Submitted by Cristiane de Pieri (pieri_cris@yahoo.com.br) on 2018-01-09T18:15:51Z No. of bitstreams: 1 Tese_Definitivo-2.pdf: 1589058 bytes, checksum: 2412924b9d45b8f28e962983596d6592 (MD5) / Approved for entry into archive by Maria Lucia Martins Frederico null (mlucia@fca.unesp.br) on 2018-01-15T11:17:17Z (GMT) No. of bitstreams: 1 pieri,c_dr_bot.pdf: 1589058 bytes, checksum: 2412924b9d45b8f28e962983596d6592 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-01-15T11:17:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 pieri,c_dr_bot.pdf: 1589058 bytes, checksum: 2412924b9d45b8f28e962983596d6592 (MD5) Previous issue date: 2016-12-20 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / A cultura do eucalipto é uma das mais importantes do Brasil, constituindo-se em fonte de energia renovável e madeira, além de importantes processos agroindustriais para produção de celulose, papel entre outros. O eucalipto é infectado por uma diversidade de patógenos, principalmente fungos, desde o viveiro até em plantios adultos. O modelo de produção predominante é o monocultivo, adensado e intensamente adubado (adubação de base e duas a três coberturas). Em espécies/clones de eucalipto suscetíveis à Puccinia psidii, a ocorrência de epidemias é observada em condições climáticas favoráveis. Dessa forma, espera-se que o plantio consorciado com uma ou mais espécies não hospedeiras, a intensidade desta doença deva ser menor, devido a barreira física criada e dificulte a disseminação das estruturas reprodutivas do referido patógeno, diluindo o inóculo. Da mesma forma, o aumento do espaçamento também pode dificultar o estabelecimento do patógeno e, um plantio consorciado com uma espécie arbórea leguminosa que permita a fixação biológica de nitrogênio pode levar a redução da aplicação de adubos na forma química devido a ciclagem de nutrientes no sistema. Diante do exposto, os objetivos deste estudo foram: comparar o monocultivo de um clone oriundo da hibridação entre Eucalyptus grandis x E. urophylla e o cultivo do mesmo consorciado com a leguminosa Acacia mangium, com e sem adubação, em dois espaçamentos, quanto a intensidade da ferrugem e, crescimento das plantas (altura, diâmetro a altura do peito, volume e biomassa). Dentre os fatores testados, o uso da adubação no plantio foi o de maior relevância, afetando a intensidade da doença, bem como as variáveis de crescimento avaliadas. Até os dois anos de idade as plantas de acácia ocupam o estrato inferior quando consorciadas com o eucalipto, com isso não estabeleceram uma barreira física eficiente para o patógeno. O mesmo efeito não foi observado com o aumento do espaçamento. Apesar da maior intensidade da doença nos arranjos adubados, as plantas tiveram maior incremento em altura, volume e biomassa. Quanto ao consórcio, a acácia não foi eficaz como barreira física ao agente causal da ferrugem. / The eucalypt cultivation is one of the most important in Brazil, constituting in source of renewable energy and wood, as well as important agro-industrial processes for the cellulose production, paper and others. The eucalypt is infected by a variety of pathogens, mainly fungus, from the plant nursery to adult cultivation. The predominant production model is the monoculture, densely one and intensively fertilized (basic fertilization and two to three coverages).In eucalypt species/clones susceptible to Puccinia psidii, the occurrence of epidemics is observed in favorable climate conditions. Thus, it is expected that the combined cultivation with one or more non-host species, the intensity of this disease should be lower, due to the physical barrier created not to facilitate the dissemination of the reproductive structures of this pathogen, diluting the inoculum. Similarly, the increased spacing cannot also facilitate the pathogen establishment and a combined cultivation with a leguminous arboreal species allowing the biological fixation of nitrogen can lead to the reduction of the fertilizer application in chemical form due to the cycling of nutrients in the system. Based on the above, the objectives of this study were: to compare the monoculture of a clone from the hybridization between Eucalyptus grandis x E. urophylla and the same combined cultivation with the leguminous Acacia mangium, with and without fertilization in two spacing, about the rust intensity and the plant growth ( height, diameter at breast height, volume and biomass). Among the factors tested, the use fertilization at the cultivation was the most relevant, affecting the disease intensity, as well as the variables of the evaluated growth. Up to the age of two, acacia plants are on the lower layer when combined with eucalypt, thus failing to establish an efficient physical barrier for the pathogen. The same effect was not observed with increasing spacing. Despite the greater intensity of the disease in the fertilized arrangements, the plants had a greater increase in height, volume and biomass. About the combined cultivation, acacia was not effective as a physical barrier to the causative agent of rust. / 2013/10700-0

