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Structure et dynamique des fagots de microtubules : implication de la protéine Tau / Dynamical behavior of microtubule bundles in the presence of TauMéphon-Gaspard, Alix 07 November 2016 (has links)
Le long de l’axone d’un neurone mature, les microtubules (MTs) sont organisés en faisceaux parallèles et orientés. Cette géométrie devrait en théorie favoriser la formation de fagots serrés de MTs par encombrement macromoléculaire au sein de l’axoplasme (distance interMT < 5 nm). Or, des images de coupes d’axones obtenues par microscopie électronique ont révélé qu’ils y étaient bien séparés (distance interMT ≈ 75 nm). Dans la littérature, cette singularité pourrait s’expliquer par la présence de Tau, une protéine associée aux MTs. Cependant, l’effet de Tau sur l’organisation de MTs est encore sujet à controverse et deux modèles antagonistes ont été proposés. Le premier modèle avance que le domaine de projection de Tau connecte les MTs tout en les maintenant espacés en formant des ponts d’origine électrostatiques, à l’inverse du second qui explique l’espacement des MTs par un effet de « polymer brush » dû à la présence de Tau à la surface du MT. Afin d’éclairer la fonction de Tau dans l’organisation des MTs, nous avons combiné des approches expérimentales à différentes échelles, in vitro et in cellulo, avec des données issues de la modélisation analytique et numérique. Les résultats obtenus nous ont permis de proposer un modèle alternatif où la protéine Tau formerait des ponts transitoires. Ces derniers permettraient de maintenir les MTs suffisamment éloignés les uns des autres afin d’éviter l’effet de forces attractives à courte portée qui déclencheraient une mise en fagot irréversible des MTs. Enfin, notre modèle tient compte de la faible densité de Tau sur la surface des MTs axonaux. En effet, même à un bas ratio molaire Tau : Tubuline, Tau permet de garder les MTs éloignés les uns des autres grâce à la mobilité relative de Tau sur les MTs. / In mature neurons, axonal microtubules (MTs) are arranged in parallel arrays. Interestingly, even though both macromolecular crowding and their parallel orientation should force the formation of tightly packed bundles, they remain well separated. For decades, Tau, a microtubule-associated protein, has been implicated in this unique organization of axonal MTs. However, Tau properties still remain controversial as two antagonist models of interaction with MTs exist. Tau projection domains are either thought to connect MTs by forming electrostatic cross-bridges or to repulse them via a polymer brush mechanism. To gain a comprehensive view of Tau function, we then performed in vitro and in cells experiments, combined to analytical and mathematical modelling. We also reviewed the data traditionally used to support the cross-bridging and the polymer brush models and compared them with our interdisciplinary approach. Taken together, these results are indicating that tau can form transient and long-range cross-bridges at the interface between microtubules. These cross-bridges could prevent short-range attractive interactions that trigger an irreversible microtubule bundling. Finally, our model explain how MTs are kept apart at very low Tau:Tubulin molar ratio thanks to tau diffusion on microtubules.
