Made available in DSpace on 2014-06-11T19:35:00Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2002-02Bitstream added on 2014-06-13T20:06:03Z : No. of bitstreams: 1 meyer_mc_dr_botfca.pdf: 871879 bytes, checksum: 19c7529e77cff6ad15a7c03041da99d7 (MD5) / A mela da soja ocorre em várias regiões tropicais e subtropicais no mundo, sendo responsável por reduções de produtividade de até 50% nos EUA e de 31% no Brasil. A doença é causada pelo fungo Rhizoctonia solani AG1-IA e AG1-IB, com relatos do AG2-3 somente no Japão. No Brasil há incidência de mela nas regiões Norte, Nordeste e Centro Oeste. A caracterização do patógeno é fundamental para o estabelecimento de estratégias de controle e direcionamento de programas de melhoramento na busca de resistência genética. O controle químico representa a única alternativa após a instalação da doença, cuja eficiência varia em função das condições ambientais. O objetivo deste trabalho foi caracterizar o agente causal da mela da soja no Brasil, bem como desenvolver metodologia de seleção e avaliar a variabilidade genética em germoplasma de soja para resistência à doença, e o efeito de fungicidas e indutores de resistência sobre o patógeno e a doença. Isolados de R. solani provenientes do Mato Grosso, Maranhão, Roraima e Tocantins, foram analisados quanto às características citológicas, morfológicas, culturais e fusão de hifas para determinação do grupamento de anastomose... / Rhizoctonia foliar blight (RFB) of soybean occur on some world tropical and subtropical regions, causing yield reductions of 50% in USA and of 31% in Brazil. The disease is caused by Rhizoctonia solani AG1-IA and AG1-IB, and by AG2-3 only in Japan. The RFB occurs in Brazil in the North, Northeast and Mid-West regions of the country. The characterization of the pathogen is important for the establishment of disease control strategies and breeding for genetic resistance. Chemical control remains the only measure for controlling RFB after its incidence in a field, but its efficiency depends on the environmental conditions. The objectives of the present work were: characterization of Brazilian RFB isolates, screening methodologies and evaluation of soybean germplasm for genetic resistance, evaluation of fungicides and activators for their effects upon systemic acquired resistance on the R. solani and RFB. Isolates from the states of Mato Grosso, Maranhão, Roraima and Tocantins were analyzed for cytological, morphological, cultural and hyphal fusion characteristics. These isolates were also compared by Random Amplified Polimorfic DNA (RAPD) and by homology of rDNA-ITS sequence regions in order to define anastomosis group (AG) and Intraspecific Group (ISG) of the pathogen. Germplasm evaluation methodologies for resistance to RFB were compared by different inoculation methods. The effect of fungicides and activators of plant resistance were tested in vitro and in vivo...(Complete abstract, click electronic access below)

Made available in DSpace on 2015-04-09T12:28:16Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-02-27Bitstream added on 2015-04-09T12:47:51Z : No. of bitstreams: 1 000817867_20160327.pdf: 244238 bytes, checksum: 138a4f9eeffca640708f9f2b8c3597ac (MD5) Bitstreams deleted on 2016-03-28T13:37:38Z: 000817867_20160327.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2016-03-28T13:38:43Z : No. of bitstreams: 1 000817867.pdf: 1263525 bytes, checksum: 3a4be59983c22dd3e70c88a764890456 (MD5) / Phyllosticta corresponde a um importante gênero de fungos associados ao reino vegetal. Devido à importância econômica dos prejuízos ocasionados por algumas espécies de Phyllosticta e ao comportamento cosmopolita das espécies endofíticas, várias pesquisas têm sido realizadas no intuito de identificar e reclassificar as espécies desse gênero. Mediante a aplicação do sequenciamento de diferentes regiões gênicas, novas espécies de Phyllosticta foram relatadas recentemente, e concomitante aos novos relatos, surgiram dúvidas acerca da identificação das espécies já relatadas e comumente citadas na literatura. Neste contexto, estudos indicaram que mangueiras são hospedeiras de diferentes espécies endofíticas de Phyllosticta spp. e, que P. capitalensis pode ocasionar lesões em frutos de goiabeiras, cujos sintomas eram até então atribuídos à outra espécie do gênero. Assim, tendo em vista a reclassificação e identificação de novas espécies, fez-se necessário a realização de estudos do complexo de espécies de Phyllosticta ainda não conhecidas, dando continuidade aos trabalhos já realizados no Brasil em mangueiras e goiabeiras, culturas nas quais a identificação do fungo ainda não está bem esclarecida. Para tanto, este trabalho objetivou obter uma coleção atual de isolados de Phyllosticta de folhas assintomáticas de goiabeiras e de mangueiras, e de frutos sintomáticos de goiabeiras. Amostras de folhas de ambas as espécies de plantas foram coletadas em bancos de germoplasma e em áreas de produção comercial. Foram selecionados 102 isolados, segundo suas características fenotípicas em meio de cultura, para serem submetidos ao sequenciamento da região ITS1-5.8S-ITS2, e dos genes codificadores