Orientador: Edson Luiz Furtado / Resumo: A seringueira (Hevea brasiliensis) é a terceira cultura florestal mais plantada no Brasil, e o estado de São Paulo é responsável por mais de 60% da produção de látex do país. É uma espécie nativa da região amazônica que possui hábito caducifólio, e durante o período de reenfolha é suscetível ao ataque de fitopatógenos foliares, que prejudicam e até limitam seu estabelecimento em determinadas regiões. Dentre os principais patógenos foliares da seringueira, destacam-se os fungos causadores de oídios, microrganismos biotróficos que infectam tecidos jovens, e podem causar desfolha, principalmente em condições de viveiro e jardim clonal. O agente causal do oídio da seringueira é descrito como Erysiphe quercicola, porém, devido a insuficientes descrições taxonômicas, morfológicas e moleculares desta doença, seu agente causal permanece em discussão, além da fase sexual deste patógeno carecer de qualquer registro neste hospedeiro. Portanto, o objetivo deste trabalho é caracterizar o oídio da seringueira, utilizando caracterizações morfológicas, análises moleculares e testes de patogenicidade. No período de julho a dezembro de 2019, foram coletadas amostras foliares de seringueira em diferentes estágios fenológicos infectadas com oídio na região de Botucatu, São Paulo. Para a caracterização morfológica, foram registradas e mensuradas características das hifas, conídios e conidióforos, que correspondem à fase assexuada do fungo. A caracterização molecular foi realizada através de análi... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Rubber tree (Hevea brasiliensis) is the third most planted forest crop in Brazil, and the state of São Paulo is responsible for more than 60% of the country's latex production. It is a species native to the Amazon region that has a deciduous habit, and during the re-leafing period it is susceptible to the attack of leaf phytopathogens, which harm and even limit its establishment in certain regions. Among the main leaf pathogens of the rubber tree, there are the fungi that cause powdery mildew, biotrophic microorganisms that infect young tissues, and can cause defoliation, especially in nursery and clonal garden conditions. The causal agent of rubber mildew is described as Erysiphe quercicola, however, due to insufficient taxonomic, morphological and molecular descriptions of this disease, its causal agent remains under discussion, in addition to the sexual phase of this pathogen lacking any record in this host. Therefore, the objective of this work is to characterize powdery mildew mildew, using morphological characterizations, molecular analyzes and pathogenicity tests. From July to December 2019, leaf samples of rubber trees were collected at different phenological stages infected with powdery mildew in the Botucatu region, São Paulo. For morphological characterization, characteristics of hyphae, conidia and conidiophores, which correspond to the asexual phase of the fungus, were recorded and measured. Molecular characterization was performed through phylogenetic analyzes o... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Orientador: Nilton Luiz de Souza / Banca: Edson Luiz Furtado / Banca: Marli Teixeira de Almeida Minhoni / Banca: Luiz Eduardo Aranha de Camargo / Banca: Eiko Kuramae / Resumo: Rhizoctonia solani Kuhn (teleomorfico: Thanatephorus cucumeris (Frank) Donk) e um fungo basidiomycota, fitopatogeno anamorfico com uma ampla gama de hospedeiros, incluindo mais de 500 generos de plantas. Causam doencas em varias culturas importantes no mundo, infectando sementes, raizes, folhas, hastes e frutos. A diversidade genetica de 274 isolados de Rhizoctonia spp. coletados, em diversas partes do mundo, foram caracterizados utilizando-se a analise de sequencia da regiao ITS1-5.8S rDNA-ITS2, para avaliar o grau de variabilidade genetica dentro e entre grupos de anastomose (AGs), incluindo os isolados padroes dos respectivos AGs. A arvore filogenetica gerada pela analise das sequencias da regiao ITS foi suportada por 66% gbootstraph para a separacao em nove maiores grupos. De maneira geral, o agrupamento dos isolados de Rhizoctonia spp. ocorreu de acordo com os grupos de anastomose ja previamente determinados. A similaridade de sequencias entre isolados de mesmo hospedeiro, mas de diferente origem geografica foi elevada. Por exemplo, isolados de melao do Brasil e Espanha mostraram 97,2% de similaridade na regiao ITS1 e de 98,6 a 99,3 % na regiao ITS2. Isolados de batata do Brasil e da Espanha mostram similaridade de sequencia de 94%. Para melhorar a qualidade das sequencias da regiao ITS1-5.8S rDNA-ITS2 dos isolados CBS316.84 (Waitea circinata) e CBS569.83 (Ceratobasidium globisporum) foram gerados clones, e a analise das sequencias dos clones apresentaram variacao de 94,9 a 100 % de identidade 2 entre os clones do isolado CBS316.84 e de 91,9 ate 100 % para os clones do isolado CBS569.83. Os 44 isolados selecionados previamente, a partir do cladograma gerado da regiao ITS1-5.8S-ITS2 foram submetidos ao sequenciamento dos genes ATP