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:28:35Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2009-11-18Bitstream added on 2014-06-13T19:58:10Z : No. of bitstreams: 1 aguiarjunior_ho_me_botfca.pdf: 487083 bytes, checksum: cf6b43776665fed2b2912c525547c0ba (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Com o intuito de melhorar a eficiência da cobertura foliar e diminuir as perdas na produtividade da cultura da soja, o presente trabalho teve como objetivos: avaliar a deposição da pulverização, perdas por deriva, produção (peso de 1000 sementes), produtividade da cultura (kg/ha), tensão superficial estática e retenção foliar da calda de pulverização. Três experimentos, dois a campo e um em laboratório foram conduzidos nesse estudo; os experimentos 1 e 2 foram conduzidos na safra 2008/09, em área experimental da fazenda de Ensino, Pesquisa e Produção (FEPP) da FCA/UNESP – Campus de Botucatu, Gleba Cascalheira na cultura da soja, cultivar Conquista e o experimento 3 foi realizado no Laboratório de Tecnologia de Aplicação de Defensivos do Departamento de Produção Vegetal – Defesa Fitossanitária da Faculdade de Ciências Agronômicas FCA/UNESP, campus de Botucatu. O experimento 1 foi conduzido no delineamento experimental em blocos ao acaso com três dosagens de surfatantes associados ao marcador oxicloreto de cobre combinadas a dois níveis de assistência de ar na barra de pulverização (0 e 29 km h-1), totalizando 6 tratamentos e 4 repetições. O pulverizador foi equipado com barra de pulverização de 18,5 m de comprimento e 37 pontas de pulverização de jato plano XR 8002, à pressão de 400 kPa e volume de 150 L ha-1. Para a quantificação dos depósitos da pulverização foram colocados em cada parcela alvos artificiais (papel filtro com dimensões de 3 x 3 cm) distribuídos em 10 plantas tomadas ao acaso. Em cada uma das 10 plantas amostradas foram fixados quatro coletores (papel filtro), um na superfície adaxial e outro na superfície abaxial do mesmo folíolo nas partes superior e inferior da mesma planta. Para avaliação do potencial de deriva, nas diferentes tecnologias de aplicação, foram colocados externamente às parcelas duas hastes de madeira... / With the intention to improve the leaf coverage efficiency and reduce in losses productivity of soybean crop, the present study aimed to evaluate the spray deposition and drift losses, production (weight of 1000 seeds), soybean crop productivity (kg / ha), static surface tension and spray leaf retention. Three experiments, two in the field and another one the laboratory, were conducted in this study. The experiments 1 and 2 were carried out during 2008/2009 crop season in experimental area of Experimental Farm, FCA / UNESP – campus of Botucatu, soybean crop, Conquista variety, and the third experiment was set at the of Laboratory Technology Application of Pesticides, in Plant Production Department, College of Agricultural Sciences of the São Paulo State University FCA/UNESP, campus of Botucatu. The Experiment 1 was conducted in randomized block design with three doses of surfactants associated with one oxychloride cooper tracer, combined at two levels of air assistance on spray boom (0 and 29 km h-1), 6 treatments in 4 repetitions. The sprayer was equipped with spray boom 18.5 m of length and 37 flat fan spray nozzle XR 8002 type at working, pressure of 400 kPa, resulting in the volume of 150 L ha-1. For the quantification of spray deposits were placed in each plot artificial targets (filter paper with dimensions of 3 x 3 cm) distributed in 10 plants randomly selected. In each one of the 10 plants were fixed four collectors (filter paper), one on adaxial surface and other on abaxial surface in the same leaflet at the top and bottom of the same plant. To evaluate the spray drift potential in different application technologies, were placed outside the plots two stems of wood at 1.0 m and 3.0 m away at the end of crop. In the stems positioned at 1.0 m of the crop were fixed artificial targets, pipe cleaners, positioned at 0.5 and 1.0 m above ground and stems distanciated at 3 m of the crop... (Complete abstract click electronic access below)

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:28:36Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2009-02-13Bitstream added on 2014-06-13T19:58:10Z : No. of bitstreams: 1 prado_ep_me_botfca.pdf: 1292692 bytes, checksum: dbf83a5af75afb9c9d97bbadfe81fa2b (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Com o intuito de melhorar a eficiência de controle da ferrugem asiática Phakopsora pachyrhizi e insetos-pragas na cultura da soja, o presente trabalho avaliou diferentes técnicas de pulverização sobre o depósito da calda. Cinco experimentos foram conduzidos na área experimental da FCA/UNESP – Campus de Botucatu, na cultura da soja (var. Conquista), dois na safra 2006/07 e três na safra 2007/08. Os experimentos 1 e 2 foram conduzidos no delineamento em blocos ao acaso no esquema fatorial 2x2+1 (dois níveis de ar, 0 e 100%; duas pontas de pulverização, JA-2 e AXI 11002, mais testemunha). Realizou-se uma única aplicação com os inseticidas tiametoxam + lambda-cialotrina (exp. 1) e endosulfan (exp. 2), com volume de calda de 200 L ha-1. As avaliações antes (prévia) e com 1, 3, 6, 10 e 14 dias após a aplicação foram realizadas pelo método de batidas-no-pano. O experimento 3 foi conduzido no mesmo local, no delineamento experimental de blocos ao acaso (quatro velocidades de ar: 0, 9, 11 e 29 km h-1 e testemunha) totalizando 5 tratamentos e 4 repetições. Foi realizada uma pulverização do inseticida deltametrina para o controle de lagartas desfolhadoras e do inseticida tiametoxam + lambda-cialotrina visando o controle de percevejos. Foram avaliados: a eficiência dos produtos nos diferentes tratamentos, danos às sementes, poder germinativo e produtividade. O experimento 4 foi conduzido no delineamento em blocos ao acaso com 4 tratamentos e 5 repetições, comparando quatro velocidades da assistência de ar junto à barra de pulverização (0, 9, 11 