 2012_CristinaLimadeMacedo.pdf: 1092613 bytes, checksum: d4d04d70cd2cf8f4d1fa3dec41b22ff7 (MD5) / Approved for entry into archive by Jaqueline Ferreira de Souza(jaquefs.braz@gmail.com) on 2012-07-05T17:53:03Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2012_CristinaLimadeMacedo.pdf: 1092613 bytes, checksum: d4d04d70cd2cf8f4d1fa3dec41b22ff7 (MD5) / Made available in DSpace on 2012-07-05T17:53:03Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2012_CristinaLimadeMacedo.pdf: 1092613 bytes, checksum: d4d04d70cd2cf8f4d1fa3dec41b22ff7 (MD5) / Diatraea saccharalis (Fabricius, 1794; Lepidoptera: Crambidae) é responsável por perdas econômicas nas lavouras afetando a cultura e o aproveitamento industrial da cana-de-açúcar. Seu hábito alimentar gera dificuldade no seu controle causando impactos à cultura canavieira. O desenvolvimento de novas estratégias para o seu controle de extrema importância. Uma alternativa para o controle desses insetos é a utilização de agentes de controle biológico, como Bacillus thuringiensis (Bt), pois esta bactéria sintetiza diferentes proteínas tóxicas a muitas pragas. Este estudo teve como objetivo, selecionar 106 estirpes da coleção de Bactérias de Invertebrados da Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia tóxicas à broca-da-cana. As estirpes selecionadas foram caracterizadas por métodos bioquímicos, moleculares e a ligação das toxinas aos receptores presentes no intestino médio das larvas de D. saccharalis foi analisada. Foram selecionadas três estirpes de B. thuringiensis, denominadas S602, S1264 e S1301, que apresentaram atividade contra D. saccharalis. A caracterização do perfil protéico revelou a presença de proteínas de 130 e 65 kDa, que correspondem às toxinas Cry1 e Cry2, respectivamente. A caracterização molecular mostrou a existência dos genes cry1 e cry2, corroborando com os resultados mostrados no perfil protéico. As proteínas Cry1Aa, Cry1Ab, Cry1Ac e Cry2Aa expressas individualmente por estirpes de Bt foram purificadas, solubilizadas, ativadas com tripsina e biotiniladas para a realização de ensaios de ligação para a observação da ligação da proteína à microvilosidades do intestino do inseto. A CL50 das proteínas Cry1Aa, Cry1Ab, Cry1Ac, Cry2Aa variou entre 222 e 610 ng/cm2. As mesmas apresentaram resultados de toxicidade significativamente semelhantes. As estirpes tóxicas selecionadas neste trabalho e o padrão apresentaram CL50 entre 8 e 43 ng/cm2 bastante inferior e significativamente diferente do das toxinas puras, indicando haver sinergismo entre as toxinas. Os resultados dos ensaios de ligação aos receptores de membrana intestinais mostraram, pela primeira vez, as interações existentes entre as toxinas e os receptores, confirmando o potencial tóxico destas proteínas à D. saccharalis. _________________________________________________________________________________ ABSTRACT / Diatraea saccharalis (Fabricius, 1794; Lepidoptera: Crambidae) is responsible for great economic losses in crops affecting the culture and the industrial utilization of sugarcane. There eating habits make harder the control by conventional tools causing impacts to sugarcane crops. The development of new strategies for its control is extremely important. An alternative for the control of this insects is the use of biological control agents such as Bacillus thuringiensis (Bt), based on the action of many different proteins synthesized by the bacteria which are active against insects orders. This study aimed to selective strains from collection of Bt in Embrapa Genetic Resources and Biotechnology toxic to the sugarcane borer, D. saccharalis. The strains selected were characterized by biochemical and molecular methods, and the binding assays of the toxins to midgut cell receptors of D. saccharalis were analysed. We selected three strains of B. thuringiensis, named S602, S1264 and S1301, which showed activity against D. saccharalis. Characterization of protein profiles revealed the presence of proteins of 130 and 65 kDa, corresponding to toxins Cry1 and Cry2, respectively. The molecular characterization showed the presence of cry1 and cry2 genes, confirming the results shown in the protein profile. Cry1Aa, Cry1Ab, Cry1Ac and Cry2Aa proteins were expressed individually by strains of Bt. The proteins were purified, solubilized, biotinylated and activated with trypsin for performing binding assays for the observation of protein binding to the microvilli of the insect gut. The CL50 of the proteins Cry1Aa, Cry1Ab, Cry1Ac and Cry2Aa showed variation between 222 and 610 ng/cm2. They have presented in the dose bioassay (LC50) Cry toxins showed no significant differences toxic results. The toxic strains selected at this work and standard showed LC50 between 8 and 43 ng/cm2 values inferior and significant different to the pure toxins, showed existence of synergism between toxins. The results of binding assays done with BBMV’s (Brush-Border Membrane Vesicle) of D. saccharalis, showed for the first time, the interactions between receptors and toxins, confirming the potential toxic effects of these proteins to D. saccharalis.

