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Identificação de genes candidatos à indução do florescimento em cana-de-açúcar em câmara de fotoperíodo / Identification of candidates genes for flowering induction in sugarcane in photoperiod chamber

Melloni, Maria Letícia Guindalini [UNESP] 15 December 2015 (has links)
Submitted by MARIA LETICIA GUINDALINI MELLONI null (letmell@yahoo.com.br) on 2016-01-14T15:02:04Z No. of bitstreams: 1 Tese_Maria_Letícia_Guindalini_Melloni.pdf: 683985 bytes, checksum: 53424c1e6da45d38a2d516aeb0a405fd (MD5) / Rejected by Juliano Benedito Ferreira (julianoferreira@reitoria.unesp.br), reason: Solicitamos que realize uma nova submissão seguindo as orientações abaixo: A versão do trabalho submetida ao Repositório Institucional UNESP deve conter o texto completo. A Coordenadoria Geral de Bibliotecas se encarregará de disponibilizar apenas o conteúdo parcial que segundo a Portaria UNESP 396 de 10 de setembro de 2015 consiste em: Artigo 3º V - conteúdo parcial: as páginas pré-textuais (a folha de rosto, a dedicatória, os agradecimentos, a epígrafe, o resumo na língua vernácula, o resumo em língua estrangeira, as listas de ilustrações, de tabelas, de abreviaturas, de siglas e de símbolos e o sumário), a introdução, a conclusão ou as considerações finais e as referências do trabalho. Lembrando que: é necessário informar no formulário de submissão que a versão do trabalho a ser disponibilizada deve ser a parcial e indicar em quanto tempo a versão integral deverá ser disponibilizada, ao atingir a data limite o sistema automaticamente disponibilizará a versão completa do trabalho. Caso necessite prorrogar o prazo para disponibilização do texto completo, de acordo com o artigo 6º da Portaria UNESP 396: A data para a disponibilização do conteúdo integral poderá ser prorrogada por até mais 2 (dois) anos mediante a apresentação, via ofício, de justificativa pelo Autor ao programa de pós-graduação com no mínimo 90 (noventa) dias de antecedência à data informada para a disponibilização do conteúdo integral. Agradecemos a compreensão. on 2016-01-18T11:30:25Z (GMT) / Submitted by MARIA LETICIA GUINDALINI MELLONI null (letmell@yahoo.com.br) on 2016-01-18T11:52:00Z No. of bitstreams: 1 Tese_Maria_Letícia_Guindalini_Melloni.pdf: 1866484 bytes, checksum: 4990d42ce801ec4b8fe8d516cb7568d4 (MD5) / Approved for entry into archive by Juliano Benedito Ferreira (julianoferreira@reitoria.unesp.br) on 2016-01-18T13:48:32Z (GMT) No. of bitstreams: 1 melloni_mlg_dr_jabo_par.pdf: 733459 bytes, checksum: d8b36f206c9b78d184a6e2627f86b26d (MD5) / Made available in DSpace on 2016-01-18T13:48:32Z (GMT). No. of bitstreams: 1 melloni_mlg_dr_jabo_par.pdf: 733459 bytes, checksum: d8b36f206c9b78d184a6e2627f86b26d (MD5) Previous issue date: 2015-12-15 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Com o intuito de aumentar o conhecimento da rede gênica envolvida no controle do florescimento em cana-de-açúcar, diferentes cultivares de cana-de-açúcar foram submetidos a tratamentos fotoperiódicos de indução e não indução do florescimento em câmara de fotoperíodo. Aos 5, 10 e 20 dias de indução, a folha +1 e a bainha foliar foram coletadas para a identificação de fragmentos diferencialmente expressos (FDEs) por meio da técnica de cDNA-AFLP entre e dentro dos tratamentos fotoperiódicos. Um total de 162 fragmentos foram selecionados e reamplificados. Destes, 63 FDEs tiveram sucesso na reação de reamplificação e foram clonados e sequenciados. As sequências foram confrontadas com seis bancos de sequências: 1. Transcritos do projeto SUCEST ;2. Proteínas do genoma de sorgo; 3. BAC de cana-de-açúcar; 4. Proteínas do genoma de arroz, 5. Proteínas presentes no Phytozome e 6. NCBI. A busca por similaridade se deu pelo uso da ferramenta BLASTn (e-value 1e-5) nos casos do banco SUCEST e dos BACs de cana-de-açúcar e BLASTx (e-value 1e-5) para os demais bancos. Dentre os 63 FDEs, 23 corresponderam a sequências de genes enquanto os outros 40 representam sequências que não estão depositadas nestes bancos (no hits). A maioria das 23 sequencias apresenta similaridade com genes que codificam proteínas hipotéticas ou preditas em diversos organismos. Com base na análise do domínio da proteína realizada pelo Pfam, seis sequências podem estar associadas ao metabolismo da indução do florescimento. Dentre estas as sequencias LM-19, LM-40 e LM-53 se destacaram. A LM-19 possui similaridade com o gene que codifica uma proteína com o domínio DNAJ sendo que proteína com este domínio é considerada mediador da integração dos sinais do florescimento em Arabidopsis thaliana. LM-40 possui similaridade com o gene que codifica proteína de domínio (F-BOX); estudos indicam forte relação deste domínio aos processos de indução ao florescimento. LM-53 tem um domínio de proteína predita semelhante ao domínio da proteína codificada pelo gene CONSTANS que regula a expressão de FLOWERING LOCUS T (FT), que codifica o florígeno em Arabidopsis thaliana e em algumas outras espécies. De maneira geral, a técnica do cDNA-AFLP foi eficiente, na identificação de FDEs ao longo dos tratamentos fotoperiódicos de indução e não indução do florescimento. Os resultados obtidos sugerem que as sequencias LM-19, LM-40 e LM-53 estão vinculadas aos metabolismos de indução do florescimento. É provável que a maioria dos FDEs obtidos possam estar envolvidos nos metabolismos da indução do florescimento, porém ainda não foram identificados na literatura. / In order to increase the knowledge of the gene network involved in sugarcane flowering induction, sugarcane cultivars were submitted to different photoperiod treatments of flowering induction and non-induction in a photoperiod facility. At 5, 10 and 20 days of induction, the +1 leaf and the leaf sheath were collected for the identification of different transcript-derived fragments (TDFs) within and between the photoperiod treatments to apply the cDNA-AFLP technique. A total of 162 TDFs were selected and re-amplified. Of these, 63 TDFs were successful in re-amplification and were cloned and sequenced. The sequences were confronted against 6 sequence databanks (SUCEST transcripts; Sorghum genome proteins; Sugarcane BACs; proteins from rice genome; Phytozome and NCBI). Similarity search was done by using the BLASTn (e-value 1e-5) tool for the SUCEST databank and sugarcane BACs while BLASTx (e-value 1e-5) was use for the other banks. Among the 63 TDFs, 23 corresponded to gene sequences while the remaining 40 represent sequences that are not