e 29 km h-1) sobre o depósito da pulverização. De cada parcela foram selecionadas, ao acaso, dez plantas para a amostragem do depósito da pulverização. À cada planta foram fixados alvos artificiais (papel filtro na dimensão 3 x 3 cm), dois na parte superior e dois na parte inferior das plantas e, em cada parte da planta... / In order to improve control efficiency of Phakopsora pachyrhizi and pests in soybean crop, the present research evaluated different spraying techniques on spray deposits, Asian rust control and the pests control: stink bungs and velvetbean caterpillars. Five experiments were carried out in the experimental area of FCA/UNESP - Botucatu, SP, on soybean crop (Conquista variety). Two of these experiments on the 2006/07 crop season and two in the 2007/08 crop season were carried out. The experimental desing of experiments 1 and 2 were randomized blocks with 5 treatments and 4 repetitions in a factorial scheme 2 x 2 + 1(two levels of air speed, 0 and 100%, two nozzles: flat fan nozzles AXI 11002 and hollow cone nozzle JA-2, more nontreated plots). The insecticides thiamethoxam + lambda-cialothrin (exp. 1) and endosulfan (exp. 2) were applied using a volume rates at 200 L ha-1 for both treatments and experiments. The evaluations before (0) and 1, 3, 6, 10 and 14 days after applications were made by the method of hits on the cloth. The third experiment was carried out in same place and the experimental design was randomized blocks with 5 treatments and 4 repetitions (four air speed: 0, 9, 11 e 29 km h-1) more non-treated plots. The insecticide used in the spraying to control of velvetbean caterpillar was the deltamethrin and to control of stink bugs was thiamethoxam + lambda-cialothrin. The evaluations before and after application were made by the method of hits on the cloth. The actual damages by stink bugs was evaluated considering the percentage of seeds damages, the power germination and production. In experiment 4 the treatments were carried out experimental design randomized blocks with 4 treatments and 5 repetitions (four air speed produced by fan: 0, 9, 11 e 29 km h-1) to evaluations of spray deposit levels. In each parcel were selected at random, ten plants to sampling of spray deposits... (Complete abstract click electronic access below)

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:28:36Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2005-08-30Bitstream added on 2014-06-13T20:58:37Z : No. of bitstreams: 1 zamprogno_kc_me_botfca.pdf: 349626 bytes, checksum: 08b4d1a900b4a6ab340f7f4250e4cbc4 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Um dos maiores problemas enfrentados pelo setor florestal, no Brasil, tem sido a ocorrência da ferrugem do eucalipto causada por Puccinia psidii Winter, devido a sua severidade em plantações de procedências muito suscetíveis, com menos de dois anos de idade, onde a produtividade das plantas atacadas é bastante reduzida. Devido a grande importância da cultura de Eucalyptus no Brasil e no mundo empresas do setor florestal têm buscado, através de programas de melhoramento genético, reduzir as perdas de produção e atender a demanda do mercado de papel e celulose. No presente trabalho, mudas de Eucalyptus pertencentes a uma geração F1, provenientes do cruzamento controlado entre os parentais: C0 (resistente) e VR (suscetível), foram inoculadas com Puccinia psidii em casa de vegetação e acompanhadas até o aparecimento dos sintomas da ferrugem. Foram classificadas, em dois grupos, segundo sua resistência como resistentes (ausência de sintomas) e suscetíveis (presença de sintomas e esporulação), cujas amostras de DNA foram comparadas com o uso de marcadores moleculares associado ao método de BSA (Bulked Segregant Analysis). O polimorfismo entre os bulks foi geneticamente relacionado ao loco que determina a característica de resistência ou sucetibilidade. Dentre os 720 primers testados, 19 foram polimórficos, porém, apenas o marcador AK 01 manteve-se presente, quando testado em todos os indivíduos integrantes do bulk e no restante da população e mostra-se localizado a uma distância genética estimada de 20 cM do gene de resistência. / One of the biggest problems faced by forest sector in Brazil, has been the ocurrence of specific case of rust in eucalyptus caused by Puccinia psidii Winter, due to its severity in crops from highly susceptible origins, with less than two years of life, where the infected plants yield is extremely reduced. Due to the great importance of the Eucalyptus crop in Brazil and in the world, companies in the forest sector have aimed, through genetic breeding programs, to reduce yield losses and meet the demands of the paper and cellulosis market. On the present study, seedlings of Eucalyptus from an F1 generation, bred from controlled crossing between parents C0 (resistant) and VR (susceptible), were innoculated with Puccinia psidii in a greenhouse and followed until the rust symptoms appeared. They were classified into two groups, according to their reaction in: resistant (absence of symptoms) and susceptible (presence of symptoms and buds), whose DNA samples were compared using mollecular markers associated to the BSA (Bulked Segregant Analysis) method. The polymorphism among the bulks was genetically characteristic. Among the 720 tested primers, 19 were polymorphic. But, only the AK01 marker kept present, when tested in all individuals who composed the bulk and in the rest of the population and it was shown as located in an estimated genetic distance of 20 cM from the resistance gene.

