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Informe jurídico sobre la Casación Nº2097-2019-LIMAPizarro Tafur, Maria Alexandra 12 August 2024 (has links)
El presente informe jurídico, a partir del análisis de la Casación Nº 2097–2019-
Lima, tiene por objetivo dar respuesta a dos problemáticas principales. Primero,
respecto a qué debe evaluarse para deducir razonablemente que el incremento
patrimonial es consecuencia del abuso del cargo en el delito de enriquecimiento
ilícito. Y, segundo, respecto a cuál es el límite para la inversión de la carga de la
prueba en este tipo penal. Para ello, la realización del presente informe se ha
valido del análisis de distintos instrumentos jurídicos, como la normativa penal y
procesal penal, la principal jurisprudencia de la Corte Suprema y la doctrina.
De esta manera, luego de la investigación llevada a cabo, se ha concluido, por
un lado, que para deducir razonablemente que el incremento patrimonial es
consecuencia del abuso del cargo, debe evaluarse si el marco competencial del
funcionario o servidor público y la calidad de la posición o puesto que desempeña
en la Administración Pública son susceptibles de generar las condiciones para
un enriquecimiento ilícito. Y, por otro lado, que la inversión de la carga de la
prueba al procesado tiene como límite el deber de la carga de la prueba del
Ministerio Público, el cual consiste en acreditar, primero, el incremento
patrimonial y, segundo, el vínculo funcionarial entre el mismo y el abuso del
cargo. / This legal report, based on the analysis of Cassation No. 2097-2019-Lima, aims
to respond to two main problems. First, regarding what must be evaluated to
reasonably deduce that the increase in assets is a consequence of the abuse of
charge in the crime of illicit enrichment. And, second, regarding what is the limit
for reversing the burden of proof in this type of crime. To this end, the preparation
of this report has used the analysis of different legal instruments, such as criminal
and criminal procedural regulations, the main jurisprudence of the Supreme Court
and doctrine.
In this way, after the investigation carried out, it has been concluded, on the one
hand, that to reasonably deduce that the increase in assets is a consequence of
the abuse of charge, it must be evaluated whether the competency framework of
the official or public servant and the quality of the position or position held in the
Public Administration are susceptible of generating the conditions for illicit
enrichment. And, on the other hand, that the reversal of the burden of proof on
the accused is limited by the duty of the Ministerio Público's burden of proof,
which consists of proving, first, the increase in assets and, second, the official
link between it and the abuse of charge.
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A reading enrichment program for gifted adolescent / Programa de enriquecimiento en lectura para adolescentes talentososMorales Silva, Silvia 25 September 2017 (has links)
This descriptive research examines the performance on reading comprehension of four gifted adolescents participating in a reading enrichment program. This performance is related to the variables associated to the gifted performance following the model developed by Mönks: motivation, creativity, high ability, school, peers and family. Results showed that school does not satisfy the cognitive needs of these students and it does not offer the required social support either. The family provides the main social support. The motivation, creativity, the high level of language and concentration of the participants facilitate learning. The reading program is described by the participants as motivating due to the subject-matters and methodology; furthermore, due to the opportunity to deal with peers who have a similar cognitive level. / Esta investigación de nivel descriptivo examina el desempeño en comprensión de lectura de cuatro adolescentes talentosos durante un programa de enriquecimiento en lectura. Este desempeño es relacionado con las variables asociadas a la conducta talentosa, de acuerdo al modelo de Mönks: motivación, creatividad, alta capacidad, escuela, pares y familia. Se encontró que la escuela no satisface las demandas cognitivas ni brinda el soporte social esperado. La familia brinda el soporte social principal. La motivación, la creatividad, el alto nivel de lenguaje y de concentración de los participantes facilitan el aprendizaje. El programa de lectura es descrito por los participantes como motivador debido a los temas y la metodología; además, por la oportunidad del intercambio con pares del mismo nivel cognitivo.