deposited in these banks (no hits). The majority of the 23 sequences showed similarity with genes coding for hypothetical or predicted proteins of different organisms. Based on the protein domain analysis conducted by Pfam, six sequences may be associated with flowering induction metabolism. Among these: LM-19, LM-40 and LM-53 sequences stood out. LM-19 has similarity to the gene encoding a protein with DnaJ domain. Proteins having this domain are considered as an integrating floral signals mediator in Arabidopsis thaliana. LM-40 has similarity to the gene encoding a protein with (F-BOX) domain. This domain has a strong relationship in flowering induction processes. LM-53 has one of the predicted protein domain similar to the domain of the protein encoded by the CONSTANS gene which governs the expression of FLOWERING LOCUS T (FT), this later one encodes the florigen. Generally the cDNA-AFLP technique was effective in identifying TDFs across the flowering inductive and non-inductive photoperiodic treatments. The results suggest that LM-19, LM-40 and LM-53 sequences are linked to flowering induction metabolisms. Probably, most of the TDF here obtained may be involved in the flowering induction metabolism, although not yet been identified in the literature. / FAPESP: 2013/24020-0
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Avaliação dos ambientes de proteção da bacia hidrográfica do rio Jundiaí-Mirim/SP / Evaluation of protective environments of Jundiaí-Mirim river basin/SP

Marques, Bruno Vicente [UNESP] 02 February 2016 (has links)
Submitted by BRUNO VICENTE MARQUES (brunovicentemarques@gmail.com) on 2016-04-18T14:10:10Z No. of bitstreams: 1 Avaliação dos ambientes de proteção da bacia hidrográfica do rio Jundiaí Mirim 2016.pdf: 3630730 bytes, checksum: 3a02da506997fdf9c8877c63bc5d66fa (MD5) / Approved for entry into archive by Juliano Benedito Ferreira (julianoferreira@reitoria.unesp.br) on 2016-04-18T15:48:54Z (GMT) No. of bitstreams: 1 marques_bv_me_soro.pdf: 3630730 bytes, checksum: 3a02da506997fdf9c8877c63bc5d66fa (MD5) / Made available in DSpace on 2016-04-18T15:48:54Z (GMT). No. of bitstreams: 1 marques_bv_me_soro.pdf: 3630730 bytes, checksum: 3a02da506997fdf9c8877c63bc5d66fa (MD5) Previous issue date: 2016-02-02 / A ocupação das áreas naturais é produto do crescimento econômico dos municípios e provoca danos irreversíveis ao ambiente, reduz grandes áreas de vegetação em seus biomas a pequenos fragmentos florestais. Esse impacto diminui consideravelmente a qualidade ambiental das bacias hidrográficas, pois a conservação da vegetação para a preservação dos recursos naturais, principalmente da água, é de extrema importância para o amortecimento da pressão das atividades antrópicas. O presente estudo teve como objetivo realizar uma avaliação nos ambientes de proteção da bacia hidrográfica do rio Jundiaí-Mirim, situada entre os municípios de Jundiaí, Jarinu e Campo Limpo Paulista, utilizando a paisagem como fator determinante para sua análise, proporcionando um maior entendimento de seus ambientes de proteção, seu estado atual em função da vulnerabilidade ambiental e da ocupação e uso das terras, possibilitando mensurar quantitativamente e qualificativamente através de um índice de eficiência ambiental da paisagem e classes de tipificação territorial de acordo com o grau de vulnerabilidade ambiental, gerando subsídios consistentes para a elaboração de um plano de gestão ambiental para a área. O trabalho contemplou um plano de amostragem com 91 pontos de coleta de dados na bacia hidrográfica. A avaliação e análise dos dados resultou em um um índice de eficiência ambiental da paisagem médio de 38%, variando entre 23% e 68%. Em uma escala de complexidade frente aos impactos ambientais e considerando como ambientes de proteção os fragmentos florestais, foi possível tipificar a área da bacia hidrográfica em cinco classes de gestão; em que, a Classe E apresenta os níveis mais críticos de qualidade ambiental e de forma crescente, a Classe A os níveis menos críticos. Portanto os resultados mostraram que 11% da área pertence a Classe E, 31% pertence a Classe D, 29% pertence a Classe C, 23% pertence a Classe B e apenas 6% pertence a Classe A. A tipificação das áreas permitiu elaborar um plano de gestão ambiental, com programas e projetos de acordo com os níveis de perturbação e vulnerabilidade ambiental para cada uma das 5 classes em cada uma das 18 sub-bacias. / The occupation of natural areas is the product of economic growth of the cities and causes irreversible damage to the environment, reduces large areas of vegetation to small forest fragments. This impact significantly reduces the environmental quality of river basins, for the conservation of vegetation for the preservation of natural resources, especially water, it is extremely important for the damping pressure of human activities. The study aimed to carry out an assessment in protective environments watershed of Jundiaí-Mirim River, located between the cities of Jundiaí, Jarinu and Campo Limpo Paulista, using the landscape as a determining factor for analysis, providing a better understanding of their protection of environments, its current state as a function of environmental vulnerability and the occupation and use of land, making it possible to measure quantitatively and qualificativamente through an index of efficiency and territorial typing classes according to the degree of apparent environmental vulnerability, generating consistent subsidies the development of an environmental management plan for the area. The work comprises a sampling system with 91 data collection points in the watershed. The evaluation and analysis of the data resulted in an average rate of apparent efficiency of 38% landscape, ranging between 23% and 68%. On a scale of complexity compared to the environmental impacts and considering how the forest fragments protected environment, it was possible to typify the area of watershed management in five classes; in that, the Class E features the most critical levels of environmental quality and increasingly, the Class A the least critical levels. Therefore the results showed that 11% of the area belongs to Class E, 31% belongs to Class D, 29% belong to Class C, 23% belong to Class B and only 6% belong to Class A. The typification of areas allows prepare an environmental management plan, with programs and projects according to levels of nuisance and environmental vulnerability for each of the five classes in each of the 18 sub-basins.