da actina (ACT) e do gliceraldeído-3-fosfato desidrogenase (GPDH). Ainda, a fim de corroborar os resultados obtidos pelo sequenciamento e objetivando analisar o perfil genético dos indivíduos, foram ... / Phyllosticta corresponds to an important genus of fungi associated with the plant kingdom. Due to the economic importance of damages caused by some species of Phyllosticta and the cosmopolitan behavior of endophytic species, several studies have been conducted in order to identify and reclassify species of this genus. Through the application of sequencing of different gene regions, new species of Phyllosticta were recently reported, and concomitant to the new reports, doubts were raised about the identification of previously reported and commonly cited species in literature. In this context, studies indicated that mango is hosted by different endophytic species of Phyllosticta spp. and that P. capitalensis can cause lesions on guava fruits, whose symptoms were previously attributed to other species of the genus. Thus, because of the reclassification and identification of new species, it was necessary to perform studies of the complex of Phyllosticta species not yet known, by continuing the work already carried out in Brazil with guava and mango crops in which the identification of the fungus is still unclear. Therefore, this study aimed to obtain a current collection of Phyllosticta isolates from asymptomatic leaves of guava and mango, and symptomatic fruits of guava. Leaves samples of both plant species were collected in germplasm banks and in areas of commercial production of the fruits. It were selected 102 isolates, according to their phenotypic characteristics in culture medium, to be submitted to the sequencing of ITS1-5.8S-ITS2, actin (ACT) and glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase (GPDH) genes. Also, in order to corroborate the results obtained by sequencing and aiming to analyze the genetic profile of the isolates, fAFLP markers (fluorescent Amplified Fragment Length Polymorphism) analysis were applied. Both techniques allowed the separation of isolates according to their species, which were identified as ...

Made available in DSpace on 2015-06-17T19:34:03Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-01-16. Added 1 bitstream(s) on 2015-06-18T12:47:30Z : No. of bitstreams: 1 000826579.pdf: 368217 bytes, checksum: 8e4e91ae5f9afdf71e55913e7b8beac1 (MD5) / A podridão floral dos citros (PFC) é uma importante doença dessa cultura, responsável por elevadas perdas de produção. Normalmente, essa doença mostra-se limitante quando ocorrem prolongados períodos chuvosos durante o florescimento das plantas ou quando existe intenso molhamento foliar. Duas espécies de Colletotrichum estão associadas à doença: C. acutatum e C. gloeosporioides. Entretanto, recentemente tem-se verificado que, mesmo sob condições não tão propícias, a doença tem ocorrido com relativa frequência; suspeitando-se do envolvimento de outras espécies de Colletotrichum ou de novas condições de adaptação das espécies descritas. Esse trabalho teve como objetivo determinar se há ou não outra espécie de Colletotrichum associada a PFC e avaliar a viabilidade do emprego de marcadores moleculares ISSR na caracterização taxonômica de isolados de Colletotrichum spp. associados a sintomas de PFC em flores, assim como de tecidos foliares e frutos cítricos assintomáticos. Para tanto, foi empregada uma combinação de iniciadores específicos, levando em conta a região ITS e marcadores moleculares ISSR. Os marcadores ISSR mostraram-se eficientes na caracterização taxonômica dos isolados de Colletotrichum analisados. A população avaliada foi constituída apenas por C. acutatum e C. gloeosporioides, descartando o envolvimento de uma espécie adicional, o que converge com os registros na literatura. Foi constatada alta diversidade genética entre os isolados analisados, o que também se mostra convergente quanto às diferenças fenotípicas observadas sob condições de campo. Entretanto, não foi encontrada relação quanto à origem e as espécies de Colletotrichum spp. associadas. De modo inédito, ainda que assintomaticamente, foi detectada a presença de um isolado de C. acutatum associado a frutos cítricos / Postbloom fruit drop of citrus (PFD) is a serious disease of this crop, accounting for high yield losses. Usually, this disease shows to be limiting when there are prolonged rainy periods during plant flowering or when there is intense leaf wetness. Two Colletotrichum species are associated with the disease: C. acutatum and C. gloeosporioides. However, recently, it has been found that, even under not so favorable conditions, the disease has occurred with some frequency; one suspects the involvement of other Colletotrichum species or new adaptation conditions of the described species. This study aimed to determine whether there is another Colletotrichum species associated with PFD and it assess the viability of using molecular markers ISSR for taxonomic characterization of Colletotrichum spp. isolates associated with PFD symptoms in flowers, as well as of leaf tissues and asymptomatic citrus fruits. For