Orientador: Carlos Gilberto Raetano / Banca: Evandro Pereira Prado / Banca: Marcelo Rocha Corrêa / Resumo: Para o controle da ferrugem asiática da soja (FAS) é necessário a otimização da tecnologia de aplicação de modo a promover incrementos na cobertura da pulverização na região do baixeiro da cultura e melhorar a distribuição das gotas no dossel. Assim, o objetivo deste trabalho foi avaliar o efeito de pontas de jato plano com diferentes inclinações e volumes de calda na otimização da pulverização de fungicidas na cultura da soja, no controle da FAS e sobre a produtividade da cultura. Para isso, foram conduzidos três experimentos durante as safras 2016/17 e 2017/18 em Botucatu, SP envolvendo três pontas de pulverização: jato plano (AXI), jato plano duplo (JGT) e jato plano inclinado (Defy3D) em dois volumes de calda (125 e 250 L ha-1). No experimento 1 foi avaliado em mesa de distribuição volumétrica a uniformidade da distribuição volumétrica dos tratamentos e o espectro das gotas da pulverização pelo medidor de tamanho de partículas em tempo real. No experimento 2 foi realizado a análise quali-quantitativa da pulverização, por meio da deposição da calda na cultura com o marcador Azul Brilhante, e a cobertura da pulverização dos tratamentos em alvos artificiais e natural. Por fim, no experimento 3 foi avaliado a severidade e incidência da FAS, de modo a se determinar a eficácia de controle dos tratamentos, assim como seu efeito sobre a produtividade da cultura da soja. Em ambos os volumes de calda, a ponta JGT obteve menor coeficiente de variação e melhor distribuição da pulveri... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract : For the control of Asian soybean rust (SBR), an optimization of the application technology is necessary in order to improve spray coverage in the lower part of the crop as well as the spray drops distribution uniformity. Thus, the objective of this study was to evaluate the effect of flat fan nozzles with different inclinations and spray volumes on the optimization of fungicide spraying in the soybean crop, as well as on the ASR control and its effect on the crop yield. For this purpose, three experiments were conducted during 2016/17 and 2017/18 crop seasons in Botucatu, SP. Three spray nozzles were evaluated: flat fan (AXI), double flat fan (JGT) and inclined flat fan (Defy 3D) with two spray volumes (125 e 250 L ha-1). In Experiment 1, the spray distribution uniformity of the treatments was evaluated in a patternator table and the spray droplet spectrum was assessed by a real-time particle size analyzer. In Experiment 2, a quali-quantitative analysis of the spraying was evaluated, assessing spray deposits on the crop with Brilliant Blue tracer, and the spray coverage of the treatments on artificial and natural targets. Lastly, in Experiment 3, ASR incidence and severity were evaluated, in order to determine the treatment control efficacy and its effect on the soybean yield. In both spray volumes, the JGT nozzle provided lowest variation coefficient and better spray distribution. All the spray nozzles and volumes kept CV values below 7%, considered acceptable by international standards. The VMD (µm), SPAN and percentage of droplets smaller than 100 µm were influenced by the addition of fungicide associated with adjuvant to the spray mixture. Irrespective of the spray nozzle and volume, the penetration of the spray droplets into the crop canopy was impaired at R2, with low deposition and coverage in the lower part of the plant. All the spray nozzles and volumes promoted effective control of the ... / Mestre

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-06-21T12:44:11Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 533052 bytes, checksum: b0aaa088353b0a9f7705de0705d1f822 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-21T12:44:11Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 533052 bytes, checksum: b0aaa088353b0a9f7705de0705d1f822 (MD5) Previous issue date: 2000-07-14 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Utilizando o tamanho das pústulas e o número de soros como critérios para avaliar a severidade, estabeleceu-se a seguinte escala de notas para quantificação da ferrugem em mudas inoculadas de Eucalyptus: S0 = imunidade ou reação de hipersensibilidade, com necrose ou “fleck”; S1 = pústulas puntiformes, < 0,8 mm de diâmetro, com uma ou duas uredínias; S2 = pústulas medianas, de 0,8 a 1,6 mm de diâmetro, com aproximadamente 12 uredínias; e S3 = pústulas grandes, > 1,6 mm de diâmetro, com 20 ou mais uredínias. Aferiu-se a utilidade dessa escala utilizando marcadores RAPD, geneticamente ligados a um gene de resistência à ferrugem, em uma progênie de E. grandis. Plantas das classes S0 e S1 apresentaram os referidos marcadores e foram consideradas resistentes. Plantas das classes S2 e S3 não apresentaram aqueles marcadores e foram consideradas suscetíveis. O erro na classificação entre plantas resistentes e suscetíveis foi apenas de 8%, o que se deveu à proximidade dos limites superior e inferior no tamanho das pústulas das classes S1 e S2, respectivamente. O uso dessa escala permitiu a seleção de grande número de materiais resistentes à ferrugem com relativas rapidez, facilidade e precisão. Mediante a inoculação artificial e a avaliação da severidade entre os 12 e 24 dias após a inoculação em famílias de irmãos- completos de E. grandis, identificou-se, no clone G21, um gene de efeito principal na resistência à ferrugem, aqui denominado Ppr1 (Puccinia psidii resistance, gene 1). A inclusão de plantas da classe S1 entre as plantas resistentes indicou que, além de Ppr1, outros genes de efeito secundário podem atuar na resistência à ferrugem. Esse foi o primeiro caso