sintase subunidade 6 mitocondrial (ATP6), fator de elongacao 1-alpha (EF-1ƒ¿), RNA polimerase 2 (RPB2) e a regiao ITS. As arvores filogeneticas baseadas na analise gneighbor-joiningh geradas a partir das... / Abstract: Rhizoctonia solani Kuhn (teleomorph: Thanatephorus cucumeris (Frank) Donk) is an anamorphic plant pathogenic basidiomycota fungus with a wide host range, including more than 500 genera of higher plants. Species cause disease in several important crops worldwide by infecting the seeds, roots, leaves, stems and fruits. Two hundred seventy four isolates from plant pathogenic fungus Rhizoctonia spp. collected worldwide was characterized using ITS1-5.8S rDNA-ITS2 sequence analysis to assess the degree of genetic variability within and among anastomosis groups (AGs), including tester isolates of the respective AGs. Within the ITS phylogenetic tree, there was support (66% bootstrap value) for the separation into nine major groups. In general the clustering isolates of Rhizoctonia species agreed with previously determined anastomosis groups. Nucleotide sequence similarity between isolates from the same host but from different geographic origin was high e.g. isolates from melon from Brazil and Spain showed from 97.2 % similarity in ITS1 region and 98.6 to 99.3 % in ITS2 region. Potato isolates from Brazil and Spain showed a sequence similarity about 94%. Several isolates from the same geographic origin were found closely related to different anastomosis groups such as isolates from potato, tomato, soybeans, beans, sugar beet and have been reported different symptoms around the world. Were generated cloning of ITS region from CBS 316.84 (Waitea circinata) and CBS 569.83 (Ceratobasidium globisporum) isolates to improve the sequence quality. The clones showed 94.9 to 100% and 91.9 to 100% identity respectively. Fourty four isolates were selected from the ITS1-5.8S rDNA-ITS2 phylogenetic tree for sequencing using the genes of ssembling the Fungal tree of Life (AFTOL) such as ATP 4 synthase subunit 6 mitocondrial (ATP6), elongation factor 1-alpha (EF-1ƒ¿) and RNA polymerase 2 (RPB2). The phylogenetic tree generated by sequences of EF-1ƒ¿ and RPB2 in general. / Doutor

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:25:17Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-07-30Bitstream added on 2014-06-13T18:53:09Z : No. of bitstreams: 1 lopes_dop_me_jabo.pdf: 210065 bytes, checksum: 48eb9836716b3396e8c0118a59f5aae2 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / O comportamento de genótipos de cana-de-açúcar em relação ao complexo infeccioso causado pelo ataque da broca Diatraea saccharalis e microorganismos, os danos provocados pelo complexo broca-podridão a cada genótipo e a influência do período em que a cultura permanece em campo sobre as infestações da praga foram avaliados em ensaios plantados simultaneamente e colhidos em duas e três épocas. Os tratamentos foram representados pelos genótipos de elite do Programa de Melhoramento Genético do Centro de Cana-de-açúcar do Instituto Agronômico de Campinas (IAC): IACSP99-1306, IACSP98-2072, IACSP99-3357, IACSP98-5008, IACSP98-5012, IACSP96-7603, IACSP00-8198 e pela cultivar RB867515, que estavam presentes em todos os experimentos. Na Usina Moema, além dos genótipos citados anteriormente foram adicionados também RB966928; CTC17; IACSP95-3028 e RB855453, na primeira época; RB92579; IACSP95-5000; CTC15 e SP81-3250, na segunda época; e RB876030, IAC87-3396, RB935744 e SP83-2847, na terceira época de avaliação. Já na Usina Guarani, no ensaio a ser colhido na primeira época foram adicionados os genótipos RB855453; CTC17; CTC9 e RB966928; RB935744, CTC14, CTC19 e RB832847 também foram estudados na segunda época. Todos os genótipos foram muito infectados pelo complexo broca-podridão, porém houve diferenças significativas entre eles. Os genótipo IACSP00-8198 e IACSP98-5008 apresentaram as maiores intensidades de infecção, enquanto o IACSP993357, a menor. Apesar dos ensaios colhidos em agosto e outubro tenham ficado em campo 3 e 5 meses, respectivamente, mais do que o ensaio colhido em maio, não houve diferenças entre eles... / The behavior of sugar cane genotypes in relation to the infection complex caused by the attack of sugarcane borer stalk Diatraea saccharalis and microorganisms, the damages caused by the infection complex to each genotype and the influence of the period that the crop remains in field on the infestation of the pest were evaluated in experiments that were planted simultaneously and harvested in two and three different times. The treatments were represented by elite genotypes Breeding Program Center Cane sugar Agronomic Institute of Campinas (IAC): IACSP99-1306-2072 IACSP98, IACSP99-3357, IACSP98-5008, IACSP98-5012, IACSP96-7603, IACSP00-8198 and by the cultivar RB867515 that were present in all experiments. In the Moema Mill, besides the aforementioned genotypes were also added RB966928; CTC17; IACSP95-3028; RB855453 and in the first season, the RB92579; IACSP95-5000; CTC15 and SP81-3250, in the second season, and