this purpose, we used a combination of specific primers, taking into account the ITS region and ISSR molecular markers. ISSR markers have proven to be effective for taxonomic characterization of the Colletotrichum isolates analyzed. The population assessed consisted only of C. acutatum and C. gloeosporioides, discarding the involvement of an additional species, something which converges with records in the literature. We found high genetic diversity among the isolates analyzed, and this also shows to converge as for the phenotypic differences observed under field conditions. However, no relation was found regarding the origin and associated Colletotrichum spp. species. In an unprecedented way, although asymptomatically, we detected the presence of a C. acutatum isolate associated with citrus fruits

Made available in DSpace on 2015-06-17T19:34:03Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-02-27. Added 1 bitstream(s) on 2015-06-18T12:47:30Z : No. of bitstreams: 1 000829670_20170301.pdf: 127810 bytes, checksum: 44d4ae85fcaac4415a01b5b5767032c2 (MD5) Bitstreams deleted on 2017-03-03T11:01:31Z: 000829670_20170301.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2017-03-03T11:02:40Z : No. of bitstreams: 1 000829670.pdf: 1102839 bytes, checksum: 4219369f7ced3eb60a4edfc75be10b10 (MD5) / A Mancha Preta dos Citros (MPC), causada pelo fungo Phyllosticta citricarpa, encontra-se espalhada pelos continentes do mundo. Seus sintomas ocasionam a depreciação dos frutos e a queda prematura daqueles severamente infectados. Dada a importância econômica desta doença, realizamos a análise da estrutura genética de duas coleções de isolados de P. citricarpa, obtidas de uma única propriedade citrícola, em um intervalo de sete anos. Os frutos foram coletados de laranjeiras 'Pera 'e 'Valência' nos anos de 2005 e 2012. Os isolados obtidos foram identificados mediante a análise de sequências da região ITS e genes GPDH e TEF1. Assim, 80 isolados da coleção de 2005 e 115 de 2012 foram identificados como P. citricarpa. Apenas seis isolados de Phyllosticta capitalensis foram encontrados em meio aos de 2012. Maior quantidade de sequências com variações genéticas foram identificadas nos isolados obtidos na última amostragem de frutos, principalmente nas populações oriundas de 'Valência'. A diferenciação genética entre as populações de P. citricarpa de laranjeiras 'Valência', de 2005 e 2012, foi evidenciada mediante o emprego de marcadores AFLP, sendo o genótipo predominante em 2012 aquele identificado nas populações de 'Pera', de ambos os períodos. Pela análise da relação genética entre os isolados, presumiu-se que indivíduos cujo genótipo tenha sido favorecido apareceram primeiramente entre as populações de P. citricarpa que abrigavam as plantas de 'Pera', e posteriormente, migraram para os pomares de 'Valência'. Esta uniformização populacional ao longo dos sete anos e o baixo polimorfismo notado entre os isolados ao longo de gerações são indicativos de baixa recombinação genética entre os indivíduos. Sequências das bandas polimórficas entre os isolados de 'Valência' de 2005 e 2012 apresentaram similaridade com aquelas de proteínas da família de ABC transporters ... / Citrus Black Spot (CBS), caused by the fungus Phyllosticta citricarpa, is spread over continents in the world. Its symptoms cause fruit depreciation and those severely infected fall prematurely. Given the economic importance of this disease, we carried out analysis of the genetic structure of two P. citricarpa isolates collections, obtained from a single citrus farm in a seven years interval. Fruits were collected from Pera and Valencia orange varieties in 2005 and 2012. The isolates obtained were identified by sequences analysis of ITS region and GPDH and TEF1 genes. Thus, 80 and 115 isolates of the 2005 and 2012 collections, respectively, were identified as P. citricarpa. Among the 2012 collection only six Phyllosticta capitalensis isolates were found. Higher amount of sequences containing genetic variations were identified in the isolates from the last fruits sampling, especially in populations derived from Valencia oranges. By applying AFLP markers it was evidenced genetic differentiation among P. citricarpa populations from Valencia oranges obtained between 2005 and 2012, whose predominant genotype in 2012 was that found in Pera populations from both periods. Through analysis of genetic relationship among isolates, it was assumed that individuals with favored genotypes have first appeared among P. citricarpa populations of Pera plants, and further migrated to Valencia orchards. Genetic populations uniformity over the seven years and low polymorphism observed among them, over generations, are indicative of low genetic recombination between individuals. Sequences of polymorphic bands between isolates of 2005 and 2012 Valencia collections presented similarity with those of ABC transporters Family proteins, which act as efflux pumps of cytotoxic compounds, as fungicides, and to NADH dehydrogenase proteins. Such gene modifications might be responsible for variability of sensibility responses of the isolates to strobilurins, which ...

