Student Number : 0002920M - MSc dissertation - School of Animal, Plant and Environmental Sciences - Faculty of Science / Sustainability of commercial plantations is dependent on the conservation of soil nutrients, especially on the ancient, leached soils of the tropics. This is particularly important when limited fertilization is practiced. To assess the sustainability of commercial plantations, various sustainability indicators have been suggested. One such indicator is that of biodiversity. The measurement of soil faunal diversity is important as soil fauna play an active role in the cycling of nutrients through the decomposition of plant residues and organic matter. The diversity and different feeding activities of soil fauna influence the rate at which nutrient cycling occurs either through microbial grazing, faecal deposition, the mixing of litter with the mineral soil as well as through the spreading of microbial inoculum. Management practices may, however, negatively influence nutrient availability through losses associated with the burning and removal of slash residues, thus changing the soil faunal community composition. In Eucalyptus grandis plantations in South Africa, the site is usually burned following the harvest and prior to replanting, which may markedly disrupt soil faunal function and nutrient availability. Soil biological processes, nutrient loss and soil faunal composition were the focus of this study. Nutrient losses associated with fire and slash management practices were determined by comparing the quantity of nutrients lost from the slash that was either spread or piled following burning. The in situ nitrogen and phosphorus mineralization rates and soil faunal composition were measured in six randomly located plots, three burned and three unburned, prior to and after a low intensity fire. Results indicate that 78 – 99% of phosphorus, nitrogen and carbon were lost from the slash as a result of burning, with a greater percentage loss occurring from the slash that was spread. It was further shown that within the burned plots the nitrogen availability was enhanced four fold within the first month following the fire. Phosphorus availability was also enhanced ten fold as a result of the burning, however, these effects on nitrogen and phosphorus availability were short lived. Soil faunal diversity was low both prior to and after burning. Ants are the dominant soil fauna. Soil faunal composition was more markedly influenced by season than by fire, with millipedes occurring in all plots in spring, prior to the fire and ants dominating in summer, post fire.

O comércio ilegal de fauna é hoje uma das principais ameaças aos animais silvestres brasileiros, junto com a perda e degradação de habitats. O grupo pelo qual existe maior demanda é o das aves, principalmente as canoras. Paralelamente, o número de apreensões de aves provenientes do comércio ilegal tem crescido a cada ano. Apesar de um grande número de indivíduos não sobreviver, dos que sobrevivem, muitos são recuperados e estão, em teoria, aptos a voltarem à vida livre. Contudo, esforços de repatriação devem ser vistos com extrema cautela, já que grandes prejuízos podem ser trazidos para as populações naturais se inseridos nelas indivíduos de grupos genéticos diferentes. Com isso, tornam-se extremamente necessários estudos demográficos e de estrutura genética de espécies com grande demanda no comércio ilegal. Além de auxiliar tomadas de decisões sobre possíveis esforços de repatriação, estes estudos contribuirão com o maior conhecimento das espécies. Este projeto teve como objetivo o estudo da genética de populações de quatro espécies de passeriformes sabidamente de grande interesse para o comércio ilegal, procurando abranger a maior área possível de suas distribuições: o azulão (Cyanoloxia brissonii), o trinca-ferro (Saltator similis), o galo-da-campina (Paroaria dominicana) e o pixoxó (Sporophila frontalis). Foram realizadas 19 viagens a campo, coletadas 522 amostras (entre amostras de apreensão e de populações naturais) e outras foram obtidas por colaboração com diversas instituições. Foram construídas quatro bibliotecas genômicas com o intuito de desenvolver oligonucleotídeos iniciadores (primers) de marcadores microssatélites espécie-específicos, que foram posteriormente testados para as outras três espécies. Partido de mais de 700 clones sequenciados, foram descritos oito locos informativos para P. dominicana, nove para S. similis, sete para C. brissonii e quatro para S. frontalis. Por conta de dificuldade de obtenção de amostragens representativas, as análises populacionais foram realizadas com P. dominicana e S. similis. As análises de estrutura genética populacional (com 74 amostras) indicaram estruturação populacional sutil, porém significativa (p<0.01) para P. dominicana, com a descrição de três clusters: (1) nordeste, que englobou as localidades de coleta Paraíba, Trindade e Petrolina, e apresentou heterozigose observada (Ho) média de 0.736 e heterozigose esperada (He) média de 0.753; (2) sudoeste, composto pelas localidades Parnaguá, Beira Rio e Vitória da Conquista, com Ho 0.624 e He 0.731; e (3) leste, composto por Canudos e Feira de Santana, Ho 0.750 e He 0.768. A presença de estrutura genética nos marcadores nucleares e ausência no DNA mitocondrial (observada em estudos anteriores) podem indicar que existe filopatria dos machos e dispersão diferencial em P. dominicana. O teste kg não identificou sinal de expansão populacional, portanto, a hipótese de expansão