Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Recursos Genéticos Vegetais, Florianópolis, 2017. / Made available in DSpace on 2017-10-03T04:21:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 349731.pdf: 958802 bytes, checksum: af7a648dfcfc9da10a4ea89c52799b05 (MD5) Previous issue date: 2017 / A Murcha de Fusarium (MF), causada por Fusarium oxysporum f. sp. phaseoli (Fop), é uma das principais doenças do feijoeiro. Embora a resistência genética seja a sua principal forma de controle, o desenvolvimento e lançamento de novas cultivares tem sido dificultado pela variabilidade do patógeno. Neste cenário, novas alternativas de controle precisam ser consideradas. O presente trabalho teve por objetivo avaliar o potencial de compostos bioativos e fermentados de algas marinhas no controle da MF do feijoeiro, bem como seu efeito na emergência de plântulas. Inicialmente, quinze compostos foram testados em casa-de-vegetação usando tratamentos de semente, solo e folha. As sementes foram embebidas por 4 h antes da semeadura, enquanto que a irrigação do solo e a pulverização foliar foram realizadas em plantas com as primeiras folhas totalmente expandidas, aos 12 dias após a semeadura. Dentre os compostos testados, somente a ulvana reduziu a intensidade da doença quando pulverizada sobre as folhas e aumentou a emergência de plântulas quando embebida via semente. Em um segundo experimento, foi comparado o efeito da frequência de pulverizações de ulvana no progresso da doença e na colonização do fungo. Adicionalmente, foi testado o efeito do tratamento de semente com ulvana na emergência de plântulas em solo infestado com Fop, esterilizado/não-infestado e não-esterilizado/não-infestado. Uma, duas ou três aplicações de ulvana similarmente protegeram as plantas de feijão contra Fop até o terceiro trifólio expandido. A partir deste estádio, Fop eficientemente colonizou epicótilos de feijão independente do tratamento. A pulverização foliar de ulvana reduziu o progresso da doença comparado as plantas controle, mas não afetou a intensidade final no estádio de enchimento de vagens. Ulvana aumentou a emergência de plântulas em todas as condições testadas, mostrando ser um eficiente tratamento promotor de crescimento no feijão.<br> / Abstract : The Fusarium wilt (Fw), caused by Fusarium oxysporum f. sp. phaseoli (Fop), is one of the most diseases of common bean worldwide. Although the genetic resistance have been the main recommended measure, the development and release of new bean cultivars has been difficult because of the high pathogen variability. In this scenario, new strategies of disease control need to be encouraged. The present study was aimed at evaluating the potential of bioactive compounds and fermented seaweeds in controlling the bean Fw as well as their effect in seedling emergence. Initially, fifteen compounds were screened under greenhouse conditions by using seed, soil and leaf treatments. Seed soaking was carried out for 4 hours previous to sowing, whereas soil irrigation or foliar spraying were performed at the first leaf growth stage (12 days after sowing). Among the tested compounds, only ulvan reduced disease intensity when sprayed onto leaves and increased seedling emergence when soaked in seeds. The effect of ulvan spray frequency was analyzed in follow-up assays on Fw progress and fungal colonization. In addition, seedling emergence was tested in Fop-infested soil, sterilized/non-infested and non-sterilized/non-infested. One, two or three applications of ulvan similarly protected bean plants until the third trifoliate leaf stage. From this stage, Fop efficiently colonized epicotyls of bean plants independently of treatment. Foliar spraying of ulvan reduced disease progress compared to control but did not affect the final intensity at pod filling growth stage. Ulvan showed to be an effective growth-promoting treatment by increased seedling emergence in all tested conditions.

