Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:16Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-01-31Bitstream added on 2014-06-13T20:23:19Z : No. of bitstreams: 1 molina_lmr_dr_jabo.pdf: 480341 bytes, checksum: b838d0062518eb208c7e881bd5eb7588 (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / No início dos anos 90, o fungo Rhizoctonia solani emergiu como um patógeno importante associado à morte de pastagens do gênero braquiária na Colômbia. Inicialmente, esse estudo indicou que R. solani AG-1 IA predomina como patógeno associado à queima da folha da braquiária nos Llanos Colombianos. Para o estudo da estrutura genético-populacional do patógeno, um total de 198 isolados de R. solani AG-1 IA foram coletados de campos de B. brizantha cv. Toledo, de Brachiaria híbrido Mulato e do arroz. Os isolados foram genotipados usando dez loci microssatélites. Um sistema reprodutivo misto (reprodução sexuada e clones adaptados) caracterizou as populações de R. solani AG-1 IA que infectam a braquiária. A alta fração clonal e os desvios do equilíbrio de Hardy-Weinberg encontrados foram consistentes com o efeito Wahlund associado à mistura de populações. Padrões históricos de migração entre populações hospedeiro-distintas indicaram a origem provável das populações que infectam braquiária a partir de populações que infectavam arroz. Para determinar o efeito do estresse térmico na evolutibilidade para crescimento micelial, populações de R. solani AG-1 IA infectando braquiária ou arroz e R. oryzae-sativae do arroz, foram submetidas à temperatura ótima e de estresse (25 e 35°C). A herdabilidade para crescimento micelial sob condições de estresse foi considerada alta na população de R. oryzae-sativae do arroz, indicando que os patógenos têm potencial de adaptação à temperatura de 35°C / In the early '90s, the fungus Rhizoctonia solani has emerged as an important pathogen associated with the death of Brachiaria pastures in the Colombian Llanos. Initially, this study indicated that R. solani AG-1 IA was the predominant pathogen associated with the leaf blight in the Colombian Llanos. To study the population genetic structure of the pathogen, a total of 198 isolates of R. solani AG-1 IA were collected from fields of B. brizantha cv. Toledo, Brachiaria Mulato hybrid and from rice. These isolates were genotyped using ten microsatellite loci. A mixed mating system (sexual reproduction and dispersal of adapted clones) characterized the populations of R. solani AG-1 IA infecting Brachiaria. The high clonal fraction and deviations from Hardy-Weinberg equilibrium found in three out of four populations were consistent with Wahlund effect associated with the mixing of populations. Historical patterns of migration between different host-populations indicated that the likely source of the current populations infecting Brachiaria in the Colombian Llanos was from populations that originally infected rice. To determine the effect of heat stress on the evolvability for mycelial growth, two host distinct populations of Rhizoctonia solani AG-1 IA infecting either brachiaria or rice and a rice-infecting population of R. oryzae-sativae, were submitted to optimal and stress temperatures (25°C and 35°C). The heritability values for mycelial growth under heat stress was considered high for rice-infecting population of R. oryzae-sativae, indicating that these pathogen’s population have a high potential to adapt to 35°C temperature

Orientador : Prof. Dr. Celso Garcia Auer / Coorientadores : Prof. Dr. Álvaro Figueredo dos Santos, Antonio Rioyei Higa / Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Engenharia Florestal. Defesa: Curitiba, 24/02/2017 / Inclui referências : f. 43-50 / Resumo: Acácia-negra (Acacia mearnsii De Wild) é uma leguminosa arbórea, originária da Austrália, que vem sendo cultivada em vários países. No Brasil, é plantada no estado do Rio Grande do Sul, com a finalidade de produção de tanino, extraído da casca, e de celulose e energia, provenientes da madeira. A acácia-negra é de grande importância econômica e social nas pequenas propriedades existentes na região de plantio. Os plantios comerciais de acácia-negra são estabelecidos por mudas seminais, mas também plantios clonais também estão sendo implantados. Um dos fatores limitantes à produção de mudas clonais é a ocorrência de podridão de miniestacas. Dessa forma, o presente trabalho teve como objetivo avaliar a podridão de miniestacas de A. mearnsii em três clones comerciais, testar a patogenicidade dos principais fungos encontrados e buscar as fontes de inóculo dos fungos causadores de podridão em miniestacas. As coletas de material foram efetuadas em viveiro na região de Triunfo/RS, em setembro/2015 (1ª coleta) e março/2016 (2ª coleta). Coletouse miniestacas em fase de enraizamento com podridão e sadias; brotações aparentemente sadias; brotações com lesões escuras; amostras do substrato utilizado para o enraizamento das miniestacas; água utilizada para a irrigação; provável material doente nas minicepas dos jardins clonais; areia proveniente dos canaletões dos minijardins; tubetes; e britas provenientes do piso da estufa. Para detecção de fungos, utilizou-se