Tese (Doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Biologia Celular, 2012. / Submitted by Jaqueline Ferreira de Souza (jaquefs.braz@gmail.com) on 2012-09-06T13:53:56Z No. of bitstreams: 1 2012_EmanuelFelipeMedeirosAbreu.pdf: 2453482 bytes, checksum: 74193cbd52cf84b634766a3d957e9018 (MD5) / Approved for entry into archive by Jaqueline Ferreira de Souza(jaquefs.braz@gmail.com) on 2012-09-06T13:54:23Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2012_EmanuelFelipeMedeirosAbreu.pdf: 2453482 bytes, checksum: 74193cbd52cf84b634766a3d957e9018 (MD5) / Made available in DSpace on 2012-09-06T13:54:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2012_EmanuelFelipeMedeirosAbreu.pdf: 2453482 bytes, checksum: 74193cbd52cf84b634766a3d957e9018 (MD5) / O feijão-caupi (Vigna unguiculata (L.) Walp.) é uma importante leguminosa para o Nordeste brasileiro e tem sido tradicionalmente cultivada por pequenos agricultores. Doenças virais são consideradas um dos principais fatores limitantes da produtividade do caupi nesta região. A doença do mosaico severo do caupi é causada pelo Cowpea severe mosaic virus (CPSMV), subfamília Comovirinae, gênero Comovirus, juntamente com o Cowpea aphid-borne mosaic virus (CABMV), família Potyviridae, gênero Potyvirus, são consideradas as viroses mais prevalentes da cultura e responsáveis por grandes perdas na produção. O objetivo do presente trabalho foi estudar a variabilidade genética do CPSMV e CABMV obtidos em diferentes municípios do Nordeste brasileiro. Essa informação é crucial para o desenvolvimento de plantas resistentes a essas viroses tanto por métodos convencionais quanto moleculares de melhoramento. Isso é ainda mais crítico para o desenvolvimento de estratégias baseadas em RNA inteferente (RNAi). Plantas com sintomas de infecção pelo CPSMV e CABMV nos estados do Piauí, Ceará, Rio Grande do Norte, Paraíba, Pernambuco, Distrito Federal, Sergipe e Bahia foram coletadas, e os isolados foram identificados por Dot-blot e RT- PCR. Foram amplificados fragmentos de 2200 pb, (correspondendo a região da Helicase (Hel), Proteína ligada ao genoma viral (VPg), Picornain 3C- protease (Pro) e RNA polimerase) e 997 pb (correspondendo a região da proteína Inclusão Cilíndrica (CI) e da proteína 6K2) dos vírus CPSMV e CABMV por RT-PCR, respectivamente. Alguns fragmentos foram clonados e outros sequenciados diretamente do produto de PCR em ambas as orientações. As sequências obtidas a partir de diferentes isolados foram comparadas com sequências disponíveis no GenBank. Os alinhamentos das sequências foram obtidos usando o programa Clustal W, e uma árvore filogenética foi criado usando o software MEGA 5.1. A análise revelou baixa variabilidade entre isolados de CPSMV, variando entre 98 e 100% para sequências de nucleótidos e 96-100% para a sequência de aminoácidos deduzida. Entre os CABMV isolado, a variabilidade foi maior, variando 84-99% entre as sequências de nucleótidos 91 a 99% das sequências de aminoácidos. Este estudo fornece informações que serão a base para o desenvolvimento de estratégias para a produção de linhagens de caupi resistentes a estes vírus por RNA interferente. Os dados indicam a possibilidade de obtenção de resistência durável e aplicável ao caupi nas principais áreas produtoras no Brasil. _________________________________________________________________________________ ABSTRACT / Cowpea (Vigna unguiculata) is an important plant crop in Northeast Brazil being traditionally cultivated by small farmers. Virus diseases are considered to be the main factor limiting cowpea yield in the region. The severe mosaic disease caused by the Cowpea severe mosaic virus (CPSMV), subfamily Comovirinae, genus Comovirus, seems to be one of the most prevalent diseases leading to high yield losses in this crop. The Cowpea aphid borne mosaic virus (CABMV) belongs to the genus Potyvirus in the Potyviridae family, and infects cowpea worldwide. In the northeastern region of Brazil, both viruses can be found in cowpea planted areas. The aim of the present study was to access the degree of homology among regions amplified of different isolates of CPSMV and CABMV, respectively; obtained in different northeastern regions in Brazil, and to compare it to isolates throughout the world. Plants with CPSMV and CABMV symptoms from the states of Piauí, Ceará, Rio Grande do Norte, Paraiba, Pernambuco, Alagoas, Sergipe, Bahia and Distrito Federal were collected, and the isolates were identified by RT-PCR analysis. Total RNA was extracted from infected tissue and afterwards used for synthesis of cDNA fragments by RT-PCR. The synthetized primers were able to amplify fragments of 2200 and 997 bp of the CPSMV and CABMV virus, respectively. Amplification products were directly cloned into the pGEMT-Easy plasmid vector (Promega), according to the manufacturer’s instructions. Cloned fragments were sequenced in both orientations. Deduced amino acid sequences of the virus were compared to sequences available from GenBank. Multiple sequence alignments were obtained with Clustal W. Phylogenetic trees using the MEGA version 5.1 software package and the neighbour-joining method with Poisson correction. Tree branches were bootstrapped with 1000 permutations. CPSMV and CABMV diseases remain as limiting factors in this crop in Brazil, and breeding programs, either by conventional or engineered approaches, should be targeted at establishing resistance of cowpeas to CPSMV and CABMV.