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El reconocimiento de las prestaciones ejecutadas por proveedores en contrataciones directas por situación de emergencia no regularizadasHuayna Chirinos, Patricia 15 November 2022 (has links)
El presente trabajo de investigación analiza la problemática que surge cuando una entidad no
cumple con la regularización de una contratación directa por situación de emergencia. Siendo
un supuesto excepcional contenido en la normativa de contrataciones del Estado que
posibilita a la entidad a requerir a los proveedores de manera inmediata la ejecución de las
prestaciones sin sujetarse a los requisitos formales de la norma, con la condición legal que
posteriormente se regularice la formalización de la documentación para la aprobación de la
contratación directa, ello a fin de obtener en forma oportuna los bienes o servicios necesarios
en una situación de emergencia. Sin embargo, si luego de la ejecución de las prestaciones por
parte del proveedor, la entidad no realiza la regularización de los documentos para la
formalización de la contratación, existen implicancias relacionadas al cumplimiento del pago
en favor de los proveedores.
Efectuada la argumentación jurídica constitucional y legisprudencial, se determina que si bien
no resulta procedente que las entidades realicen un pago bajo el marco de la normativa de
contrataciones del Estado, teniendo en cuenta que no se cumple con el requisito legal de la
regularización de la formalización de la contratación, entre otros documentos, con la
suscripción contractual; por lo cual, no se cuenta con una relación jurídica válida que sustente
el referido pago, habiéndose configurado en dichos casos una contratación irregular o al
margen de lo establecido en la referida normativa; sin embargo, procede el reconocimiento de
las prestaciones ejecutadas teniendo en cuenta la figura jurídica del enriquecimiento sin causa
en favor del proveedor que de buena fe realiza la entrega de bienes o ejecuta servicios en
favor de la entidad, previa verificación del cumplimiento de requisitos para su configuración.
Asimismo, se analizan los riesgos legales respecto a la procedencia de efectuar el
reconocimiento económico directo por las prestaciones ejecutadas, evidenciando que resulta
una alternativa eficiente y dentro del marco legal a ser aplicada por las entidades, en lugar de
esperar que los proveedores acudan a la vía judicial a reclamar el reconocimiento de dicho
adeudo por enriquecimiento sin causa. Finalmente, se propone el procedimiento para el
referido reconocimiento en forma directa, atendiendo a los criterios establecidos por el
OSCE, el cual puede considerarse como una normativa interna por las entidades que optan
por esta vía.
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Flujos de oxígeno y nutrientes entre sedimento y columna de agua: caso de las arenas finas infralitoralesSospedra Ciscar, Javier 30 March 2015 (has links)
RESUMEN
En el metabolismo bentónico de las zonas costeras y someras interactúan de forma compleja
un gran número de procesos y factores tanto físicos como químicos y biológicos. La
respiración bentónica y la regeneración de nutrientes en los fondos de arenas permeables del
infralitoral han sido, tradicionalmente, poco estudiadas, sin embargo, éstas pueden tener una
repercusión directa y transcendental en los ecosistemas costeros. Esta tesis tiene como
propósito general la determinación de los flujos de oxígeno disuelto y nutrientes en la interfase
sedimento-agua. Además, se plantea estudiar las posibles interacciones entre distintas variables
ambientales e identificar aquellas más influyentes en el metabolismo bentónico sobre fondos
de arenas finas y homogéneas.
En este estudio se llevaron a cabo un total de ocho campañas de trabajo in situ en una
estación de muestreo situada sobre fondos en los que se asienta la biocenosis de arenas finas
bien calibradas y en cuya superficie se desarrollan tapices de microfitobentos. En estas
campañas se tomaron muestras de la columna de agua, del sedimento y se instalaron trampas
de sedimentación y cámaras de incubación bentónicas, tanto opacas como transparentes, sobre
el sedimento a lo largo del ciclo anual. Además, se realizaron dos experimentos, bajo
condiciones controladas en laboratorio, en los que se incubó la misma matriz granulométrica
presente en la estación de muestreo y a la que se añadieron distintos niveles de materia orgánica
y del bivalvo Spisula subtruncata respectivamente.