populacional recente da espécie com base na expansão da Caatinga datada de quinze mil anos não foi corroborada. Foram encontrados sinais significativos de gargalo populacional recente com dois testes diferentes (Bottleneck e M-ratio) condizentes com a ocupação e degradação da Caatinga e a super-exploração da espécie nos últimos 200 anos. Além disso, os resultados permitiram o surgimento de uma nova hipótese, interessante para ser tratada em trabalhos futuros: um possível corredor de fluxo gênico entre os clusters nordeste e sudoeste, ao longo do Rio São Francisco. Por fim, foram também realizados testes de atribuição com 49 amostras de indivíduos da espécie provenientes de apreensões de fauna comercializada ilegalmente em São Paulo e todas foram atribuídas com probabilidade que variou de a 0.554 e 0.713 ao cluster nordeste. Essa tendência é relevante, e deverá ser levada em conta tanto para esforços de prevenção do tráfico da espécie, quanto o desenvolvimento de planos de repatriacão dos indivíduos apreendidos. Contudo, vale mencionar que, mesmo sempre sendo de suma importância que indivíduos apreendidos e reabilitados sejam soltos o mais próximo possível de sua real população de origem, dificilmente a mistura entre indivíduos de clusters diferentes levaria a uma depressão por exocruzamento. Não foi encontrada estrutura genética populacional significativa para S. similis (66 amostras) nem com a análise de diferenciação com populações definidas a priori, e nem através de duas análises de partição de amostras (análise discriminante de componentes principais e a realizada pelo Structure, baseada em algoritmo Bayesiano). Logo, não foi possível refutar a hipótese nula de pan-mixia. A espécie apresentou heterozigose média observada 0.643 enquanto que a esperada foi de 0.757. Os altos níveis de Hardy-Weinberg detectados sugerem que o cenário observado possa ser devido a efeitos demográficos. Os testes kg não identificaram sinal de expansão populacional recente. Entretanto, dois testes de gargalo populacional (Bottleneck e M-ratio) indicaram sinais de redução populacional recente, condizentes com a maior ocupação e degradação da Mata Atlântica e do Cerrado nos últimos 200 anos. A variação nos dialetos do canto observada para a espécie provavelmente está ligada à propagação do som nos diferentes ambientes e não a um isolamento genético entre populações. A ausência de estrutura genética permite afirmar que a probabilidade de ocorrência de depressão por exocruzamento causada por fluxo gênico entre indivíduos de origens diferentes é praticamente nula para S. similis / Wildlife trafficking is a major threat to Brazilian biodiversity, with millions of specimens withdrawn from nature every year to supply the consumer markets. In Brazil, the pet trade generates a major demand for birds. After seizure from the illegal trade, rehabilitation and release is one way of mitigating the negative impacts on wild bird populations, but those releases could create more problems for the natural populations. Knowledge of the species\' genetic structure is crucial to help avoid the possibility of outbreeding depression and to guide responsible releases. This project´s main goal was the study of the genetic structure of four passerine species, among the most trafficked birds in Brazil: ultramarine grosbeak (Cyanoloxia brissonii), green-winged saltator (Saltator similes), red-cowled cardinal (Paroaria dominicana) and buffy-fronted seedeater (Sporophila frontalis). We obtained 522 tissue/blood samples (from individuals with known orginin as well as those seized from the ilegal trade) both in field work trips and through collaboration with various institutions. We built four species-specific genomic libraries, all of which were cross-tested in the other three sepcies. From over 700 sequenced clones, we developed eight informative microsatellite loci for P. dominicana, nine for S. similes, seven for C. brissonii and four for S. frontalis. Genetic structure analyzes were performed only for P. dominicana and S. similis due to the difficulty of obtaining representative samples for the other two species. Data was analyzed both with and without a priori definition of populations using discriminant analysis of principal components, Bayesian clustering algorithms, and fixation indices. Genetic structure of P. dominicana was inferred using 71 samples with known origin and subtle but significant (p<0.01) genetic structure was found, with the description of three clusters: (1) northeast, which encompass the sampling localities of Paraíba, Trindade e Petrolina, with mean observed heterozigosity (Ho) of 0.736 and mean expected heterozigosity (He) of 0.753; (2) southwest, which encompass the localites Parnaguá, Beira Rio e Vitória da Conquista, with Ho 0.624 and He 0.731; and (3) east, which encompass Canudos and Feira de Santana, with Ho 0.750 and He 0.768. Occurrence of outbreeding depression for this species is unlikely due to high gene flow among clusters. The presence of genetic structure for nuclear markers not detected for mtDNA (previous studies) indicates male philopatry and different dispersion patterns between male and females. No population expansion signal was detected using kg tests, which precludes us from corroborating a previously proposed hypothesis of population expansion congruent with the Caating expansion 15 thousand years ago. Two tests (Bottleneck e M-ratio) indicated the occurrence of recent population bottlenecks for P. dominicana, which can be explained by the