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Optimisation des propriétés émissives du BODIPY en phase condensée par modulation de la nature des substituants / Optimization of the fluorescence properties of BODIPY derivatives by tuning the nature of the substituantsVu, Thanh-Truc 12 July 2011 (has links)
Une investigation des propriétés d’émission de fluorescence à l’état condensé a été effectuée sur des dérivés encombrés du Boron DIPYrromethene (BODIPY). L’objectif est de déterminer la nature de l’encombrement stérique afin d’optimiser l’efficacité d’émission en minimisant les interactions intermoléculaires. L’étude en films de PMMA du 3,5-di-adamantane, 8-mésityle BODIPY a mis en évidence la formation prépondérante d’agrégats H et celle de dimères J, dont le rendement quantique de fluorescence n’est diminué que d’un facteur 5 par rapport à la molécule non agrégée. Une deuxième étude spectroscopique en films évaporés a également été effectuée sur une série de quatre dérivés substitués sur les positions 3 et 5 par des groupements [2.2]paracyclophane et sur les positions 2 et 6 par les groupements respectifs : propyle, éthyle, méthyle et H (BODIPY H-, Alkyl-PcP). L’absence de substitution sur les positions 2 et 6 favorise la formation des agrégats H tandis que la présence d’une chaîne alkyle conduit à la formation prépondérante d’agrégats J. La mesure des rendements quantiques relatifs ainsi que l’analyse des images de fluorescence résolues en temps démontrent une augmentation de l’efficacité d’émission et de la durée de vie de fluorescence de la phase solide lorsque la chaîne alkyle s’allonge. Les composés BODIPY Et-PcP et Pr-PcP présentent tous deux une émission de fluorescence supérieure à un dérivé non encombré. Enfin, une étude préliminaire des phases solides de dérivés BODIPY substitués par des groupements insaturés planaires (benzothiophène, p-bromo-diphényle) a été menée afin d’étudier l’influence de la géométrie des substituants. La synthèse de l’ensemble des résultats permet de conclure que les substituants insaturés planaires ne conduisent pas systématiquement à une perte du rendement quantique de fluorescence à l’état solide, en comparaison aux substituants saturés et insaturés sphériques. Deux méthodes d’élaboration de particules ont été explorées : la première consiste à greffer des dérivés d’aza-BODIPY sur des billes de polystyrène afin d’obtenir des particules sondes de pH - la deuxième approche repose sur la polymérisation d’un dérivé BODIPY selon la méthode RAFT suivie de la formulation du polymère amphiphile obtenu en micelles de taille nanométrique. Ces particules offrent la possibilité d’une post-fonctionnalisation permettant d’élaborer des capteurs. / Fluorescence properties of Boron DIPYromethene derivatives (BODIPY) bearing bulky moieties are studied in condensed state in order to frame the nature of the substituents that would give the best emission efficiency. 3,5-bis-adamantane 8-mesityl BODIPY derivative shows a preponderant formation of H aggregates as well as J dimers, which fluorescence quantum yield is up to only about 5 times less than the monomer. Spectroscopic properties in solid state have also been studied on a set of four BODIPY derivatives substituted by [2.2]paracyclophane (PcP) on positions 3 and 5 on one hand, respectively H, methyl, ethyl and propyl on positions 2 and 6 on the other hand (BODIPY H-, Alkyl-PcP). BODIPY H-PcP shows aggregation preferentially in H type whereas substitution by an alkyl chain in position 2 and 6 favours the formation of J aggregates. The longer is the alkyl chain the more the BODIPY derivative emits, according to the measurement of relative quantum yield and the analysis of fluorescence lifetime imaging data. Both BODIPY Et-PcP and Pr-PcP show better emission efficiency than a non hindered BODIPY derivative. Preliminary work on derivatives bearing benzothiophene and p-Bromo-bisphenyl moieties on positions 3 and 5 supports the conclusion that unsaturated and planar substituents do not necessarily lead to more π--π- stacking, responsible for fluorescence quenching in solid state, compared to alkyl substituents or unsaturated and spherical substituents (Ad, PcP). Particles have also been obtained through two different approaches : the first one consists in fonctionnalizing aza-BODIPY derivatives on polystyrene beads in order to build a pH sensor - in the second one, a BODIPY derivative is polymerized according to RAFT method to give an amphiphilic polymer which is then reorganized into micelles. Those particles can be easily post-functionnalized to give a broad range of sensors.