La respiración bentónica de estas arenas finas infralitorales estuvo regulada por una
pequeña fracción de materia orgánica presente en el sedimento, compuesta por carbono
biopolimérico y pigmentos cloroplásticos, en condiciones de oscuridad. Ello supuso un
consumo de oxígeno por parte del sedimento y una liberación de nitrógeno inorgánico disuelto
y ácido ortosilícico hacia la columna de agua. En condiciones de luz, la correlación detectada
entre la producción primaria neta y la irradiancia media incidente sobre la superficie del
sedimento indicó que el microfitobentos tuvo un papel destacado en la producción de oxígeno
y en el metabolismo de estos fondos. Las arenas finas bien calibradas, emplazadas en un
ambiente meramente oligotrófico, se mostraron heterotróficas a lo largo del año, consumiendo
oxígeno y liberando nitrógeno inorgánico disuelto y ácido ortosilícico a la columna de agua
según los flujos diarios estimados, en los que se asumió que el intercambio ocurrido durante
la fase diurna se corresponde con los flujos de las cámaras trasparentes y los de la fase nocturna
a los flujos en oscuridad. Únicamente durante la primavera, estos fondos fueron autotróficos
debido a la mayor irradiancia incidente en esta estación que estimuló la producción primaria
realizada por el microfitobentos. Esta producción primaria bentónica fue superior a la
producción planctónica en todas las campañas, realizadas todas ellas en circunstancias de
estabilidad hidrodinámica sobre estos fondos someros.
Los experimentos ex situ mostraron que la respiración bentónica respondió de forma más
acusada en condiciones oligotróficas, lo que también conllevó un mayor incremento en la
liberación de nitrógeno inorgánico disuelto, que en situaciones eutróficas o hipereutróficas. La
presencia de S. subtruncata, una de las especies más abundantes en la estación de muestreo,
también implicó incrementos del 60-75 % en el consumo de oxígeno y del 65-100 % en la
liberación de nitrógeno inorgánico disuelto a densidades comprendidas entre los 400 y 850 ind
m-2, debido a su metabolismo y actividad. / Sospedra Ciscar, J. (2014). Flujos de oxígeno y nutrientes entre sedimento y columna de agua: caso de las arenas finas infralitorales [Tesis doctoral]. Universitat Politècnica de València. https://doi.org/10.4995/Thesis/10251/48466
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Study of Strategies for Genetic Variant Discrimination and Detection by OptosensingLázaro Zaragozá, Ana 05 September 2022 (has links)
Tesis por compendio / [ES] La medicina actual se dirige hacia un enfoque más personalizado basándose en el diagnóstico molecular del paciente a través del estudio de biomarcadores específicos. Aplicando este principio molecular, el diagnóstico, pronóstico y selección de la terapia se apoyan en la identificación de variaciones específicas del genoma humano, como variaciones de un único nucleótido (SNV). Para detectar estos biomarcadores se dispone de una amplia oferta de tecnologías. Sin embargo, muchos de los métodos en uso presentan limitaciones como un elevado coste, complejidad, tiempos de análisis largos o requieren de personal y equipamiento especializado, lo que imposibilita su incorporación masiva en la mayoría de los sistemas sanitarios. Por tanto, existe la necesidad de investigar y desarrollar soluciones analíticas que aporten información sobre las variantes genéticas y que se puedan implementar en diferentes escenarios del ámbito de la salud con prestaciones competitivas y económicamente viables.
El objetivo principal de esta tesis ha sido desarrollar estrategias innovadoras para resolver el reto de la detección múltiple de variantes genéticas que se encuentran en forma minoritaria en muestras biológicas de pacientes, cubriendo las demandas asociadas al entorno clínico. Las tareas de investigación se centraron en la combinación de reacciones de discriminación alélica con amplificación selectiva de DNA y el desarrollo de sistemas ópticos de detección versátiles.