RB876030, IAC87-3396 , RB935744 and SP83-2847, at the third time of evaluation. In the Guarani Mill, the test to be harvested in the first season were added genotypes RB855453; CTC17; CTC9 and RB966928, and RB935744, CTC14, CTC19 and RB832847, were studied in the second season. All genotypes were hard attacked by the complex drill-rot, however had significant differences between them. The genotype and IACSP98 IACSP00-8198-5008 showed the highest intensity of infestation, while IACSP993357, the lowest. Despite the trials harvested in August and October have been in field 3 and 5 months, respectively, more than the essay collected in May, there were no differences between them and the intensity of infection since, between May and October and the rainfall conditions... (Complete abstract click electronic access below)

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:34:59Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2006-05-05Bitstream added on 2014-06-13T20:25:38Z : No. of bitstreams: 1 nakatani_ak_dr_fca.pdf: 853202 bytes, checksum: df12fbbfd3cd127e44acff93e2b14eff (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Rhizoctonia solani Kuhn (teleomorfico: Thanatephorus cucumeris (Frank) Donk) e um fungo basidiomycota, fitopatogeno anamorfico com uma ampla gama de hospedeiros, incluindo mais de 500 generos de plantas. Causam doencas em varias culturas importantes no mundo, infectando sementes, raizes, folhas, hastes e frutos. A diversidade genetica de 274 isolados de Rhizoctonia spp. coletados, em diversas partes do mundo, foram caracterizados utilizando-se a analise de sequencia da regiao ITS1-5.8S rDNA-ITS2, para avaliar o grau de variabilidade genetica dentro e entre grupos de anastomose (AGs), incluindo os isolados padroes dos respectivos AGs. A arvore filogenetica gerada pela analise das sequencias da regiao ITS foi suportada por 66% gbootstrap h para a separacao em nove maiores grupos. De maneira geral, o agrupamento dos isolados de Rhizoctonia spp. ocorreu de acordo com os grupos de anastomose ja previamente determinados. A similaridade de sequencias entre isolados de mesmo hospedeiro, mas de diferente origem geografica foi elevada. Por exemplo, isolados de melao do Brasil e Espanha mostraram 97,2% de similaridade na regiao ITS1 e de 98,6 a 99,3 % na regiao ITS2. Isolados de batata do Brasil e da Espanha mostram similaridade de sequencia de 94%. Para melhorar a qualidade das sequencias da regiao ITS1-5.8S rDNA-ITS2 dos isolados CBS316.84 (Waitea circinata) e CBS569.83 (Ceratobasidium globisporum) foram gerados clones, e a analise das sequencias dos clones apresentaram variacao de 94,9 a 100 % de identidade 2 entre os clones do isolado CBS316.84 e de 91,9 ate 100 % para os clones do isolado CBS569.83. Os 44 isolados selecionados previamente, a partir do cladograma gerado da regiao ITS1-5.8S-ITS2 foram submetidos ao sequenciamento dos genes ATP sintase subunidade 6 mitocondrial (ATP6), fator de elongacao 1-alpha (EF-1 ¿), RNA polimerase 2 (RPB2) e a regiao ITS. As arvores filogeneticas baseadas na analise gneighbor-joining h geradas a partir das... / Rhizoctonia solani Kuhn (teleomorph: Thanatephorus cucumeris (Frank) Donk) is an anamorphic plant pathogenic basidiomycota fungus with a wide host range, including more than 500 genera of higher plants. Species cause disease in several important crops worldwide by infecting the seeds, roots, leaves, stems and fruits. Two hundred seventy four isolates from plant pathogenic fungus Rhizoctonia spp. collected worldwide was characterized using ITS1-5.8S rDNA-ITS2 sequence analysis to assess the degree of genetic variability within and among anastomosis groups (AGs), including tester isolates of the respective AGs. Within the ITS phylogenetic tree, there was support (66% bootstrap value) for the separation into nine major groups. In general the clustering isolates of Rhizoctonia species agreed with previously determined anastomosis groups. Nucleotide sequence similarity between isolates from the same host but from different geographic origin was high e.g. isolates from melon from Brazil and Spain showed from 97.2 % similarity in ITS1 region and 98.6 to 99.3 % in ITS2 region. Potato isolates from Brazil and Spain showed a sequence similarity about 94%. Several isolates from the same geographic origin were found closely related to different anastomosis groups such as isolates from potato, tomato, soybeans, beans, sugar beet and have been reported different symptoms around the world. Were generated cloning of ITS region from CBS 316.84 (Waitea circinata) and CBS 569.83 (Ceratobasidium globisporum) isolates to improve the sequence quality. The clones showed 94.9 to 100% and 91.9 to 100% identity respectively. Fourty four isolates were selected from the ITS1-5.8S rDNA-ITS2 phylogenetic tree for sequencing using the genes of ssembling the Fungal tree of Life (AFTOL) such as ATP 4 synthase subunit 6 mitocondrial (ATP6), elongation factor 1-alpha (EF-1 ¿) and RNA polymerase 2 (RPB2). The phylogenetic tree generated by sequences of EF-1 ¿ and RPB2 in general.