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Flora e distribuição ecológica de comunidades de macroalgas lóticas de fragmentos florestais da região noroeste do estado de São Paulo

Almeida, Fernanda Vital Ramos de [UNESP] 02 March 2010 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:23:03Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2010-03-02Bitstream added on 2014-06-13T18:50:15Z : No. of bitstreams: 1 almeida_fvr_me_rcla.pdf: 5323757 bytes, checksum: 55eb2e9b9c051e2271a31350a6e1ee7e (MD5) / Vários estudos envolvendo flora e distribuição de comunidades de macroalgas lóticas já foram desenvolvidos na região noroeste do estado de São Paulo; entretanto, nunca foi realizada qualquer abordagem sobre macroalgas lóticas em fragmentos florestais remanescentes, aspecto mais relevante deste estudo. Foram testadas as seguintes hipóteses: (1) entre as regiões/biomas estudados no estado de São Paulo, o atual trabalho deve apresentar maior similaridade florística com Floresta Tropical, por ser mais próxima e composta também por Floresta Estacional Semidecidual; (2) características intrínsecas de cada corpo d’água devem exercer maior influência na riqueza e abundância das comunidades de macroalgas do que parâmetros mais gerais de cada fragmento, como forma, tamanho e matriz adjacente, e da ordem de grandeza do riacho e sua respectiva bacia de drenagem. Este trabalho teve como objetivo geral realizar o levantamento florístico e analisar a distribuição ecológica das comunidades de macroalgas lóticas de fragmentos florestais remanescentes de Floresta Estacional Semidecidual da região noroeste do estado de São Paulo (20o00’13”-21o37’14”S, 48o32’26”- 50o26’02”O). Foram amostrados 17 riachos pertencentes a 12 fragmentos, no intervalo de junho a agosto de 2007 e 2008, período mais favorável para a região (estação seca). Foram identificadas 16 espécies de macroalgas, pertencentes a 14 gêneros. A maioria das espécies (69%) foi encontrada em um único ponto. Cyanophyta e Chlorophyta foram os grupos predominantes (44 e 37,5%), seguidos por Rhodophyta (12,5%) e Heterokontophyta (6%). Phormidium retzii (Cyanophyta) foi a espécie mais frequente, ocorrendo em seis pontos de amostragem. Apenas duas espécies representaram novos registros para a região: Trichocoleus sociatus (Cyanophyta) e Vaucheria pseudogeminata (Heterokontophyta); a última representa... / Several studies involving the flora and distribution of lotic macroalgal communities have been carried out in the northwest region of São Paulo State, southeastern Brazil. However, the lotic macroalgae in remnant forest fragments have never been studied, the most relevant aspect of this study. The following hypotheses have been tested: 1) among the biomes/regions previously studied in São Paulo State, the flora of the northwest region is expected to reveal the highest floristic similarity with the Tropical Forest, since it is the nearest biome and also composed by semidecidual seasonal forest; 2) particular characteristics of each water body are expected to be more influential on the species richness and abundance of macroalgal communities than more general parameters of each forest fragment, such as surrounding matrix, stream order and position in the respective drainage basin. This study aimed at surveying the flora and describing the ecological distribution the of lotic macroalgal communities from remnant forest fragments composed of semidecidual seasonal forest in the northwest region of São Paulo State (20o00’13”-21o37’14”S, 48o32’26”-50o26’02”O). 17 streams were sampled in 12 forest fragments from June to August of 2007 and 2008 during the typical most favorable period in the region (dry season). 16 species have been surveyed, belonging to 14 genera. 69% of species were found in a single site. Cyanophyta and Chlorophyta were the predominant algal groups (44 amd 37.5%), followed by Rhodophyta (12.5%) and Heterokontophyta (6%). Phormidium retzii (Cyanophyta) was the most frequent species, occurring in six sampling sites. Only two species were new records for the region: Trichocoleus sociatus (Cyanophyta) and Vaucheria pseudogeminata (Heterokontophyta); the later represents the first report for Brazil. The regional flora was more similar (nine species in common, 56%)... (Complete abstract click electronic access below)
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Contribuição ao conhecimento dos Metopiinae (Hymenoptera, Ichneumonidae) do Brasil, com ênfase em ambientes de mata e cerrado da Bacia Hidrográfica do Rio Mogi-Guaçu

Araújo, Carolina Rodrigues de 29 August 2011 (has links)
Made available in DSpace on 2016-06-02T19:29:35Z (GMT). No. of bitstreams: 1 3696.pdf: 5138781 bytes, checksum: bf8fe9db814dbf3d7dddcfacdc47515e (MD5) Previous issue date: 2011-08-29 / Financiadora de Estudos e Projetos / ABSTRACT This study aimed to contribute to the knowledge of the Brazilian fauna of Metopiinae through the characterization and quantification of their genus and species in areas of semideciduous forest and savanna in Mogi-Guaçu River Basin, located in Minas Gerais and São Paulo. Malaise traps were installed in 10 sampling points located in six localities along the entire basin, during August 2009 to September 2010. It was collected 195 specimens of Metopiinae, distributed in 41 taxa (34 species- with seven new species-, and seven "close species") among then we found 15 new records for the Brazilian fauna (14 species and one genus). The species Exochus izbus Gauld & Sithole, 2002 and Exochus sp. n. 1 were more abundant and had better distribution, being found in five and six fragments, respectively. The sampling points relating to the localities of Andradas-MG and Luiz Antônio-SP had higher abundance and greater species richness