Con el fin de atender el amplio abanico de necesidades, en el primer capítulo, se presentan resultados que mejoran las prestaciones analíticas de la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) mediante la incorporación de una etapa al termociclado y de un agente bloqueante amplificando selectivamente las variantes minoritarias que fueron monitorizadas mediante fluorescencia a tiempo real. En el segundo capítulo, se logró la discriminación alélica combinando la ligación de oligonucleótidos con la amplificación de la recombinasa polimerasa (RPA), que al operar a temperatura constante permitió una detección tipo point-of-care (POC). La identificación de SNV se llevó a cabo mediante hibridación en formato micromatriz, utilizando la tecnología Blu-Ray como plataforma de ensayo y detección. En el tercer capítulo, se integró la RPA con la reacción de hibridación alelo especifica en cadena (AS-HCR), en formato array para genotipar SNV a partir de DNA genómico en un chip. La lectura de los resultados se realizó mediante un smartphone. En el último capítulo, se presenta la síntesis de un nuevo reactivo bioluminiscente que se aplicó a la monitorización de biomarcadores de DNA a tiempo real y final de la RPA basada en la transferencia de energía de resonancia de bioluminiscencia (BRET), eliminando la necesidad de una fuente de excitación.
Todas las estrategias permitieron un reconocimiento especifico de la variante de interés, incluso en muestras que contenían tan solo 20 copias de DNA genómico diana. Se consiguieron resultados sensibles (límite de detección 0.5% variante/total), reproducibles (desviación estándar relativa < 19%), de manera sencilla (3 etapas o menos), rápida (tiempos cortos de 30-200 min) y permitiendo el análisis simultaneo de varios genes. Como prueba de concepto, estas estrategias se aplicaron a la detección e identificación en muestras clínicas de biomarcadores asociados a cáncer colorrectal y enfermedades cardiológicas. Los resultados se validaron por comparación con los métodos de referencia NGS y PCR, comprobándose que se mejoraban los requerimientos técnicos y la relación coste-eficacia. En conclusión, las investigaciones llevadas a cabo posibilitaron desarrollar herramientas de genotipado con propiedades analíticas competitivas y versátiles, aplicables a diferentes escenarios sanitarios, desde hospitales a entornos con pocos recursos. Estos resultados son prometedores al dar respuesta a la demanda de tecnologías alternativas para el diagnóstico molecular personalizado. / [CA] La medicina actual es dirigeix cap a un enfocament més personalitzat basant-se en el diagnòstic molecular del pacient a través de l'estudi de biomarcadors específics. Aplicant aquest principi molecular, el diagnòstic, pronòstic i selecció de la teràpia es recolzen en la identificació de variacions específiques del genoma humà, com variacions d'un únic nucleòtid (SNV). Per a detectar aquests biomarcadors, es disposa d'una àmplia oferta de tecnologies. No obstant això, molts dels mètodes en ús presenten limitacions com un elevat cost, complexitat, temps d'anàlisis llargues o requereixen de personal i equipament especialitzat, la qual cosa impossibilita la seua incorporació massiva en la majoria dels sistemes sanitaris. Per tant, existeix la necessitat d'investigar i desenvolupar solucions analítiques que aporten informació sobre les variants genètiques i que es puguen implementar en diferents escenaris de l'àmbit de la salut amb prestacions competitives i econòmicament viables.
L'objectiu principal d'aquesta tesi ha sigut desenvolupar estratègies innovadores per a resoldre el repte de la detecció múltiple de variants genètiques que es troben en forma minoritària en mostres biològiques de pacients, cobrint les demandes associades a l'entorn clínic. Les tasques d'investigació es van centrar en la combinació de reaccions de discriminació al·lèlica amb amplificació selectiva de DNA i al desenvolupament de sistemes òptics de detecció versàtils.