Made available in DSpace on 2016-08-12T18:48:53Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-12-07. Added 1 bitstream(s) on 2016-08-12T18:51:11Z : No. of bitstreams: 1 000865771.pdf: 870236 bytes, checksum: 6040e5a96af8ecf46732c499206503eb (MD5) / No Brasil, a cultura da soja destaca-se no agronegócio mundial devido ao atual crescimento de produção e exportação de grãos. Porém o aumento de doenças ocasionado principalmente pela monocultura em áreas extensivas acarreta perdas significativas em produção. Entre as 40 doenças já identificadas causadas por fungos, bactérias, nematóides e vírus que incidem sobre a soja, o mofo branco tem se destacado como uma das mais graves. Causada pelo fungo Sclerotinia sclerotiorum (Lib.) de Bary, o mofo branco pode acarretar perdas próximas a 100%. Paralelamente, menciona-se o fato de que, a falta de resistência varietal a S. sclerotiorum e a resistência a fungicidas por populações de S. sclerotiorum contribuem para a dificuldade de controle da doença. Os altos custos e o acúmulo de resíduos dos produtos químicos no meio ambiente, especialmente em cultivos protegidos, torna o controle biológico como um método alternativo e seguro para o controle do S. sclerotiorum. Apesar da inquestionável eficiência de métodos de inoculação artificial de fitopatógenos verifica-se que há poucos estudos referentes ao mofo branco na cultura da soja. Deste modo, o presente trabalho teve por objetivos verificar a viabilidade de metodologias de inoculação artificial do referido patógeno em diferentes condições, além de testar a reação de cultivares e a efetividade de produtos químicos e biológicos a S. sclerotiorum. Para isso, experimentos em laboratório com folhas destacadas de soja e plantas em bandejas e vasos em casa-de-vegetação foram instalados. As avaliações foram efetuadas através de escalas de notas dos sintomas foliares e contagem de escleródios. Em folhas destacadas, o método de inoculação artificial dos grãos de sorgo colonizados com o patógeno destacou-se pela maior reprodução dos sintomas foliares. Dentre as cultivares testadas a SYN 1157 RR e Emgopa 316 retardaram os sintomas da doença. O produto... / In Brazil, soybean stands out in the global agribusiness due to the current growth of production and export of grain. But the increase of diseases mainly caused by monoculture in extensive areas entails significant losses in production. Among the 40 already identified diseases caused by fungi, bacteria, nematodes and viruses that focus on soybeans, white mold has emerged as one of the most serious. Caused by the fungus Sclerotinia sclerotiorum (Lib.) de Bary, white mold can cause losses close to 100%. At the same time, it is mentioned the fact that the lack of varietal resistance to S. sclerotiorum and fungicide resistance by populations of S. sclerotiorum contribute to the difficulty of controlling the disease. The high costs and the accumulation of waste chemicals in the environment, especially in greenhouses, makes the biological control as an alternative and safe method for the control of S. sclerotiorum. Despite the unquestionable efficiency of artificial inoculation of pathogens methods it appears that there are few studies related to white mold in soybeans. Thus, this study aimed to verify the feasibility of artificial inoculation methods of that pathogen in different conditions, and test the reaction of cultivars and the effectiveness of chemical and biological products to S. sclerotiorum. For this, laboratory experiments with detached leaves of soybeans and plants in trays and pots in a greenhouse, were installed. The evaluations were made through note scales of foliar symptoms and sclerotia count. In detached leaves, artificial inoculation method of the colonized grain sorghum with the pathogen stood out for most reproduction of foliar symptoms. Among cultivars tested SYN Emgopa 316 1157 RR and slowed disease symptoms. The chemical thiophanate methyl, reduced foliar symptoms and inhibits the formation of sclerotia. In trays, isolated from the soybean crop and the method of grain sorghum colonized and deposited in planting ...

