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Fatores de risco e evolução clinica em pacientes com infecção de corrente sanguínea por Enterococcus spp resistente a vancomicina em um hospital universitário em São Paulo / Risk factors and outcome on patients with vancomycin-resistant Enterococcus bllodstream infection at a university-affiliated hospital in São Paulo

Furtado, Guilherme Henrique Campos [UNIFESP] January 2005 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2015-12-06T23:05:46Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2005 / 0 enterococo resistente à vancomicina( VRE) é hoje patógeno de imensa importância no ambiente hospitalar, com aumento progressivo em sua incidência como causador de infecções nosocomiais. A bacteremia é uma das principais infecções causadas por este 1 patógeno e devido a sua importância e limitados dados nacionais foi definida como objeto deste estudo. Foram realizados dois estudos procurando avaliar a epidemiologia desta infecção em um hospital universitário . 0 primeiro estudo teve como objetivo avaliar os fatores de risco para bacteremia por VRE. No período de janeiro de 2001 a dezembro de 2003 foram estudados 34 pacientes com bacteremia por VRE, que foram comparados com 102 pacientes-controle pareados por ~ unidade de internação, sexo e idade. Tivemos durante o estudo uma incidência média de infecção de corrente sangüínea por VRE de 0,18 por 1000 pacientes-dia e de 0,11 por 100 saídas. A análise dos resultados demonstrou os seguintes fatores de risco estatisticamente significantes na análise univariada : uso de carbapenem( p= 0,003), uso de cefalosporinas p=0,017), uso de macrolídeos ( p= 0,025) , uso de polimixina B( p= 0,004), uso de vancomicina( p< 0,001), uso de cateter venoso central ( p= 0,023) , uso de ventilação mecânica( p= 0,021) , uso de sonda nasogástrica/nasoenteral( p= 0,001), tempo de internação( p< 0,001) e número de antibióticos(p= 0,001). Na análise multivariada, o único fator de risco independentemente associado à bacteremia por VRE foi : o uso prévio de vancomicina( OR= 10,19; IC9so¿= 3,63- 28,57)¿(au) / Vancomycin-resistant Enterococcus( VRE) is currently a very important pathogen at hospital environment, with progressive increase on its incidence as a cause of nosocomial infections. Bacteremia is a leading infection caused by this pathogen and due its importance and restricted national data was defined as objective of this study. Two studies were performed in order to evaluate the epidemiology of this type of infection at an university-affiliated hospital. The first study evaluated the risk factors for bacteremia by VRE. During the period from january 2001 to december 2003 we studied 34 patients with bacteremia by VRE who were compared to 102 control-patients matched by admission unit, sex and age. We had a average incidence of bloodstream infection by VRE of 0.18 per 1000 patient-days and 0.11 per 100 discharges. The analysis of the results, showed that the following risk factors were statistically significant in univariate analysis: carbapenem use( p= 0,003), cephalosporin use( p= 0,017), macrolides use( p=0,025), polimyxyn use(p= 0,004), vancomycin use( p < 0,001), central venous catheter use( p= 0,023), mechanic ventilation use( p=0,021), nasogastric/nasoenteral tube use( p=0,001), lenght of hospital stay( p< 0,001) and number of antibiotics( p= 0,001). The only factor independently associated to bacteremia on multivariate analysis was : previous vancomycin use( OR= 10,19 ; IC95%= 3,63- 28,57). 113 The second study was performed with the aim to study comparatively the patients with bacteremia by VRE and VSE in order to define differences between the groups concerning clinical outcome. We studied 34 patients with VRE bacteremia and 55 patients with VSE bacteremia admitted in several hospital units. The analysis of results showed that the following factors were statistically significant on univariate analysis: previous carbapenem use( p= 0,001), previous vancomycin use( p< 0,001), mechanical ventilation( p=0,016), nasogastric/nasoenteral tube use( p= 0,004), vasoactive drug use( p= 0,013), lenght of hospital stay( p< 0,001), number of antibiotics( p= 0,001). The only factors statistically significants on multivariate analysis between the two groups were: vasoactive drug use ( OR= 3,61; CI95%= 1,02- 12,72) and number of antibiotics( OR= 1,57; CI95%= 1,15-2,15) in first model and vasoactive drug use( OR= 5,68; CI95%= 1,25- 25,89) and previous vancomycin use( OR= 17,58; CI95%= 5,24-58,96) in second model. The most common Enterococcus species that caused bloodstream infection in our study was E.faecalis( 100% in VRE group and 95,6% in VSE group). There was 100% of sensivity to ampicillin, streptomycin and linezolide in VRE group. Due the importance of VRE bacteremia in hospitals, it is crucial to define the main risk factors associated to it and to observe whether there is differences on outcome in enterococcal bacteremia concerning vancomycin resistance. / BV UNIFESP: Teses e dissertações