os métodos de isolamento direto, isolamento indireto, isolamento de fungos endofíticos, diluição em série, teste com isca e plaqueamento de resíduos. Calonectria polizzii e Neopestalotiopsis clavispora são os agentes causais da podridão de miniestacas de acácia-negra. Brotações e miniestacas assintomáticas, substrato usado, piso da estufa e tubetes podem ser fontes de inóculo. Palavras chave: Acacia mearnsii, Calonectria polizzii, doença em viveiro, propagação vegetativa. / Abstract: Black wattle (Acacia mearnsii De Wild) is a leguminous tree native to Australia, which has been grown in several countries. In Brazil, it has been planted, in Rio Grande do Sul, mainly for the purpose of producing tannin extracted from bark, cellulose and energy from wood. Black wattle has great economic and social importance in the small properties existing in the region of planting. Black wattle commercial plantings are established by seminal seedlings and clonal plantations are also being implanted, but one of the limiting factors to the production of clonal seedlings is the occurrence of rot minicuttings. In this way, the present study aimed to evaluate the rot of A. mearnsii minicuttings in three commercial clones, to test the pathogenicity of the main fungi found and to search inoculum sources of fungi that cause rot minicuttings. The material were collected in a nursery in the region of Triunfo/RS, in September/2015 (1st collection) and March/2016 (2nd collection). Healthy and rotten minicuttings in rooting phase, apparently healthy clonal minigarden sprouts; sprouts with dark lesions; substrate used for the minicuttings rooting; water used for irrigation; diseased ministumps; sand from clonal minigarden; plastic tubes; and cracked stones from the greenhouse floor were collected. For detection of fungi, methods of direct isolation, indirect isolation and isolation of endophytic fungi, serial dilution, bait test and plating of residues were used. Calonectria polizzii and Neopestalotiopsis clavispora are the causal agents of black wattle rot minicuttings. Sprouts and asymptomatic minicuttings, greenhouse floor, plastic tubes and infested containers are source of inoculum. Key words: Acacia mearnsii, Calonectria polizzii, nursery disease, vegetative propagation.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:33:37Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-04-16Bitstream added on 2014-06-13T19:23:49Z : No. of bitstreams: 1 000739516.pdf: 1650325 bytes, checksum: a1b57134d48fa771d7c3cfd4a0dce580 (MD5) / As espécies de Trichoderma spp. e Clonostachys rosea são bastante estudadas atualmente para o controle biológico de doenças de plantas. O objetivo deste trabalho foi avaliar o potencial dos antagonistas, Trichoderma asperellum (LQC96) e Clonostachys rosea (LQC62), no controle biológico das principais doenças fúngicas de begônia (mofo cinzento, mancha de Mirotécio e podridão do colo). A etiologia da podridão do colo em begônias foi estudada por meio das análises de suas características morfológicas e moleculares. Foram realizados ensaios in vitro a fim de verificar os mecanismos envolvidos no controle biológico dessas doenças, avaliados por meio da produção de compostos voláteis e compostos solúveis com ação inibitória aos patógenos, além da capacidade hiperparasítica dos antagonistas. A metodologia para avaliar os compostos voláteis consistiu em posicionar dois fundos de placas de Petri sobrepostas, contendo em uma delas cultura do antagonista e em outra, do patógeno. Para avaliar os compostos solúveis, foram utilizadas duas metodologias, o método em cultivo sobre o papel celofane para LQC96 e o método do filtrado da cultura líquida para LQC62. O hiperparasitismo foi avaliado por meio de culturas pareadas. Verificou-se a colonização e a supressão da esporulação em discos e em hastes de begônias. Após a análise do potencial in vitro, foram realizadas ensaios em casa de vegetação, a fim de verificar o controle dessas doenças em cultivo comercial de begônia. Nos ensaios in vitro, verificou-se que os antagonistas tiveram atividade antagônica contra esses patógenos, com a produção de compostos voláteis e solúveis, além de demonstrar a capacidade hiperparasítica de ambos antagonistas. Ambos agentes de controle biológico avaliados foram capazes de colonizar os discos e hastes de begônia e a aplicação preventiva na concentração de... / Currently the species of Trichoderma spp. and Clonostachys rosea are widely studied for biological control of plant diseases. The aim of this study was to evaluate the potential of these isolates these antagonists (T. asperellum LQC96 and C. rosea LQC62) in the biological control of major fungal diseases of begonia (gray mold, Myrothecium leaf spot and stem rot). The etiology of stem rot was studied using morphological and molecular analysis. In vitro assays were performed to verify the mechanisms involved in the biological control of these diseases, measured by the production of volatile and soluble compounds with an inhibitory effect on pathogens and the ability of antagonist hyperparasitism. The methodology for assessing the volatiles consisted of placing two Petri dishes