Orientador: José Frederico Centurion / Coorientador: Maria Aparecida Pessôa da Cruz Centurion / Banca: Helena Baroni Junqueira Franco de Luca / Banca: Gisele Herbst Vazquez / Banca: Rita de Cássia Panizzi / Banca: Mariluce Pascoina Nepomuceno de Melo / Resumo: No Brasil, a cultura da soja destaca-se no agronegócio mundial devido ao atual crescimento de produção e exportação de grãos. Porém o aumento de doenças ocasionado principalmente pela monocultura em áreas extensivas acarreta perdas significativas em produção. Entre as 40 doenças já identificadas causadas por fungos, bactérias, nematóides e vírus que incidem sobre a soja, o mofo branco tem se destacado como uma das mais graves. Causada pelo fungo Sclerotinia sclerotiorum (Lib.) de Bary, o mofo branco pode acarretar perdas próximas a 100%. Paralelamente, menciona-se o fato de que, a falta de resistência varietal a S. sclerotiorum e a resistência a fungicidas por populações de S. sclerotiorum contribuem para a dificuldade de controle da doença. Os altos custos e o acúmulo de resíduos dos produtos químicos no meio ambiente, especialmente em cultivos protegidos, torna o controle biológico como um método alternativo e seguro para o controle do S. sclerotiorum. Apesar da inquestionável eficiência de métodos de inoculação artificial de fitopatógenos verifica-se que há poucos estudos referentes ao mofo branco na cultura da soja. Deste modo, o presente trabalho teve por objetivos verificar a viabilidade de metodologias de inoculação artificial do referido patógeno em diferentes condições, além de testar a reação de cultivares e a efetividade de produtos químicos e biológicos a S. sclerotiorum. Para isso, experimentos em laboratório com folhas destacadas de soja e plantas em bandejas e vasos em casa-de-vegetação foram instalados. As avaliações foram efetuadas através de escalas de notas dos sintomas foliares e contagem de escleródios. Em folhas destacadas, o método de inoculação artificial dos grãos de sorgo colonizados com o patógeno destacou-se pela maior reprodução dos sintomas foliares. Dentre as cultivares testadas a SYN 1157 RR e Emgopa 316 retardaram os sintomas da doença. O produto... / Abstract: In Brazil, soybean stands out in the global agribusiness due to the current growth of production and export of grain. But the increase of diseases mainly caused by monoculture in extensive areas entails significant losses in production. Among the 40 already identified diseases caused by fungi, bacteria, nematodes and viruses that focus on soybeans, white mold has emerged as one of the most serious. Caused by the fungus Sclerotinia sclerotiorum (Lib.) de Bary, white mold can cause losses close to 100%. At the same time, it is mentioned the fact that the lack of varietal resistance to S. sclerotiorum and fungicide resistance by populations of S. sclerotiorum contribute to the difficulty of controlling the disease. The high costs and the accumulation of waste chemicals in the environment, especially in greenhouses, makes the biological control as an alternative and safe method for the control of S. sclerotiorum. Despite the unquestionable efficiency of artificial inoculation of pathogens methods it appears that there are few studies related to white mold in soybeans. Thus, this study aimed to verify the feasibility of artificial inoculation methods of that pathogen in different conditions, and test the reaction of cultivars and the effectiveness of chemical and biological products to S. sclerotiorum. For this, laboratory experiments with detached leaves of soybeans and plants in trays and pots in a greenhouse, were installed. The evaluations were made through note scales of foliar symptoms and sclerotia count. In detached leaves, artificial inoculation method of the colonized grain sorghum with the pathogen stood out for most reproduction of foliar symptoms. Among cultivars tested SYN Emgopa 316 1157 RR and slowed disease symptoms. The chemical thiophanate methyl, reduced foliar symptoms and inhibits the formation of sclerotia. In trays, isolated from the soybean crop and the method of grain sorghum colonized and deposited in planting ... / Doutor

Orientador: Antonio Carlos Busoli / Coorientador: Leila Luci Dinardo Miranda / Coorientador: Arlindo Leal Boiça Junior / Banca: Sérgio Antônio De Bortoli / Banca: Ivan Antônio dos Anjos / Resumo: O comportamento de genótipos de cana-de-açúcar em relação ao complexo infeccioso causado pelo ataque da broca Diatraea saccharalis e microorganismos, os danos provocados pelo complexo broca-podridão a cada genótipo e a influência do período em que a cultura permanece em campo sobre as infestações da praga foram avaliados em ensaios plantados simultaneamente e colhidos em duas e três épocas. Os tratamentos foram representados pelos genótipos de elite do Programa de Melhoramento Genético do Centro de Cana-de-açúcar do Instituto Agronômico de Campinas (IAC): IACSP99-1306, IACSP98-2072, IACSP99-3357, IACSP98-5008, IACSP98-5012, IACSP96-7603, IACSP00-8198 e pela cultivar RB867515, que estavam presentes em todos os experimentos. Na Usina Moema, além dos genótipos citados anteriormente foram adicionados também RB966928; CTC17; IACSP95-3028 e RB855453, na primeira época; RB92579; IACSP95-5000; CTC15 e SP81-3250, na segunda época; e RB876030, IAC87-3396, RB935744 e SP83-2847, na terceira época de avaliação. Já na Usina Guarani, no ensaio a ser colhido na primeira época foram adicionados os genótipos RB855453; CTC17; CTC9 e RB966928; RB935744, CTC14, CTC19 e RB832847 também foram estudados na segunda época. Todos os genótipos foram muito infectados pelo complexo broca-podridão, porém houve diferenças significativas entre eles. Os genótipo IACSP00-8198 e IACSP98-5008 apresentaram as maiores intensidades de infecção, enquanto o IACSP993357, a menor. Apesar dos ensaios colhidos em agosto e outubro tenham ficado em campo 3 e 5 meses, respectivamente, mais do que o ensaio colhido em maio, não houve diferenças entre eles... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The behavior of sugar cane genotypes in relation to the infection complex caused by the attack of sugarcane borer stalk Diatraea saccharalis and microorganisms, the damages caused by the infection complex to each genotype and the influence of the period that the crop remains in field on the infestation of the pest were evaluated in experiments that were planted simultaneously and harvested in two and three different times. The treatments were represented by elite genotypes Breeding Program Center Cane sugar Agronomic Institute of Campinas (IAC): IACSP99-1306-2072 IACSP98, IACSP99-3357, IACSP98-5008, IACSP98-5012, IACSP96-7603, IACSP00-8198 and by the cultivar RB867515 that were present in all experiments. In the Moema Mill, besides the aforementioned genotypes were also added RB966928; CTC17; IACSP95-3028; RB855453 and in the first season, the RB92579; IACSP95-5000; CTC15 and SP81-3250, in the second season, and RB876030, IAC87-3396 , RB935744 and SP83-2847, at the third time of evaluation. In the Guarani Mill, the test to be harvested in the first season were added genotypes RB855453; CTC17; CTC9 and RB966928, and RB935744, CTC14, CTC19 and RB832847, were studied in the second season. All genotypes were hard attacked by the complex drill-rot, however had significant differences between them. The genotype and IACSP98 IACSP00-8198-5008 showed the highest intensity of infestation, while IACSP993357, the lowest. Despite the trials harvested in August and October have been in field 3 and 5 months, respectively, more than the essay collected in May, there were no differences between them and the intensity of infection since, between May and October and the rainfall conditions... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:29:44Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2005-07-29Bitstream added on 2014-06-13T20:19:59Z : No. of bitstreams: 1 celoto_mib_me_ilha.pdf: 3248829 bytes, checksum: 9d56fd891d09374427dfc3f96f54210a (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / O uso de extratos vegetais no controle de doenças de plantas está sendo pesquisado como alternativa aos fungicidas convencionais, devido serem apontados como seguros ao homem e não agressivos ao meio ambiente. Extratos de Melão-de-São-Caetano (Momordica charantia) foram testados in vitro e in vivo sobre Colletotrichum musae, fitopatógeno causador da antracnose em frutos de bananeira. Extratos aquoso e hidroetanólico adicionados ao meio de BDA (Batata-Dextrose-Agar), na concentração 50%, proporcionaram respectivamente 71% e 64% de inibição do crescimento micelial (ICM) do fungo, enquanto que em meio líquido, a ICM foi maior (86% e 81% respectivamente), provavelmente devido ao maior contato do meio com o fungo. Somente o extrato aquoso e o tiofanato metílico, nas concentrações de 50% e 1000ug.mL-1, respectivamente, inibiram completamente a germinação de esporos do fungo. Os extratos metanólico e aquoso inibiram em 80% e 70%, respectivamente, o desenvolvimento das lesões de antracnose, quando aplicados até dois dias antes da inoculação do fungo, resultados próximos ao tratamento com tiofanato metílico que inibiu 80%. Os extratos metanólico e aquoso e o tiofanato metílico proporcionaram menores percentagens de frutos com a presença de esporulação visível nas lesões. A maturação dos frutos tratados com os extratos aquoso e hidroetanólico foi retardada em dois dias em relação aos frutos da testemunha. / Plant extracts for the control of plant disease are emerging as alternatives to conventional fungicides due to be pointed as safe to humans and environment. Bitter melon (Momordica charantia) extracts were screened in vitro and in vivo against the fungal banana tree fruits pathogen Colletotrichum musae. Aqueous and hidroetanolic extracts of bitter melon, at 50% concentration, in solid medium, provided respectively 71% e 64% of mycelial growth inhibition (MGI) of fungus, while in liquid medium, the MGI were bigger (86% and 81%, respectively) probably due to the better contact of medium with the fungus. Only the aqueous extracts and the metilic tiofanato, at the concentrations of 50% and 1000ug.mL-1, respectively, inhibited on 80% e 70%m respectively, the lesion diameter, when apllied until two days before of inoculation of fungus. This results were close to the metilic tiofanato, that inhibited the lesions diameter on 80%. Thoses extracts provided smaller percentages of fruits with visibles spores in the lesions. The maturation of the treated fruits with the aqueous and hidroetanolic extracts was delayed in two days in relation to the untreated fruits.