of Metopiinae. The sampling points relating to Bom Repouso-MG (sampling point II: Boa Vereda de Cima) and Jacutinga-MG (Morro da Forquilha) had considerable richness of species and highest values of diversity and evenness. The sampling points of Luiz Antônio-SP, analyzed separately due to sampling differences, also had high diversity index and evenness, and the area of riparian forest had the highest richness and abundance of Metopiinae. The fragments with more faunistic similarity were sampling point I (Serra dos Garcias) and III (Damásio district), both in Bom Repouso-MG, with 70% of similarity. It was found that Metopiinae are more abundantly collected in the rainy season, confirming the relationship between abundance and seasonality. Descriptions of new species, the characterization of other species and more information about geographical distribution of Metopiinae were other important contributions of this work. / Este trabalho buscou contribuir para o conhecimento da fauna brasileira de Metopiinae através da caracterização e quantificação dos seus gêneros e espécies em áreas de floresta estacional semidecidual e cerrado localizados na Bacia do Rio Mogi-Guaçu nos Estados de Minas Gerais e São Paulo. A amostragem foi realizada através de armadilhas Malaise instaladas em 10 pontos amostrais localizados em 6 municípios ao longo de toda a Bacia Hidrográfica, durante o período de agosto de 2009 a setembro de 2010. Foram coletados 195 exemplares de Metopiinae, distribuídos em 41 táxons (34 espécies, sendo sete novas, e sete espécies próximas ) e com a constatação de 15 novos registros para a fauna brasileira (14 espécies e 1 gênero). Exochus izbus Gauld & Sithole, 2002 e Exochus sp. n. 1 foram as mais abundantes e com melhor distribuição, sendo encontradas em cinco e seis fragmentos, respectivamente. Os pontos amostrais referentes aos municípios de Andradas-MG e Luiz Antônio-SP apresentaram altos valores de abundância e riqueza de espécies de Metopiinae. Os pontos amostrais referentes à Bom Repouso (ponto II: Boa Vereda de Cima) e Jacutinga-MG (Morro da Forquilha), além de apresentarem riqueza considerável de espécies, apresentaram os maiores valores de diversidade e equitabilidade. Os pontos amostrais de Luiz Antônio-SP, analisados separadamente devido à diferenças amostrais, também apresentaram alto índice de diversidade e equitabilidade, e a área relativa à mata ciliar apresentou maior riqueza e abundância de Metopiinae coletados. Os pontos amostrais com maior similaridade faunística foram o ponto I (Serra dos Garcias) e o ponto III (Bairro Damásios), ambos no município de Bom Repouso-MG, com similaridade de 70%. Foi constatado que os Metopiinae são mais abundantemente coletados na estação chuvosa, confirmando a relação entre abundância e sazonalidade. As descrições das espécies novas, a caracterização das demais e a ampliação das informações sobre distribuição geográfica dos Metopiinae foram outras importantes contribuições desse trabalho.
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Representatividade ambiental e fragmentação florestal em áreas dominadas por plantios homogêneos: uma proposta para o arranjo espacial de fragmentos florestais / Environmental representativeness and forest fragmentation in areas dominated by eucalyptus plantations: a proposal for the spatial arrangement of forest fragments

Sarcinelli, Tathiane Santi 08 May 2006 (has links)
Made available in DSpace on 2015-03-26T13:53:34Z (GMT). No. of bitstreams: 1 01 - capa_introducao geral.pdf: 60250 bytes, checksum: e14c387e20baf41c54bbdb10f1af0751 (MD5) Previous issue date: 2006-05-08 / Fibria Celulose S.A. / This work presents a landscape study in areas dominated by eucalyptus plantations and native forest. The objectives were to evaluate the spatial configuration and the physiographic and pedologic heterogeneity of native forest fragments, aiming to establish scenarios of arrangement of these fragments that maximize the environmental representativeness of the landscape. Hence, the study was designed to preserve the maximum diversity of fauna and flora, given the scarcity of low-cost and easy-handling scientific methodologies to allocate reserves which effectively represents all environmental diversity. The hypotheses tested were: (i) fragments of native forest are not randomly distributed and may not be representative of all landscape diversity; (ii) the judicious allocation of reserves can improve the environmental representativeness. The Chi-Square test returned significant values for all the soil and physiographic characteristics analyzed in all projects at 5% of probability level, implying that the distribution of the native forest areas is not random, depending on physiography and soil characteristics. In general, native forests are mainly associated with lower areas, areas of steep slopes, fluvial terraces and plains, concave slopes and slopes oriented to the South and Southeast, shallow Haplic or Fluvic Cambisols and Lithic Neosols. Fragments were observed to be elongated, following drainage lines, allowing in some cases connectivity between other fragments. As a general rule, the major fragments were those that possess more irregular shapes, due to drainage orientation. The program allowed the allocation or withdrawal of reserves in the borders with native forest, as well as the allocation of them anywhere in the eucalyptus plantation area, aiming to decrease the discrepancy between the expected and observed native forest in the soil and physiographic characteristics analyzed and thence optimizing the environmental representativeness. The scenarios without border restriction caused the occurence of elongated fragments with lower core areas. The proposed scenarios help the decision making