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Submitted by Maykon Nascimento (maykon.albani@hotmail.com) on 2016-04-13T18:31:06Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Dissertacao Lorena Carnielli.pdf: 1224533 bytes, checksum: 5ce69a9e54fbbc313add5eab9ac14e1b (MD5) / Approved for entry into archive by Patricia Barros (patricia.barros@ufes.br) on 2016-05-16T14:30:18Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Dissertacao Lorena Carnielli.pdf: 1224533 bytes, checksum: 5ce69a9e54fbbc313add5eab9ac14e1b (MD5) / Made available in DSpace on 2016-05-16T14:30:18Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Dissertacao Lorena Carnielli.pdf: 1224533 bytes, checksum: 5ce69a9e54fbbc313add5eab9ac14e1b (MD5) / CAPES / A cultura do abacaxi tem grande destaque para o Brasil devido sua importância econômica. No entanto, doenças que atingem os abacaxizeiros têm causado elevados prejuízos e dentre elas, destaca-se a fusariose. O agente etiológico da fusariose é o fungo Fusarium guttiforme. A dificuldade com o diagnóstico convencional para a correta identificação tem levado à busca de novas metodologias. Nesse trabalho, utilizou-se a técnica de PCR em tempo real com o objetivo de desenvolver uma metodologia rápida, sensível e específica para o diagnóstico do F. guttiforme. Os isolados foram avaliados quanto às características morfológicas e também identificados por PCR multiplex (β-tubulina e fator de elongação 1-α) e pela patogenicidade. No diagnóstico realizado por PCR em Tempo Real usou-se o corante SYBRGreen e um par de primer específico para o gene fator de elongação 1-α (tef1). Os resultados obtidos na caracterização morfológica demonstraram que as estruturas micromorfológicas dos isolados avaliados estavam de acordo com os descritores para espécie e verificou-se variabilidade no crescimento dos isolados nas temperaturas de 25 ºC e 30 ºC. No teste de patogenicidade em mudas da cv. Pérola (suscetível) houve variação entre os isolados em relação à severidade de doença. A presença de dois pares de primers contribui para um menor número de falsos negativos, mas o teste teve uma especificidade muito baixa. Entretanto o diagnóstico por meio da PCR em tempo real teve uma excelente sensibilidade (90,5%), especificidade (100%) com nível de significância de p<0,0001. A simplicidade do método, a especificidade e a sensibilidade, com a utilização do SYBRGreen, levam à recomendação do método como rápido, de reduzido risco de contaminação pós-amplificação e detecção de quantidades relativamente pequenas de DNA alvo. A facilidade de quantificação e a melhoria nos protocolos faz com que a tecnologia de PCR em tempo real seja referência para a detecção do Fusarium guttiforme em abacaxizeiro. / The pineapple crop has high significance in Brazil, due to its economic magnitude. However, diseases of the pineapple plant have caused major economic losses, and among those, the fusariosis is the most important. The etiological agent of the fusariosis is the fungus Fusarium guttiforme. The difficulty with the conventional diagnosis for correct identification has led to the search for new methods. In this study, the real time PCR method was tested with the goal of developing a rapid, specific and sensitive method for the diagnose of the F. guttiforme. The isolates were analyzed on its morphological characteristics and also identified by multiplex PCR (β-tubulin and factor 1-α gene) and by pathogenicity tests. In the diagnosis by real time PCR, SYBRGreen dye along with and a specific pair of primers for the elongation factor 1-α gene (tef1). The result obtained on the morphological characterization demonstrated that the micromorphological structures analyzed agreed with those described for the species and that there is variability in the growth of the isolates at 25ºC and 30ºC. In the pathogenicity test in seedlings of cv. Perola (susceptible) there was variation among isolates. The presence of two pairs of primers contributed to a low false number of negatives, but the test also had low specificity. However, the diagnostic by real time PCR showed good results, with high sensitivity (90,5%) and specificity (100%) with statistically significant p-value (p < 0,0001). The simplicity of the method, the specificity and the sensitivity using the SYBRGreen dye, indicates that de real time PCR technologies is recommended as fast, reduced risk of contamination and post-amplification detection of relatively low amount of target DNA. The ease of quantification and improving protocols makes real time PCR is a reference for the detection of Fusarium guttiforme in the pineapple plant.