Orientador: Gonçalo Amarante Guimarães Pereira / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-06T16:13:24Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Rincones_Johana_D.pdf: 3507237 bytes, checksum: b5905da7ffa8ea3a869dd3090e9a1d1f (MD5) Previous issue date: 2006 / Resumo: A Vassoura-de-Bruxa do cacaueiro constitui um patosistema complexo e até o momento não foi estabelecido um plano de controle efetivo na região produtora da Bahia. O objetivo principal deste trabalho foi aprimorar os conhecimentos sobre a interação C. perniciosa-Cacaueiro com informações referentes à: 1) tamanho e organização do genoma através da obtenção do cariótipo molecular do fungo; 2) variabilidade genética deste fitopatógeno a nível cromossômico na região produtora da Bahia; e 3) expressão gênica do fungo em presença de extratos do hospedeiro. O cariótipo molecular foi estabelecido por eletroforese em gel de campo pulsado. Esta mesma metodologia foi utilizada em combinação com análise tipo microsatélites para um estudo de variabilidade a nível cromossômico de 38 isolados provenientes de três biótipos e diferentes regiões geográficas. Para análise da expressão gênica foram seqüenciadas quatro bibliotecas de cDNA do fungo sob diferentes condições de cultivo e em diferentes estágios do desenvolvimento, incluindo uma biblioteca subtrativa obtida por SSH. Como resultados, apresentamos o cariótipo molecular de C. perniciosa e a existência de polimorfismos cromossômicos. A análise dos 38 isolados permitiu observar que o cariótipo do biótipo-C é estável ao longo do tempo e sua variabilidade na região da Bahia é baixa, mostrando assim a fragilidade do programa de melhoramento genético do cacaueiro na Bahia, onde os clones resistentes selecionados no campo foram desafiados contra apenas dois genótipos do patógeno. Com relação à análise da expressão do fungo, obtivemos 1427 unigenes e sua análise por similaridade com as bases de dados permitiu a identificação de diversos mecanismos pelos quais o fungo poderia estar manipulando o metabolismo da planta para seu benefício e em detrimento da produção de cacau. Assim, consideramos que a partir deste trabalho foi possível obter uma maior compreensão dos mecanismos utilizados por C. perniciosa no desenvolvimento da Vassoura-de-Bruxa em cacaueiro e estudos mais aprofundados, baseados nos resultados aqui obtidos, deverão auxiliar no desenvolvimento de estratégias de controle para esta importante doença / Abstract: Witches' broom disease of cocoa is a complex pathosystem that has evaded an efficient control program in the cacao-producing region of Bahia, Brazil. The main goal of this work was to acquire a better understanding of the C. perniciosa-Cacao interaction by providing new data regarding: 1) the size and organization of the fungal genome through molecular karyotyping; 2) the genetic variability of this phytopathogen at the chromosomal level in the cacao-producing region of Bahia; and 3) the gene expression of the fungus in the presence of host extracts. The molecular karyotype was obtained through pulsed-field gel electrophoresis. This same technique was applied in combination with microsatellite PCR analysis of 38 isolates from different biotypes and geographic regions in order to study the chromosomal-level genetic variability of this pathogen. For the gene expression analysis, four cDNA libraries of the fungus grown under different culture conditions and developmental stages, including a subtractive library using SSH, were sequenced and searched for similarities in the public databases. As results, we present the molecular karyotype of C. perniciosa and the existence of chromosome-length polymorphism. The analysis of the 38 isolates showed that the karyotype of the C-biotype is very stable in time and that the variability of the pathogen in Bahia is very low, thus indicating the fragility of the current cacao-breeding program in Bahia, where the resistant cacao clones selected in the field were challenged against only two different genotypes of the pathogen. With regards to the gene expression analysis, we obtained 1427 unigenes and the similarity searches allowed the identification of various mechanisms through which the fungus might be manipulating the metabolism of the plant for its own benefit and in detriment of cocoa production. Therefore, we consider that this work allowed us to acquire a better understanding of the molecular mechanisms used by C. perniciosa during witches' broom development in cacao and more detailed studies, based on the results presented here, might aid in the development of novel control strategies for this important disease / Doutorado / Bioquimica / Doutor em Biologia Funcional e Molecular