superimposed on one culture containing the antagonist and another pathogen. To evaluate soluble compounds, two methods were used, the cultivation on cellophane for LQC96 and and the culture liquid filtrate method for LQC62. The hyperparasitism was assessed using paired cultures. There colonization and suppression of sporulation was evaluate on leaf disks and stem of begonias. After analysis of the potential in vitro assays, were performed in a greenhouse in order to verify the control of these diseases in commercial cultivation of begonia. In vitro assays was found that the antagonists were antagonistic activity against these pathogens, producing volatile and soluble compounds, and demonstrate the ability of hyperparasitism. Both biocontrol agents evaluated were able to colonize the leaf discs and stem of begonia and preventive application in concentration of 1x107 conidia mL-1 proved to be the most effective in suppressing pathogen sporulation on leaf discs and stem of begonia. The essay on commercial cultivation decreased the incidence of diseases with weekly application of antagonists. For control of gray mold and ...

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:33:37Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-06-24Bitstream added on 2014-06-13T19:44:32Z : No. of bitstreams: 1 000739802.pdf: 2542362 bytes, checksum: c004fe8b7c12122b0e1e928a0f1aaee4 (MD5) / Foram objetivos deste trabalho determinar a influência da temperatura e do período de molhamento foliar na epidemiologia da ferrugem alaranjada da cana-de-açúcar, o progresso epidêmico através das curvas de progresso de doença e mapear as zonas de risco de ocorrência da doença. Na primeira etapa foram utilizadas plantas da cultivar SP89-1115 com vinte dias de idade inoculadas com o fungo Puccinia kuehnii na concentração de 2 x104 de uredósporos/mL. O delineamento experimental utilizado foi inteiramente casualizado (DIC) em esquema fatorial 5x7 sendo 5 temperaturas (17,5 ; 20,0 ; 22,5 ; 25,0 e 27,5°C) e 7 períodos de molhamento foliar (0 ; 4; 8; 12; 16; 20 e 24 horas), com 3 repetições. As melhores temperaturas para o desenvolvimento da ferrugem alaranjada foram 20,0; 22,5 e 25,0°C sendo esta última a melhor nos períodos de molhamentos foliares acima de 12 horas. Na segunda etapa foram conduzidos experimentos em quatro áreas comerciais localizadas nos municípios de São Carlos, Jaboticabal e Miguelópolis no estado de São Paulo nas safras de 2009/2010, 2010/2011 e 2011/2012 respectivamente. Sendo as variedades utilizadas nas safras de 2009/2010 e 2011/2012 a RB72-454 e na safra 2010/2011 a SP 89-1115 ambas sabidamente suscetíveis à ferrugem alaranjada. O delineamento experimental utilizado foi em blocos casualizados (DBC) com quatro repetições, sendo as parcelas constituídas de quatro linhas de dez metros de comprimento, com espaçamento de 1,5 m entre linhas. A severidade da doença, que ocorreu por infecção natural, foi avaliada a cada 30 dias em cinco plantas escolhidas aleatoriamente na área útil da parcela, analisando a folha +3 de cada planta com auxílio de uma escala descritiva de notas de Amorim et al. (1987) para ferrugem marrom (Puccinia melanocephala) adaptada para a ferrugem alaranjada. Os valores dos coeficientes de determinação ajustado... / The objective of this study was to determine the influence of temperature and leaf wetness in the epidemiology of rust of sugarcane. The development was evaluated through epidemic disease progress curves and mapping risk areas of disease occurrence. In the first test was used plants of the variety SP89-1115 with twenty days of old was inoculated with the pathogen Puccinia kuehnii at a concentration of 2 x 104 urediniosporal.mL-1 The experimental design was completely randomized with a factorial arrangement 5x7, representing the interaction of five temperatures (17.5, 20.0, 22.5, 25.0 and 27.5 °C) and 7 periods of leaf wetness (0, 4, 8, 12, 16, 20 and 24 hours of leaf wetness), with 3 repetitions. The temperature for the development of orange rust of sugarcane was 20.0, 22.5 and 25.0 °C, and the best results were at 25.0 °C latter being the best leaf wetness periods over 12 hours. In the second step, experiments were in four areas located in cities of São Carlos, Jaboticabal and Miguelópolis in São Paulo state during in 2009/2010, 2010/2011 and 2011/2012 respectively. Varieties being used during the agricultural year 2009/2010 and 2011/2012 RB72-454, 2010/2011 SP 89-1115 both notoriously susceptible to leaf orange rust. The experimental design was complete randomized blocks with four repetitions and plots consisting of four rows ten feet long, with spacing of 1.5 m between rows. The disease severity occurred for natural and the evolutions were made every 30 days in five randomly chosen plants in each parcel, analyzing +3 leaf of each plant with the aid of a descriptive scale. The coefficients of determination adjusted (R*2), standard deviation of the initial inoculum (x0) and infection rate (r*) confirmed that the monomolecular model was the best fit to the data of leaf orange rust of sugarcane when compared to other treatments and in all agricultural year. In the third stage with the ...

