Syftet med denna studie är att undersöka om pedagogerna positionerar barnen olika beroende på barnens verbala förmåga samt om och i så fall i vilken grad barnen positionerar varandra utifrån deras språkliga förmågor. Studien är utförd genom kvalitativ metod, där två avdelningar i samma förskola deltog. Datainsamlingsmetoderna som användes var intervjuer och observationer. Både barn och pedagoger observerades och intervjuernas respondenter var pedagogerna. Det insamlade materialet har tolkats och analyserats utifrån ett poststrukturalistiskt perspektiv med utgångspunkt i Foucaults teorier om makt och diskurser. I analysen av det insamlade materialet framkom leken som en viktig del i synliggörandet av maktaspekterna i den medverkande förskolan. Det var genom leken som barnens positionering av varandra blev synlig. Även pedagogerna positionerade barnen utifrån hur pass bra lekare barnen ansågs vara. Resultatet visade även att det verbala språket hade betydelse för hur barnen inkluderade och exkluderade varandra i leken. Det framkom också att pedagogerna hade en hög medvetenhet om att de befann sig i en maktposition gentemot barnen, samt en stark vilja att förvalta makten väl. I de pedagogstyrda aktiviteterna visade resultatet att de verbalt starka barnen hade större samstämmighet med pedagogerna och erbjöds mer delaktighet, jämfört med de barn som precis börjat utveckla verbalt språk och barn med språklig sårbarhet.

En stor del av tidigare forskning visar att flexibla arbetsformer medför positiva konsekvenser för organisationer medan de missgynnar anställda. Vidare visar tidigare studier att konsultföretag generellt präglas av flexibelt arbete, samtidigt som de är beroende av de anställdas kompetens och prestation, vilket tyder på en motsättning inom tidigare forskning. Syftet med studien är därmed att undersöka hur anställdas hantering av flexibla arbetsformer kan påverka konsultföretag. En kvalitativ undersökning har genomförts baserad på sex semi-strukturerade intervjuer med chefer från olika konsultföretag. Data analyserades utifrån en framtagen analysmodell baserad fem variabler; individens hantering av flexibilitet genom förtroende, individens arbetstillfredsställelse, individens arbetsprestation, organisationens personalomsättning och organisationens prestation. Resultatet tyder på att de flexibla arbetsformerna bidrar till en ökad arbetstillfredsställelse och arbetsprestation hos konsulterna, vilket medför en minskad personalomsättning samt en ökad lönsamhet för konsultföretagen. Vi kom därmed fram till att konsulternas hantering av de flexibla arbetsformerna generellt hade en positiv inverkan på studiens konsultföretag.

Lecythophora (Coniochaeta) hoffmannii, a soil- and lignocellulose-inhabiting sordariomycete (Ascomycota) that can also live as a facultative tree pathogen causing soft rot, belongs to the family Coniochaetaceae. The strain CBS 245.38 sequenced here was assembled into 869 contigs, has a size of 30.8 Mb, and comprises 10,596 predicted protein-coding genes.

This master thesis deals with analysis of structural variation of genome and with methods of its sequencing across all generations. Subsequently it contains a description of copy number variation and methods of its detection. The experimental part focuses on algorithm proposal for CNV detection according analysis and testing of uneven coverage in genome, variable representation of GC content and distance of sequence reads. Finally, the algorithm for detecting copy number variation is tested on genomic data of bacteria Klebsiella pneumoniae.

The aim of this work is a literature review on the topic of the mitochondrial genome and DNA barcoding, building a dataset of mitochondrial sequences from GenBank database and creatione of a software function for extraction of individual genes that are present in the mitochondrial genome. This function was developed in Matlab. DNA barcoding is a method that uses short DNA sequence of mitochondrial genome for identification of species. There is no comprehensive work examining the appropriateness of different mitochondrial genes. This aim investigates the potential of other mitochondrial genes and evaluate their effectiveness for DNA barcoding and calculation of intra-and interspecific variability.

Endosymbiotic gain and transfer of plastids is a widespread evolutionary phenomenon and a major driving force of eukaryotic evolution. The integration of a new organelle is accompanied by changes in its structure, gene content, molecular mechanisms for biogenesis and transport, and re-wiring of the host and organelle metabolic pathways. To understand the course and underlying mechanisms of plastid evolution, it is important to study these processes in variety of secondary algae and notice their differences and similarities. Euglenophytes gained their plastids from green eukaryotic algae after a long history of heterotrophic lifestyle. In my thesis, I participated in analyses of newly generated sequence datasets: transcriptomes of Euglena gracilis and Euglena longa and mass spectrometry-determined proteome of E. gracilis plastid with especial regard to the potential novelties associated with plastid gain and incorporation. In the resulting publications we particularly focus on plastid protein import machinery and targeting signals and report extremely reduced TIC and completely absent TOC in euglenophyte plastid. Using the proteomic dataset, we predict potential novel plastid protein translocases recruited from ER/Golgi and re-analyze plastid signal domains, characterizing previously overlooked...