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro Tecnológico, Programa de Pós-graduação em Ciência e Engenharia de Materiais, Florianópolis, 2013 / Made available in DSpace on 2013-12-05T22:26:47Z (GMT). No. of bitstreams: 1 318871.pdf: 5262527 bytes, checksum: b14f7098a3be34f09eee783f21caaba0 (MD5) Previous issue date: 2013 / Neste trabalho, avaliou-se uma nova rota biológica a temperatura e pressão ambiente para biotransformação da sílica contida na cinza da casca de arroz (CCA) usando o fungo Fusarium oxysporum. Ensaios foram realizados para caracterização do bioprocesso através do seguimento de parâmetros como produção de biomassa, consumo de substrato, pH, produção de ácidos orgânicos e concentração de CCA. A sílica solúvel foi analisada em diversos meios de cultura: malte-glicose (MG), malte-levedo-glicose (MYG), batata-glicose (PG) e arroz-glicose (RG). As proteínas extracelulares produzidas pelo fungo foram analisadas por SD-PAGE e métodos colorimétricos. A CCA e as nanopartículas foram analisadas por DRX, IV, potencial zeta, BET, MEV e MET antes e depois do bioprocesso. Os resultados mostraram que algumas proteínas com tamanhos entre 24, 55 e 70 kDa, e o metabolismo do fungo são provavelmente responsáveis pela dissolução e transformação da sílica a partir da CCA. Os meios de cultura MG e PG apresentaram melhores resultados com relação à transformação cristalina da sílica e com a dissolução da mesma. Foi verificado que há uma transformação da CCA em nanopartículas de sílica quase esféricas de tamanhos entre 6 a 10 nm, área de superfície de 177 m2/g e com estrutura cristalina <br> / Abstract: In this study a biological route at room temperature for the biotransformation of rice husk ash (RHA) in silica nanoparticles using the fungus Fusarium oxysporum was evaluated. Tests were carried out by monitoring the fungal biomass production, substrate consumption, pH, organic acids production. Solubilized silica was analyzed in different culture media: malte-glucose (MG), malte-yeast-glucose (MYG), potato-glucose (PG) and rice-glucose (RG). Extracellular proteins were analyzed by SD-Page and colorimetric methods. RHA and silica nanoparticles were analyzed by XRD, FTIR, zeta potential, BET, SEM and TEM, before and after bioprocessing. The results showed that the production of organic acids was not totally related to the solubility of silica and some proteins that are (24, 55 and 70 kDa) and the metabolism of the fungus with the exposure of RHA that contribute to this. MG and PG media were selected for F. oxysporum growth and production of silica nanoparticles. Zeta potential, XRD and SEM results showed a transformation of silica nanoparticles in RHA. The results indicated that through a biological process at room temperature a biotransformation of rice husk ash is reached by bioleaching and enzymatic action allowing the synthesis of silica quasi-spherical nanoparticles with size between 6 and 40 nm, surface area of 177 m2/g, and crystalline structure.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias. Programa de Pós-graduação em Recursos Genéticos Vegetais, Florianópolis, 2013 / Made available in DSpace on 2013-12-05T23:42:47Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013Bitstream added on 2014-09-24T20:28:57Z : No. of bitstreams: 1 320150.pdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / O declínio e morte das videiras, causados pelo fungo Fusarium oxysporum f. sp. herbemontis, é um dos principais problemas fitossanitários da viticultura no Sul do Brasil. A erradicação das plantas contaminadas é a principal forma de controle desta doença, por não haver controle químico eficiente. A inoculação com fungos micorrízicos arbusculares é uma alternativa para reduzir ou neutralizar efeitos de patógenos de solo, mas são necessários estudos sobre os mecanismos envolvidos na resposta das plantas nesse processo. Com o objetivo de compreender tais mecanismos um experimento trifatorial foi conduzido com os porta-enxertos de videira SO4, P1103 e R110, suscetível, tolerante e resistente ao patógeno, respectivamente. Eles foram inoculados ou não com o fungo micorrízico arbuscular (FMA) Rhizophagus irregularis e inoculados ou não com Fusarium oxysporum f. sp. herbemontis. Avaliaram-se o crescimento e sintomas de fusariose das plantas, o perfil protéico das raízes foi caracterizado por eletroforese bidimensional, e as proteínas foram identificadas por espectrometria de massa MALDI-TOF. Os porta-enxertos inoculados com R. irregularis apresentaram maior desenvolvimento e melhor estado nutricional, além de possuírem menor índice de doença quando inoculados com o fungo patogênico. O porta-enxerto R110 regulou a expressão de 73 proteínas enquanto que SO4 regulou 59 proteínas. No porta-enxerto SO4 foram identificadas nove proteínas relacionadas à indução de resistência, enquanto que no porta-enxerto R110 foram identificadas seis proteínas. Os resultados, além de confirmar a melhora no crescimento e no estado nutricional das plantas, inoculadas com Rizophagus irregulares, também mostram o potencial de micorrizas no controle biológico de doença radicular e evidenciam diferenças na interação dos porta-enxertos frente ao patógeno, ao FMA e à combinação de ambos <br>