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Determinação da relação clonal e fatores de virulência em enterococos isolados de imaturos de Heliconius erato phyllis (Lepidoptera – Nymphalidae) / Determination of clonal relationship and virulence factors in enterococci isolated from immatures of Heliconius erato phyllis (Lepidoptera – Nymphalidae)

Huff, Rosana January 2018 (has links)
Enterococcus estão presentes no trato gastrointestinal (TGI) de animais vertebrados e invertebrados, os quais podem adquirir estas bactérias através de mecanismos de transferência horizontal e vertical de micro-organismos. Pesquisas recentes descreveram a presença de Enterococcus em lepidópteros, porém estudos com borboletas do gênero Heliconius são escassos. Este trabalho teve como objetivo, a partir de uma bacterioteca de 178 Enterococcus sp. previamente isolados de fezes de imaturos de Heliconius erato phyllis detectar a presença de genes de resistência e virulência por PCR; avaliar fenotipicamente os fatores de virulência e a produção de compostos com atividade antimicrobiana; e avaliar o perfil clonal das cepas pela técnica de PFGE. Dos 178 enterococos, 55 apresentavam resistência a eritromicina e 11 a norfloxacina e/ou ciprofloxacina, porém não foi detectado nenhum gene relacionado a estes fenótipos de resistência. Quanto aos fatores de virulência testados nos 178 enterococos, 63 isolados amplificaram para o gene esp, 12 para ace e 2 para gelE. Os genes agg e cylA não foram detectados. Na análise fenotípica dos fatores de virulência, os dois E. faecalis positivos para gelE também foram positivos para a degradação da gelatinase e 130 enterococos apresentaram capacidade de hidrolisar hemácias. Para investigar a produção de substância antagonista, foram selecionados 26 enterococos; destes, 15 apresentaram atividade contra a bactéria indicadora Listeria monocytogenes. Oitenta e seis isolados foram selecionados para avaliar a relação clonal por PFGE, e foi possível observar a partir do dendrograma que os enterococos no TGI dos imaturos têm origem alimentar e materna. Conclui-se que os enterococos provenientes de amostras fecais de imaturos de H. erato phyllis possuem poucos genes relacionados a mecanismos de virulência comuns na área clínica. É possível que os Enterococcus produtores de substância antagonista desempenhem um papel importante no equilíbrio das comunidades microbianas do TGI deste inseto, e que ocorra a transferência vertical de micro-organismos das fêmeas para a prole para a espécie H. erato phyllis. / Enterococcus is present in the gastrointestinal (GI) tract of vertebrates and invertebrates, which can acquire these bacteria through mechanisms of horizontal and vertical transfer of microrganisms. Recent research has described the presence of Enterococcus in Lepidoptera, but studies with butterflies of the genus Heliconius are scarce. This study had as objective, from a bacterioteca of 178 Enterococcus sp. previously isolated from fecal samples of immature Heliconius erato phyllis detect the presence of resistance and virulence genes by PCR; phenotypically assess the virulence factors and the production of compounds with antimicrobial activity; and to evaluate the clonal profile of the strains by PFGE. Of the 178 enterococci, 55 were resistant to erythromycin and 11 resistant to norfloxacin and/or ciprofloxacin, however was not detected any gene related to these resistance phenotypes. The virulence factors were tested in 178 enterococci, and 63 isolated amplified for the esp gene, 12 for ace and 2 for gelE. The agg and cylA genes were not detected. In the phenotypic analyzes, both E. faecalis positive to gelE gene were also positive for the degradation of gelatinase, and 130 enterococci showed ability to hydrolyze red blood cells. To investigate the production of antagonistic substance, 26 enterococci were selected and of these, 15 showed activity against the indicator bacteria Listeria monocytogenes. Eighty-six isolates were selected to evaluate the clonal profile by PFGE, and it was possible to observe in the dendrogram that the origin of the enterococci in GIT of immatures was the herbivory and maternal origin. It is concluded that the enterococci from fecal samples of immature H. erato phyllis possess few mechanisms of virulence-related genes, common in the clinical area. It is possible that the antagonistic substance-producing enterococci could play an important role in the equilibrium of the microbial communities of the GIT of this insect, and there is vertical transmission of enterococci from females to their offspring to the specie H. erato phyllis.