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Vers la synthèse totale de la paulitine. Etude de nouvelles réactions de métathèse.Vedrenne, Emeline 13 July 2006 (has links) (PDF)
CES TRAVAUX DE THESE ONT INITIALEMENT EU POUR OBJET LA SYNTHESE TOTALE DE LA PAULITINE. LES RESULTATS OBTENUS NOUS ONT AMENES A MENER UNE ETUDE CONCERNANT LE MECANISME DE LA METATHESE ENE-YNE VERS LA FORMATION DU BICYCLE A-B DE LA MOLECULE CIBLE. CETTE ETUDE A ALORS PERMIS DE METTRE EN EVIDENCE QUE, LORS DE LA RCM D'ENYNES COMPORTANT UN ALCYNE VRAI ET UN ATOME D'OXYGENE EN ALPHA DE LA TRIPLE LIAISON, LE CARBENE DU RUTHENIUM ATTAQUE L'ALCYNE EN PREMIER. L'ENCOMBREMENT STERIQUE EN POSITION PROPARGYLIQUE SEMBLE FORTEMENT INFLUENCER LE RENDEMENT DE LA METATHESE: LA CYCLISATION EST PLUS EFFICACE LORSQUE CELUI-CI DIMINUE. UN PRECURSEUR DESMETHYLE DU BICYCLE CIBLE A ALORS PU ETRE SYNTHETISE AVEC UN RENDEMENT DE SEPT POURCENTS SUR HUIT ETAPES. LA SYNTHESE ASYMETRIQUE DU BICYLE AINSI QUE LA FORMATION DE MOTIFS ALPHA-METHYLENE-GAMMA-BUTYROLACTONES PRESENTS DANS LA PAULITINE ONT ENSUITE ETE ETUDIEES.PARALLELEMENT A CE TRAVAIL DE SYNTHESE, UNE NOUVELLE METHODOLOGIE A ETE DEVELOPPEE POUR LES METATHESES DE COMPOSES AZOTES ALLYLIQUES, HABITUELLEMENT DELICATES. L'UTILISATION DE BORANES, EN TANT QU'ACIDE DE LEWIS, OFFRE DE NOUVELLES CONDITIONS, PERMETTANT D'OBTENIR PROPREMENT DES PRODUITS DE COUPLAGE. CETTE NOUVELLE METHODE DONNE ACCES A DES OLEFINES DIVERSEMENT FONCTIONNALISEES PAR UN GROUPE AZOTE AVEC DE BONS RENDEMENTS, LORSQUE LA REACTION EST EFFECTUEE AU REFLUX DU TOLUENE, PENDANT DOUZE HEURES, EN PRESENCE DE CINQ POURCENTS DE CATALYSEUR D'HOVEYDA-BLECHERT ET D'UN SEUL EQUIVALENT DE PARTENAIRE DE METATHESE.
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Optimisation des propriétés émissives du BODIPY en phase condensée par modulation de la nature des substituantsVu, Thanh-Truc 12 July 2011 (has links) (PDF)
Une investigation des propriétés d'émission de fluorescence à l'état condensé a été effectuée sur des dérivés encombrés du Boron DIPYrromethene (BODIPY). L'objectif est de déterminer la nature de l'encombrement stérique afin d'optimiser l'efficacité d'émission en minimisant les interactions intermoléculaires. L'étude en films de PMMA du 3,5-di-adamantane, 8-mésityle BODIPY a mis en évidence la formation prépondérante d'agrégats H et celle de dimères J, dont le rendement quantique de fluorescence n'est diminué que d'un facteur 5 par rapport à la molécule non agrégée. Une deuxième étude spectroscopique en films évaporés a également été effectuée sur une série de quatre dérivés substitués sur les positions 3 et 5 par des groupements [2.2]paracyclophane et sur les positions 2 et 6 par les groupements respectifs : propyle, éthyle, méthyle et H (BODIPY H-, Alkyl-PcP). L'absence de substitution sur les positions 2 et 6 favorise la formation des agrégats H tandis que la présence d'une chaîne alkyle conduit à la formation prépondérante d'agrégats J. La mesure des rendements quantiques relatifs ainsi que l'analyse des images de fluorescence résolues en temps démontrent une augmentation de l'efficacité d'émission et de la durée de vie de fluorescence de la phase solide lorsque la chaîne alkyle s'allonge. Les composés BODIPY Et-PcP et Pr-PcP présentent tous deux une émission de fluorescence supérieure à un dérivé non encombré. Enfin, une étude préliminaire des phases solides de dérivés BODIPY substitués par des groupements insaturés planaires (benzothiophène, p-bromo-diphényle) a été menée afin d'étudier l'influence de la géométrie des substituants. La synthèse de l'ensemble des résultats permet de conclure que les substituants insaturés planaires ne conduisent pas systématiquement à une perte du rendement quantique de fluorescence à l'état solide, en comparaison aux substituants saturés et insaturés sphériques. Deux méthodes d'élaboration de particules ont été explorées : la première consiste à greffer des dérivés d'aza-BODIPY sur des billes de polystyrène afin d'obtenir des particules sondes de pH - la deuxième approche repose sur la polymérisation d'un dérivé BODIPY selon la méthode RAFT suivie de la formulation du polymère amphiphile obtenu en micelles de taille nanométrique. Ces particules offrent la possibilité d'une post-fonctionnalisation permettant d'élaborer des capteurs.