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Ciência dos Alimentos, Florianópolis, 2016. / Made available in DSpace on 2016-09-20T04:45:38Z (GMT). No. of bitstreams: 1 341272.pdf: 1935135 bytes, checksum: 5c3d4ed1be1fc7c44016ba805d19d5c7 (MD5) Previous issue date: 2016 / Foram avaliadas a qualidade (danos / umidade) e a segurança (fungos / fumonisinas - FBs) de grãos de milho (Zea mays L.) de diferentes unidades armazenadoras de grãos (UAGs), localizado na principal região produtora de Rondônia (RO), região Norte do Brasil. Foram coletadas amostras de grãos de milho seco (total 76) armazenados em quatro UAGs (município de Vilhena) de julho a novembro de 2014 (n ± 4 / mês) e avaliadas por danos (grãos quebrados, bolorados, fermentados, presença de insetos e matéria estranha, de acordo com a instrução normativa do Ministério da agricultura), umidade (teor de umidade / atividade de água - aw), fungos (contagem total, gêneros e espécies) e FBs (FB1, FB2 - FBtotal - por cromatografia líquida de alta eficiência). As condições climáticas (dados de temperatura, umidade relativa - UR, precipitação) também foram obtidos a partir do plantio até períodos de armazenamento. Dos resultados encontrados, o maior dano dentre as amostras foi o de grãos fermentados, seguido por grãos quebrados. Grãos bolorados e gessados foram encontrados em quantidades mínimas. Em relação à umidade, o teor de umidade e aw variaram entre 10,03 -16,10% (média de 13,20) e 0,52-0,80 (média de 0,62), respectivamente. Como esperado, esporos de fungos estavam presentes em 94,8% das amostras, dentre as quais, cinco gêneros foram isolados e 16 espécies identificadas. O gênero Fusarium prevaleceu, seguido por Aspergillus e Penicillium, Cladosporium e Mucor. O máximo unidades formadoras de colônias (UFC) foi de 2,2 x 103 UFC/g, em milho armazenado por período superior a 4 meses no silo, sendo de rejeito, pela qualidade ruim, da safra 2014/1. Em relação a FBs, 52,63% das amostras (40) estavam acima do limite de quantificação (FBtotal 43,80 µg/kg) e abaixo dos limites máximos toleráveis (LMTs) do Brasil e Estados Unidos (5000/4000 µg/kg), sendo neste aspecto, seguro para o consumo. Apenas 9,20% (7) das amostras continham níveis acima do regulamento da União Européia (LMTs: 1000 µg/kg). Este é o primeiro estudo realizado quanto à presensa de FBs em grãos de milho seco da região Norte do Brasil, novos estudos são necessários para segurança do consumo humano e animal. No segundo estudo, objetivou-se averiguar a segurança de milho (pipoca) e derivados, também provenienetes do estado de RO. Neste, 40 amostras foram adquiridas randomicamente em supermercados, feiras públicas e agropecuárias de duas regiões do estado, sendo Porto Velho (capital e extremo norte do estado - região A) e Vilhena (extremo sul do estado - região B). Os produtos estudadosforam milho para pipoca, canjica (branca e amarela), canjiquinha, farinha de milho (flocada) e quirela (também conhecida como quirera). Os produtos selecionados com critério de produção local, safra 2014/1 (período da enchente) e 2014/2 (pós-enchente). Dentre as amostras supracitadas, os mesmos gêneros Fusarium, seguido por Aspergillus e Penicillium foram isolados com maior predominância, e em menor número, o gênero Trichoderma sp., dentre outros. Em relação a contagem total de colônias, o milho e derivados com finalidade para alimentação humana apresentaram índices inferiores ao LMTs brasileiro (<1x103 UFC/g), sendo mínimo <10 e máx. 8,1x102 UFC/g. O produto com maior contaminação fúngica, em espécies e número total de colônias (mín. 9,1x102 e máx. 1,6x103 UFC/g) foi a quirela destinada ao consumo animal. Com relação à contaminação por FBs, 40% das amostras (n=16) apresentaram valores inferioires ao limite de quantificação para FB1 e FB2 (12,5 e 31,3 µg/kg respectivamente). O milho de pipoca foi o produto que apresentou o menor índice de FBs detectável, com o teor de FB1 12,72 µg/kg (região A). Concluiu-se que todos os produtos apresentaram contaminação menores que os dados obtidos por outros autores, com valores muito inferiores ao permitido pela legislação brasileira, estando seguros (fungos e fumonisinas) para o consumo. Apesar da região norte apresentar condições favoráveis (clima) para o desenvolvimento fúngico, foi observado que o controle de umidade são respeitados durante a armazenagem, reduzindo assim a possibilidade de proliferação fúngica em quantidades prejudiciais à saúde humana e animal.