Amb la finalitat d'atendre l'ampli ventall de necessitats, en el primer capítol, es presenten resultats que milloren les prestacions analítiques de la reacció en cadena de la polimerasa (PCR) mitjançant la incorporació d'una etapa al termociclat i d'un agent bloquejant amplificant selectivament les variants minoritàries que van ser monitoritzades mitjançant fluorescència a temps real. En el segon capítol, es va aconseguir la discriminació al·lèlica combinant el lligament d'oligonucleòtids amb l'amplificació de la recombinasa polimerasa (RPA), que en operar a temperatura constant va permetre una detecció tipus point-of-care (POC). La identificació de SNV es va dur a terme mitjançant hibridació en format micromatriu, utilitzant la tecnologia Blu-Ray com a plataforma d'assaig i detecció. En el tercer capítol, es va integrar la RPA amb la reacció d'hibridació al·lel específica en cadena (AS-HCR), en format matriu per a genotipar SNV a partir de DNA genòmic en un xip. La lectura dels resultats es va realitzar mitjançant un telèfon intel·ligent. En l'últim capítol, es presenta la síntesi d'un nou reactiu bioluminescent que es va aplicar al monitoratge de biomarcadors de DNA a temps real i final de la RPA basada en la transferència d'energia de ressonància de bioluminescència (BRET), eliminant la necessitat d'una font d'excitació.
Totes les estratègies van permetre un reconeixement específic de la variant d'interès, fins i tot en mostres que només contenien 20 còpies de DNA genòmic diana. Es van aconseguir resultats sensibles (límit de detecció 0.5% variant/total), reproduïbles (desviació estàndard relativa < 19%), de manera senzilla (3 etapes o menys), ràpida (temps curts de 30-200 min) i permetent l'anàlisi simultània de diversos gens. Com a prova de concepte, aquestes estratègies es van aplicar a la detecció i identificació en mostres clíniques de biomarcadors associats a càncer colorectal i a malalties cardiològiques. Els resultats es van validar per comparació amb els mètodes de referència NGS i PCR, comprovant-se que es milloraven els requeriments tècnics i la relació cost-eficàcia. En conclusió, les investigacions dutes a terme van possibilitar desenvolupar eines de genotipat amb propietats analítiques competitives i versàtils, aplicables a diferents escenaris sanitaris, des d'hospitals a entorns amb pocs recursos. Aquests resultats són prometedors en donar resposta a la demanda de tecnologies alternatives per al diagnòstic molecular personalitzat. / [EN] Current medicine is moving towards a more personalized approach based on the patients' molecular diagnosis through the study of specific biomarkers. Diagnosis, prognosis and therapy selection, applying this molecular principle, rely on identifying specific variations in the human genome, such as single nucleotide variations (SNV). A wide range of technologies is available to detect these biomarkers. However, many of the employed methods have limitations such as high cost, complexity, long analysis times, or requiring specialized personnel and equipment, making their massive incorporation in most healthcare systems impossible. Therefore, there is a need to research and develop analytical solutions that provide information on genetic variants that can be implemented in different health scenarios with competitive and economically feasible performances.
The main objective of this thesis has been to develop innovative strategies to solve the challenge of multiple detection of genetic variants that are found in a minority amount in patient samples, covering the demands associated with the clinical setting. Research tasks focused on the combination of allelic discrimination reactions with selective DNA amplification and the development of versatile optical detection systems.
In order to meet the wide range of needs, in the first chapter, the analytical performances of the polymerase chain reaction (PCR) were improved by incorporating a thermocycling step and a blocking agent to amplify selectively minority variants that were monitored by real-time fluorescence. In the second chapter, allelic discrimination was achieved by combining oligonucleotide ligation with recombinase polymerase amplification (RPA), which operates at a constant temperature, allowing point-of-care (POC) detection. SNV identification was carried out by hybridization in microarray format, using Blu-Ray technology as the assay platform and detector. RPA was integrated with allele-specific hybridization chain reaction (AS-HCR), in an array format to genotype SNV from genomic DNA on a chip in the third chapter. The reading of the results was performed using a smartphone. In the last chapter, a new bioluminescent reagent was synthesized. It was applied to real-time and endpoint DNA biomarker monitoring based on bioluminescence resonance energy transfer (BRET), eliminating the need for an excitation source.