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Copper supplementation and antimicrobial resistance in swine and Salmonella enterica in liver abscesses of cattle

Capps, Kaylen McKenzie January 1900 (has links)
Master of Science / Department of Diagnostic Medicine/Pathobiology / Raghavendra Amachawadi / T.G. Nagaraja / Copper is an essential micronutrient that is supplemented in swine diets as a growth promoter. Previous studies suggest a link between copper supplementation and co-selection of antimicrobial resistance (AMR) in Enterococcus, but the data are inconsistent. Therefore, the objective of this study was to assess the impact of copper supplementation, alone or with chlortetracycline (CTC), on prevalence and concentration of copper resistance gene, tcrB, prevalence of tetracycline [tet(M)] and macrolide resistance [erm(B)] genes, and AMR in fecal enterococci of weaned piglets. A total of 320 weaned piglets at 21 days of age were allocated into 64 individual pens distributed equally among two barns. Pen-pair was the experimental unit (n=32). Four treatments were used: a basal diet as the control, a basal diet with 200 ppm of copper as copper sulfate, a basal diet with chlortetracycline (CTC) at 400 g/ton of feed, and a basal diet with 200 ppm of copper and CTC at 400 g/ton of feed. The study period was 35 days with days -7 to -1 as an acclimation period and days 0 to 28 as the treatment period. Direct fecal samples were collected on days 0, 14, and 28. Prevalence of tcrB-positive enterococci was not affected by copper and or CTC supplementation (P > 0.05). Prevalence of tcrB-positive enterococci was higher on day 14 than other sampling days (P = 0.002). Prevalence of tet(M)-positive enterococci was not affected by treatment group or sampling day (P > 0.05). Prevalence of erm(B)-positive enterococci had a significant treatment and sampling day interaction (P = 0.0213). The total copy number of the tcrB gene was quantified as a percent of total bacterial cells in the feces. The median copper MIC of tcrB-negative and -positive isolates was 3 mM and 20 mM, respectively (P < 0.0001). For day 0 (n=64) and day 28 (n=63), all Enterococcus isolates were susceptible to gentamicin, kanamycin, streptomycin, daptomyicin, and tigecycline, with majority of isolates resistant to chloramphenicol, erythromycin, lincomycin, linezolid, tetracycline, tylosin tartrate, and synercid. For day 0 (n=64) and day 28 (n=63), respectively, a total of 61 (95.3%) and 47 (74.6%) isolates were resistant to erythromycin, 51 (79.7%) and 41 (65.1%) to tylosin, and 60 (93.8% and 95.2%) to tetracycline. The results of this study show that supplementing copper, with or without a selection pressure of chlortetracycline, did not increase copper-resistant enterococci and did not co-select resistance to any other antibiotics. Liver abscesses in feedlot cattle have a significant economic impact because of reduction in cattle performance, and carcass yield and liver condemnation at harvest. Fusobacterium necrophorum is the primary causative agent of the liver abscesses. Recently, Salmonella enterica has been isolated from liver abscesses of cattle. Our objectives of this study were to determine prevalence of Salmonella, compare conventional (serological) and commercially available Check &Trace serotyping methods, and to describe the antimicrobial susceptibility patterns of Salmonella isolated from liver abscesses of feedlot cattle. In the 2014 study, the number of liver abscesses positive for Salmonella were higher (P < 0.05) in cattle fed no tylosin in the diet (66/200; 33%) compared to tylosin-fed cattle (31/183; 16.9%). In the 2015 study, Salmonella prevalence tended to be higher in liver abscesses categorized as severe (29/106; 27.4%) compared to mild liver abscesses (38/174; 21.8%), but the difference was not significant. Out of the 164 Salmonella isolated, 152 (92.7%) were used for serotyping and 164 strains were used for antimicrobial susceptibility testing. Serotyping was done by serological method, which is considered as the gold standard, and the commercial Check & Trace method, which is a molecular method based on differences in their DNA sequence. A total of 11 serotypes were identified with Lubbock (66/152; 43.4%) being the predominant serotype, followed by Agona (24/152; 15.8%), Anatum (20/152; 13.2%), and Montevideo (18/152; 11.8%). The commercial identified only a few serotypes correctly suggesting that the method requires further validation. Antimicrobial susceptibility testing was done by microbroth dilution method according to Clinical Laboratory Standards Institute guidelines. A majority of the Salmonella strains were pansusceptible to the antimicrobials included in the panel. Overall, 10 strains (10/164; 6.1%) were resistant to one or more antibiotics and belonged to serotypes Agona, Anatum, Cerro, Lubbock, Mbandaka, and Reading. The top three of nine resistant antibiotics were chloramphenicol (5/10; 50%), streptomycin (5/10; 50%), and tetracycline (6/10; 60%). Whether Salmonella contributes to liver abscess formation or just happen to survive in an abscess initiated by the primary etiologic agent, Fusobacterium necrophorum, remains to be determined.