Made available in DSpace on 2015-03-03T11:52:25Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-10-24Bitstream added on 2015-03-03T12:07:18Z : No. of bitstreams: 1 000806884_20161031.pdf: 2377845 bytes, checksum: 2a3f97ee5bbf95e2dbbfd2e8517de872 (MD5) Bitstreams deleted on 2016-10-31T10:32:35Z: 000806884_20161031.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2016-10-31T10:33:09Z : No. of bitstreams: 1 000806884.pdf: 12054974 bytes, checksum: 3f7ed2ea30d77e1c0e72bc70fa54b0f8 (MD5) / A cana-de-açúcar (Sacharam spp.) é uma planta de grande importância econômica para o Brasil, usada principalmente na produção de açúcar e etanol, mas que está sujeita ao ataque de diversas doenças, tais como aquelas associadas à proliferação de vírus, bactérias e fungos, que comprometem a produtividade, impactando a produção de biomassa. Estudos que visam estabelecer uma correlação entre a composição micromolecular e a resistência hospedeiro/patógeno ainda são pouco explorados, mas podem auxiliar na investigação dessas interações. Portanto, o objetivo deste estudo foi analisar e comparar os perfis metabólicos da cera epicuticular e de outros metabólitos lipofílicos de folhas de diversas variedades de cana-de-açúcar, por cromatografia a gás acoplada à espectrometria de massas (GCMS). As análises qualitativas resultaram na identificação de 58 compostos na cera epicuticular (138 observados), 41 no extrato hexânico (65 observados) de folhas de cana-de-açúcar. Essas análises foram realizadas por GC-MS após sililação das amostras e alicerçadas principalmente na comparação de índices de retenção e espectros de massas experimentais com dados da literatura e de biblioteca de espectros. Algumas propostas foram também reforçadas pela análise do padrão de fragmentação, entre as quais incluem-se séries homólogas de hidrocarbonetos, ácidos e álcoois graxos e alquilresorcinóis, além de esteroides e triterpenos. A identificação de alquilresorcinóis e do triterpeno simiarenol foi confirmada por análise de frações de cera epicuticular por RMN de 1H e 13C. A julgar pelas massas de cada fração obtida no fracionamento da cera epicuticular de folhas, por cromatografia em camada delgada preparativa, e respectivos espectro de RMN de 1H, conclui-se que os constituintes principais da cera são 5-nonadecil resorcinol, heneicosil resorcinol e o triterpeno... / Sugarcane (Sacharam spp.) is a plant of great importance to Brazil, used mainly in the production of sugar and ethanol, but is subject to several diseases, such as those associated with the proliferation of viruses, bacteria and fungi, that compromise productivity and impacting the production of biomass. Studies aimed to establish the correlation between the micromolecula composition and the host / pathogen resistance are underexplored, but may assist in the understanding of these interactions. Therefore, the aim of this study was to analyze and compare the metabolic profiles of epicuticular wax and other lipophilic metabolites from leaves of different varieties of sugarcane by gas chromatography coupled to mass spectrometry (GC-MS). The qualitative analysis resulted in the identification of 58 compounds in epicuticular wax (seen 138) and 41 compounds in the hexane extract (seen 65) of leaves of sugarcane. These analyzes were performed by GC-MS after sample silylation, and the compound identification was grounded mainly on comparison of retention indices and mass spectra with experimental literature data and spectra libraries. Some proposals have also been enhanced by the fragmentation pattern analysis. The identified compounds include homologous series of hydrocarbons, fatty acids, policosanols and alkyl resorcinols, triterpenes and steroids. The identification of alkyl resorcinols and the triterpene simiarenol was confirmed by 1H NMR and 13C. Judging by the masses of fractions obtained from analysis of the epicuticular wax by preparative TLC, and its 1 H NMR spectrum, it was concluded that the main constituents of wax are 5-nonadecyl resorcinol, 5-heneicosil resorcinol and simiarenol. The comparison of the chemical profiles of epicuticular waxes and the hexane extract of leaves from different sugarcane cultivars showed random qualitative and quantitative variations between the samples, but without...