All the strategies allowed specific recognition of the target variant, even in samples containing as few as 20 copies of target genomic DNA. Sensitive (limit of detection 0.5% variant/total), reproducible (relative standard deviation < 19%), simple (3 steps or less), fast (short times of 30-200 min) results were achieved, allowing simultaneous analysis of several genes. As proof of concept, these strategies were applied to detect and identify biomarkers associated with colorectal cancer and cardiological diseases in clinical samples. The results were validated by comparison with reference methods such as NGS and PCR, proving that the technical requirements and cost-effectiveness were improved. In conclusion, the developed research made it possible to develop genotyping tools with competitive analytical properties and versatile, applicable to different healthcare scenarios, from hospitals to limited-resource environments. These results are promising since they respond to the demand for alternative technologies for personalized molecular diagnostics. / The authors acknowledge the financial support received from the Generalitat Valenciana PROMETEO/2020/094, GRISOLIA/2014/024 PhD Grant and GVA-FPI-2017 PhD grant, the Spanish Ministry of Economy and Competitiveness MINECO projects CTQ2016-75749-R and PID2019-110713RB-I00 and European Regional Development Fund (ERDF). / Lázaro Zaragozá, A. (2022). Study of Strategies for Genetic Variant Discrimination and Detection by Optosensing [Tesis doctoral]. Universitat Politècnica de València. https://doi.org/10.4995/Thesis/10251/185216 / Compendio
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Sulphate‐reducing bacterial diversity in a calcareous sandy sediment of Mallorca and community response to hydrocarbon contaminationSuárez Suárez, Ana Belén 25 July 2012 (has links)
Aquesta tesi tracta sobre l'efecte de la contaminació per cru de petroli sobre
l'ecosistema costaner mediterrani i sobre el paper fonamental dels sediments marins
en la regulació i el manteniment dels processos biogeoquímics. L'estudi presta especial
atenció a les comunitats bacterianes reductores de sulfat i la seva implicació en la
degradació de contaminants orgànics. La diversitat, abundància i fisiologia dels bacteris
reductors de sulfat que habiten el sediment arenós del nord de Mallorca (Illes Balears),
van ser analitzades mitjançant un enfocament polifàsic, basat en la combinació
d'experiments in situ i in vitro, biologia molecular clàssica i d’última generació, cultius i
determinació d'activitats metabòliques. Els resultats obtinguts durant aquesta tesi
demostren que el sediment mediterrani alberga una microbiota autòctona que podria
prosperar després d'un vessament de cru de petroli i el paper de la qual podria ser
crucial per a la transformació i l'eliminació de compostos orgànics xenobiòtics en
aquest ambient. / Esta tesis trata sobre el efecto de la contaminación por crudo de petróleo en el
ecosistema costero mediterráneo y sobre el papel fundamental de los sedimentos
marinos en la regulación y el mantenimiento de los procesos biogeoquímicos. El
estudio presta especial atención a las comunidades bacterianas reductoras de sulfato y
a su implicación en la degradación de contaminantes orgánicos. La diversidad,
abundancia y fisiología de las bacterias reductoras de sulfato que habitan el sedimento arenoso del norte de Mallorca (Islas Baleares), fueron analizadas mediante un enfoque
polifásico, basado en la combinación de experimentos in situ e in vitro, biología
molecular clásica y de última generación, cultivos y determinación de actividades
metabólicas. Los resultados obtenidos durante esta tesis demuestran que el sedimento
mediterráneo alberga una microbiota autóctona que podría prosperar después de un
derrame de crudo de petróleo y cuyo papel podría ser crucial para la transformación y
la eliminación de compuestos orgánicos xenobióticos en este ambiente. / This thesis discusses the fate and behave of crude oil contamination in the
Mediterranean coastal ecosystem, and the essential role of the marine sediments in
the regulation and maintenance of biogeochemical processes. The study pays
particular attention to the role of sulphate reducing bacterial communities in the
degradation of organic matter and pollutants entering the Mediterranean
environment. A polyphasic approach based in the combination of in situ and in vitro
experiments, next generation and classical molecular biology, cultivation, and the
determination of metabolic activities, provided first insights into the diversity, abundance and physiology of sulphate reducing bacteria inhabiting the undisturbed
sandy sediment at the north of Mallorca (Balearic Islands). The results obtained during
the thesis demonstrate that the undisturbed Mediterranean sediment harbours an
autochthonous microbiota that could prosper after a crude oil spill and which role
might be crucial for the transformation and removal of hazardous organic compounds
in this environment.