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Epidemiologia molecular, fatores de risco e prognóstico da infecção por Enterococcus spp resistentes à vancomicina em situação de introdução recente : um estudo em dois hospitais públicos de Bauru-SP /

Correa, Adriana Aparecida Feltrin. January 2014 (has links)
Orientador: Carlos Magno Castelo Branco Fortaleza / Coorientador: Antônio Carlos C. Pignatari / Banca: Silvana Torossian Coradi / Banca: Maria de Lourdes Ribeiro de Souza / Resumo: Antes da emergência da resistência à vancomicina, Enterococcus spp não eram considerados patógenos de grande risco para pacientes submetidos a cuidados em saúde. Estas bactérias raramente causavam infecções sistêmicas e eram isoladas principalmente de infecções urinárias. Atualmente, são considerados uma grande ameaça no ambiente hospitalar, devido à emergência dos enterococos resistentes à vancomicina (Vancomycinresistant enterococci, VRE). Nosso estudo pretendeu abordar de forma ampla a epidemiologia, os fatores de risco, a clonalidade e o prognóstico da aquisição de VRE em dois hospitais consorciados: O Hospital Estadual Bauru (HEB) e o Hospital Estadual Manuel de Abreu (HEMA), ambos pertencentes à Secretaria de Estado da Saúde de São Paulo. Para tanto, combinamos metodologias de epidemiologia clássica e molecular. O período de coleta de isolados foi de janeiro de 2010 a junho de 2012, correspondendo à época de emergência e disseminação dos VRE nos hospitais do estudo. Foram incluídos 122 sujeitos que adquiriram VRE em um dos hospitais, e 8 casos classificados como importados (isto é, procedentes de outros serviços de saúde). Os isolados eram procedentes de culturas clínicas (solicitadas pelos médicos responsáveis) ou de vigilância (swabs retais coletados sob orientação da Comissão de Controle de Infecção Hospitalar). Foram caracterizados por métodos usuais de identificação de espécie e antibiograma. Todos foram submetidos a tipagem molecular por Eletroforese de Campo Pulsado (Pulsed-Field Gel Electrophoresis, PFGE), utilizando a enzima de restrição smaI. Foram realizados estudos caso-controle (com análise multivariada), excluindo os sujeitos que adquiriram VRE em outros serviços. Para os 122 casos remanescentes, foram selecionados 244 controles, nos quais o VRE não foi identificado. Dentre os casos identificados nos hospitais do estudo, 113 (86,9%) foram caracterizados ... / Abstract: In the decades that preceded the emergence of vancomycin resistance, Enterococcus spp. were not considered pathogens of greatest risk for patients undergoing health care. These bacteria rarely caused systemic infections and were isolated mainly from urinary tracr infections. Presently, they are considered a major threat in hospitals due to the emergence of vancomycin-resistant Enterococci (VRE). Our study sought to provide a wide evaluation of the epidemiology, risk factors, clonality and outcome of VRE colonization/infection in two hospitals from a public health consortium: Hospital Estadual Bauru (HEB) and Hospital Estadual Manuel de Abreu (HEMA) Hospital , both belonging to São Paulo State Health Secretariat. We combined classic epidemiological methods and molecular epidemiology. The study period extended from January 2010 through June 2012 , corresponding to the time of emergence and spread of VRE in hospitals in the study. We included 122 subjects who acquired VRE in one of the study hospitals, and 8 cases classified as imported (i.e., who acquired VRE in other health services) . The isolates were obtained from clinical cultures (requested by attending physicians) or surveillance cultures (rectal swabs collected under the guidance of the Committee on Hospital Infection Control). VRE were characterized by the usual methods of species identification and antibiotic susceptibility. All isolates were subjected to molecular typing using Pulsed-Field Gel Electrophoresis (PFGE) using the restriction enzyme SmaI . Case-control studies (with multivariable analysis) were performed excluding subjects who acquired VRE in other services. For the remaining 122 cases , 244 controls were selected , in which VRE was not identified. Among the cases from the study hospitals, 113 (86.9%) were identified as Enterococcus faecium and 17 (13.1%) and Enterococcus faecalis. Overall, 88 (67.7%) were isolated in HEB and 42 (32.7%) in HEMA . The autochthony was ... / Mestre
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Enterococcus SPP resistente à vancomicina : tipagem molecular, caracterização clínica e associação com mortalidade

Sandri, Ana Maria January 2004 (has links)
Resumo não disponível
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Avaliação dos fatores de virulência e a capacidade de formação de biofilme in vitro em isolados alimentares e clínicos de Enterococcus sp. e utilização de PCR-RFLP para a identificação de Enterococcus casseliflavus e Enterococcus gallinarum / Investigation of virulence factors and the ability of biofilm formation in vitro of clinical and food isolates of Enterococcus sp. and use of PCRRFLP to identify Enterococcus gallinarum and Enterococcus casseliflavus

Medeiros, Aline Weber January 2011 (has links)