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Publicité sur Internet avec encombrement d'information / Internet Advertising with Information CongestionChoi, Dong Ook 09 July 2015 (has links)
L'attention est une ressource rare. Cette étude examine comment l'attention limitée des utilisateurs affecte le marché de la publicité sur Internet. J'analyse pour celà le marché coréen des moteurs de recherche et présente une estimation structurelle de la demande de bannières publicitaires qui tient compte de l'attention limitée des utilisateurs. Le modèle théorique qui sous-tend cette estimation suppose que l'attention des utilisateurs est distribuée de manière hétérogène.Dans ce cadre, je montre qu'une plateforme en monopole tend à diffuser trop d'annonces et que la probabilité que les messages publicitaires atteignent leur cible depend des caractéristiques des utilisateurs et des sites Web.Un modèle de choix discret à coefficients aléatoires est utilisé pour estimer la fonction de demande des utilisateurs. Les deux fonctions de demande et la fonction de profit des plateformes permettent de déduire le taux de marge. Celui-ci comprend trois composantes: un effet de réseau du côté utilisateur, un effet de congestion et l'indice de Lerner.Les modèles d'estimation sous forme réduite sont discutés en guise d'introduction.Ils semblent révéler l'existence d'un phénomène de congestion de l'information sur le marché des moteurs de recherche coréens.L'estimation structurelle que je met en oeuvre consiste tout d'abord à simuler la probabilité qu'un utilisateur prête attention à un message publicitaire posté sur un site Web. Cela permet, dans un second temps, d'indentifier dans quelle mesure la congestion de l'information affecte la demande de publicité.Le modèle estimé permet de prédire la probabilité qu'un message publicitaire donné soit perçu par les utilisateurs d'un site Web. Cette probabilité varie de 0,19 à 0,58 selon les sites et varie egalement selon le sexe, l'âge et le niveau de l'éducation des utilisateurs. Une augmentation de 1% du nombre d'annonces affichées sur une page Web se traduit par une baisse de 0,06% de la probabilité qu'un message publicitaire soit perçu par les utilisateurs.La demande des usagers estimée révèle que la publicité est une nuisance pour 92.17% des utilisateurs. En estimant la demande de publicité, je conclus que l'externalité liée à l'attention limitée des utilisateurs constitue un déterminant important du taux de marge des plateformes.L'étude enfin montre que le niveau de publicité sur les sites Web est systématiquement en dessous du niveau optimum social, ce qui implique que le pouvoir de marché dont bénéficient les sites conduit à une restriction du nombre de bannières publicitaires qui va au-delà de ce qui serait socialement optimal, compte tenu de l'externalité négative que constitue la congestion de l'information. Cela se traduit par une augmentation du surplus des annonceurs mais par une baisse du surplus social (perte sèche).J'effectue enfin une expérience contrefactuelle sur l'impact des logiciels de blocage de publicité. Cette experience révèle que la generalisation de tels logiciels réduit les niveaux d'annonce, parce que la valorisation des utilisateurs par une plateforme correspond au nombre moyen de messages publicitaires qu'ils perçoivent. Ces resultats soulignent que la prise en compte du phénomène de congestion de l'information est essentielle dans l'estimation des demandes de contenus audiovisuels et d'espace publicitaire. / Attention is a scarce resource. This study investigates the problem of the limited consumer's attention span and its impact on Internet advertising markets. For this, I explore Korean search engine market and present a structural model of the demand for the display advertising where the limited attention of website users is considered.The theoretical model assumes that the users' attention is distributed heterogeneously in constructing advertising demand.I show that the monopoly platform would send excessive messages in this setting and that the probability of message process differs by characteristics of users and websites.A random-coefficient discrete choice model is used to formulate the user demand function. Having two demand functions at hand, a markup is derived from the platform's profit function and is shown to have three components: Lerner's index, a network effect from user side, and the congestion effect.The reduced-form estimation models are, then, discussed. These estimations are to explore the market characteristics and to find preliminary evidences of the information congestion in Korean Internet search engine market.For the structural estimation, I simulate the probability that a user pays attention to a message posted on the website. This, in turn allows me to identify the extent to which information congestion affects the advertising demand.The estimated model enables me to predict a probability that a message is seen by a user of one particular website in a given month. The probability ranges from .19 to .58 across websites and it depends on gender, age, and education level of website users. I also find that 1% increase in ad level drops 0.06% of user's message process.I separately estimate the user demand function