process related to the definition of priority areas to conservation purposes in the real context of native forest fragments distribution, representing all environmental representativeness. / Este trabalho apresenta um estudo da paisagem de áreas florestais dominadas por plantios homogêneos de eucalipto e florestas nativas. Os objetivos foram avaliar a configuração espacial e a heterogeneidade fisiográfica e pedológica de fragmentos florestais nativos e estabelecer cenários de arranjo destes fragmentos de forma a maximizar a representatividade ambiental da paisagem e com isso as chances de preservação do mais vasto espectro possível da fauna e flora, tendo em vista a escassez de metodologias científicas para alocação de áreas para preservação de fácil implementação, baixo custo e que maximizem a representatividade da diversidade ambiental da paisagem. As hipóteses testadas foram: (i) a distribuição dos fragmentos de floresta nativa é não aleatória, podendo não representar toda a diversidade ambiental da paisagem; (ii) a alocação criteriosa de áreas de Reserva Legal pode melhorar a representatividade ambiental. O teste de Qui-Quadrado retornou valores significativos para todas as características de relevo e solos analisadas ao nível de 5% de probabilidade, denotando que a distribuição dos remanescentes de floresta nativa é não-aleatória, dependendo das características fisiográficas e pedológicas analisadas. Em linhas gerais, as florestas nativas encontram-se associadas principalmente a áreas mais baixas, mais declivosas, a terraços e planícies fluviais, encostas côncavas, encostas voltadas para o S e SE, Neossolos Litólicos, Cambissolos Háplicos mais rasos e Cambissolos Flúvicos. Observaram-se fragmentos de floresta nativa muito alongados, localizados principalmente ao longo dos cursos d água, proporcionando em alguns casos conexão entre outros fragmentos. Como regra geral, os maiores fragmentos são os que possuem áreas mais irregulares, justamente pelo fato destes acompanharem a drenagem. O algoritmo elaborado para geração de cenários oferece a opção de se alocar Reservas Legais nas bordas de florestas nativas já existentes, da mesma forma que retirá-las nas bordas, ou apenas adicioná-las em qualquer local dentro dos eucaliptais, proporcionando a diminuição na discrepância entre o esperado e o observado de florestas nativas nas características de relevo e solos analisadas e assim otimizando a representatividade ambiental. Observou-se que os cenários sem restrição de borda ocasionaram o aparecimento de fragmentos mais alongados e com menores áreas centrais que aqueles de alocação restrita à borda. Os cenários propostos podem auxiliar a tomada de decisão na definição de áreas prioritárias para conservação no contexto atual de distribuição dos fragmentos de floresta nativa tomando por base a representatividade ambiental da paisagem.
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Repertório vocal e variações no canto de Basileuterus spp. (Passeriformes, Parulidae) em fragmentos de mata (Uberlândia, MG) / Vocal repertoire and song s variation in Basileuterus spp. Wood Warbler (Passeriformes, Parulidae) in forest fragments (Uberlândia, MG)

Carvalho, Liliane Souza Dantas de 09 March 2010 (has links)
Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado de Minas Gerais / Bird s vocalization is directly related with vital behaviors. Some species are very sensitive to changes in sound characteristics of vocalizations. The Oscine Passerines, because they have more complex syrinx and vocal learning capacity, are one of the group with higher possibility of present variation in their voice. This study selected three sympatric and partially syntopic of Oscine Passerines, Parulidae: Flavescent Warbler (Basileuterus flaveolus), White-bellied Warler (B. hypoleucus) and White-striped Warbler (B. leucophrys) aiming to characterize the vocal repertoire of Basileuterus spp., and whether these species alter the vocal parameters of their songs with the factors seasonality, distribution of fragments and the environmental noise. The study was conducted in Uberlândia, MG, in fragments of semideciduous forest in the Cerrado. In characterizing the vocal repertoire and to verify the effect of seasonality, was analyzed recordings made in the dry and rainy, and the other studies, was analyzed the data of the rainy season. In the analysis of vocal variation, we used only the songs, because of its importance to reproduction. The parameters tested were number of notes, duration of song, lowest and highest frequency, frequency range, peak-frequency and song rate. The vocal repertoire was varied among the species studied, B. flaveolus repertoire has one song and one call and B. hypoleucus repertoire has one song and three calls. Basileuterus leucophrys repertoire was the largest and most complex, with two songs and nine calls, including some simultaneous emission of sounds with different characteristics originating on either side of the syrinx (two-voice). Most of the vocal parameters of each species are similar to reviously in the literature to the microhabitats occupied by them. All species altered their vocalizations according to factors established and showed characteristic songs for each level of the factors tested. Thus, is possible to conclude that the three species of Basileuterus spp. have vocal repertoire of varied size and complexity, and in front of natural and antropogenic factors, these species are able to vary their vocalizations. / A comunicação vocal das aves está diretamente relacionada com comportamentos vitais. Com isso, algumas espécies mostram-se extremamente sensíveis às alterações nas características sonoras das vocalizações. Passeriformes Oscines, por possuírem siringe mais complexa