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:35:00Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2005-08-19Bitstream added on 2014-06-13T20:06:02Z : No. of bitstreams: 1 aparecido_cc_dr_botfca.pdf: 485426 bytes, checksum: 0acb33f546a3cf580d7a678084d5020e (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Com o objetivo de caracterizar o complexo gênero anamórfico Cylindrocladium, dezoito isolados foram cultivados em meios de cultura distintos, mantidos sob diferentes temperaturas, além de ter conídios e vesículas terminais analisados morfologicamente para identificação correta das culturas. Inoculações em diferentes hospedeiros foram realizadas para avaliação do comportamento patogênico dos isolados estudados. Também, o DNA destes isolados foi extraído e analisado, na tentativa de se encontrar diferenças relevantes. Com relação aos caracteres morfológicos estudados, pôde-se observar que ocorrem alterações nas dimensões de conídios e morfologia da vesícula terminal devido, provavelmente, à mudança do substrato de cultivo. Porém, a variabilidade natural nas características dessas estruturas é tão elevada que dificulte a identificação correta dos isolados. Em uma mesma cultura, por exemplo, puderam ser observadas vesículas terminais de diferentes morfologias. Também foi estudada a compatibilidade genética através do pareamento, dois a dois, dos diferentes isolados em meio de cultura feijão azuki-ágar. Observou-se que, somente em alguns pareamentos, desenvolveram-se peritécios contendo esporos sexuais do gênero teleomórfico Calonectria, correspondente ao anamorfo Cylindrocladium spp., diferente compatibilidade gênica, ou seja, distintos mating-types. Pôde-se constatar que existem diferenças patogênicas e fisiológicas entre os isolados, uma vez que houve a formação de grupos distintos quando tais características foram consideradas. Estas diferenças, provavelmente, sejam devidas à constituição genética distinta existente entre os isolados. Porém, isto não pôde ser constatado devido às dificuldades encontradas nos experimentos relativos à caracterização molecular... / In order to characterize the anamorfic genus Cylindrocladium eighteen isolates had been cultivated in distinct media of culture, kept under different temperatures, besides having spores and terminal vesicles morphologically analyzed for correct identification of cultures. Inoculations on different hosts had been carried out through for evaluation of pathogenic behavior of the isolated studied. The genetic compatibility was studied by the cultures pareament on azuki-bean medium. Only in some plates were observed perithecia containing sexual spores (ascospores) of the teleomorphic genus Calonectria. This result indicates the existence of different mating types. Also, the DNA of these isolates were extracted and studied in the attempt to find important differences. Concerning the morphologic characters studied could be observed that alterations occur in the conidial dimensions and morphology of the terminal vesicle, but those alterations were meaningless and happen probably due the substratum changes. However, the natural variability in the general characteristics of these structures raised that it makes difficult the correct identification of the isolates. In the same culture, for example, can be observed terminal vesicles with different morphologies. It could be evidenced that pathogenic and physiological differences among the isolates exist. This brings the idea of the distinct populational groups formation when such characteristics were considered. These differences, probably, must to the existence of distinct genetic constitution among the isolates. However, this could not be evidenced due the difficulties that occur in the molecular characterization experiments. For these studies were necessary a good quality of DNA samples. Even though many different protocols for DNA extraction were used this quality was not obtained...(Complete abstract click electronic access below)

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:35:00Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2002-02Bitstream added on 2014-06-13T20:06:03Z : No. of bitstreams: 1 meyer_mc_dr_botfca.pdf: 871879 bytes, checksum: 19c7529e77cff6ad15a7c03041da99d7 (MD5) / A mela da soja ocorre em várias regiões tropicais e subtropicais no mundo, sendo responsável por reduções de produtividade de até 50% nos EUA e de 31% no Brasil. A doença é causada pelo fungo Rhizoctonia solani AG1-IA e AG1-IB, com relatos do AG2-3 somente no Japão. No Brasil há incidência de mela nas regiões Norte, Nordeste e Centro Oeste. A caracterização do patógeno é fundamental para o estabelecimento de estratégias de controle e direcionamento de programas de melhoramento na busca de resistência genética. O controle químico representa a única alternativa após a instalação da doença, cuja