and find that advertising is a nuisance for 92.17% of users. Using estimates from both demands, I find that the externality from the limited attention is an important determinant of the platform's markup.The study shows that the ad level on a website is systematically below the social optimum level, implying that the website's market power leads to a decrease in quantity beyond what would be socially optimal in view of the negative externality from information congestion.The corresponding deadweight loss and the surplus gain for the society are estimated.I perform a counterfactual experiment on the impact of introducing ad avoidance options on websites. From the experiment, I find that ad levels decrease in the share of ad-avoiders because the platform's valuation on users rises in average attention. These results may stress the importance of users' limited attention in the demand estimation of monopoly media markets.
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Phase diagram, jamming and glass transitions in the non-convex perceptron / Diagramme de phase, transitions vitreuse et d'encombrement dans le perceptron non-convexeSevelev, Maxime 06 October 2017 (has links)
Cette thèse de doctorat traite du « modèle de perceptron sphérique », un modèle simple et exactement soluble qui présente un comportement visqueux et d'encombrement qui a été généralisé aux valeurs négatives du paramètre de produit scalaire κ. Le problème classique d'apprentissage par machine qui consiste en la classification des motifs aléatoires par le perceptron fait partie des problèmes de satisfaction des contraintes (PSC) convexes. Même quand le « paramètre de stabilité » du modèle κ devient négatif, le problème reste toujours correctement posé et peut être interprété comme le problème de placement des particules sur une sphère N-dimensionnelle en évitant les obstacles placés au hasard. Dans ce cas, le PSC correspondant n'est pas convexe. Cette thèse étudie le problème en détail dans le domaine non convexe. Une étude systématique est rendue possible en faisant correspondre à un problème de satisfaction de contraintes un problème d'optimisation sur le même support, mais doté d'un Hamiltonien (fonction de coût) qui mesure les violations des contraintes en fonction de la configuration du système. Le lien entre le PSC aléatoire et la phénoménologie vitreuse en physique est bien connue et a été explorée en détail pour les modèles à variables discrètes. La présence de variables continues dans le modèle de perceptron (sphérique) nous permet de dévoiler, en PSC aléatoire, la transition caractéristique SAT/UNSAT où le système subit une transition du régime satisfaisable (dans lequel l'état fondamental possède une énergie nulle) à celui insatisfaisable (dans lequel l'état fondamental possède une énergie positive). Cette transition de phase peut également être interprétée comme une transition d'encombrement similaire à celles démontrées par les modèles des sphères sans friction. La simplicité du modèle étudié permet de trouver exactement son diagramme de phase à température zéro en fonction des deux paramètres de contrôle: la densité des obstacles et leur taille. Ainsi identifiée, la transition d'encombrement est complètement caractérisée dans le présent document. Sont également étudiées en détail de diverses phases vitreuses de caractère stable et marginal. / This thesis treats the «spherical perceptron model», a simple exactly solvable model for glassy behavior and jamming suitably generalized to negative values of scalar product parameter κ. The classical machine-learning problem of random pattern classification by the perceptron is a convex constraint satisfaction problem (CSP). Even when the «stability parameter» κ of the model becomes negative, the problem still make sense and can be interpreted as the problem of particles on an N-dimensional sphere trying to avoid randomly placed obstacles. In this case, the corresponding CSP is non-convex. This thesis studies the problem in detail in the non-convex domain. Systematic study is made possible by assigning to a constraint satisfaction problem its corresponding optimization version endowed with a Hamiltonian function (cost function) quantifying the violations of the constraints, as a function of the system's configuration. The connection between random CSP and glassy phenomenology in physics is well known and has been explored in detail for models with discrete variables. The presence of continuous variables in the (spherical) perceptron model enables us to unveil, in random CSP, the characteristic SAT/UNSAT transition where the system transits from the satisfiable regime (where the ground state has zero energy) to the unsatisfiable one (where the ground state energy is positive). This phase transition can also be interpreted as a jamming transition similar to the one that exhibit models with frictionless spheres. The simplicity of the considered model allows the exact determination of the zero temperature phase diagram as a function of the control parameters: the density of obstacles and their size. In the present thesis, the jamming transition thus identified is completely characterized and several glass phases of stable and marginal character are studied in detail.