intense occupation, habitat degradation and over-exploitation of the Caatinga in the last 200 years. We also propose a new hypothesis, to be tested in future studies: the existence of a dispersion route along the Sao Francisco river, promoting gene flow between northeast and southwest clusters. Furthermore, we performed assignment tests in 49 samples from specimens seized from the illegal trade in Sao Paulo. All of them were assigned to the same \"northeast\" cluster with probability 0.554-0.713, showing a clear trend and a relevant result which corroborates police intelligence information. For S. similis, no significant genetic structure was detected (using 66 samples), so we could not refut the pan-mixia null hypothesis. Although this species\' range is a large, and now fragmented area, the possibility of outbreeding depression resulting from mixing populations is higly unlikely, which does not preclude consideration of other characteristics prior to release into the wild. The observed heterozigosity was 0.643 while the expected was 0.757. High levels of deviations from Hardy-Weinberg equilibrium may be due to population fluctuations. No population expansion signal was detected (kg test), but two tests (Bottleneck e M-ratio) indicate the occurrence of recent population bottlenecks, which could be related to the intense occupation, habitat degradation and over-exploitation of the Cerrado and Atlantic Forest in the last 200 years. Variation in song dialects observed in this species is probably related to characteristics of sound propagation in different environments, rather than to genetic isolation. Knowledge of genetic structure is one of the most important steps towards intelligent management of rehabilitated seized animals

Orientador: Edmir Daniel Carvalho / Banca: Gilmar Bastos Santos / Banca: Ana Paula Vidotto Magnoni / Resumo: A criação de peixes em gaiolas ou tanques-rede iniciou-se há mais de 50 anos, no Delta do rio Mekong. Atualmente, este tipo de cultivo está se expandido em represas brasileiras, tendo como modelo a espécie não nativa Tilápia-do-Nilo (Oreochromis niloficus). Contudo os impactos decorrentes desta atividade sobre a ictiofauna são pouco conhecidos. Sendo assim, o objetivo deste trabalho é caracterizar a estrutura e composição das assembléias de peixes agregadas ao sistema de piscicultura e do respectivo trecho controle e, com base em atributos ecológicos, inferir possíveis impactos destes sistemas sobre a ictiofauna residente da represa de Chavantes. Para tal foram realizadas coletas, com redes de espera, nos meses de outubro e dezembro de 2007 na área onde seriam instalados os tanques-rede (pré- Tanque) e no período de abril/2008 a março/2009 (pós-Tanque), ao redor dos tanquesrede (TR) e em um trecho controle (CT) - sem interferência deste sistema. Entre os períodos pré-TR e TR foram encontradas diferenças com relação à composição de espécies e às médias de captura em número e biomassa. Entre os trechos TR e CT, o primeiro foi responsável por mais de 75% das capturas em abundância e biomassa. Foram observadas diferenças na composição das espécies, porém os trechos apresentaram similaridade ictiofaunística média (Jaccard = 0,73 e Morisita-Horn = 0,43). Não foram encontradas grandes diferenças com relação aos demais índices ecológicos, porém, o TR apresentou menor diversidade e riqueza de espécies e maior dominância. Assim reforçamos a idéia de que os sistemas de tanques-rede exercem forte atratividade sobre os peixes, causando agregações ao seu redor, resultando em re-estruturação da ictiofauna, pois favorecem as espécies oportunistas que se ajustam mais facilmente às novas condições resultantes das atividades deste empreendimento... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Fish farming in cages or net pens began more than 50 years in the Mekong Delta. Currently, this type of cultivation is expanding in the Brazilian reservoirs having as a model the non-native specie nile-tilapia (Oreochormios niloticus) However it's impacts on the fish fauna are poorly known. The present study seeks to defining the structure and composition of fish assemblages aggregated to that system and and its stretch control and, based on ecological attributes identify potential impacts caused by fish farming system on the on the resident fish fauna existing at the chavantes damo In order to attend that purpose it was used gill nets to collect samples in October and December of 2007 from the area where the net-pens would be installed (pre-tank) and from April of 2008 through March of 2009 (post-tank) around the cages (TR) and from a control section (CT) not influenced by the fish farming system. As a result, differences concerning species' composition and average catch in abundance and biomass were found between the pre-TR and TR periods. Comparing to the CT strecht, the TR stretch presented more than 75% of the catch in number of biomass. Differences relating to the species compositions were also found. However the stretchs presented similar average of fish fauna (Jaccard = 0.73 and Morisita-Horn = 0.43). There was no major difference concerning other ecological index, however, TR had lower diversity and species richness and higher dominance. Hence, it is reinforced the idea that systems of cages exert a strong attraction for fish, causing aggregations around the cages, resulting in restructuring of the fish fauna, for they benefit those opportunistic species witch adjust more easily to the new conditions caused by that kind cultivation. Yet, one must pay attention to the issues of non-native species that can cause significant impacts. Since this study was accomplished during... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Orientador: Tânia Márcia Costa / Coorientador: Ronaldo Adriano Christofoletti / Banca: Fosca P. P. Leite / Banca: James Tony Lee / Resumo: Os bancos de mexilhões são conhecidos engenheiros de ecossistema que agregam uma diversificada fauna associada. A exploração antrópica dos mexilhões pode alterar a estrutura e distribuição desses bancos e consequentemente influenciar a composição da fauna associada. Para testar a influencia da pesca sobre os mexilhões e sua fauna associada utilizamos da técnica do quadrado (15X15 cm, n=8) raspando bancos com mexilhões em um de três estágios de desenvolvimento (recrutas, juvenis, adultos). A fauna associada foi separada dos mexilhões, identificada e quantificada (abundancia, biomassa, riqueza e diversidade). Os mexilhões foram mensurados em relação à tamanho, peso, e volume (total e intersticial). Amostras de mexilhões obtidas diretamente de pescadores das mesmas praias de estudo foram analisadas quantos aos mesmos parâmetros, para posterior comparação por análises estatísticas descritivas (ANOVA) e multivariadas exploratórias (nMDS e PERMANOVA). Observou-se a presença de bancos diferenciados, com mexilhões de um mesmo tamanho e com valores de fauna correspondente. Sendo, a presença dos pescadores pode influenciar a distribuição e composição dos bancos de mexilhões, afetando no seu recrutamento e consequentemente pode afetar a fauna associada a esses bancos / Abstract: Not available / Mestre

Submitted by Caroline Xavier (caroline.xavier@pucrs.br) on 2017-10-03T14:56:57Z No. of bitstreams: 1 DIS_MAURICIO_BETTIO_COMPLETO.pdf: 4460744 bytes, checksum: 541ba188b47e9ce65c7838bed98a0765 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-10-03T14:56:57Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DIS_MAURICIO_BETTIO_COMPLETO.pdf: 4460744 bytes, checksum: 541ba188b47e9ce65c7838bed98a0765 (MD5) Previous issue date: 2017-03-16 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior - CAPES / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Cient?fico e Tecnol?gico - CNPq / Grassland ecosystems compound open landscapes with predominance of grass/forb/shrub vegetation, frequently interspersed by streams, wetlands, peatbogs and forest formations. Grasslands dominate practically 40% of the terrestrial surface and they are between the more suscetible natural formations to human interventions. The highland grasslands of southern Brazil are considered natural relicts historically maintened by disturbance, as fire and herbivory. The presence of natural disturbances is an intrinsic and necessary characteristic of grasslands ecosystems, being an evolutive force that forged the landscape, selecting plants and animals, especially where the climatic and soil conditions are prone to forest development. Although fire is considered a natural disturbance into highland grasslands of southern Brazil, its regime has been altered since the arrival of humans and especially after cattle introduction, in the XVII century. In this study, we evaluate the responses of the avian community in two different situations of management of the grassland vegetation in southern Brazil: areas with annualy or biennialy burns and areas where burns were excluded/suppressed since 10-15 years ago. We dedicate two chapters to explore this subject, focusing on: (1) the avian and vegetation responses to two distinct management situations (fire vs. fire exclusion); and: (2) exploring how an accidental burning event in areas with fire exclusion for many years affected community parameters, compared to frequently burned areas. We also discuss the importance of fire disturbance to maintain a diverse avifauna and grassland ecosystems in south Brazil. We conduct samplings during the breeding season, in spring/summer 2015 to 2016. We verified that diversity of birds was not significantly different between the two management practices studied, indicating that the main effects of the frequently presence or absence of burns tend to be verifyed mainly on species composition, at least in short term. The habitat structure, measured as height of vegetation, number of woddy plants and percent of ground cover by rocks and vegetation was responsible by 80% of total variation on the composition and adundance of bird community. When we compare pre and post burn state of areas usually no burned with periodically burned areas, we verify expressive modifications, such a decrease of vegetativon height and density, a larger quantity of exposed soil into post burned areas in relation to periodically burned grasslands and the pre burned time of the usually not burned areas. Again, the avifauna differs only in relation to species composition, indicating that alteration on management dynamic is able to select bird species, benefiting or harming the occurrence of a part of community. Threatened species as Xanthopsar flavus, Anthus nattereri and Cinclodes pabsti had preference for burned grasslands with short vegetation, while Scytalopus iraiensis and Sporophila melanogaster occupied excluded grasslands where vegetation was tall and dense. Our results clearly indicate that bird communities respond significantly to different types of management employed on grassland vegetation. Studies that consider a greater temporal variation than ours, would be necessary and complementary in