eficiência varia em função das condições ambientais. O objetivo deste trabalho foi caracterizar o agente causal da mela da soja no Brasil, bem como desenvolver metodologia de seleção e avaliar a variabilidade genética em germoplasma de soja para resistência à doença, e o efeito de fungicidas e indutores de resistência sobre o patógeno e a doença. Isolados de R. solani provenientes do Mato Grosso, Maranhão, Roraima e Tocantins, foram analisados quanto às características citológicas, morfológicas, culturais e fusão de hifas para determinação do grupamento de anastomose... / Rhizoctonia foliar blight (RFB) of soybean occur on some world tropical and subtropical regions, causing yield reductions of 50% in USA and of 31% in Brazil. The disease is caused by Rhizoctonia solani AG1-IA and AG1-IB, and by AG2-3 only in Japan. The RFB occurs in Brazil in the North, Northeast and Mid-West regions of the country. The characterization of the pathogen is important for the establishment of disease control strategies and breeding for genetic resistance. Chemical control remains the only measure for controlling RFB after its incidence in a field, but its efficiency depends on the environmental conditions. The objectives of the present work were: characterization of Brazilian RFB isolates, screening methodologies and evaluation of soybean germplasm for genetic resistance, evaluation of fungicides and activators for their effects upon systemic acquired resistance on the R. solani and RFB. Isolates from the states of Mato Grosso, Maranhão, Roraima and Tocantins were analyzed for cytological, morphological, cultural and hyphal fusion characteristics. These isolates were also compared by Random Amplified Polimorfic DNA (RAPD) and by homology of rDNA-ITS sequence regions in order to define anastomosis group (AG) and Intraspecific Group (ISG) of the pathogen. Germplasm evaluation methodologies for resistance to RFB were compared by different inoculation methods. The effect of fungicides and activators of plant resistance were tested in vitro and in vivo...(Complete abstract, click electronic access below)

Made available in DSpace on 2015-04-09T12:28:16Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-02-27Bitstream added on 2015-04-09T12:47:51Z : No. of bitstreams: 1 000817867_20160327.pdf: 244238 bytes, checksum: 138a4f9eeffca640708f9f2b8c3597ac (MD5) Bitstreams deleted on 2016-03-28T13:37:38Z: 000817867_20160327.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2016-03-28T13:38:43Z : No. of bitstreams: 1 000817867.pdf: 1263525 bytes, checksum: 3a4be59983c22dd3e70c88a764890456 (MD5) / Phyllosticta corresponde a um importante gênero de fungos associados ao reino vegetal. Devido à importância econômica dos prejuízos ocasionados por algumas espécies de Phyllosticta e ao comportamento cosmopolita das espécies endofíticas, várias pesquisas têm sido realizadas no intuito de identificar e reclassificar as espécies desse gênero. Mediante a aplicação do sequenciamento de diferentes regiões gênicas, novas espécies de Phyllosticta foram relatadas recentemente, e concomitante aos novos relatos, surgiram dúvidas acerca da identificação das espécies já relatadas e comumente citadas na literatura. Neste contexto, estudos indicaram que mangueiras são hospedeiras de diferentes espécies endofíticas de Phyllosticta spp. e, que P. capitalensis pode ocasionar lesões em frutos de goiabeiras, cujos sintomas eram até então atribuídos à outra espécie do gênero. Assim, tendo em vista a reclassificação e identificação de novas espécies, fez-se necessário a realização de estudos do complexo de espécies de Phyllosticta ainda não conhecidas, dando continuidade aos trabalhos já realizados no Brasil em mangueiras e goiabeiras, culturas nas quais a identificação do fungo ainda não está bem esclarecida. Para tanto, este trabalho objetivou obter uma coleção atual de isolados de Phyllosticta de folhas assintomáticas de goiabeiras e de mangueiras, e de frutos sintomáticos de goiabeiras. Amostras de folhas de ambas as espécies de plantas foram coletadas em bancos de germoplasma e em áreas de produção comercial. Foram selecionados 102 isolados, segundo suas características fenotípicas em meio de cultura, para serem submetidos ao sequenciamento da região ITS1-5.8S-ITS2, e dos genes codificadores da actina (ACT) e do gliceraldeído-3-fosfato desidrogenase (GPDH). Ainda, a fim de corroborar os resultados obtidos pelo sequenciamento e objetivando analisar o perfil genético dos indivíduos, foram ... / Phyllosticta corresponds to an important genus of fungi associated with the plant kingdom. Due to the economic importance of damages caused by some species of Phyllosticta and the cosmopolitan behavior of endophytic species, several studies have been conducted in order to identify and reclassify species of this genus. Through the application of sequencing