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Le rôle des fréquences spatiales dans l’effet d’encombrement en identification de lettresZahabi, Sacha 12 1900 (has links)
L’effet d’encombrement, qui nous empêche d’identifier correctement un stimulus visuel
lorsqu’il est entouré de flanqueurs, est omniprésent à travers une grande variété de classes
de stimuli. L’excentricité du stimulus cible ainsi que la distance cible-flanqueur
constituent des facteurs fondamentaux qui modulent l’effet d’encombrement. La
similarité cible-flanqueur semble également contribuer à l’ampleur de l’effet
d’encombrement, selon des données obtenues avec des stimuli non-linguistiques. La
présente étude a examiné ces trois facteurs en conjonction avec le contenu en fréquences
spatiales des stimuli, dans une tâche d’identification de lettres. Nous avons présenté des
images filtrées de lettres à des sujets non-dyslexiques exempts de troubles neurologiques,
tout en manipulant l’excentricité de la cible ainsi que la similarité cible-flanqueurs (selon
des matrices de confusion pré-établies). Quatre types de filtrage de fréquences spatiales
ont été utilisés : passe-bas, passe-haut, à large bande et mixte (i.e. élimination des
fréquences moyennes, connues comme étant optimales pour l’identification de lettres).
Ces conditions étaient appariées en termes d’énergie de contraste. Les sujets devaient
identifier la lettre cible le plus rapidement possible en évitant de commettre une erreur.
Les résultats démontrent que la similarité cible-flanqueur amplifie l’effet
d’encombrement, i.e. l’effet conjoint de distance et d’excentricité. Ceci étend les
connaissances sur l’impact de la similarité sur l’encombrement à l’identification visuelle
de stimuli linguistiques. De plus, la magnitude de l’effet d’encombrement est plus grande
avec le filtre passe-bas, suivit du filtre mixte, du filtre passe-haut et du filtre à large
bande, avec différences significatives entre les conditions consécutives. Nous concluons
que : 1- les fréquences spatiales moyennes offrent une protection optimale contre
l’encombrement en identification de lettres; 2- lorsque les fréquences spatiales moyennes
sont absentes du stimulus, les hautes fréquences protègent contre l’encombrement alors
que les basses fréquences l’amplifient, probablement par l’entremise de leur impact
opposé quant la disponibilité de l’information sur les caractéristiques distinctives des
stimul. / Visual crowding, which impairs our ability to accurately identify a target stimulus when
surrounded by flankers, is ubiquitous across a wide variety of stimulus classes. Target
eccentricity and target-flanker distance constitute fundamental factors in crowding.
Target-flanker similarity appears as another key factor based on findings obtained with
non-linguistic stimuli. The present study investigated the impact of these factors in
conjunction with spatial frequency content on single letter identification performance.