Orientador: Gonçalo Amarante Guimarães Pereira / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-08T06:16:48Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Scarpari_LeandraMaria_D.pdf: 5130527 bytes, checksum: 37ee3077a3d859fb1da23df8ea1fa70c (MD5) Previous issue date: 2006 / Resumo: A doença vassoura-de-bruxa, provocada pelo fungo hemibiotrófico Crinipellis perniciosa, é uma das doenças mais importantes do cacaueiro, diminuindo drasticamente a produção e causando grandes prejuízos econômicos. Uma maior compreensão sobre a interação cacaueiro - C. perniciosa e sobre os processos que ocorrem na planta durante a progressão da doença é necessária para estabelecer novas estratégias de controle para a doença. O presente trabalho teve dois objetivos principais: 1) identificar as mudanças bioquímicas que ocorrem no cacaueiro durante o desenvolvimento da doença; 2) identificar os genes diferencialmente expressos no micélio biotrófico do fungo C. perniciosa cultivado in vitro, sendo este micélio o estágio do ciclo de vida do fungo que induz os sintomas da doença. Os resultados da caracterização bioquímica da doença, usando plântulas de cacau infectadas artificialmente, indicaram uma elevação inicial de metabólitos secundários relacionados à defesa da planta, como alcalóides, fenólicos e taninos. Como esses mecanismos não são eficientes para deter a colonização da planta pelo fungo, uma cascata de eventos, provavelmente ativada pelo aumento dos níveis de etileno, eleva os teores de asparagina, de açúcares, malondialdeido (MDA) e glicerol, altera o perfil de ácidos graxos, reduz os níveis de aminoácidos individuais e de pigmentos fotossintéticos, causando a morte da vassoura. O importante avanço do desenvolvimento de um sistema que permite a manutenção in vitro do micélio biotrófico de C. perniciosa, estabelecido recentemente por nosso grupo, permitiu o estudo da expressão gênica diferencial das duas fases miceliais do ciclo de vida do fungo: biotrófica e necrotrófica. Utilizamos a técnica de microarrays de DNA, analisando 2.304 fragmentos de bibliotecas de DNA genômico do Projeto Genoma da Vassoura-de-bruxa, selecionados a partir da similaridade com genes de patogenicidade de outros patógenos. Os resultados mostraram supressão da expressão de genes relacionados ao transporte e metabolismo de hexoses e ao metabolismo de lipídeos no micélio biotrófico do fungo. Já os genes da família do citocromo P450, hidrofobinas, aglutinina, lacase, várias proteases, lipases, álcool oxidase (AOX) e proteínas pol do sistema de retrotransposição de vírus, tiveram sua expressão induzida no micélio biotrófico, sugerindo uma possível participação nos mecanismos de patogenicidade do fungo. Esses resultados representam avanços significativos para as pesquisas sobre o metabolismo do fungo C. perniciosa e sobre as bases moleculares da progressão da doença vassoura-de-bruxa do cacaueiro, e servirão como base para orientar futuras investigações visando o controle da doença / Abstract: Witches¿ broom disease, caused by the hemibiotrophic fungus Crinipellis perniciosa, is one of the most important diseases of cocoa, causing dramatic production and economic losses. A better understanding of the cacao - C. perniciosa interaction and the processes that occur in the plant during disease progression becomes necessary in order to establish novel control strategies for this disease. In view of this, the present work had two main goals: 1) establishment of the biochemical modifications that occur in the host plant during disease development; and 2) identification of differentially expressed genes in in vitro grown biotrophic mycelia of C. perniciosa, which constitutes the fungal life stage that induces disease symptoms. The results of the biochemical characterization of the disease in artificially infected cocoa seedlings indicated an initial increase of secondary metabolites related to plant defenses, such as alkaloids, phenolics, and tannins. Since these mechanisms fail to control plant colonization by the fungus, a cascade of events, probably triggered by the increased levels of ethylene, boosts the contents of asparagine, sugars, malondialdehyde (MDA) and glycerol, alters the profile of fatty acids, lowers the levels of individual amino acids and photosynthetic pigments, and ultimately leads to tissue death. The important technological development of an in vitro system that allows the maintenance of the biotrophic phase of C. perniciosa, which was recently established by our group, allowed the analysis of the differential gene expression between the two mycelial phases of the life cycle of this fungus: the biothophic and the necrotrophic phases. For this study we employed the technique of DNA microarrays, analyzing 2,304 fragments obtained from the genomic DNA libraries of the Witches¿ Broom Genome Project, and which were selected based on their sequence similarity to pathogenicity genes of other pathogens. The results showed suppressed expression of genes related to the metabolism and transport of hexoses and to the metabolism of lipids in the biotrophic mycelia of the fungus. On the other hand, the expression of genes of the cytochrome P450 family, hydrophobins, agglutinin, laccase, several proteases, lipases, alcohol oxidase (AOX), and pol proteins of the viral retrotransposition system were induced in the biotrophic mycelia, thus suggesting their possible participation in fungal mechanisms of pathogenicity. These results represent significant advances to our understanding of the metabolism of C. perniciosa and also regarding the molecular basis underlying the progression of witches¿ broom disease of cocoa, and will be valuable as a basis for future investigations aimed at disease control / Doutorado / Bioquimica / Doutor em Biologia Funcional e Molecular