of different gene regions, new species of Phyllosticta were recently reported, and concomitant to the new reports, doubts were raised about the identification of previously reported and commonly cited species in literature. In this context, studies indicated that mango is hosted by different endophytic species of Phyllosticta spp. and that P. capitalensis can cause lesions on guava fruits, whose symptoms were previously attributed to other species of the genus. Thus, because of the reclassification and identification of new species, it was necessary to perform studies of the complex of Phyllosticta species not yet known, by continuing the work already carried out in Brazil with guava and mango crops in which the identification of the fungus is still unclear. Therefore, this study aimed to obtain a current collection of Phyllosticta isolates from asymptomatic leaves of guava and mango, and symptomatic fruits of guava. Leaves samples of both plant species were collected in germplasm banks and in areas of commercial production of the fruits. It were selected 102 isolates, according to their phenotypic characteristics in culture medium, to be submitted to the sequencing of ITS1-5.8S-ITS2, actin (ACT) and glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase (GPDH) genes. Also, in order to corroborate the results obtained by sequencing and aiming to analyze the genetic profile of the isolates, fAFLP markers (fluorescent Amplified Fragment Length Polymorphism) analysis were applied. Both techniques allowed the separation of isolates according to their species, which were identified as ...

Made available in DSpace on 2015-06-17T19:34:03Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-01-16. Added 1 bitstream(s) on 2015-06-18T12:47:30Z : No. of bitstreams: 1 000826579.pdf: 368217 bytes, checksum: 8e4e91ae5f9afdf71e55913e7b8beac1 (MD5) / A podridão floral dos citros (PFC) é uma importante doença dessa cultura, responsável por elevadas perdas de produção. Normalmente, essa doença mostra-se limitante quando ocorrem prolongados períodos chuvosos durante o florescimento das plantas ou quando existe intenso molhamento foliar. Duas espécies de Colletotrichum estão associadas à doença: C. acutatum e C. gloeosporioides. Entretanto, recentemente tem-se verificado que, mesmo sob condições não tão propícias, a doença tem ocorrido com relativa frequência; suspeitando-se do envolvimento de outras espécies de Colletotrichum ou de novas condições de adaptação das espécies descritas. Esse trabalho teve como objetivo determinar se há ou não outra espécie de Colletotrichum associada a PFC e avaliar a viabilidade do emprego de marcadores moleculares ISSR na caracterização taxonômica de isolados de Colletotrichum spp. associados a sintomas de PFC em flores, assim como de tecidos foliares e frutos cítricos assintomáticos. Para tanto, foi empregada uma combinação de iniciadores específicos, levando em conta a região ITS e marcadores moleculares ISSR. Os marcadores ISSR mostraram-se eficientes na caracterização taxonômica dos isolados de Colletotrichum analisados. A população avaliada foi constituída apenas por C. acutatum e C. gloeosporioides, descartando o envolvimento de uma espécie adicional, o que converge com os registros na literatura. Foi constatada alta diversidade genética entre os isolados analisados, o que também se mostra convergente quanto às diferenças fenotípicas observadas sob condições de campo. Entretanto, não foi encontrada relação quanto à origem e as espécies de Colletotrichum spp. associadas. De modo inédito, ainda que assintomaticamente, foi detectada a presença de um isolado de C. acutatum associado a frutos cítricos / Postbloom fruit drop of citrus (PFD) is a serious disease of this crop, accounting for high yield losses. Usually, this disease shows to be limiting when there are prolonged rainy periods during plant flowering or when there is intense leaf wetness. Two Colletotrichum species are associated with the disease: C. acutatum and C. gloeosporioides. However, recently, it has been found that, even under not so favorable conditions, the disease has occurred with some frequency; one suspects the involvement of other Colletotrichum species or new adaptation conditions of the described species. This study aimed to determine whether there is another Colletotrichum species associated with PFD and it assess the viability of using molecular markers ISSR for taxonomic characterization of Colletotrichum spp. isolates associated with PFD symptoms in flowers, as well as of leaf tissues and asymptomatic citrus fruits. For this purpose, we used a combination of specific primers, taking into account the ITS region and ISSR molecular markers. ISSR markers have proven to be effective for taxonomic characterization of the Colletotrichum isolates analyzed. The population assessed consisted only of C. acutatum and C. gloeosporioides, discarding the involvement of an additional species, something which converges with records in the literature. We found high genetic diversity among the isolates analyzed, and this also shows to converge as for the phenotypic differences observed under field conditions. However, no relation was found regarding the origin and associated Colletotrichum spp. species. In an unprecedented way, although asymptomatically, we detected the presence of a C. acutatum isolate associated with citrus fruits