We presented spatial frequency filtered letters to neurologically intact nondyslexic
readers while manipulating target-flanker distance, target eccentricity and target-flanker
similarity (metric based on published letter confusion matrices). Spatial frequency
filtering conditions were broadband, low-pass, high-pass and hybrid (i.e. medium spatial
frequencies, known as optimal for letter recognition, removed from the stimulus). These
conditions were matched on overall contrast energy. Participants were required to
identify the target letter as fast and as accurately as possible. The results show that high
target-flanker similarity enhances crowding, i.e. the joint effects of distance and
eccentricity. This extends past findings on the impact of similarity on crowding to the
visual identification of linguistic materials. Most importantly, the magnitude of the
crowding effect is greatest with low-pass filtering, followed by hybrids, high-pass, and
broadband, with all pairwise contrasts significant. We conclude that: 1- medium spatial
frequencies provide optimal protection from crowding in letter recognition; 2- when
medium spatial frequencies are absent from the stimulus, low spatial frequencies magnify
crowding and high spatial frequencies protect against it, most likely through their
opposite impact on the availability of distinctive feature information.
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La dynamique intracellulaire explorée par marquage isotopique et diffusion incohérente de neutronsJasnin, Marion 05 December 2007 (has links) (PDF)
L'objectif de la thèse était d'étudier la dynamique des molécules biologiques in vivo, sur l'échelle de la pico- à la nanoseconde (ps-ns), en combinant la diffusion incohérente de neutrons et le marquage isotopique hydrogène/deutérium.<br /> Les mouvements diffusifs de l'eau ont été explorés dans le cytoplasme d'E. coli. L'étude a établi que la diffusion de l'eau intracellulaire est similaire à celle de l'eau pure, à température physiologique. Ce travail infirme le paradigme établi, selon lequel l'eau cellulaire est fortement ralentie par l'encombrement macromoléculaire.<br /> Les mouvements moléculaires internes et la diffusion globale des macromolécules ont été étudiés in vivo. Les résultats montrent que la proportion d'eau intracellulaire est un facteur déterminant dans la dynamique interne des macromolécules in vivo. L'encombrement macromoléculaire atténue cependant l'effet lubrifiant de l'eau sur les mouvements moléculaires internes. L'étude témoigne du fait que les échantillons standards (poudres et solutions) ne miment pas l'environnement physiologique.<br /> L'effet isotopique du solvant et l'influence de la deutériation sur la dynamique macromoléculaire moyenne, ont été explorés in vivo. Les macromolécules natives sont moins flexibles et moins résilientes en D2O. La deutériation augmente légèrement la flexibilité structurale et diminue faiblement la résilience, ce qui suggère que l'utilisation du marquage isotopique est justifiée pour les études dynamiques.<br /> Ce travail souligne l'importance du contrôle négatif lors des mesures sur des échantillons sélectivement marqués et montre qu'un taux de marquage conséquent (> 10 %) est nécessaire pour observer la dynamique d'un composant spécifique.
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Ciments et suspensions concentrées modèles. Écoulement, encombrement et floculationLootens, Didier 07 October 2004 (has links) (PDF)
Nous reportons ici le comportement rhéologique de suspensions concentrées - ou pâte - de particules granulaires ou colloïdales de ciment ou de silice sphérique et monodisperse. Le système modèle de particules de silice est utilisé pour pouvoir contrôler les propriétés physicochimiques de la suspension. Notre projet de recherche se centre sur deux points qui s'intéressent aux propriétés du coulis frais : (i) le premier est l'étude du processus de structuration par coagulation au repos et sa relation avec la prise. Nous avons utilisé des outils (ultrason, confocal) adaptés pour suivre et interpréter la coagulation et la prise du ciment.(ii). Le second est l'étude d'un phénomène de structuration dynamique, sous écoulement, typique des suspensions très concentrées et appelé " jamming ". Nous montrons que l'apparition de ce régime d'encombrement va de pair avec des fluctuations géantes de contraintes, avec une statistique caractéristique des événements critiques auto-organisés. L'état de surface des grains et du frottement intergranulaire est un paramètre important dans le blocage sous cisaillement. La simultanéité des fluctuations des efforts normaux et des efforts tangentiels aussi que des visualisations microscopiques suggère fortement que la formation de chaînes de contacts frottants est à l'origine du phénomène.