O papel dualístico exercido por Enterococcus na natureza estimula a pesquisa dos fatores que determinam sua virulência. O objetivo desse estudo foi investigar a distribuição de genes envolvidos com fatores de virulência entre isolados de Enterococcus e sua correlação com a capacidade de formação de biofilme e confirmar a identificação de E. casseliflavus e E. gallinarum por PCRRFLP. Foram analisados 66 isolados clínicos e 70 alimentares quanto a presença dos genes gelE, esp, agg, ace e cylA por PCR e atividade de gelatinase e citolisina. Isolados clínicos apresentaram maior incidência de fatores de virulência quando comparados com alimentares, exceto para os genes gelE e ace. Em ambas amostragens houve a ocorrência de isolados positivos para os genes gelE e cylA, porém sem atividade enzimática, indicando a presença de genes silenciosos. A maioria dos isolados apresentou capacidade de formação de biofilme, entretanto não houve uma correlação entre os genes analisados e o fenótipo de formação de biofilme, porém é possível que o gene ace e gelE atuem como potencializadores na formação de biofilmes em Enterococcus. Para testar a técnica de PCR-RFLP, 32 e 20 isolados de E. gallinarum e E. casseliflavus, respectivamente, identifcados bioquimicamente foram avaliados. O fragmento de 661 bp correspondente a uma região conservada do 16S rDNA foi clivado com HinfI e 47% E. gallinarum e 25% E. casseliflavus apresentaram fragmentos de 589bp e 72bp, padrão esperado para o PCR-RFLP. Assim sendo, a PCR-RFLP mostrou ser uma ferramenta molecular útil na confirmação das espécies E. casseliflavus e E. gallinarum. / The dualistic role played by enterococci in the nature, encourages the study of virulence factors. The aim of this study was to investigate the distribution of genes involved in virulence among Enterococcus isolates and to correlate with biofilm formation ability and to confirm the identification of Enterococcus gallinarum and Enterococcus casseliflavus isolated from clinical and food samples by PCR-RFLP. Sixty six clinical and 70 food isolates were analyzed for the presence of gelE, esp, agg, ace and cylA genes by PCR and the gelatinase and cytolysin activities. Clinical isolates showed a higher incidence of virulence factors when compared to food isolates, except for gelE and ace genes. In both samples was observed the occurrence of isolates positive for gelE and cylA genes, but with no enzymatic activities, indicating the presence of silent genes. Most isolates showed ability to form biofilm, although there was no correlation between the presence of the genes and the phenotype of biofilm formation, but it is possible that ace and gelE genes perform as enhancers in biofilm formation in Enterococcus. To test the PCR-RFLP tecnhique, 32 and 20 strains identified by conventional biochemical exams as E. casseliflavus E. gallinarum, respectively, were were submitted to PCR amplification and digested with HinfI.. The DNA fragment of 661 bp corresponding to a conserved region of 16S rDNA was cleaved with HinfI and 47% and 25% of E. gallinarum and E. casseliflavus showed DNA fragments of 589 bp and 72 bp, expected for PCR-RFLP. Thus, PCR-RFLP proved to be a useful molecular tool for confirmation the E. casseliflavus and E. gallinarum species.
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Análise fenotípica e genotípica de Enterococcus sp. isolados de frango após subcultura no laboratório

Schmidt, Gisele January 2009 (has links)
Enterococos são bactérias que exercem um papel muito importante na produção de vários alimentos fermentados e também podem ser usadas como probióticos. A presença e o crescimento de enterococcos em alimentos fermentados como queijos e lingüiças conferem a esses produtos características organolépticas únicas. Em contrapartida, sua presença nos alimentos também está associada com falta de higiene durante a manipulação. Estes microrganismos também estão relacionados com o desenvolvimento de algumas doenças, como endocardites, septicemia, infecções do trato geniturinário, entre outras. A presença de características de virulência aumenta o potencial de infecção do microrganismo e a severidade da doença a ele relacionada. Com o objetivo de avaliar possíveis modificações fenotípicas e genotípicas de amostras de enterococos isoladas de frango, durante a subcultura destas cepas no laboratório, várias análises foram realizadas como: a presença dos fatores de virulência; proteína de superfície (esp) e gelatinase (gelE), do operon fsr-regulador do gelE, a expressão fenotípica do gelE, a capacidade de formação de biofilme e a resistência a antimicrobianos, desinfetantes e antisépticos. Quarenta isolados de Enterococcus sp. foram avaliados quanto a presença dos genes gelE, esp, operon-fsr, sprE por PCR, a atividade gelatinolítica por testes bioquímicos convencionais, resistência a antimicrobianos, antisépticos e desinfetantes por antibiograma e formação de biofilme pelo método cristal violeta. Todos os testes foram realizados na 1º geração e na 12º geração das cepas. 