e capacidade de aprendizagem vocal, são o grupo com maior condição de apresentar variações vocais. Neste estudo foram escolhidas três espécies simpátricas e parcialmente sintópicas de Passeriformes Oscines, Parulidae: Basileuterus flaveolus, B. hypoleucus e B. leucophrys, com o objetivo de caracterizar o repertório vocal destes Basileuterus spp., e verificar se essas espécies alteram os parâmetros vocais de seus cantos devido aos fatores sazonalidade, distribuição entre fragmentos e maior intensidade de ruído ambiental. O trabalho foi realizado no município de Uberlândia, MG, em fragmentos de floresta estacional semidecidual no bioma Cerrado. Para a caracterização do repertório vocal e verificar o efeito da sazonalidade, foram analisadas gravações feitas nas estações seca e chuvosa e para os demais estudos, foram analisados os dados da estação chuvosa. Nas análises de variação vocal, foram utilizados apenas os cantos, devido sua importância reprodutiva. Os parâmetros testados foram o número de notas, a duração do canto, a menor e a maior frequência, a amplitude de frequência, a máxima frequência e a taxa de emissão de notas. O repertório vocal foi bastante variado entre as espécies estudadas, B. flaveolus apresentou um tipo de canto e um tipo chamado e B. hypoleucus apresentou um tipo de canto e três tipos de chamados. Basileuterus leucophrys foi o que teve o maior e mais complexo repertório, com dois tipos de cantos e nove tipos de chamados. Essa maior complexidade deveu-se a emissão simultânea de sons com características distintas, originários de cada lado da siringe (two-voice), tanto para os dois tipos cantos quanto para alguns tipos de chamados. Foi possível verificar que a maioria dos parâmetros vocais de cada espécie, se assemelha aos padrões pré-estabelecidos pela literatura, para os microhabitats ocupados por elas. Todas as espécies alteraram suas vocalizações diante dos fatores sazonalidade, distribuição entre fragmentos e intensidade do ruído ambiental ao ponto de apresentarem cantos característicos para cada nível dos fatores testados. Com isso, é possível concluir que as três espécies de Basileuterus, têm repertório vocal de variado tamanho e complexidade e que diante de fatores naturais e antrópicos, essas espécies são capazes de variar suas vocalizações. / Mestre em Ecologia e Conservação de Recursos Naturais
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"O uso de técnicas de play-back no desenvolvimento de um método capaz de atestar a presença ou ausência de aves no interior de fragmentos florestais" / Using playback techniques to develop a method able to attest the presence or absence of birds inside forest fragments

Danilo Boscolo 01 July 2002 (has links)
Nosso objetivo foi desenvolver um método para atestar a presença ou ausência de seis espécies de aves (Basileuterus leucoblepharus, Batara cinerea, Carpornis cucullatus, Chiroxiphia caudata, Pyriglena leucoptera e Trogon surrucura) em fragmentos florestais. Foi determinado o horário do dia e época do ano em que o play-back é mais eficiente em atestar a presença dessas aves. Os testes ocorreram na Reserva Florestal do Morro Grande (Cotia, SP). Três horários foram testados (manhã, meio do dia e tarde) ao longo de um ano. O teste G verificou a variação de eficiência entre os diferentes horários, e o teste de Rayleigh a variação anual. A manhã e o meio do dia apresentaram-se mais eficientes que a tarde para B. leucoblepharus, C. caudata e T. surrucura. A única ave a apresentar uma época do ano mais eficiente foi B. cinerea. Para avaliar sua eficiência, a capacidade do método em atestar a presença das aves em 13 fragmentos foi correlacionada com sua abundância nos mesmos. Os testes ocorreram quatro vezes em cada área nos momentos de maior eficiência. Os resultados indicam que C. caudata seja recenseada pelo menos duas vezes por fragmento. Três visitas é o mínimo para B. cinerea, B. leucoblepharus, P. leucoptera e T. surrucura. Para C. cucullatus deve-se ser repetir quatro vezes. O método foi criado para gerar rapidamente dados de presença e ausência em grande quantidade de fragmentos. Essa informação pode auxiliar estudos sobre dinâmica de metapopulações destas espécies. / In order to provide rapid access to presence/absence data of six species of birds (Basileuterus leucoblepharus, Batara cinerea, Carpornis cucullatus, Chiroxiphia caudata, Pyriglena leucoptera and Trogon surrucura) inside forest fragments, an efficient playback method was developed. The broadcast of these birds’ vocalizations was carried out at the Morro Grande Forrest Reserve (Cotia, SP). Playback tests were executed three times a day (sunrise, noon and before sunset) during one year. Daily and seasonal variations in the efficiency of the play-back were tested with G-statistics and the Rayleigh test. Sunrise and noon were more efficient than the period before sunrise to B. leucoblepharus, C. caudata and T. surrucura. The only species to show an annual period of higher rate of response was B. cinerea. To evaluate the real efficiency of the method, 13 forest fragments were surveyed for presence of these birds. The data was compared to the abundance of the birds in these areas. Each fragment was surveyed four times. At least two surveys are needed for C. caudata. Three surveys are the minimum effort to access the distributional pattern of B. leucoblepharus, B. cinerea, P. leucoptera and T. surrucura. Due to its rarity, C. cucullatus must be censused not less than four times. The method developed in the current study was created to provide a rapid access to the patch occupancy patterns of these six species in a large number of fragments. That kind of data may be very useful in studies about metapopulation dynamics and conservation ecology.