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Le rôle des fréquences spatiales dans l’effet d’encombrement en identification de lettresZahabi, Sacha 12 1900 (has links)
L’effet d’encombrement, qui nous empêche d’identifier correctement un stimulus visuel
lorsqu’il est entouré de flanqueurs, est omniprésent à travers une grande variété de classes
de stimuli. L’excentricité du stimulus cible ainsi que la distance cible-flanqueur
constituent des facteurs fondamentaux qui modulent l’effet d’encombrement. La
similarité cible-flanqueur semble également contribuer à l’ampleur de l’effet
d’encombrement, selon des données obtenues avec des stimuli non-linguistiques. La
présente étude a examiné ces trois facteurs en conjonction avec le contenu en fréquences
spatiales des stimuli, dans une tâche d’identification de lettres. Nous avons présenté des
images filtrées de lettres à des sujets non-dyslexiques exempts de troubles neurologiques,
tout en manipulant l’excentricité de la cible ainsi que la similarité cible-flanqueurs (selon
des matrices de confusion pré-établies). Quatre types de filtrage de fréquences spatiales
ont été utilisés : passe-bas, passe-haut, à large bande et mixte (i.e. élimination des
fréquences moyennes, connues comme étant optimales pour l’identification de lettres).
Ces conditions étaient appariées en termes d’énergie de contraste. Les sujets devaient
identifier la lettre cible le plus rapidement possible en évitant de commettre une erreur.
Les résultats démontrent que la similarité cible-flanqueur amplifie l’effet
d’encombrement, i.e. l’effet conjoint de distance et d’excentricité. Ceci étend les
connaissances sur l’impact de la similarité sur l’encombrement à l’identification visuelle
de stimuli linguistiques. De plus, la magnitude de l’effet d’encombrement est plus grande
avec le filtre passe-bas, suivit du filtre mixte, du filtre passe-haut et du filtre à large
bande, avec différences significatives entre les conditions consécutives. Nous concluons
que : 1- les fréquences spatiales moyennes offrent une protection optimale contre
l’encombrement en identification de lettres; 2- lorsque les fréquences spatiales moyennes
sont absentes du stimulus, les hautes fréquences protègent contre l’encombrement alors
que les basses fréquences l’amplifient, probablement par l’entremise de leur impact
opposé quant la disponibilité de l’information sur les caractéristiques distinctives des
stimul. / Visual crowding, which impairs our ability to accurately identify a target stimulus when
surrounded by flankers, is ubiquitous across a wide variety of stimulus classes. Target
eccentricity and target-flanker distance constitute fundamental factors in crowding.
Target-flanker similarity appears as another key factor based on findings obtained with
non-linguistic stimuli. The present study investigated the impact of these factors in
conjunction with spatial frequency content on single letter identification performance.
We presented spatial frequency filtered letters to neurologically intact nondyslexic
readers while manipulating target-flanker distance, target eccentricity and target-flanker
similarity (metric based on published letter confusion matrices). Spatial frequency
filtering conditions were broadband, low-pass, high-pass and hybrid (i.e. medium spatial
frequencies, known as optimal for letter recognition, removed from the stimulus). These
conditions were matched on overall contrast energy. Participants were required to
identify the target letter as fast and as accurately as possible. The results show that high
target-flanker similarity enhances crowding, i.e. the joint effects of distance and
eccentricity. This extends past findings on the impact of similarity on crowding to the
visual identification of linguistic materials. Most importantly, the magnitude of the
crowding effect is greatest with low-pass filtering, followed by hybrids, high-pass, and
broadband, with all pairwise contrasts significant. We conclude that: 1- medium spatial
frequencies provide optimal protection from crowding in letter recognition; 2- when
medium spatial frequencies are absent from the stimulus, low spatial frequencies magnify
crowding and high spatial frequencies protect against it, most likely through their
opposite impact on the availability of distinctive feature information.
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