Orientador: Eleni Gomes / Coorientador: Éder Antônio Giglioti / Banca: Fernando Barbosa Noll / Banca: Marcia Maria de Souza Moretti / Banca: José Eduardo Marcondes de Almeida / Banca: Jeferson Gross / Resumo: A broca da cana-de-açúcar é considerada a principal praga da cultura, cujo controle químico não tem sido eficaz. O controle biológico com Cotesia flavipes, em função da expansão do plantio, não será suficiente para o controle em áreas de alta infestação. O clima quente e úmido das regiões Noroeste e Centro-Oeste do Estado de São Paulo potencializam a utilização dos fungos Beauveria bassiana e Metarhizium anisopliae para o controle desta praga. O presente trabalho teve como objetivos estudar as variações genéticas dentre uma população pré-selecionada de 20 isolados de Metarhizium spp. associada ao controle de Diatraea saccharalis para identificar espécies e isolados com potencial de uso como agentes para o controle desta praga e a compatibilidade dos mesmos com o parasitoide Cotesia flavipes para serem utilizados em programas de manejo integrado dessa praga-MIP. Neste sentido, foram realizados testes para determinação da agressividade desse grupo de isolados de Metarhizium spp. previamente selecionados sobre D. saccharalis. Os isolados foram inicialmente caracterizados quanto ao potencial de patogenicidade, posteriormente foi realizada a seleção de cepas com alta eficiência de infecção sobre a D. saccharalis através da TL90. Também foi realizada a avaliação da compatibilidade dos isolados selecionados de Metarhizium spp. com o parasitoide C. flavipes para serem utilizados juntamente em programas de Manejo de Pragas - MIP. Os resultados do presente estudo demonstraram que todos... / Abstract: The sugarcane borer is considered as a major crop pest, whose chemical control has not been very effective. The biological control by Cotesia flavipes, due to the expansion of the plan, are not enough to control in areas of high infestation. The hot and humid climate of the Northwest and Miwest regions of São Paulo state potentiate the utilization of the fungi Beauveria bassiana and Metarhizium anisopliae to control this pest. The present work aims to study the genetic variations among a pre-selected population of 20 isolates of Metarhizium spp. associated to the control of Diatraea saccharalis to identify species and isolates with potential of use as agents for the control of this pest and their compatibility with the Cotesia flavipes parasitoid to be used in Integrated Pest Management (IPM) programs. In this sense, the tests were carried out to aggressiveness determination of this Metarhizium spp isolate groups previously selected on Diatraea saccharalis. The isolates were initially characterized for the pathogenicity potential, later the strain selection was made of highly efficient of infection on D. saccharalis through TL90. Also was made the evaluation of Metarhizium spp selected isolates compatibility with the Cotesia flavipes parasitoid to be used together in Integrated Pest Management (IPM) programs. The results of the present study demonstrated that all the isolates evaluated showed high virulence against D. saccharalis caterpillars, and being possible to prove the efficiency of these isolates in the control of this pest, but they showed differences in mortality distribution over time, and the estimate of the lethal time to kill 90% of insect population (TL90) ranged from 5.39 days for M13 to 7.49 days for M20. Moreover, the results of the compatibility tests showed that most of the isolates of the Metarhizium spp. fungus presented some toxicity degree to C. flavipes, ... / Doutor

Orientador: Antonio de Goes / Coorientador: Marcelo Augusto Boechat Morandi / Coorientador: Káthia Fernandes Lopes Pivetta / Banca: Rita de Cássia Panizzi / Banca: Edson Luiz Furtado / Banca: Adelmo Golynski / Banca: Helson Martins do Vale / Resumo: As espécies de Trichoderma spp. e Clonostachys rosea são bastante estudadas atualmente para o controle biológico de doenças de plantas. O objetivo deste trabalho foi avaliar o potencial dos antagonistas, Trichoderma asperellum (LQC96) e Clonostachys rosea (LQC62), no controle biológico das principais doenças fúngicas de begônia (mofo cinzento, mancha de Mirotécio e podridão do colo). A etiologia da podridão do colo em begônias foi estudada por meio das análises de suas características morfológicas e moleculares. Foram realizados ensaios in vitro a fim de verificar os mecanismos envolvidos no controle biológico dessas doenças, avaliados por meio da produção de compostos voláteis e compostos solúveis com ação inibitória aos patógenos, além da capacidade hiperparasítica dos antagonistas. A metodologia para avaliar os compostos voláteis consistiu em posicionar dois fundos de placas de Petri sobrepostas, contendo em uma delas cultura do antagonista e em outra, do patógeno. Para avaliar os compostos solúveis, foram utilizadas duas metodologias, o método em cultivo sobre o papel celofane para LQC96 e o método do filtrado da cultura líquida para LQC62. O hiperparasitismo foi avaliado por meio de culturas pareadas. Verificou-se a colonização e a supressão