85% dos isolados produziram gelatinase e em 92,5% dos isolados o gene gelE estava presente na 1º geração. A análise do fsr-operon destes isolados do primeiro cultivo demonstrou que o gene fsrA estava presente em 35 isolados e o fsrC em 37 isolados e a presença destes genes pareceu não ter correlação com a atividade gelationolítica. O gene fsrB estava presente em todos os isolados (35) que apresentaram atividade gelatinolítica sugerindo que a presença deste gene é importante na expressão desta enzima. Após o subcultivo, apenas um isolado perdeu a atividade gelatinolítica e 15 perderam o gene gelE. Doze isolados perderam pelo menos um gene do fsr-operon durante a subcultura, porém nenhum destes perdeu a capacidade de expressar a enzima gelatinase talvez devido à presença do gene fsrB. O gene sprE foi detectado em 34 isolados na primeira geração e na 12º geração em apenas 20 isolados. O gene da proteína de superfície de Enterococcos (Esp), não foi encontrado em nenhum dos isolados. O antibiograma do isolados no primeiro cultivo demonstrou que 100% dos isolados foram sensíveis a ampicilina e a gentamicina, 95% sensíveis a vancomicina, 85% a ciprofloxacina, 5% a tetraciclina, 65% a eritromicina e 52,5% a cloranfenicol tanto na 1º quanto na 12º geração. Após a subcultura a susceptibilidade dos isolados aumentou a eritromicina (67,5%) e ao cloranfenicol (80%). Quanto ao perfil de resistência aos detergentes e anti-sépticos de uso comercial, todos os isolados apresentaram fenótipo de resistentes ao linear alquilbenzeno sulfonato (LAS) e ao triclosan durante a subcultura. Todos isolados foram suscetíveis ao formaldeído, mas se tornaram resistentes ao 8,5% hipoclorito de sódio e a clorexidina durante a subcultura. Em geral, todos os isolados foram formadores de biofilme e a produção de gelatinase parece ser necessária para esta formação. O perfil genético não pareceu ter relação com a formação de biofilme. Tanto o perfil genotípico quanto o fenotípico pode sofrer alterações durante a subcultura das cepas no laboratório. / Enterococci are bacteria that have a very important role in the production of various fermented foods and can also be used as probiotics. The presence and growth of enterococci in fermented foods like cheese and sausages bring to these products unique organoleptic characteristics. However, their presence in foods is also associated with lack of hygiene during handling. These microorganisms are also related to the development of some diseases such as endocarditis, septicemia, genitourinary infections, among others. The presence of virulence characteristics increases the potential infection of the organism and severity of disease related to it. The aim of the present study is analyze the possible changes of phenotypic and genotypic of enterococci isolated from chicken, during the subculture of the strains in the laboratory, the presence of virulence factors: enterococcal surface protein (esp) and gelatinase (gelE), operon-fsr gelE regulator, gelE phenotypic expression, the ability of biofilm formation and antibiotic, disinfectant and antiseptic resistance were determined in samples of enterococci isolated from chicken. The presence of gelE, esp operon-fsr and sprE genes were evaluated by PCR, gelatinase activity were observed by conventional biochemical tests, antibiotics resistance, antiseptics and disinfectants resistance were analyzed by standard disk diffusion method and biofilm formation were detected following the crystal violet staining method in forty enterococci isolates from chicken. All tests were performed in the 1st generation and 12th generation. 85% of the isolates produced gelatinase and in 92.5% of the isolated the gelE gene was present in the 1st generation. The analysis of operon-fsr in the 1st generation of these isolates showed that the fsrA gene was present in 35 isolates and fsrC gene was present in 37 isolates and the presence of these genes seemed to have no correlation with the gelatinase activity. The fsrB gene was present in all isolates (35) with gelatinase activity suggesting that the presence of this gene is important in the expression of this enzyme. After subculture, only one isolate lost the gelatinase activity and 15 isolates lost the gelE gene. Twelve isolates lost at least one gene of the operon-fsr during laboratory subculture, but none of these isolates lost the ability to express the enzyme gelatinase probably due the presence of the fsrB gene. The sprE gene was detected in 34 isolates in the 1st generation and in 12th generation only 20 isolates maintained this gene. The protein surface of enterococci gene (Esp), was not found in any isolate. The antibiogram of the isolates showed that 100% of the isolates were susceptible to ampicillin and gentamicin, 95% susceptible to vancomycin, 85% to ciprofloxacin, tetracycline 5%, 65% to erythromycin and 52.5% to chloramphenicol in the 1st generation. After subculture the susceptibility of isolates to erythromycin (67.5%) and chloramphenicol (80%) increased. As the profile of resistance to detergents and antiseptics for commercial use, all isolates showed resistance phenotype of the linear alkylbenzene sulfonate (LAS) and triclosan during subculture. All isolates were susceptible to formaldehyde, but became resistant to 8.5% sodium hypochlorite and chlorhexidine during the subculture. In general, all isolates were biofilm formers. Gelatinase production appears to be required for biofilme formation. The genetic profile did not appear to have relation with the formation of biofilms. Genotypic and the phenotypic profile may change during the subculture of the strains in the laboratory.