<br> / Abstract : Quality were evaluated (damage / humidity) and security (fungus / fumonisin - FBs) of grains of maize (Zea mays L.) from different storage units of grains (SUGs), located in the main producing region of Rondonia (RO) North region of Brazil. Samples of dried maize grains were collected (total 76) stored in four UAGs (municipality of Vilhena) from July to November 2014 (n ± 4 / month) and evaluated for damage (broken grains, bolorados, fermented, presence of insects and foreign matter, according to the normative instruction of the Ministry of agriculture), humidity (moisture content / water activity - aw), fungi (total count, genera and species) and FBs (FB1, FB2 - FBtotal - by high performance liquid chromatography efficiency). Climatic conditions (temperature data, relative humidity - RH, precipitation) were also obtained from planting to storage periods. Of the results, the most damage among the samples was the fermented grains, followed by broken grains. bolorados and chalky grains were found in minute quantities. Relative humidity, moisture content and aw ranged from 10.03 -16.10% (average of 13.20) and 0.52 to 0.80 (mean 0.62), respectively.. As expected, fungal spores were present in 94.8% of samples, of which five were isolated genera and 16 species identified. The genus Fusarium prevailed, followed by Aspergillus, Penicillium, Cladosporium and Mucor. The maximum colony forming units (CFU) was 2.2x103 CFU/g, in maize stored for longer than four months in the silo, and tailing by the bad quality of the crop 2014/1. For FBs, 52.63% of the samples (40) were above the quantitation limit (FBtotal 43.80 µg/ kg) and below the maximum tolerable limits (MTLs) of Brazil and the United States (5000/4000 µg/kg ). Only 9.20% (7) contained levels above the European Union regulation (MTLs: 1000 µg/kg). This is the first study for the presence of FBs in dry corn grain of northern Brazil, further studies are necessary for the safety of human and animal consumption.For the second study aimed to investigate the corn security (popcorn) and derivatives also provenienetes RO state. In this, 40 samples were purchased randomly in supermarkets, public agricultural fairs and in two regions of the state, and Porto Velho (capital and the far north of the state - A region) and Vilhena (extreme south of the state - B region). The products studied were popcorn, flaking grits (white and yellow), broken maize grains (regular grits), corn flour (flocked) and fine grits. Products selected criteria of local production, 2014/1 season (the periodof the flooding) and 2014/2 (post-flood). Among the above samples, the same Fusarium, followed by Aspergillus and Penicillium were isolated with a predominance, and outnumbered, the genus Trichoderma sp., among others. Compared to the total colony count, maize and derivatives with purpose for human consumption had lower rates to the Brazilian LMTs (<1x103 CFU/g), with minimum <10 and max. 8,1x102 CFU/g. The product with the highest fungal contamination, species and total number of colonies (min. and max 9,1x102 - 1,6x103 CFU/g) was quirela intended for animal consumption. With regard to contamination by FBS 40% of samples (n = 16) showed values inferioires the limit of quantification for FB1 and FB2 (12.5 and 31.3 µg/ kg respectively). The popcorn was the product that showed the lowest FBs index detectable with the FB1 content of 12.72 µg/kg (the region A). It was concluded that all products had lower contamination that the data obtained by other authors, with much lower values than permitted by Brazilian law, being safe (fungi and fumonisin) for consumption. Despite the northern present favorable conditions (climate) for fungal growth was observed that the moisture control are respected during storage, thereby reducing the possibility of fungal proliferation in harmful quantities to human and animal health.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina. Centro de Ciências Biológicas. Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia. / Made available in DSpace on 2012-10-21T05:51:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 190175.pdf: 571082 bytes, checksum: 0319f824ddf597e41a4465d85acdccef (MD5) / Uma das causas do declínio dos vinhedos catarinenses é o ataque pelo fungo de solo Fusarium oxysporum f. sp. herbemontis. Para reposição dos vinhedos têm potencial a micropropagação e o controle biológico da doença. Para isso pode ser feita a introdução de fungos micorrízicos arbusculares (FMA) e de antagonistas aos patógenos. Faz-se necessário, portanto, determinar as condições favoráveis ao estabelecimento das plantas e ao uso, conjunto ou isolado, desses agentes de controle biológico. Foram conduzidos experimentos em