da esporulação em discos e em hastes de begônias. Após a análise do potencial in vitro, foram realizadas ensaios em casa de vegetação, a fim de verificar o controle dessas doenças em cultivo comercial de begônia. Nos ensaios in vitro, verificou-se que os antagonistas tiveram atividade antagônica contra esses patógenos, com a produção de compostos voláteis e solúveis, além de demonstrar a capacidade hiperparasítica de ambos antagonistas. Ambos agentes de controle biológico avaliados foram capazes de colonizar os discos e hastes de begônia e a aplicação preventiva na concentração de ... / Abstract: Currently the species of Trichoderma spp. and Clonostachys rosea are widely studied for biological control of plant diseases. The aim of this study was to evaluate the potential of these isolates these antagonists (T. asperellum LQC96 and C. rosea LQC62) in the biological control of major fungal diseases of begonia (gray mold, Myrothecium leaf spot and stem rot). The etiology of stem rot was studied using morphological and molecular analysis. In vitro assays were performed to verify the mechanisms involved in the biological control of these diseases, measured by the production of volatile and soluble compounds with an inhibitory effect on pathogens and the ability of antagonist hyperparasitism. The methodology for assessing the volatiles consisted of placing two Petri dishes superimposed on one culture containing the antagonist and another pathogen. To evaluate soluble compounds, two methods were used, the cultivation on cellophane for LQC96 and and the culture liquid filtrate method for LQC62. The hyperparasitism was assessed using paired cultures. There colonization and suppression of sporulation was evaluate on leaf disks and stem of begonias. After analysis of the potential in vitro assays, were performed in a greenhouse in order to verify the control of these diseases in commercial cultivation of begonia. In vitro assays was found that the antagonists were antagonistic activity against these pathogens, producing volatile and soluble compounds, and demonstrate the ability of hyperparasitism. Both biocontrol agents evaluated were able to colonize the leaf discs and stem of begonia and preventive application in concentration of 1x107 conidia mL-1 proved to be the most effective in suppressing pathogen sporulation on leaf discs and stem of begonia. The essay on commercial cultivation decreased the incidence of diseases with weekly application of antagonists. For control of gray mold and ... / Doutor

Orientador: Modesto Barreto / Coorientador: Érika Auxiliadora Giacheto Scaloppi / Banca: Marcel Bellato Spósito / Banca: Mariana Viléla Lopes Ninin / Banca: Margarete Camargo / Banca: Rita de Cássia Panizzi / Resumo: Foram objetivos deste trabalho determinar a influência da temperatura e do período de molhamento foliar na epidemiologia da ferrugem alaranjada da cana-de-açúcar, o progresso epidêmico através das curvas de progresso de doença e mapear as zonas de risco de ocorrência da doença. Na primeira etapa foram utilizadas plantas da cultivar SP89-1115 com vinte dias de idade inoculadas com o fungo Puccinia kuehnii na concentração de 2 x104 de uredósporos/mL. O delineamento experimental utilizado foi inteiramente casualizado (DIC) em esquema fatorial 5x7 sendo 5 temperaturas (17,5 ; 20,0 ; 22,5 ; 25,0 e 27,5°C) e 7 períodos de molhamento foliar (0 ; 4; 8; 12; 16; 20 e 24 horas), com 3 repetições. As melhores temperaturas para o desenvolvimento da ferrugem alaranjada foram 20,0; 22,5 e 25,0°C sendo esta última a melhor nos períodos de molhamentos foliares acima de 12 horas. Na segunda etapa foram conduzidos experimentos em quatro áreas comerciais localizadas nos municípios de São Carlos, Jaboticabal e Miguelópolis no estado de São Paulo nas safras de 2009/2010, 2010/2011 e 2011/2012 respectivamente. Sendo as variedades utilizadas nas safras de 2009/2010 e 2011/2012 a RB72-454 e na safra 2010/2011 a SP 89-1115 ambas sabidamente suscetíveis à ferrugem alaranjada. O delineamento experimental utilizado foi em blocos casualizados (DBC) com quatro repetições, sendo as parcelas constituídas de quatro linhas de dez metros de comprimento, com espaçamento de 1,5 m entre linhas. A severidade da doença, que ocorreu por infecção natural, foi avaliada a cada 30 dias em cinco plantas escolhidas aleatoriamente na área útil da parcela, analisando a folha +3 de cada planta com auxílio de uma escala descritiva de notas de Amorim et al. (1987) para ferrugem marrom (Puccinia melanocephala) adaptada para a ferrugem alaranjada. Os valores dos coeficientes de determinação ajustado ... / Abstract: The objective of this study was to determine the influence of temperature and leaf wetness in the epidemiology of rust of sugarcane. The development was evaluated through epidemic disease progress curves and mapping risk areas of disease occurrence. In the first test was used plants of the variety SP89-1115 with twenty days of old was inoculated with the pathogen Puccinia kuehnii at a concentration of 2 x 104 urediniosporal.mL-1 The experimental design was completely randomized with a factorial arrangement 