de identificação de um gene de resistência à ferrugem em Eucalyptus e um dos poucos genes de efeito principal em patossistema não co-evoluído. Utilizando uma progênie de E. grandis, constituída de 994 indivíduos segregantes para resistência à ferrugem, identificaram-se seis marcadores RAPD ligados ao gene Ppr1. O marcador AT9/917 apresentou completa co-segregação com o gene Ppr1 em todas as plantas segregantes avaliadas, indicando localizar-se a uma distância genética máxima estimada de 0,462 cM de Ppr1. Esse marcador foi clonado e seqüenciado, não revelando homologia significativa com seqüências depositadas em bancos de dados. No entanto, esse marcador poderá ser utilizado na clonagem posicional de Ppr1. / Based on the number of sorus and pustule size, a rating scale was developed for evaluation of rust severity in inoculated seedlings of Eucalyptus as follow: S0 = immunity or hypersensitive reaction, with necrosis or fleck; S1 = small pustules, < 0,8 mm diameter, with one or two uredinia; S2 = medium sized pustules, from 0,8 to 1,6 mm diameter, with approximately 12 uredinia and S3 = large pustules, > 1,6 mm diameter, with 20 or more uredinia. Plants belonging to S0 and S1 classes were considered resistant and those belonging to S2 and S3 classes, susceptible. The error in the classification of resistant and susceptible plants was of only 8%. The error is due to similarities in pustule size among plants at the upper limit in the S1 class with plants at the lower limit in the S2 class. The use of this scale allows the screening of rust resistant genotypes. The segregation ratio of resistant to susceptible plants in artificially inoculated E. grandis full-sib progenies suggested that rust resistance is controlled by a major gene, designated Ppr1 (after Puccinia psidii resistance, gene 1). Inclusion of plants belonging to S1 class suggests that, besides Ppr1, other genes of minor effect can be involved in rust resistance. This is the first case of a resistance gene identified in Eucalyptus and one of the few of single inheritance in non-coevolved pathosystems. Using a full-sib progeny of 994 individuals of E. grandis, six RAPD markers linked to the Ppr1 gene were identified. The AT9/917 marker was tightly linked to Ppr1 gene, although sequence does not reveal homology with previously characterized resistance genes in other plant species. This marker can be used as a starting point to positional cloning of Ppr1. / Tese importada do Alexandria

Submitted by Nathália Faria da Silva (nathaliafsilva.ufv@gmail.com) on 2017-07-26T15:41:23Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 11424544 bytes, checksum: ca99a18cd5691209513b8bdabb2843dd (MD5) / Made available in DSpace on 2017-07-26T15:41:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 11424544 bytes, checksum: ca99a18cd5691209513b8bdabb2843dd (MD5) Previous issue date: 1986-08-21 / A duração do molhamento foliar, ou seja, o período em que as folhas do cafeeiro permanecem molhadas, é considerada pelos fitopatologistas como um dos principais fatores que influem na epidemiologia da ferrugem (Hemileia vastatrix Berk et Br.). A determinação desse período tem sido dificultada em razão do alto custo dos equipamentos envolvidos. Apare- lhos mais simples como aspergígrafo e orvalhógrafo não têm sido eficientes em alguns casos. Este trabalho teve por objetivo principal propor e verificar uma metodologia para a obtenção do período de molha- mento a partir de parâmetros agrometeorolõgicos, tais como temperatura do ar, umidade relativa, velocidade do vento etc. A parcela experimental foi definida em um talhão de cafeeiro de 60 x 15 m, formado por 32 linhagens-oan15 anos de idade, altura média de 2 m e espaçamento de 1,80 x 2,8om- localizado no “Campus" da Universidade Federal de Viçosa. Mediram-se as temperaturas dos bulbos seco e úmido e a velocidade do vento, registrando-se a temperatura foliar por meio de dois termopares instalados em duas folhas: uma sombreada e outra exposta. Em um abrigo meteorológico, colo- cado no interior da parcela experimental, instalaram-se ainda dois termoigrógrafos. O período de molhamento foliar foi observado de três maneiras: visualmente, através de um circuito elétrico e de um aspergígrafo. Os dados observados foram submetidos ã formulação teórica, resultando em um modelo físico-matemático para a obtenção do período de molhamento foliar. As observações foram utilizadas para o ajuste do modelo teórico e para a sua vali- dação. Assim, é possível calcular o período de molhamento com boa aproximação, utilizando-se apenas um psicrômetro ou um termoigrõgrafo.

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2018-01-22T17:24:08Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1001213 bytes, checksum: 6e669d036943dcd0ba8454e8d4728199 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-01-22T17:24:08Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1001213 bytes, checksum: 6e669d036943dcd0ba8454e8d4728199 (MD5) Previous issue date: 2016-02-16 / A ferrugem asiática da soja (FAS), causada pelo fungo Phakopsora pachyrhizi, é uma das doenças foliares mais importantes que afetam a produção de soja em todo o mundo. Este estudo teve como objetivo investigar o desempenho fotossintético (trocas gasosas, imagens da fluorescência da clorofila (Chl) a e concentração de pigmentos fotossintéticos) de plantas de soja pulverizadas com Acibenzolar-S-Metil (ASM) e com o fungicida Epoxiconazol + Piraclostrobina (Epo + Pyr) e inoculadas com P. pachyrhizi. Os sintomas da FAS progrediram muito mais rapidamente nas folhas das plantas do tratamento controle (inoculadas com água) em comparação com os tratamentos ASM e Epo + Pyr. Em geral, os valores para os parâmetros de