The microphthalmia with linear skin defects syndrome (MLS) is an X-linked dominant disorder with male lethality. In the majority of the patients reported, the MLS syndrome is caused by segmental monosomy of the Xp22.3 region. To date, five male patients with MLS and 46,XX karyotype (“XX males”) have been described. Here we report on the first male case with MLS and an XY complement. The patient showed agenesis of the corpus callosum, histiocytoid cardiomyopathy, and lactic acidosis but no microphthalmia, and carried a mosaic subtle inversion of the short arm of the X chromosome in 15% of his peripheral blood lymphocytes, 46,Y,inv(X)(p22.13∼22.2p22.32∼22.33)[49]/46,XY[271]. By fluorescence in situ hybridization (FISH), we showed that YAC 225H10 spans the breakpoint in Xp22.3. End-sequencing and database analysis revealed a YAC insert of at least 416 kb containing the genes HCCS and AMELX, and exons 2–16 of ARHGAP6. Molecular cytogenetic data suggest that the Xp22.3 inversion breakpoint is located in intron 1 of ARHGAP6, the gene encoding the Rho GTPase activating protein 6. Future molecular studies in karyotypically normal female MLS patients to detect submicroscopic rearrangements including the ARHGAP6 gene as well as mutation screening of ARHGAP6 in patients with no obvious chromosomal rearrangements will clarify the role of this gene in MLS syndrome. / Dieser Beitrag ist mit Zustimmung des Rechteinhabers aufgrund einer (DFG-geförderten) Allianz- bzw. Nationallizenz frei zugänglich.

Paenibacillus larvae is a Gram-positive sporulating bacterium that causes American foulbrood (AFB). It is one of the most dangerous bacterial pathogens of the honeybee (Apis mellifera). P. larvae spores are highly infectious to bee larvae and resist physicochemical influences. P. larvae is subtyped using repPCR with ERIC primers (Enterobacterial Repetitive Integrance Consensus) into five genotypes (ERIC I-V), which possess different colony morphology, metabolism and especially virulence. There is a significant genetic variability among isolates of P. larvae, which may contribute to differences in virulence. P. larvae isolates used in this work were obtained from clinical cases of American foulbrood as well as from a debris collected from bee hives with no American foulbrood symptoms from all over the Czech Republic in cooperation with the Beekeeping Research Institute, s.r.o., Dol. The isolates were obtained from larvae and hive debris. Both virulet and avirulet strains were sequenced using the SMRT (single molecule real time) method on the Sequel platform (PacBio). This method is suitable for Whole Genome Sequencing (WGS), because it allows sequencing of long reads with high accuracy, eliminating the effect of a large number of repetitive sequences during the genome assembly. Furthermore,...

Charles University, Faculty of Science Department of parasitology Doctoral study programme: Parasitology Abstract (en) Analysis of the genome of a free-living amoeba Mastigamoeba balamuthi and its comparison with pathogenic Entamoeba histolytica Mgr. Vojtěch Žárský Supervisor: prof. RNDr. Jan Tachezy, Ph.D. Praha, 2020 Abstract Examination and comparison of organisms have been tremendously important for the study of life's history on earth. The progress of our understanding of the genetic basis of heredity and the recent boom of sequencing technologies allows us to continue in this exciting field of research from the perspective of genes and genomes. In this work, I focus on the study of an anaerobic amoeba Mastigamoeba balamuthi, which is related to an important human pathogen Entamoeba histolytica. Comparative analysis allows us to draw some conclusions about the nature of the common ancestor of Mastigamoeba and E. histolytica, how it adapted to the anaerobic lifestyle, and about the way the Entamoeba lineage evolved to become a successful parasite. Surprisingly we also noticed that besides hydrogenosomes (hydrogen-producing organelles related to mitochondria), M. balamuthi also harbors peroxisomes - organelles thought to be absent in anaerobic organisms. This finding motivated us to inquire more about...

I den rådande läroplanen för gymnasieskolan står framskrivet att undervisningen skall ske genom demokratiska arbetsmetoder (Skolverket 2011a), det vill säga att undervisningen skall ske genom demokrati. Samtidigt står det framskrivet i ämnesplanen för samhällskunskap på gymnasiet att innehållet i undervisningen skall bestå av demokrati (Skolverket 2011b), det vill säga att undervisningen skall vara i demokrati. Det väcker frågan om det är möjligt att kombinera dessa två. Samtidigt som de demokratiska ambitionerna från Skolverket är fortsatt höga så sjunker de demokratiska värderingarna i Sverige (Economist Intelligence Unit, 2010). Tidigare forskning visar på att demokratibegreppet är både brett och abstrakt vilket kan göra det svårt att omsätta i praktik. Detta är en kvalitativ intervjustudie baserad på målriktat, systematiskt urval. Målet med intervjuerna var att dels ta del av lärares tankar kopplat till styrdokumenten, dels samla in arbetsmetoder som används för att undervisa i och genom demokrati. Resultaten analyseras sedan utifrån Robert A. Dahls demokratimodell. Resultatet av denna studie ringar in delar av de konsekvenser som Skolverkets höga ambitioner har på den verkställande nivån, men lyfter även fram exempel på lärares lösningar på dessa problem.