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Isolamento e caracterização de peptídeos antimicrobianos produzidos por Enterococcus spp. provenientes de amostras alimentares e ambientais / Isolation and characterization of antimicrobial peptides produced by Enterococcus spp. from food and environmental samples

Comerlato, Carolina Baldisserotto January 2015 (has links)
As enterocinas são compostos de natureza proteica que apresentam atividade antimicrobiana contra bactérias patogênicas e deteriorantes de alimentos. Sendo assim, 53 isolados de Enterococcus spp. de leite cru de búfala e fezes de lobos-marinhos foram triados através da técnica de dupla camada e 26 apresentaram atividade antimicrobiana contra Listeria monocytogenes. A presença dos genes entA, entB, entP e munKS foi avaliada por PCR e 10 isolados apresentaram o entB, um munKS e nenhum entA e entP. De 26 isolados foi produzido o sobrenadante livre de células para a avaliação da atividade e destes, somente E. mundtii (que apresentou o gene munKS) apresentou atividade contra L. monocytogenes. Este isolado foi suscetível aos antimicrobianos testados e foi negativo para os genes de virulência cylA, ace e asa e positivo para gelE. O sobrenadante livre de células de E. mundtii apresentou resistência a maioria dos solventes orgânicos testados, estabilidade ao aquecimento (121 °C por 15 min), a uma ampla faixa de pH e à estocagem por 30 dias a -20 °C, além do aumento da atividade com Tween 80. A sensibilidade a proteases confirmou a natureza proteica desse peptídeo. Foi realizada a curva de produção da mundticina, que começou na fase logarítmica e obteve sua atividade máxima na fase estacionária. Não foi observada a presença de plasmídeo sendo, portanto, considerado que o gene que expressa este peptídeo esteja presente no cromossomo. Os resultados obtidos nesse trabalho indicam que a mundticina possui potencial de aplicabilidade em novos estudos relacionados com bioconservantes. / Enterocins are proteic compounds that exhibit antimicrobial activity against spoilage and food borne pathogenic bacteria. Therefore, 53 Enterococcus spp. of raw milk from buffalo milk and feces of fur seals were screened by double-layer assay and 26 showed antimicrobial activity against L. monocytogenes. The presence of entA, entB, entP and munKS genes was assessed by PCR and 10 isolates showed the entB, one munKS and no entA and entP. From 26 isolates was produced cell-free supernatant for evaluating the activity; and only E. mundtii (who presented munKS gene) showed activity against L. monocytogenes. This isolate was susceptible to antimicrobials tested and was negative for virulence genes cylA, ace, asa and positive for gelE. Cellfree supernatant of E. mundtii showed resistance to most organic solvents tested, stability to heat (121 °C for 15 min), to a wide range of pH and to storage for 30 days at -20 °C, in addition, increase the activity with the addition of Tween 80. The sensibility to proteases confirmed the protein nature of this peptide. Mundticin production curve was performed, which began production in log phase and obtained its maximum activity in the stationary phase. The presence of plasmid was not observed, therefore, was considered the gene that expresses this peptide is present in the chromosome. The results obtained in this study indicate that the mundticin has potential applicability in new studies related biopreservatives.
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Avaliação da diversidade e do perfil de susceptibilidade a antimicrobianos de Enterococcus sp. isolados nas águas do Arroio Dilúvio-Porto Alegre, RS / Evaluation of diversity and antimicrobial susceptibility profile of Enterococcus sp. isolated from Dilúvio stream waters – Porto Alegre, RS

Garbinatto, Gisele Nachtigall January 2011 (has links)
A contaminação das águas naturais representa um dos principais riscos à saúde pública, sendo conhecida a estreita relação entre a qualidade da água e inúmeras enfermidades. Enterococcus são habitantes da microbiota intestinal humana, podendo ser encontrados em praticamente todos os animais e ambientes. A importância crescente dos enterococos como patógenos oportunistas e a emergência e disseminação de cepas multiresistentes contribuiu para um maior interesse na epidemiologia desses micro-organismos. Os objetivos desse trabalho são caracterizar fenotipicamente e determinar o perfil de susceptibilidade a antimicrobianos de Enterococcus isolados das águas do arroio Dilúvio, em Porto Alegre. Foram coletadas amostras de água em cinco diferentes pontos do arroio, em quatro períodos do ano. Dos 348 isolados, 62,07% foram identificados como E. faecium, 13,50% como E. faecalis, 12,07% como E. casseliflavus e 12,36% como Enterococcus sp. Noventa e quatro por cento dos isolados demontraram resistência a pelo menos uma classe de antimicrobianos e 44,25% a duas classes. E. faecium foi a espécie com maior frequência de cepas resistentes (74,07%) a pelo menos duas classes de antimicrobianos, seguida de E. casseliflavus (66,67%) e E. faecalis (36,17%). No ponto 1, que corresponde a nascente do arroio, foi observado a menor incidência de cepas de Enterococcus e de cepas resistentes, quando comparados com os demais pontos de coleta. Os resultados demonstram a presença de cepas de Enterococcus resistentes isoladas em todos os pontos do arroio Dilúvio. Estes resultados mostram a necessidade de medidas sanitárias urgentes que busquem a melhoria da qualidade de suas águas a fim de evitar a contaminação e a disseminação de micro-organismos resistentes à antimicrobianos. / The contamination of natural resources of water is a major risk to public health, due to the tight relation between water quality and countless diseases. Enterococcus is ainhabit of human intestinal microbiota, and can be isolated from animals and environments. The increasing importance of enterococci as opportunistic pathogens, as well as the emergence and dissemination of multiresistant strains, contribute for a greater interest in epidemiology study of these microorganisms. The aim of this study was to characterize phenotypic and to determine the antimicrobial susceptibility of Enterococcus isolated from Dilúvio stream, in Porto Alegre. Water samples were collected in five different locations of the stream, throughout four periods of the year. Among the 348 isolates obtained 62.07% were identified as E. faecium, 13.50% as E. faecalis, 12.07% as E. casseliflavus, and 12.36% as Enterococcus sp. Ninty-four percent of the isolates were resistant to at least one antimicrobial class, and 44.25% to two classes. E. faecium was the most frequently species resistant to at least two antimicrobial classes (74,07%), followed by E. casseliflavus (66.67%) and E. faecalis (36.17%). In all locations was isolated Enterococcus resistant the results indicate the urgent sanity initiative, in order to improve the water quality of Dilúvio’s to avoid the contamination and of antimicrobial-resistant microorganisms.