order to verify the resilience of grassland-specialists bird species in relation to fire events or their absence. The management with fire in grasslands has proven to be important to maintenance of birds, including globally threatened taxa. Although application of fire has legal impediments, its controlled use seems to be a strategic management tool for maintenance of bird diversity in the south brazilian highland grasslands. / Ecossistemas campestres constituem paisagens abertas com predom?nio de vegeta??o herb?cea/arbustiva, frequentemente entremeada por cursos d??gua, banhados, p?ntanos e at? forma??es florestais. Os Grasslands, como s?o chamados, dominam praticamente 40% da superf?cie terrestre e est?o entre as forma??es naturais mais suscet?veis a interven??es humanas. Os campos de altitude localizados no sul do Brasil s?o considerados relictos naturais mantidos historicamente por dist?rbios, como fogo e herbivoria. A presen?a de dist?rbios naturais ? uma caracter?stica intr?nseca e necess?ria aos ecossistemas campestres, sendo uma for?a evolutiva que forjou a paisagem selecionando plantas e animais, especialmente onde as condi??es clim?ticas e de solo s?o propensas ao desenvolvimento de florestas. Embora o fogo seja considerado uma forma de dist?rbio natural nos campos de altitude do sul do Brasil, seu regime tem sido alterado desde a chegada dos humanos, especialmente ap?s a introdu??o da pecu?ria no s?culo XVII. Avaliamos neste estudo a resposta da comunidade de aves em duas situa??es distintas de manejo da vegeta??o campestre no sul do Brasil: ?reas com hist?rico de queimadas anuais ou bianuais e ?reas exclu?das de fogo por um per?odo entre 10-15 anos. Dedicamos dois cap?tulos para explorar este tema, focando no primeiro a resposta das aves e vegeta??o ?s duas situa??es antagonistas de manejo e, no segundo, explorando um evento de inc?ndio acidental sobre a vegeta??o com hist?rico de exclus?o de queima, para verificar altera??es nos par?metros da comunidade em rela??o a ?reas frequentemente queimadas e para discutir a import?ncia dos dist?rbios na manuten??o de uma avifauna diversa bem como do ecossistema campestre no sul do Brasil. Realizamos a coleta de dados na ?poca reprodutiva, entre a primavera/ver?o de 2015 e 2016. Constatamos que a diversidade da comunidade de aves n?o foi alterada significativamente entre os tipos de manejo, indicando que os principais efeitos da presen?a frequente ou aus?ncia das queimadas tendem a ser verificados sobre as esp?cies, ao menos num curto espa?o de tempo. Houve, portanto, significativa modifica??o na composi??o de esp?cies. A estrutura do habitat, como altura da vegeta??o, n?mero de plantas lenhosas e porcentagem de cobertura do solo por rochas e vegeta??o foi respons?vel por 80% da varia??o total da comunidade de aves, demonstrando que a avifauna responde intensamente ?s altera??es do ambiente. Quando comparamos o per?odo pr? e p?s queima com ?reas queimadas periodicamente constatamos modifica??es expressivas na estrutura da vegeta??o, como a diminui??o de altura e densidade, al?m de uma grande quantidade de solo exposto nas ?reas p?s queima em rela??o aos campos periodicamente queimados e ao per?odo pr? queima. Novamente, a avifauna respondeu significativamente somente em rela??o a composi??o de esp?cies, indicando que a altera??o da din?mica de manejo ? capaz de selecionar as esp?cies de aves, de modo a beneficiar ou prejudicar a ocorr?ncia de parte da comunidade. Esp?cies amea?adas de extin??o como Xanthopsar flavus, Anthus nattereri e Cinclodes pabsti tiveram uma prefer?ncia em ocupar campos queimadas com vegeta??o baixa, enquanto Scytalopus iraiensis e Sporophila melanogaster ocuparam campos exclu?dos de queima onde a vegeta??o era alta e densa. Nossos resultados indicam claramente que a comunidade de aves responde significativamente aos diferentes tipos de manejo empregados sobre a vegeta??o campestre. Estudos que levem em considera??o uma varia??o temporal maior do que a avaliada neste trabalo s?o um gargalo no sentido de verificar a resili?ncia das esp?cies de aves campestres especialistas em rela??o aos eventos de fogo ou sua aus?ncia. O manejo dos campos demonstrou ser de grande import?ncia para a manuten??o de aves, incluindo t?xons globalmente amea?ados. Apesar da aplica??o do fogo ter impedimentos legais, seu uso controlado parece ser uma ferramenta de manejo estrat?gica na manuten??o da diversidade de aves nos campos de altitude sul-brasileiros.

O presente estudo teve como objetivo determinar a estrutura da comunidade de macroinvertebrados bentônicos em riachos de baixa ordem, sob diferentes processos de ocupação e grau de antropização, na bacia hidrográfica do Ribeirão das Antas, Planalto de Poços de Caldas. Para tanto, nove pontos de amostragem foram estabelecidos em riachos e córregos de baixa ordem (1ª a 3ª ordem) desta bacia. As coletas ocorreram em dois períodos distintos do ano, períodos de chuva (janeiro/2013) e de seca (julho/2013). O Protocolo de Avaliação Rápida e Simplificada – PARS (CALLISTO et al., 2002) foi aplicado para caracterizar o entorno dos ambientes amostrados. Medidas de pH, condutividade elétrica, temperatura, concentração de oxigênio dissolvido, concentração de sólidos totais dissolvidos e potencial de oxi-redução foram determinados in situ utilizando de um aparelho multisensor. A comunidade de macroinverterbrados bentônicos foi coletada utilizando-se de uma rede tipo “D” com malha de 250 μm. O esforço amostral foi de 1 minuto, dividido em três tomadas