trocas gasosas taxa líquida de assimilação de carbono, condutância estomática, concentração interna de CO 2 e taxa de transpiração aumentaram para as plantas infectadas pulverizadas com ASM ou Epo + Pyr em relação às plantas do tratamento controle. Os valores para os parâmetros de fluorescência inicial, fluorescência máxima, eficiência quântica máxima do fotossistema II, rendimento quântico efetivo do fotossistema II Y (II) e rendimento quântico de dissipação de energia regulado Y (NPQ) foram mantidos sempre superiores para os tratamentos ASM e Epo + Pyr em comparação ao tratamento controle nos estágios mais avançados da infecção pelo fungo. Em contraste, os valores para o parâmetro de rendimento quântico de dissipação de energia não regulado (Y(NO) reduziu significativamente para os tratamentos ASM e Epo + Pyr. As curvas para Y(II) diminuíram enquanto que as curvas para Y(NPQ) e Y(NO) aumentaram para as plantas dos tratamentos controle, ASM e Epo + Pyr em função da densidade de fluxo de fótons fotossintéticos. As concentrações de clorofilas e de carotenóides aumentaram significativamente para as plantas infectadas dos tratamentos ASM e Epo + Pyr em comparação com as plantas do tratamento de controle. Em conclusão, os resultados do presente estudo demonstram que a aplicação de ASM ou Pyr + Epo em pantas de soja, mas especialmente do fungicida, contribuíram para reduzir os efeitos negativos causados pela infecção por P. pachyrhizi e permitiu a manutenção do desempenho fotossintético das plantas infectadas. / Asian soybean rust (ASR), caused by Phakopsora pachyrhizi, is one of the most important foliar diseases affecting soybean production worldwide. This study aimed to investigate the photosynthetic performance (leaf gas exchange, chlorophyll (Chl) a fluorescence images and photosynthetic pigment pools) of soybean plants sprayed with Acibenzolar-S-Methyl (ASM) and with the fungicide Epoxiconazole + Pyraclostrobin (Epo + Pyr) and further inoculated with P. pachyrhizi. The ASR symptoms progressed much faster on the leaves of plants from the control treatment (water spray) in comparison to the ASM and Epo +Pyr treatments. In general, the values for the leaf gas exchange parameters net carbon assimilation rate, stomatal conductance to water vapor, internal CO 2 concentration and transpiration rate increased for the infected plants sprayed with ASM or Epo +Pyr in comparison to plants from the control treatment. The values for the parameters initial fluorescence, maximal fluorescence, maximal photosystem II quantum efficiency, effective photosystem II quantum yield (Y(II)) and quantum yield of regulated energy dissipation (Y(NPQ)) were consistently higher for the ASM and Epo +Pyr treatments in comparison to the control treatment at advanced stages of fungal infection. By contrast, the values for the parameter quantum yield of non-regulated energy dissipation (Y(NO) were significantly lower for the ASM and Epo +Pyr treatments. The curves for Y(II) decreased while the curves for Y(NPQ) and Y(NO) increased for plants from the control, ASM and Epo +Pyr treatments as a function of the photosynthetic photon flux density. The concentrations of total Chl and carotenoids significantly increased for the infected plants from the ASM and Epo +Pyr treatments in comparison to plants from the control treatment. In conclusion, the results of the present study demonstrat that the spray of either soybean plants with Epo + Pyr or ASM, but especially the former, contributed to reduce the negative effects caused by P. pachyrhizi infection and allowed a good photosynthetic performance of the infected plants. / Dissertação liberada do sigilo em 17/01/2018 pelo Orientador Prof. Fabrício de Ávila Rodrigues. Autorização anexada ao Termo.

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2015-12-08T15:00:36Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1186772 bytes, checksum: e0f4566d7496f1e70c3befb3afd2df41 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-12-08T15:00:36Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1186772 bytes, checksum: e0f4566d7496f1e70c3befb3afd2df41 (MD5) Previous issue date: 2015-08-12 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / A raça XXXIII de Hemileia vastatrix foi recentemente identificada no Brasil, infectando algumas cultivares resistentes à ferrugem do cafeeiro. Embora o processo infeccioso de H. vastatrix seja bem estudado, não existem informações acerca da interação de cafeeiros com esta raça do fungo. Diante disso, um dos objetivos deste trabalho foi avaliar o processo de colonização do fungo e as respostas de defesa da planta em genótipos de cafeeiro resistente (Híbrido de Timor – HDT CIFC 832/1) e suscetível (C. arabica cv. Caturra CIFC 19/1) infectados pela raça XXXIII. As primeiras respostas citológicas induzidas pelo fungo foram observadas particularmente nas células estomáticas de ambos os genótipos, às 17 horas após inoculação (hai), e corresponderam à morte celular e ao acúmulo de compostos fenólicos. No genótipo suscetível, o fungo foi capaz de colonizar os tecidos do hospedeiro e produziu um grande número de haustórios, culminando na esporulação cerca de 20 dias após a inoculação (dai). Ao contrário, no genótipo resistente, o crescimento do fungo foi impedido, com alta frequência no estádio pré-haustorial. Estas observações citológicas indicam que a resistência de HDT CIFC 832/1 à raça XXXIII de H. vastatrix é pré-haustorial, ao contrário da resistência pós-haustorial que é geralmente descrita para interações cafeeiro - H. vastatrix. Com base nesta análise, foram definidos os tempos mais adequados para o estudo de genes expressos ao longo do processo infeccioso. Embora o sequenciamento do transcriptoma