Made available in DSpace on 2015-06-17T19:34:03Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-02-27. Added 1 bitstream(s) on 2015-06-18T12:47:30Z : No. of bitstreams: 1 000829670_20170301.pdf: 127810 bytes, checksum: 44d4ae85fcaac4415a01b5b5767032c2 (MD5) Bitstreams deleted on 2017-03-03T11:01:31Z: 000829670_20170301.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2017-03-03T11:02:40Z : No. of bitstreams: 1 000829670.pdf: 1102839 bytes, checksum: 4219369f7ced3eb60a4edfc75be10b10 (MD5) / A Mancha Preta dos Citros (MPC), causada pelo fungo Phyllosticta citricarpa, encontra-se espalhada pelos continentes do mundo. Seus sintomas ocasionam a depreciação dos frutos e a queda prematura daqueles severamente infectados. Dada a importância econômica desta doença, realizamos a análise da estrutura genética de duas coleções de isolados de P. citricarpa, obtidas de uma única propriedade citrícola, em um intervalo de sete anos. Os frutos foram coletados de laranjeiras 'Pera 'e 'Valência' nos anos de 2005 e 2012. Os isolados obtidos foram identificados mediante a análise de sequências da região ITS e genes GPDH e TEF1. Assim, 80 isolados da coleção de 2005 e 115 de 2012 foram identificados como P. citricarpa. Apenas seis isolados de Phyllosticta capitalensis foram encontrados em meio aos de 2012. Maior quantidade de sequências com variações genéticas foram identificadas nos isolados obtidos na última amostragem de frutos, principalmente nas populações oriundas de 'Valência'. A diferenciação genética entre as populações de P. citricarpa de laranjeiras 'Valência', de 2005 e 2012, foi evidenciada mediante o emprego de marcadores AFLP, sendo o genótipo predominante em 2012 aquele identificado nas populações de 'Pera', de ambos os períodos. Pela análise da relação genética entre os isolados, presumiu-se que indivíduos cujo genótipo tenha sido favorecido apareceram primeiramente entre as populações de P. citricarpa que abrigavam as plantas de 'Pera', e posteriormente, migraram para os pomares de 'Valência'. Esta uniformização populacional ao longo dos sete anos e o baixo polimorfismo notado entre os isolados ao longo de gerações são indicativos de baixa recombinação genética entre os indivíduos. Sequências das bandas polimórficas entre os isolados de 'Valência' de 2005 e 2012 apresentaram similaridade com aquelas de proteínas da família de ABC transporters ... / Citrus Black Spot (CBS), caused by the fungus Phyllosticta citricarpa, is spread over continents in the world. Its symptoms cause fruit depreciation and those severely infected fall prematurely. Given the economic importance of this disease, we carried out analysis of the genetic structure of two P. citricarpa isolates collections, obtained from a single citrus farm in a seven years interval. Fruits were collected from Pera and Valencia orange varieties in 2005 and 2012. The isolates obtained were identified by sequences analysis of ITS region and GPDH and TEF1 genes. Thus, 80 and 115 isolates of the 2005 and 2012 collections, respectively, were identified as P. citricarpa. Among the 2012 collection only six Phyllosticta capitalensis isolates were found. Higher amount of sequences containing genetic variations were identified in the isolates from the last fruits sampling, especially in populations derived from Valencia oranges. By applying AFLP markers it was evidenced genetic differentiation among P. citricarpa populations from Valencia oranges obtained between 2005 and 2012, whose predominant genotype in 2012 was that found in Pera populations from both periods. Through analysis of genetic relationship among isolates, it was assumed that individuals with favored genotypes have first appeared among P. citricarpa populations of Pera plants, and further migrated to Valencia orchards. Genetic populations uniformity over the seven years and low polymorphism observed among them, over generations, are indicative of low genetic recombination between individuals. Sequences of polymorphic bands between isolates of 2005 and 2012 Valencia collections presented similarity with those of ABC transporters Family proteins, which act as efflux pumps of cytotoxic compounds, as fungicides, and to NADH dehydrogenase proteins. Such gene modifications might be responsible for variability of sensibility responses of the isolates to strobilurins, which ...