de 20 segundos cada, explorando os diferentes microhabitats locais. Índices de diversidade (Shannon, Simpson, riqueza de Margalef e uniformidade) e bióticos (BMWP, ASPT e EPT%) foram calculados. Na aplicação do PAR verificou-se que o ribeirão Tamanduá (PT2), o córrego da Ventania (PT9) e o córrego das Antas (PT4 e PT7) apresentaram condições de alterados, enquanto que o ribeirão Pitangueiras (PT5), o córrego do Aterrado (PT8), o córrego Pinheirinhos (PT1), o córrego Cachoeirinha (PT6) e o ribeirão Tamanduá (PT3) foram classificados como impactados. No total foram coletados 2.689 organismos, sendo 1.150 em janeiro/2013 e 1.539 em julho/2013, pertencentes a 47 famílias do filo Annelida e Classe Insecta. Os Diptera foram os principais componentes da comunidade, especialmente pela abundância de Chironomidae. Entre os grupos funcionais, os coletores foram os que apresentaram maior abundância relativa para ambas às coletas. Considerando o índice BMWP os pontos PT4, PT7 e PT9 apresentaram características ótimas; os pontos PT6 e PT8 foram classificados como aceitáveis; os pontos PT1 e PT5 tiveram qualidade duvidosa e os pontos PT2 e PT3 tiveram qualidade crítica. Os índices ASPT e EPT% tiveram uma boa correlação com o índice BMWP, apresentando maiores valores nos ambientes com melhor qualidade. A Aplicação do Protocolo de Avaliação Rápida e Simplificada e das métricas bióticas se mostraram ferramentas importantes na avaliação dos ecossistemas aquáticos da região da cabeceira da bacia hidrográfica do ribeirão da Antas. / The present study aimed to determine the benthic macroinvertebrate community structure of the in low-order streams under different processes of occupation and degree of human disturbance in the watershed of Ribeirão das Antas, Poços de Caldas Plateau. For this, nine sampling points was established in creeks and streams of low order (3rd order 1st) this basin. Sampling occurred in two distinct periods of the year, during the rainy (January/2013) and dry (July/2013) season. The Rapid Assessment Protocol - PAR (CALLISTO et al., 2002) was applied to characterize the surroundings of the study sites. Measurements of pH, electrical conductivity, temperature, redox potential, dissolved oxygen and total dissolved solids concentrations were determined in situ using a multisensor equipment. The macroinvertebrate community was collected using a D-frame net with 250 μm. The sampling effort was by 1 minute, divided into three taken of 20 seconds to explore different microhabitats. Diversity (Shannon , Simpson , Margalef richness and evenness) and biotic (BMWP , ASPT and EPT %) indices were calculated. In the application of the PAR, it was found that the ribeirão Tamanduá (PT2), córrego da Ventania (PT9) and córrego das Antas (PT4 and PT7) presented altered conditions, while the ribeirão Pitangueiras (PT5), córrego do Aterrado (PT8), córrego Pinheirinhos (PT1), córrego Cachoeirinha (PT6) and ribeirão Tamanduá (PT3) were classified as impacted. In total 2.689 organisms were collected, and 1.150 and 1.539 in January/2013 in July/2013, belonging to 47 families of the phylum Annelida and Class Insecta. The Diptera were the main components of the community, especially the abundance of chironomids. Among the functional groups, the collectors were those with the highest relative abundance for both the collections. Whereas the index BMWP in PT4 , PT7 , and PT9 points showed great features, the points PT6 and PT8 were classified as acceptable , the points PT1 and PT5 were dubious quality and PT2 and PT3 points were critical quality. The ASPT and EPT indices were correlated with BMWP index values were high in environments with best quality. The Application of Rapid Assessment Protocol and biotic metrics proved very important tools in the assessment of aquatic ecosystems in the headwater of ribeirão das Antas watershed.

Essa dissertação foi dividida em dois capítulos, sendo que o primeiro abordou a caracterização da macrofauna de invertebrados bentônicos. As coletas foram realizadas em quatro meses (março, junho, setembro e dezembro) na represa Águas Claras, no município de Caldas, Minas Gerais, Brasil. Foram coletados, em triplicata, os substratos presentes em 13 pontos com uma draga Van veen (378cm). Foram identificados 1792 espécimes, distribuídos em 37 táxons, pertencentes aos filos Annelida (classe Oligochaeta) e Arthropoda (superclasse insecta). Os oligoquetos representaram 9,2% do total de espécies. Entre os insetos, a família Chironomidae (ordem Diptera) foi a que apresentou maior riqueza (26 táxons – cerca de 33% do total). Ainda entre os dípteros, foram identificadas as famílias Ceratopogonidae (0,45% do total) e Chaoboridae (23,5% do total). Ephemeroptera foi representada exclusivamente pelo gênero Campsurus sp (16,5% do total) e Trichoptera (Cyrnellus sp e Polycentropus sp) representaram, juntas, 8,8% do total. As ordens Coleoptera, Lepdoptera e Odonata tiveram registros esporádicos representando juntas 0,2% do total. As análises das densidades mostraram que a maior densidade média foi registrada em junho com 480,26ind.m-2 e o índice de similaridade de Bray-Curtis evidenciou a formação de dois grupos distintos. A diversidade da comunidade estimada pelo índice de Shannon foi de 3,415 para março, 3,555 em junho, 3,254 para setembro e para dezembro de 2,661, não sendo significativamente diferentes (p = 0,8513). Neste estudo revelou-se a influencia de fatores ambientais sobre a comunidade de macroinvertebrados bentônicos da represa Águas Claras. Fatores