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Estudo temporal dos fragmentos florestais urbanos por meio das ferramentas geotecnológicas: o caso da cidade de Manaus, Amazonas

Alves, Jhones Lemos 13 June 2011 (has links)
Submitted by Geyciane Santos (geyciane_thamires@hotmail.com) on 2015-07-27T14:55:13Z No. of bitstreams: 1 Dissertação - Jhones Lemos Alves.pdf: 11617386 bytes, checksum: 3307d34f9f7271510b433bfbcaa6725b (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2015-07-28T15:02:34Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação - Jhones Lemos Alves.pdf: 11617386 bytes, checksum: 3307d34f9f7271510b433bfbcaa6725b (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2015-07-28T15:05:46Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação - Jhones Lemos Alves.pdf: 11617386 bytes, checksum: 3307d34f9f7271510b433bfbcaa6725b (MD5) / Made available in DSpace on 2015-07-28T15:05:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertação - Jhones Lemos Alves.pdf: 11617386 bytes, checksum: 3307d34f9f7271510b433bfbcaa6725b (MD5) Previous issue date: 2011-06-13 / FAPEAM - Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas / This essay had as main goal to make the temporal study of urban forest fragments in Manaus to support future management programs being implemented by the municipal government. It was used satellite images from Quickibird (2005 and 2007) and Landsat 5 (2010) softwares. With the support of geotechnological tools it was performed vectorization of these selected fragments with an area above 01 ha and / or those that could be viewed. Calculations of areas of the fragments (spatial distribution, fragmentation level and Index of fragment areas) were performed individually for three periods. The analysis of the comparison was made between the periods of follows: i) between 2005 and 2007, between 2007 and 2010 and between 2005 and 2010. Through the presented results it was verified that Manaus during the course of five years decreased by 2210 hectares the area of fragments existing within the city limits on the amount of 87 fragments and content areas (iaf) in 27.22 m2/inhabitant. These results show the need for government to set policies to the preservation of urban forest fragments that still exist, especially in city areas with lower level of distribution space. / Este trabalho teve como objetivo realizar o estudo temporal dos fragmentos florestais urbanos da cidade de Manaus para subsidiar ações futuras de gestão a ser implementadas pelo poder público municipal. Foram utilizadas imagens dos satélites Quickibird (2005 e 2007) e landsat 5 (2010). Com o apoio de ferramentas geotecnológicas foi realizada a vetorização dos fragmentos sendo selecionados aqueles com área acima de 01 hectare e/ou aqueles que pudessem ser visualizados. Os cálculos das áreas dos fragmentos (distribuição espacial, nível de fragmentação e índice de áreas de fragmentos) foram realizados individualmente para os três períodos. A análise da comparação entre os períodos foi realizada da seguinte maneira: i) entre 2005 e 2007; entre 2007 e 2010 e; entre 2005 e 2010. Por meio dos resultados apresentados verificou-se que Manaus durante o ciclo de cinco anos reduziu em 2.210 hectares a área de fragmentos existentes no perímetro urbano, em 87 a quantidade de fragmentos e o índice de áreas (iaf) em 27,22 m2/habitante. Pelos resultados ficou evidente a necessidade do poder público definir políticas para a preservação desses fragmentos de florestas urbanas ainda existentes, principalmente nas zonas da cidade com menor nível de distribuição espacial.
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Biomassa de raízes em ilhas de mata de savanas de Roraima: efeito da dimensão do fragmento, distribuição espacial e variáveis edáficas

Maryory Medina Turcios 26 February 2015 (has links)
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Biomassa de raízes em sistemas florestais dispersos nas matrizes de savana da Amazônia é pobremente estudada e indiretamente calculada dentro do Inventário Nacional sobre fontes e reservatórios de carbono do Brasil. O objetivo do estudo foi estimar a biomassa de raízes em ilhas de mata dispersas na savana de Roraima levando em consideração o efeito da dimensão destes fragmentos florestais, distribuição espacial (borda e interior) e das variáveis edáficas como fontes de variação da biomassa. A amostragem foi desenvolvida em 12 ilhas de mata distintas por categorias de dimensão (pequenas ≤ 10 ha, médias = 1020 ha, grandes = 20-60 ha) e pela borda e interior do fragmento. Tradagens de solo (1 m de profundidade) foram realizadas de forma equidistante ao longo de transectos estabelecidos no sentido norte sul em cada ilha. Todas as raízes com diâmetro ≥ 2 mm foram triadas manualmente a intervalos de 10 cm no perfil vertical do solo e transformadas em massa por unidade de área. Foram realizadas análises químicas e físicas do solo a cada intervalo de 10 cm. A análise dos dados foi realizada através de ANOVA, teste t e regressão linear. A biomassa de raízes não diferiu em relação a dimensão dos fragmentos (38,8 22,4 Mg ha-1 de média geral). No entanto, a média das bordas (37,6 19,6 Mg ha-1) foi distinta do interior (23,3 24,4 Mg ha-1), independente da dimensão das ilhas, sugerindo ser afetada por diferenças florísticas e estruturais entre a borda e o interior. Apenas 50% da variação da biomassa de raízes ao longo do perfil vertical (0-1 m) foram explicados pelas variáveis edáficas devido à uniformidade química e física dos solos amostrados. A maior concentração de raízes foi registrada entre 0-30 cm (finas = 32,8%, médias = 55,9% e grossas = 11,3%), não sendo observadas diferenças entre as dimensões dos fragmentos neste intervalo de profundidade. O valor médio da razão root:shoot nas ilhas amostradas foi de 0,40 0,28 no perfil de 0 a 1 m de profundidade A conclusão do estudo é que biomassa de raízes em fragmentos florestais dispersos na savana de Roraima não é afetada pela dimensão dos fragmentos, mas é distinta entre borda e interior das ilhas, podendo ser explicada pelas diferenças na estrutura e composição florística entre borda e interior. / Root biomass in forest ecosystems scattered in Amazonian savanna matrix is poorly studied and indirectly calculated within the National Inventory of carbon sources and reservoirs in Brazil. The goal of the study is to estimate root biomass in forest islands dispersed in Roraima savanna taking into account the size effect of these forest fragments, spatial distribution (edge and interior) and edaphic variables as biomass sources of variation. Sampling was conducted in 12 different forest islands by size categories (small ≤10 ha, medium = 10-20 ha, large = 20-60 ha) and the edge and the forest interior. Soil samples (1 m deep) were performed at equal distances along transects established in the north - south direction on each forest island. All root diameter ≥ 2 mm were manually screened at intervals of 10 cm in the soil vertical column and converted in mass per unit area. Chemical and physical soil analyzes were made in each10 cm interval. Data analysis was performed using ANOVA, t test and linear regression. The average root biomass did not differ in the size of fragments, resulting in 38.8 22.4 t ha-1 as the overall mean for all fragments. However the edge mean (37.6 19.6 t ha-1) was distinct from the interior (23.3 24.4 t ha-1), regardless of the size of the islands, suggesting that it is affected by floristic and structural distinctions between the edge and the interior. Only 50% of the variation in root biomass along the vertical profile (0-1 m) were explained by the soil characteristics due to chemical and physical uniformity of the sampled soils. The highest concentration of roots was recorded between 0-30 cm (fine = 32.8%, medium = 55.9% and coarse = 11.3%), with no differences between the sizes of the fragments in this depth range. The ratio root: shoot in the sampled forest islands was 0.40 0.28 (0-1 m deep). The conclusion is that root biomass in forest fragments dispersed in Roraima savannah is not affected by the size of the fragments, but is distinct between edge and interior of the islands, which can be partially explained by differences in the structure and floristic composition between edge and interior.