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Identificação de espécies de enterococcus isoladas de queijo minas tipo frescal através da análise do polimorfismo dos fragmentos de restrição de parte do gene 16S rRNA amplificado pela PCR / Identification of enterococcus spp. isolated from fresh minas cheese by restriction fragment length polymorfism of the 16S rRNA gene fragment amplified by PCR

Scheidegger, Érica Miranda Damasio January 2009 (has links)
Made available in DSpace on 2015-02-20T12:56:11Z (GMT). No. of bitstreams: 2 94.pdf: 738482 bytes, checksum: 667de0856e030e189a750c7b2df0e974 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2009 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde / O gênero Enterococcus inclui aproximadamente 30 espécies, algumas das quais muito freqüentemente envolvidas com alimentos e ambientes relacionados, e cuja diferenciação com identificação precisa torna-se muitas vezes problemático, quando estas questões baseiam-se apenas em características fenotípicas que, mesmo assim, permitem separar estes microrganismos em cinco grupos fisiologicamente diferentes. A dificuldade para categorizar inequivocamente as espécies dos enterococos com base somente nas características bioquímicas pode estar relacionado com uma heterogeneidade bastante alta dos aspectos fenotípicos, independentemente da origem dos isolados, devendo ainda ser considerado o fato de haver bastante similaridade das exigências nutricionais entre os enterococos e outras bactérias ácido lácticas. Por estas razões as técnicas moleculares tornaram-se um importante instrumento para caracterização destes microrganismos. Dentre estas, aquelas que se baseiam no uso do 16S rRNA como molécula alvo têm sido consideradas como excelentes opções com propósitos de identificação. A técnica PCR/RFLP fundamenta-se em uma metodologia baseada na amplificação por PCR e nos perfis de restrição obtidos após o uso de enzimas selecionadas com base na sua habilidade de revelar polimorfismo nos fragmentos de DNA ou RNA analisados. Este trabalho tem como objetivo implantar a técnica da PCR/RFLP com as enzimas DdeI, HaeIII e HinfI associada a alguns testes bioquímicos para uma identificação de Enterococcus spp. isolados de amostras de queijo Minas tipo frescal. / O gênero Enterococcus inclui aproximadamente 30 espécies, algumas das quais muito freqüentemente envolvidas com alimentos e ambientes relacionados, e cuja diferenciação com identificação precisa torna-se muitas vezes problemático, quando estas questões baseiam-se apenas em características fenotípicas que, mesmo assim, permitem separar estes microrganismos em cinco grupos fisiologicamente diferentes. A dificuldade para categorizar inequivocamente as espécies dos enterococos com base somente nas características bioquímicas pode estar relacionado com uma heterogeneidade bastante alta dos aspectos fenotípicos, independentemente da origem dos isolados, devendo ainda ser considerado o fato de haver bastante similaridade das exigências nutricionais entre os enterococos e outras bactérias ácido lácticas. Por estas razões as técnicas moleculares tornaram-se um importante instrumento para caracterização destes microrganismos. Dentre estas, aquelas que se baseiam no uso do 16S rRNA como molécula alvo têm sido consideradas como excelentes opções com propósitos de identificação. A técnica PCR/RFLP fundamenta-se em uma metodologia baseada na amplificação por PCR e nos perfis de restrição obtidos após o uso de enzimas selecionadas com base na sua habilidade de revelar polimorfismo nos fragmentos de DNA ou RNA analisados. Este trabalho tem como objetivo implantar a técnica da PCR/RFLP com as enzimas DdeI, HaeIII e HinfI associada a alguns testes bioquímicos para uma identificação de Enterococcus spp. isolados de amostras de queijo Minas tipo frescal. Vinte e uma espécies de referência do gênero Enterococcus foram utilizadas para o estabelecimento dos perfis de restrição. Cinquenta e quatro isolados de leite e frango que apresentaram perfis fenotípicos típicos, atípicos e alguns sem identificação quanto à espécie estocados em nosso laboratório foram utilizados para testar a técnica desenvolvida e 21 isolados provenientes do queijo Minas tipo frescal foram utilizados para confirmar a utilidade da técnica. Ao utilizarmos a técnica PCR/RFLP obtivemos 5 perfis de restrição diferentes e, quando associados alguns testes bioquímicos, foi possível obter uma identificação rápida e precisa da maioria das espécies de Enterococcus.

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