relacionados a impactos decorrentes da atividade humana como o elevado teor de matéria orgânica no sedimento e pouca preservação da vegetação ciliar. Contudo, outros fatores como a profundidade, temperatura, tamanho das partículas minerais do sedimento foram ao mesmo tempo importantes devendo-se ter prudência na interpretação dos dados para fins de monitoramento. No segundo capítulo foram verificados o ciclo de vida, a produtividade secundária e a distribuição de Campsurus sp (Ephemeroptera: Polymitarcyidae) na represa Águas Claras, Caldas, Minas Gerais, Brasil. Foram estabelecidos quatro pontos de amostragem onde foram realizadas coletas mensais entre fevereiro/2013 a janeiro/2014. A comunidade de Campsurus sp foi coletada com a mesma metodologia da capítulo anterior. Em laboratório, os Campsurus sp foram separados dos demais organismos. Foram identificados 138 indivíduos na represa Águas Claras. No mês de agosto foi registrada a maior quantidade, 25 espécimes (18,12%). A densidade média total no período estudado foi de 25ind.m-2, com o mês de agosto (2013) apresentando maior densidade média, com valor de aproximadamente 55ind.m-2. A análise dos histogramas mostrou que a maior parte das classes de tamanho foi representada em praticamente todos os meses, sendo que os meses de maior recrutamento foram fevereiro, março e agosto e os meses com maiores quantidades de indivíduos maiores foram julho, novembro, dezembro e janeiro. A relação entre o tamanho (mm) e o peso úmido (g) indicou que o ajuste exponencial obteve uma curva com r² = 0,9282. A produtividade secundária anual calculada foi de 3.841g.m-2ano-1. Na represa Águas Claras, observou-se que a distribuição de Campsurus sp não é controlada pelo tipo de sedimento, pois estes foram registrados em todos os tipos de partículas sedimentares. O sedimento foi considerado orgânico (> 10% de matéria orgânica) podendo ser interpretado como grande disponibilidade de recursos alimentares, já que os Ephemeroptera são considerados, geralmente, raspadores ou forrageiros. / This thesis has been divided into two chapters, the first of which addressed the characterization of benthic invertebrate macrofauna. The collections were made in four months (March, June, September and December) at Águas Claras Dam, in the municipality of Caldas, Minas Gerais, Brazil. In triplicate, the substrates were collected on 13 points with a Van Veen grab (378cm). 1792 specimens distributed in 37 taxa belonging to the phylum Annelida (class Oligochaeta) and arthropods (insect superclass) were identified. Oligocaheta represented 9.2% of the total species. Among insects, the family Chironomidae (Diptera) showed the highest richness (26 taxa - about 33% of the total). Still among the Diptera, the Ceratopogonidae (0.45% of total) and Chaoboridae families (23.5% of total) were identified. Ephemeroptera was exclusively represented by gender Campsurus sp (16.5% of total) and Trichoptera (Cyrnellus sp and sp Polycentropus) brought together 8.8% of the total. The Coleoptera, and Odonata Lepdoptera orders had sporadic records together representing 0.2% of the total. Analyses of densities showed that the highest density was recorded in June with 480.26 ind/m2 and the similarity index of Bray-Curtis revealed the formation of two distinct groups. The diversity estimated by Shannon index community was 3,415 in March, 3,555 in June, 3,254 for September and December to 2,661, not significantly different (p = 0.8513). This study revealed the influence of environmental factors on the benthic macroinvertebrate community of Águas Claras Dam. Factors related to impacts resulting from human activities such as the high content of organic matter in the sediment and poor preservation of riparian vegetation. However, other factors such as depth, temperature, size of the mineral particles of sediment were important at the same time one should exercise caution in interpreting data for monitoring purposes. In the second chapter were verified life cycle, secondary productivity and the distribution of Campsurus sp (Ephemeroptera: Polymitarcyidae) in Águas Claras Dam, Caldas, Minas Gerais, Brazil. Four sampling where monthly sampling between the fevereiro/2013 janeiro/2014 were performed were established. The community Campsurus sp was collected with the same methodology of the previous chapter. In the laboratory, the Campsurus sp were separate from other organisms. 138 individuals were identified in Águas Claras Dam. In August there was a greater amount, 25 specimens (18.12%). The total average density in the period studied was 25ind.m-2, with the month of August (2013) showing higher average density value of approximately 55ind.m-2. The analysis of histograms showed that most of the size classes was represented in almost all months, with the months of highest recruitment were February, March and August and the months with higher amounts of larger individuals were July, November, December and January. The relationship between the size (mm) and wet weight (g) indicated that the exponential fit obtained a curve with r ² = 0.9282. The calculated annual secondary production was 3.841gm-2year-1. In dam Águas Claras, it was observed that the distribution of Campsurus sp is not controlled by sediment type, since these have been registered in all kinds of sedimentary particles. The pellet was considered organic (> 10% organic matter) can be interpreted as greater availability of food resources, since the Ephemeroptera are considered generally scrapers or fodder.