Made available in DSpace on 2015-03-03T11:52:25Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-10-24Bitstream added on 2015-03-03T12:07:18Z : No. of bitstreams: 1 000806884_20161031.pdf: 2377845 bytes, checksum: 2a3f97ee5bbf95e2dbbfd2e8517de872 (MD5) Bitstreams deleted on 2016-10-31T10:32:35Z: 000806884_20161031.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2016-10-31T10:33:09Z : No. of bitstreams: 1 000806884.pdf: 12054974 bytes, checksum: 3f7ed2ea30d77e1c0e72bc70fa54b0f8 (MD5) / A cana-de-açúcar (Sacharam spp.) é uma planta de grande importância econômica para o Brasil, usada principalmente na produção de açúcar e etanol, mas que está sujeita ao ataque de diversas doenças, tais como aquelas associadas à proliferação de vírus, bactérias e fungos, que comprometem a produtividade, impactando a produção de biomassa. Estudos que visam estabelecer uma correlação entre a composição micromolecular e a resistência hospedeiro/patógeno ainda são pouco explorados, mas podem auxiliar na investigação dessas interações. Portanto, o objetivo deste estudo foi analisar e comparar os perfis metabólicos da cera epicuticular e de outros metabólitos lipofílicos de folhas de diversas variedades de cana-de-açúcar, por cromatografia a gás acoplada à espectrometria de massas (GCMS). As análises qualitativas resultaram na identificação de 58 compostos na cera epicuticular (138 observados), 41 no extrato hexânico (65 observados) de folhas de cana-de-açúcar. Essas análises foram realizadas por GC-MS após sililação das amostras e alicerçadas principalmente na comparação de índices de retenção e espectros de massas experimentais com dados da literatura e de biblioteca de espectros. Algumas propostas foram também reforçadas pela análise do padrão de fragmentação, entre as quais incluem-se séries homólogas de hidrocarbonetos, ácidos e álcoois graxos e alquilresorcinóis, além de esteroides e triterpenos. A identificação de alquilresorcinóis e do triterpeno simiarenol foi confirmada por análise de frações de cera epicuticular por RMN de 1H e 13C. A julgar pelas massas de cada fração obtida no fracionamento da cera epicuticular de folhas, por cromatografia em camada delgada preparativa, e respectivos espectro de RMN de 1H, conclui-se que os constituintes principais da cera são 5-nonadecil resorcinol, heneicosil resorcinol e o triterpeno... / Sugarcane (Sacharam spp.) is a plant of great importance to Brazil, used mainly in the production of sugar and ethanol, but is subject to several diseases, such as those associated with the proliferation of viruses, bacteria and fungi, that compromise productivity and impacting the production of biomass. Studies aimed to establish the correlation between the micromolecula composition and the host / pathogen resistance are underexplored, but may assist in the understanding of these interactions. Therefore, the aim of this study was to analyze and compare the metabolic profiles of epicuticular wax and other lipophilic metabolites from leaves of different varieties of sugarcane by gas chromatography coupled to mass spectrometry (GC-MS). The qualitative analysis resulted in the identification of 58 compounds in epicuticular wax (seen 138) and 41 compounds in the hexane extract (seen 65) of leaves of sugarcane. These analyzes were performed by GC-MS after sample silylation, and the compound identification was grounded mainly on comparison of retention indices and mass spectra with experimental literature data and spectra libraries. Some proposals have also been enhanced by the fragmentation pattern analysis. The identified compounds include homologous series of hydrocarbons, fatty acids, policosanols and alkyl resorcinols, triterpenes and steroids. The identification of alkyl resorcinols and the triterpene simiarenol was confirmed by 1H NMR and 13C. Judging by the masses of fractions obtained from analysis of the epicuticular wax by preparative TLC, and its 1 H NMR spectrum, it was concluded that the main constituents of wax are 5-nonadecyl resorcinol, 5-heneicosil resorcinol and simiarenol. The comparison of the chemical profiles of epicuticular waxes and the hexane extract of leaves from different sugarcane cultivars showed random qualitative and quantitative variations between the samples, but without...