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Isolation and Identification of Foodborne Pathogens of Special Interest in Food SafetyBoukharouba, Aya 13 May 2022 (has links)
[ES] La seguridad alimentaria es una prioridad para la población y en la actualidad cobra mayor importancia por ciertas tendencias alimentarias como el consumo de alimentos crudos y la distribución generalizada de alimentos orgánicos, que pueden ser la causa de enfermedades transmitidas por alimentos.
Para garantizar la seguridad alimentaria, la detección de estos microorganismos debe realizarse de manera rápida y eficiente. Par eso, el método de cultivo microbiológico se considera el oficial para la detección de estos patógenos. Sin embargo, adolece de importantes inconvenientes, ya que no solo requiere mucho tiempo, sino que también es laborioso y consume muchos recursos. Además, puede ser limitado con respecto a la detección de bacterias fisiológicamente alteradas y/o estresadas durante el almacenamiento y la conservación.
En este trabajo se ha desarrollado un protocolo sencillo y rápido para la detección simultánea de E. coli, L. monocytogenes, S. aureus y S. enterica en alimentos, mediante la combinación de una etapa de co-cultivo en medio líquido y la detección por PCR múltiple.
Se ha evaluado la eficiencia de varios medios de enriquecimiento y se seleccionó el agua de peptona tamponada como el medio óptimo para el co-cultivo de las cuatro bacterias diana. También se optimizaron las condiciones de PCR múltiple y se aplicaron tanto a co-cultivos como a muestras de alimentos inoculados artificialmente, lechuga orgánica y carne picada.
Después de la optimización, la PCR múltiple desarrollada fue capaz de detectar las cuatro bacterias simultáneamente, hasta con una inoculación inicial de 10^0 UFC/mL. En presencia de ambas matrices alimentarias inoculadas, tras la etapa de co-cultivo, la PCR múltiple pudo detectar simultáneamente las 3 bacterias E. coli, S. enterica y L. monocytogenes, mientras que S. aureus se ha detectado por PCR simplex, a partir del mismo extracto de ADN del co-cultivo.
Los resultados obtenidos permiten concluir que el uso de un paso de co-cultivo en Agua peptona tamponada, antes de la detección por PCR simple y múltiple, puede facilitar la detección simultánea de las cuatro bacterias potencialmente presentes en las matrices alimentarias. La presencia o ausencia de la bacteria diana en los alimentos se confirma en unas 30 horas, lo que reduce el tiempo requerido para la detección en comparación con el tiempo mínimo de 7 días por método cultural. Asimismo, permite reducir el número de medios de cultivo y reactivos, para el aislamiento e identificación de bacterias que no son detectadas por PCR y que no están presentes en las matrices alimentarias, lo que supone un importante ahorro económico. / [CA] La seguretat alimentària sempre és una prioritat per a la població i en l' actualitat cobra major importància per certes tendències alimentàries, com el consum d' aliments crus i la distribució generalitzada d' aliments orgànics, que poden ser la causa de malalties transmeses per aliments.
Per garantir la seguretat alimentària, la detecció d' aquests microorganismes s' ha de realitzar de manera ràpida i eficient. Per a això, el mètode de cultiu microbiològic es considera l' oficial per a la detecció d' aquests patògens. Però, hi ha importants inconvenients, ja que no només requereix més temps, sinó que també és laboriós i consumeix molts recursos. A més, pot ser limitat pel que fa a la detecció de bacteris fisiològicament alterats i/o estressats durant l'emmagatzematge i la conservació.