Submitted by Dominick Jesus (dominickdejesus@hotmail.com) on 2016-01-20T18:25:55Z No. of bitstreams: 1 Dissertação_Fábia Geórgia Santos de Andrade.PDF: 1580678 bytes, checksum: 4ff81a568ea2be1a9dc2cf922d67ed1e (MD5) / Made available in DSpace on 2016-01-20T18:25:55Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertação_Fábia Geórgia Santos de Andrade.PDF: 1580678 bytes, checksum: 4ff81a568ea2be1a9dc2cf922d67ed1e (MD5) Previous issue date: 2011-03-10 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The high nutritional quality of leaves is indicated by a low C/N ratio and leaves with low nutritional quality by high C/N ratio. In this study six species of litter were used: three species considered to have good nutritional quality and rapid decomposition and three with low quality and slow decomposition. The study aimed to verify differences in decomposition, nutrient release, nutrient concentrations in the soil beneath these trees and the existence of a differential macrofauna in the two litter groups. Weight loss showed the expected results, except for one species, indicating that other factors are acting in addition to C/N ratio and lignin percentage. The amounts of calcium increased in decomposing leaves continuously during the experiment, indicating a relative rise, or even result of translocation of Ca from fungal hyphae and/or by soil fauna. The amounts of magnesium, potassium and phosphorus should standard results, with higher losses in the rainy season. The element released faster to soil was potassium. The nutrients determinations in the soil below the chosen species and its relation with the species nutrients showed no significant values. The differences between species for the percentage of remaining weight, and the lack of correlation between the species and soil nutrients, indicate the importance of high trees diversity and proximity in the Amazon forest for controlling nutrient cycling. / Alta propriedade nutricional das folhas é geralmente indicada por uma baixa razão C/N e a baixa propriedade nutricional das folhas por alta razão C/N. Neste estudo utilizaram- se liteira de seis espécies de árvores, três espécies com folhas consideradas de boa qualidade nutricional e rápida decomposição potencial e três com baixa qualidade e decomposição lenta. O estudo teve a intenção de verificar a importância da qualidade dos recursos para a liberação de nutrientes e o enriquecimento nutricional do solo. A liberação de nutrientes e macrofauna foram verificadas em litter bag’s presentes no campo durante 220 dias. Os nutrientes no solo foram extraídos dos primeiros dez centímetros de solo. Os experimentos de perda de massa foliar apresentaram resultados equivalentes a outros trabalhos do gênero, havendo maior redução da massa foliar nos primeiros meses para todas as espécies. Os valores residuais para cálcio em todas as espécies aumentaram ao longo do tempo, indicando um forte aumento relativo, ou mesmo o resultado da translocação de Ca das hifas de fungos ou do transporte pela fauna do solo. Os valores residuais de magnésio, potássio e fósforo apresentaram, em geral, redução dos valores ao passar o tempo do experimento. O elemento que mais apresentou perdas para o ecossistema foi o potássio. Não houve correlações entre os nutrientes presentes nas folhas das espécies em estudo e os nutrientes no solo abaixo dessas espécies (p>0.05). A fauna da liteira apresentou maior atividade durante o período de chuvas com grandes diferenças na abundância de indivíduos entre as espécies.

Os Enterococcus spp. apresentam natureza ubiquitária e são encontrados no trato gastrointestinal de diversos animais. Entretanto, estudos desses microorganismos associados a tartarugas marinhas são escassos. Os objetivos deste estudo foram: isolar enterococos a partir de amostras fecais de tartarugas marinhas encontradas no Litoral Norte do Rio Grande do Sul; determinar a prevalência das espécies; avaliar seu perfil de suscetibilidade antimicrobiana; verificar a presença de genes relacionados à resistência e à virulência e; analisar sua diversidade genética. Um total de 158 enterococos foram identificados como E. faecalis (55,7%), E. faecium (23,4%), E. hirae (15,2%) e E. casseliflavus (5,7%). A maioria dos isolados foi suscetível aos antimicrobianos testados, no entanto, fenótipos de resistência foram encontrados para eritromicina (34,2%), rifampicina (32,9%) e tetraciclina (0,63%). O gene de resistência à eritromicina msrC foi encontrado em todos os E. faecium resistentes, já o gene erm(B), não foi detectado. Somente um isolado foi resistente à tetraciclina, e este não apresentou nenhum dos genes testados. Os genes de virulência, gelE e ace (98,86%), asa (68.18%) e cylA (40,90%) foram detectados somente em E. faecalis. A atividade de gelatinase e citolisina foi verificada em 87 e 19 isolados, respectivamente. A maioria dos enterococos não foi capaz de formar biofilme. A análise dos perfis gerados por PFGE revelou um grande número de clones. Em conclusão, diferentes espécies de enterococos compõem a microbiota do trato gastrointestinal das tartarugas marinhas e a presença de determinantes de resistência e virulência nestes animais pode estar relacionada a fatores antropogênicos ou, ainda, ter origem no resistoma ambiental. / Enterococcus spp. shows an ubiquitous nature and are found in the gastrointestinal tract of several animals. However, studies of enterococus in sea turtles are scarce The aims of this study were: to isolate Enterococcus spp. from fecal samples of sea turtle found on the North coast of Rio Grande do Sul; to determine the prevalence of species; to evaluate their antimicrobial susceptibility profile; to check the presence of resistance and virulence related genes and; to analyse their genetic diversity. A total of 158 enterococci were identified as E. faecalis (55.7%) E. faecium (23.4%), E. hirae (15.2 %) and E. casseliflavus (5.7%). Most of the isolates were susceptible to the tested antimicrobials, however, resistance phenotypes were found for erythromycin (34.2%), rifampicin (32.9%) and tetracycline (0.63%). The erythromycin resistance gene msrC was detected in all E. faecium erythromycin resistant; moreover, the gene erm (B) was not detected. Only one sample was resistant to tetracycline, although it did not show any of the tetracycline resistant genes tested. Virulence genes gelE and ace (98.86%), asa (68.18%) and cylA (40.90%) were detected only in E. faecalis. The cytolysin and gelatinase activity was observed in 19 and 87 strains, respectively. Most enterococci were not able to form biofilm. The profile analysis generated by PFGE revealed a large number of clones. In conclusion, different species of enterococci were found in the microflora of sea turtle gastrointestinal tract and the presence of resistance and virulence determinants in these animals might be related to anthropogenic factors or even to an environmental resistome origin.

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