câmara de crescimento com o objetivo de selecionar substratos que promovam a micorrização; avaliar o enraizamento in vitro e ex vitro na aclimatização; verificar a compatibilidade entre os FMAs e os antagonistas e testar o uso em conjunto desses microrganismos no controle da fusariose. Foram testados seis substratos, à base de solo e aditivos, com e sem inoculação micorrízica, para aclimatização de dois porta-enxertos. Após 12 semanas as melhores combinações para produção de biomassa vegetal e colonização micorrízica (%M) foi o substrato à base de solo, composto termofílico e areia, para o porta-enxerto Paulsen 1103; enquanto para o porta-enxerto SO4 destacou-se o substrato à base de solo, composto e vermiculita. O substrato comercial usado proporcionou o aumento na biomassa vegetal, mas causou baixa %M. As raízes formadas in vitro sobreviveram e se mostraram necessárias à sobrevivência das plantas na aclimatização. A introdução dos antagonistas a patógenos Trichoderma sp., Gliocadium roseum e Bacillus sp. não interferiram na intensidade de colonização das raízes pelo FMA e no crescimento das plantas. Essas combinações antagonistas e FMAs foram testadas para o controle da fusariose. Após 30 dias da inoculação do patógeno observaram-se sintomas de fusariose no porta-enxerto susceptível. Dentre as combinações testadas a FMA/Bacillus sp. e FMA/Trichoderma sp. são mais promissora que a combinação FMA/G.roseum. Os FMAs são eficientes para o controle de fusariose nos porta-enxertos susceptíveis à doença, quando inoculados isoladamente.

Made available in DSpace on 2015-12-10T14:23:57Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-02-13. Added 1 bitstream(s) on 2015-12-10T14:30:01Z : No. of bitstreams: 1 000851960_20160101.pdf: 357482 bytes, checksum: ae9894ea91df158c3f254d8712309980 (MD5) Bitstreams deleted on 2016-01-04T10:26:50Z: 000851960_20160101.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2016-01-04T10:28:39Z : No. of bitstreams: 1 000851960.pdf: 1986629 bytes, checksum: fd2eda9f5c5da698a200b6313ee03909 (MD5) / A indução de supressividade a Fusarium oxysporum f. sp. cubense (Foc) em bananeira por meio de produtos orgânicos foi avaliada pela incorporação ao solo, artificialmente infestado com o patógeno, de biocarvão de serragem de Eucalyptus (BC), casca de camarão (CC), composto de lodo de esgoto (LE), concha de marisco (CM), bio-óleo de casca de arroz (BA) e de serragem de Eucalyptus (BE), emulsão (EP) e hidrolisado de peixe (HP). Características químicas do solo; área abaixo da curva de progresso do índice da doença (AACPID); severidade final; descoloração interna do rizoma; respiração microbiana por meio da liberação de CO2; comunidade de F. oxysporum, fungos e bactérias totais; a inibição do crescimento micelial e da germinação de microconídios pelos extratos aquosos e pela liberação de compostos voláteis tóxicos foram os parâmetros avaliados. A CC e o LE reduziram a severidade externa (50 e 37%, respectivamente) e a descoloração interna do rizoma (56 e 36%, respectivamente). As CC e CM reduziram o desenvolvimento das plantas nas fases iniciais de cultivo, mostrando sintomas de fitotoxicidade. A elevação do pH, condutividade elétrica (CE), K, Mg, S, Na, Fe, Zn, CO2 e comunidade de bactérias foram as características que apresentaram maior influência na redução da severidade, enquanto que o aumento no pH, CE, CO2, P, Ca, S, Na e B também contribuíram para reduzir a população de F. oxysporum no solo. O BA, o BE e o HP reduziram em 94, 84 e 40% a AACPID, respectivamente. Os teores de Zn, a inibição do crescimento micelial e inibição da germinação dos microconídios pela ação de compostos voláteis e de extratos aquosos foram os mecanismos que mais explicaram o controle ... / The induction of suppressiveness to Fusarium wilt in banana by the incorporation of Eucalyptus sawdust biochar (BC), shrimp shells (CC), composted sewage sludge (LE), clamshell (CM), bio-oil of rice husk (BA) and bio-oil of Eucalyptus sawdust (BE), fish emulsion (EP) and fish hydrolyzate (HP) to soil was evaluated. Soil chemical characteristics; the area under the curve of progress of the disease index (AUPCDI), final severity and internal discoloration of the rhizome; microbial respiration through the release of CO2; the populations of F. oxysporum, fungi and total bacteria; and inhibition of mycelial growth and microconidia germination through the compounds volatile toxic and aqueous extracts were the parameters evaluated. The CC and LE reduced final severity (50 and 37%, respectively) and the internal discoloration of the rhizome (56 and 36%, respectively). The incorporation of CC and CM reduced plant development in the early stages of cultivation, showing symptoms of phytotoxicity. The increase in pH, electric ...

Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Fitopatologia, Programa de Pós-Graduação em Fitopatologia, 2016. / Submitted by Raquel Almeida (raquel.df13@gmail.com) on 2017-08-02T18:17:54Z No. of bitstreams: 1 2016_SandroCoelhoLinharesMontalvão_PARCIAL.pdf: 1518701 bytes, checksum: d86ee1aac30dfe2a9bb7f01f5ab7f320 (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana (raquelviana@bce.unb.br) on 2017-10-06T17:55:29Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2016_SandroCoelhoLinharesMontalvão_PARCIAL.pdf: 1518701 bytes, checksum: d86ee1aac30dfe2a9bb7f01f5ab7f320 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-10-06T17:55:29Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2016_SandroCoelhoLinharesMontalvão_PARCIAL.pdf: 1518701 bytes, checksum: d86ee1aac30dfe2a9bb7f01f5ab7f320 (MD5) Previous issue date: 2017-10-06 / O algodoeiro é uma das espécies mais cultivadas no mundo. A cotonicultura brasileira tem destaque, ocupando o 5o lugar entre os produtores mundiais e 3o como exportador. Apresenta a maior média de produção por área cultivada (~5t/ha) em sequeiro no mundo. As pragas e doenças podem comprometer a produtividade. Assim, duas doenças merecem destaque, a meloidoginose (Meloidogyne incognita raças 3 e 4) e a murcha de fusário (Fusarium oxysporum f. sp. vasinfectum), pois podem ser destrutívas às plantas, tanto isoladamente como em associação. A dificuldade de se fazer um controle eficiente, é devido à capacidade dos patógenos de parasitarem uma ampla gama de hospedeiros e terem grande persistência no solo, dificultando o controle através de tratos culturais como a rotação de cultura e até mesmo a utilização de tratamentos químicos. A busca por alternativas como o uso de Bacillus sp. no controle de doenças de plantas é justificada. Assim, o objetivo geral desse trabalho foi selecionar e caracterizar estirpes de Bacillus antagonistas a M. incognita e F. oxysporum f. sp. vasinfectum (Fov). Para tanto, foi realizado um ensaio in vitro com 11 estirpes de Bacillus thuringiensis para verificar a atividade tóxica a Caenorhabditis elegans, e posteriormente contra J2 de M. incognita, em laboratório e em casa de vegetação. Também foram testados quatro produtos biológicos (Onix, Rizos, NemaControl e Nemix) e carbofuran – (Furadan 350 SC) para o controle de M. incognita em casa vegetação. Para isso, foi instalado um ensaio em delineamento inteiramente casualizado com seis repetições por tratamento e uma planta por vaso. Foram inoculados os ovos e eventuais J2 do nematoide, 20 dias após a emergência das plantas e as seguintes variáveis foram avaliadas: altura (cm), peso fresco da parte aérea (g), peso seco da parte aérea (g), peso fresco de raiz (g), peso seco de raiz (g) e fator de reprodução (FR). Para a histopatologia, foi selecionado o produto Onix (Bacillus methylotrophicus) inoculado em sementes de algodão. Vinte dias após a emergência das plântulas foi inoculada uma suspensão de J2 de M. incognita. As avaliações foram realizadas entre 2 e 45 dias após a inoculação, com o cálculo de fator de reprodução, acompanhamento da penetração de J2 durante os 12 primeiros dias após a inoculação dos nematoides e cortes histopatológicos da raiz para acompanhar o desenvolvimento do parasita. Para a realização dos ensaios de seleção de Bacillus contra Fov, foi realizada uma seleção prévia do meio de cultura, onde diferentes concentrações de meio EMBRAPA e meio BDA foram avaliadas. Nos testes de antagonismo, foi proposta uma escala de notas para facilitar as avaliações, onde com os testes e o auxilio da escala foram avaliados 178 isolados de Bacillus e selecionadas 13 estirpes para os ensaios de metabólitos solúveis em água e metabólitos