tenha sido bastante utilizado em estudos de interação planta-patógeno, uma das maiores dificuldades consiste na separação dos transcritos provenientes da planta e do fungo, principalmente quando não existe genoma de referência. Por esta razão, foi realizado o sequenciamento e a montagem do transcriptoma de esporos hidratados e germinados da raça XXXIII de H. vastatrix. A montagem resultou em 32.882 contigs, a partir dos quais foi gerado um conjunto de 11.989 genes preditos. Plantas de C. arabica cv. Caturra Vermelho (CIFC 19/1) e Híbrido de Timor (CIFC 832/1) foram inoculadas com esporos frescos de H. vastatrix (raça XXXIII) para estabelecer uma interação compatível e incompatível, respectivamente. Como controle, foram utilizadas folhas não inoculadas. Nos tempos de coleta pré-definidos (12, 24, 96 horas e 17 dias após a inoculação), as folhas foram removidas e utilizadas para extração de RNA. O sequenciamento das dez bibliotecas de cDNA foi realizado na plataforma Illumina MiSeq, gerando um total de 206 milhões de reads. Após tratamento dos reads, foi realizado o mapeamento das bibliotecas da interação, utilizando como referência o transcriptoma de H. vastatrix previamente montado. Os dados obtidos mostraram que muitos genes de H. vastatrix são similares aos genes do cafeeiro, o que dificulta o estudo da expressão de genes na interação. Por outro lado, genes não conservados entre os dois organismos puderam ser avaliados quanto à sua expressão. Foi verificada a presença de muitos genes comuns às duas interações (compatível e incompatível), sendo que a grande maioria não apresentou expressão diferencial, principalmente nas fases iniciais do processo infeccioso. As maiores diferenças entre as interações foram encontradas aos 17 dai, consistindo principalmente de genes “no hit”, ou seja, genes que não apresentam similaridade com sequências dos bancos de dados de proteínas. Estas sequências podem corresponder a genes específicos de H. vastatrix. As informações geradas nesta pesquisa poderão auxiliar no melhor entendimento da interação entre H. vastatrix e o cafeeiro. O conhecimento dos genes expressos durante a infecção poderá auxiliar no entendimento dos mecanismos moleculares que levam à suplantação da resistência por novas raças do fungo. / The race XXXIII of Hemileia vastatrix was recently identified in Brazil, infecting some cultivars that had been released as resistant to coffee leaf rust. To gain new insights into the interaction between coffee plants and this race of the fungus, we evaluated the fungal growth and the plant defence responses in coffee genotypes resistant (Híbrido de Timor – HDT CIFC 832/1) and susceptible (C. arabica cv. Caturra CIFC 19/1) to race XXXIII. The first cytological responses induced by the fungus were observed particularly in stomatal cells of both coffee genotypes by 17 hours post-inoculation (hpi) and corresponded to hypersensitive-like response (HR) and accumulation of phenolic-like compounds. In the susceptible genotype, the fungus was able to colonize the host tissues, produced a large number of haustoria and sporulated around 20 days post-inoculation (dpi). Reversely, in the leaves of resistant genotype, the fungus stopped its growth with higher frequency at pre-haustorial stages. These cytological observations indicate that the resistance of HDT CIFC 832/1 to race XXXIII of H. vastatrix is pre-haustorial, contrary to the post-haustorial resistance that is generally described for coffee - H. vastatrix interactions. Based on this analysis, the most suitable key time points of the infection process were defined, aiming at the study of differentially expressed genes in the interaction. Although the transcriptome sequencing has been widely used in plant-pathogen interaction studies, a major challenge is to separate transcripts from the plant and the fungus, especially in the absence of reference genomic sequences. For this reason, we performed the transcriptome sequencing and assembly of H. vastatrix (race XXXIII) hydrated and germinated spores. A total of 32.882 contigs were assembled, from which 11.989 genes were predicted. Plants of C. arabica cv. Caturra (CIFC 19/1) and Híbrido de Timor (CIFC 832/1) were inoculated with fresh spores of H. vastatrix race XXXIII to establish a compatible and an incompatible interaction, respectively. No inoculated leaves were used as control. In each time point (12, 24, 96 hours and 17 days post- inoculation), the leaves were removed and used for RNA extraction. Illumina MiSeq sequencing of ten cDNA libraries generated 206,000,000 reads. High quality reads of the H. vastatrix and coffee interacting transcriptomes were mapped against the H. vastatrix (race XXXIII) hydrated and germinated spores transcriptome previously assembled. The data showed that many genes of H. vastatrix are similar to coffee genes, which makes difficult the study of gene expression in the interaction. On the other hand, genes not conserved between the organisms could be evaluated for their expression. The presence of many common genes to both interactions (compatible and incompatible) was verified, and the majority did not show differential expression, especially in the early stages of the infection process. The major differences between interactions were found at 17 dpi, consisting mainly of genes that showed no similarity to protein databases. Those sequences can correspond to H. vastatrix specific genes. This investigation provides new insights into the coffee-rust interaction. The knowledge of gene expression profiling during the infection process may contribute to understanding the molecular mechanisms that lead to the breakdown of resistance by new physiological races of the fungus.