En aquest treball s'ha desenvolupat un protocol senzill i ràpid per a la detecció simultània d' E. coli, L. monocytogenes, S. aureus i S. enterica en aliments, mitjançant la combinació d' una etapa de co-cultiu en medi líquid i la detecció per PCR múltiple.
S'ha avaluat l'eficiència de diversos mitjans d'enriquiment i s'ha seleccionat l'aigua de peptona tamponada com el medi òptim per al co-cultiu dels quatre bacteris diana. També es van optimitzar les condicions de PCR múltiple i es van aplicar tant a co-cultius com a mostres d'aliments inoculats artificialment, enciam orgànic i carn picada.
Després de l'optimització, la PCR múltiple desenvolupada va ser capaç de detectar els quatre bacteris simultàniament, fins a una inoculació inicial de 10^0 UFC/mL. En presència d' ambdues matrius alimentàries inoculades, després l' etapa de co-cultiu, la PCR múltiple va poder detectar simultàniament els 3 bacteris: E. coli, S. enterica i L. monocytogenes, mentre que S. aureus s' ha detectat per PCR simple, a partir del mateix extracte d' ADN del co-cultiu.
Els resultats obtinguts permeten concloure que l' ús d' un pas de co-cultiu en Aigua de peptona tamponada, abans de la detecció per PCR simple i múltiple, pot facilitar la detecció simultània dels quatre bacteris potencialment presents en les matrius alimentàries. La presència o absència del bacteri diana en els aliments es confirma en unes 30 hores, la qual cosa redueix el temps requerit per a la detecció en comparació amb el temps mínim de 7 dies per mètode cultural. Així mateix, permet reduir el nombre de mitjans de cultiu i reactius, per a l' aïllament i identificació de bacteris que no són detectats per PCR i que no estan presents en les matrius alimentàries, la qual cosa suposa un important estalvi econòmic. / [EN] Food safety is a priority for the population and is nowadays more important than ever due to certain dietary trends such as the consumption of raw foods and the widespread distribution of organic foods, which may be the cause of foodborne diseases.
To ensure food safety, the detection of these microorganisms must be done quickly and efficiently. Although, the microbiological culture method is considered to be the official method for the detection of these food-borne pathogens, it suffers from significant drawbacks, such as time-consuming, laborious and expensive, in addition it may be limited regarding the detection of physiologically altered and/or stressed bacteria, during storage and preservation.
In this work has been developed a simple and rapid protocol for the simultaneous detection of E. coli, L. monocytogenes, S. aureus and S. enterica in food, by combining a liquid co-culture step and detection by multiplex PCR.
The efficiency of several enrichment media was evaluated and buffered peptone water was chosen as the optimal medium for the co-culture of the four target bacteria. Then, optimized multiplex PCR conditions were applied to both the co-cultures and the samples of artificially inoculated foods, organic lettuce and ground meat.
After optimization, the developed multiplex PCR was able to simultaneously detect the four bacteria, up to an initial inoculation of 10^0 CFU/mL. In the presence of the two inoculated food matrices, after a co-culture step, the multiplex PCR could simultaneously detect the 3 bacteria: E. coli, S. enterica and L. monocytogenes, whereas, S. aureus has been detected by simplex PCR, from the same co-culture DNA template.
The results obtained allow conclusion that the use of a co-culture step in Buffered Peptone Water, before detection by simplex and multiplex PCR, can facilitate the simultaneous detection of the four bacteria potentially present in the food matrices. The presence or the absence of the target bacteria in food is confirmed in approximately 30 hours, which reduce the time required for the detection compared to the minimum time of 7 days by cultural method. Also, it allows to reduce the number of culture media and reagents, for the isolation and identification of bacteria that are not detected by PCR and which are not initially present in the food matrices, which represents a significant economic savings. / Boukharouba, A. (2022). Isolation and Identification of Foodborne Pathogens of Special Interest in Food Safety [Tesis doctoral]. Universitat Politècnica de València. https://doi.org/10.4995/Thesis/10251/182828
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