5x7, representing the interaction of five temperatures (17.5, 20.0, 22.5, 25.0 and 27.5 °C) and 7 periods of leaf wetness (0, 4, 8, 12, 16, 20 and 24 hours of leaf wetness), with 3 repetitions. The temperature for the development of orange rust of sugarcane was 20.0, 22.5 and 25.0 °C, and the best results were at 25.0 °C latter being the best leaf wetness periods over 12 hours. In the second step, experiments were in four areas located in cities of São Carlos, Jaboticabal and Miguelópolis in São Paulo state during in 2009/2010, 2010/2011 and 2011/2012 respectively. Varieties being used during the agricultural year 2009/2010 and 2011/2012 RB72-454, 2010/2011 SP 89-1115 both notoriously susceptible to leaf orange rust. The experimental design was complete randomized blocks with four repetitions and plots consisting of four rows ten feet long, with spacing of 1.5 m between rows. The disease severity occurred for natural and the evolutions were made every 30 days in five randomly chosen plants in each parcel, analyzing +3 leaf of each plant with the aid of a descriptive scale. The coefficients of determination adjusted (R*2), standard deviation of the initial inoculum (x0) and infection rate (r*) confirmed that the monomolecular model was the best fit to the data of leaf orange rust of sugarcane when compared to other treatments and in all agricultural year. In the third stage with the ... / Doutor

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:27:21Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-12-06Bitstream added on 2014-06-13T19:55:56Z : No. of bitstreams: 1 000749700.pdf: 3868289 bytes, checksum: 9b3635588bdc5371eddfe626ebc297d8 (MD5) / Dentre as principais doenças que ocorrem na pós-colheita em citros destacam-se o bolor verde, bolor azul e a podridão azeda, ocasionadas pelos fungos Penicillium digitatum, P. italicum e Geotrichum candidum, respectivamente. Uma alternativa para o controle destas doenças se dá por meio da utilização de leveduras. Sendo assim, objetivou-se no presente estudo isolar, selecionar e identificar leveduras de solos, folhas, flores e frutos de citros de diferentes regiões produtoras do estado de São Paulo, com potencial de aplicação como agentes de biocontrole aos fitopatógenos de pós-colheita. Foram obtidos 95 isolados de leveduras de 14 municípios do estado de São Paulo, sendo o filoplano a fonte de 90,5% dos isolados. Nos ensaios in vitro realizados com G. candidum, o ACBL-77 proporcionou o maior valor de inibição do crescimento micelial do fungo (35%) e os isolados ACBL-68 e ACB-K1 (Saccharomyces cerevisiae), os que proporcionaram maiores valores de inibições na germinação de conídios, 83 e 82%, respectivamente. Quando se avaliou o controle da podridão azeda em frutos de Laranja Pêra, três isolados (ACBL-23, ACBL-44 e ACBL-77) foram os mais eficientes no controle da doença de maneira preventiva e curativa. Em ensaios realizados in vitro com P. digitatum, cinco isolados de levedura (ACBL-76, ACBL-82, ACBL-84 e ACBL-87) proporcionaram valores de inibições do crescimento da colônia do fungo acima de 80%. Entretanto, in vivo somente dois isolados (ACBL-82 e ACBL-86) foram capazes de controlar o progresso e também a incidência da doença, quando utilizados preventivamente. Na avaliação da inibição do crescimento micelial in vitro do P. italicum, oito isolados proporcionam valores de inibições acima de 80%, sendo que o ACBL-04 proporcionou 100% de controle. Nos ensaios in vivo, quatro isolados (ACBL-04, ACBL-05, ACBL-08 e ACBL-11) foram eficientes na diminuição... / Among the major diseases that occur in citrus post-harvest stand out green mold, blue mold and sour rot, caused by Penicillium digitatum, Penicillium italicum and Geotrichum candidum, respectively. An alternative for the control of these diseases is through the use of yeasts. Thus, the aim of the present study was to isolate, select and identify yeasts from soil, leaves, flowers and fruits of different citrus producing regions of the São Paulo State, with potential application as biocontrol agents for postharvest pathogens. Ninety-five yeast isolates were obtained from 14 counties in the São Paulo State. The phylloplane was the source of 90.5% of the isolates. Tests conducted in vitro, with G. candidum showed that ACBL-77 presented the highest inhibition of mycelial growth (35%) and both strains ACBL-68 and ACB-K1 (Saccharomyces cerevisiae), provided the highest values of inhibitions of conidia germination, 83 and 82%, respectively. When the control of sour rot in fruits of ´Pera´ sweet Orange was evaluated, three isolates (ACBL-23, ACBL-44 and ACBL-77) were the most effective in controlling the disease in a preventive and curative way. In in vitro assays with P. digitatum, five yeast strains (ACBL-76, ACBL-82, ACBL-84 and ACBL-87) inhibited the mycelial growth with values above 80%. However, when the ability of yeast to control green mold was evaluated on orange fruits, only two isolates (ACBL-82 and ACBL-86) were able to decrease the progress and also the incidence of the disease when used preventively. Eight isolates inhibited the mycelial growth of P. italicum above 80%, and the isolate ACBL-04 provided 100% of inhibition. In in vivo assays, four isolates (ACBL-04, ACBL-05, ACBL-08 and ACBL-11) were effective in reducing the progress of blue mold as well as in inhibiting the incidence of disease when applied preventively