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2016-04-19T08:36:01Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1103060 bytes, checksum: 2db816e2be5ff856ea3cab2969628d3d (MD5) / Made available in DSpace on 2016-04-19T08:36:01Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1103060 bytes, checksum: 2db816e2be5ff856ea3cab2969628d3d (MD5) Previous issue date: 2015-02-24 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais / A ferrugem asiática da soja causada pelo fungo Phakopsora pachyrhizi é a principal doença da cultura da soja no Brasil. Visando entender a dinâmica da doença no campo e fornecer subsídios para programas de melhoramento visando resistência à doença e estudos de clonagem e caracterização de genes de avirulência do patógeno, esse trabalho teve por objetivo estudar a variabilidade fisiológica e molecular de isolados de P. pachyrhizi coletados em diferentes regiões brasileiras produtoras de soja. Durante os meses de janeiro a setembro de 2014, coletou-se 199 amostras de folhas com sintomas da doença. Deste total, 138 amostras foram recuperadas por meio da inoculação de uredósporos em folíolos destacados. No total, 68 isolados monolesionais de P. pachyrhizi foram multiplicados e armazenados em freezer -80°C e 113 isolados estão sendo multiplicados em folíolos destacados. Dentre os isolados multiplicados, 26 foram utilizados neste estudo. Estes isolados são representativos de 24 locais geograficamente distintos, em 6 Estados localizados em três regiões brasileiras: Centro-Oeste, Sudeste e Sul. Apenas o isolado DF 01-1 tem origem no Distrito Federal. Para avaliação da variabilidade fisiológica foi utilizado um conjunto de variedades diferenciadoras de soja, que incluiu oito genótipos com genes de resistência Rpp1 a 6, dois genótipos com genes R desconhecidos e a cultivar Conquista, suscetível. Para a análise molecular, o DNA genômico foi extraído a partir de esporos congelados dos isolados monolesionais, de uredósporos coletados diretamente das amostras e de tecido infectado. Foi utilizado um conjunto de 18 pares de oligonucleotídeos que amplificam locos microssatélites previamente caracterizados. Três tipos de reação ocorreram nas variedades diferenciadoras de soja em resposta à infecção pelos isolados monolesionais de P. pachyrhizi: reação de hipersensibilidade caracterizada por imunidade com flecks necróticos (IF), lesões vermelho-castanhas (RB) e lesões TAN, típicas de reação de suscetibilidade. Todos os isolados produziram lesão TAN com abundante esporulação na cultivar Conquista e nos acessos PI 200492 (Rpp1) e PI 462312 (Rpp3); lesão RB nos genótipos PI 230970 (Rpp2), PI 459025 (Rpp4), PI471904 (Rpp5), PI 567102B (Rpp6) e PI 594767-A (Rpp1?), e reação de imunidade com flecks necróticos nos acessos PI 587880-A (Rpp1?), PI 587905 (Rpp1?) e PI 587886 (Rpp1?). Os isolados diferiram quanto ao nível de esporulação observado nos genótipos PI 230970 (Rpp2), PI 459025 (Rpp4), PI471904 (Rpp5) e PI 567102B (Rpp6). Observou-se ausência de variabilidade molecular nos locos microssatélites analisados, o que pode ser indicativo de um efeito fundador recorrente na população do patógeno, em razão de seleção imposta pelo uso intensivo de fungicidas e da prática do vazio sanitário. Todavia, essa hipótese deverá ser confirmada por uma análise englobando todos os isolados obtidos e novas amostras coletadas na safra 2014/2015. / Asian soybean rust, caused by the fungus Phakopsora pachyrhizi, is the main soybean disease in Brazil. Aiming to understand the dynamics of the disease in the field and to contribute to breeding programs aiming disease resistance and to studies of characterization of avirulence genes from the pathogen, the objective of this work was to study the physiological and molecular variability of P. pachyrhizi isolates collected in different soybean producing regions in Brazil. Between January and September of 2014, 199 samples of leaves showing symptoms of the disease were collected. One hundred thirty-eigth populations were recovered from these samples through inoculation of detached leaves with urediniospores. A total of 68 single-lesion P. pachyrhizi isolates were multiplied and stored in a freezer at -80oC and 113 isolates are currently being multiplied on detached leaves. Twenty-six out of the total multiplied isolates were used in this study, which are representative of 24 distinct geographic sites, located in six states corresponding to three major soybean production regions: midwest, southeast and south. The isolate DF 01-1 originated from the Distrito Federal. To evaluate physiological variability, a set of differential soybean varieties was used, including eight genotypes carrying the Rpp-1 to -6 resistance genes, two genotypes with uncharacterized resistance genes and the susceptible cultivar Conquista. For the molecular analysis, genomic DNA was extracted directly from frozen spores collected from single-lesion isolates, from urediniospores collected directly from collected leaf samples and from infected leaves. A set of 18 oligonucleotide pairs was used to amplify microsatellite loci previously characterized. Three types of reactions occurred on differential soybean varieties in response to infection by single- lesion P. pachyrhizi isolates: hypersensitive reaction, characterized by immune necrotic flecks (IF), red-brown (RB) lesions, and TAN lesions, typical of a susceptible reaction. All isolates produced TAN lesions with abundant sporulation on cultivar Conquista and on accessions PI 200492 (Rpp1) and PI 462312 (Rpp3); RB lesions on genotypes PI 230970 (Rpp2), PI459025 (Rpp4), PI471904 (Rpp5), PI 567102B (Rpp6) and PI 594767-A (Rpp1?); and immune reaction with necrotic flecks on accessions PI 587880-A (Rpp1?), PI 587905 (Rpp1?) and PI 587886 (Rpp1?). There were differences among isolates in the level of sporulation on genotypes PI 230970 (Rpp2), PI 459025 (Rpp4), PI471904 (Rpp5) and PI 567102B (Rpp6). Absence of molecular variability in the analyzed microsatellite loci was observed, which could be indicative of recent and recurrent founder effects in the pathogen population as a consequence of the selection pressure by the use of fungicides and the host-free period, a period of 60 to 90 days from July to September during which farmers are restricted from planting soybean (so-called vazio sanitário). This hypothesis needs to be confirmed by a more comprehensive analysis using all isolates collected so far, as well as additional samples collected during the 2014/2015 season.