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Manejo de lianas em bordas de floresta estacional semidecidual e de cerradão, Santa Rita do Passa Quatro, SP / Management of lianas in semideciduous forest and cerradão edges, Santa Rita do Passa Quatro, SP

Sônia Maria Schaefer Jordão 03 February 2010 (has links)
No Estado de São Paulo, dentro de uma mesma zona climática, a floresta estacional semidecidual e o cerradão são comumente encontrados dividindo o espaço. Atualmente, essas duas formações encontram-se reduzidas a pequenos fragmentos florestais, em estágio avançado de perturbação. Com a fragmentação da floresta, há um aumento da luminosidade nas bordas dos remanescentes florestais e lianas heliófitas podem aumentar suas populações e competir vigorosamente com as espécies arbustivo-arbóreas. O objetivo desse estudo foi verificar o efeito do manejo das lianas sobre o processo de restauração florestal em bordas perturbadas de floresta estacional semidecidual e de cerradão. Também foi analisada a influência do tipo de vizinhança sobre a borda florestal e sobre os resultados do manejo. O experimento foi instalado na região de Santa Rita do Passa Quatro, SP, em bordas de floresta estacional semidecidual, com vizinhanças de cana-de-açúcar e rodovia e em bordas de cerradão, com vizinhanças de eucalipto, cana-deaçúcar e rodovia. O delineamento experimental foi de blocos casualizados, com parcelas de 100m2 e 3 repetições. Nas bordas de floresta estacional semidecidual foram testadas 3 técnicas de manejo: corte de lianas (C), corte de lianas + revolvimento do solo (CR) e corte de lianas + plantio de espécies arbóreas nativas (CP). Nas bordas de cerradão foram testadas 2 técnicas de manejo: corte de lianas (C) e corte de lianas + revolvimento do solo (CR). Para análise do processo de restauração florestal, foram avaliados o crescimento médio em altura e diâmetro das espécies arbustivoarbóreas, a mortalidade média e o número médio de indivíduos ingressantes no estrato arbustivoarbóreo, a chuva de sementes e a mortalidade média e o número médio de indivíduos ingressantes no estrato da regeneração. Nas duas formações florestais, verificou-se uma diminuição na riqueza de espécies arbustivo-arbóreas e no número de árvores de maior porte, no sentido das bordas com vizinhança de eucalipto, para as bordas com vizinhanças de cana-de-açúcar e rodovia, respectivamente. Tanto nas bordas de floresta estacional semidecidual, quanto de cerradão, os resultados do manejo das lianas foram influenciados pelo grau de infestação por lianas, pela estrutura da vegetação recém manejada, pelas espécies presentes e pela vizinhança do fragmento florestal. Embora na maioria dos casos as diferenças não tenham sido significativas, efeitos positivos do corte das lianas foram observados para o crescimento médio em altura ou diâmetro dos indivíduos, principalmente nas áreas mais infestadas. No entanto, nas bordas com vizinhança de rodovia, o corte das lianas pode intensificar os efeitos de borda, a ponto de prejudicar o ingresso das espécies arbustivo-arbóreas no estrato da regeneração. Nas bordas de floresta estacional semidecidual, o corte das lianas não será suficiente para promover a recuperação da fisionomia florestal, pois os indivíduos presentes sob as lianas correspondem a espécies de subbosque, sendo necessário o enriquecimento das bordas com espécies de dossel. Nas duas formações florestais, o revolvimento superficial do solo não favoreceu a regeneração das espécies arbustivo-arbóreas. / In São Paulo state, throughout the same climatic zone, semideciduous forests and cerradão patches commonly share the same geographic area. Currently, these two formations are reduced to small fragments, in advanced stage of disturbance. Along with the fragmentation of the forest, there is an increase in ligth incidence at the edges and lianas generally increase their populations, competing vigorously with trees and shrubs species. The objective of this study was to verify the effect of management of lianas on the processe of restoration of forest physionomy in disturbed edges of semideciduous forest and cerradão. It was also analyzed the influence of matrix on the edge of forests and the results of liana removal management. The experiment was installed in Santa Rita do Passa Quatro, SP, on the edges of semideciduous forest fragments surrounded by sugar cane and roads, and cerradão fragments bordered by eucalyptus plantations, sugar cane and roads. The experimental design was randomized with blocks of plots of 100m2 and 3 replications. At the edges of semideciduous forest three techniques of management were tested: cutting of lianas (C), cutting of lianas + revolving surface soil (CR) and cutting of lianas + planting of native tree species (CP). On the edges of cerradão two management alternatives were tested: cutting of lianas (C) and cutting of lianas + revolving surface soil (CR). To analyze the process of restoration of forest physionomy, we assessed the average growth in height and diameter of tree and shrub species, the average mortality and average number of individuals entering the tree stratum, the rain seed, the average mortality and the average number of individuals entering the stratum of regeneration. In both forests, there was a decrease in the richness of tree and shrub species and the number of larger trees from areas surrounded by eucalyptus to areas in a matrix of sugar cane and road. The results of lianas management, both on semideciduous forest and cerradão, were influenced by the degree of infestation, by the structure of vegetation recently managed, by the species composition and by the nature of surrounding matrix. Although in most cases the differences were not significant, positive effects of cutting lianas were observed on the average growth in height or diameter of the individual, mainly in the most infested areas. However, when the edges are contiguous to roads, lianas removal may intensify edge effects, as to disturb the number of individuals entering the stratum of regeneration. On semideciduous forests, cutting the lianas on the edges alone will not be enough to promote the recovery of the forest structure, because individuals providing support for lianas are understory species, being necessary the enrichment of the edges with the tree canopy species. In both forests, the revolving surface soil did not favor the regeneration of arbustive-arboreal species.

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