Orientadora : Profª Drª Vanessa Kava-Cordeiro / Co-orientadora : Profª Drª Chirlei Glienke / Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Genética. Defesa: Curitiba, 28/04/2014 / Inclui referências / Área de concentração : Genética / Resumo: A citricultura é uma das principais atividades econômicas no Brasil. A presença de fungos fitopatogênicos ocasiona perda de produtividade e aumento do custo de produção devido ao uso de fungicidas. Com o objetivo inicial de selecionar fungos endofíticos de Citrus sinensis com potencial antagonista contra o fitopatógeno Phyllosticta citricarpa, foram obtidos 1141 isolados fúngicos de 443 folhas, representando 1% de um pomar no estado do Paraná, não afetado pela Mancha Preta dos Citros, doença causada por este fitopatógeno. Um isolado, identificado como Muscodor sp (LGMF1254), apresentou os melhores resultados no teste de antagonismo. Com o objetivo de selecionar outros isolados deste gênero, o isolado LGMF1254 foi utilizado na bioprospecção da planta medicinal Aroeira (Schinus terebinthifolius Raddi). Desta seleção foi obtido mais um isolado (LGMF1255), sendo estes dois os primeiros descritos no Brasil do gênero Muscodor. Fungos do gênero Muscodor são considerados uma promessa no controle biológico pela produção de compostos orgânicos voláteis (COVs). Esses dois isolados apresentaram antagonismo contra P. citricarpa pela produção de COVs. Os compostos majoritários foram identificados como Thujopseno e Ácido benzenodicarboxilico por cromatografia gasosa acoplada a espectrometria de massas. A identificação e a caracterização dos isolados foram baseadas em macromorfologia, micromorfologia por microscopia eletrônica de varredura e sequenciamento parcial das regiões ITS1-5.8S-ITS2 (Internal Transcribed Spacer) do DNA ribossomal e do gene rpb2 (RNA polymerase II). Os isolados LGMF1254 e LGMF1255 apresentaram identidade absoluta de ITS com M. sutura e M. vitigenus. Com a sequência do gene rpb2 não foi possível diferenciar os isolados LGMF1254 e LGMF1255, porém estes apresentaram diferenças quando comparados com a mesma sequência de M. sutura. A sequência do gene rpb2 de M. vitigenus não está disponível em bancos de dados. Na análise dos resultados, estes primeiros isolados identificados no Brasil receberam a denominação de Muscodor vitigenus latu sensu, pois M. vitigenus é a espécie mais antiga deste clado. Palavras chave: Xylareaceae, Muscodor, Citrus sinensis, Schinus terebinthifolius, Phyllosticta citricarpa, controle biológico, compostos orgânicos voláteis, sequenciamento de DNA, fungo endofítico, fungo fitopatogênico. / Abstract:The citrus cultivation is one of the main economic activities in Brazil. The presence of phytopathogenic fungi causes lost productivity and production's cost increase, due to the use of fungicides. With the initial goal of selecting Citrus sinensis endophytic fungi with antagonistic potential against the phytopathogenic Phyllosticta citricarpa, was obtained 1141 fungical isolates of 443 leaves, representing 1% of a Paraná orchard unaffected by the Citrus Black Spot, an illness caused by this phytopathogen. An isolate, identified as Muscodor sp (LGMF1254), presented the best results in the antagonism test. With the aim of selecting other isolates of the same genus, this isolate was used in the Aroeira medicinal plant (Schinus terebinthifolius Raddi) bioprospection. Another isolate (LGMF1255) was obtained in this prospection, being both of them the very first of the Muscodor genus described in Brazil. Muscodor genus fungi are considered a promise in biological control via the production of volatiles organic compounds (VOC's). This two isolates presented antagonism against P. citricarpa by means of the production of VOC's. Using gas chromatography and mass spectrometry, the main compounds were identified as Thujopsene and Benzenedicarboxylic acid. The identification and the characterization of the isolates were based on macromorphology, micromorphology by means of electronic microscopy scanning and regions sequencing ITS1-5.8S-ITS2 (Internal Transcribed Spacer) of the ribosomal DNA and the rpb2 (RNA polymerase II) gene. The LGMF1254 and LGMF1255 isolates presented absolute ITS identity with M. sutura and M. vitigenus. With the rpb2 gene sequence it was not possible to differentiate the LGMF1254 and LGMF1255 isolates, nevertheless, both presented differences when compared to the same sequence of M. sutura. The rpb2 de M. vitigenus gene sequence is not available in databases. In the results analysis, these first isolates received, in Brazil, the designation of Muscodor vitigenus latu sense, since M. vitigenus is the oldest species of this clade. Keywords: Xylareaceae, Muscodor, Citrus sinensis, Schinus terebinthifolius, Phyllosticta citricarpa, biological control, volatiles organic compounds, DNA sequencing, endophytic fungi, phytopathogenic fungi.