voláteis. Por fim, foi realizado um teste em casa de vegetação para avaliar a eficiência dos isolados selecionados in vitro, onde as sementes de algodão foram sanitizadas, microbiolizadas com micélio e esporo de Fov colocadas em bandejas com substrato, inoculadas com os tratamentos e conduzidas em casa de vegetação por 25 d. Quatro estirpes de B. thuringiensis tóxicas a C. elegans também apresentaram atividade de controle in vivo sobre M. incognita; o produto Onix reduziu aproximadamente 50% o FR de M. incognita; para os testes de antagonismo contra Fov, as estirpes de Bacillus, GF267, S1301, S1823, S1967, S2535 e S2536 foram selecionadas. / Cotton crop is one of the most cultivated arround the world. The brazilian cotton production has grown, occupying 5th place among the world's producers and 3rd as exporter. Brazil presents the highest average production per cultivated area (~5t/ha) in non-irrigated land in the world. Pests and diseases can compromise the productivity. Thus, two diseases highlight: root-knot nematode (Meloidogyne incognita races 3 e 4) and Fusarium-wilt (Fusarium oxysporum f. sp. vasinfectum). These pathogens can be destructive to the plant, both singly as in association. The difficulty of making an efficient control, is due to the ability of the pathogens to infect a wide range of hosts and to have great persistence in soil, making difficult to control through cultural practices as the crop rotation and even the use of chemical treatments. The search for alternatives such as the use of Bacillus sp. in the control of plant diseases is justified. Thus, the overall objective of this work was to select and characterize strains of Bacillus antagonists to M. incognita and F. oxysporum f. sp. vasinfectum (Fov). For that, initialy an in vitro trial was conducted with 11 strains of Bacillus thuringiensis to evaluate their toxic activity to Caenorhabditis elegans, and later against J2 juvenilles of M. incognita, in laboratory conditions and under greenhouse. Were also tested four commercial products (Onix, Rizos, NemaControl and Nemix) and carbofuran – (Furadan 350 SC) for the control of M. incognita under greenhouse. This test was conducted in a completly randomized design with six replications per treatment and one plant per pot. Nematode eggs were inoculated, 20 d after emergence of plants and the following plant variables were evaluated: height (cm), shoot fresh weight (g), shoot dry weight (g), fresh root weight (g), root dry weight (g), the reproduction factor (RF). For the histopathological study was selected the product Onix (Bacillus methylotrophicus) inoculated in cotton seeds. Twenty days after cotton seed germination a suspension juvenilles of M. incognita was inoculated. The evaluations was carried out from 2 to 45 d after inoculation. The reproduction fator and penetration of J2 were evaluated and observed by histopathology tissue cuts. For the tests of selection of Bacillus against Fov, a prior selection of culture media was done, where different concentrations of culture medium EMBRAPA and BDA were evaluated. In tests of antagonism 178 isolates of Bacillus have been tested and 13 strains were selected for water-soluble metabolites and volatile metabolites. Finally, a greenhouse test was conducted to evaluate the efficiency of in vitro selected isolates, where the cotton seeds were inoculated with Fov and antagonists, and, cultivated under greenhouse for 25 d. Four strains of B. thuringiensis toxic to C. elegans also in vivo controled M. incognita; the product ‘Onix’ reduced around 50% of RF for M. incognita; in tests of antagonism against Fov, the strains of Bacillus, GF267, S1301, S1823, S1967, S2535 e S2536 were selected.